1EEJA

Crystal structure of the protein disulfide bond isomerase, dsbc, from escherichia coli
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
216
structure length
216
Chain Sequence
DDAAIQQTLAKMGIKSSDIQPAPVAGMKTVLTNSGVLYITDDGKHIIQGPMYDVSGTAPVNVTNKMLLKQLNALEKEMIVYKAPQEKHVITVFTDITCGYCHKLHEQMADYNALGITVRYLAFPRQGLDSDAEKEMKAIWCAKDKNKAFDDVMAGKSVAPASCDVDIADHYALGVQLGVSGTPAVVLSNGTLVPGYQPPKEMKEFLDEHQKMTSGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the protein disulfide bond isomerase, DsbC, from Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Escherichia coli
molecule keywords THIOL:DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN
total genus 68
structure length 216
sequence length 216
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2000-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 1eejA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1eejA02
3D6IA 1THXA 5INYA 1TI3A 1GUKA 3LQ7A 1O85A 4LMWA 5CP1A 5A4VA 1X9MB 3UL3A 4LMVA 1F3AA 2P5QA 2VUPA 2HI7A 3HVVA 1HD2A 3PGTA 2VLTA 2H8LA 3UARA 1SJ6A 1SYRA 3C1SA 1VF4A 4KB3A 1AAZA 4NHWA 2R2JA 2C0GA 1Z3EA 3OR5A 1MDKA 4XS4A 3ZIJA 4YAVA 2RM6A 2PU9C 5LNKe 2B6MA 4MF7A 1JFUA 3QPMA 4MPFA 3GIXA 1ZYQB 1Y25A 3LSZA 3VPQA 4RI7A 4TXOB 2AAWA 4GRFA 3HJPA 1WMJA 1TKDB 5IMAA 1M9BA 5ECSA 4IW9A 2C80A 4JBBA 3DRNA 4NHZA 4QL9A 11GSA 18GSA 4AJ7A 4DSSA 1V40A 2CVDA 3QDNA 2BTOT 2C0FA 3FR3A 4BA7A 1XBSA 4BPYA 1KTEA 3M9KA 5ABRA 3ZVJD 3MWHA 1YKCA 3RHBA 3Q19A 1GWCA 1PX6A 1O81A 4ZL7A 2YANA 2XPEA 4HUAA 3N5OA 4PNGA 3IHQA 1IYIA 3VWUA 4Z7XA 2CVBA 1ERUA 1A2JA 1DE2A 3HHVA 1SK2A 1TRSA 2IFQA 3QAVA 4MZBA 3EINA 2VM1A 1T3BA 4NXIA 4NMUA 1TTZA 2JSZA 2JU5A 1PL2A 3KMNA 4EXJA 4ID0A 3FR6A 2FY6A 5H5RA 4ECCA 3C8EA 3U6VA 1FOVA 2M80A 5J9CA 4IS0A 2IMDA 5LCZA 3EE2A 2GSTA 1X5EA 3TDGA 4GLTA 4MH2A 1G6YA 1EV9A 2I1UA 3ERFA 3I69A 2IL3A 6GSXA 3GV1A 1A2MA 2MMAA 3BJ5A 4TRXA 2J9HA 2P5RA 2PWJA 2N5FA 4HZ2A 4I2TA 4Q5QA 3Q18A 3KD0A 1PGTA 2WDUA 2FGXA 2XHFA 1F37A 4LLRA 3RDWA 1GSSA 1O6JA 2CA8A 3F4RA 3EURA 1WJKA 4JR4A 3FW2A 4MABA 4G9HA 1PSQA 1SL1B 1R26A 4ZB6A 2HZEA 3GH6A 1Y6EA 4RQRA 1ERWA 2KOKA 5DJMA 5J4UA 3S9FA 1F6MC 1TI1A 7GSSA 2X99A 5FHIA 2H19A 2N5AA 4PQ1A 20GSA 4WF4A 2OKAA 3HZ8A 4HU7A 3DGQA 4J2FA 2VO4A 2VL2C 1Z5YE 2GS3A 5EVOA 3GN3A 2CX3A 5CRHA 3EVIA 4L8EA 1GLPA 3ME8A 1GTIA 2HXKA 3GHAA 1V98A 3F0IA 2V41A 3VURA 13GSA 3CSIA 2HFDA 2BJXA 2CZ3A 2L59A 4CW9A 1M2DA 2OJLA 2VCQA 4F0BA 2PUKC 5F07A 3LGCA 2H71A 1PKWA 1FAAA 3FHKA 4V1Ag 5HR0A 4KE3A 3P7XA 4EVMA 2H0HA 3ED3A 4O32A 2HE3A 4MA9A 3IXRA 5H5SA 1S3CA 4XHMA 5IMDA 2YJHA 2LRNA 4AF2A 1ACVA 2CAIA 3TJBA 5JWOB 4HU9A 4ECIA 5C00A 1K0MA 1MDIA 2R4VA 1EEMA 2CT6A 2M46A 1WPIA 5KEJA 4FYCA 1EGOA 3F3QA 5CNWA 5G5FA 1U87A 3A2VA 4DVCA 3KIJA 4V2NA 5IMZA 5E59A 5D96A 1THOA 3EU4A 4RUVA 1UN2A 4AJ8A 4D73B 1K3YA 4K7IA 2PN8A 1VRSD 4QL7A 4IELA 2LNTA 3C7MA 2MMZA 1EOHA 3ZREA 2GDRA 2YWMA 4BVYA 1V9WA 2HNLA 3QMXA 1M0UA 1R4WA 2C3NA 2LJKA 4DSRA 1FB6A 6GSTA 4WKWA 5A4WA 4IP6A 4PNFA 3IOSA 1RW1A 1T8EB 2NVLA 4OCEA 19GSA 2LQOA 2FHEA 3ME7A 1BYEA 5ECQB 3ZFBA 4HDEA 4IQ1A 2I9HA 1TRUA 3H93A 5CREA 4HJ2A 5JCGA 3VWXA 1M7TA 2O7KA 1A24A 2Z9SA 5EY6A 4NV5A 1NHOA 3A3TA 2B5XA 2MZCA 1EV4A 6GSWA 1KEBA 2H0GA 4ML1A 2IN3A 1OKDA 3TKSC 2XBQA 1J08A 3APSA 3M3MA 5IMVA 1OE7A 4L5OA 1Z9HA 4Q5NA 2RIIA 2P0GA 2TRCP 3UBLA 4PUAA 2C3TA 2H1AA 1SJZA 3E3EA 3KCMA 3Q74A 3WGXA 3APOA 3TJFA 1ZMAA 2PMTA 3VFIA 2GT5A 5GZZB 2AYTA 3IBHA 4N0ZA 1CQHA 3FR9A 2RLIA 4NPBA 1YEXA 2HLSA 4CHSA 4JRRA 1TDIA 1AW9A 2GGTA 3BCIA 2K8VA 4MZCA 1SKSB 4PXOA 3TB2A 4WR5A 4ZL9A 2MBSA 2KUCA 5EPFA 1FO5A 2NTOA 2WGRA 3HZ4A 4MJCA 3ZFLA 2EIQA 5F0GA 2L5OA 6GSUA 4OO4A 2HYXA 1GULA 2C3QA 4IJIA 4K1FA 4JE1A 3HDCA 1MDJA 1TW9A 4OMVA 4K0NA 2LJRA 2PGTA 2JADA 2A2RA 4GF0A 3GNJA 1SU9A 2LTKA 4KDYA 3ZVJA 3IC4A 4GCIA 1HNCA 1GP1A 4OFTA 4EC0A 3IK7A 1YDKA 2K18A 4ZBDA 1URMA 3EC3A 1GLQA 3WT2A 2IYJA 3I6AA 3IE3A 5KN2A 1O7UA 4N11A 4IQAA 3RAZA 4JR6A 1OAZA 4GSNA 3KMOA 3FZ5A 1O73A 3G9BA 1G6WA 4Q5FA 3NZNA 1QQ2A 4L0UA 1TRVA 3FYGA 4V2MA 4YH2A 3M8NA 1T00A 2ON5A 1K0AA 1XWKA 3BBYA 1BEDA 2YPMA 5EL8A 4XS6A 2DJ0A 4ZB9A 1T7PB 2CVKA 3FKFA 4KDXA 4ZB8A 4QQ7A 1SD8A 1M2BA 2NBSA 3CBUA 3I9V2 1Q4JA 2IMIA 1GNWA 3F3RA 2IIYA 3QOUA 1VF3A 2D2ZA 2LEGA 4JZQA 4K6XA 1A8LA 3HXSA 1B4PA 2QGVA 4HOJA 1E2YA 3EMXA 4YQVA 4G2EA 4TXVA 3UVTA 1ABAA 1SD9A 5IPHA 5B8AA 1TXXA 3LFLA 2IMKA 3TOUA 2IPAA 1U6TA 1DBYA 1LBKA 1BJXA 3DXBA 2KP2A 2OADA 3CRTA 2NPBA 1BG5A 3FEUA 3IK9A 1PRXA 3BOAA 5AISA 2ZUPA 4GWRA 4FYUA 2AV4A 3WGDA 1U3IA 2LQQA 5A5KA 3IDVA 1H4OA 2VLVA 5AIVA 3KP9A 3RBTA 2DJ1A 1X5CA 2WRTA 2LUSA 1EEJA 1GSUA 2DJ2A 4PGTA 4YQMA 2I3YA 2MMNA 4D73A 3L9VA 3EMPA 3F6DA 1O8WA 1TOFA 5G5EA 1M9AA 2AJQB 5GAPD 1K0CA 1X9SB 1ZOFA 4NV2A 1F2EA 5KN0A 2OA7A 4WBJA 2YP6A 1SKWB 2YNXA 1GUHA 4XS1A 1PL1A 5D9TA 3SBCA 2M72A 3DWVA 2PVOC 5AGYA 2E7PA 5ID2B 4KNDA 2K9FA 4RQXA 2L6DA 2YWOA 3GURA 5IQYA 1OC3A 3ZIVA 2HT9A 1X9WB 3U5RE 3H8QA 4AJ6A 2L4QA 3QAWA 1AQWA 3M9JA 1K0OA 2H6YA 3F4SA 3MNGA 5ECOB 2MYGA 2GZZA 3L0HA 2AUVA 2FA4A 1OVNA 4TR1B 5E4WA 1H75A 2H6ZA 2JACA 3D5JA 5HFKA 2O89A 1U88A 4NAXA 1TU8A 2JZRA 4X1UA 1YEPA 1XW5A 3TKQA 3GA4A 2G0FA 3UIWA 2H76A 2KP1A 5JCUA 5G1LA 1XWCA 2GLRA 3LORA 2FA8A 2V6OA 1MTCA 5G1KA 2FD3A 2DMMA 1XXUA 4K9ZA 2R6KA 3CMIA 4E8EA 2LV3A 3DVWA 2FWHA 4GSTA 4EUYA 3IPZA 2OACA 1S3DA 3HVSA 4MDCA 1TK5B 3D4MA 5HR1A 2I81A 2DC5A 4EDZA 1G7EA 4K2DA 3IAM2 2OBIA 1A23A 1PKZA 1EP8A 1AQXA 3HJOA 4Q5RA 1WOUA 3HKRA 4GQFA 2FUG2 2EIOA 3VWWA 3P8WA 4MK3A 5CRGA 2IY2A 1LU4A 4IKHA 3TRXA 1XVWA 3PH9A 5FWGA 5DAKB 2RUEA 3HJMA 5IMCA 1EP7A 3TKPA 2TIRA 4F03A 1OYJA 5DQSA 3P90A 4EF0A 4GTUA 1SL2B 2LKUA 2E0QA 2FCHA 3PR8A 1EOGA 2DJ3A 3DEXA 3W8JA 2C8UA 3HA9A 1GTAA 4TKYA 2GSQA 1T4ZA 2QC7A 1PN9A 4IVFA 1XW9A 3UVHA 1GRXA 2VLUA 2DLXA 1B8XA 2CAQA 4POLA 1ZZYA 3FZAA 3W6GA 2KHPA 3TCOA 2DSAA 3ZLPA 5COHA 1JHBA 4WXTA 5D8IA 1FVJA 3GTUB 1YKAA 1XWGA 4HQZA 1N8JA 2E2MA 3TUEA 1GTUA 4L5LA 2CX4A 2L6CA 4V2LA 2E2GA 3WT1A 2V2GA 1TU7A 1ON4A 2HSHA 4ECJA 2QSIA 4MP4A 2H0IA 4GQCA 2MBTA 2VL2A 1SYXA 1K0BA 2IWTA 2WS2A 3VK9A 5F06A 2VL9A 3F6FA 1YJ6A 3IA1A 5G31A 2H1DA 2O8VB 2A2SA 1HNBA 1WE0A 10GSA 1B4QA 2O87A 2WZ9A 1ST9A 2V32A 1V57A 3DMLA 4KCAA 1RK4A 4ZILA 2V1MA 1GSYA 1NHYA 5B6NA 2CQ9A 1W4VA 2ZCTA 4ISDA 3DD3A 5D73A 3L9UA 6GSSA 5DQYA 1HYUA 1PX7A 3ZMKA 4EKZA 2VD0A 1M99A 3FY7A 5CRDA 1KBNA 1R5PA 3H79A 2WJUA 1JZRA 4BWSA 5ECMB 2G2QA 1ERVA 4P3YB 3LXTA 1FHEA 2K8SA 2JZTA 4KSMA 3KM6A 4GXZA 4X43A 4MPGA 5F8BA 4OWYA 4POMA 3UAPA 2DMLA 2XBIA 1HQOA 5D9XA 2GQKA 1N2AA 2JL4A 5DVBA 1G0TA 2WULA 4KSOA 5DBQA 1R5AA 3KGKA 1XZOA 1WWJA 1J0FA 4MCUA 2LNSA 4XRAA 4TW5A 5ID2A 3A2WA 1BAYA 2LRCA 2IJYA 4MF6A 1I9DA 2H1BA 1T4YA 4F9ZA 3KTLA 1EZKA 3C73A 1QK8A 3DYRA 16GSA 2C0EA 1SL0B 5JWQB 1HNAA 4ULXA 4TN8A 4TR1A 2F8AA 3CYNA 5B8BA 4DEJA 1K0DA 3GH9A 4LL1B 5G30A 1GUMA 1ZCPA 5J41A 1MD3A 1YZXA 17GSA 2CV4A 1LJRA 4XCSA 4ILFA 1A0RP 1IYHA 3HCZA 3D22A 4F2IA 5DALB 4OFNA 3J7Yk 1GL8A 4O92A 2NDOA 3GKNA 4G19A 2HZFA 3GFKA 5J5NA 3V1WA 3O6TA 5DJLA 1USBA 3A5WA 1FVKA 3TKSA 4K7OA 4V1Ap 1X0RA 5DCGA 1SKRB 2YOIA 3D4TA 2H1GA 3IV4A 3PINA 4MMMA 1VF2A 3KEBA 1C72A 4DSQA 4MLYA 3FZ9A 3ZITA 4H86A 3GKXA 1GSFA 4MZWA 1A2LA 4EDYA 2B5EA 4IHUA 4I2UA 2X64A 1ZYEA 5LD0A 3QFAC 2PERA 2H72A 5HR2A 1GH2A 3ERGA 2F51A 2FWEA 4PX1A 3HY2A 2H70A 4TR4A 2K6VA 2X8GA 4F0CA 1AQVA 4ZL8A 3WD6A 5DAKA 3UJ1A 1YF0A 1QUWA 2F8FA 1GTBA 4TR3A 1XOBA 3LEFA 3D21A 2ZNMA 4N0VA 2GZPA 2H73A 2AHEA 2REMA 3MDKA 4KAEA 3KJYA 3RPPA 2ES7A 1SK0A 2LJAA 3MSZA 4HI7A 2ON7A 3AY8A 1ZL9A 2X8HA 2H74A 2DJKA 5AN1A 1XWBA 5C04A 4POBA 3HVXA 3WGEA 2JZSA 5ECKB 2QKEA 2YWIA 5D9WA 2VAFA 2DJJA 2GZYA 4BL7A 1JLWA 1FG4A 2VM2A 1OC9B 2DIYA 5A4UA 1DUGA 4I6XA 4OCFA 4XIHA 1GNEA 2VCXA 4LA1A 1NW2A 3CXGA 4KW6A 1WP0A 2VCZA 3TRQA 2LSTA 1TK8B 4IN0A 3NIVA 4FH8A 1CQGA 3GTUA 2P31A 1QMVA 3JCML 3RHCA 2RUFA 4HS1A 5ECNB 4HEA2 5KN1A 3SWLA 1V2AA 5CAXA 1ILOA 1QGVA 2I4AA 2JSYA 4J57E 1E6BA 5IMFA 4PUFC 12GSA 2TRXA 3CSJA 2B1KA 2GQMA 3KP8A 4OFMA 5ECRB 1B9YC 2XPDA 3G7YA 4ZBBA 3LJRA 1Z6MA 4FIWA 3QR6A 3G7IA 3APQA 6GSVA 3E9JB 4ZBAA 2IMFA 3GKMA 3BCKA 1WIKA 1G7OA 1JZOA 2GQLA 3C1RA 3NOFA 1TRWA 1OC8A 1Z6NA 4N10A 3GL3A 3ZZXA 1QFNA 4HZ4A 1XW6A 3EYTA 2B3SA 2IMEA 2L4CA 2H75A 3KXOA 3G7JA 4PQIA 2L57A 1ML6A 4NWYA 1OKTA 1XPVA 4K8MA 5J9BA 4EO3A 2WFCA 3E0UA 4I97A 3TGZA 4MJEA 4ZXGA 3M0FA 3M1GA 2HRNA 3L4NA 3ZTLA 3VI7A 4OO5A 3EU3A 5B6MA 4ECBA 3L78A 1R7HA 3GX0A 4KH7A 4WEYA 5ECIB 1I5GA 5IO0A 2FNOA 1A0FA 2X8CA 5H5QA 4IGJA 1MEKA 3LG6A 3A2XA 1EGRA 3TJGA 3HD5A 5ECLB 1F3BA 5F05A 2KLXA 3KH7A 2R37A 5CYYA 1DE1A 1UA5A 1GSDA 5HFGA 1RQMA 3FK8A 1TP9A 4BWQA 2OE3A 4K7NA 2L5LA 2ALBA 3Q6OA 1U3AA 5CO3A 3ISOA 3GSTA 1TK0B 3VWVA 4RI6A 1VF1A 4O7HA 4WF5A 2C0DA 4I8BA 2H6XA 3CTGA 3UBKA 2WB9A 3KH9A 4X0XA 2HSYA 4WBRD 5B7CA 1ERTA 3GSSA 4JU5A 3ZRDA 5DALA 2B1LA 3DKSA 2CZ2A 5IM9A 5FT3A 4CDOA 1UVZA 1XFLA 2GVPA 4YQUA 1K3LA 1Z7RA 1JZWA 1ZGNA 4WETA 1A8YA 2YJ7A 4XRDA 4PURA 4J56E 4IJ3A 4FYBA 1JLVA 1F9MA 1FB0A 1K3OA 3CSHA 4YAPA 3VPTA 2VCWA 5HFIA 1SENA 3RPNA 1BQ7A 4PQHA 3QD9A 2O85A 1B9XC 3IRAA 1KNGA 1XIYA 3LYPA 4EL1A 3GUSA 2OBKA 2PBJA 1QXHA 3ZL5A 1WRYA 3J7Yb 5ENUA 2VIMA 4KUNA 5GSSA 3I43A 2PVQA 4MF5A 3TKRA 2YZHA 4TVEA 5D93A 2J23A 5ECPB 4XS4B 2LRTA 2PPTA 4N30A 2GTUA 3FZ4A 5AIXA 2N5BA 2AB6A 3GKKA 1AC1A 4G10A 3ERWA 1S3AA 3HYPA 5L71A 3VI5A 3UEMA 2GT6A 3FRCA 2FLSA 2H01A 3IR4A 4AGSA 4KDUA 4JEDA 4KGIA 1EWXA 2DBCA 1GSEA 2YV7A 5JWRB 1X5DA 4BVXA 2FWFA 1Q98A 3KZQA 4POKA 4DSSB 3TJJA 4HJMA 4TR0A 2XC2A 6GSYA 2H66A 1T1VA 5HR3A 3H4KA 3ZYWA 2YV9A 2EC4A 2BMXA 3K8NA 1MD4A 5IO2A 4ZIJA 3TOTA 4IBPA 2VL3A 1OC9A 3IAS2 3CRUA 8GSSA 3WYWA 2B7JA 4KA0A 1JZDA 2IFQB 2OE0A 5IOWA 3GL5A 4OD7A 4TXOA 3TKSE 1PD21 4MJAA 3KTBA 2FWGA 1OE8A 5IIZA 3GRXA 2F3MA 1M2AA 4ML6A 2V6KA 3F63A 1XWAA 1O8XA 3F8UA 5KN3A 1DSBA 2YN1A 2C4JA 3F9UA 1V58A 2LS5A 2HRFA 2EIRA 5DCHA 1BX9A 3UMAA 4F82A 5CRWA 3UOMA 5D9VA 3QAGA 4TOPA 4GSSA 1SJIA 2A4VA 4O5RA 3DVXA 4KCEA 1SK1A 1NSWA 4XTSA 5JCWA 3O76A 5DDLA 1GSQA 5ECHB 3N9JA 1B48A 3R2QA 1K0NA 5GSTA 4KX4A 4ACSA 9GSSA 2YWNA 1YY7A 2F9SA 4EE0A 3VLNA 1AUCA 3L9SA 2HZEB 2YCDA 2DIZA 5J3RA 1W89A 4LL4B 2VCVA 2R5GA 3GMFA 3D0ZA 4MJBA 3US3A 3EWLA 3LXZA 3C71A 3W8SA 2GSSA 2VD1A 5GAND 5IPGA 1XOAA 5ELGA 3QFBC 3TRPA 22GSA 2H30A 3P2AA 1TJDA 1PA3A 1XVQA 2GSRA 1J9BA 3QCPA 5IOXA 1FW1A 2OE1A 4I5QA 3H1NA 2RM5A 4FO5A 3CTFA 4L0WA 5ELAA 3GX8A 4WR4A 3O3TA 3ZMLA 4MH3A 2WCIA 2VCTA 1NM3A 1YF1A 3LYKA 1PQNA 2YZUA 3GYKA 1Z7PA 1UC7A 1VGLA 2MMOA 5HQPA 1XCCA 3BD2A 3TJKA 2C1YA 3DIEA 5G2ZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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