4ISQA

Binding domain of botulinum neurotoxin dc in complex with human synaptotagmin i
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
422
structure length
414
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNDNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structures of Botulinum Neurotoxin DC in Complex with Its Protein Receptors Synaptotagmin I and II.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords Neurotoxin
total genus 96
structure length 414
sequence length 422
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4isqA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4isqA02
5DZEA 5GLWA 3MW4A 3AP9A 3SNMA 1XHBA 4WZFA 1YBIA 1MS5A 4LBLA 4L4IA 1KNMA 1JQZA 5D61A 2A70A 2XB6C 1PUMB 4C1XA 4XJ8A 3VT1A 1BYHA 3WG1A 4FOQA 4AGVA 2FO1A 1CESA 2P39A 3A23A 3AH2A 1JW6A 4DENA 4I0YA 2KKIA 2AAIB 4ENDA 3HSMA 4QO3A 1DBNA 3H6QA 1W3AA 3BB2A 2HZ9A 5H9QA 1QXMA 2E51A 1BFFA 4I4RA 3MW2A 4Q9GA 1TWEA 4D8HA 5GLVA 5BXPA 2AREA 2YV8A 5GLTA 1WCSA 1L2HA 1LGBA 3D7WB 1LTEA 4Y1UA 1UPSA 1HKDA 3DUIA 4IONA 2PHXA 5DG2A 2RG9B 4USOA 2HWMA 5DUUA 5HCFA 3WA1A 3OGGA 3AP6A 4UW3A 2W39A 3BTAA 1V6WA 4UW4A 2A6VA 4YOLA 1ZM1A 2WT2A 3CA4A 4IY8A 5IUQA 5EC5A 1IS5A 3BRDA 1FMZA 4AN6A 5JMCA 4Y1VA 3PG0A 4XJ9A 3QCWA 2ZGPA 1AJOA 2BEBA 2IHOA 3ZXFA 2ZHKA 1SLAA 1EYLA 4JAWA 2CWMA 2PHFA 2WSVA 5DXDA 3CU1B 3R4UA 4BMBA 3AZWA 4G6MA 4FP3A 3V64A 1TP0A 2JJ6A 1JBCA 4IZXA 1IRPA 1CPNA 3ENRA 4MYEA 4XIKA 3OJVA 2D6PA 4XYXA 1AZDA 2BFHA 1W6MB 3MALA 4KEIA 2W52A 3FJEA 3ZXGA 4LBOA 1VIWB 4PBOA 1QDCA 3ILAA 3WVJA 3R05A 2J3PA 1XZZA 4XJZA 4FGFA 1IJTA 4YM1A 4YM0A 3FJIA 2ZZJA 3H6SE 3B01A 1CQ9A 5T5OA 1W6MA 1FV3A 2I2SA 5T50A 4JKXB 3ILFA 1SLCA 3Q7YA 1JTCA 2ZGTA 2OUHA 1LOAA 4LO0A 1I3HA 1DFQA 5DZUA 4FPGA 1R8NA 2ZGSA 3OBRA 1DQ2A 1R1ZA 3ZYRA 1Z2VA 3LCPA 1MS3A 3W58A 2Q9XA 3AJ6A 1EV2A 2CNAA 3IAGC 5JOZA 4LO2A 3FJCA 1P63A 4KEJA 21BIA 3PVEA 1HWPB 4YW5A 1DQ5A 2KI6B 5GZCA 4LO7B 1QMJA 1GANA 4I1EA 3CRHA 3WNXA 4Y1YA 3FLRA 3A4UA 1K5UA 5DUYA 2WSUA 4Q9PA 3CRIA 2KI4A 3EF2A 4I96A 4HANA 3V65A 2Z48A 3UDAA 3B9CA 2YMZA 4LBJA 1MS8A 4XOGA 3O3QA 1CVSA 4G6JA 4LO3A 4GOYA 1N4KA 2FGFA 1YXWA 1FATA 4XTPA 3ZPYA 3FUOA 2ZHLA 3IM7A 4BMEA 1PWAA 1QQLA 1AFCA 4AYUA 4XXAA 1N1TA 2F2FC 1WBLA 2CY6A 3WG4A 4I4UA 4GWNA 1G7YA 1BKZA 5KXBA 3WUDA 4F83A 1Z4SA 1GNZA 4EKXB 1LGNA 1E0OA 1GV9A 3HR9A 3HN1A 3ZSJA 1ULGA 2CWSA 1F9KA 1IKPA 2VUAA 4LO1C 2AR6A 1TFMB 3FJDA 4XMIA 2R0FA 2P37A 3S8JA 3VV1A 4XMAA 1G9FA 4I7IA 2A3XA 3VSZA 1LOGA 3CA6A 2UWCA 4AVVA 1MC9A 2JE7A 1GKBA 1FGAA 1W0PA 3ILRA 4FPLA 2GNMA 3SNVA 1DZDA 4HJJA 4M01A 3USUA 2X2SA 2M49A 2SLIA 4P9XA 4OEFA 4WV8A 5HPZA 3H6RA 4IHZA 2GDFA 1IRAX 4G1RA 3R4SA 2JECA 5DVHA 2VY0A 1Q03A 2GO2A 3ZC8A 2ZACA 5JOXA 4YGDA 3T1LA 2Y9XE 4YG6A 2A3WA 4FOWA 2L5XA 1JT4A 4C1WA 4FPEA 2UU8A 1GNHA 2ZA9A 3UJOA 3WHTA 5AVAA 1RITA 5G00A 3BAGA 3M2MA 4YW1A 2ZR1B 1KDKA 4P0JA 4XBQA 1DYKA 4BM8A 3ATGA 5BVPI 2RHPA 1QGLA 3IPVA 2GMPA 1LECA 4K1ZA 3FJJA 3AYDA 4GOVA 3WDVA 1HIBA 4I6IA 2K43A 3BRGC 1BXHA 2ZMNA 3AJYA 1S0FA 4XJUA 2R1BA 3VKFC 2FMDA 4AVTA 2DVFA 4D0TA 1K5VA 1PC8B 4R6UB 1DQ1A 5JVVA 2VW2A 4PC4A 4XBNA 1J0SA 2D7FA 1S0LA 1YYNA 4WVVA 1S0JA 2YXSA 3U4XA 3AKGA 3O4OA 1HDKA 3S8KA 1NXD1 1RZOB 4J2KA 2DS0A 4ZBVB 2OVUA 2IWTB 4P0LA 1V00A 1GYKA 1HWMB 2B7YA 1SBDA 5EHAA 1LHOA 2DVAA 5SV8A 3INAA 2Q5TA 4GKXA 4I4VA 3BAOA 3N7KA 4LO7C 2NZ9A 3BAUA 3O49A 3SH5A 4XILA 1JT7A 1T9FA 3KQRA 3DGTA 2FHRA 3CRGA 4YZ4A 3AZYA 2G4IA 3LLPA 1HCEA 1VLNA 2AH2A 4FPHA 2DV9A 5KXDA 1FWUA 1S0CA 1H9WA 2VU9A 5T5LA 2P3KA 3I8TA 3LSDA 3PHZA 1G86A 2F8XC 5BYNA 2WJSA 4NO4A 1AVUA 4PCRA 2AXMA 4Q91A 2PHWA 4J23B 1FYUA 4H04A 1FNYA 2DYCA 3AYEA 3C2UA 1PZ9A 3SH3A 1M2TB 2WT0A 1VCLA 3JRRA 2GMMA 3GNEA 1PZ7A 1WW7A 1UKGA 4JP0A 3N36A 4QKRA 1BJQA 3OBTA 1YRZA 5GAQA 4LBQB 1CN1A 2EXHA 1UZYA 4LBNA 1X50A 2EALA 1HLCA 3AKIA 2H0BA 3APBA 1ISYA 3POSA 3V79C 3AYAA 1I1BA 2PHUA 4LBQA 1LOBA 3VT0A 1N1SA 2BQPA 2GNTA 2F2FA 2CTVA 2ZGNA 3RQ0A 3N35A 3WDXA 2D3SA 4ZGRB 1YO8A 1G9CA 1LU2A 4M3CF 4I8MA 1DZCA 1W6OB 2DREA 41BIA 1RIRA 1LOEA 4W65A 5JOWA 3JU9A 4M3CB 1FQ9A 2NM1A 1QOTA 1GICA 3IIRA 3OYWB 4LO1A 1PUUB 1SR4C 4QALA 3UJ4A 3AYCA 2AUYA 1JUIA 1LHWA 3BA4A 1MR5A 1F5FA 2OUJA 4YW3A 3JUTA 4M3CA 2P3JA 4H9WA 4IYBA 2LIQA 1ISZA 2VH9A 2DU0A 1YIFA 1BFCA 1AJKA 4ZFWB 2WLQA 3AFKA 3WDYA 2ZQNA 4DS0A 3ZC9A 1N1VA 3TB0A 2PELA 3SITA 1JT5A 4YZ5A 3O44A 5CB7A 4YZ2A 2D7RA 3B00A 1HQWA 1V6KA 2R49A 1DIWA 4F34A 4I4XA 2E4MC 4RA0A 3TAYA 3CQAA 3HMYA 2A75A 1WBFA 4XJWA 2D23A 1APNA 4A7KA 4DQAA 1UL9A 5T5PA 1W6QB 4U36A 4J2YA 3P6IA 3HOMA 1Q8PA 2XOAA 4USPA 3NV2A 5GZDA 3HALA 3W59A 4BPZA 4GXLA 1GSLA 4LO8B 2DRYA 2EXJA 3D6EA 4YLZA 2CL2A 1TIEA 1CONA 3NV3A 2DTYA 3OJBA 1RG8A 1FWVA 3VSFA 1AX1A 1HWOB 1AX0A 3RS6A 2JDZA 3ZX7A 3AP5A 1O4ZA 1AVWB 1G9BA 2D6OX 2I1BA 3AH4A 1NUNA 3NBDA 1AXYA 3FJ8A 4YG0A 3SH4A 1D2SA 3KM5A 2TEPA 3I4IA 1G9AA 4FQZA 1JT3A 3BAQA 1SBEA 1CR7A 2AYHA 3O4AA 1GZ9A 2A7AA 4FQ4A 5GLZA 3KMVA 3SLIA 3O0WA 2W08A 4YG3A 3QR5A 4ZLBB 3UD7A 1OFSA 3A21A 2E7TA 1ENQA 3Q7XA 2ZMKA 8I1BA 3FFZA 5LK5A 1QOOA 2D3PA 1ISVA 4YFZA 1R8OA 3I2XA 1KJRA 1V6VA 3Q9OA 1IOBA 4ZFUB 5D62A 2D22A 4I37A 1V6XA 4EFPA 5DG1A 3VUOA 3UD8A 1LESA 2FFUA 3ILNA 4L4HA 1H30A 4I2SA 2VLCA 5FNWA 1LCLA 1AVXB 4X37A 2PHRA 5F5QA 5FRAA 5FREA 2ESUA 2UWBA 3NBNA 4QD2B 2HW9A 1ISXA 1IS6A 4CZSA 1LULA 1XG6A 2WKKA 2EXIA 3RMXA 3Q7WA 4FPKA 3NBCA 3A22A 3F62B 3JUUA 2K4AB 5CA6A 1JHNA 2VW1A 3VKLA 5GZGA 1UMZA 2DUOA 2DVGA 3WCRA 2ZMLA 2MLLB 2E7QA 1DHKB 2FDBM 1OQ1A 1BFGA 5DUVA 5FZUA 2JKBA 1PZZA 4J2SA 1S0DA 1CJPA 3RTIB 3I2AA 2D20A 2DVBA 1AX2A 1LHUA 4EB2B 3O12A 5EYXA 1A78A 1BASA 3FJHA 1JXNA 1EPWA 2MIBA 4OEGA 1Y7BA 3WG2A 3WMVA 1WLCA 3CA1A 9ILBA 1OQLB 4XFUA 1AF9A 4D69A 5E88A 1LJ7A 1LEDA 1QDOA 2WNEA 3ZXLA 1QNWA 3POKA 4I4YA 3VKMA 1MACA 1BFBA 1DQ4A 1YTOA 1MS1A 3WINC 1C4RA 4GAIA 4OUJA 5E89A 1IS3A 4GA9A 5GLUA 1SCRA 2GN3A 2HWAA 2DVDA 3AX4A 1DZQA 1MS4A 1OKQA 1LOFC 3UJ0A 3LTQA 1SLLA 4XHBA 1C57A 4G9NA 4HL0A 1SR4A 3B9UA 3OPZA 3AKHA 4YZ1A 3FJ9A 2WRYA 2ZKNA 4TYSA 5HCBA 5BQUC 3O0XA 1JOJA 2Y9FA 1LHVA 5JOYA 2ZGLA 4JC1A 2D24A 1XYFA 2ENRA 2YUGA 2ERMA 3T8SA 2ARBA 4UW5A 3AZZA 1Q8SA 4K1YA 4YGCA 1J1TA 1U0AA 1A8DA 4AWDA 3CA0A 2NMNA 2YZ4A 4KBBA 5B2HA 1V6UA 3WO3A 2Z49A 2NVHA 3POWA 1HQLA 5EG6C 3VEQA 4UW6A 3ZSKA 2E4MA 1KJLA 4ZA3B 2D43A 4XBLA 1QNYA 4FOVA 3AZVA 2EIGA 2LALA 3WLUA 5F8WA 1WLDA 2UWAA 1BA7A 3WOGA 4IZEA 4ASMB 2EAKA 3WMUA 4KC3A 4Y20B 2P23A 4Q1RA 3O0VA 1IHKA 5EWSA 3FUQA 4DCKC 3IKWA 1WUVA 4ZFYB 3WDTA 3LSEA 2ZGRA 3AK0A 3I29B 1IOAA 4GWMA 4BLJA 4GKYA 2A6ZA 2QN4A 4EFQA 4M00A 3BAHA 2DTWA 5JLVA 4AGRA 4XZPA 2VSAA 3QLQA 2P2KA 7I1BA 3OY8B 1VALA 2ERFA 3WDWA 2BEAA 4CRQA 1F31A 1AXKA 4R9CA 1V6OA 3CAHA 5IT6A 1V6MA 4Z8BA 5F8SA 2A71A 3WDUA 1LENA 4HA2A 1DQ6A 1LOCA 1MVQA 1HWNB 1UAIA 3M3CA 3AXDA 4FPJA 1N3PA 2ZAAA 3WZ1A 4WBCA 3IN9A 1DQOA 1ULDA 4YGEA 1S0IA 1DJSB 1Z0HA 2KH2A 5F8YA 3WO2A 4FPCA 2C5DA 1FN0A 3UJQA 4G9MA 3IM5A 4Q26A 3BA7A 4QD2C 4XDQA 5T54A 4BQ1A 5F90A 1FAYA 1Q8VA 1DYPA 1SLIA 1ONAA 2Y9GA 4WVWA 3O5WB 2UUSA 2MC2A 4Y24A 2GMEA 3H0OA 2R1DA 1II4A 4DEPA 4YZ3A 3M3QA 4I4OA 1URXA 1ULEA 4OWJA 5IK7A 1UZZA 2VXTI 3WUCA 3M3OA 2W68A 1Q8QA 4ATFA 4A7YA 3L2YA 5CAZA 2DU1A 2EF6A 2WT1A 3IMNA 1S1AA 4BLIA 4JRAA 3B69A 3PVOA 1JY0A 1VAMA 1LGCA 2Q3NB 2A3YA 4P0KA 3WHUA 3RRDA 1Q8OA 2D7IA 4HR6C 3BODA 2AGSA 4ZXKA 3ZXEA 2D3RA 2D6KA 2GALA 4OW4A 5GALA 2ARXA 4P9WA 1HKNA 2P3IA 3PUBA 4OZXA 4OEEA 4FPFA 3FLTA 3AJ5A 3AP4A 5BXRA 1WD3A 1MZ5A 1W6OA 2Z42A 3N7LA 4M3CE 3MEPA 3AH1A 1QKQA 2D6LX 4H55A 5CBLA 1SBFA 2XG3A 4I4PA 3OYWA 4I4SA 5H9RA 4A7ZA 5L73A 3FJBA 2DUQA 2E53A 2YROA 3CA5A 1BLAA 3BIWE 4IQPA 5DSSB 4FP2A 2UURA 1LU1A 3NWKA 5DZFA 1N3OA 1QOSA 3UL2A 2GN7A 1Q56A 1SZ6B 4QC4A 3PMEA 1B09A 3WINA 3CA3A 2FFVA 2NYYA 4GP0A 3ZSMA 1GZWB 1IILA 5BP5C 1N1YA 1W0OA 3NBEA 1LOFA 1C1LA 3N7JA 3ZXDA 3O5SA 3A0NA 1AVBA 3PVNA 5GZFA 4FPYA 5CNAA 4RL7A 1GZWA 1GBGA 1GZCA 1W6QA 4CTEA 3ASIA 4J2XA 4Y26A 5BQUA 1ITBA 1AVAC 3FJKA 2DWRA 2VXRA 4GALA 5BXSA 1VAVA 2V5YA 3AZXA 3IM6A 1MVEA 4EFRA 4Y1XA 4P6AA 2NN8A 3O4DA 2OW4A 3P53A 2CYFA 3FJFA 5IK4A 3AJZA 1MD6A 2R9KB 1PZ8A 2ZGQA 1DQ0A 4R9DA 4U2AA 2DRZA 4ZKTB 2ZGUA 1G82A 3N7MA 1G8WA 1RY7A 2KM2A 1A3KA 2Y9WC 3BX1C 5FZZA 3OJMA 1LEMA 5DZGA 3HBWA 4X39A 3C9ZA 1SLBA 3WG3A 1FNZA 2DUPA 3RG0A 4IY9A 3BOPA 3V0AB 4YM2A 2ZABA 1TTUA 1YF8B 2EXKA 4GAFA 4NOTA 1SACA 3F1RA 1AXZA 4JKQA 2NP0A 3E8LC 6I1BA 4Y22B 1KRIA 1TWMA 1DQGA 3IM0A 4DRRA 5HCAA 2VSEA 5T52A 5T55A 4SLIA 2QYIB 3O4BA 4I4QA 3VWCA 4LBQD 3V0AA 1M16A 1UN1A 3N0KA 4XE9A 2C9AA 2X2TA 4GP3A 5H9SA 4KEKA 4Y22A 4Q27A 2LIEA 3GALA 1XQNA 1I1EA 1IT0A 1BQPA 3WO4A 1KITA 1YI7A 2SBAA 3FJAA 1SLTA 1D0HA 5FNXA 2GNBA 4XIOA 3NV4A 3MPPG 4XHXA 4PF5A 4ISQA 1KDMA 4XXPA 5E8AA 3BA5A 1LODA 2ZGKA 4R9AA 1W6PB 4I30A 1W6NB 4P14A 1SCSA 2VW0A 2R0HA 1H9PA 4FPOB 3QYDA 1CVNA 2ZHNA 1UX6A 1NLSA 5KXCA 4ATEA 1W6PA 2WBCA 1W6NA 1W3GA 2A6WA 4Y1ZA 3O4CA 1RINA 3N3HA 4I3NA 4Z8SB 5I1BA 2ZBJA 2KLLA 4BOWA 1CIWA 4YW2A 4YGBA 4TLPA 2WQZC 1SFYA 4QBCA 1MS9A 2D6NA 3VKOA 2DURA 1T4QA 2HYKA 1WW5A 1ONKB 4JCKA 2D6MA 3USUB 3SISA 3WCSA 1C1FA 4ISRA 1ISWA 1EVTA 4XFSA 5KXEA 3H6RB 1BARA 3OJ2A 4QBVA 2R16A 2RQ9A 5IK5A 1JLXA 3RTJB 3UD9A 5DUXA 3PJQA 2E6VA 1FMMS 1LHNA 1WD4A 2A6XA 5BXTA 1FV2A 1WW6A 3BRFA 1V6NA 1G9DA 4D0ZA 1ENRA 1GLHA 1S0EA 4OWLA 3VT2A 3ZXKA 2PHTA 1ULFA 4QKSA 1NZKA 1JLYA 2P34A 3UK9A 3AXEA 1TEIA 4PQ9A 3V0BB 1QF3A 4YM3A 1Q04A 3NV1A 2V73A 2K8RA 4JQ0A 3IPVB 4P9YA 5EYYA 2NTDA 2ES3A 1ZA4A 5D63A 5E24E 3FLPA 3V0BA 3OGFA 3FGMA 3M3EA 4Q2FA 1IKQA 2JD4A 3P6JA 1JN2P 5IK8A 1ENSA 4K21A 1RMLA 3D5OA 1CPMA 4R9BA 1ABRB 1BLDA 4ITCA 4L8QA 2D1ZA 4LBMA 2JE9A 5BP5A 1MZ6A 1KQRA 1DGLA 4DPNA 2LTNA 3BAVA 3K1XA 2A5ZA 3M1HA 4PBPA 1Q1UA 31BIA 1WBAA 1V6JA 4K20A 3D4KA 4ZOTA 4LO0C 4XKIA 1WW4A 5DUWA 1W3FA 3CNAA 3T1MA 2ZHMA 1Z78A 3AP7A 1O4YA 3WV6A 4Y20A 3ZVXA 3A0KA 4X3AA 1N3QA 3POYA 2GZBA 2AENA 3FBYA 4Q1PA 3AKFA 4LO2C 3RSJA 5GM0A 4XTMA 4I1BA 2A6YA 1S0BA 4FOYA 3VKNA 1QQKA 1GGPB 3T2TA 4Q8LA 4TZDA 1FX5A 2RSTA 1IS4A 2ET2A 1WLWA 1BZWA 3OY8A 1MS0A 1ULCA 5JDBA 1JYIA 3MW3A 5BOWA 4CJMA 4JPZA 1V6LA 4FVVA 4EEEB 4LO3C 1N47A 5GJ6A 4AVSA 5FZYA 4X38A 3ZSLA 1WBCA 1AXMA 3A07A 2ZGOA 4DRVA 5H9PA 1S0GA 4OWKA 4XJAA 2GNDA 3NJ5A 5T5JA 1TOOA 3W9TA 3BADA 3B3QE 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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