1JZO | Genus

Total Genus 67

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	67
sequence length	215
structure length	215
Chain Sequence	DDAAIQQTLAKMGIKSSDIQPAPVAGMKTVLTNSGVLYITDDGKHIIQGPMYDVSGTAPVNVTNKMLLKQLNALEKEMIVYKAPQEKHVITVFTDITCGYSHKLHEQMADYNALGITVRYLAFPRQGLDSDAEKEMKAIWCAKDKNKAFDDVMAGKSVAPASCDVDIADHYALGVQLGVSGTPAVVLSNGTLVPGYQPPKEMKEFLDEHQKMTSG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Escherichia coli
publication title	The Disulfide Bond Isomerase DsbC is Activated by an Immunoglobulin-fold Thiol Oxidoreductase: Crystal Structure of the DsbC-DsbDalpha complex. pubmed doi rcsb
molecule keywords	THIOL:DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN DSBC
total genus	67
structure length	215
sequence length	215
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2001-09-17

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF10411	DsbC_N	Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A	PF13098	Thioredoxin_2	Thioredoxin-like domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.450.70	Alpha Beta	Roll	Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,	Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal	1jzoA01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1jzoA02

4AGSA 1X0RA 3APQA 1YDKA 3PGTA 6GSUA 2ZUPA 5DQSA 3UVTA 1RQMA 2EIQA 3C8EA 3ERGA 4LMWA 1SKWB 1NHYA 3D22A 2OBIA 5F0GA 2J23A 2NBSA 2R4VA 3APSA 1U88A 4ZBDA 2HE3A 4HQSA 1K3LA 1ST9A 3A2WA 2WJUA 5HFGA 1GTIA 1XZOA 4PUAA 4DSSA 1SL0B 1GSQA 1TKDB 4HU9A 5DBQA 2HXKA 3P7XA 1FW1A 1O73A 2CAIA 2FGXA 1HNAA 3ZFLA 5A5KA 5AISA 5ECMB 3NOFA 2PBJA 4Q5NA 3W8JA 5INYA 5IMVA 2G2QA 1MDIA 3S9FA 3QR6A 4GXZA 3UL3A 1PX7A 1TU8A 2GT5A 3L9UA 2WS2A 3TJJA 4ID0A 1KTEA 2H19A 1QMVA 2WRTA 2FNOA 1WE0A 3FRCA 5CREA 1FOVA 5CRWA 3ZIVA 2XBIA 4BVXA 3PINA 2H0GA 1AC1A 3UBLA 2PWJA 1VRSD 3GNJA 3HHVA 2I1UA 6GSXA 1Z7RA 2D2ZA 2NPBA 3DWVA 3EURA 4F9ZA 1MD3A 5AIVA 2VLTA 5G30A 3H79A 3IE3A 3C71A 2XBQA 4J2FA 2TRCP 5J9BA 4EF0A 4YAVA 3ERFA 4ECIA 3KIJA 1XOAA 5FT3A 2C0DA 3ED3A 3UAPA 2GVPA 1BEDA 4Z7XA 4JU5A 4ILFA 2A4VA 2IL3A 1F3AA 2GZYA 5J41A 8GSSA 3TDGA 1XWGA 4V2MA 1V57A 4HUAA 3DVXA 5KN3A 1YJ6A 4L0UA 4F03A 1EOGA 2LRTA 3FZ9A 2DMMA 1SL2B 2MMNA 4QL7A 3TKSC 2O7KA 1JLVA 1QXHA 1Q98A 2LTKA 5GAPD 5AGYA 1DE2A 4XS4B 3DKSA 4IQAA 1M7TA 3RHCA 1SYXA 2IPAA 2H1BA 2H6XA 5D9VA 4HEA2 2VO4A 1JLWA 3IPZA 2PPTA 3TUEA 2PVQA 5ECKB 2L57A 4MDCA 3ZTLA 1XFLA 2DJJA 4PNFA 3G7JA 2CZ3A 4BL7A 4I97A 4XS6A 2TRXA 2IY2A 4WBJA 2O8VB 1S3DA 2IMDA 3SBCA 1B8XA 3CXGA 1K0AA 3MDKA 1MEKA 4Q5QA 2H0IA 2K9FA 1GSSA 6GSWA 4KNDA 1FG4A 4ECCA 1T3BA 2FHEA 3ISOA 4GTUA 2VCVA 3KCMA 4L5OA 1B4QA 4GSNA 3C7MA 1NSWA 4K7OA 3CRTA 3EINA 1GWCA 1VF2A 1OC3A 1XW5A 1ZYQB 4EUYA 1BJXA 2BJXA 1YF1A 5ECSA 3WGDA 1ERVA 5A4WA 5JCWA 1M2AA 4OFTA 2QKEA 3ME7A 2HLSA 1B9YC 1UA5A 4IP6A 3BD2A 4ULXA 2E7PA 1XVWA 4ZILA 2X8GA 3O6TA 3KMOA 4KDUA 5C04A 1T4ZA 3CRUA 1W4VA 5CRGA 4NXIA 1BYEA 4Q5RA 2WCIA 4IKHA 3G7YA 1I9DA 5ECOB 3LXTA 2QSIA 2H71A 3EWLA 1ZCPA 5ECHB 4F2IA 4MZBA 1EGOA 1XCCA 3CSJA 2PVOC 22GSA 1URMA 1SK0A 3KZQA 4L0WA 5HR2A 3EMPA 3CBUA 3M3MA 3QPMA 4JE1A 5AN1A 3APOA 2VIMA 4JRRA 1TRWA 1JZRA 3HKRA 1YKAA 3UBKA 4DVCA 1B9XC 2O87A 3EU3A 1LBKA 5LNKe 3L9SA 2CZ2A 3TJGA 2VL3A 4F0BA 1T4YA 4IGJA 5HFIA 3WD6A 3FYGA 3G7IA 5IOXA 4IP1A 1IYIA 4K7IA 4OCFA 3RPNA 4EE0A 4GCIA 2LJAA 3L78A 4NV2A 1OVNA 4MZCA 3C73A 2C3NA 4X0XA 4BVYA 2VL2C 2R2JA 3F0IA 3RAZA 4MK3A 4NV5A 4AJ8A 3AY8A 2YCDA 1GUKA 1UN2A 3DD3A 1MDKA 2H1GA 1TRUA 5ECRB 3N9JA 2N5AA 2R37A 4EVMA 1JZDA 1GTUA 4IBPA 1Z7PA 4L5LA 4OMVA 3P2AA 2YJHA 4RI6A 2JL4A 3I69A 2K8VA 1UVZA 3GMFA 2C0FA 5E59A 3O76A 4IJ3A 3TGZA 3HJPA 4WBRD 4DEJA 1OAZA 2WZ9A 1ABAA 3EE2A 4CHSA 5DALB 1PSQA 4YH2A 3LJRA 2FLSA 1XW6A 2HRNA 3VFIA 2OJLA 2H70A 4V1Ap 1TK5B 2H0HA 4MH3A 1F3BA 3FZ5A 3Q74A 4BWQA 3I6AA 5F8BA 2GTUA 3HA9A 1PRXA 4FIWA 4OFMA 1SK1A 1XWCA 4JR4A 5FWGA 2VCWA 4GSTA 3QAGA 1NHOA 4BPYA 4HS1A 1TP9A 1DBYA 4PGTA 2F8AA 3OR5A 2CAQA 3HVXA 1R5PA 3UOMA 3RPPA 3ZIJA 1TK8B 2P5QA 4FH8A 2H72A 1CQHA 3KEBA 3LXZA 3H93A 3MSZA 2IMKA 3A2VA 3P8WA 2WULA 3Q19A 4GWRA 5GSSA 3KMNA 3GSTA 2GSTA 5LCZA 2HT9A 4KH7A 4IHUA 5ELGA 2A2SA 1EGRA 1HD2A 2RM6A 3DMLA 4MH2A 5G5EA 2H73A 1OC8A 3VURA 4HZ4A 3IHQA 2I9HA 4WF4A 1T1VA 2CX4A 2MYGA 3L4NA 5G1KA 2RIIA 1EV9A 1RK4A 4G10A 1CQGA 2CT6A 2IMEA 2CA8A 2B6MA 2WDUA 3IA1A 4OO5A 3ZL5A 1H75A 4KGIA 1SK2A 5KN0A 5AIXA 1QUWA 5D73A 1U87A 1K0CA 4YAPA 5IOWA 4EKZA 1OC9B 1EOHA 2GT6A 3A5WA 1XW9A 2CV4A 3FW2A 2YWMA 2OADA 2RUEA 1K0NA 4E8HA 4O92A 4NHZA 4J56E 3J7Yk 2LRNA 3TRXA 1A0FA 3EYTA 3KH7A 1B4PA 2C80A 5ECIB 4ZXGA 3GX0A 1F37A 2N5BA 4ZL7A 3FR6A 1EEMA 5J9CA 4HDEA 3FZ4A 4POLA 1ON4A 2JACA 1OE7A 2EIRA 1ILOA 2K6VA 2IIYA 1OYJA 1JZWA 5DJLA 5CO3A 4TN8A 1PGTA 3UARA 4FO5A 5ECQB 2KP1A 3KTBA 1E2YA 4OFNA 2X8HA 5D8IA 1VF3A 1F6MC 4OO4A 2H76A 1TXXA 1A0RP 3HYPA 1FAAA 2X99A 4GSSA 5IMDA 1WRYA 4KB3A 1J0FA 1F2EA 2LNTA 2GSRA 2IJYA 2IYJA 2VCTA 2IFQA 4PNGA 3UVHA 2HSHA 1A23A 4EO3A 3FHKA 1X9WB 2VCZA 1XWAA 3DGQA 1N8JA 2YP6A 4XCSA 4FYCA 5B6NA 1A2MA 1DSBA 3RDWA 1TDIA 1YF0A 1F9MA 2OE1A 5D96A 2LRCA 1PX6A 3FR3A 2YZHA 3I9V2 4N0ZA 2E0QA 4Q5FA 5G31A 1GTBA 2EIOA 1XVQA 3KP9A 2OA7A 1OE8A 1SENA 3DYRA 2VLVA 4GQFA 1EP7A 2LUSA 16GSA 3E3EA 4KDYA 2LEGA 4KX4A 1QK8A 1BG5A 1TJDA 1SKRB 1NM3A 4DSQA 4MF5A 3J7Yb 2JSZA 3GTUA 5IMZA 3L9VA 3ZREA 4YQMA 1FB6A 3VPQA 1WJKA 4TW5A 1WPIA 4TXOA 4D73B 3IAS2 4MLYA 4RQRA 5ID2B 3ZITA 1V58A 1YEXA 4ZL9A 4KW6A 1J9BA 6GSYA 2L4CA 3UIWA 3ZFBA 2RLIA 1QGVA 1ML6A 5JWOB 4ML6A 4K9ZA 1GUMA 2VD1A 4IS0A 5H5RA 1AW9A 2LQOA 2V6KA 2VM2A 4NAXA 5JCUA 3VI7A 3MWHA 1XBSA 2YJ7A 2L6DA 2B5XA 1VF1A 3FK8A 2GDRA 4TXVA 1E6BA 4KUNA 5DDLA 2VL9A 4LMVA 4ML1A 3L0HA 2E2GA 2DJ2A 5IO2A 2C0EA 1QFNA 4AF2A 2QGVA 4L8EA 4V1Ag 4KE3A 1TOFA 3TKSA 3A3TA 2DJ0A 2ZNMA 4ZBAA 2VM1A 1FHEA 5DAKB 5A4VA 5A4UA 2XPEA 3W6GA 2HZEB 4LL1B 3VWVA 1KNGA 3WT2A 1HNBA 3LYPA 5EL8A 1FVKA 2FUG2 1T7PB 2C3TA 1O7UA 2FWEA 4K6XA 3V1WA 5ENUA 3CTGA 2YV9A 2ALBA 1AXDA 5CRDA 4CW9A 3QAWA 2KOKA 2H66A 4TR0A 1UC7A 1ERUA 2J9HA 3QFBC 1TW9A 1OKTA 3CSHA 4WXTA 3F3QA 5ECPB 3ZVJD 2C3QA 2V2GA 2NDOA 2K18A 3FZAA 4NMUA 4N30A 1PKWA 1SYRA 1Z9HA 4LLRA 2YWOA 1JHBA 1A8YA 3TRPA 2L5LA 4PXOA 4X43A 3ZMKA 3QDNA 5CRHA 4DSSB 1EWXA 2WGRA 4P3YB 2O85A 2H1DA 3WGXA 5F07A 5F05A 2H6YA 5LD0A 2LNSA 4WKWA 5DCHA 4PQ1A 3W8SA 4GRFA 4LL4B 2F51A 1ZOFA 2GSSA 3VPTA 1DE1A 4JEDA 3ZLPA 2DJ1A 2DLXA 1Z6NA 1XWBA 5D9XA 2AYTA 1XOBA 3A2XA 4KCEA 4AJ7A 5CP1A 1KEBA 2OE3A 1X5EA 4V2LA 3ZRDA 3IC4A 1X9MB 4X1UA 2XC2A 3I43A 1M9BA 3DIEA 1W89A 5D93A 4V2NA 1SD9A 4TVEA 3US3A 1Z6MA 2M72A 2PUKC 2C8UA 3F6DA 4PQIA 4AJ6A 2DJ3A 4OCEA 2X64A 5IPHA 3DVWA 1K3OA 5B6MA 3LSZA 4WR4A 4KSMA 4TR1B 4BA7A 2H01A 3MAKA 3VWWA 3IRAA 3KGKA 1GULA 5DCGA 2BMXA 3HDCA 2OACA 1AUCA 2B5YA 4I8BA 4POMA 4PQHA 4G2EA 3KXOA 1WP0A 2RUFA 3C1SA 4ZB9A 1G6WA 1A8LA 2HRFA 4MJEA 1V2AA 1ERWA 1WOUA 4MCUA 4KCAA 4ECJA 3GX8A 3KM6A 3EC3A 1M2DA 2VL2A 1O8WA 4IQ1A 2I81A 1XPVA 2C1YA 1R7HA 5B8BA 2TIRA 5ID2A 1XIYA 4MF6A 4XS4A 2GQMA 1Q4JA 2REMA 5D9WA 3UEMA 3CTFA 5E4WA 3EMXA 4F0CA 2PMTA 4PX1A 4WETA 4ZB6A 2WB9A 4NWYA 1GTAA 5JCGA 3FEUA 2YN1A 3N5OA 2IN3A 2NTOA 4KA0A 2JZRA 2L6CA 3LWAA 4K7NA 4EL1A 1TU7A 4DSRA 1U6TA 3TCOA 1OKDA 1TI1A 1GNEA 2NVLA 1ERTA 1HNCA 2XHFA 1S3CA 3GFKA 4MZWA 2LQQA 1THXA 3BJ5A 3HY2A 2GS3A 3GKXA 3GIXA 2FWHA 4PUFC 2HZEA 4HQZA 1EEJA 3CMIA 3IK7A 3GL5A 4CDOA 1GSUA 1KBNA 2FCHA 4HJMA 3H8QA 4F82A 1JZOA 3O3TA 1FO5A 3R2QA 4MJAA 2FA8A 5IMFA 5JWRB 5HR3A 2CQ9A 2HZFA 2MBTA 3F4SA 1USBA 2DBCA 3P90A 1WMJA 3IBHA 1NW2A 1MD4A 5IO0A 1G0TA 2I3YA 3PH9A 4I2TA 3JCML 3GURA 3ZMLA 1XXUA 2JU5A 3TJKA 3TOUA 2ES7A 3G9BA 2F9SA 4K8MA 5CYYA 3FR9A 2V1MA 4HU7A 1XWKA 2V32A 5COHA 1TI3A 5GAND 5HQPA 2LJRA 3M9KA 4TR4A 1HYUA 5HR0A 2YZUA 2GSQA 2JZSA 5J4UA 11GSA 4JZQA 1X9SB 1Z5YE 4RI7A 5IMCA 1EP8A 1R4WA 2VAFA 4XTSA 2YWIA 2JZTA 1LJRA 3BBYA 3TKPA 1SJZA 3QCPA 1ZMAA 2JSYA 1PN9A 1X5CA 4MPFA 3LGCA 1BX9A 5KEJA 2LSTA 2DIYA 3U5RE 1PKZA 3LFLA 5ELAA 3HJOA 1K0MA 2DIZA 4BWSA 1SJ6A 5KN2A 1VGLA 2OKAA 1SJIA 4QQ7A 4OD7A 2IMIA 1AQVA 2R5GA 1A2JA 2AB6A 2LJKA 1I5GA 3GYKA 5B8AA 1Y6EA 3BOAA 2PU9C 2PN8A 3HJMA 1Y25A 1M0UA 2LV3A 1C72A 1QQ2A 5F06A 3NZNA 4LA1A 5EY6A 2E2MA 3E9JB 1YZXA 4TR1A 3IAM2 2JADA 4ACSA 3HZ4A 20GSA 3GA4A 3EU4A 1R5AA 2O89A 2CX3A 5J5NA 2X8CA 2M46A 3MNGA 4G9HA 3K8NA 4YQVA 2GGTA 3TB2A 2OBKA 1SU9A 4MABA 4IVFA 3NIVA 2H1AA 4WEYA 2MMOA 2H75A 4RUVA 2P5RA 3D5JA 5DALA 1VF4A 4N0VA 4J57E 2VCQA 5HR1A 2AHEA 4EDYA 1TK0B 1GUHA 3TRQA 4G19A 3TJBA 2G0FA 1T8EB 4JR6A 3PR8A 3D6IA 3SWLA 1FVJA 4HI7A 1YEPA 2FA4A 3Q18A 3LYKA 4I2UA 3GV1A 1GSEA 3IR4A 2HI7A 4MP4A 4N11A 2DC5A 3RBTA 1GP1A 1THOA 4IW9A 3F4TA 4OWYA 2QC7A 2AJQB 1SD8A 1TTZA 2GZPA 1T00A 12GSA 1EZKA 2FD3A 2L4QA 2HSYA 4FYUA 7GSSA 4GF0A 1BAYA 5G1LA 1GLQA 3ME8A 5JWQB 1PD21 2YWNA 1PMTA 2N5FA 4K1FA 2B7KA 3M1GA 3F6FA 1MDJA 5G5FA 3UJ1A 3KD0A 4TKYA 3HXSA 4KDXA 3QOUA 1K0OA 2YOIA 2LS5A 3ZYWA 2ON5A 5B7CA 1MTCA 3WGEA 3LORA 1BQ7A 1M99A 5CNWA 1M2BA 2VLUA 4MPGA 4EC0A 2H74A 4O7HA 1H4OA 2VCXA 3TKQA 4NPBA 3DXBA 1AAZA 3GH6A 1PA3A 4HJ2A 1YQ1A 4I5QA 2VOCA 3DRNA 3VK9A 4MJCA 1OC9A 3M8NA 4ECBA 3HVVA 4O5RA 4XRAA 2M80A 3QAVA 3GKKA 1V40A 2PERA 4FYBA 1G6YA 4YQUA 2I4AA 1S3AA 2C0GA 3HD5A 1WIKA 9GSSA 3GUSA 1R26A 3F4RA 3HZ8A 2H6ZA 3QFAC 4KSOA 2YANA 5HFKA 5EVOA 3KTLA 1G7EA 2AV4A 1HQOA 1K0BA 2KHPA 4E8EA 3TJFA 3U6VA 1TRVA 4K2DA 1K3YA 2HFDA 4K0GA 5ABRA 1LU4A 4WF5A 14GSA 3IOSA 4XRDA 3ERWA 4WR5A 1GRXA 2CVKA 4ZB8A 1GSYA 1V9WA 2KP2A 1A2LA 2L5OA 2MZCA 1IYHA 1B48A 5GZZB 4ZL8A 2H30A 3QD9A 4RQXA 3FY7A 3RHBA 5IQYA 4O32A 2YPMA 2K8SA 1SKSB 4NHWA 1AQXA 3M0FA 1AIUA 1GSFA 4MMMA 2BTOT 4POBA 3GKNA 5KN1A 2AUVA 5DJMA 3H4KA 3VLNA 2GZZA 1GH2A 4TR3A 3WT1A 3E0UA 5GSTA 4EDZA 4XIHA 3QMXA 2R3XA 2FWFA 2CVBA 1DUGA 4IJIA 2B1KA 6GSSA 2B5EA 3HVSA 2V41A 1K0DA 3TOTA 3GSSA 1Z3EA 5ECLB 5IIZA 3F9UA 2IFQB 4XHMA 3ZZXA 5CAXA 5EPFA 2GQKA 2ON7A 2GLRA 2HNLA 2WFCA 3BCIA 3M9JA 4N10A 3IXRA 1U3AA 2IWTA 4H86A 3C1RA 1J08A 1SL1B 4ISDA 2A2RA 2L59A 2AAWA 2B3SA 3VWUA 19GSA 1PQNA 1GSDA 2FY6A 3KP8A 3WYWA 2DJKA 10GSA 1O85A 3TKRA 4EXJA 3Q6OA 2F3MA 2B7JA 5H5QA 1GL8A 3VI5A 1ZZYA 2R6KA 18GSA 2C4JA 2P0GA 2PGTA 5G2ZA 2DSAA 2YV7A 1TRSA 2V6OA 3LG6A 2P31A 4D73A 3KH9A 2F8FA 4IN0A 4JBBA 2KLXA 3GTUB 1V98A 1YY7A 3IDVA 1PL1A 5IPGA 2YNXA 1WWJA 5FHIA 3GRXA 4TOPA 3IV4A 5IM9A 4ZBBA 2OE0A 4TXOB 1O81A 3CYNA 13GSA 1ACVA 1ZYEA 3GH9A 3F63A 3F3RA 3GL3A 3GHAA 3FKFA 1X5DA 2FWGA 3ZVJA 1GNWA 2CVDA 4GLTA 2ZCTA 1ZGNA 4PURA 4QL9A 3CSIA 3F8UA 4K0NA 2DMLA 5IMAA 2MMZA 4I6XA 3KJYA 3UMAA 1RW1A 5ECNB 4ZIJA 2MMAA 5L71A 1GLPA 2KUCA 3DEXA 5DAKA 5DQYA 17GSA 2GQLA 1JFUA 2RM5A 1N2AA 3D4MA 5J3RA 3TKSE 2IMFA 3D0ZA 2LKUA 3LEFA 2VUPA 3IK9A 2VD0A 4MJBA 3VWXA 6GSVA 1G7OA 3D21A 1O8XA 3LQ7A 2MBSA 1ZL9A 2EC4A 1O6JA 2B1LA 4XS1A 4KAEA 3EVIA 1AQWA 4GQCA 2XPDA 1U3IA 4IELA 5DVBA 5D9TA 4HZ2A 1YKCA 3D4TA 2HYXA 5H5SA 4HOJA 3GN3A 2Z9SA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1JZOA

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations