1V57 | Genus

Total Genus 68

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	68
sequence length	229
structure length	229
Chain Sequence	ELPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCPYCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVTPAIYYMSKENTLQQAVGLPDQKTLNIIMGN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structures of the DsbG disulfide isomerase reveal an unstable disulfide pubmed doi rcsb
molecule keywords	Thiol:disulfide interchange protein dsbG
molecule tags	Isomerase
source organism	Escherichia coli
total genus	68
structure length	229
sequence length	229
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2003-11-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF13098	Thioredoxin_2	Thioredoxin-like domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.450.70	Alpha Beta	Roll	Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,	Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal	1v57A01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1v57A03

4TR4A 3WGEA 4BVYA 3RAZA 2P5QA 3M3MA 3O6TA 5DBQA 3F4SA 2VOCA 2O8VB 1PL1A 1F3AA 3TJFA 4N30A 4QL9A 1XWBA 2V2GA 3ZREA 4E8EA 1Z3EA 3M9KA 2R4VA 2AJQB 3H1NA 1DBYA 3A2WA 2LEGA 5JCWA 3KH7A 3GRXA 4K2DA 4D73B 2L6DA 2H1BA 2B5EA 2HSYA 1W89A 1V98A 5IPHA 2IFQB 2JU5A 1SENA 1S3DA 4K0GA 1ON4A 3ZIVA 3P90A 2PMTA 4H86A 3VWXA 1PL2A 3HD5A 2I4AA 2OBKA 18GSA 5FHIA 1ZYQB 1XPVA 3EINA 5IMDA 1T7PB 2V6OA 1YY7A 5HFGA 1ILOA 2LSTA 5ELAA 3ZFBA 2VAFA 2M72A 2VL2A 3UIWA 4RI7A 1EGRA 3ME8A 1A0FA 3N9JA 3EMXA 4KAEA 2ALBA 5ECMB 3A3TA 2GT6A 7GSSA 4POMA 3FZ4A 3JCML 5KN1A 2KP1A 4TR1B 4WR5A 2R37A 2CX3A 2CA8A 3PINA 1VF3A 1TI3A 1T4YA 1VF2A 1PD21 2VO4A 5B7CA 3ERGA 5ECOB 5AISA 5ECRB 4CW9A 1GTIA 3GKMA 1FVKA 5EPFA 5H5RA 5AIVA 6GSWA 4XS4A 1O7UA 5F07A 2H6ZA 4MH2A 4MK3A 2C8UA 5EY6A 2P5RA 1SU9A 3IAS2 1QXHA 2C3NA 2PBJA 1OC8A 1EOGA 1FO5A 4O32A 4ZXGA 2KP2A 2VLTA 5G1KA 3QAWA 3ZZXA 4MPFA 1LJRA 3KH9A 4N0VA 4ULXA 3KMNA 4LL4B 5HFIA 4G10A 2B7JA 4MCUA 5LCZA 2VL2C 3L78A 2R3XA 3ED3A 2V1MA 2CT6A 3F4TA 4KDUA 3OR5A 1AQVA 1T4ZA 4GF0A 3V1WA 4TN8A 3EU4A 1T1VA 3IOSA 3BCKA 5DCGA 2K18A 1GWCA 3FZ9A 4ECBA 4GRFA 5ENUA 5IMAA 5IMCA 2C4JA 1QQ2A 4BVXA 4HZ4A 2LTKA 5CRWA 2IMFA 1XOAA 4F9ZA 3VWVA 4GWRA 1M0UA 5IQYA 3GFKA 4EXJA 1ZL9A 3O76A 2ZUPA 5B8AA 4TXOA 1WP0A 4WBRD 3DRNA 4NV2A 3FR3A 5AN1A 2NVLA 2B1KA 3G7IA 2GZYA 2H76A 3F0IA 5ECNB 4NHZA 4ID0A 1KBNA 3EWLA 1KTEA 2WDUA 1SK0A 4K0NA 3FZ5A 5D9WA 2H01A 1M2AA 2V6KA 3ZRDA 3E3EA 1IYIA 3ISOA 2FWEA 5IMFA 1F3BA 3GL3A 4TW5A 3KXOA 6GSVA 5IM9A 1WE0A 3AY8A 2PVQA 5HQPA 2ON7A 2HFDA 2P31A 1WRYA 1TW9A 5G31A 5D9VA 1Q98A 1JFUA 1XWKA 3A5WA 2HE3A 4TR1A 5ECKB 2RIIA 2OADA 1B48A 2PWJA 3KP9A 4HEA2 2VCZA 4MJAA 1TI1A 1X5DA 3VI5A 1SKRB 6GSSA 2X8CA 4TR0A 1MEKA 1AC1A 2CAIA 4FIWA 2HT9A 2KLXA 1PRXA 4Q5NA 4AF2A 2VCTA 1GSEA 3GKNA 3MAKA 1PX6A 2OA7A 1RK4A 4IGJA 5IMVA 3W6GA 1O8WA 5GSSA 2L5OA 2OACA 1Y6EA 1OE7A 3WYWA 3LSZA 2IL3A 4BPYA 2FWHA 3KD0A 3VWWA 1A8LA 4DSQA 4V2MA 1AW9A 2AV4A 3ZVJA 1UN2A 4MZWA 4YQUA 3DD3A 5E4WA 1K0OA 1M99A 2JZTA 5GAPD 2OKAA 1GSQA 1MDIA 2H75A 1J08A 4K7NA 1SJZA 3APOA 3TKSE 2F9SA 3E9JB 5A4UA 5DCHA 2C0GA 5ECIB 5ID2B 3R2QA 3HKRA 2KOKA 5AGYA 3D21A 1EOHA 1ACVA 3EMPA 4EL1A 3F3QA 4NWYA 2F51A 2XPDA 3U5RE 3Q74A 4MLYA 3FY7A 1IYHA 2WB9A 2M80A 1EEJA 1THOA 5IO0A 1TKDB 4I6XA 5F05A 1OAZA 2FCHA 1YF0A 3LWAA 5H5QA 3NOFA 5DVBA 1TJDA 2Z9SA 3LJRA 2BMXA 1SYRA 1NHOA 2VCQA 3HA9A 2IMKA 3UJ1A 1DE2A 3DGQA 1PA3A 1A2LA 1YKCA 3LG6A 1K3LA 1U88A 3IK9A 4DEJA 5COHA 5J3RA 5JWQB 4HS1A 4JZQA 5HFKA 1BEDA 4MF7A 2B6MA 1K3OA 2GQLA 4YQVA 3D6IA 4PX1A 1GSSA 3FRCA 2R6KA 2VL9A 2I81A 5D73A 4XS4B 1UVZA 3MDKA 3CTGA 3ZTLA 2H1GA 3D4TA 3UMAA 1U6TA 5JCGA 4ACSA 4N11A 4KUNA 3EURA 2TRXA 2F3MA 3GIXA 4FO5A 1J0FA 2C0EA 1QK8A 5B6NA 3KM6A 3UAPA 4XHMA 4IKHA 1PQNA 4OFNA 3DYRA 4FYCA 2DJ2A 3L9VA 4TOPA 1SL1B 3TRQA 1EEMA 2P0GA 5FWGA 3HJOA 2VCVA 3HDCA 3ZL5A 4JEDA 2JZRA 1K0CA 1JLWA 4ML6A 4MMMA 4EKZA 2VL3A 4IVFA 1AIUA 1SKWB 2H1DA 1M9AA 1A2MA 1EP7A 5G1LA 1K3YA 4GSSA 3HVSA 3GURA 2LJAA 3KP8A 2TIRA 5CP1A 1E6BA 4XS1A 2LQOA 1TK5B 3I43A 2JL4A 1CQHA 1PKWA 4ISDA 4V2NA 1A0RP 1TP9A 5G2ZA 3UARA 5IOWA 2IYJA 3H93A 4NAXA 3LQ7A 1MD4A 4PGTA 5D8IA 4K7OA 2IMIA 3M1GA 1J9BA 4K9ZA 3BOAA 4DSRA 3APQA 1EWXA 1B9XC 2H74A 2JACA 1SJ6A 3G7JA 3G7YA 1RW1A 4MJCA 3TKPA 2ZNMA 4TXOB 1X0RA 1MDJA 5C04A 4IS0A 4HOJA 3TJJA 1PX7A 3M9JA 4F03A 1XOBA 4XTSA 2OE3A 2AAWA 3N5OA 1PKZA 4PQHA 3GN3A 1GUHA 1GLQA 1WOUA 5ID2A 1HNBA 4NV5A 3BJ5A 1TK8B 2O85A 2GVPA 3VPTA 3VFIA 3C1RA 3C73A 3KZQA 3UVTA 2PUKC 2LJKA 2MMOA 2HZFA 2VLVA 3RPNA 1ZGNA 2HNLA 4ECCA 3C7MA 1YEXA 2O7KA 1OE8A 1U87A 2IY2A 1TRVA 2WCIA 3RDWA 3PR8A 2PPTA 4DVCA 4GSTA 3QAGA 1FB6A 5DQSA 2EIOA 2LQQA 1SK2A 4MH3A 1TK0B 2OE1A 1B8XA 3GX0A 3I6AA 4I2UA 4IN0A 2LKUA 4WF4A 6GSXA 2C3QA 1R5PA 3EE2A 1M2BA 4WBJA 2H6XA 5A4WA 1DUGA 2WS2A 1XWAA 1QFNA 1SD9A 4QL7A 4WXTA 2GQKA 3WGXA 2FUG2 1K0MA 1G7EA 3LXTA 3GKKA 1OYJA 3Q18A 3ZMKA 1M2DA 5LNKe 4MZCA 1B4PA 5INYA 2R2JA 2DJ0A 3TJGA 1VGLA 8GSSA 12GSA 4KW6A 4ZB9A 4MJBA 4RQXA 1A24A 4RI6A 4E8HA 6GSUA 2JSZA 3VLNA 2PU9C 2YNXA 1O85A 3D22A 2YV7A 2ON5A 1ERWA 4POBA 1F2EA 4JBBA 2DJKA 1R7HA 4IQ1A 1BX9A 2IIYA 1TU8A 4LMVA 5HR1A 2LRTA 4ZL8A 4EO3A 4NPBA 3PH9A 3WD6A 3VI7A 4HJ2A 4BWSA 4L8EA 3L0HA 1FHEA 1AXDA 5ECPB 2A2RA 5CYYA 4IELA 4KX4A 4MABA 2N5AA 2D2ZA 2H0GA 2REMA 1TTZA 3CTFA 5DAKA 1XVWA 2J9HA 3HVXA 2K8VA 4IP1A 5IMZA 17GSA 4GXZA 2L4CA 3W8SA 1OC9B 2CZ3A 4ZBBA 1T00A 3FR9A 1G6YA 2VM2A 3RPPA 3TGZA 1T8EB 2LUSA 1TRWA 1OVNA 4XCSA 3HXSA 2YP6A 2OE0A 1JZWA 4I5QA 3LEFA 3MSZA 4K1FA 2KHPA 1V58A 2VLUA 3L9SA 2WRTA 1GTUA 3US3A 2PN8A 4XRAA 4KA0A 3DVWA 5EVOA 14GSA 4ILFA 2BTOT 1JZDA 4AGSA 4RQRA 5GAND 1OKTA 4YQMA 5G5FA 4BL7A 4N0ZA 3U6VA 1PN9A 2E2MA 5J9BA 3D4MA 1QGVA 1GNWA 3GTUA 1BAYA 1BQ7A 1KNGA 1USBA 4LLRA 3DEXA 4HU7A 3F4RA 5JWOB 4LL1B 2A4VA 3A2XA 5CRDA 3VPQA 3UEMA 1T3BA 4F82A 1X5EA 1FVJA 3QDNA 3GL5A 3HY2A 2V32A 5JCUA 3GMFA 1GSYA 2DIZA 1N2AA 2BJXA 2HI7A 1NSWA 2GSSA 2C0FA 2YN1A 2EC4A 2DIYA 1JZRA 1EV4A 2GQMA 3LXZA 4YAPA 3CRUA 2H30A 4HQZA 2XPEA 4PQ1A 3KCMA 2E0QA 1N8JA 2VIMA 3GA4A 3GNJA 5IIZA 2HYXA 4OFMA 2NDOA 3KTBA 2EIQA 4KE3A 3QCPA 3DWVA 2HRFA 3H79A 4F2IA 2GZPA 1PMTA 3IHQA 1VF1A 3UBKA 2GSQA 3NZNA 4POLA 2YOIA 20GSA 2MZCA 4ZB6A 2FWFA 1MDKA 5CRGA 1V9WA 5F8BA 4TKYA 3IC4A 1OKDA 3SBCA 1O8XA 4IBPA 1K0BA 3TCOA 1GSFA 1AAZA 3C8EA 4TVEA 5IO2A 1GH2A 2DJ3A 4PUFC 4KDYA 1U3AA 4BWQA 2MMZA 3UOMA 3F8UA 1G0TA 1GUKA 3HCZA 3ZFLA 3ZYWA 2RUFA 4JU5A 3TB2A 3LGCA 4DSSB 1XIYA 1HQOA 2VD0A 3ERWA 3H4KA 3F6FA 4WF5A 1URMA 1BJXA 3GKXA 3GX8A 4N10A 5C00A 5B6MA 4PQIA 1OC9A 1XBSA 1FOVA 1AQWA 2V41A 1XW9A 3QD9A 3TKQA 1GSDA 5H5SA 3M0FA 2K9FA 1ERVA 3P7XA 4OFTA 5EL8A 4AJ7A 4MJEA 2AYTA 2HZEB 1AUCA 3VK9A 3IBHA 1X5CA 3J7Yk 4KSOA 1I9DA 1XZOA 16GSA 22GSA 2MMAA 3KIJA 1XWCA 1TRSA 2H19A 4Q5RA 3IR4A 5DALB 2CAQA 1C72A 3WT1A 3TKSA 5FT3A 5G5EA 3A2VA 3IAM2 1MD3A 5B8BA 2IJYA 4X43A 1SYXA 4I8BA 4GQFA 3I69A 4L5OA 4ZBDA 4WKWA 3P2AA 5J4UA 1CQGA 4O5RA 1YKAA 5A5KA 3E0UA 4OWYA 1W4VA 1ZCPA 2I3YA 5CRHA 1HNCA 3ERFA 2WFCA 5DJMA 3W8JA 2E2GA 1RQMA 4YH2A 3S9FA 3KJYA 1BYEA 3EVIA 3L4NA 3FEUA 4HJMA 1HYUA 3DIEA 3NIVA 3O3TA 1Z6MA 3QR6A 2IWTA 1GTAA 3LFLA 5LD0A 1GSUA 1YJ6A 1XXUA 4EDZA 3CSJA 2NPBA 4OO4A 2LV3A 2QGVA 4WR4A 3MWHA 1PGTA 2ZCTA 2GDRA 3VWUA 1TOFA 1SKSB 2MYGA 1SL0B 3IK7A 1WMJA 3F6DA 3ZIJA 3RHBA 3J7Yb 1B9YC 19GSA 3QAVA 4F0CA 2VCWA 2RUEA 5CREA 1G6WA 5D9TA 2RM5A 1ERUA 5DAKB 3F3RA 2HLSA 1ZZYA 2XC2A 4FH8A 2QSIA 3FHKA 4L0WA 3TKRA 3CMIA 1H4OA 4O7HA 2O87A 2JSYA 4F0BA 1Q4JA 1DE1A 2J23A 4I2TA 2H66A 4KH7A 1O73A 1ERTA 3UL3A 3FKFA 4HI7A 4TXVA 4LMWA 2VCXA 2FA8A 4AJ8A 3ZVJD 3BBYA 4ZB8A 1R5AA 2TRCP 4NHWA 1UC7A 2YCDA 4X0XA 4MA9A 4HU9A 3APSA 4I97A 2YJHA 2K6VA 4TR3A 5AIXA 2JADA 3GHAA 3GH9A 4PXOA 1V40A 4G19A 2GT5A 4XIHA 2GGTA 4OCEA 2C3TA 4EC0A 1K0NA 3HZ4A 4PNGA 3WGDA 4V1Ag 4OMVA 3GTUB 1WJKA 4DSSA 2H72A 2E7PA 3CRTA 2CZ2A 5G30A 1GUMA 4AJ6A 4HZ2A 3IE3A 3QFAC 1OC3A 2LRCA 2MMNA 1R26A 4JE1A 3TJBA 3M8NA 1F9MA 2NBSA 1GLPA 2VUPA 4KNDA 1DSBA 1JLVA 3DXBA 4GQCA 2EIRA 1ST9A 1A2JA 1YQ1A 13GSA 4HQSA 2HZEA 1Z7PA 3GYKA 10GSA 2H0HA 5KEJA 2IPAA 2H71A 5ECLB 4V1Ap 5DALA 2H0IA 1B4QA 2LJRA 1LU4A 1U3IA 3FW2A 5J5NA 1KEBA 1A8YA 2XBQA 3HZ8A 4ZL7A 5GZZB 3GSSA 2FD3A 2PGTA 1YZXA 4HDEA 4KCAA 4V2LA 2VM1A 4MZBA 1F6MC 2L57A 4ZILA 3P8WA 2OJLA 4IW9A 1GTBA 1EP8A 5A4VA 2CVKA 4PUAA 4IQAA 3C71A 4MF6A 2GTUA 2AB6A 4MPGA 2G0FA 3TOTA 4EDYA 5KN2A 3HVVA 4ZIJA 1K0DA 2YV9A 1FAAA 2QKEA 2KUCA 2N5BA 3CSHA 3HJPA 1M9BA 1HNAA 2YANA 4GSNA 3LYKA 4OO5A 3QMXA 4TRXA 3TUEA 3RBTA 4JRRA 2CV4A 1K0AA 5D96A 3F63A 3HJMA 1ZMAA 3D0ZA 2DC5A 2H70A 2QC7A 5J41A 3WT2A 1FG4A 1O6JA 1S3CA 3CSIA 1EGOA 3FZAA 3TRXA 3DMLA 3EYTA 4FYUA 4RUVA 1XCCA 1TU7A 2RM6A 3CXGA 2N5FA 2X8HA 2LNSA 5CNWA 4MP4A 1FB0A 4G9HA 4YAVA 2LNTA 2CX4A 2R5GA 1S3AA 1ML6A 1XWGA 4JR6A 1THXA 1GULA 2WZ9A 3KMOA 3TJKA 2DBCA 2X8GA 3SWLA 5ELGA 1AQXA 2C1YA 4NMUA 1GRXA 3CBUA 3GSTA 4L0UA 2FHEA 1Z9HA 1M7TA 2HRNA 1XFLA 2XHFA 4CDOA 2PERA 3IV4A 3F9UA 6GSYA 1NM3A 1X9MB 1Y25A 4OD7A 4J56E 4EVMA 3KEBA 5F06A 3TOUA 5KN3A 1WPIA 1I5GA 3MNGA 1A23A 4P3YB 4WEYA 4D73A 4J2FA 2YZHA 3I9V2 2H6YA 2DMMA 2XBIA 1NHYA 5KN0A 3QPMA 4Q5FA 1SK1A 4K7IA 4PNFA 2IFQA 2GLRA 4KB3A 4MF5A 5IPGA 3GH6A 4IJ3A 4GLTA 2H8LA 3HHVA 2B5XA 2M46A 1EZKA 3BD2A 2YWOA 5DJLA 2I1UA 2L6CA 4XS6A 2K8SA 5ABRA 3LORA 2G2QA 3IDVA 3UVHA 2DMLA 2DJ1A 2IMDA 1X9SB 5J9CA 2B7KA 1PSQA 1YDKA 1H75A 2HSHA 2GSTA 4KGIA 3Q19A 5F0GA 2YZUA 2PVOC 3ZITA 2GS3A 3HYPA 2L5LA 1UA5A 3QFBC 4BA7A 3PGTA 5HR2A 2FGXA 5HR0A 2H1AA 1YF1A 5ECSA 4X1UA 1SL2B 2WGRA 4IHUA 1HD2A 3VURA 1XVQA 1Z7RA 2CVDA 3TDGA 2YJ7A 4O92A 1YEPA 3IXRA 1R4WA 4GTUA 2F8AA 4ECJA 2CQ9A 4J57E 4QQ7A 2DLXA 2JZSA 5DQYA 5D93A 4GCIA 2OBIA 4ML1A 4IP6A 2FWGA 4KDXA 3EC3A 5CO3A 3QOUA 4NXIA 4K8MA 1TDIA 2O89A 1XW5A 3CYNA 4HUAA 1GP1A 3K8NA 3TRPA 4ZL9A 2X99A 2WJUA 2YWNA 3FK8A 1EV9A 5CAXA 2B5YA 4JR4A 2VD1A 4ECIA 3L9UA 2LS5A 2ES7A 5JWRB 6GSTA 2NTOA 2YPMA 3Q6OA 4LA1A 5L71A 4MDCA 3H8QA 1JZOA 2F8FA 3D5JA 3IRAA 2L4QA 2GZZA 4KCEA 1VRSD 2YWIA 1VF4A 2HXKA 9GSSA 5IOXA 3IPZA 5D9XA 4Z7XA 2C80A 3BCIA 1BG5A 1ZOFA 1E2YA 4L5LA 1G7OA 3GV1A 2C0DA 1SJIA 3FR6A 1TXXA 5HR3A 1JHBA 2I9HA 1WIKA 3ZMLA 4WETA 3KTLA 2FY6A 1ZYEA 4EE0A 4POKA 1O81A 4G2EA 2L59A 2LRNA 1F37A 2DJJA 3ME7A 3DKSA 4XRDA 4ZBAA 1QUWA 1SD8A 4Q5QA 2CVBA 3UBLA 5ECQB 2MBSA 1FW1A 1XW6A 2X64A 2A2SA 3FYGA 2IMEA 3EU3A 1Z5YE 2B1LA 2GSRA 2AUVA 1LBKA 4EF0A 1V57A 2H73A 4K6XA 4CHSA 1GL8A 1ABAA 4OCFA 1TRUA 3KGKA 5GSTA 3ZLPA 3C1SA 2YWMA 11GSA 1NW2A 1GNEA 2FNOA 3IA1A 2IN3A 5ECHB 1MTCA 1QMVA 2FA4A 3LYPA 4EUYA 2AHEA 3G9BA 4PURA 5DDLA 4KSMA 3RHCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1V57A

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations