5JLVA

Receptor binding domain of botulinum neurotoxin a in complex with human glycosylated sv2c
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
427
structure length
425
Chain Sequence
PMNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYANKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title N-linked glycosylation of SV2 is required for binding and uptake of botulinum neurotoxin A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 117
structure length 425
sequence length 427
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2016-04-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 5jlvA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 5jlvA02
1L2HA 4X38A 2ENRA 1UX6A 4YZ1A 4YW2A 1V6NA 4I1EA 2UURA 2KM2A 1I1EA 5DXDA 1OQ1A 5EG6C 3ILAA 4A7KA 2PELA 1LOBA 5SV8A 4GAIA 2DUOA 2DTWA 2WRYA 5CBLA 2I1BA 3L2YA 4XFSA 3DGTA 3FJ8A 2E4MA 3BAOA 3V79C 1W6PB 4LO7C 3V0AA 5GZDA 2E53A 2ZHMA 5GLTA 5JOYA 3O4CA 3I29B 1N1TA 1WW7A 2ZGUA 4GAFA 3AH2A 2DUQA 2Z48A 1QQLA 4YGCA 4TLPA 5GZGA 3BRGC 1JLXA 5JOZA 3VT0A 5T5PA 3KQRA 4HJJA 3VKNA 1EVTA 4FPFA 3RMYA 2ZACA 3VUOA 4FVVA 4FPCA 3FGMA 2GN3A 2VY0A 1BYHA 3WHTA 1RG8A 3F1RA 3P53A 3VKOA 4I96A 3IPVB 1MS3A 4PCRA 3GALA 4AVSA 2WSUA 1PUUB 4F34A 1S0JA 5F5QA 4ASMB 5BOWA 1G9BA 4C1XA 3VT2A 1ISXA 3WMVA 2WNEA 2A3WA 1FX5A 1VCLA 4I6IA 1G9FA 2ZMLA 4U36A 3AJ6A 2NN8A 5BYNA 3TAYA 3AJ5A 2EIGA 1II4A 3H6RB 3T8SA 1BFCA 3IM0A 1QMJA 4A7ZA 2D23A 3IM7A 4AN6A 3WDTA 1G9AA 4R9CA 1IS5A 5E88A 1AF9A 3O4DA 4JPZA 1IOBA 3AFKA 3RTIB 1V6JA 4K21A 1ENQA 4YG0A 3WINA 3FLTA 2IHOA 2ZAAA 1JY0A 1DQGA 1KDMA 1H9PA 3N0KA 3BRFA 4YW3A 3D7WB 3O4AA 2A70A 5GJ6A 3MW2A 1SACA 4OEFA 3P6IA 2ZA9A 1BLAA 1CESA 2YXSA 5GLZA 2ZQOA 1SLBA 4DFSA 4FOWA 3HALA 3K1XA 2CWSA 5GLWA 4M01A 1DFCA 2D22A 1SFYA 1G86A 3IPVA 3AYAA 2E6VA 4LBJA 3RRDA 4J2YA 3O5SA 4I37A 2Q3NB 2P34A 3ZC8A 1ENSA 3BTAA 4LBKA 1Z4SA 3ZSJA 5FREA 4OEEA 1Q8VA 4DEPA 4EKXB 2CTVA 3QR5A 3VKFC 1JW6A 1N3PA 1Z2VA 2R1DA 1UAIA 2MIBA 4G6JA 3PG0A 4Z9WB 3FJFA 3O4OA 4CJMA 2ZMKA 3R4SA 4Y20B 1DHKB 1Q8OA 3DUIA 4J23B 3BX1C 2ZGLA 1ULCA 2K4AB 2OUJA 1DFQA 5D61A 4BOWA 2VU9A 1W0PA 3A0KA 3SNVA 3OY8B 4PC4A 1AX0A 5KXCA 5HCAA 2HWAA 2A3XA 3OBTA 4QKRA 3JRRA 3SNMA 5F8SA 4XBNA 3O3QA 1OFSA 4LBMA 2Z49A 2WJSA 3PVEA 2AYHA 1AVUA 1GGPB 5GZFA 1SBFA 2R0HA 2A6XA 1RITA 3SITA 4FPOB 1UPSA 1AX1A 4G6MA 3VEQA 3NBCA 3N7JA 3IM5A 4M3CE 1AXYA 4BPZA 3PUBA 1WBFA 3P6JA 2Z42A 3KMVA 1DQ5A 1KRIA 1XZZA 3GNEA 4Q1RA 2PHXA 2GMPA 3A23A 2A6ZA 1KNMA 5DUVA 1VALA 1JQZA 3FLRA 4LBQA 4BQ1A 2D6OX 3USUB 5DUUA 4DRVA 4II0A 3SLIA 1Q8SA 1LU1A 2D6MA 4XXPA 3AZYA 2ZHKA 3O5WB 4DCKC 3HOMA 2AENA 1T4QA 5T5JA 1CE7B 3WLUA 3MEPA 1C1FA 1PZ8A 1BA7A 4Y20A 3WDYA 1G9DA 2ZQNA 41BIA 2ERFA 2K43A 2ZGQA 1LEMA 3BIWE 4QALA 5KXEA 1VAVA 5IK5A 1WBAA 4DRRA 3CRHA 3B3QE 2OUHA 4U2AA 4EEEB 4XJAA 2P23A 4LO2A 1WLCA 5EXOA 2ZBJA 2GNDA 3WO3A 4ATFA 5I1BA 4MYEA 2ZR1B 1QDCA 1HQWA 1MR5A 5FNXA 5BXRA 4XJZA 4AN7B 4ITCA 3NV1A 2JECA 5JOXA 2JD4A 1XYFA 5HCFA 3CU1B 1KITA 4YLZA 2PHUA 1LODA 3SISA 1N4KA 4M3CF 3UL2A 5F90A 4IZXA 1UL9A 4DQAA 1ABRB 5GLUA 1BLDA 4AWDA 3CA5A 2FMDA 2D43A 1BASA 1J0SA 3AZWA 2NP0A 4FPEA 1Q8PA 3ZXEA 4M3CB 3VKMA 3UJ4A 1ENRA 2AXMA 5E89A 2D3RA 2DU0A 4XFUA 3UDAA 5BXSA 2X2TA 1LJ7A 3OJMA 1FMMS 1ULEA 4ENDA 2D6LX 1O4YA 1LGBA 3D4KA 2QN4A 4IHZA 5IK8A 4X39A 4FP2A 3BADA 2VXRA 1RIRA 1AJKA 1N3QA 4QD2B 1ULFA 1UMZA 1LOGA 4R9BA 1QQKA 5FZZA 3WO4A 1MVQA 1LHUA 3A21A 3N36A 5BXTA 1W3GA 4KEJA 31BIA 2AH2A 4XMAA 1EV2A 4K20A 2DVDA 1QOOA 5T54A 3WDXA 3H0OA 5DG1A 3M3QA 3FJAA 5GZCA 1M2TB 1W6NB 4XOGA 2LALA 4ZA3B 2E7QA 4OW4A 4J2XA 4LO2C 4I30A 1W3AA 1DJSB 4R6UB 3ZSMA 4ZOTA 1WD3A 3FBYA 4IZEA 1W6MB 3JU9A 3HBWA 4H55A 2CL2A 3NBEA 1S0DA 1NXD1 4HR6C 3UJQA 1TWEA 2A7AA 1AVXB 1BFGA 2Y9FA 3HN1A 4AGRA 1QU0A 1BFFA 3PHZA 1GZ9A 4H04A 1JT7A 1LOFA 2XG3A 5BQUA 1JT4A 4YGDA 4UW3A 4GXLA 3FJIA 5AVAA 3I2AA 1F31A 3BOPA 2P3IA 3AK0A 3POSA 1VLNA 1WW5A 3B01A 5BXPA 1I1BA 3RQ0A 1MZ5A 4H9WA 4BMEA 3AKIA 1ONKB 1HWPB 2JE9A 4LO3A 5BP5C 4LO0C 4LBNA 2HWMA 1DIWA 3PVOA 5DUYA 4XYXA 1LECA 1HQLA 4ZXKA 4UW4A 4JKQA 4HL0A 1CPNA 1W6NA 3AKGA 1LULA 4Q9PA 3WHUA 5DUXA 3MALA 3I2XA 3ZPYA 1Q1UA 1LOCA 1D2SA 1LGNA 3JUTA 4J2SA 4IONA 3FUOA 1EPWA 5T50A 3VWCA 1LGCA 5IT6A 1IS4A 2PHWA 3WVJA 5E24E 3WUCA 1VIWB 4WZFA 1IS3A 2GMEA 2Q5TA 4P6AA 1ITBA 2NVHA 1BXHA 1YYNA 1IT0A 4XBLA 2DRYA 2ET2A 3ENRA 4FQ4A 4Z8BA 1PZ7A 1GKBA 4GALA 3WNXA 1F9KA 4XMIA 2LIEA 2P39A 3FJJA 1I3HA 3O49A 3UJOA 3BAVA 3AZVA 1WBLA 4ISRA 1V6MA 1DZQA 4C1WA 1KJLA 1JTCA 3BRDA 1PZ9A 3C2UA 3T2TA 2D7IA 1ISZA 2VW2A 1T9FA 1V6VA 1LOFC 3W59A 4USOA 1VAMA 1LTEA 1QKQA 1HWOB 1HIBA 3BODA 1JOJA 1GZWB 4OWJA 1YIFA 4EFPA 2M49A 2GN7A 3WDUA 4L4HA 1FGAA 4PBPA 1W6PA 4YG3A 1APNA 4P9YA 1TOOA 6I1BA 1ZA4A 1QNYA 2NMNA 3FJHA 5F9TA 3AXEA 4XDQA 1MS0A 2FFUA 3W9TA 2FGFA 1W6QB 4G9MA 2R0FA 2UWBA 1TP0A 1IRAX 4D69A 1AVAC 2W68A 1DQ4A 1MS9A 1A8DA 4DS0A 2E4MC 3TC2A 3ZXFA 5DZFA 3WZ1A 1QOSA 2EXJA 3BA5A 3LTQA 1QF3A 4CTEA 4YW4A 2YMZA 2D20A 1UN1A 1SLTA 3NV3A 4AVTA 1V6WA 3AYCA 2NZ9A 4YGBA 2W08A 3UD8A 3PMEA 4XTPA 1H30A 2JDZA 1CR7A 2JKBA 4JRAA 1DQ1A 1LCLA 2D1ZA 3AXDA 1V6XA 3MW4A 1AFCA 2G4IA 4WV8A 3V0BB 3H6RA 2WBCA 4FQZA 3ZXKA 4I0YA 1QOTA 3VT1A 3ZYRA 1IHKA 1N47A 4XIKA 4IYBA 3KM5A 4FPHA 5GALA 1CONA 1LOEA 2A71A 4ZFWB 1MD6A 4TZDA 2D7FA 1FNZA 2CNAA 2DREA 3AP5A 1AX2A 2J3PA 3OPZA 4FPKA 3F62B 3RMXA 2SLIA 4Q2FA 1C4RA 1NUNA 1IKQA 4WVVA 1FV3A 1W6QA 1B09A 3PVNA 3BAHA 4I4PA 2F2FA 1CVSA 1DQOA 3ZC9A 3N35A 3AP6A 4WVWA 2WT1A 3ILNA 4I4YA 4QKSA 2FO1A 1X50A 3ZXJA 4I2SA 4R9DA 4I4OA 1LHWA 2KLLA 1RZOB 2MC2A 2AFGA 1FV2A 3UJ0A 3WINC 3FJKA 3O0XA 4XHXA 2IWTB 2A5ZA 5L73A 1FN0A 3T1MA 1EYLA 3H6QA 5IUQA 3FFZA 3O12A 3A0NA 3WO2A 1HKDA 5T55A 3WDWA 3WG3A 4Q1PA 5DZGA 4Q9GA 1KDKA 4YM3A 2ARXA 1YRZA 4JC1A 4FOYA 2CWMA 1QDOA 2DU1A 3WCSA 2LTNA 4BLIA 8I1BA 3QCWA 3D6EA 1TFMB 3V0BA 1NLSA 1ZM1A 2V73A 4Y1ZA 2FHRA 4QBVA 1MS8A 2DRZA 1HDKA 4ZFYB 1W6OB 1IJTA 1O4ZA 3A07A 2VH9A 4Y26A 4Z8SB 4FOQA 2F8XC 4OWKA 1IS6A 2GZBA 3OY8A 4JKXB 1V6IA 1DQ2A 1PWAA 2GO2A 2VLCA 3AH4A 3Q7YA 4XILA 4GKXA 3WDVA 2ZGMA 3AJYA 3AYEA 4Q8LA 2DVGA 2UUSA 2RSTA 2BFHA 1IKPA 1MS5A 4GOYA 2BEBA 4LBQD 2E7TA 4LO7B 3UK9A 4DENA 3WG1A 2D7RA 2DTYA 2GNMA 4ZLBB 3LCPA 2AREA 3CA3A 4YZ5A 5DVHA 4Y1VA 5D62A 4AGGA 5LK5A 4OWLA 2WKKA 2ZGSA 1HCDA 1F5FA 3V64A 2F2FC 3VSFA 3AYDA 3R05A 4A7YA 4P9XA 3Q7WA 3RSJA 3USUA 1A3KA 2KI6B 4D8HA 1KJRA 3M3OA 4XTMA 2EXKA 4OZXA 1JXNA 2H0BA 2C5DA 3CA0A 4R9AA 2E51A 3ASIA 4LO1A 2ZABA 2AQZA 1SLCA 2D6NA 2DURA 2ERMA 1N1VA 2NMOA 3M2MA 3NBDA 5EHAA 3A4UA 4YOLA 4Y24A 2C9AA 1W3FA 5JLVA 5GZEA 3AKHA 2UU8A 1FQ9A 1G7YA 5EC5A 1MC9A 4HA2A 1V6UA 5CA6A 3VKLA 2DVFA 4BM8A 4KEIA 2I2SA 4M00A 1MZ6A 3BAGA 3ZSLA 1BZWA 2TEPA 3WV6A 4BLJA 4JAWA 4LO8B 4I4RA 1W0OA 1H9WA 5T5OA 2Y9XE 1XG6A 3S8JA 5FNWA 4DPNA 3POKA 4YZ3A 2NYYA 4K1ZA 3O4BA 2ZGRA 3CA4A 3LLPA 4OUJA 1DYPA 1GZCA 1S0BA 2YROA 3M1HA 4BMBA 4P0JA 4XHBA 2DUPA 2X2SA 4FOVA 1JN2P 5IK7A 5DSSB 4FPLA 3AH1A 1D0HA 5F8WA 3TB0A 2BEAA 3V0AB 4M3CA 3I4IA 4KC3A 4YFZA 2GALA 5H9QA 2NM1A 4FPJA 2Y9GA 2AGSA 3E8LC 4UW5A 3N7LA 5EYYA 4XJWA 2ZMNA 21BIA 3N7KA 2K8RA 2HYKA 3VSZA 2D24A 1XHBA 4FPGA 3BAQA 5GLVA 4XXAA 1MVEA 1LHOA 4PQ9A 4EFRA 5JVVA 3WUDA 5H9RA 1FATA 4LO1C 1FNYA 2JJ6A 1FAYA 3N7MA 2ZZJA 2WT0A 3ZVXA 2AUYA 2VUAA 2HZ9A 5D63A 1V00A 1R1ZA 5DG2A 2EXHA 1HLCA 3AP9A 2YY1A 1DQ6A 1YI7A 1CJPA 3NV4A 2V5YA 1TTUA 2ZHLA 3WCRA 2VSEA 4XE9A 1Q8QA 1BJQA 4JCKA 3WG4A 4XZPA 3ZXLA 2RHPA 5H9SA 2WSVA 4YGEA 1LEDA 2L5XA 4RL7A 1ULGA 4W65A 3IAGC 3R4UA 1AVWB 3O0VA 1XQNA 3OBRA 2D44A 1W6MA 4Y22B 3CA1A 1LOAA 3V65A 4I3NA 2GMMA 1MS4A 1CPMA 1LESA 4YM2A 2QYIB 3LSDA 2AR6A 4SLIA 4RA0A 2OW4A 3RTJB 2YUGA 4X3AA 1GLHA 1AJOA 4YFWA 4TYSA 1URXA 1ISVA 3ZSKA 3UD7A 1S0FA 3D5OA 2ZKNA 3OGFA 1WBCA 2WQZC 2DS0A 2WLQA 1JHNA 2A6WA 4XKIA 3AJZA 4XFTA 3RG0A 1JT5A 4OEGA 1SLAA 1ONAA 1TIEA 1JUIA 1V6LA 5KXBA 2CY6A 2ARBA 4GWMA 4NO4A 2KI4A 2XB6C 4PBOA 3CRIA 4I4XA 1WW6A 1WLDA 5BQUC 4ZFUB 2NTDA 2A6VA 3OJBA 1YTOA 3ATGA 4GOVA 4QD2C 2AAIB 2D6KA 3B9UA 4YW5A 3O0WA 3LSEA 3IIRA 1YF8B 1GYKA 2VW0A 1JLYA 1Z78A 3SH4A 3OYWB 4LO3C 1N1YA 4IQPA 2RQ9A 4ZBVB 2A75A 4QBCA 2P2KA 4Y22A 1GANA 4I1BA 9ILBA 1WW4A 1OKQA 1DYKA 3B69A 1GSLA 2WT2A 4XIOA 2ZGNA 4Y1XA 2ZHNA 3RS6A 1SZ6B 5CNAA 1GNHA 3SH3A 5FZYA 1M16A 4Q91A 3CNAA 2Q9XA 2P3JA 5FZUA 4JP0A 4KBBA 3WA1A 1TWMA 1Z0HA 2OVUA 2R1BA 4LBLA 3NWKA 1QXMA 5T5LA 2VXTI 4IY8A 5BVPI 3O44A 2DV9A 2HW9A 1AXKA 1CIWA 4GWNA 3FJ9A 5EYXA 1IRPA 2VW1A 1WLWA 3MPPG 1S0IA 1SR4A 4WBCA 1QGLA 3ZYPA 4LBQB 2YZ4A 1AXMA 1N3OA 1GZWA 1BFBA 2EAKA 1YXWA 4Q8KA 3POWA 3IKWA 1PUMB 3BA7A 1YBIA 3AX4A 3Q9OA 5HCBA 1MS1A 4HANA 1UZZA 3CQAA 3AKFA 3OYWA 4Y1UA 1SBEA 2UWAA 2W52A 2GNTA 2FFVA 4FGFA 2A6YA 2DWRA 3A22A 3BB2A 2P37A 2PHFA 1P63A 3BAUA 3ZXGA 4QO3A 4ATEA 2PHRA 4P0LA 3S8KA 5G00A 3FUQA 2SBAA 2DVAA 1WCSA 3WG2A 4GKYA 5HPZA 3BA4A 1HWMB 2BQPA 3HR9A 3AZZA 1SBDA 2R9KB 4J2KA 1N1SA 2DYCA 5KXDA 5IK4A 3C9ZA 5GAQA 1WD4A 4IY9A 5JOWA 1SLLA 1Q04A 3QYDA 4UW6A 4YW1A 2XOAA 4Q26A 3FJBA 1C57A 2CYFA 1WUVA 4D0TA 4Q27A 3ZX7A 1GICA 4XBQA 3NBNA 1SLIA 4P14A 1GNZA 1JBCA 1RINA 1AVBA 1K5VA 3B00A 3FLPA 1GBGA 3PJQA 3ILFA 3N3HA 1BARA 1TEIA 1S0CA 5F8YA 1UZYA 3FJCA 2KKIA 5EWSA 3NV2A 1U0AA 1SR4C 3OJ2A 3M3CA 3VV1A 3ILRA 4I4VA 4G1RA 1HWNB 4ZGRB 1JYCA 5E8AA 1RMLA 3JUUA 4L8QA 1R8OA 4I8MA 3U4XA 1FYUA 1FWUA 1YO8A 3NJ5A 3WMUA 3SH5A 2ESUA 3MW3A 2ZGKA 2FDBM 2PHTA 4L4IA 4GA9A 5CB7A 1OQLB 1R8NA 3M3EA 2MLLB 4P9WA 5DZUA 2R16A 4I4UA 4QC4A 2ZGPA 3Q7XA 3B9CA 1ILR1 2DVBA 2ES3A 4GP3A 1Q03A 3WOGA 4YZ2A 1AXZA 2Y9WC 1JT3A 4I4SA 1DZCA 1ISYA 3IM6A 2LIQA 1HCEA 1IILA 1C1LA 4GP0A 1DLLA 3IMNA 1JYIA 1KQRA 1ULDA 4G9NA 4NOTA 1W6OA 2YV8A 3OJVA 4ISQA 1PZZA 3OGGA 1MACA 4CZSA 1DGLA 1ISWA 3APBA 4I4QA 5H9PA 3W58A 2JE7A 5JMCA 3AZXA 3HMYA 5BP5A 3CAHA 3AP7A 4LO0A 1E0OA 4USPA 1BQPA 4EB2B 3CRGA 4AYUA 2ZGTA 4YZ4A 4EFQA 4AGVA 3POYA 1DBNA 3CA6A 4FPYA 1LHVA 5B2HA 1FWVA 3AP4A 2GDFA 2R49A 3FJDA 1Q56A 1LENA 1S1AA 4YM1A 4ZKTB 1UKGA 3T1LA 3ZXDA 1DZDA 2KH2A 1CN1A 5DUWA 2D3PA 2EXIA 1IOAA 1S0LA 1AZDA 5T52A 1PC8B 1LU2A 4I7IA 4K1YA 1G9CA 4XJ9A 3I8TA 1S0EA 1GV9A 3FJEA 1Y7BA 1V6KA 1FMZA 4KEKA 1CVNA 1K5UA 2B7YA 3EF2A 3INAA 2A3YA 3IN9A 1G8WA 1BKZA 5CAZA 7I1BA 4YG6A 2P3KA 4YM0A 1QNWA 1SCRA 1HKNA 1NZKA 1DQ0A 4XJ8A 5FRAA 4CRQA 4P0KA 1SCSA 5GM0A 5DZEA 4PF5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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