4JRAA

Crystal structure of the botulinum neurotoxin a receptor-binding domain in complex with the luminal domain of sv2c
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
421
structure length
416
Chain Sequence
TSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis for recognition of synaptic vesicle protein 2C by botulinum neurotoxin A.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
total genus 93
structure length 416
sequence length 421
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2013-03-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4jraA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4jraA02
1DQ4A 2Q5TA 1DYPA 1Q8SA 1ONAA 4LO3A 2GMPA 2UURA 5EYXA 3TAYA 4OEGA 3O0WA 4X38A 4FPJA 4IYBA 3O4BA 2EALA 4JKQA 2UWBA 2K4AB 5JOYA 1DYKA 1HIBA 3R05A 4EFPA 5JVVA 3ZSLA 1HWOB 1I1BA 1AXMA 4I7IA 4IZEA 4QC4A 2FHRA 3IPVA 3WG4A 4F83A 3T2TA 5DG2A 3WOGA 1V00A 1JYIA 4G1RA 3IMNA 3LCPA 3BAHA 3IAGC 1II4A 3WMVA 4LBQB 2X2SA 2NMOA 4HANA 1SR4C 3LTQA 2AGSA 4Y26A 2IWTB 3O12A 3VT0A 3WDXA 3SH5A 1KDKA 3FJ9A 4QD2B 4SLIA 2BFHA 3B00A 3OBTA 2LIEA 3HMYA 4DENA 2E53A 1DGLA 2G4IA 2ZGUA 3N35A 4Y1XA 2RG9B 3WUDA 1Z2VA 3AH1A 2AREA 4XJAA 2CNAA 1GSLA 2V73A 3WDWA 4YW4A 1C1FA 3FLPA 2VW2A 3CNAA 4CZSA 2NN8A 4JAWA 3IKWA 1T4QA 3SH4A 3U4XA 4EFQA 4P9WA 4ZXKA 2GDFA 2D6LX 3FJFA 3Q7YA 2KKIA 1W6MA 1CESA 1FNZA 1FX5A 4IY9A 3IIRA 4R9DA 1VIWB 4LBQA 3N7JA 4GWNA 5DUUA 3RQ0A 3WUCA 3WCRA 4BOWA 1ULGA 1A78A 1LHOA 1G9FA 5GZGA 3O0VA 4ZFYB 1ZA4A 4ZLBB 3WDVA 4CRQA 3BOPA 5DZUA 1LESA 3BAOA 4CJMA 1OQ1A 1LENA 3ATGA 5DUXA 2X2TA 2M49A 1CIWA 2CWSA 2ZGNA 4Z9WB 4M3CE 4PQ9A 4QO3A 1AVXB 3PVNA 3FUOA 1JT4A 4KEIA 3UD9A 4YG6A 2ZZJA 2FMDA 1ABRB 3JUUA 4OZXA 3A21A 4II0A 1YYNA 2JE9A 3PHZA 4Y22A 1APNA 3VSZA 3FJBA 2HZ9A 4XFTA 3AH4A 2CL2A 1JTCA 2MIBA 2RSTA 4ASMB 1OFSA 3APBA 4LO2C 4FQZA 3T8SA 5T55A 2A3XA 1TIEA 4I8MA 1ISYA 3CAHA 1BLDA 4OWLA 3OYWB 4I3NA 1N3QA 5GZEA 4Z8SB 4X37A 4DCKC 1CPMA 3AZZA 3O49A 5HCBA 1IHKA 1LOFC 3UL2A 2MLLB 1MC9A 2DVDA 2ZKNA 1FNYA 4I4QA 5DUVA 5EHAA 1V6UA 2SLIA 3F1RA 4DRRA 2FFVA 1DQ6A 4IHZA 4YW1A 4GXLA 1JY0A 2GALA 4OWKA 3CA0A 3AFKA 1FATA 2E4MC 2E6VA 4LBLA 2D6NA 2NVHA 1QDOA 3O5SA 3GNEA 1Q03A 2E51A 1HWMB 2GNBA 3FGMA 2UWCA 5DZGA 1SCRA 4U36A 2GN7A 4A7KA 1DFCA 4WV8A 4P0KA 4L8QA 4FPYA 3R4SA 1N3PA 5EWSA 2QYIB 3CA1A 4J2YA 3CU1B 4P9XA 5L73A 2PHUA 3WA1A 3ZYPA 1WW6A 2ZGRA 1FGAA 3M1HA 4OEFA 1QGLA 2GNTA 2ERFA 2YZ4A 3CA6A 3NBDA 1LOFA 4FP3A 1V6JA 2VUAA 3TB0A 1G9CA 2KI4A 1VAVA 2PELA 2UUSA 1F9KA 4Q2FA 1NLSA 2YY1A 1M16A 3UK9A 1SZ6B 3AX4A 3ZXGA 1VLNA 3PUBA 5LK5A 4GKYA 3VKMA 4AN7B 3BIWE 1WBCA 1UAIA 2W68A 1RIRA 4RL7A 2ZQOA 2DS0A 2OUHA 2CY6A 1GZWB 2WT0A 3BAQA 2ZGMA 4JRAA 4UW6A 1WW7A 4YFZA 1I3HA 1I1EA 2D20A 3SLIA 1ITBA 2D3RA 1F31A 1JHNA 3A0NA 2YROA 1DQ5A 1WD4A 1ISXA 4J2KA 1AXKA 2BEBA 1FMMS 3M3OA 3FJDA 4YG3A 2K8RA 1VCLA 4GP3A 4JKXB 1S1AA 1R8NA 2C5DA 3QCWA 1KITA 1PZZA 2D6KA 1W0PA 5IK8A 1DHKB 3ZSJA 1UL9A 4BPZA 4ENDA 4FOVA 1JOJA 3AH2A 3AJZA 4I1EA 5D63A 3R4UA 1RZOB 3I2AA 2ARXA 1YIFA 1S0IA 4GP0A 2WRYA 5D61A 1AFCA 2Z48A 1AVUA 4Y1UA 4NOTA 2EXJA 4IONA 3OJVA 1HWNB 3M3QA 3AXEA 3KQRA 1DQ2A 4M00A 2GO2A 1LJ7A 4JPZA 1KQRA 1FWVA 4TYSA 2WBCA 3O4CA 2OW4A 1MD6A 3WINC 1V6XA 2YUGA 4G6JA 2J3PA 3OJBA 1ULDA 2HYKA 5H9QA 3ZSMA 3ZC8A 1MS4A 2D3PA 3RMYA 3AKGA 1EYLA 3ZPYA 1Z78A 3RTJB 1KJLA 5T52A 1VALA 1AVBA 4ATFA 3OPZA 1IRPA 2JDZA 2YV8A 1G9BA 4LO3C 3RG0A 2F8XC 2JKBA 3I8TA 3A4UA 1TTUA 4LO0A 2PHWA 2R0HA 4P14A 5BVPI 2ZHLA 4Y20A 4GOVA 4FQ4A 3NBCA 2OUJA 1IRAX 2DVAA 3O4DA 3T1MA 1TEIA 5GLTA 2GNMA 4LBNA 4YGDA 1ULCA 3FLRA 3NBEA 2ZGQA 4I4VA 5FNXA 3O5WB 1QOTA 4XE9A 1GANA 1KRIA 3AYDA 4GKXA 1S0EA 3HBWA 4XBNA 4YW3A 1MZ6A 4YG0A 4FOYA 4JC1A 4XFUA 1NUNA 1ZM1A 1RY7A 4ZGRB 1CQ9A 4BMBA 1AJOA 3BRGC 1LGCA 2ZA9A 2SBAA 3JUTA 4AVVA 4DQAA 3CA3A 2ZMNA 1JLYA 1S0FA 2EIGA 4OW4A 2RHPA 1LHUA 1GBGA 2JE7A 1AXYA 3OY8A 5IT6A 3WCSA 4XHXA 4JCKA 3CA4A 1V6WA 3ILRA 5B2HA 2HWMA 3MEPA 4UW3A 3PVEA 3Q9OA 1J0SA 5FRAA 1CJPA 4XOGA 1JT5A 1GV9A 1AVWB 4ZOTA 1UZZA 2WQZC 3CRGA 4EKXB 3HR9A 3PJQA 2JJ6A 1D0HA 1EVTA 1HCDA 3OJMA 4I4XA 4H9WA 1MS0A 1BASA 3VKNA 5JDBA 2D6OX 1QOOA 1V6LA 2W52A 2K43A 2VSEA 2RQ9A 2ZACA 1FQ9A 2D24A 1S0CA 3UJ0A 4EB2B 1DIWA 4I4PA 4YLZA 3V64A 1LOAA 4UW5A 3V0AB 1B09A 1SLAA 1LTEA 1V6MA 1SLTA 2WNEA 4QD2C 1N4KA 4WZFA 5EYYA 4RA0A 1Q1UA 1C1LA 2VU9A 1PZ8A 1BQPA 2E7QA 4I4YA 1WBAA 1HLCA 1LCLA 4GOYA 2P3JA 3INAA 2L5XA 1JUIA 2KI6B 1WBLA 4UW4A 5DZFA 2ZABA 4QKSA 2GNDA 1TWMA 1LHWA 1LU2A 4I4OA 4PF5A 4R9CA 1IJTA 1CE7B 5KXEA 3HN1A 3N7KA 3RMXA 3WZ1A 2R0FA 3OGFA 2DTYA 3N0KA 4LBOA 4LO8B 5DZEA 1ULFA 4C1WA 2NYYA 3VKFC 2ZGKA 1PC8B 1BARA 1FN0A 1C4RA 2XG3A 3OBRA 3A0KA 2AXMA 2D43A 1MR5A 3M3EA 3D7WB 5GLUA 1FMZA 3WG1A 1DLLA 1W6NB 1H9PA 1FWUA 4G6MA 4YZ3A 3N7MA 5BYNA 1SLIA 3ILNA 4YM0A 4FOQA 3O4OA 5GLWA 4I4SA 5F8WA 5HCAA 4PBPA 1ENRA 4YZ1A 4K20A 1MZ5A 2DV9A 2WSVA 4XMAA 1IKPA 4XXPA 1GNHA 4QKRA 3AJYA 2H0BA 1Q8PA 5T5JA 1JT3A 1AZDA 3B69A 5BXPA 2A6ZA 3UDAA 4WVVA 1HWPB 2P34A 3D6EA 1AJKA 4ATEA 4FPLA 1OQLB 3ILFA 2I2SA 1SLLA 4W65A 1W6PB 5EXOA 3ZYRA 7I1BA 3OJ2A 1MS8A 3B3QE 1LHNA 2DTWA 2EAKA 3BAVA 1WLDA 1XQNA 3P6JA 4ZBVB 1QMJA 4DS0A 1W3AA 4I1BA 4D0TA 1WLWA 1JQZA 1UPSA 1LOCA 1W6QB 2ESUA 4Q8KA 3RSJA 4LO7C 5H9SA 5BP5C 1O4YA 1WD3A 5IUQA 5F9TA 4JQ0A 1WW5A 1MS3A 1Q8QA 4TZDA 3H6RB 5T5LA 3IM0A 2DRYA 3H6SE 2YMZA 1W6OB 4XTMA 5IK5A 1HKNA 3IM7A 2Q9XA 4A7ZA 1UMZA 1YXWA 5G00A 4AVTA 3BADA 2EF6A 4XIKA 4G9NA 5FZZA 2F2FA 1PWAA 1TOOA 3PG0A 4XDQA 3N7LA 4KC3A 1QKQA 21BIA 3QYDA 3LSEA 2ZMLA 1C57A 4KBBA 2PHRA 4JP0A 4I4UA 4NO4A 1PUUB 5GM0A 3CRHA 3DUIA 3V65A 3FJ8A 4IY8A 2VXRA 1DQGA 1V6OA 3WNXA 1IS5A 2FDBM 2A6WA 3OYWA 2MC2A 4XFSA 4XTPA 3MW2A 1FYUA 1DZQA 3WLUA 9ILBA 3FBYA 2YXSA 4XXAA 4YM1A 4QALA 1AX1A 3QR5A 4I4RA 1DQ1A 4LBMA 3JU9A 3B9UA 2C9AA 3ENRA 1JBCA 2B7YA 5BP5A 2FO1A 2A71A 1N1VA 3HSMA 3ZX7A 5GZCA 3BRFA 5E89A 4HR6C 5F8YA 4HJJA 2VXTI 1XG6A 3AJ5A 1DQOA 2JECA 4DEPA 2DURA 2D3SA 4AGVA 3UD8A 4XBQA 2DREA 1S0JA 2GMMA 4GA9A 1CPNA 3AJ6A 2NM1A 3BRDA 3K1XA 1QF3A 1TWEA 4XILA 3AK0A 4I96A 3I2XA 3AP4A 4BMEA 3BX1C 2A70A 2TEPA 3NJ5A 2DUPA 1GZ9A 3ASIA 1LODA 1CONA 1D2SA 3A22A 4LO0C 3E8LC 5EC5A 1W3GA 2CYFA 1QQKA 1RITA 4YZ4A 3VWCA 4QBVA 1KDMA 4DFSA 3POYA 1NZKA 3P6IA 1QU0A 3AYEA 3UJQA 1Q04A 1GZWA 2CWMA 1T9FA 3B01A 3WHTA 4LO1A 3AZWA 4M01A 4FVVA 3FLTA 3O4AA 4OUJA 3W59A 1UN1A 4KEKA 4F34A 1MVQA 3VT1A 1LHVA 4L4HA 1UZYA 1IS6A 3NV2A 5F8SA 4OEEA 3L2YA 2VW1A 2HWAA 5SV8A 2XB6C 4Q91A 3CQAA 2ZGLA 4A7YA 5BQUA 4ZKTB 2JD4A 31BIA 4BQ1A 3NBNA 3ZXDA 4FP2A 2D6MA 4FPFA 1LEMA 2FFUA 5E24E 4X39A 1WW4A 5DUWA 4LBQD 4XYXA 1L2HA 2D1ZA 3TC2A 1A3KA 3S8KA 4I37A 1CVSA 4WVWA 4M3CB 5GAQA 2WSUA 4Y1YA 1Q8OA 1V6IA 4Q9GA 4P9YA 2Y9GA 1Y7BA 1BKZA 3WO4A 4I2SA 1FV2A 2AR6A 1JXNA 1SBDA 3P53A 1AXZA 1N1TA 3AP5A 2NMNA 1Q8VA 5GJ6A 4WBCA 2VLCA 4DPNA 1V6NA 3ZVXA 3QLQA 1WUVA 3BAUA 3NV3A 4I0YA 3MW4A 1SLBA 1W0OA 4Q26A 1AX0A 3VUOA 1EPWA 2ZMKA 2D23A 3AP9A 1BJQA 3IPVB 1HDKA 1GYKA 4K1ZA 3AZXA 6I1BA 1V6VA 41BIA 4I6IA 2AUYA 4ZFUB 4XHBA 1OKQA 3SISA 3I29B 3N3HA 5KXCA 4D69A 3BA4A 3ZXLA 5DVHA 1Z0HA 4L4IA 5DG1A 1MS5A 4AWDA 4FPEA 3WDTA 5FZUA 3V0BB 4ITCA 1LGNA 3WDYA 1YF8B 3O44A 2ZAAA 3ZXKA 4AVSA 3WO2A 3BTAA 1SBFA 1N1SA 5CAZA 3SNMA 1IOBA 4R9AA 2BEAA 5T54A 4R6UB 1M2TB 3WO3A 4ISQA 4Q27A 2GMEA 2D44A 1CVNA 1LEDA 2P23A 2PHTA 3BAGA 2W08A 2W39A 3BB2A 2AYHA 4AGRA 1URXA 5GZDA 3EF2A 4X3AA 1W6MB 3SITA 1AF9A 3KMVA 4GAIA 1ISWA 1S0BA 1R1ZA 1CN1A 1LOEA 3KM5A 2ZHMA 1NXD1 1TP0A 4LBJA 2FGFA 5EG6C 3NV4A 4TLPA 3GALA 2P3KA 4J23B 1DZDA 1H9WA 2R16A 2R1DA 2A7AA 1Q56A 3AKIA 3UJ4A 3AZYA 2A3YA 3VEQA 2GN3A 3V0BA 4Y24A 3O0XA 5JLVA 2ENRA 3FJEA 1AVAC 2P39A 4Y1ZA 2A6VA 5IK7A 3H0OA 2EXHA 1CR7A 2P2KA 1TFMB 2WLQA 5E88A 5I1BA 4K21A 3LSDA 3AKHA 1R8OA 3WVJA 1BFCA 3FJAA 5BOWA 3VSFA 2DVBA 4FPHA 1QNYA 1G8WA 3V0AA 1LULA 3AXDA 3VKLA 2ET2A 1UKGA 1J1TA 4Y22B 4G9MA 2ZGPA 3M3CA 4AN6A 2R1BA 2LTNA 2PHFA 3S8JA 2KH2A 1GZCA 5JMCA 1K5UA 1MVEA 2AH2A 5CB7A 4D0ZA 1K5VA 1BLAA 1QQLA 2A3WA 1JN2P 3O3QA 1GGPB 2NTDA 5BXSA 3N36A 1SCSA 5AVAA 2A6YA 1G7YA 1XZZA 4Q1PA 2AFGA 2ZR1B 3WHUA 3H6QA 3AZVA 3RRDA 1ISVA 2Q3NB 1YO8A 4ZFWB 1SR4A 4FPKA 2F2FC 1QXMA 2VSAA 3V79C 5F5QA 1JW6A 2R49A 2AQZA 5DSSB 1SLCA 1V6KA 2D7RA 4AGGA 3ZSKA 2EXKA 1SBEA 3ILAA 3POSA 4FPGA 1VAMA 2A6XA 5JOZA 3AYAA 3NV1A 5T5OA 4XKIA 4QBCA 1DJSB 4GAFA 4CTEA 1EV2A 1LOBA 2XOAA 1DQ0A 2Z42A 5JOXA 4XZPA 1RG8A 3IM6A 4YFWA 3NWKA 5IK4A 4ISRA 2ES3A 1W6NA 4YGCA 1H30A 3CRIA 1QDCA 3HOMA 1GLHA 1XYFA 1DFQA 1ENSA 5F90A 4EFRA 4YZ5A 2WKKA 3F62B 1GNZA 2A75A 1A8DA 3D4KA 3FJJA 3SNVA 1BFBA 3ZXJA 2DU1A 4Q8LA 1YTOA 3LLPA 4OWJA 3W58A 4XMIA 4LO7B 4YM2A 1W6PA 2WT2A 1KNMA 2HW9A 4PC4A 3FUQA 3OGGA 2ERMA 2EXIA 4BLIA 4XJ9A 2QN4A 1IS3A 1G86A 5T5PA 4IQPA 3C9ZA 4MYEA 1Z4SA 3WG2A 3C2UA 1WLCA 2KM2A 1W3FA 2DWRA 2ZHKA 1SACA 4Q1RA 2UU8A 4Z8BA 1QOSA 1W6QA 2Z49A 1ISZA 2V5YA 4J2SA 3IM5A 4LO2A 5H9PA 1GICA 5BXTA 3H6RA 2AENA 1YRZA 1W6OA 4GWMA 1BA7A 4M3CF 3AP6A 1JLXA 3AP7A 3FJKA 4H04A 1MS9A 2VH9A 4BM8A 5CNAA 1ENQA 2WJSA 4YOLA 5BXRA 1XHBA 3Q7WA 2P37A 1MACA 1BFFA 1E0OA 4LO1C 2BQPA 1DZCA 5JOWA 4D8HA 5E8AA 2DRZA 5DUYA 1KJRA 3BA7A 3DGTA 1P63A 5D62A 2Y9XE 1DBNA 4ZA3B 1PZ9A 3USUB 3VT2A 4PBOA 3JRRA 2PHXA 4EEEB 3UD7A 3FFZA 2DYCA 3RS6A 3D5OA 4FOWA 3IN9A 1S0DA 1BFGA 1F5FA 4XJ8A 2E4MA 5BQUC 3WDUA 2KLLA 2ARBA 1HCEA 3WG3A 2I1BA 3A23A 1YBIA 3HALA 5GLZA 1N47A 1N3OA 1JYCA 4P0LA 3CA5A 3PMEA 4YM3A 1IKQA 2ZGSA 1WBFA 2E7TA 4Q9PA 4BLJA 4FPCA 4FPOB 2ZGOA 4FGFA 2ZHNA 3VV1A 5KXBA 8I1BA 1LGBA 3SH3A 3BODA 4U2AA 2DVFA 3MALA 3PVOA 2WT1A 1IS4A 4K1YA 4PCRA 3USUA 1WCSA 2GZBA 4Y20B 5KXDA 1HQLA 2A5ZA 2VY0A 3UJOA 1LU1A 2DUOA 5HPZA 5FNWA 3ZXFA 2IHOA 4KEJA 3AKFA 3M2MA 2DU0A 1ILR1 4USPA 1G9AA 4Y1VA 1LECA 4IZXA 1YI7A 5DXDA 1BXHA 3MW3A 1S0GA 5H9RA 3POKA 4HA2A 1BZWA 2Y9WC 1RINA 4YW5A 4C1XA 1PUMB 1QNWA 1GKBA 2VW0A 2NZ9A 3A07A 3WMUA 4H55A 1U0AA 2P3IA 4DRVA 1SFYA 3MPPG 2DVGA 2ZBJA 2D7IA 3I4IA 4YGBA 2ZGTA 3FJHA 4YW2A 1ULEA 3FJIA 1N1YA 2LALA 1UX6A 2ZQNA 1G82A 4R9BA 4P0JA 3BA5A 3OY8B 1PZ7A 5FREA 1G9DA 3ZXEA 2CTVA 1IILA 5FZYA 2DUQA 4HL0A 1MS1A 1IOAA 4XBLA 5CA6A 3VKOA 5GLVA 4YZ2A 5GZFA 1FV3A 1BYHA 4I30A 4AYUA 4USOA 2D7FA 4XJWA 1S0LA 3B9CA 4XJUA 3POWA 3WV6A 2LIQA 5CBLA 1FAYA 1AX2A 2NP0A 2D6PA 1HKDA 1IT0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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