4ISRA

Binding domain of botulinum neurotoxin dc in complex with rat synaptotagmin ii
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
422
structure length
414
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNDNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structures of Botulinum Neurotoxin DC in Complex with Its Protein Receptors Synaptotagmin I and II.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords Neurotoxin
total genus 94
structure length 414
sequence length 422
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4isrA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4isrA02
1WW5A 2VUAA 1QDOA 1WBFA 3C9ZA 4FPEA 1LHNA 4JCKA 3BA7A 3VT0A 4XJ8A 4BLIA 1S0EA 2WNEA 2D43A 4IY9A 4JRAA 4HANA 3BAOA 4A7KA 3IPVA 2GMEA 1DHKB 4Z8SB 2CWSA 5T52A 1H9PA 2MIBA 4GA9A 2ZHMA 2BFHA 2D6LX 1FN0A 4K21A 4X39A 1Q03A 3CAHA 4MYEA 1W6OA 4GXLA 1TOOA 4OUJA 2VU9A 1IT0A 1E0OA 2OUJA 5JVVA 5T5PA 5BXPA 1Z4SA 2MLLB 1NLSA 3O3QA 3VSFA 3CA1A 4ASMB 1GANA 4IQPA 1KDMA 2ZHLA 3FJKA 2LIEA 4YM1A 3OJ2A 4JP0A 2J3PA 1M2TB 5HCFA 4R6UB 2ARXA 1H9WA 2DU1A 4OEEA 2A3YA 4A7ZA 1LOCA 3PG0A 2A3XA 2K4AB 4LO7C 1ILR1 1VCLA 1FWUA 3WG3A 4IHZA 3FJCA 1F31A 2ZBJA 1I3HA 3MW4A 3BADA 4A7YA 5HPZA 1LOFA 2EXHA 3OJBA 3ILNA 4LO8B 5AVAA 1G82A 3IM6A 5BP5C 3FGMA 4LBOA 3S8JA 2ZMKA 4GOYA 1QOTA 1V6IA 3FUOA 2ZABA 2CL2A 2OW4A 2CYFA 1Q04A 4XHBA 3M3EA 3ZSMA 1AXZA 1IS4A 1ULGA 2JE9A 1DGLA 5FZYA 4I3NA 2Q9XA 5I1BA 2D3SA 1IS3A 1VALA 5LK5A 5DUUA 1ONAA 4J2KA 1JW6A 2NN8A 1EYLA 4H55A 2DURA 4TZDA 5GZEA 4I96A 3I2XA 3MW3A 2D6MA 4P0KA 2ZHKA 2JDZA 3WNXA 1VIWB 4PQ9A 5DZEA 3Q7YA 1JTCA 3ZSJA 3FJFA 2GN3A 4AGGA 2Q3NB 5KXCA 3AYEA 2JKBA 4M01A 4XTMA 3E8LC 4DCKC 2VW0A 3QLQA 1EV2A 3FFZA 4XBNA 5G00A 4LBLA 4YLZA 3UD8A 4IONA 3AP4A 4LO0A 4ZFUB 2LTNA 5T5OA 1W6NA 1Q8VA 3H0OA 1ISVA 5SV8A 2HWAA 5T50A 2QN4A 2V5YA 4GP3A 4K20A 4YGDA 1QGLA 4P9WA 1QOSA 1FMZA 5GLWA 2FDBM 4XHXA 1IOAA 2DVAA 3JRRA 4OWLA 4Q9GA 5DUYA 2UWBA 3R4SA 4Z8BA 1LOAA 4YZ5A 5JOXA 1AVUA 4HA2A 3N7MA 2W52A 4M3CA 3AZYA 4XFUA 5H9SA 3C2UA 1GZ9A 2ZGNA 3EF2A 4FPHA 4USOA 3OGFA 1WCSA 1MZ5A 2YROA 3POKA 3ATGA 1W6QB 1LGNA 1SCSA 1AX1A 3M3OA 3BAUA 1IOBA 5CAZA 3A0KA 4XFSA 4YFWA 2GALA 5IK4A 4KBBA 3WOGA 2WRYA 2PHXA 4FP2A 4BOWA 4P0LA 2EIGA 3WDXA 3WDYA 4FPGA 4AGRA 3POWA 3POSA 1V6XA 3ZXFA 2KLLA 1GZCA 1YO8A 1G7YA 4YOLA 1N1SA 1N1TA 2P3JA 5H9PA 2GMPA 2NZ9A 3CA6A 4I37A 3WLUA 1MACA 5F8YA 1MR5A 3MPPG 4OW4A 3OYWA 1FMMS 1S0CA 3UD9A 41BIA 4R9DA 4K1YA 3SH3A 1N3QA 4II0A 3DUIA 5F90A 1IRPA 2YY1A 1RG8A 4L8QA 1W6MB 1DQGA 3P6IA 3RTJB 2LALA 1AF9A 4YZ4A 5FNXA 1U0AA 4ZLBB 1S0IA 4JKQA 5KXBA 3B69A 3HSMA 1LOBA 3UJQA 1AZDA 4IZEA 4IZXA 1UZYA 1GZWB 1PUMB 1IKQA 4X37A 2EXIA 3V0BA 1EVTA 4XKIA 1CIWA 5GLZA 1W6PB 3V0AA 1V6UA 3W59A 5F8WA 1YIFA 5T55A 4FPJA 5GLVA 3FJIA 2CNAA 1QOOA 2NP0A 2FO1A 2BEAA 1LHUA 1LHWA 5T5LA 5DZFA 3B01A 2A6YA 2ZMLA 1LOFC 4P14A 1CPNA 5IK7A 1GBGA 2I2SA 3FJ8A 4I8MA 3ZSLA 2ESUA 3CA0A 3LLPA 1CPMA 3ZX7A 2A3WA 4LBQD 4G1RA 3AZXA 3WO2A 1JQZA 1V6VA 4YGEA 21BIA 2A7AA 3P6JA 3ENRA 4YW4A 2WKKA 3BRDA 2VLCA 2ET2A 2DVBA 1C57A 2DU0A 1DQOA 3CRHA 3AZVA 4XMAA 4GOVA 3HALA 3RQ0A 1IJTA 4L4IA 1V6KA 2A5ZA 2E4MA 3O4AA 1SBEA 2HW9A 2Z42A 4DQAA 4XZPA 3IAGC 3I8TA 3PUBA 3WO3A 3CRIA 3CU1B 4EFRA 3BA5A 3H6QA 4Q26A 1S0LA 3BIWE 4R9CA 1CN1A 3T8SA 5GM0A 1JBCA 4HR6C 1ZA4A 2VH9A 1LJ7A 4KEKA 2ZGOA 4BMBA 4XBQA 3PVOA 4DRRA 3WDVA 4JPZA 4I4PA 4YG6A 3V64A 4W65A 1G9FA 2RSTA 4LO0C 2D20A 1QNWA 4Y20A 4QBVA 4LBNA 3R05A 3UDAA 1V6WA 2W68A 2D7FA 4EFPA 2ARBA 3FJAA 1W3FA 3O5WB 1DBNA 3A07A 4XE9A 3ZPYA 2NTDA 3VT1A 1WLWA 1OQ1A 2D6PA 1XYFA 3HMYA 2F2FA 5DXDA 4CTEA 3ASIA 1VAMA 2VSEA 4P6AA 3OBTA 3N7LA 1BLAA 2DUPA 1Z78A 4AN7B 1YTOA 2KI6B 1WUVA 4FQ4A 3D5OA 1LULA 4ZGRB 2ZA9A 1N1VA 3OY8B 4QC4A 4XJ9A 2CY6A 3ZSKA 1TTUA 2EAKA 1DZDA 1LODA 4GWMA 1YRZA 1AFCA 1Q8QA 2WQZC 4I7IA 1BFGA 3CA3A 2NM1A 31BIA 1SLCA 5JOYA 2YUGA 4TLPA 1MS5A 1G9BA 4WBCA 1N1YA 4BMEA 3CA5A 3VUOA 1SLTA 1UKGA 1JXNA 1WLDA 1SBFA 4FOYA 1ABRB 1AVAC 3WDUA 4ATEA 1FAYA 3A0NA 4KEIA 4BQ1A 1Q8PA 1PC8B 2AREA 1JYCA 2OVUA 3H6SE 3INAA 1VLNA 1N3OA 2A6ZA 1HKDA 4FVVA 3AFKA 3FJBA 4QKRA 5BYNA 3VT2A 1C4RA 2XOAA 5GALA 1CVSA 1J0SA 3H6RB 4M3CF 2W39A 4EB2B 3CNAA 1DFCA 4UW5A 4LO3C 2AUYA 1CR7A 3SISA 1FNYA 1SLLA 2AFGA 4QBCA 3AH2A 4ZKTB 2DTWA 4XBLA 3SLIA 7I1BA 5IK8A 5JLVA 4ZOTA 2A6VA 3AYCA 4BLJA 4YZ1A 1DYPA 4FGFA 4FQZA 2AH2A 2H0BA 5FZUA 5IUQA 4XFTA 2AENA 4AYUA 4QALA 1DQ5A 1GKBA 1WD3A 3AKFA 5DZGA 2ZACA 1UMZA 2K8RA 1T9FA 1QNYA 2D3PA 4DEPA 1ENQA 4C1WA 2DRZA 1WW6A 1BKZA 3WUCA 1JHNA 2GZBA 5KXEA 5T5JA 4M3CE 1S0DA 1R1ZA 1T4QA 2R0HA 1MVEA 4HJJA 4XIKA 1TFMB 3I29B 1W3GA 3AJYA 1DJSB 1BJQA 2ZGTA 4UW4A 4PF5A 1Q8SA 2DVFA 4ZBVB 5L73A 4OWKA 1UX6A 1M16A 2EF6A 3NJ5A 4LBQB 3UL2A 4XIOA 4ZA3B 3F62B 4Y22B 2NVHA 3ZXDA 3ZXLA 4PBPA 1MD6A 4D0ZA 2ZZJA 3OJVA 1W0PA 1QMJA 3JUTA 2W08A 1G9AA 4DRVA 4I4RA 3AZWA 3M2MA 1IKPA 4Y26A 5HCAA 1SLAA 4WV8A 2WSUA 4Y1UA 1DQ0A 4H04A 1BFFA 1L2HA 4U2AA 3D4KA 4FPYA 2UU8A 2RHPA 3A4UA 4I1EA 3D6EA 3IKWA 3L2YA 2ENRA 4QKSA 1TIEA 2XG3A 1LOGA 3KQRA 1R8OA 2OUHA 1XG6A 1UPSA 3PJQA 3OGGA 1ZM1A 4GALA 3KM5A 5EYXA 4Q27A 4OEFA 4DPNA 2CWMA 1HQWA 1LGBA 1FX5A 1W6QA 1WLCA 2E7QA 3N0KA 3ZXKA 3VKLA 2XB6C 1LU2A 3WUDA 4CZSA 1KDKA 3LCPA 3AK0A 3RMXA 5HCBA 2P3KA 2WJSA 1MZ6A 4GKYA 2F8XC 1W3AA 1A78A 1AXMA 5GJ6A 4PBOA 5DUVA 3AXEA 4Y1YA 2WSVA 2M49A 5BXTA 3NBNA 3AJ5A 2I1BA 1V6JA 4H9WA 3NBEA 3PVNA 3M3CA 4LO1A 3WO4A 5FNWA 1S0FA 4AVTA 2ZQOA 2EXKA 2GMMA 3LSEA 5F5QA 3O0VA 4QD2C 1S1AA 1PZ8A 4I0YA 2D23A 3VSZA 4XXAA 1BYHA 1DZQA 3UJOA 5F8SA 5DVHA 1GYKA 1PZ9A 1D2SA 3TAYA 4AGVA 1LESA 1IRAX 2D3RA 1FV3A 4OEGA 1W6MA 3NWKA 2YV8A 1K5UA 2SLIA 2AGSA 2C9AA 1H30A 1NZKA 4OWJA 2AXMA 4M00A 5BVPI 3GNEA 4XYXA 2GNBA 4GAFA 1MS1A 4XOGA 3BA4A 1SZ6B 4PC4A 3AH4A 4Y1VA 4ATFA 1A3KA 1QQLA 1MC9A 1JY0A 1BXHA 1Q56A 1X50A 3OYWB 3F1RA 2R49A 3NBDA 4AVVA 1BASA 2R1DA 3ZC8A 3SNMA 1Q1UA 1SFYA 1BQPA 1KJRA 1MS0A 3O44A 4X38A 1AX2A 4Y1ZA 3V65A 5GAQA 2P23A 3WINA 1RINA 4XJZA 2D6KA 4C1XA 3OJMA 1DQ2A 4DENA 2P39A 4LO7B 3VWCA 4Q8LA 2UURA 1CESA 2DUOA 1KRIA 3V0BB 4F83A 2VW2A 3WDWA 4U36A 2MC2A 1PZZA 3NBCA 1ITBA 3V0AB 2EALA 5E88A 4WZFA 2BQPA 4D8HA 3MALA 3RSJA 3AJZA 4FOVA 3A22A 1V00A 3FUQA 1FATA 3DGTA 1EPWA 4JKXB 1DIWA 1LEDA 1AVXB 4P9YA 3IMNA 2ZGSA 3O4OA 3USUB 1QU0A 2NMOA 3SH4A 4I4QA 5EHAA 3WVJA 4BM8A 1TWEA 1D0HA 2ZMNA 2Z48A 2Z49A 1BLDA 2VXTI 3Q7WA 2PHTA 4I4UA 4J23B 1MS9A 3JUUA 3VKOA 3AP9A 1GICA 4G9MA 1JT4A 4I1BA 4IYBA 1V6NA 2HYKA 1BA7A 3RG0A 3BOPA 4USPA 4R9BA 3SH5A 1JUIA 4Q1RA 4WVVA 4RA0A 4AVSA 1SCRA 2HZ9A 1AVBA 3GALA 3IM5A 3IM0A 1JOJA 3HOMA 2PHUA 4LO2A 3HR9A 3QYDA 3NV3A 1PWAA 1ENSA 5EG6C 5JOZA 4Y24A 3I2AA 4I6IA 5EC5A 2RG9B 3RRDA 2ZGPA 5EYYA 3VKNA 1ENRA 1O4ZA 1HLCA 4I30A 2B7YA 1ULEA 1I1BA 4XILA 4GP0A 8I1BA 4R9AA 1ISZA 5GZGA 2D44A 1R8NA 3AKHA 1FYUA 3PHZA 3OY8A 1JT3A 4XJUA 2BEBA 3P53A 3B9CA 4UW6A 1NUNA 4ISQA 2PHFA 3PVEA 1UN1A 3WZ1A 4P9XA 3A21A 4CRQA 4DFSA 2R9KB 1HDKA 5GZCA 1DFQA 2R16A 2SBAA 2ZGQA 5BXRA 2FGFA 4FOQA 3ZXJA 4P0JA 3B00A 9ILBA 3K1XA 2D6OX 4XTPA 1KNMA 1TP0A 3AZZA 2UUSA 5CA6A 1GGPB 2VXRA 1Z2VA 3B3QE 2LIQA 2WT1A 2JJ6A 2FFVA 4LBMA 1WBLA 2AR6A 3O12A 1F9KA 3AH1A 4LO1C 1ULFA 1JYIA 1LCLA 1XQNA 1MVQA 4YFZA 4CJMA 2GDFA 1LTEA 4QD2B 5H9RA 3T1MA 1OFSA 1C1FA 1AX0A 2CTVA 1GLHA 2NYYA 1WBCA 1N3PA 1C1LA 1PUUB 1LHVA 1S0BA 3APBA 6I1BA 1W0OA 5B2HA 1FV2A 3TC2A 3O49A 3N7KA 1IS5A 2ZAAA 3IPVB 2E51A 2K43A 3H6RA 5D61A 2E53A 4Z9WB 5T54A 4XMIA 1ULCA 3BODA 1WD4A 3HN1A 2ES3A 4FPCA 4J2XA 4Q1PA 4ZFWB 3AP5A 5GLUA 1W6OB 3B9UA 3WA1A 4SLIA 4YZ3A 2Y9WC 2DWRA 2VY0A 3AXDA 2DRYA 1YF8B 1RIRA 3CQAA 3O5SA 2Y9GA 4EFQA 2P3IA 1SR4A 5D63A 2PHRA 3OBRA 2TEPA 5CB7A 5JDBA 2P37A 4HL0A 4I4VA 2PELA 4GWNA 2JECA 3WINC 2Y9XE 3O4BA 5D62A 5BOWA 5FREA 5H9QA 1N47A 1AJKA 2AYHA 1HIBA 1JN2P 1APNA 3KMVA 3LTQA 2WLQA 4ENDA 5BQUA 2Y9FA 1Q8OA 3O4DA 2KI4A 3WMVA 2UWAA 3AKIA 1PZ7A 3WG2A 4Y1XA 4LBQA 1DQ6A 3LSDA 4J2SA 4Y22A 2WT0A 1O4YA 1A8DA 3WCRA 2V73A 4YM3A 2D24A 1AJOA 3BAQA 3I4IA 2GO2A 2Q5TA 3Q7XA 4Q2FA 2KH2A 4OZXA 4FPFA 3FLRA 1AXYA 3VV1A 2ZGUA 2AAIB 4YW3A 1CONA 4LBJA 2E4MC 1VAVA 4FP3A 2JD4A 3ZYRA 2P2KA 1DQ1A 3NV2A 1UAIA 3FBYA 2A6XA 5EXOA 3VKMA 2ZGLA 1BZWA 2ZGKA 1F5FA 1DQ4A 3MEPA 3N35A 1URXA 4XXPA 3A23A 2IWTB 1YI7A 3VEQA 4D69A 3AP6A 4UW3A 1RMLA 1KITA 2EXJA 3O0WA 1OQLB 4I4SA 2L5XA 1AXKA 1ISWA 1W6NB 4LO2C 4YGCA 4EKXB 3UJ0A 3ZYPA 4EEEB 4I4XA 3W9TA 2R0FA 2D6NA 2ZQNA 3FLTA 5IT6A 1HWPB 1JT7A 3W58A 2F2FC 1HCEA 3FJJA 1P63A 5BXSA 3FLPA 3QCWA 4Q9PA 5FRAA 3ZXGA 1V6MA 1II4A 4G6JA 3ZC9A 1CJPA 4K1ZA 4M3CB 3NV4A 2A70A 2D1ZA 3AKGA 1QDCA 5GLTA 4YG3A 2FMDA 3N7JA 1ISYA 1ONKB 3O4CA 1WW7A 2DVGA 1TWMA 2P34A 4I4YA 4JQ0A 1UZZA 2A6WA 2DUQA 3V79C 2D7IA 2YXSA 4J2YA 3CA4A 3RTIB 2C5DA 1MS3A 1G86A 3WDTA 3BRGC 2E7TA 1G9DA 3MW2A 2X2SA 1CVNA 3T1LA 4YW1A 4GAIA 1V6OA 1G9CA 3BAVA 1LECA 4X3AA 4I4OA 1JLYA 1FWVA 4LBKA 3WCSA 5DZUA 2ERFA 2E6VA 2R1BA 1XHBA 2DREA 4G6MA 3AJ6A 3M3QA 2QYIB 2X2TA 4YGBA 3WHUA 2G4IA 2WBCA 5DUXA 1LEMA 1IILA 1UL9A 1GZWA 1QF3A 3BTAA 5JMCA 1SLBA 4D0TA 4IY8A 2DV9A 1BARA 3UJ4A 4ZFYB 1YBIA 1YYNA 3ZXEA 1W6PA 1NXD1 1ISXA 3IM7A 5CNAA 3SNVA 4BPZA 2ERMA 4LO3A 3AX4A 2HWMA 2RQ9A 3AP7A 1LENA 1WBAA 4QO3A 4AN6A 3N3HA 3BX1C 5DG1A 4I2SA 4XJWA 3SITA 1XZZA 3IN9A 3ILFA 5DUWA 4PCRA 2JE7A 3IIRA 1HQLA 1LOEA 3PMEA 1SR4C 5EWSA 1B09A 2DYCA 1SLIA 3WHTA 5BP5A 1JLXA 4KC3A 3D7WB 1ULDA 2NMNA 1HWOB 1QXMA 1OKQA 1BFCA 1RITA 2ZKNA 1SBDA 1V6LA 1HCDA 1QKQA 3FJEA 3USUA 2KM2A 1RZOB 5BQUC 4F34A 1JT5A 2IHOA 5GZFA 3O0XA 4FOWA 3JU9A 2WT2A 3WV6A 4YM0A 1KJLA 3AYAA 1QQKA 4YG0A 1BFBA 2ZGRA 1MS8A 4GKXA 5E8AA 3CRGA 1YXWA 1FQ9A 1DLLA 1KQRA 1LGCA 4JAWA 5F9TA 4XDQA 1J1TA 1DZCA 1S0JA 1GV9A 1N4KA 3RS6A 1CQ9A 1GSLA 4G9NA 2GNMA 1GNHA 3UD7A 1LU1A 5KXDA 3U4XA 3AYDA 3ZVXA 3BAGA 2VSAA 4YM2A 4RL7A 4XJAA 1TEIA 1S0GA 3BB2A 2ZHNA 2FFUA 2GN7A 3VKFC 4YW5A 5DSSB 4ISRA 2ZGMA 1LHOA 3BRFA 2DVDA 3N36A 4TYSA 1WW4A 3HBWA 4ZXKA 1MS4A 4Q91A 2GNTA 4L4HA 2D7RA 1FNZA 5IK5A 4FPLA 4Q8KA 2YMZA 2DS0A 3FJDA 1G8WA 2A75A 2AQZA 4ITCA 3WG4A 3POYA 5DG2A 4JC1A 3ILRA 4DS0A 4NOTA 2UWCA 5CBLA 3T2TA 3RMYA 2YZ4A 4Y20B 2A71A 3M1HA 3Q9OA 4NO4A 3ILAA 2PHWA 4AWDA 4YW2A 3OPZA 4FPKA 3WG1A 2FHRA 3NV1A 1Y7BA 4KEJA 1IHKA 3R4UA 3BAHA 5E24E 2DTYA 5GZDA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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