1G0TA

Dsbc mutant c101s
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
DDAAIQQTLAKMGIKSSDIQPAPVAGMKTVLTNSGVLYITDDGKHIIQGPMYDVSGTAPVNVTNKMLLKQLNALEKEMIVYKAPQEKHVITVFTDITCGYSHKLHEQMADYNALGITVRYLAFPRQGLDSDAEKEMKAIWCAKDKNKAFDDVMAGKSVAPASCDVDIADHYALGVQLGVSGTPAVVLSNGTLVPGYQPPKEMKEFLDEHQKMTSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the protein disulfide bond isomerase, DsbC, from Escherichia coli
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Escherichia coli
molecule keywords THIOL:DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN DSBC
total genus 68
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2000-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 1g0tA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1g0tA02
2L59A 5DDLA 3APSA 4IBPA 2RM5A 3MNGA 4G9HA 4BA7A 10GSA 3FR3A 2DJ1A 4NMUA 1QXHA 5IPHA 6GSVA 1X9SB 1NM3A 4MF5A 4MJAA 5ELGA 1Y25A 2HZEB 4GSTA 2FA8A 2B5XA 2DSAA 1GP1A 2WFCA 3UAPA 1BX9A 2WRTA 2GLRA 4ILFA 2OJLA 1G6WA 3D6IA 4IN0A 2YWNA 4HJMA 4NXIA 3CBUA 2OKAA 4X1UA 2H0IA 4POKA 4OO5A 5DCGA 3VI7A 4XHMA 2I4AA 2MBTA 4POMA 2C0FA 1XPVA 2FHEA 3LQ7A 2GQKA 2VO4A 5ECQB 4NHWA 4EDZA 2AYTA 3BCIA 3A2WA 4ECBA 4WF4A 2ZCTA 1UVZA 3DWVA 2LNSA 1M9AA 1Z7PA 5AISA 4DSSA 2GSQA 2P5RA 1EV4A 4PQIA 4LL1B 2NVLA 1NHYA 1TU8A 1XWCA 5DJLA 4GTUA 2AV4A 1B4QA 3KXOA 1N2AA 4HI7A 4F03A 4DVCA 2P5QA 1WWJA 2NTOA 2FY6A 3GX8A 1GUMA 3PH9A 4L5LA 3S9FA 3TRXA 2H1GA 4AGSA 5IO2A 1SK0A 4WF5A 1UN2A 5J9BA 2HFDA 1ZL9A 1GNWA 2E2MA 3P7XA 1W4VA 3N9JA 2HSYA 3QAWA 2DJ3A 5AGYA 2B3SA 2GQMA 1G0TA 1JHBA 3DIEA 2OE1A 2C4JA 4MZWA 1I5GA 1Q4JA 1HNAA 3C1RA 3MDKA 5D9WA 5IOWA 1O8XA 4FYUA 1X5DA 5D9VA 1TK8B 5A4UA 1EOHA 1KEBA 4YQVA 4E8HA 22GSA 1SYXA 2ES7A 3IHQA 3JCML 2L5LA 2N5AA 1EEMA 2V1MA 4GRFA 3NOFA 1X5EA 1ERVA 2X8GA 4HUAA 4O32A 2PMTA 1BEDA 2CA8A 1PX6A 2HE3A 1XBSA 1O81A 3VFIA 3IAS2 2LV3A 4GF0A 4NV2A 3EE2A 1O73A 5HR0A 5H5SA 3VWVA 1TI1A 1WOUA 5KN3A 4XCSA 3U6VA 1F9MA 2K9FA 2FUG2 2YANA 1F37A 3VWXA 5FHIA 3KIJA 2FGXA 6GSSA 2FA4A 1XWBA 1VF3A 3UOMA 5IOXA 2JSZA 1GULA 2K8SA 3KGKA 4KDYA 5INYA 1SKSB 1XIYA 3DXBA 1V40A 1VRSD 5EY6A 3I6AA 3UBLA 4N11A 3KCMA 4OFNA 4TR1A 2KHPA 1A2MA 2H76A 3KZQA 3GL5A 2MMNA 1TK0B 1G7EA 2CZ3A 2M72A 4JR4A 4GQCA 4ZB8A 1X9WB 2HLSA 2MZCA 2VCQA 2H74A 3FW2A 4GXZA 5HR3A 5DBQA 1QGVA 4GLTA 2YPMA 4MDCA 4OCEA 3G7IA 4KSMA 2FD3A 2H70A 4FH8A 4XIHA 2CVBA 4MH2A 2L6CA 2H6XA 1LBKA 3IA1A 4ECJA 1A0RP 3P8WA 3MSZA 5D96A 3TGZA 1K3LA 1M2BA 1XWGA 1MDKA 2R2JA 1FO5A 3WYWA 1YF1A 1GSSA 1I9DA 3ZZXA 1X5CA 1PKZA 2GSSA 2L5OA 4EKZA 2GGTA 1U87A 2OBKA 5IMAA 5ECPB 5CRWA 1PA3A 1V9WA 2YCDA 4PQ1A 1XW9A 4MP4A 3L9UA 3US3A 1TK5B 4G2EA 1JLWA 3GUSA 1JZWA 3ERGA 4GCIA 1NW2A 3CSHA 3O3TA 3HKRA 2R4VA 5ID2A 2RIIA 3IK7A 4NHZA 4RQRA 2VD0A 4ZBAA 4ZL7A 2YJHA 4HEA2 4O92A 3CRTA 1XXUA 3Q19A 1FB0A 4LMWA 3EU4A 4K2DA 1SENA 2IL3A 2L4CA 2HI7A 4MPFA 3TJJA 2DMMA 3CXGA 1GSQA 4IQAA 4OD7A 2DJ2A 1AAZA 3QAVA 5C00A 2J9HA 2PGTA 4TW5A 1GLQA 2VOCA 3C73A 1BQ7A 3BBYA 2B1LA 4FO5A 1M7TA 4G10A 1T8EB 5ECLB 1VF1A 2F8FA 4TXOA 1K0MA 1GL8A 4JU5A 5B7CA 1PGTA 4KX4A 5G5EA 4F82A 1AQWA 1RQMA 3GFKA 1E2YA 4QL9A 2IFQA 4ZL8A 2B6MA 1FVJA 5J4UA 3UARA 5AN1A 1M0UA 2CAQA 1ON4A 3TKSA 3TKSE 3FYGA 4TRXA 4XTSA 5LNKe 1R4WA 1GNEA 5DAKA 2BMXA 2CT6A 12GSA 5COHA 1WP0A 1B9YC 3G7JA 1TU7A 3RBTA 1PL1A 3WGDA 1SK2A 2H19A 2LRCA 1R5PA 4GSSA 1WMJA 4XS4A 1QMVA 5GZZB 2VCXA 3KP9A 3D22A 1UC7A 5A5KA 1M2AA 4G19A 1T4ZA 2DBCA 3EC3A 3WGEA 5IMVA 5JWRB 3DYRA 3HJOA 1ILOA 2N5FA 2JADA 1QFNA 5G31A 1ACVA 3FEUA 2LUSA 14GSA 5F07A 2GS3A 3TUEA 4RUVA 3IOSA 5HR1A 1FW1A 2H6ZA 3GRXA 4ZB6A 4WEYA 2GZZA 2HYXA 3DVXA 1EGOA 4RI7A 5CRHA 5IMZA 1GTUA 3F6FA 4IJIA 2K18A 5B8BA 2AUVA 5HFIA 2H30A 3BJ5A 1XW6A 4L0UA 4WXTA 3Q18A 3GX0A 5ABRA 2H71A 1AC1A 2VLVA 4EF0A 2D2ZA 2X8CA 2C8UA 1F3BA 3WT2A 4K6XA 3FRCA 3Q6OA 3GNJA 4K7IA 1T1VA 3FR6A 2YWIA 4WR4A 4BWSA 2H0HA 1C72A 5ECIB 5EVOA 2JACA 1URMA 5GAPD 5KN0A 4X0XA 1DUGA 4J2FA 1ERUA 2DC5A 3DEXA 1ST9A 2H73A 3H4KA 3D5JA 3ZYWA 2JZRA 5J5NA 4I5QA 3GIXA 4NV5A 4EXJA 2I9HA 4Z7XA 1VF4A 5G1LA 4GWRA 3IV4A 4DSSB 1JLVA 2IPAA 3QPMA 3APQA 4ZL9A 4LL4B 2B5YA 1Z6MA 18GSA 1XZOA 3UBKA 2MMZA 1VGLA 19GSA 2I81A 1YKAA 2KP2A 4GSNA 2C1YA 3HJMA 3UEMA 3HZ4A 4NPBA 3ZITA 1O8WA 3D4TA 4POBA 5H5QA 3TKSC 2R3XA 2TRCP 2YZHA 4BVXA 5FT3A 1FG4A 3ME8A 2VM1A 2CVKA 6GSWA 5F06A 2G0FA 2CX4A 2PVQA 3FZ9A 3TJGA 1U6TA 3ZL5A 3ZLPA 3HA9A 2NPBA 5A4WA 3MAKA 2E0QA 2KP1A 4K0GA 3KJYA 5LCZA 2B7JA 4MZCA 4ULXA 4JBBA 3W8JA 3ZVJD 3DMLA 5ECSA 1FOVA 3HZ8A 4NWYA 3FKFA 1J08A 3GKMA 2Z9SA 1ZYQB 5JCWA 2RUFA 2E7PA 4TR3A 2REMA 1K0AA 3ZIVA 4P3YB 3GTUA 5HQPA 1AXDA 1OC9A 5IMDA 3RPNA 1OE8A 2DIZA 1T7PB 2OBIA 1S3AA 2DJJA 5J3RA 3F4TA 5DQSA 4AJ6A 5FWGA 5JWQB 11GSA 1EWXA 3HVVA 3NIVA 3TRQA 4EL1A 5CNWA 5HFKA 1J0FA 3C1SA 3PR8A 1SD8A 4KAEA 3A2VA 2H6YA 2GZYA 1QK8A 3ZFBA 2WCIA 5KEJA 1XFLA 2B1KA 4Q5NA 1PKWA 2DIYA 1A2LA 1ZOFA 5DQYA 3GKXA 4KH7A 2H0GA 1G6YA 4L0WA 3LXZA 1EV9A 1YF0A 2H01A 4PGTA 5CREA 3G9BA 3C7MA 3GSSA 3GMFA 1X0RA 3M0FA 4V2LA 3OR5A 4DEJA 1V58A 2L57A 3P90A 2V2GA 3F3QA 3LFLA 3ZVJA 4IP1A 4QL7A 3KEBA 2H1DA 1MDJA 1PRXA 1B8XA 1GSUA 2GQLA 3TOUA 3UMAA 2H66A 4EC0A 1HD2A 4TR4A 1E6BA 5KN1A 3H93A 3LYKA 1K0NA 5G30A 2MBSA 3F0IA 4TR1B 2JL4A 2IMIA 5IMCA 3VWWA 3H8QA 1AUCA 2VD1A 5DALA 4MPGA 4O5RA 3GV1A 1RK4A 2H1BA 1OE7A 5F8BA 1SL2B 2LJAA 2JU5A 4F9ZA 4ZBDA 4EO3A 1GLPA 4K1FA 1PD21 4ISDA 1HYUA 5ECMB 1OKDA 2V6OA 1A23A 2V32A 2PWJA 3K8NA 5E4WA 1USBA 1OC8A 4KW6A 2IWTA 2LKUA 2K6VA 2HNLA 2QGVA 3CSIA 5F0GA 3QOUA 1SK1A 3APOA 3BOAA 3QD9A 3LGCA 1SU9A 4KB3A 2XBQA 1MD4A 2R37A 5ECHB 4MLYA 2VCZA 1TDIA 4KDXA 1ZYEA 1EZKA 1YEPA 3HHVA 2AB6A 3HYPA 1ERTA 3O76A 4HQZA 17GSA 5IMFA 4HS1A 1V57A 1DE2A 5HR2A 2IIYA 4MF6A 1AQXA 5JWOB 3GH9A 3FR9A 2WZ9A 4F2IA 2O89A 3EVIA 1FHEA 3LSZA 1OAZA 2JZTA 3ED3A 5ID2B 3A2XA 1SJ6A 2J23A 1BJXA 3ZMLA 1LU4A 4JRRA 2B7KA 4EUYA 1S3CA 3RHBA 2ALBA 2X64A 3M1GA 4WBRD 5DJMA 4V1Ag 3TOTA 4CDOA 5G2ZA 3CTGA 4ZIJA 2P0GA 1JZRA 2GTUA 2VL2A 3F4SA 3I43A 2F8AA 4ECCA 4EE0A 4PQHA 5DVBA 4Q5RA 4JR6A 1M2DA 1EP7A 5ECRB 4X43A 2CV4A 2WS2A 2VL3A 3KP8A 3ERWA 2E2GA 1RW1A 4HOJA 5CAXA 3GN3A 4WR5A 3EWLA 1GSEA 3U5RE 3D21A 4WBJA 1K3YA 4F0BA 2XC2A 3KH9A 1V2AA 1T3BA 2CQ9A 4CW9A 1GTAA 4HZ2A 4TXOB 3A5WA 1TP9A 2ZNMA 3MWHA 3VURA 1U88A 5ECNB 4WKWA 2IFQB 1PSQA 3PGTA 4PXOA 3C71A 5JCUA 2LQOA 3PINA 3VI5A 1MDIA 4TKYA 2YZUA 2EC4A 5ENUA 1OC3A 2DLXA 3RDWA 3IPZA 2NBSA 5DAKB 4MF7A 1IYHA 5LD0A 1J9BA 3F4RA 3I9V2 2BJXA 3HVXA 1XOAA 2FWFA 1OKTA 3BCKA 2B5EA 4XS4B 1SJZA 2WDUA 5IM9A 4JZQA 3D0ZA 1SD9A 2PBJA 4N10A 2FWHA 2OE3A 5B8AA 4I97A 1U3AA 4D73A 1MTCA 4L8EA 5CRDA 1A8LA 5D9XA 1PL2A 5EPFA 3QFBC 2IY2A 4IW9A 1WE0A 1GWCA 2VCTA 2YP6A 4ML6A 3HD5A 3FZAA 3C8EA 4HU7A 2LTKA 1GRXA 2GZPA 2HT9A 1ZGNA 1DBYA 4V2NA 1TRWA 1HNBA 2L6DA 2CZ2A 3ZFLA 2IMEA 1GTBA 5GSTA 3D4MA 4BL7A 2AAWA 2XPEA 1EOGA 3GHAA 1Q98A 4PUFC 4K7OA 4IJ3A 1TW9A 2F51A 3L9SA 4FYCA 3KTLA 6GSXA 2DJ0A 1Z3EA 4ZB9A 5CP1A 4KCEA 3LJRA 4TVEA 3L4NA 3QMXA 1A0FA 2O85A 3RPPA 1SYRA 4KSOA 4J57E 1SJIA 4GQFA 4K8MA 2O7KA 4J56E 4PNGA 3M3MA 5GSSA 3FY7A 1F2EA 2C3TA 1ZCPA 4I2TA 3ERFA 4AJ7A 2VCWA 4OFMA 2FLSA 2R6KA 1THXA 5ELAA 2N5BA 5L71A 3ISOA 1CQHA 1AQVA 1BG5A 3QDNA 1CQGA 3VPTA 1XVWA 2EIQA 4MABA 3ZTLA 2X99A 1BAYA 4HZ4A 2A2SA 5F05A 1ERWA 3EMPA 3LWAA 3SBCA 1YKCA 5IIZA 4KA0A 3QAGA 4PUAA 2I3YA 5IO0A 2EIRA 2LRNA 3AY8A 4OFTA 2VLTA 3CTFA 4V2MA 4IVFA 2VM2A 4MJBA 3HCZA 1UA5A 1O6JA 2NDOA 3KH7A 3FZ5A 3E3EA 2VL9A 3ZMKA 3VLNA 4IS0A 2XBIA 3EYTA 2ON7A 2DJKA 4MZBA 4ZBBA 2HZEA 2QSIA 1WRYA 2ON5A 1TKDB 1O7UA 2OADA 4YAPA 1SKRB 1EEJA 3R2QA 2C3NA 5EL8A 5D73A 1XCCA 1ZZYA 2AHEA 2C0DA 2OACA 4HDEA 2AJQB 1PX7A 1TTZA 2YWMA 1YEXA 2YWOA 1TXXA 4ZILA 2HXKA 3KM6A 3IDVA 5D8IA 1Z6NA 2QKEA 1QUWA 4K9ZA 3W6GA 3DVWA 5CO3A 2XPDA 2LS5A 3F8UA 2GDRA 3DKSA 1SL1B 3GTUB 1SL0B 1ZMAA 2C80A 4N30A 1OC9B 2GT6A 5A4VA 1G7OA 2L4QA 3LG6A 4MCUA 1VF2A 4XS6A 2LJKA 3GKNA 3FZ4A 3HVSA 2H75A 3QR6A 3IRAA 3GL3A 3HJPA 4IHUA 4TN8A 3FK8A 1JZDA 5C04A 1EP8A 5ECOB 4IQ1A 6GSUA 1A2JA 3IE3A 1YDKA 3TB2A 6GSYA 3TJKA 3QFAC 1XVQA 2X8HA 2GT5A 5B6NA 5J9CA 2O87A 1WPIA 3TJFA 2WJUA 5B6MA 3RHCA 2HSHA 6GSTA 2PU9C 3VPQA 2FNOA 2H8LA 5HFGA 2HZFA 3EURA 3L78A 3IBHA 2LNTA 13GSA 1GUHA 1EGRA 2RUEA 3VK9A 4JE1A 3W8SA 4PURA 1NSWA 1PMTA 2WULA 2WGRA 4IELA 4OO4A 1H75A 1B48A 2GSTA 2A4VA 1V98A 1XWAA 4Q5QA 3TKQA 2KUCA 4KE3A 2V6KA 4LMVA 5G5FA 3CMIA 1K0OA 4KUNA 1FVKA 1XW5A 3H1NA 3NZNA 1GSYA 3G7YA 1A8YA 2IMDA 1BYEA 2FWGA 2PPTA 1AIUA 16GSA 5DALB 1GTIA 2PERA 2CX3A 4YQUA 3UL3A 3Q74A 4OMVA 1WIKA 1OVNA 4HU9A 2YOIA 3F63A 4H86A 2YN1A 3LYPA 2CAIA 4K0NA 1KNGA 5D93A 4CHSA 1F3AA 2FWEA 3HY2A 4I6XA 2LRTA 2OE0A 3TKRA 4IKHA 3CYNA 2R5GA 2C0EA 3RAZA 4MJEA 3KMOA 2V41A 2OA7A 2MMAA 4KGIA 4L5OA 4DSQA 1XOBA 2LEGA 2JSYA 2KOKA 4LLRA 1K0CA 2C3QA 4I2UA 2PVOC 5ECKB 1NHOA 4ECIA 2DMLA 3TJBA 2F3MA 1PN9A 2WB9A 3HXSA 1X9MB 3GYKA 3L9VA 2H72A 1TOFA 5DCHA 4LA1A 2IJYA 2YJ7A 2F9SA 1PQNA 3J7Yb 4OCFA 4PX1A 3IXRA 9GSSA 3WD6A 3EU3A 8GSSA 1HQOA 1SKWB 3F6DA 1O85A 3EMXA 1MD3A 2YNXA 1GUKA 1R7HA 3V1WA 1JZOA 1M99A 2C0GA 3WGXA 2VIMA 3E0UA 2I1UA 2LQQA 3M9JA 2TRXA 4RQXA 4HQSA 2KLXA 4IP6A 4YAVA 4I8BA 1JFUA 4MK3A 2CVDA 1THOA 1U3IA 1Z5YE 2HRNA 3GSTA 1LJRA 3A3TA 2BTOT 4K7NA 3FHKA 2LJRA 3HDCA 2M80A 1B9XC 2IMFA 2H1AA 3SWLA 4TOPA 2IMKA 3IR4A 1GSFA 4F0CA 1QQ2A 3DGQA 4TXVA 3DRNA 4MMMA 3O6TA 3E9JB 4EVMA 3BD2A 3ZREA 3ZRDA 1TRVA 1Z9HA 1T4YA 1B4PA 4FYBA 2FCHA 2IN3A 2VUPA 5D9TA 3VWUA 1K3OA 4ACSA 1OYJA 2MMOA 2PUKC 4FIWA 3J7Yk 4PNFA 5AIVA 1ML6A 4V1Ap 3ME7A 3WT1A 5CRGA 2M46A 1YZXA 3DD3A 3GH6A 1FAAA 1FB6A 1S3DA 1DE1A 4AF2A 2TIRA 1YY7A 1K0BA 1W89A 2IYJA 1F6MC 5CYYA 5H5RA 2HRFA 1M9BA 3F3RA 3GURA 3TCOA 3GA4A 2GVPA 1YJ6A 1K0DA 1MEKA 4KCAA 4ZXGA 1GSDA 4AJ8A 4EDYA 4D73B 2GSRA 3H79A 1XWKA 3QCPA 4MH3A 3KTBA 3UJ1A 5IPGA 2MYGA 4WETA 3CSJA 2LSTA 3IK9A 2VAFA 5E59A 4E8EA 2P31A 1KBNA 2EIOA 2YV9A 3IC4A 3M9KA 3M8NA 1KTEA 3LORA 4BPYA 5GAND 3P2AA 3I69A 3L0HA 4ID0A 1R26A 4XRDA 3TDGA 3CRUA 5KN2A 2A2RA 20GSA 3KMNA 3UIWA 1Y6EA 1YQ1A 3TRPA 4TR0A 3IAM2 2G2QA 4MA9A 4N0ZA 5AIXA 2XHFA 1ABAA 5IQYA 4Q5FA 2VCVA 4HJ2A 1T00A 4YQMA 4QQ7A 1WJKA 3TKPA 3UVTA 5G1KA 4KDUA 4ML1A 1TRUA 1DSBA 4POLA 4OWYA 4BVYA 4IGJA 1HNCA 2K8VA 4YH2A 1Z7RA 2JZSA 7GSSA 1TJDA 3GKKA 2O8VB 1GH2A 2RM6A 1TI3A 2RLIA 1IYIA 4N0VA 2YV7A 3ZIJA 4XRAA 2PN8A 1AW9A 3EINA 4JEDA 1A24A 2VL2C 2ZUPA 4DSRA 3LXTA 1N8JA 1R5AA 4BWQA 4MJCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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