1T3BA

X-ray structure of dsbc from haemophilus influenzae
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
DAAIKRKLQSFNISNIVIKSSPISGIKTAVTDQGILYVSEDGKYLFEGKLYELTNNGPVDVAGKILVDKLNSYKDEMIVYPAKNEKHVVTVFMDITCHYCHLLHQQLKEYNDLGITVRYLAFPRAGMNNQTAKQMEAIWTAKDPVFALNEAEKGNLPKEVKTPNIVKKHYELGIQFGVRGTPSIVTSTGELIGGYLKPADLLRALEETA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Haemophilus influenzae
publication title Structure of DsbC from Haemophilus influenzae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbC
total genus 53
structure length 209
sequence length 209
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2004-04-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 1t3bA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1t3bA02
1RK4A 2PU9C 5ID2B 1GSSA 3TJBA 1KTEA 4KGIA 2AB6A 1PD21 4NAXA 1JLWA 3M9JA 1T4ZA 4OO5A 4PQIA 4GWRA 4O7HA 5JCGA 1EOHA 3L4NA 1OYJA 1GSFA 3RDWA 3MWHA 4P3YB 2DMMA 2HFDA 1PA3A 1PL1A 2GT5A 4MA9A 4QL7A 5IMFA 4EKZA 4RUVA 1IYIA 1WOUA 2BTOT 5GAND 5FHIA 5CNWA 3IBHA 5DBQA 4EC0A 2ZNMA 3FR9A 1O81A 4E8EA 3ZVJA 2K9FA 2XC2A 3D21A 3UVHA 2AV4A 1ZZYA 2L4QA 1MTCA 3Q19A 2LV3A 3DGQA 2WULA 1OE8A 1R5AA 2YWNA 1XZOA 1GTIA 1OKDA 1HNBA 3L9VA 4AF2A 3APSA 1HYUA 2PUKC 2GLRA 2AJQB 4BWSA 5C00A 1K0MA 4F0BA 1T00A 2AHEA 1R5PA 3KJYA 4MJEA 5ECQB 2H1AA 1VF3A 4G10A 5J5NA 3IAS2 2HT9A 5D9WA 3J7Yb 1AXDA 4LLRA 2X8GA 6GSVA 1XW9A 4I6XA 3CSIA 3GMFA 3QOUA 5CRGA 4MLYA 5IMDA 4MP4A 3HVSA 3HDCA 1YKCA 3UEMA 2FWEA 5D73A 3F6DA 4N30A 5IMCA 3DXBA 5EY6A 1PMTA 3E3EA 2Z9SA 4JZQA 3KP8A 3F8UA 3TOUA 4MK3A 3CXGA 1A2JA 3LORA 4I5QA 3UBKA 1SKSB 3FKFA 5B6MA 1GSDA 5ID2A 1JFUA 3OR5A 4KB3A 4L0UA 2H1DA 1TP9A 3GUSA 4ZBDA 1X9MB 5HR3A 1M2DA 3HJOA 3H1NA 1T4YA 3KXOA 5D96A 2H72A 3TJGA 5A5KA 3ISOA 3DVWA 2K6VA 3ZMKA 4PUAA 3ZITA 1OVNA 1K0NA 2F8AA 2L6CA 3Q74A 2IMEA 2VAFA 4MF5A 2B6MA 2HRFA 1ERTA 5JCWA 3TJKA 2LRNA 4L8EA 3I43A 4ACSA 1AQVA 4GF0A 4LL4B 5DDLA 1GUKA 3TKSC 1BEDA 1AQXA 1F6MC 4X0XA 2JADA 1PGTA 2LJKA 3M3MA 1T7PB 2TIRA 4K0GA 4NWYA 4TRXA 3KIJA 3V1WA 1SL2B 1WPIA 2FD3A 2F51A 2L6DA 3C8EA 4XRAA 4O32A 4WBRD 6GSXA 5AIVA 3TJJA 3QMXA 1JZRA 1Z5YE 1AQWA 4OMVA 2E7PA 3H79A 1J08A 3D22A 5B8BA 2EIRA 3QPMA 2YWOA 5CRWA 3TKQA 4ML6A 2AUVA 3DEXA 4ZBBA 3UARA 1DE1A 5CREA 4X1UA 2K8VA 4HDEA 2PGTA 4MH2A 1Z9HA 3O76A 4TR1B 3LXTA 4WKWA 5ECPB 1T1VA 1ACVA 1SKWB 1K0OA 2LJRA 4I2TA 1EP7A 4K2DA 3I9V2 1THXA 1X9WB 5ECHB 4BPYA 4XS1A 3P90A 2I9HA 4I8BA 5AN1A 5JWRB 2XPEA 2GGTA 3RAZA 3VFIA 5LD0A 1EP8A 4K0NA 5KN2A 4IP6A 1MD4A 4F2IA 3WT2A 2J9HA 3LGCA 5DCHA 2IN3A 3N9JA 4FIWA 1GTAA 4POBA 2P31A 3P8WA 3ZTLA 3ZIVA 3M9KA 4POLA 2RUEA 3EYTA 3C1SA 3ZYWA 1T3BA 2VUPA 3GH6A 1XFLA 2AYTA 4NMUA 5F06A 3GKMA 3D0ZA 4L5OA 2NTOA 5ELAA 4IQAA 2MZCA 1FB6A 2B1KA 3IK7A 3WYWA 1YQ1A 1R4WA 2GSTA 5H5RA 4F9ZA 5DCGA 4JEDA 2DIZA 1Z7PA 2IY2A 5KN3A 3FZAA 2WJUA 1U88A 3TRPA 2PPTA 3UMAA 1SENA 4N0ZA 4AJ7A 3LQ7A 5KN0A 1HQOA 5G30A 2EIOA 1Z6NA 2I3YA 2LNTA 1MDJA 2F9SA 5IMZA 3FRCA 1AUCA 3NOFA 1NHYA 2HYXA 2D2ZA 3MNGA 4OO4A 2R2JA 5H5SA 2MMOA 2QC7A 2OBIA 3FW2A 4Q5QA 1JHBA 2JACA 1QMVA 1O73A 3KCMA 2G0FA 4GTUA 1B4QA 4ZB9A 3TKSE 3BBYA 3GL5A 2YOIA 5DQYA 5CP1A 3D5JA 4JR4A 5FWGA 3P7XA 1FG4A 4FYCA 1GLPA 1CQHA 3HY2A 1XPVA 1HD2A 1PX6A 4BWQA 3LWAA 11GSA 1FVKA 3M1GA 5A4VA 2LUSA 10GSA 2HE3A 3KTLA 2OE3A 1S3AA 1TK0B 2BJXA 4TW5A 4TN8A 4TXVA 4ULXA 2CQ9A 5IIZA 3KD0A 4ZL7A 2DJ3A 1FB0A 2RM6A 2CX3A 3GKKA 2H73A 4IP1A 4PX1A 1SK1A 3KEBA 1F3AA 3Q18A 1A23A 3ERWA 2DSAA 2JL4A 5E4WA 5CYYA 1VF2A 5B6NA 1JLVA 3U5RE 3FZ4A 5IPGA 4MH3A 3UIWA 2L5LA 4TVEA 3CTFA 1HNAA 3K8NA 2H6XA 4HQSA 5IO0A 2C0EA 5IPHA 5EVOA 1BAYA 3ZIJA 3GNJA 1PSQA 1N8JA 1A2LA 4PURA 1SJ6A 3GYKA 4DEJA 3F4TA 4LL1B 1GUMA 4H86A 3L0HA 1A0RP 1M0UA 4POMA 2NDOA 2QSIA 2DJ1A 3ZMLA 3FK8A 1HNCA 2B1LA 3H8QA 3IV4A 1U3IA 2H1BA 3UBLA 3A2XA 1EGOA 3P2AA 4GLTA 3VWVA 4V2LA 2IMDA 1EWXA 2YNXA 4Q5NA 1V57A 2H6ZA 4KNDA 2QGVA 2CV4A 4LMWA 3IRAA 3RBTA 2K18A 2VL2A 3MDKA 3F6FA 18GSA 1MDIA 1ML6A 2DBCA 2RM5A 2YJ7A 3HKRA 1YEXA 3W8JA 2OJLA 4K9ZA 1EOGA 3RHBA 1FW1A 2FLSA 3ZRDA 1ZL9A 2KHPA 5DALB 1SJIA 2HI7A 3EC3A 5G31A 1TRWA 1DBYA 2VLTA 4EDZA 2I1UA 3C1RA 4WETA 3IC4A 1MD3A 1S3CA 2LQOA 4IKHA 3GSSA 2HNLA 8GSSA 3CRUA 1AW9A 1GRXA 2VD1A 2IMKA 2LKUA 2GTUA 2LRTA 1V40A 2ALBA 2H71A 3KMOA 4OCFA 3A3TA 3WGDA 3PH9A 1IYHA 2H0IA 4LMVA 5EL8A 2VOCA 1SL1B 1NHOA 4RQRA 2H75A 1F2EA 2FUG2 4I97A 3M0FA 1KBNA 5HFGA 4N11A 2C0GA 3TJFA 1PX7A 3HVVA 1GUHA 3WT1A 4CHSA 3TGZA 1Y6EA 4EF0A 5AISA 3GKXA 3HJMA 4ECCA 2DJKA 1PN9A 4KSMA 2R5GA 2XBQA 4GCIA 3ZL5A 4F0CA 1ABAA 2LRCA 4IJ3A 4MF6A 2WDUA 4J56E 2JZSA 5DAKB 2BMXA 4MJAA 5F07A 4XCSA 1J0FA 3GN3A 4WR5A 3US3A 4OCEA 4ZILA 2YZUA 5COHA 2H01A 2JZTA 4L5LA 4KDUA 1XVWA 1JZWA 1FO5A 4HZ4A 2FNOA 3L9UA 4MJBA 13GSA 3F4RA 3BOAA 1GTUA 3ZLPA 1DE2A 3RPNA 4BL7A 3KMNA 1F9MA 1NM3A 4IW9A 2ZCTA 3E0UA 5HR0A 2VO4A 4ILFA 6GSYA 5D9XA 1GULA 2MBSA 2YV9A 2HSYA 1A8LA 4ECIA 4E8HA 1TOFA 5J9BA 2V32A 2WGRA 3QDNA 2CA8A 3W8SA 2NPBA 5KN1A 4OWYA 4WR4A 5DALA 3VI7A 2H1GA 3ME7A 4G19A 3SWLA 4TXOA 1OE7A 4K6XA 5HR2A 4NHWA 3VLNA 3VWUA 3KTBA 1GSUA 3Q6OA 4IBPA 5E59A 4L0WA 1E6BA 1B8XA 2P5RA 2CZ2A 3LEFA 2WRTA 4V2MA 4KX4A 3I6AA 4ECJA 2GVPA 2GSSA 1TI1A 1B9YC 4V1Ap 5IQYA 3QAGA 2V41A 3G7YA 4Q5FA 4XRDA 2H19A 3TKPA 2CX4A 2QKEA 3KZQA 5D8IA 3FY7A 3H93A 2P5QA 20GSA 3L9SA 5HFIA 3EWLA 2ON7A 3IAM2 1PKZA 1WRYA 3G9BA 2B5EA 2I81A 4ZL8A 2H76A 2O89A 2OE0A 5LCZA 3IK9A 1YKAA 5ECIB 1THOA 4PNFA 5IMAA 2YWMA 2G2QA 3U6VA 5DAKA 1Z7RA 2IFQA 4O5RA 2JU5A 4GSTA 1XVQA 3CRTA 5IOXA 4HJMA 1WIKA 1K3YA 3GURA 1XW5A 3UAPA 1CQGA 4K7NA 2V1MA 4FO5A 4WEYA 2V6KA 4IHUA 4ZB8A 5J4UA 4DSRA 3ME8A 1E2YA 5J9CA 2H8LA 3GKNA 2IYJA 3GTUA 1GLQA 1QXHA 5INYA 3HA9A 2YJHA 1XOAA 1S3DA 1TDIA 1V9WA 1SL0B 4FYBA 2C1YA 4G2EA 3FZ5A 2WZ9A 4V1Ag 4F03A 1NW2A 4DSSA 4EO3A 1VGLA 6GSUA 3HHVA 1A24A 4JU5A 3PR8A 4K7OA 3HD5A 2O7KA 4POKA 5D9TA 4XHMA 1B48A 2F8FA 2IIYA 5DQSA 4EUYA 3J7Yk 1M9AA 4AJ6A 1X5CA 5JWOB 3L78A 2VCZA 4GQCA 3VK9A 1M2AA 5ECRB 3A2VA 1GWCA 2GQLA 4KE3A 2WFCA 4J57E 1XCCA 2B7KA 4NXIA 6GSWA 1K0AA 2O85A 4RI7A 2ON5A 2C3NA 1Q98A 2JSZA 6GSTA 5H5QA 3A5WA 1PQNA 5G2ZA 2L59A 3C7MA 1NSWA 3VWWA 4HUAA 5CRDA 1ZYEA 5AGYA 2YN1A 3TDGA 2WCIA 5FT3A 4O92A 1PKWA 4Z7XA 2GT6A 1O8XA 1OC8A 9GSSA 2H0HA 2IWTA 2YWIA 2VLVA 5HR1A 4MZCA 1ERUA 1K0CA 4NPBA 5DVBA 3QFAC 3HYPA 2NVLA 2IL3A 3LYKA 2PVQA 3TUEA 1V2AA 5HFKA 1JZOA 4JR6A 2LSTA 1BG5A 2MMNA 3TOTA 1TKDB 3F3RA 2KOKA 2R3XA 1EZKA 5KEJA 5G5FA 2GZYA 5D9VA 2FWHA 1V98A 3F0IA 4XTSA 5JCUA 4WXTA 4N0VA 3FYGA 2LEGA 3IHQA 3DD3A 2OACA 2AAWA 4IQ1A 4MPFA 2WB9A 2CT6A 1AC1A 2DIYA 2X99A 1TRVA 2VL2C 4G9HA 4JBBA 1U3AA 4ZB6A 2YANA 3DMLA 4PUFC 2V2GA 1FHEA 3CMIA 1RQMA 5G1KA 5F0GA 3APQA 3UJ1A 4CDOA 4N10A 3ED3A 3KP9A 4YAVA 1WWJA 1H4OA 4XS4A 2VD0A 1I9DA 1LBKA 1TXXA 2PVOC 3IR4A 5CRHA 4ZBAA 2X64A 1SK2A 4AGSA 2OE1A 3HZ8A 4ID0A 2CVKA 1SD9A 2N5BA 1TTZA 6GSSA 3TKRA 1DUGA 2TRXA 2H0GA 4YAPA 5C04A 1Y25A 2VCWA 4RI6A 1XBSA 1ST9A 4YQMA 2C0DA 2OBKA 2A4VA 5ABRA 3GX0A 3F3QA 3EE2A 3FR3A 5GSSA 1N2AA 3DVXA 4MMMA 3UOMA 2EC4A 4PXOA 4DVCA 4YQVA 2CVDA 2FWFA 1EEJA 2GSQA 4ECBA 3ZFLA 2L5OA 3BCIA 1LJRA 4TR0A 2PWJA 3GIXA 2VL9A 3GHAA 2C80A 2GS3A 1XIYA 4HEA2 1GL8A 1OC9B 1PL2A 4IS0A 2LNSA 2RUFA 3IOSA 1R26A 1W4VA 1URMA 4K7IA 4BVXA 4PQ1A 4D73A 1X9SB 2DLXA 3FR6A 4HZ2A 1TRSA 3C73A 3LJRA 2N5FA 1GNEA 2YPMA 4XIHA 4BVYA 3VWXA 2LQQA 3IA1A 4TXOB 4QQ7A 1SU9A 2X8HA 4IELA 1YEPA 1GNWA 1M7TA 3ERFA 1Z3EA 4CW9A 4MDCA 1Z6MA 5J3RA 1WJKA 4V2NA 2LJAA 2HZFA 2B3SA 3HCZA 4PGTA 4NHZA 3IE3A 1SK0A 4ZIJA 3ZVJD 2M46A 4EVMA 3GX8A 2GQMA 3UL3A 1SKRB 4GQFA 4IJIA 1FOVA 2PN8A 4ML1A 1TW9A 1X0RA 3D4TA 1F37A 2FGXA 5ECLB 1UA5A 4IGJA 4KSOA 1ERWA 2YV7A 3GH9A 1YF0A 2GZPA 5EPFA 5IO2A 4KA0A 3O6TA 3NIVA 1DSBA 3MAKA 2R6KA 2F3MA 3VURA 2IFQB 2VIMA 4TR4A 1O8WA 3GSTA 5DJMA 2MMAA 3GA4A 3LG6A 5ECSA 3G7IA 1XWAA 3I69A 3TB2A 3MSZA 1TI3A 1QUWA 1WMJA 5IMVA 2C4JA 3VPTA 22GSA 16GSA 4EDYA 5G5EA 3EMXA 2WS2A 4KDXA 1ILOA 2VLUA 3GTUB 1OC9A 2CAIA 3QCPA 2LTKA 1BQ7A 1KNGA 1QQ2A 4OFMA 3DWVA 3D6IA 2FWGA 2O8VB 4WF4A 19GSA 2X8CA 2FA8A 2KP1A 1SD8A 3KM6A 4DSSB 5GAPD 1QGVA 1AIUA 4ZL9A 1R7HA 3BCKA 3GL3A 2IMIA 4EE0A 4HI7A 2H66A 1J9BA 1TU8A 2VCQA 3UVTA 4WBJA 5ECNB 2YCDA 2VM2A 1GTBA 5L71A 1XW6A 2C0FA 3DKSA 3IPZA 3F4SA 2A2SA 4YQUA 5ECOB 4MZWA 4IN0A 1OKTA 1EV4A 1M2BA 2VL3A 3KGKA 2PMTA 2CZ3A 1VRSD 3WGXA 3D4MA 5DJLA 3CBUA 2C3TA 1GSQA 1WP0A 1EEMA 4K1FA 3DIEA 2DJ2A 2E2GA 1O7UA 2GZZA 1XWGA 4MZBA 2TRCP 2IJYA 2B5YA 2A2RA 4OFNA 2ZUPA 1WE0A 1OAZA 1BJXA 1TK5B 2JSYA 2KLXA 3G7JA 2M72A 2RIIA 3EMPA 3WGEA 2FY6A 2DJJA 5G1LA 1LU4A 1XWCA 3LFLA 5ECMB 5B8AA 3HVXA 3QD9A 3KH9A 4LA1A 3IDVA 1AAZA 14GSA 2B7JA 1K3OA 2XHFA 1FAAA 3QFBC 4FYUA 3CSHA 2FA4A 4IVFA 4TR3A 3EURA 5CAXA 4DSQA 1G6WA 2IPAA 4OD7A 5A4WA 1ERVA 2FHEA 2V6OA 4ISDA 3F63A 4GXZA 17GSA 5A4UA 2HSHA 1O85A 4X43A 1VF1A 3M8NA 4KDYA 3RPPA 4NV5A 2OA7A 3R2QA 1K0BA 4GSNA 3PINA 3W6GA 1VF4A 1Q4JA 3TKSA 5GZZB 3SBCA 1A8YA 5F05A 4QL9A 2YP6A 4F82A 4OFTA 4XS6A 4PQHA 1YDKA 4J2FA 1XWBA 3HJPA 2GSRA 3VPQA 3TRXA 3ERGA 3S9FA 1MDKA 5AIXA 4KAEA 3GFKA 1FVJA 3IXRA 4XS4B 2ES7A 4HS1A 4GRFA 3BJ5A 3EU3A 2O87A 1GP1A 4YH2A 5CO3A 2HRNA 4HJ2A 4HOJA 1V58A 2CAQA 2OADA 1B4PA 2R4VA 5IM9A 1YF1A 2E2MA 2I4AA 5J41A 3F9UA 2HXKA 3GRXA 1OC3A 4I2UA 3LSZA 1T8EB 1QK8A 3BD2A 1YZXA 2KP2A 2HZEB 3FZ9A 2L57A 7GSSA 1BX9A 1ZYQB 3QR6A 1UVZA 4JRRA 5ELGA 3JCML 2RLIA 4KH7A 4MPGA 3RHCA 1G7EA 4KW6A 2FCHA 4TR1A 2GQKA 1H75A 4TOPA 1U87A 3HZ4A 2REMA 2EIQA 2MMZA 1M99A 1TK8B 2E0QA 3PGTA 12GSA 3CTGA 4KCEA 3O3TA 2MYGA 4HQZA 2XPDA 3AY8A 3C71A 2B5XA 4EXJA 1SYXA 3N5OA 3WD6A 1BYEA 1GSYA 4D73B 4PNGA 1QFNA 3E9JB 2N5AA 5ECKB 4MABA 2HLSA 3EU4A 3APOA 2JZRA 3ZFBA 3A2WA 3DRNA 4NV2A 1W89A 5LNKe 1GH2A 3TCOA 5B7CA 4WF5A 2CVBA 1GSEA 1TRUA 2R37A 5JWQB 1PRXA 2H30A 3QAVA 2P0GA 4BA7A 1SJZA 3H4KA 1B9XC 1KEBA 1ZOFA 2NBSA 2LS5A 1YY7A 4RQXA 4TKYA 2DC5A 1X5EA 5GSTA 4AJ8A 1EV9A 4JE1A 4MJCA 1ZMAA 1M9BA 1YJ6A 1UC7A 5HQPA 1F3BA 1RW1A 1UN2A 3TRQA 3CSJA 1ZGNA 2KUCA 3ZZXA 2L4CA 2H6YA 2DMLA 2VCVA 1XWKA 1XOBA 1G6YA 4KUNA 3HXSA 2H74A 2YZHA 3ZREA 1K0DA 4HU7A 1ZCPA 3DYRA 4MF7A 2XBIA 1TJDA 1K3LA 1G0TA 4KCAA 1A0FA 2VM1A 1MEKA 1C72A 2C3QA 2PBJA 3VI5A 4HU9A 3LXZA 5D93A 1ON4A 1U6TA 2C8UA 4GSSA 2HZEA 3CYNA 3GV1A 5IOWA 3FEUA 1X5DA 5ENUA 2K8SA 3NZNA 2J23A 4Q5RA 2VCTA 1I5GA 4MCUA 3QAWA 1USBA 3LYPA 4ZXGA 1G7OA 2MBTA 1EGRA 2GDRA 3FHKA 1O6JA 2IMFA 3KH7A 2M80A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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