5JLVA

Receptor binding domain of botulinum neurotoxin a in complex with human glycosylated sv2c
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
427
structure length
425
Chain Sequence
PMNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYANKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title N-linked glycosylation of SV2 is required for binding and uptake of botulinum neurotoxin A.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
total genus 117
structure length 425
sequence length 427
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2016-04-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 5jlvA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 5jlvA02
1QDOA 1G9CA 1AVUA 1YBIA 2IWTB 3VKMA 5JMCA 3IPVA 2P34A 1DYPA 5GALA 1TWEA 4I4XA 2FO1A 3CNAA 3AP4A 3N7MA 4XKIA 1CQ9A 2NVHA 3WVJA 4Q8LA 3AZXA 1PWAA 2EALA 4Z9WB 2HW9A 5DUYA 2UURA 1QKQA 4Y26A 2LALA 1AX2A 1GICA 3OY8B 4I4UA 1AXKA 1ONAA 2JD4A 4Y1XA 2XB6C 2JE7A 1GZCA 2NZ9A 4FQ4A 4YM0A 3AXDA 1T4QA 2D7IA 4G6MA 1TTUA 4F34A 1S0GA 3PUBA 1NXD1 4I4RA 2K43A 2RG9B 5GZDA 3AP6A 4H55A 1TIEA 5KXBA 1FATA 1SFYA 2P2KA 1MS8A 1RG8A 2GMEA 4GP0A 3NV4A 1PUUB 3VSFA 1QOSA 3RS6A 3H6RA 1J1TA 2FHRA 1F5FA 3N36A 4LBQA 2R9KB 1KJRA 4I4SA 4USPA 3FJEA 5DG2A 3WNXA 4P9YA 1V6OA 1RINA 2ZGRA 3OJVA 4WBCA 1NZKA 3O4AA 3JUUA 1WD4A 1C1LA 1IKPA 1QF3A 5I1BA 4HL0A 5IUQA 2DVAA 4IQPA 1GKBA 2ESUA 1EVTA 3RMXA 3BA7A 2EXJA 5CNAA 2B7YA 3WDTA 2KI4A 2ZHMA 4UW6A 1JT7A 4TZDA 2ZGOA 3O12A 1FNZA 3SH4A 1GSLA 1S0EA 2J3PA 1LESA 2Z49A 3BB2A 4XMIA 3OY8A 3K1XA 1LHUA 3AZVA 3FLTA 4X38A 2ZBJA 1QNYA 4K21A 3VV1A 5DZFA 4ZBVB 2E7QA 5GZFA 1MS3A 3AKFA 3IN9A 4M3CF 3Q7XA 1JT5A 5T5OA 3AJYA 3WUCA 1GZWA 5GLVA 3NV2A 1V6LA 2YZ4A 1W0PA 4XZPA 2A6XA 4FP3A 3HALA 3ZX7A 2AAIB 3SITA 3ZSLA 8I1BA 1MVQA 1FNYA 1DLLA 2AFGA 2AQZA 3ATGA 1SR4C 3AH1A 3FUOA 1W6NB 2WRYA 2GNDA 3RTJB 1URXA 1AX0A 7I1BA 3FUQA 1FV2A 3WO3A 1UMZA 1QU0A 4YG6A 1HLCA 4P0KA 1XHBA 4JRAA 2DWRA 3O0WA 3W58A 3HN1A 2GMMA 4AWDA 2GO2A 4LO3C 3UD9A 4ZKTB 3HR9A 5IK5A 2ZZJA 2NN8A 3O0XA 4NO4A 4DRRA 1R8NA 2YROA 3WLUA 1QDCA 3FLRA 3FBYA 2KLLA 4YFZA 2A6VA 4IY8A 1S0DA 3QLQA 3SNMA 1W6OA 4FPEA 2WBCA 5HCAA 4C1XA 3NBEA 1V6VA 2GALA 5BXTA 1XZZA 1WLDA 1LTEA 2E4MC 3UD7A 1SZ6B 2E6VA 1SBEA 2D6MA 3WG2A 1N4KA 1ABRB 4FVVA 2KM2A 3WCRA 3OBTA 1QGLA 4CJMA 4LO0C 3ZXLA 5E89A 4J2SA 5H9RA 1W6NA 2ZABA 4BOWA 2GMPA 2DREA 2WKKA 3AYDA 4Y20B 2BEBA 3F1RA 2ZAAA 3WO4A 1GV9A 3V0AB 3NBCA 3B69A 1DGLA 1O4ZA 1FX5A 1YTOA 2R1DA 1SBDA 3MW4A 2D1ZA 4QO3A 4SLIA 5H9SA 3FJAA 1ISVA 2JECA 3IMNA 3IM6A 3CU1B 1LOBA 4XBQA 3WDUA 2ARXA 5IT6A 4FPFA 1GGPB 3H6QA 4XTPA 4WV8A 1AJKA 4XILA 1W6PB 2ARBA 3QYDA 3T1LA 4PBOA 3WV6A 3O49A 4ISQA 3A07A 1M16A 1Z0HA 1SR4A 2A6ZA 4GXLA 3WCSA 3IKWA 5DUWA 4I7IA 3Q7YA 1S0IA 1JLXA 4X3AA 5JDBA 4FQZA 2DS0A 4YG3A 4WZFA 1MS9A 4XBLA 3BOPA 3BA4A 1VAVA 4FGFA 2NMOA 5DG1A 4ATFA 4Q26A 4FPCA 4XBNA 4XIOA 3O4BA 2PHFA 1LOEA 3APBA 3F62B 3FJIA 2AH2A 4LO3A 4GKYA 3HBWA 4PCRA 4C1WA 1V6UA 2D7RA 1BYHA 2WJSA 5IK4A 1CJPA 1SLCA 4KC3A 1SBFA 2ZGQA 3CRIA 4Y20A 4D0TA 3AH4A 4K1ZA 3KM5A 3TC2A 3BAHA 2JDZA 1VCLA 3V0AA 3FJKA 3PVEA 1ITBA 1LODA 4G9MA 5FNWA 4LO2A 2DYCA 4R9DA 1LGCA 1JXNA 2VU9A 1PZ7A 2M49A 3L2YA 4LO1C 4Q27A 4XJZA 5EG6C 3NBDA 1FWVA 1CVNA 2ZGUA 3WDYA 4LBJA 3R4SA 3LLPA 4YW3A 2E4MA 1N3QA 2YMZA 4Q8KA 1A3KA 1W6PA 1V6WA 4YM3A 1Q8OA 2UWCA 2D3RA 2AGSA 4YZ3A 4KEIA 4OUJA 5BQUC 4K20A 2RQ9A 3MW2A 4JAWA 1TOOA 1BLDA 4M3CB 4DENA 1X50A 1ISWA 2WNEA 1QNWA 2LTNA 1G9AA 1AF9A 2V5YA 1KDKA 4USOA 1OFSA 2DUPA 21BIA 2DURA 4YOLA 2HYKA 2VUAA 3VKOA 3VWCA 1C1FA 3CAHA 4FPYA 5AVAA 5BOWA 2PELA 1N47A 1ULGA 1UN1A 3AP5A 2NP0A 2ZR1B 3FJCA 1SCRA 1CR7A 3SLIA 2HWAA 5BVPI 5JOZA 1S0LA 3ZXFA 1FMMS 4AGVA 5GZGA 1Q8SA 3V64A 2EXKA 1P63A 2W08A 2A3YA 4X37A 2CNAA 3M3QA 3MPPG 1XG6A 3D4KA 1TFMB 1ENRA 3MW3A 3ZXGA 1VIWB 2ZGNA 3V65A 4WVWA 3I29B 9ILBA 1PZ8A 2D20A 1S0JA 1SACA 1WD3A 1K5VA 3BX1C 2PHTA 1WBAA 2P3IA 2CWSA 1ULCA 1FQ9A 4D0ZA 4M01A 4KBBA 4AGGA 2CL2A 3H6SE 1KQRA 4YGDA 3OBRA 4BQ1A 1YRZA 3I4IA 3VKLA 1ENSA 4GAFA 2AUYA 3WA1A 4Y24A 1Z78A 4LBQB 1I1BA 2W52A 2NTDA 2NYYA 3B01A 1BFGA 3UJ4A 1IS3A 3T8SA 2UWAA 5GLUA 5EWSA 3N7JA 4LBQD 1JYIA 1N1VA 31BIA 1IS4A 1MC9A 1QMJA 4LO7B 2KH2A 5FZUA 2K8RA 2F2FA 4I4YA 3IIRA 5DZEA 5GLZA 1DZCA 4LO8B 4QBVA 3BAVA 1DJSB 4GAIA 4I2SA 3LSEA 3HOMA 1BQPA 3VKNA 2AXMA 1TP0A 5BQUA 1SLAA 3FGMA 2D6NA 3ZXDA 1BKZA 3ZC8A 4XDQA 5GM0A 4XJAA 3CA5A 4QBCA 1R8OA 2E51A 1KDMA 4Y1YA 3A4UA 1GZWB 3OGFA 4QALA 1QXMA 1LU2A 3B9UA 1JOJA 1LHVA 1IKQA 3UJQA 5BP5A 4PQ9A 5T5PA 3BADA 3IM5A 1YIFA 2R0FA 1JW6A 3NV3A 3O4CA 1WUVA 5EYYA 1MS4A 1WLWA 4W65A 1W3GA 1ULFA 2Q5TA 1LENA 5T50A 3BRGC 1MS1A 1Q03A 2YUGA 3DUIA 41BIA 4QC4A 1AFCA 4GKXA 3AYAA 1OKQA 1LJ7A 1U0AA 4OW4A 1S0BA 5SV8A 5BXPA 4EFRA 5F90A 1D0HA 4Y1UA 1IHKA 3CRHA 3GALA 4XFSA 3IAGC 3NV1A 2OW4A 2A7AA 3AJ6A 1MZ5A 4R6UB 1AX1A 3WG1A 2LIEA 1XYFA 4IHZA 1UZYA 2FFUA 3P6IA 2Z42A 2ES3A 2OVUA 1DQOA 4XFUA 1HQWA 4IONA 1GBGA 4YM2A 1HCDA 5L73A 1W6OB 2D44A 3PMEA 4XHXA 4IYBA 3FJHA 4I30A 3B00A 1ISXA 3O4DA 4GWMA 1G9DA 1PC8B 2C9AA 1W3FA 4Y22B 4Q91A 5IK7A 4GWNA 2ZHNA 4FOYA 1I1EA 1E0OA 3NWKA 4EFQA 2A3WA 1R1ZA 3BAQA 4YFWA 4ITCA 2DVBA 2SLIA 2P23A 3PJQA 1BXHA 3WDXA 4YG0A 3CA6A 4G6JA 2X2TA 3FJ8A 5GLTA 3PVOA 4BMBA 2GNMA 2CYFA 2PHXA 4LBLA 1W0OA 4I4PA 1DQ1A 1RZOB 2WSVA 1TEIA 2AYHA 3RG0A 5GZCA 1APNA 3AK0A 2VLCA 3B9CA 3SH3A 2P37A 1SLBA 1ZM1A 1CN1A 3JRRA 3BA5A 3UL2A 3AKHA 4XTMA 1LOFC 1WBLA 3AYCA 4JC1A 3UD8A 5CBLA 4R9CA 3HMYA 3QCWA 3VSZA 1AXYA 1QOTA 3BODA 2ZHKA 1JLYA 1Z4SA 1FAYA 4Y22A 3WINC 1WBFA 4KEJA 1LOCA 1NUNA 5JLVA 2FMDA 5BXRA 2VH9A 1VLNA 1BJQA 1BLAA 2GNTA 4DFSA 4OWLA 1QQKA 2V73A 3VT0A 4OWKA 1SLLA 1S1AA 1WW5A 1L2HA 3WG4A 1WW6A 4Q9PA 2P3JA 3R05A 3C2UA 5T54A 4X39A 1LOAA 4QD2C 2E53A 3WMUA 5F8SA 2P3KA 1JT4A 2VW0A 3FJDA 4Y1ZA 4Q2FA 3CA4A 1WCSA 4DEPA 3P53A 1JUIA 1D2SA 1RITA 3AKGA 5FNXA 2MC2A 3DGTA 5CA6A 1IJTA 4AVVA 1SLTA 4FPOB 5D63A 3N7LA 3RQ0A 5LK5A 2GNBA 3R4UA 3BIWE 1Q1UA 2GDFA 1YF8B 2UUSA 3FJBA 2WT0A 5T52A 3GNEA 3IM0A 2HZ9A 4JP0A 4ZFWB 3N0KA 3WZ1A 1WLCA 3D5OA 3TAYA 2A6YA 4DRVA 1DQ4A 3O5WB 1FN0A 1Z2VA 4XMAA 2BEAA 1DBNA 3LTQA 4Z8BA 3OJBA 1I3HA 2BFHA 1MS5A 4LBOA 4MYEA 4DPNA 4K1YA 1CIWA 1XQNA 1RIRA 2VW2A 3AJZA 3ZSJA 4I1EA 2I2SA 2Q9XA 2ZQNA 2FDBM 3VT1A 2L5XA 1II4A 1YI7A 5F8YA 5T55A 1F31A 1G86A 5HCBA 1RY7A 1KNMA 1LOFA 3PG0A 4OEEA 5D61A 2FFVA 2Z48A 1FMZA 3SISA 5G00A 3RMYA 5GLWA 4I4OA 4D8HA 4OZXA 1W6MB 2D6OX 5KXEA 2Y9FA 2D7FA 3WINA 1HWOB 4GOVA 3OYWA 3W59A 1YO8A 4XXPA 3ZXEA 2ERMA 4PF5A 1OQLB 1ISYA 5E8AA 5B2HA 3D7WB 4LO0A 1AZDA 4I4QA 1NLSA 4G1RA 1G9FA 1G8WA 4RA0A 2LIQA 5EC5A 4PC4A 4P0JA 2DV9A 2YXSA 1DQGA 4I1BA 3BAUA 4YZ5A 1IRAX 1LGNA 2UWBA 3AZWA 2GZBA 2XG3A 4HA2A 4JQ0A 4YW5A 1MZ6A 3INAA 5BYNA 3A0KA 2D6KA 4H04A 1DIWA 1ENQA 4QKRA 2EXHA 1GANA 3ZVXA 1UAIA 4FPGA 3PHZA 2XOAA 4JKQA 2R0HA 3POKA 4FOQA 2ENRA 2P39A 2DVFA 2PHWA 3NJ5A 2D3PA 5F8WA 4XJWA 1W6MA 1Q04A 1QQLA 3POYA 1N1TA 2VSAA 3N7KA 2R16A 5JVVA 1Q8VA 1Q8QA 3H0OA 3HSMA 4ASMB 1MACA 3LCPA 1EV2A 4GP3A 2C5DA 4J2XA 2QYIB 1J0SA 1WW4A 1C57A 2WLQA 2JE9A 4ZGRB 4ZOTA 4XYXA 4XE9A 1HKDA 1WBCA 2D6LX 2D43A 3A22A 2DRZA 3AX4A 3ASIA 2ZMKA 4LBKA 4A7KA 4G9NA 3V79C 2PHUA 4ZFYB 1LOGA 2ZGPA 4Z8SB 4ISRA 1JQZA 2KKIA 2DVGA 1LULA 1WW7A 2ZA9A 1IOAA 5FZZA 4LO1A 2RSTA 4QKSA 1AJOA 1FYUA 1F9KA 3AP7A 1ONKB 4BLJA 1KRIA 2JKBA 1BA7A 2R49A 4ZLBB 5D62A 1DQ0A 3O4OA 5FREA 4FPKA 1HQLA 3ILRA 4J23B 1CE7B 5JOYA 2Q3NB 2ZGKA 1LHNA 1HKNA 2ZHLA 1ULDA 4GOYA 1N3PA 1ZA4A 3JUTA 1JTCA 4LBNA 3IM7A 2K4AB 4XOGA 4ENDA 1UX6A 1MVEA 3T1MA 3AYEA 1N3OA 5EHAA 1MD6A 2DVDA 3E8LC 4HJJA 1BARA 4PBPA 1MS0A 4AVTA 1AXZA 1LU1A 3MEPA 3USUA 2DRYA 1W3AA 1IS5A 4YGBA 4P9XA 2FGFA 2ZKNA 4Y1VA 4R9AA 4DCKC 1K5UA 3WHTA 3OJ2A 1V6JA 3AFKA 3V0BA 4AYUA 1S0FA 2GN7A 1DZQA 2PHRA 4M3CE 1SCSA 3I2AA 4YZ4A 2D3SA 3AH2A 4JPZA 5GAQA 3M3CA 4YW1A 3ENRA 1DZDA 3OPZA 2DUOA 1BFCA 2MLLB 3POWA 3M1HA 5IK8A 1LEMA 1A78A 1W6QB 4JCKA 4BM8A 4XJ8A 1DYKA 1YXWA 3UJ0A 4XXAA 4OEFA 5DUXA 1UPSA 2AREA 4P0LA 3TB0A 4I3NA 1AVWB 1A8DA 1CVSA 2F8XC 3AXEA 1LGBA 2D24A 4F83A 5F9TA 1LCLA 5DXDA 3VT2A 2HWMA 4I0YA 4JKXB 2CWMA 1H9PA 4J2KA 4WVVA 1T9FA 3OJMA 3ZPYA 4AN6A 4FOVA 3SH5A 6I1BA 4YLZA 3RTIB 4HR6C 4IZEA 4YM1A 1Y7BA 4M00A 4I6IA 1UKGA 1GYKA 2H0BA 3P6JA 3D6EA 4YGEA 2MIBA 3RSJA 2ZMLA 4I4VA 5E24E 1G9BA 3BAGA 3AZZA 1HDKA 1IOBA 4XHBA 1G7YA 1JBCA 1N1SA 4XFTA 4P6AA 4OWJA 4XIKA 1V00A 4GA9A 1JYCA 5CAZA 5EYXA 4CRQA 3M2MA 2RHPA 1FWUA 3A23A 3WDWA 1ULEA 3AZYA 2ZQOA 1BZWA 1W6QA 4UW4A 2A6WA 5FZYA 4EFPA 3A21A 2ERFA 2JJ6A 4FOWA 3VEQA 3M3EA 1EYLA 4P9WA 1DFQA 3ZYPA 5H9PA 4XJ9A 4AN7B 4UW5A 2E7TA 3B3QE 4LO2C 2A5ZA 4A7YA 2ZGTA 3U4XA 3AKIA 5DSSB 4EEEB 3FLPA 3ILFA 3ZSMA 2DUQA 1GNHA 4IY9A 3CRGA 1CPNA 1V6IA 2D23A 1BFBA 2ZGLA 4ZA3B 1EPWA 1DQ5A 3FFZA 4DS0A 4FPHA 3ZXJA 2ZGSA 3VUOA 1VALA 2ZMNA 4KEKA 1IILA 4TYSA 5H9QA 3ILNA 4I8MA 3I2XA 3WOGA 5JOWA 2A71A 1UZZA 1JHNA 2EIGA 1AVBA 2R1BA 3EF2A 5DZUA 2Y9GA 1O4YA 3OGGA 1HWPB 2NM1A 4FP2A 4CTEA 5F5QA 5BXSA 1IT0A 3ZSKA 3OYWB 1ILR1 4YW4A 3I8TA 1DFCA 4BPZA 1SLIA 1G82A 1V6KA 1S0CA 1GLHA 3A0NA 4Q1PA 4I37A 5DUVA 4NOTA 3CA3A 3FJ9A 2DTYA 1LHOA 1PZ9A 2VSEA 2WT2A 2A3XA 2UU8A 2DU1A 4IZXA 3UK9A 4LBMA 4L8QA 2YV8A 4BLIA 2CY6A 2DTWA 3QR5A 4QD2B 3O3QA 3WO2A 1UL9A 3S8KA 2KI6B 4Q9GA 4YGCA 2ET2A 2I1BA 1GNZA 1H30A 3BRDA 3AP9A 3O44A 3C9ZA 1AXMA 1JT3A 3AJ5A 1HWNB 1KJLA 1PUMB 5HPZA 1IS6A 1M2TB 5JOXA 5GZEA 3N35A 3UDAA 2VY0A 3LSDA 3W9TA 2QN4A 1CONA 1HWMB 2D22A 2WT1A 2VXRA 3O5SA 3ILAA 4D69A 1DHKB 2EAKA 5DUUA 4XJUA 1QOOA 4II0A 4U36A 1DQ2A 3WHUA 4R9BA 4L4IA 4ATEA 1IRPA 2W39A 3WUDA 4GALA 3VKFC 2VXTI 4FPJA 1FV3A 5GJ6A 2AENA 2F2FC 4RL7A 2WQZC 3Q7WA 3ZC9A 1DQ6A 2OUHA 1JN2P 4U2AA 1AVAC 5KXDA 2ZGMA 1HIBA 4TLPA 3N3HA 1ISZA 3Q9OA 5T5LA 1OQ1A 3UJOA 2DU0A 5KXCA 4AVSA 2A75A 3RRDA 1KITA 1JY0A 5HCFA 3KQRA 2D6PA 1HCEA 3FJFA 2SBAA 1PZZA 2IHOA 2ZACA 3SNVA 1LHWA 1V6XA 3NBNA 3BRFA 1BFFA 4BMEA 3IPVB 2CTVA 5BP5C 4YZ2A 1Q8PA 2X2SA 4CZSA 4AGRA 3S8JA 2WSUA 3MALA 4EB2B 4I96A 1YYNA 2EXIA 1VAMA 5E88A 3POSA 2A70A 2BQPA 4OEGA 2Y9XE 1MR5A 2G4IA 3T2TA 2NMNA 4H9WA 2GN3A 2TEPA 3BTAA 5DVHA 1LECA 1B09A 3CA0A 4ZXKA 3CQAA 3WDVA 5FRAA 3CA1A 4LO7C 4P14A 1CPMA 4FPLA 4UW3A 3ZYRA 1RMLA 4HANA 3WG3A 2YY1A 3JU9A 5EXOA 1AVXB 1BASA 1FGAA 1N1YA 2AR6A 4DQAA 4J2YA 4ZFUB 3KMVA 4A7ZA 3USUB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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