4JRAA

Crystal structure of the botulinum neurotoxin a receptor-binding domain in complex with the luminal domain of sv2c
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
421
structure length
416
Chain Sequence
TSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
publication title Structural basis for recognition of synaptic vesicle protein 2C by botulinum neurotoxin A.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 93
structure length 416
sequence length 421
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2013-03-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4jraA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4jraA02
2AAIB 4ZXKA 3BA5A 5DVHA 5KXCA 4P9WA 3I2XA 3AKGA 3OJBA 5DXDA 5FRAA 1UAIA 3WDXA 3R4SA 4OEEA 1LOGA 4LO2A 3HR9A 4H55A 4BLIA 4XBNA 4QBCA 1FAYA 4FVVA 3O44A 3WG1A 4XTPA 3ZC9A 4BMBA 2Q5TA 3A21A 2V73A 3VKNA 1UMZA 3AP5A 3V0AB 1IRPA 4ENDA 1IOBA 3B3QE 4JQ0A 1G86A 2Y9FA 2VW1A 4C1XA 2DV9A 2DU1A 1X50A 1AVBA 1YI7A 4G9NA 3AJYA 3HSMA 4HANA 3RQ0A 3NV3A 4PCRA 3AJZA 1JT4A 3F1RA 4OWLA 1I1BA 1BYHA 4FQ4A 2JDZA 3D4KA 2KKIA 3S8KA 1C57A 3A4UA 5D61A 2DVDA 2YROA 1WCSA 3N7KA 4AWDA 3KM5A 4IQPA 1LHUA 4GKYA 1R1ZA 4IY9A 1IS3A 4XHXA 4DENA 1QMJA 3WO2A 3A23A 3RTJB 3AZVA 1UN1A 3ZXFA 1E0OA 2F2FC 3V0BA 1Y7BA 2FFUA 3GALA 2KI6B 1BFCA 5GJ6A 1DHKB 2AH2A 4Y22B 4FPGA 1F31A 3UDAA 1VIWB 2VLCA 4XZPA 3W59A 5BP5A 2A75A 2IHOA 2CWSA 2L5XA 4G9MA 2ENRA 3E8LC 4I4YA 1RIRA 1KQRA 2D20A 4WBCA 5IK4A 5DZFA 3FUOA 4BM8A 5FNWA 1M2TB 3FJIA 4ATFA 3IIRA 5IK5A 2RG9B 1GV9A 1U0AA 3AKIA 2A5ZA 1J1TA 1MVEA 1V6MA 4QC4A 1DYKA 2OUHA 3H6RB 5IK8A 2W68A 5IT6A 1MS3A 4Q27A 1W6OB 2Z42A 4Y1VA 4I4RA 3AP9A 2DS0A 2ZGNA 2ZGPA 3O4AA 4ISRA 3B9UA 1YYNA 3WO4A 3NJ5A 1DZDA 3WG4A 3A0NA 3BTAA 1Q8SA 2GO2A 2P3IA 4M3CA 3ZC8A 3FLPA 3SH5A 2G4IA 4I6IA 4A7YA 1MS8A 3SITA 4W65A 1C1FA 4JRAA 5AVAA 1IS4A 5CNAA 2ZACA 4YGEA 1JUIA 3D5OA 4AVVA 5EWSA 1MC9A 1QXMA 2IWTB 1JY0A 1S0IA 4Y1UA 2YZ4A 4LO3A 1N1YA 4OWJA 4MYEA 1WBFA 5GM0A 4EFQA 2HWAA 3LSEA 3D7WB 4GXLA 2NMOA 2WT0A 2E4MA 1WLCA 2HW9A 2LTNA 1S1AA 2D6PA 5GLUA 3Q7WA 1GGPB 2KLLA 3ZYPA 3T8SA 1HQLA 5KXBA 1OFSA 2MIBA 2ZKNA 3EF2A 1DZCA 4USOA 1SACA 4YGDA 2ZGOA 2D23A 1ITBA 1FYUA 4FOYA 4FPCA 1SLCA 1BKZA 1WLWA 4XBQA 31BIA 3JUTA 2V5YA 2PHUA 4SLIA 1V00A 1H9PA 3CRHA 1F9KA 1W6PA 1N1VA 2DWRA 1CESA 4D8HA 2RQ9A 1IJTA 1DFQA 3UD7A 2EXHA 1S0GA 3PVEA 3N3HA 1FATA 1AX2A 1WUVA 4UW5A 1FV3A 4ITCA 3WUCA 2CY6A 1FMMS 4Y26A 4TYSA 3ZYRA 2GMPA 4YFZA 1NUNA 2R49A 4Q8LA 5H9PA 2J3PA 1ZM1A 2F2FA 4XDQA 3OY8B 1KRIA 2TEPA 5DUYA 5EYYA 1AVWB 3HALA 3USUA 3FJBA 1JYCA 5DUXA 2FFVA 3CA1A 3U4XA 4LO7B 3AYAA 3OJ2A 4BMEA 2D43A 5GLVA 5DZUA 1PZ8A 1OKQA 1ISYA 1LODA 1ENRA 5T5OA 2CL2A 2CTVA 3BA7A 3R4UA 3CAHA 3WV6A 2GDFA 1PZ7A 4I4XA 1O4ZA 3RSJA 1LEMA 4FPEA 3AZXA 3IM6A 5BOWA 1CVSA 1V6WA 2GALA 3TC2A 2ET2A 2D1ZA 3QYDA 3VKFC 1JXNA 1I1EA 1WLDA 2DUQA 2H0BA 5E88A 4LO0C 3RTIB 4AGGA 1BASA 1WD4A 2OVUA 1SLBA 3I29B 3AXDA 4QALA 1XZZA 3N0KA 1PZZA 1BXHA 3H6QA 2A6YA 3CRGA 5JMCA 5B2HA 5T50A 1L2HA 1FNZA 4LBNA 4HR6C 2DRYA 2QN4A 3I2AA 2ES3A 2JD4A 4I4PA 1YO8A 4IZXA 2X2TA 1VLNA 5D62A 4YG6A 1SLLA 1AXMA 4YZ1A 2E7QA 3SNVA 3HN1A 1PWAA 1WBLA 3HBWA 1A8DA 1N1TA 4Q2FA 1DLLA 5IK7A 4I4QA 4ZGRB 4UW6A 3NBCA 3WA1A 3Q9OA 2Y9XE 3T1MA 4XFTA 4Y24A 1T4QA 3POWA 1W3AA 1DYPA 2D3RA 3ILNA 5T5LA 4QD2B 5BXTA 1JW6A 1XG6A 1IS5A 4GOVA 4I4SA 3M3OA 1A3KA 2DUOA 2DU0A 1JN2P 4Q1RA 4GALA 4Q9GA 4K1YA 1KJLA 1QOTA 2R1DA 4OZXA 1CIWA 4D0TA 1G9BA 3W58A 4P6AA 1N47A 5F8YA 5GZCA 3JRRA 4GA9A 1LU1A 4PF5A 3BAOA 3VSFA 2ZR1B 3LTQA 3FLTA 2UWAA 4UW4A 1W3GA 4P0KA 1W6NA 3IKWA 2Z48A 3AK0A 1CPNA 1RINA 4FPHA 3AYEA 1HCDA 1CR7A 2PHXA 2P2KA 3O3QA 4HL0A 1MACA 3BODA 1V6OA 3BAVA 1BQPA 4GAIA 3OBRA 4YW1A 5JVVA 2UWCA 5EXOA 5DUUA 4HJJA 5EYXA 2DTYA 1Q8OA 2ZGLA 2PELA 1AVXB 1ULEA 1TFMB 5GZDA 2ZHMA 1ISWA 2UUSA 4DFSA 4XJUA 3F62B 3CA3A 3FJKA 1LCLA 1ABRB 4R9BA 3JU9A 1LJ7A 1TP0A 4GWNA 1OQ1A 2M49A 4R6UB 1HQWA 1TIEA 4BQ1A 4YOLA 1S0EA 5BXPA 2DREA 2RHPA 3B01A 1W6MA 3IPVA 2GN7A 1FN0A 4G6MA 2ZGQA 1SZ6B 1V6IA 1JLYA 4LBQA 1R8NA 3O0WA 4I0YA 3FJEA 1LU2A 3N7MA 1N1SA 3FLRA 2Y9WC 1Z0HA 4EB2B 1IS6A 2DTWA 3V65A 4YM2A 5BVPI 5DZGA 2FO1A 1Q8PA 2W52A 4LO0A 4QO3A 6I1BA 4ASMB 2UWBA 3AH2A 1QGLA 2P37A 3WOGA 5T5JA 1ONAA 3FJCA 1G9DA 4I1BA 1LOCA 2R0FA 3C2UA 2HZ9A 1GSLA 2ZHNA 1QNYA 1V6UA 2WLQA 5I1BA 1LOFC 4LBMA 1MD6A 4YW4A 4CJMA 3SISA 1D2SA 3FJFA 4P14A 4RA0A 4ISQA 2ZA9A 1N3OA 3ZSLA 2K8RA 4YZ3A 4JKXB 1VAVA 4NO4A 3BAGA 3FFZA 1DQOA 1GNZA 1Q8VA 4LBJA 1G9AA 3V0AA 3A07A 1EYLA 1LGNA 1FMZA 3AP6A 3CA4A 2AENA 1QU0A 4Y20A 1JHNA 3AKHA 3O49A 3IM7A 2HYKA 2YV8A 2ESUA 3FUQA 2AFGA 3BRFA 2K43A 2NN8A 5LK5A 3RMXA 3KMVA 2BQPA 3POSA 2PHTA 1DQGA 3MW3A 2R9KB 4Q26A 1LTEA 5JOYA 3M3EA 1DQ0A 4IY8A 5E24E 2ZGUA 3O0XA 3Q7XA 3AJ6A 4X39A 5H9RA 3OYWB 4KBBA 1EVTA 1SBFA 1HWPB 2JJ6A 1FNYA 4XIKA 1QDCA 1ULDA 5HPZA 3VKLA 2RSTA 2ARXA 4ZA3B 3SNMA 3LCPA 1ISZA 2A3WA 4Y22A 4YM3A 2AQZA 4L8QA 1G8WA 1W6QB 1AJOA 4LO7C 1XYFA 2WSVA 3M3CA 4M3CB 4DS0A 3WINC 3PJQA 3VV1A 1ULCA 4GP0A 3ATGA 1IILA 1CVNA 3AP4A 1SFYA 4AYUA 2WKKA 2ZQNA 2VXTI 1BFFA 1LGBA 4GOYA 2NM1A 4Y1YA 2ZGRA 3BB2A 3BRDA 3H6RA 1TWEA 3WMUA 4K1ZA 1B09A 2HWMA 4ZBVB 4ZFYB 1W6OA 4G6JA 4WV8A 1QQLA 4WVVA 3ASIA 2BEBA 3V79C 1AXZA 2GNMA 1ULGA 2E53A 1SBDA 4QBVA 2ZGKA 3FGMA 2FMDA 5BYNA 2AGSA 4LBKA 4FOVA 4IONA 2NTDA 4J23B 1BJQA 3ZXDA 1ISXA 4C1WA 1SLTA 2OUJA 1CQ9A 1DQ6A 4FQZA 2CYFA 5EHAA 4Z8BA 4EKXB 1LOBA 3N36A 2GNDA 4K21A 2Q9XA 4FGFA 2D6KA 4XTMA 2JECA 4DEPA 4ZFWB 3BADA 4R9DA 1W0PA 5GZGA 4OUJA 3ZVXA 3S8JA 2FHRA 5HCBA 2JE7A 4QD2C 1MR5A 4XHBA 1IOAA 2LIEA 3FJAA 1RZOB 4FPYA 4LBQD 4XMIA 3UD8A 1AVUA 3VWCA 4G1RA 4JCKA 3N7LA 2VUAA 1DQ2A 2D24A 2F8XC 1JYIA 1V6XA 5F5QA 1DZQA 4OW4A 2NMNA 5IUQA 4FOWA 1GNHA 2MC2A 1EPWA 5CB7A 3ZXEA 3PHZA 3BAQA 4QKRA 2WJSA 1V6LA 3LLPA 2Y9GA 3AH4A 1WW4A 1UX6A 3NV1A 4HA2A 2D7FA 3I4IA 4FPJA 5DUVA 4EFRA 3WVJA 4XXPA 3ILRA 3IN9A 2P23A 1TOOA 3FJDA 3POKA 1ENSA 2D3PA 5JOZA 4FPKA 4R9AA 3ZXJA 3WG2A 2ZHKA 3MPPG 5E89A 3WDTA 1KJRA 2FDBM 1SR4C 4EFPA 1JT5A 4LO8B 2Q3NB 1NXD1 1G7YA 1LOEA 1DQ1A 1UKGA 4P9XA 2XB6C 1V6VA 4XXAA 1LULA 1V6JA 3UD9A 4Q9PA 2X2SA 1SBEA 1AVAC 4FPFA 4KEKA 2A6XA 3TB0A 2YMZA 4K20A 5GALA 4ATEA 3P53A 3L2YA 3RRDA 4PC4A 1BFGA 4BOWA 3IM5A 1ULFA 2D6NA 1YBIA 1P63A 3SH3A 1FQ9A 2WBCA 2K4AB 5F90A 3WCRA 5CBLA 2VU9A 5GZEA 3Q7YA 4AVTA 3P6IA 1PZ9A 1ZA4A 2ERFA 4YG3A 1HIBA 2E6VA 3ENRA 4KC3A 3APBA 2E7TA 3ZSMA 1MS5A 2EXJA 2NZ9A 1QDOA 1VCLA 3ZX7A 4YZ5A 1GKBA 1LHNA 1FWVA 3K1XA 2CNAA 1HKNA 5T5PA 3UJOA 1T9FA 1XQNA 1CJPA 2D6OX 4J2XA 3D6EA 5E8AA 1YIFA 1HWMB 1S0DA 3NBNA 3AYDA 5T52A 1S0CA 1QF3A 1VAMA 3FJ8A 4II0A 2ZABA 1SCRA 3OGFA 3FJ9A 4I96A 2VSEA 3LSDA 4WVWA 4J2YA 2VW2A 3OBTA 2R16A 3OJVA 1RITA 1BLAA 3SH4A 4X3AA 1GZWA 2I1BA 1JLXA 2VY0A 4EEEB 2I2SA 1PC8B 1FV2A 4TLPA 3QCWA 2ARBA 3AZYA 4Q91A 1AFCA 4USPA 3ZXGA 3MW4A 1Z78A 1WD3A 3NV4A 2EAKA 8I1BA 3WNXA 4PQ9A 2FGFA 2UU8A 2AUYA 2A71A 2ZMNA 4D69A 5BQUC 3I8TA 1HKDA 4XMAA 2YUGA 1TEIA 1GLHA 5FZYA 3DUIA 1AX1A 3GNEA 1QQKA 4AVSA 1HCEA 1GANA 3BOPA 1F5FA 3M3QA 4XYXA 1MVQA 5GAQA 1MZ5A 3VSZA 2VXRA 2KH2A 3MALA 2WNEA 4YZ2A 3BAHA 2DRZA 4GAFA 4L4HA 1SLIA 4DRVA 3FJJA 4F83A 3B9CA 1G9FA 1R8OA 2VW0A 1AZDA 1RY7A 3M1HA 2WSUA 2EXIA 1SR4A 3NBDA 2ZBJA 1Z4SA 4I7IA 1ILR1 4H04A 2D6LX 4WZFA 3WMVA 5L73A 2E4MC 2YY1A 1GZCA 3AYCA 1PUMB 2GN3A 1BARA 1O4YA 1G82A 3WDUA 3TAYA 3M2MA 4Z9WB 3FJHA 4I8MA 1A78A 4RL7A 4XJZA 4YW5A 1GBGA 2AREA 3BX1C 5H9SA 2E51A 2Z49A 4Y20B 3ILFA 1IT0A 2D22A 3CU1B 1QOSA 3VUOA 5HCAA 1GICA 1SCSA 4LBOA 3WHTA 3CA6A 3HOMA 1QNWA 3UJ4A 2C9AA 1LHOA 2GMMA 3KQRA 3V0BB 3AFKA 2EIGA 1W0OA 2AR6A 4I4UA 1LHVA 5HCFA 3A0KA 3O5WB 1WW7A 3R05A 3QR5A 4P0JA 4H9WA 4CTEA 1LGCA 1DIWA 3W9TA 1DBNA 1BFBA 1UL9A 5G00A 3UL2A 4PBOA 1S0JA 2NP0A 4OEFA 1QKQA 1LECA 4XJWA 4JP0A 4P9YA 3WZ1A 4TZDA 3AX4A 3OGGA 1CPMA 4LBLA 4KEIA 4JPZA 1DQ4A 4L4IA 3T2TA 3AXEA 1KDMA 4IZEA 4UW3A 1DFCA 3RG0A 2D7RA 2DURA 1FWUA 1BLDA 1KNMA 1IRAX 5JDBA 2LALA 4LO1C 4I2SA 1RMLA 4D0ZA 1Q56A 3ZSKA 1KDKA 4I3NA 4IYBA 3IAGC 4FOQA 1LESA 2JE9A 1LENA 1SLAA 5FREA 3N7JA 4I1EA 4YGCA 5BQUA 2AXMA 3OYWA 3ZXKA 4XE9A 3CA5A 4AGRA 5F8WA 2BFHA 4XIOA 2XG3A 1CE7B 1V6KA 1UZYA 4X37A 2R1BA 2ZAAA 3A22A 1AJKA 2WRYA 1N4KA 2D6MA 4BLJA 1C1LA 1W6QA 1S0BA 5T55A 2PHRA 4GWMA 3O12A 4Q1PA 4DCKC 2WT1A 3O5SA 2SBAA 4I30A 3NBEA 2NYYA 5JLVA 1TWMA 2A70A 1W3FA 2C5DA 3H0OA 3C9ZA 4J2KA 1FGAA 1WBCA 1JT3A 3VKMA 4YW2A 1JQZA 2A6ZA 4YZ4A 2ZHLA 2ZGMA 3WHUA 3DGTA 4FP3A 4YGBA 5BXRA 5F8SA 1IKQA 1M16A 2EF6A 9ILBA 3CRIA 4Z8SB 2GNTA 5F9TA 2KM2A 1LOAA 4KEJA 4I4VA 4ZFUB 1W6PB 1J0SA 2GZBA 3AZZA 3O4OA 2PHFA 2CWMA 5DUWA 3ZXLA 1BA7A 4XFSA 5SV8A 5DG1A 3FBYA 3CQAA 3VT0A 3AJ5A 4QKSA 1V6NA 2A6VA 3N35A 3WUDA 3P6JA 41BIA 4PBPA 3O4DA 1JOJA 1LOFA 4BPZA 4A7KA 4JKQA 1S0LA 1N3PA 1WW6A 1WBAA 1HDKA 1Z2VA 2P39A 3VT2A 3WCSA 2ZGTA 3CNAA 2UURA 4M00A 3USUB 2DYCA 4R9CA 3WDYA 3AH1A 5EG6C 4AN6A 1K5UA 2D44A 3MEPA 2JKBA 2R0HA 4XOGA 2EALA 3UK9A 4AGVA 3WLUA 1YTOA 1D0HA 3AZWA 3JUUA 3UJ0A 3IMNA 1DGLA 2ZMLA 2ERMA 2WT2A 3BA4A 4FPLA 4GKXA 4CRQA 1N3QA 1YRZA 1UPSA 1APNA 4XJAA 4XBLA 1EV2A 2LIQA 5KXDA 4X38A 3UJQA 4Q8KA 3ZSJA 2XOAA 2D7IA 1S0FA 2DVGA 5DG2A 4DQAA 3H6SE 3WDVA 1NLSA 2P3JA 3BIWE 1MZ6A 2ZMKA 5D63A 3POYA 2DVBA 3MW2A 2VSAA 4U2AA 2NVHA 4LO2C 3O0VA 3OY8A 1HWOB 3SLIA 1H30A 1YXWA 4LO1A 5DSSB 4YW3A 4I37A 1MS1A 1G9CA 1AF9A 3AKFA 2OW4A 5EC5A 3WINA 1QOOA 4IHZA 4DPNA 4Y1ZA 4XFUA 1GZ9A 5FZZA 5FZUA 4NOTA 4AN7B 1CONA 4YM1A 1GYKA 4YFWA 3RS6A 3B69A 2A3YA 1AX0A 1KITA 1H9WA 1MS4A 1LEDA 1I3HA 1Q04A 1TTUA 1URXA 1IHKA 3PMEA 1JTCA 3RMYA 3PG0A 1OQLB 4YLZA 3IM0A 3OJMA 1C4RA 1NZKA 4YM0A 5CAZA 4XILA 5GLWA 1II4A 1AXYA 4ZOTA 21BIA 5CA6A 1FX5A 2P34A 5DZEA 4F34A 1ONKB 3WDWA 1ISVA 1GZWB 1AXKA 3ZPYA 2KI4A 3AP7A 3VEQA 3OPZA 4DRRA 4XJ9A 2B7YA 3HMYA 2GMEA 2D3SA 4FP2A 3PVNA 1MS0A 4J2SA 4M3CE 1W6NB 5GZFA 1BZWA 1IKPA 4U36A 5GLZA 1DJSB 3T1LA 4M01A 4GP3A 5JOWA 5BP5C 2BEAA 4JC1A 2WQZC 4XKIA 3CA0A 2ZGSA 2A7AA 5KXEA 1HLCA 1RG8A 1DQ5A 1WW5A 1XHBA 2EXKA 3NWKA 4I4OA 1Q03A 3ILAA 7I1BA 3V64A 1CN1A 1VALA 2A3XA 1MS9A 3PVOA 1JT7A 3QLQA 1LHWA 2AYHA 2YXSA 4FPOB 2ZZJA 1K5VA 2ZQOA 2W39A 1JBCA 2GNBA 4P0LA 1Q8QA 2P3KA 2DVAA 2SLIA 3O4BA 3O4CA 3VKOA 3VT1A 5FNXA 4Y1XA 4JAWA 1W6MB 4ZKTB 3IPVB 2PHWA 1HWNB 2DUPA 1YF8B 4CZSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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