1EEJA

Crystal structure of the protein disulfide bond isomerase, dsbc, from escherichia coli
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
216
structure length
216
Chain Sequence
DDAAIQQTLAKMGIKSSDIQPAPVAGMKTVLTNSGVLYITDDGKHIIQGPMYDVSGTAPVNVTNKMLLKQLNALEKEMIVYKAPQEKHVITVFTDITCGYCHKLHEQMADYNALGITVRYLAFPRQGLDSDAEKEMKAIWCAKDKNKAFDDVMAGKSVAPASCDVDIADHYALGVQLGVSGTPAVVLSNGTLVPGYQPPKEMKEFLDEHQKMTSGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the protein disulfide bond isomerase, DsbC, from Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Escherichia coli
molecule keywords THIOL:DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN
total genus 68
structure length 216
sequence length 216
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2000-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 1eejA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1eejA02
1M7TA 5IMFA 1EEMA 3LXTA 4ML6A 2V2GA 2F8AA 3RDWA 3FY7A 5E59A 3E3EA 3W8SA 4HUAA 3TRQA 1UC7A 5IO0A 4IBPA 4XHMA 5GAPD 1PL1A 3UAPA 2DC5A 2RUEA 4K7NA 2P0GA 1V2AA 2AV4A 2C8UA 1A8YA 3A2XA 2HZEB 2DIZA 1JLWA 2YWOA 2G0FA 2MMNA 5ENUA 2H75A 2N5AA 2LS5A 4XCSA 2CAIA 2VLTA 2F8FA 3TCOA 3VWUA 5EL8A 2ZNMA 2H0IA 3IC4A 2VCTA 3N9JA 3WD6A 1X9WB 3EYTA 4K0NA 4NHWA 4HI7A 5B6MA 3IRAA 1T7PB 1SL1B 2L4CA 1GSFA 1GUMA 2AJQB 5HFIA 1SL2B 2KP2A 1NSWA 4MZCA 5J9CA 4MA9A 2GLRA 2CVKA 5CNWA 3C1RA 4MPGA 1X5CA 1BAYA 1GUHA 4WETA 4V1Ag 2F3MA 1TK0B 5IQYA 2LKUA 1T8EB 2M80A 2OE1A 2LEGA 2AB6A 3FW2A 4IJIA 4V1Ap 3EMXA 1H4OA 2YJHA 1SYXA 4I5QA 1TRUA 2L6CA 1O8XA 3EU3A 2CZ2A 4YQUA 4IGJA 1O73A 3RPPA 3D22A 4ACSA 1GSQA 4KDXA 3FK8A 1YZXA 1K0NA 2LV3A 1VGLA 2VM1A 1ERWA 3KMNA 3L78A 3I43A 4ZB9A 1XOAA 5IMCA 4EVMA 1FB0A 2RLIA 2MBSA 2FUG2 4ISDA 3ZMLA 3GUSA 2HZEA 4HQSA 3KEBA 4YQMA 5IMZA 1DE1A 2FD3A 2DJ3A 3KZQA 1TK8B 3TUEA 3CTFA 1SD8A 4V2LA 3QAWA 2H1GA 4HZ4A 1YKAA 1Z7PA 3ZFLA 4L5LA 3BCKA 3VPQA 4N30A 2VCXA 4IVFA 1TRWA 1ERUA 3GIXA 2QKEA 3GL3A 2EC4A 2IMIA 4IW9A 2DJ2A 3L4NA 3ERWA 2LNTA 1JHBA 2IL3A 1OKTA 4WKWA 1Z6MA 1K3OA 3VI7A 4F03A 2YZUA 1OE7A 3ZVJD 5ID2A 2AYTA 2DJ1A 2CQ9A 1YF1A 3ZYWA 2YNXA 5KN2A 4I2UA 1K0CA 5DJMA 3KIJA 1HNBA 4IQAA 2HZFA 3HD5A 3LWAA 3M9JA 4GCIA 4GSTA 4KDYA 5IOXA 2H0HA 1PD21 2F9SA 2L5LA 1XVWA 1XZOA 3EINA 2ZCTA 3G7IA 2HSYA 4EDZA 5CRDA 5A4UA 2V41A 1QMVA 1EV4A 3VFIA 2H0GA 4DSSA 4RQRA 1QXHA 1RQMA 3ZVJA 3EWLA 3APSA 1A24A 2VL3A 3K8NA 3H4KA 6GSYA 1WE0A 2GDRA 3J7Yb 1EOGA 3AY8A 4MLYA 5HR2A 3DKSA 5KN1A 3L9UA 1AUCA 3SWLA 2YZHA 2WCIA 3QDNA 2ON5A 1THOA 1OYJA 1SU9A 3IE3A 5IPHA 2M46A 1VF3A 4WXTA 1YDKA 2HFDA 3PGTA 1EV9A 1JZWA 2GSRA 1KEBA 3PH9A 1PMTA 4N11A 1H75A 4E8HA 2OACA 4LL1B 2H6XA 2ALBA 1B8XA 2LNSA 1GSDA 1M0UA 4KSOA 2ZUPA 5CP1A 3VLNA 3US3A 3QD9A 2MBTA 4GXZA 2MZCA 4ZL8A 1PX7A 4KGIA 1ZOFA 14GSA 1QUWA 4PQ1A 2CA8A 3LYKA 2JZTA 1TK5B 3ZIJA 5CRHA 1LBKA 1Y6EA 3HJMA 3I69A 1OKDA 3H1NA 3QFBC 3ZREA 1X9MB 2EIOA 5CRWA 3ZMKA 3LXZA 4ZIJA 3F6DA 3HY2A 1ERTA 4L8EA 4LL4B 1GUKA 1EGRA 4MJBA 3EC3A 3IPZA 3TDGA 3D4MA 2JL4A 2VLVA 3BCIA 4XRAA 3DXBA 2LRNA 5HQPA 1F2EA 5H5RA 3EE2A 3TB2A 4HU9A 1R26A 4HZ2A 1M2AA 4I2TA 2L6DA 2GSTA 2IN3A 4G2EA 3RHBA 3UVHA 3KXOA 4PX1A 2IMDA 4XS6A 2NTOA 5IOWA 2XHFA 3GKMA 4CDOA 3IHQA 5ECOB 1JZOA 18GSA 4CW9A 1V57A 1PX6A 1USBA 2IPAA 1QFNA 3HZ4A 4MJCA 2YN1A 2H19A 3PINA 4O7HA 2P5RA 2R3XA 2VL2C 2X8GA 2XPDA 5ABRA 2IMKA 1JZDA 1K0MA 2X64A 1F9MA 2KHPA 1S3AA 1E2YA 1XWKA 3VK9A 3CSIA 3CMIA 3TKRA 4HOJA 2HT9A 4KB3A 4O32A 3SBCA 3HVSA 4NAXA 2C80A 5JWRB 1SKRB 4ZB6A 1AC1A 4TXVA 4Z7XA 1UN2A 3ERGA 3ZL5A 5JCUA 4TR1B 3KGKA 1FVJA 2VCVA 2K18A 2PVQA 2I3YA 3UBKA 3GNJA 3FHKA 1HNAA 2HYXA 2A2SA 2DMMA 1BG5A 3GV1A 1EOHA 5IM9A 1TI1A 5B8BA 1PQNA 3P90A 3KJYA 1WIKA 5G2ZA 3WGXA 4EL1A 4MP4A 1ZL9A 5F05A 4IP6A 1SENA 1RW1A 2FWHA 2VCWA 3TRPA 2LQOA 1GP1A 5DALB 3ME8A 1LU4A 4H86A 2X8CA 2M72A 4NMUA 2E0QA 1R4WA 4ZB8A 3HCZA 5DBQA 1SK2A 4Q5RA 3IDVA 3WGEA 4GTUA 4IS0A 4BVYA 2ES7A 4XS4B 1TJDA 3TJGA 4EKZA 2OE0A 3LJRA 2C4JA 2FWFA 1X0RA 1A0RP 3F9UA 4NV5A 2C3NA 4PXOA 1TXXA 2HNLA 3GYKA 1ZGNA 4G10A 1TI3A 2H73A 3TKQA 1ML6A 2PGTA 2IY2A 1N8JA 3FR3A 2QC7A 3QR6A 1ERVA 2L57A 1EP8A 1X5DA 2PVOC 2LSTA 2WFCA 5ECPB 1OC9A 2VAFA 3Q6OA 2HRNA 1FW1A 1NHYA 2BMXA 3F6FA 3O6TA 2YJ7A 2CVBA 3KMOA 5DQSA 4OCFA 5C00A 4TR1A 5DVBA 4MJEA 5AN1A 2NBSA 3ZZXA 3IV4A 3VPTA 1SL0B 2AHEA 4L0WA 4POMA 3M3MA 3F8UA 1Z5YE 2XBIA 3NOFA 4HDEA 1TOFA 3G7JA 3FZ9A 1VF4A 3QFAC 1XBSA 2B1LA 2C3QA 1AQWA 3IAS2 2V32A 1IYHA 3CBUA 2O8VB 5L71A 19GSA 3TJKA 1MDJA 2I4AA 1SYRA 3MAKA 3HVVA 4XRDA 3LORA 2GQMA 3GKKA 1TKDB 5GSSA 4FIWA 5H5QA 2DIYA 4EE0A 1F3AA 4XS4A 4AJ8A 3A2WA 1R5PA 5KN0A 1KNGA 4LA1A 3GH6A 2H1BA 3D5JA 3GKXA 3KM6A 4RUVA 2YANA 5ECMB 4LMWA 5INYA 1MD4A 2O87A 4TR0A 3A2VA 3N5OA 4HJ2A 4FO5A 3LFLA 1VF1A 2LRTA 5DDLA 2VUPA 3BD2A 3DMLA 4P3YB 5A5KA 3GRXA 3HDCA 4OFTA 2JSYA 1A8LA 1ILOA 4N0ZA 4DEJA 22GSA 2C0FA 2VCQA 2OADA 2XC2A 2LJAA 2K8VA 1AW9A 2B1KA 1R7HA 3F0IA 2B5YA 1PL2A 4LLRA 3Q74A 1XPVA 2H6YA 3UJ1A 4ULXA 2H01A 5B8AA 2C0GA 16GSA 2VOCA 3HHVA 3Q18A 2NVLA 3A5WA 3FR9A 1M99A 4MK3A 1R5AA 2MMAA 2TRCP 4EXJA 1YEXA 2GZPA 4KE3A 2BJXA 3C71A 3PR8A 5D8IA 4K6XA 3TGZA 4ECBA 1M9AA 3IA1A 4X0XA 4HQZA 3VURA 4AJ6A 1QGVA 3VWVA 2GQKA 2RUFA 4BVXA 1T4YA 2WZ9A 4JR4A 4KUNA 1GH2A 3WGDA 1HQOA 2FA8A 4XIHA 1PSQA 1FB6A 2R4VA 1ZCPA 3GN3A 5F8BA 1DBYA 1TDIA 3F4SA 2GS3A 2IFQB 5AISA 1V9WA 5LCZA 3FZ4A 4NV2A 2V6KA 4MZWA 2IMFA 4V2NA 2KP1A 2WGRA 1VF2A 2E2MA 3UVTA 4V2MA 3HKRA 1GTUA 4MF5A 3HJOA 3FYGA 1THXA 2ON7A 1U87A 4J2FA 1PA3A 5ECHB 4EC0A 2XPEA 3CXGA 4RI7A 1ACVA 1AIUA 5ELGA 1GNWA 2DJKA 4D73B 5D9TA 1K0DA 3GSSA 3G9BA 2EIQA 2H1AA 4I97A 2FHEA 1B4PA 2H1DA 5ELAA 1O7UA 4FH8A 4OCEA 2YV7A 2JACA 2R5GA 2R6KA 1U3IA 1DUGA 4TW5A 8GSSA 2HLSA 4MZBA 3FZ5A 5DAKB 2CVDA 2PMTA 3MWHA 3CSHA 4MPFA 4WR4A 4ZL7A 2REMA 1GSSA 1S3CA 1S3DA 1XIYA 4GWRA 2H30A 5G1LA 3IK9A 3JCML 1YJ6A 4KA0A 2NPBA 1I5GA 3D21A 3DVWA 2PWJA 3IK7A 4G9HA 4ECCA 2J9HA 4HU7A 2XBQA 2IFQA 3ZFBA 3E9JB 1Z6NA 4PUAA 5FT3A 4KDUA 2H6ZA 2N5BA 3LSZA 4IJ3A 3L9SA 2VL9A 4ILFA 2WS2A 3F4RA 3HYPA 1B9XC 2HSHA 3DIEA 2X8HA 5J41A 2GGTA 1YY7A 4OWYA 4GSNA 3LQ7A 4IKHA 2CV4A 1YF0A 2HI7A 3I6AA 2DBCA 5E4WA 2VD0A 5D96A 4KCEA 2WDUA 2OE3A 5AIVA 3ME7A 4PUFC 4ZXGA 2YPMA 4BWQA 3TJJA 5IPGA 4D73A 4QL9A 4GF0A 4WEYA 1GSYA 1GWCA 3IR4A 2FWGA 3M0FA 2YV9A 5EVOA 1BEDA 13GSA 2Z9SA 4CHSA 2H70A 3M1GA 3EVIA 1OC8A 3APOA 1EP7A 1XWCA 1FHEA 2B6MA 4O5RA 4PQHA 5DAKA 2FA4A 1A2JA 4YAVA 3DEXA 4OD7A 2E7PA 3I9V2 2VO4A 3FKFA 6GSVA 3QMXA 4YQVA 1K0OA 4F82A 3W6GA 4KX4A 1K3LA 2TIRA 1TU7A 1KBNA 2VCZA 3W8JA 1E6BA 1G6WA 2LJKA 4BA7A 4X43A 1EEJA 1GTBA 5HR1A 2GQLA 3WYWA 2WJUA 7GSSA 4J56E 3UL3A 2TRXA 2DLXA 4YH2A 5J4UA 3KP8A 4HJMA 4ECIA 1A2LA 2GT6A 1BJXA 3GURA 1TRVA 4JE1A 2LQQA 1LJRA 3L0HA 3ED3A 1Z9HA 1M2DA 3U5RE 3ZLPA 1XOBA 2O7KA 4XS1A 1V58A 5D9WA 1F3BA 1GTIA 3OR5A 5JCGA 3H93A 1M9BA 5JWQB 3UMAA 4KH7A 3UARA 4PNFA 2DJJA 2QSIA 2I1UA 2GSQA 4EO3A 5LD0A 3GTUB 1BYEA 1XWBA 2VIMA 4DSQA 3VWXA 5HR0A 4JR6A 2A2RA 2H71A 2JZSA 1AXDA 1SK1A 4EDYA 3A3TA 1TU8A 3M9KA 1CQHA 3VI5A 4F2IA 5F06A 4JRRA 1IYIA 3H8QA 4RI6A 1JFUA 2VM2A 2HXKA 3TOUA 2IMEA 2YP6A 1OE8A 4IHUA 1FO5A 1U6TA 3MSZA 4TOPA 3GH9A 4PGTA 1O6JA 1I9DA 4JU5A 1SKSB 1GSEA 4MH3A 2DJ0A 4TVEA 3UEMA 1XW6A 1WPIA 1FVKA 5IMVA 3IOSA 2CT6A 2O89A 4ZBAA 3WT2A 5F0GA 3F3RA 1Z7RA 4K2DA 3RPNA 3L9VA 5JCWA 2JZRA 4OO5A 4K8MA 1A0FA 2B3SA 2G2QA 1G7EA 1TP9A 1MEKA 2PUKC 5ECLB 1NHOA 2C3TA 1PN9A 3GX8A 1GL8A 4MF6A 3GFKA 1MDKA 3C8EA 3U6VA 2KUCA 4JBBA 5G5EA 4OMVA 3GTUA 4EUYA 3HA9A 4K1FA 2WULA 4POLA 1OAZA 5G1KA 5IMDA 4WBRD 1YEPA 4L0UA 3J7Yk 3WT1A 4L5OA 1B4QA 5D93A 1V98A 5GZZB 2R37A 5DALA 1G0TA 4OO4A 4ZL9A 3BOAA 4IN0A 3RBTA 2IIYA 1Z3EA 4O92A 2JSZA 4J57E 4E8EA 3CYNA 3FEUA 2HE3A 4ZILA 1ZYEA 2RM5A 4TXOB 20GSA 5COHA 2PN8A 5KN3A 2V1MA 5FWGA 5LNKe 4TR3A 4WF4A 1K0AA 2FNOA 2NDOA 1YQ1A 3CSJA 3ZITA 1SK0A 2GVPA 2MYGA 5J3RA 4G19A 5D9VA 1XW5A 1QQ2A 4BL7A 2F51A 3G7YA 1T1VA 1GRXA 5CAXA 4FYBA 4TN8A 4GSSA 4WF5A 1SJ6A 5ID2B 5J9BA 1U88A 3NZNA 2WRTA 1TTZA 1ZMAA 2AAWA 1J08A 3LG6A 3ISOA 2VD1A 3D0ZA 1AAZA 3C73A 2FY6A 5G5FA 4BWSA 3GL5A 3QPMA 1X5EA 1WWJA 3KP9A 4YAPA 1PKZA 4OFNA 1DSBA 3UBLA 1AQVA 2OBIA 3H79A 3P7XA 3QAGA 3VWWA 2VL2A 1NW2A 4MCUA 5CREA 3S9FA 5AIXA 4DSSB 3MDKA 5CRGA 3IAM2 1O85A 1PKWA 11GSA 1BQ7A 2K6VA 4Q5FA 4X1UA 3UOMA 2MMZA 6GSWA 4MH2A 3DGQA 1JLVA 4NHZA 2FCHA 3KTBA 4TXOA 4ML1A 2B7KA 3DD3A 5EPFA 4I6XA 3C1SA 3RAZA 3GA4A 3LEFA 4NPBA 2PBJA 2GSSA 2GZYA 4QL7A 3P8WA 1Q4JA 5D9XA 5A4WA 3KH7A 1GTAA 3FZAA 5B7CA 3TRXA 3P2AA 2LJRA 3EMPA 2DMLA 3TOTA 4F0CA 1XVQA 4K9ZA 3DWVA 2H66A 2LUSA 2RM6A 2J23A 3DVXA 2C1YA 4TR4A 3TKSA 3LGCA 5GAND 4QQ7A 17GSA 1PGTA 5JWOB 3KTLA 3KD0A 5J5NA 4POKA 1XXUA 3TKSE 2B7JA 4OFMA 4WR5A 5DCHA 1GLQA 2H8LA 4XTSA 5H5SA 3KH9A 3CRUA 4IP1A 1K3YA 1J0FA 3HXSA 4ECJA 3TJFA 1PRXA 2H72A 4F0BA 1WMJA 1MD3A 1G7OA 2KLXA 4WBJA 3TJBA 3FRCA 2X99A 3F4TA 5GSTA 4TKYA 1K0BA 1DE2A 2P5QA 4MDCA 2JU5A 2O85A 5HFKA 2MMOA 2PU9C 2YOIA 1UVZA 4POBA 2L59A 4F9ZA 4HEA2 1ABAA 2PPTA 1YKCA 3QOUA 4K7OA 4DSRA 5B6NA 2PERA 1Q98A 1T4ZA 1QK8A 5ECSA 1SD9A 3R2QA 1TRSA 1VRSD 12GSA 2YWNA 1O8WA 1RK4A 2I81A 4KNDA 4FYUA 5ECRB 1J9BA 3ZTLA 3D4TA 4KCAA 2LTKA 3GX0A 4Q5NA 3RHCA 5CO3A 1FAAA 2P31A 5ECIB 3EU4A 2R2JA 4HS1A 3FR6A 2GT5A 2C0DA 4ZBDA 2OJLA 1BX9A 1CQGA 2L4QA 4K0GA 2OKAA 3DRNA 2WB9A 3M8NA 3O3TA 4PQIA 5G30A 2CX4A 3ZIVA 2H76A 6GSSA 2E2GA 1OVNA 2GZZA 4MJAA 2L5OA 3GHAA 4GLTA 1M2BA 1ZZYA 5FHIA 4K7IA 4MMMA 2B5EA 2HRFA 3O76A 1X9SB 4FYCA 5ECKB 5ECQB 2K8SA 1U3AA 2IWTA 3DYRA 4ID0A 3C7MA 3KCMA 6GSXA 1W89A 4PNGA 4IELA 4JEDA 2C0EA 3BBYA 1SKWB 2OA7A 1T00A 3LYPA 1SJIA 2OBKA 2KOKA 3GSTA 5EY6A 1WJKA 4RQXA 1W4VA 1JZRA 1G6YA 2DSAA 2FGXA 4ZBBA 2A4VA 2JADA 2B5XA 4GRFA 1TW9A 1ZYQB 2GTUA 2YWMA 3CRTA 4DVCA 5D73A 1A23A 3F63A 5HFGA 3HJPA 5DQYA 2QGVA 4KW6A 4JZQA 4KSMA 4N0VA 1EWXA 3QCPA 5C04A 3GKNA 5IO2A 1GSUA 3QAVA 3BJ5A 10GSA 1F37A 1WP0A 3EURA 2N5FA 1XWAA 3IBHA 1T3BA 3APQA 1N2AA 2EIRA 1HNCA 1MTCA 1GNEA 1WRYA 2V6OA 4TRXA 4MABA 1OC9B 5DCGA 3NIVA 1ST9A 1XCCA 4N10A 3F3QA 4PURA 2H74A 1UA5A 1FG4A 1F6MC 1Y25A 2IYJA 2D2ZA 5ECNB 5HR3A 5AGYA 4GQCA 1C72A 5A4VA 2FLSA 2CAQA 2YCDA 2K9FA 3GMFA 3Q19A 1KTEA 1WOUA 1XW9A 3ZRDA 4KAEA 3V1WA 1O81A 4GQFA 5F07A 2I9HA 3UIWA 2CZ3A 1MDIA 1HD2A 4IQ1A 1B48A 1B9YC 3TKSC 5KEJA 3TKPA 1HYUA 4EF0A 1FOVA 4BPYA 5G31A 3MNGA 3CTGA 4Q5QA 1A2MA 2RIIA 2LRCA 2AUVA 1EGOA 5IMAA 3IXRA 2BTOT 3E0UA 1XWGA 1SJZA 2IJYA 3D6IA 2VLUA 1GULA 4NXIA 9GSSA 5CYYA 4MF7A 3ERFA 4AJ7A 1XFLA 5DJLA 4AF2A 1OC3A 6GSUA 6GSTA 1URMA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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