5JMCA

Receptor binding domain of botulinum neurotoxin a in complex with rat sv2c
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
431
structure length
420
Chain Sequence
GSHMNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQRTLGCSWEFIPVDDGWGERPLLV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
publication title N-linked glycosylation of SV2 is required for binding and uptake of botulinum neurotoxin A.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 113
structure length 420
sequence length 431
chains with identical sequence C, E, G
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2016-04-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 5jmcA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 5jmcA02
3OBTA 4BQ1A 3BODA 1BLAA 4AVTA 2A6ZA 5FNXA 3D5OA 3OYWB 5IK5A 1MC9A 4JPZA 4LO7B 2DVAA 4I0YA 3DGTA 3WDWA 4USPA 1JYIA 1KJRA 4Q9PA 4XHBA 1DZQA 3AYCA 4FPGA 2NMOA 2PHXA 3IPVA 1AX1A 4PF5A 1DJSB 1XQNA 2D7IA 4XKIA 4JCKA 1O4YA 5EHAA 3IN9A 4ZA3B 3H6SE 1SCSA 2JJ6A 4P9WA 4I4SA 3ILRA 2F2FC 2IHOA 4I4QA 4I1EA 5H9SA 5GJ6A 1F9KA 4FPCA 5GLUA 5HPZA 3NBCA 1Q8VA 3N3HA 3O0WA 4L8QA 5DVHA 5BP5A 1DGLA 2ZACA 1IKPA 4OZXA 1ULEA 1SR4C 3VV1A 3T1LA 4HA2A 3BAUA 1C1LA 1JBCA 2CY6A 4Y20A 1DFQA 1NUNA 1BQPA 1DQ0A 5BQUC 5EG6C 1OKQA 1LHWA 2ZHNA 2VH9A 1LECA 5DZGA 1XZZA 4YW2A 1JT3A 2EAKA 3AJZA 4YZ2A 1LOFA 3WO2A 4BPZA 2A6WA 1LTEA 3ILFA 4D8HA 2AAIB 4AN7B 2LIQA 3AJ5A 1DFCA 4EEEB 4H04A 2R16A 2A3YA 3IKWA 2ZHMA 2D22A 1QF3A 1JYCA 3GNEA 4QD2B 1A8DA 1ISZA 5D61A 9ILBA 2W39A 2GNDA 4C1WA 3RSJA 1V6IA 2RQ9A 5T5PA 2YXSA 3B00A 2RHPA 1SBDA 1P63A 4LO2A 1A78A 4QC4A 3CA5A 1JTCA 1T9FA 21BIA 3P53A 3UD8A 2DREA 4FPFA 3W59A 3AZYA 2A7AA 2C9AA 5GZEA 3U4XA 3IMNA 1OQ1A 1CQ9A 3EF2A 5IK8A 5H9PA 4CRQA 4I4RA 5JMCA 1DQ2A 3VKNA 4YZ3A 1J1TA 2DU0A 2YMZA 4YM0A 5CB7A 5G00A 4I6IA 3AJYA 1AX0A 1DIWA 1FYUA 1Q03A 5T5JA 7I1BA 2HWAA 1GNHA 2E53A 1CIWA 1GZWB 2OUJA 5L73A 2R9KB 1TTUA 4XJZA 4G9MA 4XBQA 2ZHLA 4GWNA 3RRDA 1Q8QA 3A4UA 3HBWA 1LOBA 1GANA 4HANA 2BQPA 3AP9A 4Q1RA 5KXCA 1KDMA 2VW2A 3FBYA 1IS5A 4HR6C 4YG6A 3BIWE 3O44A 1HQWA 2IWTB 2AGSA 3FJDA 3UDAA 2A6XA 1K5UA 3V64A 3V0AB 3L2YA 2W08A 1S0BA 4LBKA 1QMJA 1ZA4A 4LBJA 3VKOA 3NV2A 4ITCA 4JC1A 1BFGA 2L5XA 3MPPG 3WINC 3VKLA 5EXOA 1A3KA 3AH1A 1SLAA 3UD7A 1FMZA 1WLWA 3UJ0A 1LHUA 1NLSA 5DZUA 5JOZA 5GZDA 3QYDA 3ZXEA 3RTJB 3JUUA 5GLVA 3WHUA 1AXYA 1WW6A 4NO4A 1BFBA 1JQZA 1AJOA 1HWPB 3N7LA 4M00A 1QDOA 2ZQOA 6I1BA 4YW4A 1S0IA 1DQ6A 2K43A 2BEAA 1G8WA 2VXRA 2E7TA 4A7KA 1IILA 1R8NA 4Y1XA 2OW4A 3VT2A 2EF6A 3WDYA 2DVFA 4FP3A 4LBLA 4CJMA 1AF9A 3RQ0A 1ILR1 1G9AA 2DU1A 4M3CB 2D3SA 5FZUA 2AR6A 1GLHA 1LCLA 2E6VA 1OFSA 1ISYA 2HYKA 3I29B 3JUTA 4YM1A 3WLUA 1ULFA 3NV1A 1MS8A 2AH2A 1S1AA 3HALA 3WDUA 4XJWA 3M3QA 3R4UA 2X2SA 1BASA 3H6RB 3LCPA 1HLCA 2UWBA 2QN4A 1APNA 1TEIA 2UU8A 3FUQA 3O0VA 5BXPA 1DQ4A 2D3RA 1W6MB 4LO1C 4I2SA 3S8JA 1N3PA 3INAA 3OYWA 4ISQA 3PVEA 3CA6A 2GDFA 1XHBA 1GZCA 1R1ZA 4GALA 2Y9XE 5T52A 3N7KA 1MZ6A 1AX2A 3OJVA 2P39A 3M3CA 2OUHA 3Q7WA 1SLCA 1UZYA 1KQRA 2DVBA 4HJJA 2X2TA 3Q7YA 2ENRA 4P9XA 3I2XA 1V6MA 5E88A 1DQGA 1V6WA 2Q9XA 3KM5A 4IONA 3O3QA 2D3PA 2J3PA 3CRIA 4D69A 3B3QE 1R8OA 1CJPA 4DPNA 5GM0A 1GSLA 3M1HA 3Q7XA 2DV9A 4LBOA 4HL0A 2GN7A 1HQLA 5KXEA 2WKKA 4QBCA 4DQAA 4LBNA 4UW4A 1T4QA 3SISA 2P3KA 3SLIA 1M16A 1JT4A 3FLTA 5EWSA 1TP0A 3JU9A 1N4KA 1QXMA 4WVVA 3ZC8A 2VUAA 1BFFA 4FP2A 3T2TA 2NP0A 3QLQA 5E24E 2KI6B 2DUOA 3CNAA 1V6XA 5BVPI 5DSSB 2DYCA 3ZSMA 4UW3A 4OWLA 2WRYA 4ATFA 3O5WB 4JQ0A 1SACA 5JOWA 1QGLA 2ESUA 2ZGLA 4P14A 5DUXA 2EXKA 1IS3A 4R9AA 1V6JA 3ASIA 1WBAA 3WCRA 1W6OB 5FNWA 1Y7BA 2WT0A 3A23A 4TLPA 5DUUA 5F9TA 1S0LA 2UWCA 4YW5A 2ZGUA 3AP6A 4Y22A 3UD9A 5JVVA 1IHKA 1IKQA 4FOVA 3R4SA 1VALA 2ZAAA 2ZGKA 4FOQA 2H0BA 2I2SA 1AZDA 5T50A 1W6NB 1W3FA 5DUYA 5F8YA 1UN1A 1V6VA 4Z9WB 4OUJA 4I30A 4Y1VA 3WUCA 5T5LA 2D7FA 2FO1A 1LEMA 2Z49A 3ZXDA 3SH3A 1TWEA 1SLTA 1WW5A 3IM6A 3B01A 1ENQA 5CAZA 1JY0A 1GZWA 2XG3A 5H9QA 2CWSA 1RG8A 3UJ4A 2Y9FA 2A75A 3ZX7A 4EB2B 4CZSA 4GKYA 5GLWA 1FNZA 3OJMA 1IOBA 3N7MA 2TEPA 2R0HA 4WVWA 1HWOB 2D44A 2ZR1B 2KLLA 4GXLA 4ZBVB 1QOOA 4Q27A 3HOMA 2C5DA 1AXKA 2EXIA 1Q8OA 3FJHA 5D62A 4K21A 4R9DA 4XJUA 4YM3A 1LJ7A 4F83A 2GN3A 3E8LC 3AZWA 1PZ7A 1V00A 4L4IA 1VCLA 2KM2A 2WSVA 1L2HA 1SBFA 2ZZJA 2PHWA 2WJSA 1B09A 1W6QB 5FRAA 1MS5A 3A22A 1PUUB 3CAHA 3AKIA 2GMEA 4Q2FA 4AN6A 3UL2A 2E4MC 2P34A 3BB2A 1WUVA 1RITA 4A7ZA 4G1RA 2GNTA 2VW0A 3AYEA 1W3AA 3OGFA 1YTOA 1BJQA 1QOTA 4QKSA 4J23B 4YZ1A 1DYKA 3A21A 2FHRA 3SH4A 4XJ8A 3A0KA 3VSZA 4FGFA 1LU1A 4XFTA 1FAYA 3O12A 3AP5A 1WBLA 1W0OA 1AVUA 1D2SA 2CYFA 2DVGA 5F5QA 1WD3A 4LO3A 3ZXFA 1BXHA 3WNXA 5JDBA 1AVWB 1V6KA 2V73A 4YGEA 5KXDA 1Q1UA 5F8WA 3OY8B 1AJKA 4M3CF 3RMXA 2VU9A 4OWKA 1EPWA 4H55A 1FV2A 3SNVA 3SNMA 4KC3A 4Z8SB 3VT0A 2ZGTA 1GGPB 5BXTA 4XIOA 3IM5A 1W6MA 4NOTA 2A70A 5B2HA 1QNWA 3POSA 4KEKA 4ENDA 3FGMA 4K1YA 3F1RA 5DUVA 5HCBA 4OEGA 5CA6A 1Z78A 1PC8B 3FUOA 2YZ4A 2RSTA 2DUQA 4MYEA 2WNEA 1ULGA 1FMMS 1X50A 3FJKA 2JKBA 4I96A 3AXEA 3CRGA 1YBIA 4ZFYB 3ZXGA 2D23A 4ZKTB 5BP5C 3AK0A 3AP7A 2FGFA 1TFMB 1JHNA 2NMNA 3WMVA 1JOJA 4YFWA 4I4OA 3WO4A 3D6EA 3FJJA 2VXTI 1ULCA 1CR7A 2HZ9A 3BADA 3WDVA 4JP0A 1RIRA 2LTNA 4XFSA 1VLNA 4X3AA 1HCDA 4XBLA 1N1TA 5HCFA 4BMBA 2A3XA 3ZSKA 3IM7A 1LEDA 4AVSA 3NJ5A 1O4ZA 3C2UA 3NV4A 4A7YA 2VSAA 1HIBA 1LOFC 2W68A 1JUIA 2ZA9A 2ET2A 1Q04A 1UAIA 3ZPYA 2M49A 3WMUA 1G9FA 3MEPA 3TC2A 3OGGA 2ZQNA 1MVEA 1G9BA 1SLBA 4QKRA 2ES3A 2GZBA 4ASMB 4I3NA 1PZ9A 4DS0A 2P2KA 3PUBA 3MW3A 4BOWA 1S0GA 2PHRA 4PC4A 3POYA 4PBPA 2DURA 5E89A 4P0KA 4GOYA 1KDKA 3A07A 1BYHA 1PWAA 1G9DA 2NM1A 4XBNA 4FPYA 1GICA 1BA7A 4LO2C 1W6OA 2P3IA 4IY9A 3V79C 1ENSA 5DZEA 3P6JA 1PUMB 3PMEA 4R6UB 4M01A 3TAYA 4YGCA 1WLCA 1JT5A 1MVQA 1LOGA 4WZFA 4AGVA 4GP0A 3CRHA 3O4OA 1MS9A 2GALA 3WA1A 1DQOA 4LBQD 1YI7A 2VSEA 5DXDA 4OEEA 3BRGC 2VW1A 2ZGQA 4K20A 2WLQA 3QR5A 4FPEA 3AH2A 5IK7A 5T54A 1CVSA 4I4VA 1W6NA 3H6QA 4PCRA 4FOYA 4LO0A 1UMZA 1S0FA 1FX5A 3LLPA 3WG3A 4TYSA 3BOPA 5DUWA 2FMDA 4P9YA 2MIBA 2ZGPA 1LODA 3P6IA 1HDKA 1ONAA 4XDQA 2YY1A 1BZWA 3PG0A 1PZZA 4G6JA 4DENA 4PQ9A 4XIKA 3WG1A 4P0JA 2R49A 3BAGA 4R9CA 3M2MA 5JOXA 1K5VA 3VSFA 4AWDA 3POWA 3BA4A 4IY8A 5GALA 4ZXKA 2D7RA 4AGRA 5BXSA 3FJIA 2A71A 3FLPA 4FOWA 4G6MA 2JDZA 2ZGRA 1HCEA 3BTAA 4BM8A 3RG0A 2A3WA 3TB0A 2WBCA 3F62B 3WVJA 3T8SA 3KMVA 1G7YA 1W6QA 1MS3A 2BFHA 3HN1A 4J2SA 5EYYA 3AP4A 4ZOTA 1WLDA 2ZBJA 3FLRA 2YROA 1N47A 4YGBA 2GNMA 3S8KA 2D6OX 3N0KA 1AVAC 4XXAA 3AKFA 4YFZA 4ZFWB 4JKQA 1XYFA 1LENA 2WQZC 1RY7A 2NTDA 4YW3A 4BLJA 1W6PB 1LGBA 4I4YA 2ZMKA 3BAHA 3FFZA 1SFYA 4YLZA 3WCSA 2D6KA 1V6OA 3V0BB 2EIGA 1FATA 2D6LX 3V65A 5GAQA 2P23A 4Y1YA 1H9PA 3FJAA 1LOCA 5BYNA 3OY8A 1YIFA 4R9BA 4X37A 3POKA 4DRVA 4ISRA 2R1BA 3O5SA 4ZFUB 1MR5A 1ENRA 4RL7A 2DRZA 4ZGRB 2K8RA 3UJOA 3BA7A 3ZYRA 2VLCA 1ISVA 2GMMA 2P3JA 3OPZA 3H0OA 5F90A 3RMYA 4XJAA 5FZYA 3VKMA 4GP3A 3FJFA 1LHNA 4I7IA 1AFCA 4QO3A 4GA9A 1Q56A 3ATGA 3LSDA 3C9ZA 3AH4A 4I1BA 4FPLA 4DCKC 1AXMA 3R05A 3WG4A 2F2FA 3Q9OA 2ARBA 3AZVA 4IYBA 3O4CA 1CPMA 1IS6A 3LSEA 3CQAA 4J2YA 1Z0HA 1JT7A 4I37A 3FJCA 3FJEA 1GZ9A 4YZ4A 1JW6A 1IT0A 4DEPA 4G9NA 5GZCA 1BFCA 4BLIA 3APBA 1C1FA 4I4UA 5I1BA 3WZ1A 3A0NA 4XHXA 5GZFA 1LHOA 4YOLA 1OQLB 1KITA 3CA4A 1CN1A 1IRPA 2Q3NB 3V0AA 3VT1A 3PVOA 3PVNA 4XMIA 3B69A 3AYDA 1II4A 1V6UA 4FQZA 4QD2C 1MD6A 5T5OA 3BRFA 1VAMA 3WDXA 2AUYA 2PHUA 1KRIA 1AVXB 2WT2A 2D6MA 4W65A 3HMYA 1W0PA 1FV3A 4YGDA 4XFUA 5D63A 1AXZA 1ZM1A 4GKXA 1YF8B 1YYNA 1YO8A 3IM0A 2AFGA 1LOEA 3CA3A 1G86A 5DG1A 5T55A 2D6PA 2NVHA 3D7WB 2B7YA 4FVVA 2ZGMA 2WT1A 1EYLA 4FPJA 3BA5A 2ZGOA 3VKFC 1MS1A 1M2TB 4ZLBB 4EFPA 3O4AA 3SITA 2V5YA 3VEQA 4YG3A 4Z8BA 1LESA 1MZ5A 3M3OA 31BIA 3WG2A 2Q5TA 3D4KA 2DTYA 2NN8A 3ENRA 1DQ1A 2MLLB 1IOAA 1UX6A 5DG2A 5JOYA 1Q8PA 1UL9A 4M3CA 1Z4SA 1FN0A 1TWMA 2CL2A 2Y9WC 3QCWA 2Z42A 2OVUA 4FPHA 1KJLA 2D20A 2KKIA 4J2KA 3ILNA 3BAQA 2HWMA 2SLIA 3H6RA 4JRAA 1QOSA 1YRZA 3MW2A 4GAIA 5BXRA 4GWMA 3CA1A 3M3EA 3FJ8A 2ZGNA 4K1ZA 5IT6A 3BRDA 3BAVA 5IK4A 3USUB 3B9UA 4XE9A 4Y24A 2EXHA 2UWAA 2A6YA 4QBVA 2ZMLA 3CA0A 1QKQA 4XJ9A 1LU2A 4YW1A 2I1BA 5FZZA 4LBQB 4Y1UA 3WINA 1RINA 4I4PA 4BMEA 3ILAA 1HWMB 5E8AA 3OBRA 4FPKA 3N35A 1GBGA 1UKGA 4D0ZA 5CBLA 2E51A 3WV6A 3CU1B 2ZGSA 1SLLA 2XB6C 1C4RA 4Q91A 4EFRA 1AVBA 4Y22B 2ERFA 3PJQA 5IUQA 1CVNA 2KH2A 4KEJA 3ZXJA 3MALA 1XG6A 4I8MA 5GLZA 1CPNA 3AFKA 2A5ZA 1S0CA 4LO8B 4AGGA 1LULA 4CTEA 2ERMA 3I2AA 4U36A 4JKXB 1BLDA 3AJ6A 3DUIA 3ZC9A 2DS0A 1EVTA 4H9WA 3B9CA 2VY0A 1ISXA 4LO3C 1DLLA 3HR9A 3MW4A 1FNYA 4X39A 2AENA 2AYHA 3AZZA 1LGNA 1JXNA 1W3GA 4XILA 3AXDA 3ZXKA 5KXBA 1W6PA 3OJBA 4GOVA 5AVAA 2DRYA 4YM2A 1GKBA 2K4AB 1BARA 4Q1PA 2ZMNA 3V0BA 2NYYA 1QQLA 1URXA 2FFVA 2P37A 4ATEA 3AKHA 5HCAA 2ARXA 5EC5A 1WBFA 1DHKB 1GV9A 4FPOB 1MACA 1N3QA 1IS4A 3I4IA 5H9RA 41BIA 4LO1A 3IPVB 2W52A 3UJQA 3PHZA 2BEBA 2JECA 1FWUA 3UK9A 2SBAA 8I1BA 5FREA 1DQ5A 2R1DA 2ZKNA 4TZDA 3O4DA 4IZXA 4OEFA 3ZXLA 4XTPA 2D1ZA 2G4IA 4JAWA 3RS6A 2F8XC 3AKGA 4Y26A 4YZ5A 1YXWA 3ZYPA 3KQRA 1RMLA 4FQ4A 2E7QA 1HKDA 4XXPA 3BX1C 1C57A 3ZSLA 2LIEA 1LOAA 4M3CE 3FJ9A 4XYXA 4Y20B 4DRRA 2KI4A 2R0FA 3GALA 2JE7A 1LGCA 3NV3A 4Q8LA 2MC2A 4KBBA 1WD4A 4I4XA 1H9WA 1KNMA 2WSUA 4C1XA 3BAOA 5JLVA 4AYUA 1ONKB 2DTWA 2JE9A 3LTQA 2PELA 1GNZA 1G9CA 4DFSA 1ULDA 2UURA 1DBNA 1V6LA 2DUPA 4KEIA 2CNAA 2ZHKA 1PZ8A 4XMAA 5GLTA 3WOGA 1CE7B 1HKNA 1IRAX 3T1MA 1I1BA 1FQ9A 1MS4A 3RTIB 1CONA 1TOOA 3WDTA 1E0OA 1VAVA 4Q26A 2EALA 1QU0A 1Q8SA 2GMPA 2YUGA 4F34A 1JLXA 1UPSA 4Y1ZA 1RZOB 3O49A 2NZ9A 4XZPA 2EXJA 1QQKA 4UW5A 1S0DA 3AYAA 4PBOA 3AZXA 1QDCA 1U0AA 3AX4A 2AQZA 2CWMA 4P0LA 3ZSJA 2AXMA 5GZGA 4OWJA 1LHVA 4XTMA 1BKZA 4IZEA 1F5FA 4EKXB 1WW7A 4LO0C 3FJBA 2GO2A 2D24A 1G82A 2FFUA 3NBNA 2DVDA 1SLIA 1CESA 4OW4A 4J2XA 1NXD1 4WV8A 1GYKA 3OJ2A 2A6VA 3WO3A 5SV8A 1F31A 3W58A 1D0HA 3SH5A 2HW9A 2Y9GA 1V6NA 3ZVXA 1SBEA 2RG9B 3NBEA 3O4BA 3WHTA 5EYXA 2XOAA 4LO7C 3I8TA 1JLYA 4D0TA 1WCSA 4YG0A 1J0SA 4U2AA 5LK5A 3NWKA 2LALA 1DZDA 1ABRB 1I1EA 2D43A 1N1YA 2QYIB 4WBCA 1Z2VA 4EFQA 1WW4A 1FWVA 3USUA 5DZFA 1SZ6B 3NBDA 4L4HA 3O0XA 1ITBA 1S0EA 1H30A 2JD4A 2YV8A 2PHTA 4USOA 4XOGA 1MS0A 4LBQA 4UW6A 1JN2P 4X38A 4LBMA 3HSMA 2PHFA 1SCRA 3IIRA 5BOWA 1FGAA 1EV2A 3VUOA 2FDBM 1N1VA 1VIWB 5CNAA 1S0JA 4IHZA 2D6NA 2GNBA 3K1XA 3N7JA 4RA0A 1HWNB 2Z48A 2AREA 2E4MA 1WBCA 4Q9GA 5F8SA 2ZABA 1TIEA 4Q8KA 1UZZA 1N1SA 3W9TA 2CTVA 1NZKA 3VWCA 1SR4A 1DZCA 1DYPA 4IQPA 3N36A 4II0A 2UUSA 1ISWA 2DWRA 1QNYA 3IAGC 4SLIA 4AVVA 1I3HA 4GAFA 1IJTA 4P6AA 5BQUA 3JRRA 1N3OA 4QALA 3WUDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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