4F83A

Crystal structure of the receptor binding domain of botulinum neurotoxin mosaic serotype c/d with a tetraethylene glycol molecule bound on the hcn sub-domain and a sulfate ion at the putative active site
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
416
structure length
413
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNALVDTSGYNAEVRLEGDVQVNTIYTNDFKLSSSGDKIIVNLNNNILYYENSSVSFWIKISKDLTNSHNEYTIINSIKQNSGWKLCIRNGNIEWILQDINRKYKSLIFDYSESLSHTGYTNKWFFVTITNNIMGYMKLYINGELKQSERIEDLDEVKLDKTIVFGIDENIDENQMLWIRDFNIFSKELSNEDINIVYEGQILRNVIKDYWGNPLKFDTEYYMINYNYIDRYIAPKNNILVLVQYSDISKLYTKNPITIKSAANKNPYSRILNGDDIMFHMLYDSREYMIIRDTDTIYATQGGQCSKNCVYALKLQSNLGNYGIGIFSIKNIVSQNKYCSQIFSSFMKNTMLLADIYKPWRFSFENAYTPVAVTNYETKLLSTSSFWKFISRDPGWVEHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords Type C neurotoxin
publication title Structural insights into the functional role of the Hcn sub-domain of the receptor-binding domain of the botulinum neurotoxin mosaic serotype C/D.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 109
structure length 413
sequence length 416
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4f83A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4f83A02
4XJUA 1GYKA 1LGNA 4GALA 3AP7A 3VSZA 3ZPYA 4FPEA 1HIBA 3BAHA 4FOVA 1WLWA 2VW2A 4Q9PA 3IPVB 1PWAA 1HCEA 4H04A 4YG0A 1SLCA 2CWSA 1W6PB 4XKIA 4Q91A 3PMEA 3UJOA 2EAKA 2AFGA 1QNWA 2AREA 1CVNA 2ZHNA 1FQ9A 3ZXGA 2C9AA 1WW6A 2Y9XE 2LIQA 4YFZA 4KC3A 3VT0A 2JE9A 3AX4A 2ZACA 4LBQD 2WQZC 4JP0A 3FJCA 5CBLA 2J3PA 2ZQOA 5T5OA 2D23A 2JD4A 5T50A 2ZGTA 1TP0A 3FJ8A 3V0BB 4USOA 2W52A 5DUWA 3W9TA 2D3SA 4EFPA 5FREA 2DUQA 4CRQA 4AYUA 3BA5A 3HOMA 4YW2A 2DVBA 3ZSJA 2P3KA 1TTUA 5F8SA 4EEEB 1W6OB 1ISWA 2VW0A 2YY1A 4XXAA 2E53A 3IMNA 5FNWA 1LODA 3RTIB 2VUAA 2A70A 1AVBA 4XTMA 1GGPB 1BFFA 2YMZA 4DRRA 3BTAA 31BIA 1Q8VA 4ZFYB 3FLRA 3N7LA 2WKKA 1LOAA 4IYBA 1N1SA 3TAYA 2ZHKA 1ISXA 3AP4A 3UDAA 3OYWA 1LOEA 3HMYA 1G86A 5F5QA 1N3PA 4IHZA 1V6XA 1H9PA 3IM0A 1KDKA 2EXJA 3ZXFA 5BQUC 4YW1A 2ZMLA 2JDZA 3DGTA 1FGAA 3AJYA 3M1HA 4YFWA 1HQWA 2K4AB 4J2XA 3A22A 1ISYA 1JLYA 3P6JA 2EXHA 3ZSMA 1Q8PA 3C2UA 3RG0A 2K8RA 1JY0A 4R9BA 1IS4A 1R1ZA 4Q9GA 3LLPA 1DYKA 2DURA 1CVSA 1SR4C 1RITA 3HR9A 4PQ9A 1HWOB 3DUIA 41BIA 2EF6A 2NZ9A 2MIBA 1JW6A 5DZGA 5EWSA 1QOSA 3ZXJA 1AF9A 5DUXA 2UURA 1HCDA 5L73A 2WLQA 2D7RA 3POSA 4JRAA 4PF5A 1FYUA 1Z2VA 3SNMA 3O4BA 1A3KA 4YG6A 1AVAC 1C57A 1Z78A 5KXEA 2W08A 2FO1A 3ZXEA 3N7JA 4XJ8A 4OW4A 2V5YA 2A3YA 2F2FA 2FGFA 3LCPA 3RQ0A 2D20A 1QOOA 2GNTA 1ONAA 5E24E 4Q1RA 2VXRA 3KQRA 1JYCA 1MR5A 3O4DA 5FZUA 4BMBA 1LESA 1EPWA 3CNAA 4I4RA 5DZUA 1FN0A 2DWRA 2ERFA 3WG1A 5BQUA 1OKQA 3E8LC 1Q8QA 1AVUA 2R0FA 4K1YA 3APBA 2LIEA 3M3EA 4WV8A 3O3QA 2JE7A 1CIWA 3IIRA 1DQ4A 3CRIA 4M00A 3AJ6A 3R4UA 1AJKA 5KXDA 2F8XC 1SZ6B 2LALA 5HCFA 3FJ9A 4LO8B 3OYWB 1HWMB 3BX1C 1LOCA 4AVVA 2HZ9A 3AH1A 2GNMA 1GKBA 1QQKA 4P0JA 4Y1UA 3VT2A 4KBBA 3WO4A 3UD9A 4YW5A 5BXRA 1UN1A 2D24A 4A7YA 3PVEA 1RINA 2A6ZA 1GNZA 4CTEA 1TEIA 3POWA 1QU0A 1JUIA 1VAMA 3MALA 3PVOA 4XHXA 3O5WB 2VSAA 4FPGA 4XILA 1BKZA 1ULCA 1V6OA 4YLZA 1RZOB 1KNMA 1G9DA 3ZYRA 2R9KB 3JUUA 4J2KA 2PHWA 2H0BA 1IS3A 1KDMA 3OBRA 1LENA 1S0IA 4I1BA 1KQRA 3FUQA 1IKQA 3OPZA 3ILRA 5BP5A 1BARA 5JOXA 1DFCA 2P34A 3AKHA 1N47A 4UW5A 3SH3A 1QKQA 1HKNA 5BVPI 3AP5A 4FPLA 3NBCA 2ZGRA 1HLCA 2OUHA 2WNEA 4Y22A 1FWVA 1MS9A 3RMXA 3R4SA 1H9WA 1ENRA 1KRIA 3VKOA 1WLDA 3BB2A 1CONA 2A71A 3NV4A 2A3XA 4GAIA 4FPKA 2NVHA 1QDOA 4FPOB 1SLIA 2VXTI 4LO3C 3I2XA 4D0ZA 3JUTA 3PVNA 2WT0A 5HPZA 1I1BA 1Q1UA 2P3JA 3SH5A 2PHTA 4YZ3A 4IQPA 4GWMA 1JYIA 1FNYA 2AXMA 3T2TA 1RMLA 1MZ6A 1DZCA 5DUUA 3O4OA 2AR6A 2A7AA 4FP3A 3T8SA 1IOBA 1LOGA 2CYFA 3KM5A 1Q8SA 2UWBA 2ZR1B 1S0BA 1C1LA 4OZXA 5E8AA 5JLVA 2D22A 4P6AA 3ILFA 1I1EA 3CA1A 2ARBA 3N36A 4XXPA 1ISVA 4JC1A 3VT1A 2HWMA 1AX0A 4G6MA 3EF2A 3SNVA 4H55A 1GBGA 3BAOA 1S1AA 1W3FA 3A23A 3OJ2A 2ZZJA 4BQ1A 5DG2A 3OGGA 1W6MA 2Q9XA 1LULA 5EC5A 3IN9A 3S8KA 2DUOA 4Y26A 1CQ9A 2R49A 4BOWA 3UD7A 1N3OA 2DRYA 4FPYA 2E6VA 5FRAA 4Q8KA 1RIRA 3CQAA 3V65A 1MS8A 1S0CA 1G9CA 3AKGA 1ISZA 1T4QA 1NXD1 3AKIA 4K21A 4Y1ZA 4FPFA 1LHVA 4YZ4A 4LBJA 4P0LA 5T55A 2JECA 3Q7WA 4G9NA 1DIWA 2DV9A 3WVJA 2VLCA 1JT3A 1W6NA 2KH2A 2AENA 4G1RA 2ZHMA 1UMZA 1IHKA 3LSEA 2ERMA 3VSFA 5EXOA 2AUYA 1JT7A 1UPSA 2ZQNA 2P39A 4XIOA 1WBAA 2NP0A 4Y22B 4LO0C 1JLXA 4II0A 1ULDA 1WD3A 3RSJA 5DUVA 1EV2A 2NMNA 2FDBM 21BIA 1M16A 3WDWA 3BRGC 1B09A 4AGVA 1LEMA 4XYXA 1V6JA 4AWDA 2HW9A 5D62A 3B9UA 2RG9B 1VAVA 2OUJA 3USUA 3A07A 2EXIA 1R8NA 4ZGRB 3AYEA 1MVQA 3H6SE 4I8MA 1JBCA 1OFSA 1NLSA 4PBOA 1U0AA 1DZQA 2E4MA 1QF3A 1HKDA 4DFSA 1AZDA 1SFYA 2ZGPA 4ZFWB 4OWKA 1G7YA 3ILNA 2ZGKA 2YUGA 4XMAA 1BFGA 1PC8B 5T54A 3K1XA 2ZHLA 4Y20A 2HWAA 4X38A 2ZAAA 1AXMA 1LOFA 2Z42A 4ATFA 4XBNA 1K5VA 1G9AA 1W6MB 3P6IA 3BAUA 4HR6C 4W65A 1BFBA 3V79C 4GWNA 3I4IA 2VY0A 2NMOA 4I4YA 3QYDA 4DENA 4LO0A 2NN8A 2YV8A 2ZGOA 3UK9A 1HWNB 4XZPA 3BAQA 2F2FC 2W68A 2M49A 3CRGA 4GA9A 2DVAA 2P3IA 3OBTA 1AVXB 5T5PA 4YGCA 4HA2A 1W6NB 5B2HA 3ENRA 4AN7B 2GO2A 1MS3A 1PZZA 4J23B 3CA4A 1V00A 3U4XA 1YF8B 1IJTA 3NBEA 4PBPA 1QDCA 2I1BA 3WHUA 1YI7A 4DCKC 3WDYA 4I4PA 3WG3A 3WA1A 1WW5A 3FGMA 5F90A 1IS5A 3F1RA 1SBDA 1CESA 3M2MA 1LU2A 4YGBA 2ES3A 3I29B 3WO3A 1I3HA 1DQ6A 4FVVA 2P23A 4ISQA 4X37A 2A6VA 2D6PA 3AZYA 1XYFA 1TIEA 2A6WA 3FJFA 1WLCA 5JMCA 3V0AA 3USUB 1PUUB 5DG1A 1TWEA 2L5XA 2UU8A 1GZ9A 2YROA 4WVWA 3IAGC 4Q8LA 5KXCA 1SACA 4JQ0A 2HYKA 4J2SA 1UX6A 8I1BA 1YRZA 5AVAA 2EIGA 4Q2FA 4GKXA 1BFCA 1DHKB 2ZABA 3PG0A 4DQAA 3INAA 3OY8A 5GZGA 1MZ5A 4OWLA 4Y20B 1UL9A 1Z4SA 2CNAA 3T1LA 2D7FA 1V6LA 3B9CA 3AJ5A 2I2SA 1ULFA 4R9CA 4XJZA 2OW4A 4I96A 4FOYA 3FJAA 2LTNA 1MS0A 2E7TA 4P0KA 2D6LX 4AN6A 1EYLA 1BXHA 4IONA 1GLHA 2GMMA 4M01A 5BP5C 2WJSA 5JOYA 4YZ2A 4JKXB 5IK5A 1WBCA 4XOGA 3QLQA 4Z9WB 4X39A 3O5SA 2XOAA 4D8HA 1LJ7A 1S0FA 4U2AA 3SH4A 4Y24A 1D2SA 4Y1VA 4YGDA 1WCSA 4I30A 3AZXA 4XIKA 3RS6A 1NUNA 4F34A 1J0SA 3W59A 5H9PA 3AKFA 1TFMB 3RMYA 1OQ1A 1P63A 4LO7C 1AXKA 3ATGA 4Y1XA 1KJRA 4F83A 4DEPA 3VUOA 2ZGUA 4UW3A 1ZA4A 4USPA 4YOLA 4M3CA 2GNDA 5H9SA 4XJAA 3UD8A 2VU9A 2BFHA 2G4IA 1F9KA 2GN7A 2JKBA 1GZWA 2DU1A 3WMUA 4OUJA 1UZZA 1KJLA 5DSSB 2A6XA 2R16A 1Q8OA 5CB7A 2X2TA 1N1YA 3NV3A 3FLTA 4I4XA 1C4RA 1N1VA 4QBVA 4I4UA 5LK5A 5JOZA 1IILA 1FNZA 3AYCA 3FFZA 1YO8A 3TC2A 1MS5A 3B00A 3N7KA 3P53A 3RRDA 1R8OA 1AXZA 3Q7YA 1TWMA 4QD2C 3FJIA 2VSEA 2RQ9A 2CTVA 1V6NA 4EFRA 3B3QE 5EYYA 1K5UA 4P14A 3H6QA 1V6MA 2KLLA 4DPNA 3L2YA 2R1BA 3ZXDA 1AX1A 3BODA 1SLBA 3IKWA 1FMMS 3CA5A 3MW4A 2DVFA 1WD4A 3UJ4A 3WDTA 4ZA3B 1NZKA 4L4IA 4GXLA 2ZGLA 2RSTA 2OVUA 5H9RA 3OY8B 3M3OA 3O4AA 2GMPA 1IS6A 1SLAA 4G6JA 3H6RA 2RHPA 3WDVA 3FUOA 3VKMA 3MEPA 2GDFA 2SLIA 3ZC8A 3H0OA 4I4OA 1MD6A 3SLIA 3ZXLA 2AH2A 3CAHA 1BZWA 4RL7A 2IWTB 3NV2A 2B7YA 4C1XA 2DREA 1QOTA 3HBWA 3FJDA 5GLVA 4I1EA 1V6VA 5HCAA 3ZSLA 2Y9FA 2R1DA 5G00A 3WUDA 4OEFA 3WOGA 1G9BA 1BYHA 2D3PA 3ZC9A 2EXKA 2XG3A 4XFUA 5F8WA 2D6MA 1LTEA 3NJ5A 1QGLA 3VWCA 1GICA 3Q9OA 4LO1A 4GOVA 3UJ0A 1LOBA 2ZGSA 2BEBA 4WBCA 1O4YA 1IKPA 2ENRA 3FJBA 3WINC 3IM7A 1SBFA 1XHBA 1V6WA 4CZSA 2DU0A 3NBDA 4HANA 4XFSA 9ILBA 4YM0A 2ZGQA 1DQGA 3A0NA 4ASMB 4ATEA 3ZXKA 4YM1A 4WZFA 4M3CB 4ISRA 4OEEA 1JN2P 4XE9A 1GZWB 1SLTA 5IUQA 5GLTA 2P2KA 1MVEA 2E4MC 1FWUA 1QQLA 5BXPA 4LBQA 3UJQA 4FGFA 5T5LA 2PHXA 3OJMA 2PELA 3OJBA 2PHUA 3AYAA 4QALA 4XDQA 3WLUA 4Q1PA 3BAGA 1CR7A 3A4UA 1QXMA 1AXYA 1W6OA 1PZ9A 1UAIA 5FZZA 1FV3A 2DRZA 1LOFC 5IK4A 4LBNA 2KKIA 4I4VA 3AH2A 1FX5A 1YYNA 1FATA 4GAFA 1II4A 3FLPA 2D6OX 3SISA 2GN3A 3D7WB 4TZDA 3CA6A 4LO2A 3I8TA 4IY8A 4QBCA 4AGRA 4A7KA 1WW4A 5D63A 4OWJA 5IK7A 5BOWA 5H9QA 2D3RA 2ZBJA 3NV1A 3UL2A 1GZCA 2ARXA 4NOTA 2WT1A 1AFCA 1MC9A 3H6RB 5FNXA 3WCSA 2YXSA 3WG4A 3WDUA 2MC2A 3ZVXA 2W39A 4LBLA 1Y7BA 5HCBA 3WINA 4I7IA 4JCKA 4LO7B 4GP3A 1LHWA 2D1ZA 3VV1A 1VLNA 1S0GA 4D69A 3NWKA 5JVVA 2XB6C 3OGFA 1DYPA 4XFTA 2NTDA 1Q56A 4ZXKA 4TLPA 4P9YA 1BASA 3HN1A 3AK0A 5EG6C 2UUSA 1QNYA 2Y9WC 2JJ6A 1V6IA 2KI4A 3N35A 5BXSA 1S0EA 3ZX7A 2DVDA 5GZDA 4QD2B 4AVTA 3WMVA 4QC4A 3CA0A 1DLLA 3QR5A 1JTCA 4Y1YA 3B69A 5E89A 1ABRB 1SCSA 4SLIA 4U36A 1IT0A 5GLZA 5GALA 4EB2B 1G9FA 3KMVA 4LBQB 1W6QA 1DJSB 2D6KA 3BA7A 4JAWA 2PHRA 5JDBA 2DTYA 5GZCA 2UWCA 2ZMKA 3LSDA 1S0LA 1CPMA 2ZGNA 2DS0A 3FJKA 2YZ4A 1AVWB 1LHUA 4CJMA 2Q5TA 4H9WA 5F8YA 1IOAA 4L8QA 2AAIB 4EKXB 1YTOA 4X3AA 3WV6A 4DRVA 1ILR1 1N4KA 4XHBA 1LHNA 2GALA 1SLLA 3SITA 5CNAA 1AX2A 5IK8A 1V6UA 3N3HA 3D4KA 4IZEA 1DZDA 4I4SA 1L2HA 5DZFA 4IZXA 2EALA 5DUYA 2FHRA 1M2TB 2FMDA 1JQZA 4LBMA 3Q7XA 1N1TA 1DQ5A 4Q27A 2ZMNA 1GSLA 1F31A 4NO4A 3WO2A 1DFQA 1JT5A 5BXTA 3BADA 4QO3A 2E51A 5CA6A 4ITCA 1A8DA 4GP0A 1APNA 5T52A 4QKRA 5CAZA 4J2YA 1YIFA 1CPNA 2R0HA 1YXWA 3AP6A 3MW2A 3WG2A 4YM3A 3WDXA 1WUVA 4I4QA 4QKSA 3LTQA 1ULEA 2TEPA 2ZKNA 1DQOA 2BQPA 2P37A 1C1FA 3VKLA 4GKYA 2ZGMA 4YG3A 4XJWA 1IRPA 1E0OA 2AGSA 3D5OA 3AYDA 4BLIA 4R9AA 4PC4A 2CY6A 1BLDA 1HQLA 1GNHA 2NM1A 4I2SA 1Q04A 2WBCA 5GZEA 1EVTA 4KEIA 1UZYA 1JT4A 1T9FA 3POKA 5GM0A 4YZ1A 3N0KA 3ZYPA 2GNBA 3F62B 3WNXA 2C5DA 3TB0A 4C1WA 4EFQA 3O0XA 4YGEA 4DS0A 1W6QB 4ZLBB 4UW6A 1ITBA 4HL0A 1URXA 1LU1A 1WBLA 1XQNA 1GV9A 4I0YA 1N3QA 4Q26A 4YM2A 1LGCA 4ZBVB 1Q03A 2IHOA 1ONKB 4XBQA 2A3WA 4PCRA 4R6UB 1XG6A 3MPPG 3V64A 1RG8A 4ENDA 1J1TA 3WUCA 3B01A 3M3CA 4I3NA 3D6EA 3S8JA 1CE7B 1VCLA 3A21A 4AGGA 3AZWA 4FOQA 4FQ4A 4XBLA 3GNEA 1Z0HA 2K43A 1WBFA 2GMEA 3HALA 3GALA 1CN1A 4K20A 3O49A 1LECA 1SBEA 3T1MA 4KEJA 1W0OA 5EYXA 2ESUA 3VKNA 4FOWA 3AZVA 4RA0A 5F9TA 1ENQA 1O4ZA 1W0PA 5BYNA 3BA4A 2PHFA 1PUMB 3QCWA 1SR4A 1DBNA 3AZZA 4LO1C 1DGLA 1S0DA 3BOPA 3WHTA 2CL2A 1WW7A 5GLUA 3WZ1A 1W3AA 5E88A 1ULGA 3AXEA 4KEKA 4A7ZA 3PJQA 1IRAX 3FJHA 3CA3A 1DQ2A 3N7MA 4FP2A 1W3GA 3WCRA 5GZFA 2D43A 5FZYA 3V0AB 2MLLB 2GZBA 2ET2A 3O0WA 4ZFUB 7I1BA 4TYSA 1ZM1A 5DZEA 5GLWA 2AQZA 3BRDA 1ENSA 2WT2A 2DTWA 1AJOA 2NYYA 1A78A 4L4HA 4FQZA 3AP9A 4P9WA 1FAYA 1BA7A 4YW3A 4GOYA 4BMEA 3VEQA 1LEDA 2Z48A 5IT6A 1TOOA 4Z8SB 2WSUA 3BAVA 4BPZA 5T5JA 4K1ZA 1D0HA 2A75A 1DQ0A 4UW4A 3O4CA 2BEAA 1VALA 4AVSA 2Z49A 2DYCA 1BJQA 3AH4A 2KI6B 4LO2C 3W58A 1JOJA 2A5ZA 3OJVA 4YZ5A 1BQPA 3O0VA 4M3CE 1QMJA 2Y9GA 4XJ9A 3C9ZA 4FPJA 3IM5A 2VH9A 5GJ6A 1OQLB 3ZSKA 2UWAA 3IPVA 4YW4A 4WVVA 4HJJA 1GANA 3FJJA 1BLAA 1DQ1A 1JXNA 1W6PA 3AJZA 3CRHA 4XTPA 1PZ8A 4FPCA 2D44A 3ILAA 4IY9A 5DVHA 5D61A 1H30A 2ZA9A 3RTJB 4ZKTB 1HWPB 1G8WA 1X50A 3NBNA 1CJPA 1MACA 4BM8A 4P9XA 3MW3A 3BIWE 2DVGA 3PHZA 1JHNA 1XZZA 3AXDA 1FV2A 2FFVA 4ZOTA 4G9MA 4FPHA 5JOWA 3V0BA 1S0JA 1MS1A 5GAQA 2QN4A 3O44A 2QYIB 5DXDA 4R9DA 4LBKA 2V73A 6I1BA 3R05A 4JKQA 2DUPA 1PZ7A 4M3CF 5EHAA 3FBYA 3HSMA 2WSVA 1VIWB 2SBAA 4BLJA 4JPZA 1LGBA 3O12A 1LCLA 1KITA 4D0TA 3IM6A 1YBIA 2VW1A 3JRRA 4Z8BA 4MYEA 5KXBA 1RY7A 1UKGA 2AYHA 2E7QA 2D7IA 3AFKA 4LBOA 3CU1B 4XMIA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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