4KBBA

Structure of botulinum neurotoxin b binding domain in complex with both synaptotagmin ii and gd1a
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
430
structure length
417
Chain Sequence
NNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of dual receptor binding to botulinum neurotoxin B.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
molecule tags Signaling protein/toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 103
structure length 417
sequence length 430
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2013-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4kbbA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4kbbA02
2AUYA 3M1HA 2DRYA 3NV2A 1RIRA 3OGGA 2ZQNA 2GDFA 4Y1XA 3D4KA 2D24A 3AP5A 1FWUA 1RG8A 2R49A 1KJRA 1UL9A 2VXRA 1ENSA 1SR4C 2Z49A 3BRDA 2ZACA 3LTQA 4XFSA 2EXHA 1TEIA 5T52A 4YZ4A 2D20A 4I3NA 3N3HA 4P6AA 1PZZA 3O4CA 3IPVA 4JKXB 4XOGA 2GN7A 3IAGC 5BXPA 1LGCA 1N1SA 1HIBA 4CRQA 1WBLA 1M2TB 4YGBA 5T55A 4XE9A 1DJSB 1AXKA 4YG3A 3A22A 1IRAX 5EYXA 2MIBA 2A5ZA 2PHRA 3WCRA 5D61A 4BPZA 4Q9PA 3AH1A 1DZDA 4GKYA 1HWMB 3D6EA 4Z9WB 3O4DA 3VWCA 4GOYA 3SNMA 1WLCA 4G9NA 4FOQA 3WHUA 1DYPA 2NP0A 4FPLA 3H6RB 1MS8A 3IM6A 1N1TA 1SFYA 3R05A 3FJAA 4I4XA 5DZFA 2EALA 4J2SA 4XMIA 2GZBA 5JOZA 1HWNB 4Y24A 1WCSA 2DVGA 4Y1VA 2DUPA 1G8WA 2OW4A 4FOYA 2GMPA 5T5OA 3WDUA 3AKGA 2GNTA 4J2XA 1CPMA 3ILRA 3WG4A 2ZHLA 2D43A 1CVSA 5BP5A 1V6NA 3V0BA 1LECA 3WVJA 3AH4A 1Q04A 1DQ2A 3CA5A 3W59A 4Q1PA 2A6ZA 3FBYA 3BAQA 5T5LA 3OY8B 3WV6A 3ZYRA 2JD4A 2VW0A 1AJOA 4JAWA 1ISXA 2VSEA 4YM3A 3WINA 2XG3A 1F31A 4ZOTA 3AZZA 4ZBVB 1SCSA 2FHRA 1QKQA 2YZ4A 1QOTA 4G6JA 2YY1A 1CJPA 1AVBA 1CPNA 4RA0A 1E0OA 2WT1A 4BOWA 3TAYA 1TWMA 3UJQA 1MS4A 3UJ0A 3FLPA 3SNVA 3O3QA 2A3WA 4GOVA 1Q8PA 4ISRA 4IY9A 3FJDA 1HLCA 5GLUA 2WT2A 1D2SA 1C1FA 41BIA 4TYSA 1PUMB 2SLIA 3B9UA 1IJTA 3BRFA 3IPVB 4QD2B 1W6PB 1QOSA 2MLLB 4K1ZA 5BVPI 4M01A 2TEPA 1MS0A 3WDTA 3WUCA 1O4YA 4ZXKA 2GNDA 3I29B 3RQ0A 3ZSMA 3KMVA 2EIGA 2W68A 4CZSA 4H55A 1AVAC 1HWOB 1QDCA 4IQPA 1T4QA 2ERMA 1GICA 4XJ9A 1FV3A 4I4VA 4Y22B 1GKBA 1APNA 1OQLB 2HW9A 3LLPA 1S1AA 3CA4A 1MD6A 2I1BA 2F8XC 1FN0A 1HKNA 3FJFA 2VH9A 1S0FA 2ZGMA 5DVHA 2CL2A 1SR4A 5DZGA 3OYWB 3IM7A 2P2KA 3OBRA 1DLLA 4K20A 3A0NA 3CAHA 3P53A 4D69A 4IYBA 3I2XA 2K4AB 4Q26A 4CTEA 2ZQOA 2FFUA 4FPOB 2CY6A 2AFGA 1WBFA 3AP7A 2ZGTA 3AJ6A 5GLTA 2YXSA 1KRIA 4LBJA 1XZZA 1YIFA 5B2HA 3WO2A 3I2AA 2IWTB 1VAMA 1N3OA 5HPZA 1AX2A 1GSLA 4DCKC 2KI6B 4QO3A 4RL7A 3CQAA 4ZFWB 4JCKA 1DHKB 2XOAA 2AQZA 1IS4A 4HA2A 3T1MA 2AYHA 1CIWA 3AZVA 1I1EA 3N36A 2KM2A 1OKQA 4R9CA 4XZPA 3RS6A 1LOFC 4A7KA 4PF5A 1FYUA 4JKQA 4FPCA 1W6NB 2ZKNA 3A0KA 2ZMLA 2NTDA 3B00A 3SH3A 1WW6A 4QC4A 1Q8VA 4DQAA 2WSVA 4D0ZA 4Q91A 1HQWA 2Y9GA 2Q9XA 5BYNA 3ZXLA 1BLAA 1PZ9A 5SV8A 3H6QA 4Q2FA 3B69A 1M16A 5JMCA 4LO0C 2WBCA 1PC8B 2DUQA 3H0OA 3AZWA 3AJ5A 3FUOA 4Z8SB 3OJVA 3ZSLA 2CWMA 3N7MA 4H04A 1UKGA 5H9SA 3WMVA 2UWBA 4YW5A 1JT4A 3JUTA 1N3QA 4FQ4A 4XBLA 1RINA 1IOBA 3HALA 4K21A 4OZXA 2A6XA 2ZGOA 1WBAA 2GMEA 3VSZA 2P37A 4I4QA 1DYKA 3BAHA 4Y26A 1HQLA 1W6OB 1W0PA 1HCEA 3T8SA 3WMUA 5HCBA 1A3KA 3AK0A 1FX5A 2D22A 3AFKA 3BRGC 3N7JA 4YM1A 4LO1C 1ISZA 2GNMA 1WBCA 1MZ5A 1QOOA 2R1DA 3UD9A 3D5OA 1W3AA 4BLIA 1MR5A 2M49A 2ERFA 3M3OA 3DGTA 3O4OA 5DG1A 1ULGA 4BM8A 1URXA 1V6IA 4M3CA 4Y1YA 3VKFC 2UWCA 5FREA 2GNBA 1DIWA 3ATGA 2ZGQA 1KDMA 4FP3A 3ZXKA 4FVVA 3F62B 4ATEA 5FZYA 2UURA 3M3CA 4YG6A 1A78A 1AF9A 2QN4A 3NV3A 1XHBA 3FJHA 3MPPG 5IUQA 3ZXFA 1GLHA 2P3IA 1LCLA 1KQRA 1LEMA 3Q7XA 5FNXA 2ZMNA 2VUAA 3K1XA 5CA6A 2E7QA 5CNAA 1WLWA 3O5WB 3WZ1A 3FJIA 1Q8SA 2Y9WC 3AKIA 3AXDA 1VLNA 3EF2A 4AGRA 3ZVXA 3W9TA 1AVUA 4M3CE 2ZGLA 3LSEA 4YM0A 1Q8OA 4Q27A 4LO2C 2D23A 1V6UA 3BAVA 4GP0A 2Q3NB 1N47A 4KEIA 4YZ2A 2FMDA 4YGDA 1JN2P 4Y20B 1V00A 1Q03A 4KEKA 2JJ6A 3Q7YA 1YXWA 4FOWA 1PZ7A 4I4PA 2BEBA 3O5SA 2E53A 1FQ9A 4FPFA 3FJJA 3V79C 1MZ6A 4WBCA 2A75A 4Q1RA 4ZFUB 4I7IA 1LU2A 1LOFA 2DV9A 3A07A 1JT7A 5JDBA 2IHOA 1X50A 3VKNA 4AYUA 5F90A 3CU1B 1GZWA 5DUVA 5L73A 1WD4A 8I1BA 3KM5A 4HANA 4GAFA 4EEEB 3TC2A 4XIKA 3WNXA 3JUUA 2ARXA 1S0CA 1XYFA 3WOGA 2DTWA 3KQRA 1ENRA 2L5XA 3NBCA 5GZCA 1FGAA 4JC1A 4LO0A 1ULCA 1B09A 1FMZA 1TFMB 1LOAA 1F9KA 1GBGA 1EPWA 1BA7A 1BXHA 1F5FA 2DURA 3PHZA 4OUJA 3RTIB 1BLDA 3FUQA 3QCWA 1EV2A 1JOJA 2E6VA 4I4RA 4FPKA 4XJZA 4LBQB 1LU1A 5EG6C 4HR6C 3U4XA 3HR9A 1Y7BA 1TTUA 4YZ3A 5HCAA 5KXBA 2ZGSA 2X2SA 1WW7A 3AYCA 3PVOA 5EWSA 3OJMA 3FJ9A 1ISWA 3MW4A 4USOA 2WLQA 1IILA 4LO8B 1ISYA 5DUYA 3WDXA 2HYKA 3QR5A 4SLIA 2RHPA 3BX1C 3ZC8A 5EHAA 2ZR1B 4DENA 3APBA 1V6XA 1JYIA 2VY0A 3BA7A 2FGFA 2ENRA 4GAIA 3OGFA 3WLUA 1RITA 4LO1A 1EVTA 3F1RA 3W58A 4ITCA 1BFGA 5HCFA 1BKZA 3ASIA 1LOGA 3RTJB 2WJSA 4MYEA 1T9FA 2K43A 1Z78A 1KDKA 3MW2A 4LBMA 3WO3A 3HSMA 2W08A 2Y9XE 1JXNA 4ZKTB 1MS5A 4OWLA 4ZA3B 3AH2A 2GMMA 4YOLA 3DUIA 5FNWA 4FPHA 5F9TA 3GALA 1IS3A 4P0KA 2CYFA 1JT3A 2WQZC 3RG0A 1YI7A 1MVEA 6I1BA 4YW4A 3ILNA 3WUDA 5I1BA 5JOYA 3WDYA 5T5PA 2EF6A 3CA6A 1HKDA 4LO7C 1G82A 4DFSA 3BADA 1V6MA 2A6WA 4JP0A 3OBTA 1AJKA 4PC4A 5D62A 3ZPYA 1CN1A 5EYYA 1MS3A 1DQGA 2AENA 4XXPA 4LO2A 4AN6A 4QKSA 1U0AA 3LCPA 4WVVA 3SH5A 1H9PA 2D44A 2R0HA 5E8AA 4XIOA 2VLCA 4C1XA 2ARBA 1IKPA 2LTNA 1ILR1 2ZZJA 2KH2A 3UD7A 3FGMA 2G4IA 1GZCA 4IONA 4XJAA 1QMJA 5IK8A 1BASA 4YLZA 1JQZA 1W6MA 2NMNA 5FRAA 3SISA 2DYCA 2ES3A 2XB6C 1JT5A 2PELA 3PG0A 3R4UA 2MC2A 3FLRA 1ULFA 3AP6A 4R9AA 3S8KA 3NWKA 5KXDA 4J2YA 4XKIA 2LALA 3V0BB 2PHWA 3WCSA 2RSTA 3MEPA 3O0VA 4I8MA 1G86A 2YUGA 5DUWA 2RG9B 3FFZA 2VW1A 1JHNA 2D7FA 1XQNA 1Q8QA 1S0BA 1GNZA 4GKXA 1H9WA 4GALA 3AP9A 2EXIA 2R0FA 3VT2A 2JDZA 4YZ1A 1WD3A 1V6KA 5F5QA 1BYHA 3ZX7A 4AN7B 1KNMA 4PBPA 1LGBA 2D7IA 3AX4A 4ATFA 2DREA 4FQZA 1ULDA 2ZHMA 1PWAA 4AGGA 2PHXA 4JQ0A 3A23A 1I1BA 3ENRA 3IN9A 2VSAA 3VEQA 2ZBJA 1G9FA 4YW3A 1LHUA 2DU0A 1WUVA 1EYLA 2OUHA 4GWMA 5IK4A 3AJZA 5KXEA 3O4BA 4II0A 4P9XA 3POKA 3T2TA 1JLXA 3IM5A 1S0GA 1ULEA 3CA0A 2KLLA 5BQUC 1NUNA 1S0EA 4X37A 4ZLBB 4ENDA 2HWMA 4I37A 1QQKA 2FFVA 1FATA 4D0TA 4XJWA 2X2TA 2WNEA 2AGSA 1LODA 4YFWA 5GLWA 5KXCA 4LBKA 5GLZA 3SH4A 4KEJA 5CB7A 1AX0A 1ONAA 2FO1A 1V6VA 2W52A 2ZHKA 4I1EA 3USUA 1PUUB 2AXMA 2WKKA 3RSJA 1DZQA 1MS1A 4QKRA 4I96A 2GO2A 4QALA 5IT6A 3AJYA 5GM0A 3AKHA 3FJKA 3VKOA 1AXZA 2H0BA 1NXD1 4R9DA 2NZ9A 1BQPA 1N4KA 2EXJA 2P34A 1DQ6A 4XTMA 2R1BA 1IKQA 5H9RA 2Q5TA 1LOEA 1OQ1A 3O49A 2R9KB 4YG0A 1SACA 4ZGRB 3RRDA 4YW1A 4BMEA 1LJ7A 3M3EA 1LENA 3ILAA 1UN1A 1DQ5A 1WLDA 2WSUA 2ET2A 2NM1A 3AKFA 2OVUA 2ZABA 1ENQA 3SITA 4IHZA 3A21A 4I0YA 4FPJA 3UK9A 1AVWB 1R8OA 4OEEA 5LK5A 3B01A 2BEAA 1CQ9A 2D6OX 1WW5A 2P23A 1DGLA 3C2UA 1BFFA 1BZWA 1ABRB 1LHWA 1GNHA 3TB0A 1BFCA 3FJBA 4DEPA 4BLJA 4Q8KA 3H6RA 3V0AA 4WVWA 2PHFA 2D1ZA 2LIEA 2D3PA 3R4SA 3NBEA 1UAIA 2VXTI 2Y9FA 4YZ5A 2ZMKA 2ZAAA 1VAVA 3RMXA 4QBVA 4P9YA 2RQ9A 5DSSB 2LIQA 5EC5A 3I4IA 3IIRA 3VT1A 1JUIA 4M3CF 2C5DA 2A6YA 4K1YA 1CESA 3O12A 3O0WA 4AVSA 2NVHA 1YBIA 2EAKA 3HMYA 4FGFA 1IT0A 1KJLA 5BXTA 4EFPA 1FMMS 2E7TA 4NO4A 1NLSA 1WW4A 2A6VA 3IM0A 4XFUA 2AAIB 3VV1A 1LESA 2F2FC 3L2YA 4PCRA 3B9CA 3O44A 3FJ8A 1SLAA 1UZYA 4LO3C 2D3SA 2DRZA 3OY8A 2E4MC 4XFTA 1K5UA 5D63A 9ILBA 3GNEA 2YV8A 1R8NA 1S0DA 5GZGA 4I2SA 4UW6A 2WRYA 3ZXJA 4HJJA 5H9QA 2FDBM 1UMZA 2SBAA 1QDOA 3BIWE 3VUOA 4C1WA 4XBQA 2JE7A 3CA1A 3N0KA 5BXRA 2BQPA 2QYIB 2ZHNA 2D6MA 1SLBA 3ZXGA 1DQOA 1IS5A 4Q9GA 2P3KA 1IOAA 3BA4A 3WG3A 1ZM1A 4XJ8A 3WA1A 2EXKA 5H9PA 3T1LA 3WDWA 5DG2A 5JOWA 3P6IA 2Z48A 2WT0A 5BQUA 3RMYA 4AGVA 1QGLA 1AFCA 1W6PA 1Z2VA 4IZXA 5E24E 2A3YA 1HDKA 1OFSA 1G9AA 1SBDA 1XG6A 1VCLA 4LO7B 1FAYA 1NZKA 4F83A 1YRZA 2NYYA 3BB2A 2VU9A 3AXEA 2J3PA 3BAUA 1DQ4A 3AZXA 4XJUA 1AX1A 1H30A 1LHVA 4DRVA 3S8JA 1RY7A 1SZ6B 1UPSA 1YTOA 4UW4A 3WHTA 3NV1A 4P0LA 3AYEA 4FPYA 3BOPA 3QLQA 4JRAA 1V6WA 4Y22A 2R16A 5BXSA 4M3CB 3V0AB 1ISVA 2ZGUA 3BODA 1Z0HA 4W65A 1S0IA 2ZGPA 4PQ9A 1QQLA 3N7KA 3OPZA 5GZEA 2C9AA 2V73A 3OYWA 4ASMB 3INAA 3NV4A 2A3XA 4EFQA 3ZC9A 1DQ1A 1J0SA 4DPNA 1QXMA 5JVVA 1DZCA 1SBFA 1A8DA 2NN8A 4I1BA 2ZGNA 2D6NA 3WG1A 5AVAA 3MALA 3VKMA 3POSA 3M2MA 1W0OA 1JLYA 5F8SA 1BFBA 1IHKA 1RMLA 1SLCA 3POWA 4EKXB 4I30A 2I2SA 2ZGRA 3ZSKA 1MS9A 1IRPA 1SLIA 2UU8A 1QF3A 2JECA 3V65A 4J23B 3CRHA 2GN3A 5T50A 4LBNA 2JKBA 1DBNA 5FZUA 1K5VA 2CNAA 4G1RA 3VT0A 3HN1A 4I6IA 4GA9A 4FPGA 4OW4A 5T5JA 1JTCA 2W39A 1CVNA 1UX6A 1DFQA 5CAZA 4R9BA 1W6NA 5F8WA 4HL0A 1N1YA 1AZDA 2ZA9A 3AYDA 1GV9A 4D8HA 1GZWB 4FP2A 4YGEA 1II4A 1QNWA 1IS6A 1SBEA 1G9DA 3PJQA 1GANA 3N7LA 1SLLA 4FPEA 4BQ1A 4X38A 3AZYA 4YW2A 1HCDA 1HWPB 1V6JA 1FV2A 4LBLA 4IY8A 4I4UA 2AH2A 4UW5A 4P14A 2F2FA 2CWSA 1SCRA 2Z42A 1JBCA 3A4UA 4LO3A 1YYNA 7I1BA 4A7YA 3BAOA 2E4MA 4CJMA 5DUXA 4A7ZA 3H6SE 3VSFA 4Y1UA 3HOMA 3FLTA 1FNYA 3D7WB 1G7YA 2DWRA 4GP3A 3QYDA 2V5YA 1P63A 4XBNA 1CONA 5GJ6A 1W6QA 3I8TA 3CRIA 3PUBA 4PBOA 1LHOA 3C9ZA 4XILA 1G9CA 4XXAA 1DFCA 5JOXA 3WDVA 1W3GA 5BOWA 4EB2B 3UJ4A 3V64A 3PVEA 31BIA 1KITA 2PHUA 3JRRA 1LEDA 1CR7A 3SLIA 4U2AA 1N1VA 2B7YA 4X39A 2KI4A 4QBCA 2DS0A 1W6OA 2AR6A 4L4HA 2VW2A 1MVQA 4OEGA 4TZDA 5F8YA 1FWVA 2DVDA 4OWJA 4XDQA 3NJ5A 3P6JA 1J1TA 4KC3A 3PMEA 1GGPB 1UZZA 1C1LA 4Q8LA 4I4SA 1V6OA 4G9MA 3NBDA 4WV8A 4XHBA 1AVXB 2HWAA 1TWEA 2YROA 4X3AA 4L4IA 4KBBA 4AVVA 3O0XA 2A71A 4OEFA 2P3JA 2PHTA 3WO4A 1LOCA 5IK7A 4TLPA 1GYKA 3Q9OA 1I3HA 2UUSA 4QD2C 1JY0A 2OUJA 4Y1ZA 1YO8A 1MC9A 4AVTA 1QNYA 4BMBA 2DUOA 3Q7WA 3UL2A 1TIEA 3M3QA 1BJQA 2UWAA 3HBWA 5DXDA 2HZ9A 2AREA 5G00A 3VKLA 5GLVA 3AP4A 1FNZA 1RZOB 4WZFA 3ILFA 3UD8A 3BAGA 1LTEA 4NOTA 2BFHA 3CA3A 3NBNA 2K8RA 3BA5A 4XTPA 2D7RA 3FJEA 1GZ9A 2KKIA 1SLTA 5GALA 1C57A 4Y20A 1Q56A 4P0JA 4LBOA 2D6LX 1R1ZA 4YFZA 1ITBA 5GZDA 4I4OA 4ISQA 1YF8B 1V6LA 4USPA 1D0HA 21BIA 1S0JA 3ZSJA 4U36A 1L2HA 1W6QB 2ESUA 5IK5A 4XHXA 1W6MB 4UW3A 4AWDA 1C4RA 1JW6A 1ZA4A 5DUUA 2D3RA 2D6PA 1Q1UA 2GALA 3LSDA 1PZ8A 5BP5C 2E51A 3O4AA 5DZEA 3OJBA 3ZXDA 4JPZA 2NMOA 3AYAA 1LOBA 4XYXA 4I4YA 4OWKA 4M00A 1LULA 5EXOA 3ZYPA 2A70A 4YM2A 2ZGKA 2CTVA 1DQ0A 3B3QE 4R6UB 4YGCA 4XMAA 3ZXEA 3WINC 1O4ZA 5E88A 4DRRA 3JU9A 3E8LC 2DVAA 4IZEA 3PVNA 3FJCA 2JE9A 1BARA 3OJ2A 1N3PA 4GWNA 5JLVA 4Z8BA 4LBQA 3UJOA 1QU0A 4F34A 4ZFYB 3N35A 2P39A 1TOOA 1VIWB 4L8QA 3IKWA 3POYA 2DVBA 5DZUA 3MW3A 5T54A 2DTYA 3WG2A 1G9BA 4G6MA 2D6KA 2DVFA 1AXMA 1CE7B 5CBLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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