4FVVA

Crystal structure of hcr/d-sa-gbl1/c
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
421
structure length
412
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKLTGINFSKTITFQMNKIPSDNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFRLGGDWYRHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin serotype C associates with dual ganglioside receptors to facilitate cell entry.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords Neurotoxin
total genus 96
structure length 412
sequence length 421
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4fvvA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4fvvA02
3AYCA 3ZX7A 3AP6A 3VKNA 3W58A 2ZR1B 3RTIB 4YW4A 5JOXA 2GALA 2SLIA 4G9MA 4GAFA 1BA7A 1QQLA 5KXBA 3ZVXA 3FJHA 4TZDA 2EAKA 4CZSA 1QNWA 2R1DA 4G6JA 4OW4A 1S1AA 4XTPA 3T1MA 1FATA 4DFSA 2BFHA 2VW1A 3MW3A 4XJWA 4IZEA 3NBNA 3AYDA 2NP0A 2CTVA 2HWAA 1Z0HA 3S8JA 2PHUA 2I2SA 4LO2A 3O49A 3M3CA 2MLLB 1V6MA 4G6MA 3V0AA 2EF6A 5FZZA 2D3RA 4D69A 1OQ1A 2A6VA 5E24E 4J2KA 3FJFA 3WDWA 3A23A 4YM3A 1KRIA 4GA9A 1S0CA 1C4RA 4FOQA 4XILA 1DHKB 2FMDA 3APBA 3SNVA 2DTWA 4AVSA 2BEAA 1FNYA 3SLIA 3HALA 1VAMA 5GAQA 3WINA 3AZYA 3WHUA 1IRAX 3B69A 1BFCA 1TIEA 4FPEA 4I4UA 3OYWA 1UKGA 3FJAA 1O4ZA 3R4UA 1ENQA 1XQNA 4YW1A 2GMPA 3CA3A 2KH2A 5DZEA 2CL2A 4UW5A 3IN9A 4H9WA 4Q2FA 2FO1A 3QYDA 3D4KA 1LU1A 6I1BA 1PZ9A 2MC2A 2AFGA 1Y7BA 4R9AA 4ATEA 4XFTA 4FPKA 3PUBA 1IILA 2ARBA 2KM2A 3M1HA 2VLCA 3ZPYA 1N3PA 1AXMA 5CB7A 3BAOA 4LBQA 2IHOA 5GZEA 3DGTA 4XXAA 3WDXA 3ZXJA 3HBWA 4XFSA 2VSAA 1W6OB 2JE9A 2E4MA 2VW2A 4EFPA 1MS1A 1Q8VA 3UD9A 2NMOA 1VIWB 1PZZA 5GZFA 4Q27A 1ISXA 1IJTA 5HCBA 5DG1A 5IUQA 2ZZJA 4I4SA 5DUUA 3B00A 3IM0A 1I1BA 4I4YA 3N7KA 3NV2A 4K20A 1XZZA 1WLCA 2F8XC 4X39A 5T52A 1N3QA 2Z42A 1FN0A 3WDYA 5T54A 5BXTA 3FLTA 4JKQA 2DVAA 4I4RA 4JAWA 4QBVA 4M3CE 4LBQD 1VLNA 2X2SA 1PWAA 3CRGA 5DSSB 1AVUA 1MS5A 2FFUA 1YTOA 1WBLA 4IY8A 3NV1A 2D6OX 2VW0A 2R0HA 4Y26A 1IKPA 3O4DA 3WHTA 3T1LA 4YOLA 5B2HA 2C5DA 4YW2A 4IY9A 4F34A 5GLUA 4XJUA 3P6IA 2CWMA 4KBBA 3AJ6A 3ATGA 3SITA 4I4VA 2M49A 3BTAA 4LBLA 2DREA 3ZXFA 1SBEA 5GLTA 3WVJA 1UX6A 1SACA 2DVGA 3WG4A 1N3OA 1BFGA 3HR9A 4XJ9A 1R8OA 3O0WA 2NTDA 1JT3A 4X3AA 2AXMA 3C2UA 1WW4A 2PHWA 1HQLA 2D6MA 1NXD1 1Q8QA 2DVDA 1G9DA 3CA0A 3OBRA 1GKBA 5EYXA 1DQ5A 2WT0A 3WNXA 1N1YA 1V6WA 1GLHA 1PUMB 3VKLA 3V0BA 3O3QA 1P63A 4L4IA 2KKIA 2UWAA 1LTEA 1LOGA 3UJ0A 2GO2A 5FZUA 1NZKA 2DRYA 2Q5TA 4FPCA 3ZSJA 5DXDA 3FJBA 1DYPA 4RA0A 2D43A 3B9CA 3PG0A 1KQRA 5FRAA 1GICA 1J0SA 1MS4A 4YZ5A 2XB6C 1JT5A 1SLAA 4EKXB 1JHNA 1G8WA 4Q26A 2FHRA 2PHTA 1FAYA 4BQ1A 1I1EA 1G9FA 3O4BA 1UL9A 2Y9FA 1BZWA 3LLPA 1W6NB 3BRDA 2NYYA 3FLRA 2GMMA 3AKHA 2EXJA 4JRAA 2WBCA 4DRVA 4GP3A 5BVPI 4JKXB 1GYKA 2R9KB 2HYKA 2VXRA 1MVQA 3RMYA 3AH1A 3F62B 4XHBA 4QBCA 4AN7B 1HCDA 2A70A 1B09A 1W6MA 4YZ1A 1KDKA 3BAQA 1YF8B 5F8SA 1MZ5A 3WCRA 5EWSA 5GZGA 3ILFA 4XBLA 4KEJA 1FQ9A 3NBEA 3O5WB 5I1BA 2NM1A 1MS3A 1DZQA 3AXDA 1DZDA 5IT6A 3CA4A 1CQ9A 2ZBJA 2A6XA 1GSLA 2UWBA 1H9PA 4ZFYB 3ENRA 4XIOA 2D7RA 1V6NA 2A7AA 1JLYA 3RG0A 1S0EA 1VALA 2MIBA 4R9BA 5BP5A 1LECA 5FNXA 3KM5A 3WG2A 2V5YA 5DUVA 4G9NA 2ZQNA 3O4AA 1WLDA 2ZHNA 4BMEA 2ARXA 1URXA 3AXEA 4FQZA 1ONKB 4YLZA 3H6RB 3PVOA 1LOFA 3NJ5A 3H6SE 5FNWA 4PC4A 2KLLA 4I8MA 3QR5A 1QKQA 1S0DA 3ILRA 3B9UA 2D22A 5DVHA 1F31A 2X2TA 1WBCA 2ERFA 3ZXKA 4AWDA 1IKQA 1LEDA 2D3PA 5AVAA 2P37A 1PUUB 3FLPA 4I4PA 1LOAA 2GMEA 1ENSA 2EXKA 3PVEA 5EC5A 3TC2A 3UJOA 1OQLB 3AJZA 3FUOA 2P23A 3F1RA 3ZC8A 1QMJA 5GJ6A 4EEEB 4P14A 4LBJA 1WD4A 2ZKNA 1U0AA 1LOEA 4XTMA 3FFZA 3IM5A 4PBPA 4I3NA 1SBDA 4R9CA 4P9WA 2WKKA 4I7IA 2CNAA 2GNMA 2D7FA 1VAVA 1Q1UA 1AZDA 4AVVA 1H30A 4JCKA 1N1TA 1NLSA 1WUVA 3FJKA 31BIA 1WLWA 4Q8LA 1Z4SA 1F5FA 2A6ZA 4I1EA 3M3OA 5GALA 3A07A 4FVVA 5DUWA 1W3GA 1GZWA 4XFUA 4L8QA 4LO1C 2IWTB 5JOWA 1CR7A 1TWEA 2AAIB 3POSA 1SBFA 3AP7A 4J2YA 5EHAA 2ZGUA 3OPZA 2WJSA 3H6QA 1ILR1 1GV9A 1R1ZA 3FJIA 3AJYA 1CVNA 5DUXA 4OZXA 4SLIA 1LOBA 3V79C 3R4SA 3UJQA 3AKIA 1LESA 2VU9A 1DQ6A 1AX1A 4XBNA 3MW2A 1BARA 3JRRA 2ZHMA 2BQPA 4OEEA 1JBCA 4F83A 5GZDA 2HWMA 3FGMA 1IS6A 1V6LA 1S0FA 2ZGRA 4XBQA 1S0GA 4YM2A 2E7TA 3UK9A 2D24A 3AK0A 4D0TA 3ZXGA 1A3KA 4YG3A 4FP3A 4I4XA 5E8AA 1MR5A 4ZA3B 4DCKC 1ULCA 2RQ9A 3SNMA 3VKFC 3IKWA 5KXCA 1ISZA 3HMYA 3IMNA 2W08A 4I4OA 5CBLA 4QO3A 3NV4A 3SH5A 1RG8A 1QNYA 3FJCA 4FPYA 1JW6A 4FOWA 4EFRA 2LIQA 4OWKA 2I1BA 1MVEA 1Q04A 3M3QA 1JT4A 4YFWA 3N0KA 1K5UA 1LCLA 2P39A 3JUTA 4ATFA 4BPZA 3UL2A 4AVTA 3WOGA 2YY1A 1SLTA 5BQUC 1Q8OA 4P9YA 2JECA 1AVAC 2A3WA 5T55A 1FWUA 4YFZA 1AF9A 4XJZA 1LGBA 2AQZA 1TEIA 1AXZA 2B7YA 2WT2A 1OKQA 1AFCA 4DQAA 5G00A 2DUOA 4OUJA 3CQAA 2WQZC 21BIA 2R16A 2OW4A 1S0BA 4ISRA 3BA4A 3W59A 4OWJA 1W3FA 4LO3A 2P3KA 4DPNA 1MS8A 4A7KA 3ZSKA 4Y1VA 1I3HA 1R8NA 4LBNA 3FJEA 1VCLA 1JOJA 3ZXLA 1QGLA 1LHUA 1M2TB 2GN7A 2ESUA 4Y1YA 3ZXEA 4ZFUB 1W6OA 3WDVA 1QXMA 5IK5A 3WV6A 2YV8A 4GP0A 1PZ8A 1DQGA 4FGFA 1JYIA 4I6IA 4FPOB 1TOOA 4LO0A 2DYCA 3Q7YA 3O12A 1LGNA 4WBCA 4FP2A 1X50A 3VV1A 4ZOTA 3P53A 2VSEA 4JPZA 2ZMNA 3SH4A 1IOBA 2Z49A 1S0IA 3BAHA 4XJ8A 4KEKA 3K1XA 3POYA 2ZACA 3HN1A 4Y20B 4OWLA 2YZ4A 4PBOA 4GOVA 3AZWA 4GALA 3OGFA 3MALA 4C1XA 4YM0A 3VEQA 3Q7XA 2DURA 2DVBA 2EALA 2YMZA 2KI6B 3SISA 1HQWA 2K4AB 5T5OA 4BLIA 41BIA 1CN1A 1RMLA 2EIGA 1G82A 2WLQA 2DRZA 1WD3A 4MYEA 1AVBA 9ILBA 1MZ6A 2DU1A 2AR6A 3AP4A 1KJLA 4LBKA 1ISVA 1W0PA 5F8YA 3VT0A 2V73A 1UZYA 5JOYA 4P0LA 1G9BA 3WDUA 2PHFA 2P2KA 1UPSA 4M01A 4YGBA 1BLDA 4ASMB 1J1TA 1EYLA 3O0VA 1BFFA 1JYCA 2A5ZA 4WV8A 5T5PA 4UW3A 3WG3A 5BXRA 3POKA 1KJRA 2LTNA 1V6KA 1D2SA 1DQ2A 4YGDA 2E4MC 3WMUA 2UU8A 1YIFA 3A21A 1SLLA 4K1ZA 2E51A 3POWA 1WBAA 1XHBA 1DQ1A 4XHXA 3CNAA 4YW3A 5F9TA 3ILNA 5CNAA 1II4A 2HW9A 1M16A 3O4CA 4I1BA 2DV9A 1MD6A 1Z78A 4GWMA 3FJDA 1CPMA 4QALA 4J23B 5GLZA 3ZXDA 5H9QA 5JMCA 4ZFWB 2W52A 3MPPG 1HWNB 1HLCA 3RQ0A 2ZGLA 3WUCA 2PELA 4ZKTB 1DZCA 3N7MA 1CPNA 2DUQA 1W6NA 4JC1A 1AX0A 3RRDA 1SR4A 2JE7A 5BXSA 4KC3A 1XG6A 3BB2A 1F9KA 2YXSA 4II0A 1APNA 3M3EA 1TFMB 3ZYRA 2R49A 2AH2A 2VY0A 7I1BA 4I0YA 2JJ6A 3B3QE 3CRHA 2LALA 4J2SA 3LCPA 4LBMA 1W6QB 1GBGA 4Z8BA 1BXHA 1WW6A 1JN2P 5DUYA 1A78A 1DQ4A 1QDCA 3Q7WA 2AUYA 1BFBA 1V6XA 3NBCA 4M3CF 3D6EA 1FMMS 3AH2A 5T50A 2BEBA 4QKRA 1AXKA 2PHRA 1N4KA 4FPGA 2OVUA 3WO3A 2TEPA 2NN8A 1V00A 3BIWE 1MACA 3WZ1A 3P6JA 4Y1UA 3TAYA 2G4IA 1IOAA 2R0FA 3OY8B 8I1BA 3PHZA 4QC4A 3LTQA 3N36A 2YUGA 1FGAA 4PF5A 1TP0A 1LHVA 4FPJA 3LSEA 1YXWA 2NVHA 3CAHA 1UZZA 4U36A 3FJ8A 2Z48A 4XYXA 2ERMA 1Q56A 2E6VA 3WLUA 2ZGTA 1GANA 1YYNA 3ASIA 1MS0A 4ENDA 1QF3A 1V6JA 1HWMB 3AX4A 4I2SA 1BASA 1T9FA 4AYUA 3H6RA 1DLLA 3PMEA 3S8KA 3EF2A 2Y9WC 2H0BA 5JVVA 1SLBA 4J2XA 3I8TA 4XMAA 1DQ0A 3RTJB 1YBIA 1LHNA 1QOTA 4Q9PA 1LHWA 4XXPA 4YGCA 1C1FA 1BYHA 3AZXA 2AENA 3D5OA 4FOYA 1XYFA 1RY7A 4BMBA 3IPVB 1CVSA 3AZVA 3JUUA 3CA6A 4C1WA 2RSTA 3BADA 3USUB 1D0HA 1EPWA 2D20A 2LIEA 1H9WA 1W6PB 2RG9B 2GDFA 4AGGA 2ZAAA 4AGRA 1ULGA 1SFYA 4HANA 4Q9GA 3OJMA 1DIWA 1FV2A 1OFSA 4USOA 3AP9A 2P34A 3LSDA 1LEMA 1LU2A 3VKOA 4EB2B 3NBDA 3CU1B 4AN6A 2WNEA 3O0XA 2YROA 4GKXA 5D61A 1ISWA 2QN4A 2D44A 4LO8B 5KXDA 2VXTI 2DWRA 4YZ3A 2RHPA 5BP5C 3DUIA 3ZC9A 2ZGQA 4Y1XA 3IIRA 3RSJA 1MS9A 1RITA 5JLVA 5H9PA 4GKYA 1GGPB 1JTCA 2K8RA 1RIRA 2GNDA 5F5QA 2ZGSA 2A3XA 3V0AB 3OGGA 1LOFC 1DYKA 1G9CA 5F8WA 3T2TA 4IONA 5IK4A 1ONAA 3A0NA 1UN1A 4XOGA 1FWVA 1GNZA 2PHXA 2D6KA 4XKIA 1HDKA 3Q9OA 4I4QA 3VSFA 1MC9A 1ENRA 5BOWA 3WO4A 4TLPA 3KMVA 5DZUA 2A75A 2Q9XA 2NMNA 3V65A 3OYWB 1RZOB 3BODA 3N3HA 3C9ZA 4Q8KA 1V6OA 4Y24A 3NV3A 3IM7A 3CA5A 2FDBM 4GAIA 5CA6A 3VKMA 4IHZA 4WZFA 2A3YA 4GXLA 5DZFA 2WSUA 1V6VA 1HWPB 4P0JA 2L5XA 4YG0A 1WCSA 1HCEA 3FBYA 3BRFA 3R05A 2CWSA 2F2FC 1LENA 1S0JA 1G86A 1FNZA 2D6PA 4QD2C 1GNHA 2GNBA 1HIBA 1HKDA 1AXYA 2UWCA 4LBQB 5IK8A 2E53A 1KITA 5L73A 3RMXA 2GN3A 2HZ9A 3SH3A 4YZ2A 2D6NA 4NOTA 2ES3A 1G7YA 2ZGMA 4Q91A 3AH4A 1SLCA 3BOPA 4BOWA 4USPA 2ZGOA 1JXNA 2W39A 2A6WA 3W9TA 1IS5A 3OJBA 5HCFA 1QDOA 3BAUA 3OJVA 1WW5A 2WT1A 1DQOA 5KXEA 3A0KA 1N47A 1CJPA 5DG2A 1DBNA 3B01A 1YRZA 1KNMA 1FMZA 4Y1ZA 4I96A 1W0OA 1O4YA 4M3CB 1C57A 4YZ4A 3BAGA 4EFQA 2JKBA 4UW6A 2ET2A 2FFVA 3BX1C 3A4UA 1K5VA 3BA5A 3VWCA 4XMIA 5HPZA 1IT0A 1IS3A 1CE7B 1IS4A 4U2AA 2EXIA 1DFQA 4KEIA 2W68A 1QQKA 4LO2C 2DS0A 2P3JA 4HJJA 2D23A 5GZCA 1LJ7A 1CIWA 1UAIA 4QKSA 2VH9A 4M3CA 1FV3A 4K21A 4XJAA 2CYFA 4XDQA 2DVFA 3VT1A 4PQ9A 2XOAA 2DU0A 1Q03A 5BYNA 3ILAA 5JOZA 4LBOA 4YM1A 2K43A 1W3AA 1WBFA 2EXHA 4ITCA 3I2AA 3IAGC 3WINC 3NWKA 1Q8SA 1PC8B 1BJQA 4P0KA 2Y9GA 3U4XA 3GALA 3L2YA 4I37A 3O5SA 4LO7B 4YG6A 4R9DA 3VSZA 1AJKA 5GLWA 1JLXA 4ISQA 5GM0A 5H9RA 4OEFA 4Y20A 1CONA 2DTYA 2D7IA 3V0BB 1LOCA 4XE9A 3BAVA 4DENA 4Z9WB 1SLIA 1ZA4A 3PVNA 2CY6A 5FREA 4P6AA 1UMZA 1QOOA 4W65A 3T8SA 1NUNA 4ZBVB 5JDBA 3M2MA 1DFCA 3INAA 1T4QA 1AVWB 5LK5A 4JQ0A 3KQRA 1HWOB 4H04A 4LO3C 3ZYPA 1AX2A 1SZ6B 2D6LX 3WUDA 1AVXB 1QOSA 2E7QA 3CA1A 5E89A 4FPFA 1N1VA 1V6IA 1FX5A 4PCRA 3QCWA 5EG6C 4ZXKA 3CRIA 2KI4A 4HL0A 3I29B 4G1RA 2AREA 5D62A 3AP5A 1L2HA 3QLQA 1A8DA 3OJ2A 3WMVA 4A7YA 4TYSA 2UURA 1E0OA 1ULEA 4LO0C 4X38A 1W6MB 5T5JA 4HA2A 1EV2A 4FPLA 3JU9A 4GOYA 3UDAA 1RINA 2GZBA 5IK7A 3WO2A 4WVWA 2ZQOA 1SCSA 2Q3NB 2R1BA 1N1SA 1YI7A 3ZSMA 2ZMLA 4ZLBB 4GWNA 2QYIB 2ZMKA 1Z2VA 4Y22B 3AJ5A 1V6UA 3MEPA 4D8HA 1TTUA 4DS0A 3AYEA 3FJJA 3IM6A 1AJOA 2OUJA 2DUPA 5GLVA 4IZXA 2UUSA 4LO1A 2WRYA 4XZPA 1BQPA 2ZHLA 3N35A 4YGEA 5CAZA 1WW7A 3PJQA 3GNEA 1DJSB 3UD7A 4BM8A 1LHOA 4Y22A 1BLAA 1LGCA 2ZHKA 4A7ZA 3VUOA 3WA1A 4LO7C 1ULDA 4IYBA 1BKZA 1W6QA 2SBAA 3BA7A 3AKGA 2ZABA 2J3PA 3AKFA 3D7WB 3HOMA 1LULA 1HKNA 3I4IA 3O4OA 3OBTA 5DZGA 3TB0A 3E8LC 2AYHA 2P3IA 2AGSA 2OUHA 4H55A 4FPHA 1ABRB 3I2XA 4Q1RA 1SCRA 2ZGKA 2A71A 5D63A 1G9AA 3OY8A 4ZGRB 4UW4A 5T5LA 4CJMA 4IQPA 5FZYA 1IRPA 4Q1PA 1ZM1A 1JY0A 1S0LA 3WDTA 2XG3A 1ULFA 1DGLA 1GZCA 3UD8A 1GZ9A 3FJ9A 2ZGNA 2Y9XE 2WSVA 3MW4A 3RS6A 4AGVA 4DRRA 1TWMA 3BRGC 4P9XA 5H9SA 4R6UB 5SV8A 4L4HA 3V64A 3FUQA 3WCSA 4FOVA 4CTEA 4JP0A 1LODA 4K1YA 4RL7A 3UJ4A 3O44A 3N7JA 4QD2B 4I30A 4M00A 4NO4A 2JDZA 1CESA 1C1LA 5BXPA 4D0ZA 5E88A 4X37A 2ZGPA 3AFKA 1SR4C 1GZWB 4OEGA 2ENRA 4CRQA 3AYAA 4WVVA 1YO8A 3AZZA 2ZA9A 2JD4A 2VUAA 1JUIA 2D1ZA 5BQUA 2F2FA 1EVTA 1ITBA 1ISYA 2NZ9A 1JQZA 1PZ7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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