4JRAA

Crystal structure of the botulinum neurotoxin a receptor-binding domain in complex with the luminal domain of sv2c
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
421
structure length
416
Chain Sequence
TSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis for recognition of synaptic vesicle protein 2C by botulinum neurotoxin A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 93
structure length 416
sequence length 421
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2013-03-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4jraA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4jraA02
2EXIA 1KITA 4YGEA 1IS6A 4WV8A 2WT2A 2NTDA 1UZZA 3FJ9A 4EFPA 8I1BA 2FDBM 2P3JA 2ARBA 3OYWA 1EVTA 4XE9A 3NBNA 3V64A 1QNYA 4AVVA 5GLZA 3CA4A 2GNMA 3AYCA 1LOFC 2WSUA 5F8SA 1LGBA 1C1LA 1GLHA 1XZZA 1W6MB 4UW6A 3N7LA 2RSTA 1FV3A 3POSA 3DGTA 1FATA 3AYAA 5DG1A 4IQPA 5D63A 1GSLA 4P9WA 3ZC8A 3CNAA 3TC2A 2V73A 5F90A 2VLCA 3IN9A 3VKNA 5IT6A 1JHNA 4Q9PA 2JECA 4AGRA 2V5YA 4I8MA 2ZGRA 1Z0HA 4IY9A 2OVUA 4I1BA 1Y7BA 1MVEA 3HR9A 4Q8KA 1LTEA 1BFCA 5E89A 1JLYA 1WCSA 5JOXA 1XYFA 1SLAA 5BXSA 2ZACA 4Y26A 4DEPA 4YZ3A 1JT4A 5DXDA 3UJOA 2MLLB 1YO8A 3AZXA 3ZSLA 31BIA 1Q1UA 3WINA 5BXPA 3O0VA 5GLUA 3H0OA 2ZR1B 1SBEA 4LO0C 3HMYA 4A7ZA 2DURA 3F62B 4GALA 3FJHA 1G82A 4TYSA 2TEPA 4LO3C 3TAYA 2D6MA 1ISYA 1ONAA 1XG6A 3INAA 1IOAA 3AZWA 4I4YA 1IS3A 2Y9FA 1FWUA 1N1TA 4P0LA 1G9BA 3VT0A 1V6IA 1AXKA 1BFGA 1CVNA 1T9FA 1V6VA 3USUA 2VU9A 1DQ6A 2F2FC 5T5JA 3AX4A 4OUJA 3RSJA 4LBKA 4DENA 3LCPA 4M00A 5CAZA 3VSFA 1S0JA 1MZ5A 2ZKNA 1IKQA 3T1MA 4Y1XA 2NYYA 2D6NA 1JY0A 1GICA 1SZ6B 4Y20B 2D3SA 4P9YA 4J2YA 1SR4A 4CRQA 1SCSA 4F34A 2D6KA 1N1SA 4Y22A 4YZ5A 2KLLA 2ET2A 3AP5A 2FFUA 3O5SA 5KXCA 4GOVA 1V6UA 2X2TA 1Q8VA 3ZXKA 4Z8SB 4C1WA 2ERMA 3W9TA 4XFTA 3AP9A 4WVVA 4I4QA 4FPCA 1JBCA 3RG0A 3SH5A 5SV8A 1S0IA 1G9DA 1Z2VA 1S0DA 1LHNA 1DQ2A 1LHVA 3M3EA 3O12A 4XKIA 2CL2A 7I1BA 4JKQA 2MC2A 4XJ9A 1ULFA 3BRDA 4PCRA 1WLCA 4FOVA 5JOWA 4TLPA 3FLPA 2A7AA 1TWMA 1SACA 4ISQA 5GLWA 4FVVA 5E24E 1W6MA 4YGDA 3PVEA 4R9CA 1FX5A 2OUJA 1W0PA 1IRPA 4XOGA 5H9PA 5I1BA 1DQ1A 1UN1A 3BAGA 1KJRA 3VEQA 1I3HA 3AP4A 3I4IA 4XBLA 4IZXA 3AH4A 1AX0A 2EIGA 4YGCA 1GYKA 5T54A 3WNXA 1ULDA 3GNEA 2GZBA 3A0KA 1MS9A 4K1ZA 1WW6A 4AGGA 3ZXEA 1UZYA 1LU1A 4IONA 1SLCA 4Q91A 4XMIA 1Z78A 5F8YA 1RITA 4K20A 4DCKC 1FNZA 2DS0A 2DUOA 3K1XA 4H9WA 3PVOA 2HW9A 3IPVB 1R8OA 4YG3A 4MYEA 4AVSA 4QC4A 3V79C 2WT1A 4M3CF 3MALA 1HQLA 4XDQA 1ZM1A 3OY8B 1II4A 2D7IA 1LOEA 3FJ8A 3T2TA 2EF6A 4GP3A 3M3OA 3BA4A 3PG0A 1ISXA 2D24A 4M3CB 1I1EA 3VKOA 5GLTA 2Z48A 1AXZA 2OW4A 1QQLA 2ZMKA 4LO1A 1PUMB 2A75A 4L8QA 3AK0A 1AZDA 3WDXA 3KMVA 2A3WA 3RTIB 4WZFA 1MD6A 3WCSA 3ENRA 1FV2A 1U0AA 1HKNA 2D7FA 4YFZA 3AXDA 1Q8PA 4ASMB 3RTJB 3BAOA 1Q8SA 3NV2A 2UU8A 3BAHA 3FJAA 3POYA 3MW3A 3UL2A 1N3OA 3WO2A 3UD7A 2VW2A 5GM0A 2PHWA 2QYIB 3IM6A 4FPHA 2D6LX 2WJSA 4IY8A 4YZ1A 1VCLA 5DUVA 1V6OA 4GKXA 4DRVA 4P0JA 3WMUA 3WLUA 2GNTA 1VALA 2NMOA 4YG6A 3D4KA 2MIBA 3AJ5A 3UDAA 2R0FA 1TFMB 4C1XA 2AUYA 2EAKA 2D43A 2DYCA 3BX1C 4FPEA 3ZXGA 1D0HA 4I6IA 4ZFYB 5EG6C 2Y9GA 5BP5A 2ESUA 4XTMA 3VSZA 3R05A 1HWMB 4DPNA 4FOQA 1OQ1A 2ZGUA 3QCWA 1WD4A 4G6MA 1DQOA 2WNEA 4AN6A 4TZDA 3GALA 5IK5A 2ARXA 4XJUA 1DFQA 2GMEA 4DRRA 1JXNA 3FJJA 5DZUA 4YW2A 3FFZA 1MS4A 1KRIA 4Y1YA 4P0KA 4XFUA 3B69A 4M3CE 2R16A 2WBCA 1G7YA 2LTNA 2DVBA 1GANA 4G6JA 4BMBA 4QD2C 2D3RA 3WHTA 2ERFA 1L2HA 4XFSA 1JYCA 3QLQA 3SITA 3FJKA 2KI4A 3WOGA 1LOCA 1DZDA 1ONKB 4YM1A 4LBOA 3O0WA 4LBQB 1AJOA 4LBLA 3EF2A 3IMNA 2K43A 1MACA 2Q9XA 1IS4A 2W52A 4OWLA 2LIEA 1FMMS 5GLVA 4ITCA 2D22A 1GZCA 1ULGA 3NWKA 3RMYA 2R1DA 3LTQA 2JD4A 1QOTA 1PZ7A 3B3QE 1CE7B 1ENQA 1HQWA 1BKZA 4QO3A 2P3IA 3IPVA 2D6OX 2LALA 2NZ9A 3PHZA 1KDKA 2P3KA 1CPNA 1ENRA 1DLLA 3OY8A 1AVWB 3BAUA 4XJWA 3FJFA 1IOBA 1F31A 3MW2A 3CA0A 1HWOB 1W3FA 1UKGA 1BLDA 1NXD1 4I4SA 4M3CA 3WCRA 5BQUA 3SNVA 3BIWE 4EFQA 1KDMA 3ZXDA 1LHUA 3SNMA 4LO2C 3M1HA 3SH3A 2DUQA 4ZFUB 1UMZA 4BM8A 2XOAA 4YW5A 1YTOA 3CA3A 1GBGA 5IK8A 5KXEA 1FAYA 4XILA 1SBFA 1V6XA 2UUSA 2AGSA 2P34A 4D0ZA 3Q9OA 1N47A 3DUIA 3ZSKA 1GZ9A 1URXA 1IKPA 1Q04A 2AQZA 3A22A 3O4DA 4GXLA 1SLBA 1R1ZA 3Q7XA 4XIKA 3V0BB 3E8LC 1LODA 4PBOA 1S0CA 2WKKA 4GOYA 1J1TA 2ZHLA 1SLLA 2ZQNA 2ZGNA 2XB6C 1TEIA 3C2UA 1SLTA 4LBNA 4D69A 2WSVA 2JE7A 2D7RA 1N3QA 4YG0A 4I4UA 4FPFA 5FZUA 4KC3A 2D20A 3R4SA 4ZFWB 1HDKA 3CA6A 1PZ9A 1AVUA 2DRZA 2ZMLA 4HJJA 1W6OB 1JYIA 3WO3A 5JOYA 3PMEA 2W39A 4Q8LA 2ZHMA 2A3XA 1N4KA 1LEDA 4EEEB 3CAHA 1QKQA 2P23A 2PHRA 2D44A 3V65A 2AAIB 3BAVA 4FPKA 4Q1RA 5H9SA 3VT1A 2E7TA 4YM3A 2WQZC 1HCEA 3O4OA 1XHBA 1FN0A 5FZYA 2UWAA 3OJMA 1W0OA 4GWNA 2FO1A 2W68A 2HZ9A 4KEJA 2KH2A 5FRAA 1GNZA 3VKFC 2A6ZA 5T5PA 3ATGA 1G9AA 1YXWA 5IUQA 5CBLA 4M01A 3OJBA 4I0YA 3ZYRA 4L4HA 4YM0A 2GO2A 2BQPA 1ULEA 1IRAX 2YMZA 4XBQA 2WT0A 3S8JA 4X39A 3V0AB 4XHBA 1BA7A 2GNBA 1R8NA 2AENA 2NP0A 4USOA 1ILR1 2NVHA 3SISA 2D1ZA 5EYXA 2I1BA 2AYHA 4YZ2A 2HWAA 6I1BA 1DYKA 1N3PA 2Y9XE 4XXPA 1LU2A 3APBA 3POWA 2ZHKA 3N7MA 1RIRA 3WG3A 1MS0A 1BJQA 1CR7A 4J23B 4BMEA 4JCKA 2E7QA 1PWAA 4ZBVB 1S0LA 2NMNA 1RG8A 3ZSMA 1K5UA 3BODA 2BEAA 3AKFA 4CTEA 3OBTA 3BA5A 4I4PA 3AKHA 1LOAA 5DZEA 2K4AB 1YF8B 1LHWA 4DFSA 4II0A 3CRGA 5BXRA 2YXSA 5BYNA 2A3YA 3AJ6A 3FUQA 3AP7A 2AFGA 3OJVA 3BAQA 4FGFA 1IHKA 3QR5A 1TP0A 1LJ7A 3WO4A 4HA2A 1V6NA 3IIRA 2B7YA 4FPGA 3I2XA 1EYLA 41BIA 1LHOA 3OBRA 1MS8A 2P37A 3Q7YA 3UK9A 4I3NA 1J0SA 3UD9A 1QGLA 1W3AA 4AGVA 4Q27A 3UJ0A 1GNHA 2ZABA 3AH2A 3ZXJA 2E4MC 4Y1ZA 3A21A 5FREA 1CN1A 1CONA 2J3PA 1LGNA 1AF9A 2Q5TA 4GA9A 1H9WA 4FP3A 3O3QA 1DQGA 1IILA 3RMXA 3N7JA 4JPZA 3Q7WA 3N0KA 4ZLBB 3V0BA 2DUPA 4GWMA 4Z8BA 1WUVA 3WHUA 5F9TA 4ATEA 1SLIA 2JDZA 1LGCA 3AKIA 5FNWA 4J2KA 3ZYPA 1BFFA 4PBPA 1T4QA 1G8WA 1KNMA 3H6RB 4I30A 4Q26A 1W6OA 2SBAA 1CJPA 4K1YA 3MEPA 4Z9WB 1AFCA 1KJLA 1ENSA 2QN4A 2ZGMA 3RQ0A 1S0FA 1UPSA 4IYBA 4BOWA 3KQRA 1JQZA 2C9AA 3W59A 5T50A 4UW3A 1WBLA 2KM2A 4JC1A 4I37A 4OWKA 3JUTA 1D2SA 2CYFA 1QU0A 1G9FA 1YI7A 5H9QA 4OWJA 2ZGKA 3NV3A 1DYPA 3V0AA 1DQ0A 3WINC 4FPYA 1W6PB 1UX6A 4LO0A 4Y20A 2RHPA 2ZBJA 4GAIA 3PJQA 4I1EA 1QDCA 2AREA 4I4OA 4A7KA 4SLIA 4LO3A 3WG1A 3RRDA 1RY7A 3WUCA 3ZVXA 2FMDA 1WD3A 3AXEA 1GZWB 1ULCA 3AYEA 2FGFA 1YIFA 4XYXA 1OQLB 2A6YA 2A6XA 5GZEA 2EALA 1W6NB 2G4IA 3IAGC 5HCFA 3B9CA 3LSDA 1BQPA 4XJAA 1S0BA 2F2FA 3LSEA 3HALA 1LENA 4LO7C 4WBCA 3O49A 3AP6A 3BTAA 3CRIA 4KEIA 2ZGTA 2ZQOA 3A23A 1OKQA 3MW4A 4HANA 3ILNA 3O4CA 2CWMA 3UJQA 1VIWB 1IJTA 1SR4C 2VH9A 2RQ9A 1SBDA 4ENDA 1CPMA 3B01A 2AXMA 2ZHNA 4Q9GA 1V6MA 3H6QA 4L4IA 3FGMA 4DQAA 2DU1A 2ZMNA 3FUOA 5DVHA 4H55A 3IM0A 1N1YA 3M2MA 3PUBA 1M2TB 1V6LA 1QNWA 1A8DA 2BEBA 1W3GA 1AVBA 3ZC9A 4J2SA 3OGGA 3FJCA 1RZOB 5B2HA 1UL9A 2Z42A 2E6VA 2DVDA 2BFHA 1K5VA 5AVAA 1MVQA 2WLQA 1AX2A 1KQRA 2PHXA 3MPPG 1HKDA 4HR6C 1ISZA 2D23A 4U2AA 3NV4A 1CVSA 4CZSA 3FJIA 4JRAA 3CA1A 1EV2A 2A5ZA 5EC5A 2F8XC 5GZFA 1Q03A 5BVPI 4KEKA 1V6KA 4FP2A 1S0GA 1ISVA 2K8RA 4GKYA 3H6RA 1BXHA 1BYHA 4FOYA 3AZVA 1ABRB 5JLVA 4OEFA 1GGPB 2DVAA 1LOGA 5BOWA 4JKXB 1FYUA 4QBCA 2ZGPA 4G9NA 3I2AA 3TB0A 1SFYA 4DS0A 3C9ZA 2JKBA 2GN7A 4ISRA 4FQZA 1AXMA 2EXHA 4OEEA 3WG4A 3A4UA 2A71A 1UAIA 3CRHA 3R4UA 1BASA 1Z4SA 5LK5A 1AX1A 3T1LA 3WDTA 2Y9WC 2VY0A 2UWCA 4R9DA 5GAQA 4GP0A 2VXTI 3VT2A 3CQAA 4KBBA 2LIQA 2PHTA 4H04A 1W6PA 3WV6A 1WBAA 5F5QA 4ZA3B 5EHAA 4LBJA 1DQ5A 2E51A 5E8AA 4BPZA 3O5WB 2OUHA 2ZA9A 3VWCA 4ZOTA 2DVGA 4JP0A 1JUIA 1NLSA 5GALA 1XQNA 3LLPA 3U4XA 1WLWA 5DUXA 4IZEA 4LO1C 1AXYA 1IT0A 1MR5A 4J2XA 3ZX7A 5DUUA 4OZXA 1GZWA 1MS3A 2A70A 4YZ4A 3ILFA 3D7WB 4PC4A 1EPWA 2EXJA 1JN2P 2A6WA 3B9UA 2HYKA 4YFWA 1W6NA 1DQ4A 1LECA 4W65A 1HIBA 1DGLA 1W6QB 4D0TA 1V6WA 1HWPB 2PHUA 1ITBA 2DWRA 3AZZA 2ENRA 1C4RA 3SH4A 3AJYA 4F83A 3ZSJA 1YBIA 3NJ5A 4EKXB 2CY6A 4P9XA 2GMMA 1BFBA 3BB2A 3O4BA 2YUGA 3A07A 1P63A 4P6AA 3CA5A 3ILRA 2Z49A 1AJKA 1DFCA 1FMZA 4XBNA 1C1FA 1H30A 1DHKB 1WW4A 2FFVA 2VXRA 5DUYA 5EWSA 2UURA 3OGFA 1E0OA 1Q8OA 3ZXLA 21BIA 3UJ4A 4OW4A 3N7KA 4QBVA 3FJBA 2ZGOA 3M3QA 4R9AA 5BP5C 5FZZA 2JJ6A 5T55A 4AN7B 5D62A 4LBQA 2YY1A 4IHZA 1F5FA 3VV1A 3I29B 4XHXA 2ZGSA 2HWMA 4PF5A 4YM2A 1NZKA 4WVWA 1TOOA 5CA6A 1LESA 4PQ9A 3O44A 4ZKTB 4RL7A 4Y1UA 1B09A 5FNXA 4R6UB 3F1RA 4JQ0A 1WBCA 3FLTA 3N36A 4X38A 3L2YA 2KKIA 3HN1A 2VSEA 2RG9B 1X50A 1OFSA 2ZZJA 4U36A 3FJDA 5DZGA 2DRYA 3S8KA 1LOBA 2AH2A 1BZWA 3P53A 2R9KB 2P2KA 3HOMA 5CNAA 5EYYA 2PELA 3NBCA 5DSSB 3ILAA 3O0XA 1VAVA 2W08A 2EXKA 5HCBA 1G86A 4X3AA 1N1VA 3IKWA 1PUUB 3BOPA 4QKSA 3SLIA 4GAFA 1FNYA 3BRFA 2WRYA 4LBQD 3VUOA 4YW4A 2I2SA 4FQ4A 4YW1A 2R0HA 1A3KA 1PZ8A 1DBNA 2E53A 4EB2B 1LEMA 4UW4A 1YYNA 3P6IA 4G1RA 5HPZA 2R49A 4R9BA 1TIEA 1DZCA 2ZAAA 2DTWA 3N3HA 2VW1A 1G9CA 1WBFA 4ZXKA 3NV1A 5T52A 3WG2A 3FBYA 4FOWA 2R1BA 3WUDA 3VKLA 3AH1A 1WLDA 4BQ1A 4AVTA 1NUNA 5BQUC 3OPZA 4I96A 5T5LA 4YLZA 3RS6A 5IK7A 2IWTB 3QYDA 3NBEA 1LOFA 4HL0A 2P39A 4XZPA 1BLAA 3VKMA 1ZA4A 3T8SA 1RINA 4LO2A 1JT3A 4G9MA 2IHOA 3HSMA 3ZPYA 1A78A 5GZCA 1W6QA 1QXMA 1WW7A 1Q56A 1WW5A 4XTPA 2PHFA 4D8HA 4ATFA 1IS5A 1V00A 9ILBA 5BXTA 5JDBA 5IK4A 1JTCA 3FLRA 3P6JA 1CQ9A 2JE9A 5KXBA 4P14A 4USPA 1QOSA 1PC8B 1VLNA 3AZYA 3JRRA 2X2SA 4LBMA 3FJEA 3AKGA 2YV8A 3W58A 1MS1A 4FPLA 2NN8A 1RMLA 3OYWB 2GMPA 1JOJA 1DIWA 3ZXFA 4BLJA 3BADA 3AJZA 2A6VA 5G00A 1MS5A 1FQ9A 3M3CA 3WDVA 4X37A 2FHRA 2GDFA 2GNDA 4Y24A 1BARA 3AYDA 1QQKA 2Q3NB 3CU1B 5F8WA 3IM7A 4AWDA 5JOZA 1C57A 1TTUA 1V6JA 1QOOA 4I7IA 5DG2A 3D5OA 4EFRA 2XG3A 3B00A 1JT7A 4XXAA 1FGAA 1VAMA 1SCRA 5DUWA 2GALA 2YROA 2ZGQA 5EXOA 4XIOA 1DJSB 2DU0A 1F9KA 1CIWA 2CWSA 5D61A 4FPOB 4I4RA 3UD8A 2C5DA 4JAWA 2KI6B 3WZ1A 1O4YA 2GN3A 1MZ6A 3POKA 3JUUA 1YRZA 4QKRA 1APNA 4NO4A 4XJ8A 5GZDA 1AVAC 4LO8B 2VUAA 4I4VA 1AVXB 2CNAA 2NM1A 1LULA 1S0EA 1MC9A 1HLCA 2D6PA 4XJZA 4K21A 2AR6A 4Y1VA 1QF3A 4NOTA 3O4AA 4QALA 1ISWA 1JLXA 3IM5A 5GZGA 1CESA 3I8TA 2M49A 3AFKA 3PVNA 4BLIA 4CJMA 2VW0A 1JT5A 1GV9A 4AYUA 2UWBA 1HCDA 4A7YA 4I2SA 1DZQA 1HWNB 1FWVA 1I1BA 4FPJA 4OEGA 3WVJA 3NBDA 3WDWA 3OJ2A 3A0NA 2ES3A 5CB7A 5JMCA 2DVFA 3BA7A 3WDYA 3HBWA 3JU9A 3KM5A 4XMAA 3N35A 3USUB 5DZFA 1TWEA 5H9RA 4UW5A 3WMVA 4Q1PA 2YZ4A 4LO7B 1PZZA 1LCLA 1QMJA 1JW6A 3WDUA 2DTYA 2CTVA 2L5XA 5L73A 1M16A 2SLIA 5HCAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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