1JZDA

Dsbc-dsbdalpha complex
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
GAMADDAAIQQTLAKMGIKSSDIQPAPVAGMKTVLTNSGVLYITDDGKHIIQGPMYDVSGTAPVNVTNKMLLKQLNALEKEMIVYKAPQEKHVITVFTDITCGYSHKLHEQMADYNALGITVRYLAFPRQGLDSDAEKEMKAIWCAKDKNKAFDDVMAGKSVAPASCDVDIADHYALGVQLGVSGTPAVVLSNGTLVPGYQPPKEMKEFLDEHQKMTSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
publication title The Disulfide Bond Isomerase DsbC is Activated by an Immunoglobulin-fold Thiol Oxidoreductase: Crystal structure of the DsbC-DsbDalpha complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords thiol:disulfide interchange protein dsbc
total genus 66
structure length 219
sequence length 219
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 1jzdA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1jzdA02
2X64A 1M2BA 2LSTA 4RI7A 3UOMA 5D9VA 3P90A 5J5NA 5CRGA 2LJAA 2I81A 2OKAA 13GSA 4F2IA 1GRXA 2H72A 2IMIA 2VCXA 3G7IA 2IFQB 2N5AA 5ENUA 2YCDA 1A2JA 4GXZA 2X99A 3ZLPA 1W4VA 4BWSA 2VCQA 1WP0A 4MF6A 4J57E 1URMA 3UBKA 4GQCA 1X0RA 5FT3A 3ZVJD 1TW9A 3IHQA 2LQOA 3C8EA 4F0CA 2IWTA 1TJDA 3GTUA 2VCVA 3C1RA 4XS4B 2FA8A 1R5AA 1SL2B 1F2EA 4NXIA 5HR3A 2CAIA 2WDUA 1QFNA 2VD0A 1K3YA 3GFKA 5KN1A 4KE3A 4GSSA 2M46A 1WRYA 3UJ1A 1J9BA 1Z6MA 1EZKA 1ZMAA 2L5OA 4GRFA 2J9HA 4IJIA 2DMMA 3HJMA 2KUCA 3GX8A 1V2AA 2R4VA 3CYNA 2YJ7A 2HI7A 5DAKB 1OE8A 1T4YA 1QUWA 1U6TA 2OE1A 2YV9A 1Z9HA 2WCIA 1PGTA 4EKZA 2ON7A 3IPZA 1SKRB 5HR2A 4HQSA 5D93A 2WULA 3G7JA 4IBPA 2HZEB 5ECMB 2IJYA 3PH9A 4IP6A 5DDLA 4YQUA 1NSWA 3DXBA 1EWXA 2FD3A 1SJZA 3APSA 1F6MC 2PERA 1TRUA 4ECCA 4KNDA 1JHBA 3W8JA 1B4PA 3U6VA 1T00A 1U88A 3IK7A 4WF4A 2B3SA 5F05A 2H0IA 3WT2A 3Q6OA 2RM5A 4MZWA 3Q19A 4NHWA 3TKPA 3HZ8A 1N8JA 3GNJA 1Z6NA 4WETA 1ILOA 2PBJA 1THOA 3UEMA 1FW1A 3ZREA 4PQ1A 1WE0A 1MDJA 1TRWA 3VWWA 1K0BA 2LRTA 4EF0A 4ZB9A 1F3AA 3FR3A 1PD21 1O73A 2DJKA 3ZTLA 1VF4A 4F82A 2VD1A 1S3CA 3F6DA 3CSIA 4V1Ap 4Z7XA 1FB6A 1ERVA 5AN1A 2VUPA 2GS3A 4HJMA 2K18A 4PGTA 4X0XA 1BQ7A 4DVCA 1K0AA 3DWVA 4FO5A 1XXUA 5AIXA 2YN1A 2GLRA 5ELGA 3M1GA 2XPDA 4D73B 1M0UA 4CW9A 3H79A 1AQVA 1I9DA 3BCKA 3EYTA 4IQ1A 1TRVA 1THXA 2PVQA 5KEJA 1VGLA 3D6IA 1K0OA 3CSHA 2OADA 2YWIA 2V2GA 4OCFA 3QD9A 3U5RE 4TRXA 5J9BA 2GZYA 3VPQA 2IL3A 1XBSA 2XHFA 1SL1B 3KTBA 2C0FA 1OC9B 1CQHA 2HE3A 1YJ6A 4L0WA 4IW9A 2H70A 4YAVA 4TXOB 1YKCA 1WWJA 3CRUA 3GH9A 2C0GA 2MZCA 1TRSA 4YQVA 3QCPA 2ZCTA 2H8LA 2HRFA 3GMFA 18GSA 3FEUA 4G19A 4BA7A 2R37A 3BBYA 3L78A 2C4JA 20GSA 1IYIA 3NIVA 5HQPA 4N11A 4BPYA 4FH8A 1GP1A 1KBNA 1O8WA 1BJXA 1XCCA 1ZGNA 5G31A 3VK9A 2G2QA 3MDKA 3QOUA 1QQ2A 1ZOFA 2C0EA 3GSSA 2JACA 4NAXA 4ECIA 5B7CA 3D21A 2BMXA 3MNGA 1NW2A 5GSTA 4JU5A 5ECIB 3GIXA 1SENA 1A23A 1NHYA 2R2JA 2LTKA 2B5YA 3TKRA 4PNFA 1Q4JA 4ULXA 2DBCA 3TKSA 4XRAA 4X1UA 4N0VA 5ELAA 3LORA 2YWMA 1Z7PA 2GQMA 4PQIA 2NPBA 4O7HA 2AAWA 2PN8A 1A2MA 4O92A 4OD7A 1AAZA 3CTGA 5G1LA 2B1KA 3TJGA 4I8BA 3FW2A 1GTUA 3KD0A 2RUEA 3KTLA 2F8FA 1SJ6A 2H01A 5G2ZA 1OC3A 3LQ7A 3GV1A 1T3BA 1R26A 1OE7A 1A8LA 1PSQA 2GT6A 4EO3A 4DEJA 1A8YA 5ECQB 3R2QA 1K0CA 2E0QA 1ABAA 5DJMA 4EXJA 1W89A 2A2SA 5F07A 2ON5A 5DAKA 4LL1B 3IBHA 2I3YA 3ZVJA 3QAGA 2E2GA 1BYEA 1VF2A 1FHEA 5ECPB 3DIEA 3O76A 2F9SA 3TGZA 1FG4A 2HZEA 3NZNA 1MDIA 3IV4A 5ECLB 1N2AA 1ZZYA 2JZSA 3FYGA 1PX7A 3TJBA 1JZRA 3DGQA 1T1VA 1DUGA 1KEBA 3ZYWA 4KW6A 4L5OA 1SKSB 1TU8A 2I9HA 2VCTA 3LWAA 5D9TA 2KHPA 3WGDA 4F03A 4KUNA 1XFLA 3UAPA 4AJ7A 4HOJA 5EVOA 2VOCA 1E6BA 3NOFA 1AIUA 3KH7A 2DIZA 3RDWA 3W8SA 2P5RA 4POKA 5IOXA 5D9XA 4Q5QA 3GUSA 1DE1A 5IO2A 1ACVA 1GULA 4RQXA 1M9BA 2OBIA 3GX0A 4QQ7A 4K7IA 2FUG2 2H30A 3QAWA 2V6OA 2HSHA 1G6WA 1YY7A 1WIKA 2WJUA 2ZNMA 2YZUA 1O85A 4ZB6A 1EOHA 2AHEA 2B5EA 2YWNA 3DEXA 3APQA 1XWBA 3UBLA 5B6MA 2IYJA 2GSTA 3TKQA 3HCZA 1K3LA 5CO3A 4ZXGA 4OWYA 4D73A 2H0HA 2K8SA 1SYRA 3KCMA 3L9VA 4TR1A 2LRCA 3KMOA 2WRTA 4PUAA 1SU9A 5C04A 2RM6A 3VPTA 5DQYA 1V40A 4ZL8A 1PL2A 4V2LA 2B6MA 3EURA 1DBYA 2IMEA 2MMNA 2GSQA 3ED3A 1X9MB 4YQMA 1OC9A 5DCHA 1UVZA 1YQ1A 6GSWA 3N9JA 3RBTA 4MK3A 17GSA 2RUFA 1OKDA 3WYWA 1G7OA 1MTCA 4XHMA 3DRNA 4OO5A 1EV4A 3FY7A 3KM6A 1EP7A 4MABA 5KN0A 3KEBA 2GDRA 1BG5A 1S3AA 1J0FA 2VLVA 2GGTA 4BL7A 2HRNA 4TKYA 4N10A 3QFBC 4ZILA 1I5GA 3TUEA 1ERTA 2H76A 4NWYA 2YV7A 5AGYA 1GTIA 2GSRA 4I5QA 4WBRD 3CMIA 4MJCA 2JZTA 1V58A 3I6AA 2JZRA 2HXKA 1PQNA 2V1MA 4KA0A 3W6GA 3HKRA 4K1FA 4FYCA 4MJBA 5ECRB 2IMFA 2GSSA 2YWOA 3ZZXA 3M8NA 5DJLA 1UN2A 3RHBA 8GSSA 2IY2A 3D0ZA 2O7KA 1SKWB 3ME8A 4EC0A 4AGSA 3S9FA 3CSJA 1GLPA 3F4RA 2H71A 1AW9A 4JE1A 3HVSA 1TDIA 4ZB8A 4MCUA 2MMZA 1GSDA 3WGXA 5EY6A 2XC2A 3DD3A 2YOIA 1GUMA 3BD2A 1GNEA 3I43A 2TIRA 3MWHA 4MZBA 4WF5A 4XRDA 2B5XA 4IQAA 2C0DA 1ERUA 4P3YB 1OKTA 2LJKA 4PUFC 3L9UA 5AISA 3FZ9A 4WBJA 3DVXA 3LXZA 5ECNB 2HLSA 2OA7A 3P7XA 1WPIA 2FY6A 5CRHA 4MMMA 1TK5B 1AC1A 2KOKA 1TK0B 4ISDA 2WB9A 1YEXA 3GKKA 3EC3A 4JRRA 4KB3A 5IMDA 1AQWA 5J41A 2DJ1A 4QL7A 1Z5YE 1S3DA 4KSOA 3A2VA 4MJAA 1T4ZA 4AJ6A 5IO0A 3EMXA 3GH6A 3HJPA 1OC8A 3FZAA 1JZWA 4L8EA 1ST9A 1YKAA 3UIWA 1X9WB 3HY2A 4PQHA 3HYPA 1OAZA 3M0FA 1WJKA 2H1DA 6GSXA 3P2AA 2X8GA 2OE0A 5DCGA 3ISOA 4MH2A 5E59A 3IK9A 1VF1A 4LLRA 5A5KA 1XWGA 4MPGA 3ZIJA 2VO4A 3BCIA 2H1BA 2IMDA 2O87A 1OYJA 3QMXA 4DSSA 1SK1A 2H19A 2J23A 4NV2A 3VI7A 1XVQA 5IMCA 1R4WA 1ZCPA 2I1UA 4EVMA 3TJFA 3DYRA 2AB6A 3G9BA 1ZL9A 2VM2A 3TDGA 1HNAA 4Q5NA 1E2YA 4K2DA 5INYA 4G9HA 4IJ3A 1XZOA 1MD4A 3HA9A 2L5LA 2CQ9A 2REMA 2K6VA 4OMVA 4J2FA 1RK4A 3V1WA 3HVXA 4TVEA 2V6KA 4ECJA 2VL3A 5B8BA 3OR5A 3K8NA 1A0RP 2GT5A 2MBTA 4E8HA 3E3EA 5IPHA 2LNTA 2K8VA 5CYYA 2B7JA 4IVFA 3UVHA 3ZFLA 2VLTA 4ZBDA 4F0BA 3IAM2 4J56E 4TOPA 2DSAA 2FCHA 4EDZA 4ZBAA 3D5JA 1GSQA 3GRXA 2L6DA 3A3TA 4L0UA 1ZYEA 3Q18A 3FR6A 4YH2A 5ECHB 2R6KA 5JCWA 1R5PA 3HVVA 1HD2A 2E7PA 2FWGA 1TXXA 3BOAA 1K0DA 2IFQA 6GSTA 4BWQA 4MZCA 2CA8A 2EIOA 4NHZA 2BTOT 1RW1A 12GSA 4POLA 4EL1A 3F6FA 4WEYA 5DQSA 2DJ2A 4XCSA 4NMUA 2L59A 1FAAA 4PNGA 4OFTA 5KN2A 5AIVA 3P8WA 3APOA 2X8HA 1WMJA 2PPTA 2HYXA 4G10A 1VRSD 4IN0A 3JCML 1AXDA 1F9MA 2QC7A 1A24A 4OFMA 5H5RA 1DE2A 3L4NA 4ID0A 3EU3A 4XS4A 2DC5A 5CRDA 5J9CA 4HS1A 4XIHA 4MJEA 1PKZA 2EC4A 3H4KA 3IA1A 2CVKA 1XWAA 3RPNA 3TRXA 2ALBA 3TOTA 1M99A 3F3QA 2LEGA 3QDNA 2TRXA 1PX6A 2CVBA 5IMZA 22GSA 1SK0A 5ECOB 3VWXA 1SK2A 1R7HA 2GZZA 4GF0A 2PMTA 2PU9C 4OCEA 1O8XA 2YP6A 2FLSA 2CZ2A 3C73A 2MBSA 2KP1A 5ECSA 4F9ZA 2NVLA 5B8AA 2H1GA 3ZRDA 3TJJA 1G6YA 4LA1A 2AJQB 4G2EA 2I4AA 1T8EB 2LUSA 4OFNA 3J7Yb 3US3A 1A0FA 2H74A 3HD5A 3KGKA 4EE0A 4JR6A 3GA4A 2H6XA 2P5QA 3AY8A 1B9XC 1LJRA 2AUVA 1HQOA 1Y6EA 4KDUA 3UL3A 2KP2A 1BX9A 5ID2B 2O89A 3O6TA 5HR0A 3HDCA 2C3TA 2C3NA 2LV3A 1EOGA 5CAXA 5C00A 2VL2A 4XS6A 3PR8A 5D96A 3VURA 1PN9A 10GSA 1XIYA 1Q98A 4FYUA 3VLNA 4MA9A 2DLXA 1ZYQB 2DIYA 3E0UA 3KP9A 2VCWA 2DJ3A 5CNWA 1GUHA 4ML6A 5LD0A 14GSA 1LU4A 4N0ZA 3C7MA 3GL5A 2LRNA 5DVBA 1B4QA 1GSFA 6GSUA 1LBKA 1MDKA 4LL4B 4GCIA 4ILFA 4L5LA 4Q5FA 1ON4A 2JL4A 2GZPA 2WS2A 5J4UA 4EDYA 2GTUA 4E8EA 4HI7A 2YANA 4Q5RA 3ZFBA 1SYXA 2H75A 1OVNA 3IRAA 1PRXA 2H66A 3KMNA 1PKWA 3FZ4A 5GAPD 1NM3A 1M7TA 2CVDA 2GVPA 2V32A 2B1LA 3I9V2 3QAVA 5A4VA 5IQYA 4XS1A 2KLXA 2JADA 3FR9A 2A4VA 4HU7A 1KTEA 1XWCA 4O32A 4AF2A 1JFUA 2XPEA 2NDOA 2HZFA 1SD9A 1RQMA 1TI3A 3WGEA 2L6CA 4TXOA 2P0GA 2NTOA 3C1SA 1GSYA 2LS5A 3CBUA 2OBKA 1B9YC 1M9AA 4MDCA 4KGIA 2DMLA 3C71A 3RHCA 1AUCA 5JCGA 1J08A 2HSYA 2VLUA 2CX4A 4K7OA 1UC7A 3TRQA 1JZOA 5F8BA 2G0FA 1U87A 1TTZA 5D8IA 4KH7A 1C72A 4GLTA 5HR1A 1B48A 5J3RA 4PURA 4CHSA 4DSQA 3ZMKA 4ECBA 3TRPA 5DALB 3F8UA 2JSYA 5JCUA 2JU5A 4V1Ag 5CREA 5IOWA 5JWRB 3EWLA 3WT1A 3M3MA 3LFLA 4MF7A 3GKNA 5D73A 3M9JA 1XOBA 2O8VB 4TN8A 2Z9SA 2YNXA 3HXSA 4IP1A 3FRCA 1XW6A 3SWLA 4GWRA 1MEKA 3L9SA 3CXGA 3ZIVA 5CP1A 2H1AA 4I6XA 1HYUA 1XOAA 2M80A 2X8CA 1M2DA 3D4TA 1AQXA 1KNGA 4TR3A 2L57A 2LNSA 3GSTA 1HNCA 2P31A 2C1YA 3F9UA 3F63A 3KXOA 1QXHA 3VI5A 4LMVA 3RAZA 5LCZA 1X5DA 5L71A 3MSZA 5FWGA 2YJHA 4WXTA 5H5SA 1TI1A 5E4WA 4POMA 5FHIA 1X9SB 1SD8A 2QSIA 4TR0A 2PWJA 2XBIA 4AJ8A 1TK8B 4MLYA 5GAND 2OE3A 1Z7RA 3ZL5A 3QFAC 4JZQA 4K6XA 4MPFA 1G0TA 3HJOA 3TKSE 6GSVA 2K9FA 3LEFA 2HT9A 4JBBA 4KDYA 2WZ9A 4EUYA 1O81A 2BJXA 4K7NA 2IMKA 4OO4A 3ZMLA 1QMVA 1GLQA 3LYKA 1SJIA 1TU7A 4K0NA 5G5FA 4JEDA 4K8MA 4PX1A 3IOSA 4WR5A 5EPFA 1GL8A 4HZ2A 3ME7A 3IDVA 3HHVA 4ML1A 3M9KA 4IKHA 5ECKB 2F3MA 4KSMA 5ID2A 1Z3EA 1FB0A 4TXVA 1X5CA 4IS0A 4GSTA 2L4QA 3TCOA 3VWVA 3TJKA 3EVIA 4TR4A 5IMFA 4MP4A 1BEDA 1GWCA 3PGTA 4RQRA 3IR4A 3VWUA 4MH3A 3DVWA 3GURA 2WFCA 3FKFA 3CRTA 1EP8A 3D4MA 1JLWA 1F3BA 1TOFA 2VAFA 3LGCA 5F06A 2C3QA 5G30A 2NBSA 1XW5A 3FK8A 4WKWA 3FZ5A 16GSA 4H86A 3F3RA 2MMOA 2CX3A 3UMAA 5HFGA 3EMPA 2FGXA 1PA3A 2FNOA 3Q74A 5KN3A 2EIRA 4N30A 4I2TA 4ZIJA 4V2NA 4TR1B 2A2RA 3GKXA 4KDXA 3H1NA 3ERGA 4ZL7A 1GSSA 3O3TA 2CV4A 2R3XA 3A5WA 1V98A 4KCAA 3DKSA 1ERWA 3TKSC 1UA5A 2TRCP 1U3AA 4O5RA 1Y25A 2CT6A 5JWQB 2F8AA 2GQLA 3ERWA 5G5EA 2R5GA 1XW9A 2FWFA 1U3IA 3EE2A 1EV9A 2QGVA 1DSBA 1MD3A 1YF0A 2N5BA 2DJ0A 2YZHA 3WD6A 2PGTA 4ZBBA 3BJ5A 4IHUA 2MMAA 1WOUA 1XPVA 3KP8A 1FVKA 1GTBA 2JSZA 5A4UA 1FVJA 1YEPA 3A2XA 3LG6A 3E9JB 5EL8A 5IM9A 2AYTA 3IXRA 1M2AA 1YZXA 2YPMA 5DALA 3PINA 6GSSA 3GYKA 1SL0B 5IMVA 3EINA 1FOVA 2LKUA 9GSSA 4ZL9A 3H8QA 3H93A 2HFDA 4GSNA 4GQFA 2B7KA 1O7UA 1K0MA 3GTUB 1PMTA 1PL1A 4HQZA 5COHA 1EEMA 4HJ2A 4JR4A 4KCEA 2GQKA 3KZQA 3KIJA 2M72A 3G7YA 5IMAA 5HFKA 1V57A 2OJLA 3F0IA 4I97A 4KAEA 3ZITA 2H73A 2XBQA 4BVXA 3F4SA 2CAQA 2L4CA 1JZDA 5CRWA 3KH9A 3LSZA 5H5QA 5GSSA 5G1KA 2LJRA 2H6YA 1ML6A 3I69A 5A4WA 2EIQA 4X43A 3DMLA 3LJRA 3FHKA 2VL2C 3IC4A 2FWEA 1XVWA 2WGRA 3GL3A 3GHAA 1TP9A 5DBQA 5D9WA 2IPAA 1QGVA 3D22A 1CQGA 4WR4A 1EGOA 7GSSA 3TOUA 4HZ4A 1GNWA 3F4TA 2IN3A 1H4OA 2C8UA 3EU4A 2MYGA 2H0GA 5HFIA 3LXTA 1FO5A 4CDOA 1B8XA 4HDEA 2RIIA 2PUKC 1A2LA 5LNKe 5F0GA 5GZZB 4FIWA 2PVOC 3VFIA 4IGJA 1GH2A 3GN3A 4NPBA 3LYPA 2FWHA 3HZ4A 4GTUA 1BAYA 5JWOB 3SBCA 3MAKA 4MF5A 19GSA 2CZ3A 1T7PB 1YDKA 2LQQA 1JLVA 1G7EA 1O6JA 1V9WA 2AV4A 4LMWA 1YF1A 4TW5A 4KX4A 3IE3A 3QR6A 2DJJA 3GKMA 2VIMA 4QL9A 1IYHA 2V41A 2VM1A 2RLIA 1EEJA 2ZUPA 1QK8A 4BVYA 4DSSB 3UVTA 4IELA 1EGRA 2C80A 2F51A 1NHOA 3RPPA 1GSUA 4PXOA 2VCZA 4RUVA 1X5EA 2E2MA 2ES7A 4POBA 3IAS2 5IIZA 5IPGA 4NV5A 4DSRA 1F37A 1HNBA 1GSEA 3ERFA 3KJYA 5ABRA 2OACA 4RI6A 1GUKA 3N5OA 4K0GA 4XTSA 2O85A 4HEA2 1XWKA 2FHEA 2N5FA 1K3OA 3TB2A 3CTFA 3L0HA 2HNLA 1H75A 4K9ZA 2D2ZA 1GTAA 2QKEA 11GSA 6GSYA 3QPMA 1VF3A 4YAPA 2H6ZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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