1V57 | Genus

Total Genus 68

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	68
sequence length	229
structure length	229
Chain Sequence	ELPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCPYCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVTPAIYYMSKENTLQQAVGLPDQKTLNIIMGN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Isomerase
source organism	Escherichia coli
publication title	Crystal structures of the DsbG disulfide isomerase reveal an unstable disulfide pubmed doi rcsb
molecule keywords	Thiol:disulfide interchange protein dsbG
total genus	68
structure length	229
sequence length	229
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2003-11-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF13098	Thioredoxin_2	Thioredoxin-like domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.450.70	Alpha Beta	Roll	Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,	Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal	1v57A01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1v57A03

5ENUA 1Z6NA 5LNKe 3M0FA 1FO5A 2YCDA 2C1YA 2KHPA 4G2EA 1SL1B 2VO4A 1ZZYA 2LRCA 1EEJA 5AN1A 3C1RA 2N5AA 2CT6A 1CQGA 1HNCA 2V32A 1F37A 4XS4B 4POBA 3GNJA 4TXVA 4OWYA 3GX0A 2ZNMA 2GT6A 3OR5A 1TDIA 3MWHA 4KB3A 2V1MA 1SYXA 2HSHA 2IPAA 1AC1A 1TJDA 2RIIA 1FHEA 1GSUA 3Q19A 3L9VA 1F9MA 1OYJA 1B48A 1XXUA 5HFKA 5C00A 3VI5A 2AUVA 1GNWA 18GSA 3UVTA 4EDZA 5CAXA 2MMAA 1X9MB 3KMOA 1SL2B 2HLSA 4OFTA 1EP8A 17GSA 2VD0A 2DJ3A 2AB6A 4LL4B 1QMVA 3E9JB 2TRXA 3U6VA 1ABAA 2CVDA 1NHYA 2E7PA 4EDYA 5ECLB 2VAFA 3LSZA 3VWUA 2OA7A 3FEUA 2JZTA 2PUKC 4PUFC 2L59A 2OBKA 3WT2A 5DAKA 5F06A 1JHBA 1WIKA 4I5QA 3GSSA 2YJ7A 4JE1A 1GSEA 4WKWA 5D73A 3WT1A 3F3QA 4POKA 3TJKA 3CRUA 3F63A 3EMXA 2RUEA 4ILFA 1UVZA 4XS1A 4K7OA 1CQHA 2WDUA 1LJRA 5L71A 1LBKA 2PVQA 2GZZA 1NW2A 3GYKA 3KP8A 3C73A 3WYWA 3ZLPA 2DIZA 3KIJA 1GH2A 2NDOA 4X0XA 2N5BA 3TJBA 1X5EA 4BWQA 2PPTA 5G2ZA 5IOWA 2VCQA 3M1GA 2LNSA 3FZ9A 5D93A 3N9JA 3QR6A 4IVFA 2FUG2 3HJPA 3VWXA 1XPVA 1TOFA 1EEMA 5DJLA 3LXTA 3GTUA 3NZNA 3HYPA 1K0CA 4EUYA 4J56E 3WD6A 2YP6A 2P5RA 3GRXA 1AAZA 2C3QA 3QDNA 1EGRA 2DBCA 2VCZA 2HFDA 4PXOA 3A2WA 3FR3A 2LEGA 3FW2A 3QD9A 3EU3A 1WE0A 4MLYA 3H4KA 1XW6A 3NOFA 2YNXA 1OKDA 1PGTA 3TRPA 4LLRA 1A2MA 1AXDA 4XRAA 2B5EA 1MEKA 4K7NA 1URMA 3ZMKA 3LEFA 2H1DA 2YZHA 5IIZA 1EV9A 1DBYA 2AHEA 3KH7A 4V1Ap 2PGTA 2FLSA 4KDUA 4O92A 1OE7A 3TKPA 4WEYA 4O5RA 3IOSA 1G6WA 4BVYA 2LUSA 4PUAA 3D21A 3BOAA 2NBSA 1X5CA 3F6FA 4OCFA 4JEDA 3F4SA 2LJKA 5D9WA 5G30A 2GT5A 3KEBA 3ZVJD 2KLXA 4HJ2A 2A2SA 5CO3A 5HR2A 5DALB 1VF4A 4NAXA 13GSA 1Q4JA 4HS1A 4KSMA 4WETA 2AAWA 1GRXA 4F82A 5GAPD 2WFCA 2K9FA 2DIYA 1XWBA 1O81A 5B6MA 3D4MA 3G7JA 2IIYA 3KD0A 2DC5A 1M9BA 2PU9C 3QCPA 1MTCA 1N2AA 2XHFA 5IMVA 3ERWA 3DVXA 5A4VA 1TRSA 2L4CA 3HKRA 2H1GA 3VI7A 2BJXA 1V98A 3LYKA 4IP6A 2IL3A 2L5LA 1G7EA 1FW1A 2H6YA 3CBUA 2IFQA 1ZL9A 3GN3A 2C3NA 2KOKA 4OCEA 4AJ7A 5JWRB 1G7OA 1B8XA 5JCGA 2R2JA 4DSRA 3IE3A 1YZXA 3D22A 3CRTA 4TOPA 3K8NA 5HFGA 1XWAA 1SD9A 2K18A 3W6GA 3ZIVA 14GSA 3LWAA 2PVOC 2JADA 4HZ2A 3VWVA 2C4JA 2V2GA 5AIVA 1AIUA 1YKAA 3UARA 1BG5A 3A3TA 2H01A 3TDGA 5H5SA 1T00A 6GSVA 1XZOA 4IHUA 1GNEA 1Z7RA 3TOTA 1GTBA 4MJEA 3ZREA 1PX6A 4D73A 2MMZA 1TK0B 1A23A 2CZ2A 2FHEA 1F6MC 1G0TA 4RQRA 3TJFA 2NVLA 3IAS2 2H66A 3EVIA 4ECBA 2O89A 1JZOA 4TXOB 4MPGA 2JL4A 5E4WA 4IP1A 5D96A 2C3TA 3TCOA 2J9HA 4HU9A 3GMFA 4Q5RA 1TRWA 3HXSA 3CXGA 1H4OA 2OE1A 2BTOT 3C7MA 3HY2A 3GH9A 2DJ0A 1BX9A 4XIHA 3A2VA 2HNLA 1XOAA 1M7TA 4EL1A 3F3RA 2CX4A 3FKFA 3KZQA 4IBPA 3ZIJA 2H75A 4TR1B 4V1Ag 1PD21 4XRDA 2C80A 2ZCTA 5ABRA 4YQMA 2FA8A 5CP1A 3HJOA 3D0ZA 4N10A 2YWOA 2V6OA 1GLQA 1I5GA 5IMAA 2DLXA 5FHIA 1UA5A 1QK8A 4JR6A 1ZGNA 2E0QA 1GUMA 1BYEA 1GSDA 1A0FA 4MF6A 2P31A 3IDVA 3S9FA 1PN9A 3UJ1A 1XWKA 4K7IA 1XWCA 4GRFA 5LD0A 4WBRD 4E8HA 1WP0A 4KAEA 2B7JA 2HSYA 1Q98A 3IRAA 1G6YA 4G10A 19GSA 4ECCA 2H0GA 3ERFA 6GSXA 1UN2A 4QL9A 2H19A 3DGQA 4GQFA 3GUSA 2AV4A 2CX3A 3HCZA 5INYA 3IC4A 4RUVA 3ZL5A 2YN1A 3W8SA 2LRTA 2XBQA 3Q6OA 3QMXA 4POLA 5ECPB 5IMDA 3VFIA 4MDCA 5F0GA 2VL2C 4V2NA 1ERTA 2DMMA 2XBIA 4BPYA 4IKHA 4BWSA 1TKDB 5D9TA 4IS0A 5ECMB 1MD3A 20GSA 1UC7A 3GFKA 1GTAA 5DCGA 4I97A 1ZYQB 3FR6A 1JLVA 1HNBA 1TW9A 1U3IA 4YH2A 4TVEA 3HZ4A 2J23A 3APQA 2HZEA 1GULA 3FZAA 4G19A 1PKWA 2ON7A 4ML1A 2LQQA 3IV4A 4PX1A 3FHKA 2FWFA 4K1FA 1FG4A 3FRCA 4MF7A 1S3CA 4NWYA 5GSSA 5CRGA 22GSA 4MZWA 2AJQB 3WGXA 5IM9A 4FO5A 5JWQB 3C71A 1AQXA 1VRSD 2YJHA 2H0HA 2FWHA 4WF5A 4BA7A 4PGTA 2WZ9A 1YEPA 3PINA 4BVXA 4MP4A 4IJIA 1U6TA 4ZBBA 4O7HA 4ML6A 5A4UA 4JBBA 3UBKA 2H1BA 1PL1A 5ELAA 3GSTA 2H72A 1E6BA 2I1UA 2V41A 2WGRA 4MH2A 4OFNA 5CRHA 4TR3A 1GTIA 4MZCA 3FZ5A 4FYUA 4QQ7A 1NSWA 1ZCPA 1YF1A 5LCZA 4MF5A 1HNAA 4ZIJA 4LMVA 2F51A 4EF0A 1R5PA 3RBTA 4ID0A 4FIWA 1MDIA 2OE0A 2RLIA 5J9BA 3LJRA 1PKZA 3GA4A 2CVKA 4DSSB 2FY6A 1ML6A 1A24A 5GZZB 5H5RA 4FYBA 2IY2A 2FGXA 1M0UA 3HD5A 3L9UA 1TRVA 1TK8B 3F6DA 2YV9A 4KGIA 2JSZA 1OKTA 2GGTA 3ZFBA 3O6TA 2B1LA 3TOUA 1K0BA 3IR4A 1NM3A 3LG6A 2IJYA 3O76A 3QAWA 1VF2A 1SKRB 1FB6A 2VLTA 5IMZA 3TKSC 4IGJA 1SK1A 1PA3A 2C8UA 2VLUA 3GKNA 3KM6A 3L9SA 1ILOA 4MA9A 5DQSA 1M2AA 5ID2A 3TGZA 1SJIA 2L6DA 1QGVA 1K3YA 1JFUA 1GLPA 3DVWA 1SYRA 2M72A 2A2RA 2L57A 1U88A 2PBJA 3TRXA 3EURA 1XOBA 4WBJA 2B6MA 4K2DA 4JR4A 3APSA 1HQOA 3KCMA 4I2TA 2VM1A 2H0IA 4PQIA 9GSSA 3GIXA 5GAND 1WJKA 4GQCA 3FZ4A 2VL9A 4CDOA 1AUCA 1N8JA 1B4QA 4HU7A 1ZYEA 5EY6A 3EWLA 3Q74A 4K9ZA 2VCVA 4GF0A 3F8UA 4ZL9A 2VUPA 4K0GA 3M9KA 5JCWA 1J08A 1RW1A 3D4TA 1GL8A 5COHA 1I9DA 4NV5A 1DE1A 1FVJA 2DJJA 2LSTA 4GSNA 2L5OA 1M2DA 3LGCA 1O8WA 1THXA 1O6JA 1THOA 2FWEA 2CA8A 5AGYA 2M80A 1OC9A 2A4VA 1T7PB 5DJMA 2JU5A 2IN3A 2CAIA 3EINA 4KA0A 1HD2A 4HUAA 1X9WB 2B7KA 2GSSA 2OBIA 3C8EA 2B5YA 3UOMA 1SENA 4OO5A 4NXIA 1OC8A 2I9HA 3GH6A 1W4VA 4TN8A 3CSJA 2OKAA 1IYHA 3ME7A 5ECIB 2X64A 3G7YA 4GCIA 2ES7A 3AY8A 2H6ZA 6GSWA 1TI1A 5EL8A 1VF1A 2Z9SA 3I69A 3ZVJA 4N0VA 3ZITA 1T4ZA 2YPMA 1SKWB 1XW5A 4KCEA 3VPTA 2FWGA 2YWNA 2CVBA 2L6CA 3QFBC 2X8GA 3C1SA 3U5RE 2DMLA 2VL3A 1SKSB 4HJMA 4K8MA 5DAKB 2WS2A 3P7XA 2EIQA 4WXTA 3KJYA 3CYNA 4ZL7A 2REMA 3JCML 3TB2A 4KH7A 4XHMA 4YAVA 2LKUA 2O7KA 3I43A 1T4YA 2HE3A 5IOXA 4GXZA 1EOHA 4G9HA 4ZBAA 3ZFLA 1JZWA 2XPEA 2RM6A 5ECKB 3UEMA 3KGKA 2H74A 2HRFA 1W89A 4YQUA 2GTUA 1FVKA 3IA1A 5F8BA 5GSTA 5FWGA 2HT9A 3FYGA 3ED3A 5J4UA 2RUFA 4TKYA 3GTUB 3J7Yk 4XS4A 3DMLA 2CAQA 5ECSA 3GL3A 5B6NA 3LYPA 1Y6EA 4J57E 1JZDA 3VWWA 4HZ4A 2FNOA 4RI6A 1R5AA 1SK0A 1TK5B 1K3OA 2GQLA 5JCUA 4ZB9A 4OMVA 1GUHA 2EIRA 3IAM2 1J9BA 5D9XA 6GSUA 4XTSA 4F0BA 4I8BA 3EC3A 1A2JA 1ERWA 5IQYA 3IK9A 3TKQA 3QPMA 3EMPA 5A5KA 2VD1A 2VL2A 1FB0A 2LRNA 1K0MA 3HHVA 5IPGA 5DCHA 4E8EA 4LMWA 4V2LA 3KXOA 2G2QA 5B8BA 3TKRA 5KN3A 3CSIA 1TP9A 2QSIA 2H6XA 1BEDA 2OE3A 5D9VA 3DD3A 4GSTA 5IPHA 4IJ3A 1SU9A 1EP7A 3PR8A 1GSFA 2LQOA 3A5WA 4YAPA 3RHBA 4MABA 1T3BA 2H70A 4ZB8A 3TKSE 1GP1A 3HZ8A 3F0IA 1TTZA 2MMOA 4Z7XA 2GVPA 4DSQA 1XIYA 1U3AA 3I9V2 1QQ2A 3D6IA 3LXZA 5J5NA 2HRNA 4PNGA 4EE0A 1R7HA 3WGEA 1Y25A 1V58A 1OC3A 2OADA 2I3YA 1OE8A 1GTUA 3HA9A 3KTBA 2VCWA 5G31A 1DE2A 3VLNA 1PX7A 3FY7A 1SD8A 1PSQA 5DVBA 16GSA 3EU4A 2N5FA 1YJ6A 1J0FA 1TU7A 1C72A 4F2IA 1WRYA 3QOUA 4PNFA 2HI7A 2IFQB 1O73A 3L78A 3GKKA 2QC7A 3UAPA 3FK8A 4J2FA 2PMTA 3HDCA 2DJ2A 2G0FA 3F4TA 3RPPA 3M8NA 1Z9HA 4JZQA 5B8AA 2OACA 1AQWA 4IQAA 2K6VA 4L5LA 3GV1A 5G5EA 4RI7A 5G1KA 2PWJA 2H8LA 4ISDA 1ON4A 3H79A 1EV4A 4NMUA 1F2EA 2YOIA 1DUGA 2X99A 3APOA 4GSSA 3KMNA 1Z3EA 5EPFA 2C0GA 2C0FA 2VLVA 2KP2A 4WR5A 1K3LA 4D73B 2JZRA 3FR9A 1A8YA 1E2YA 3LORA 4X43A 4IW9A 3LQ7A 3P2AA 4L8EA 4MH3A 1OAZA 4MJAA 4ULXA 3SBCA 3E3EA 4FYCA 3TRQA 1V9WA 3TKSA 2CQ9A 4Q5NA 4GTUA 3HVVA 2LTKA 3MDKA 1SK2A 1ST9A 5DALA 5J3RA 4N30A 1KTEA 1WWJA 3BJ5A 4P3YB 12GSA 1X0RA 3GL5A 2MYGA 1PL2A 4TR0A 4NHZA 2GSTA 4RQXA 3IXRA 3ME8A 3CSHA 1A0RP 4AF2A 1K0NA 1O85A 1TXXA 4AJ6A 1MD4A 3PH9A 2XC2A 4MK3A 3F4RA 5KEJA 2DJ1A 4EO3A 3ZTLA 2BMXA 1USBA 4POMA 6GSSA 1FAAA 2R5GA 3N5OA 3R2QA 1X5DA 2IMEA 4XS6A 2IYJA 3IPZA 1R26A 3H1NA 2IMDA 5CYYA 5EVOA 3ZYWA 5HR1A 3G9BA 2GQMA 4AJ8A 4HI7A 5G5FA 4GWRA 1YDKA 3P90A 1GSQA 2L4QA 4V2MA 1EGOA 2HZFA 1SL0B 4YQVA 1TI3A 3MNGA 2VM2A 3E0UA 3H93A 1JZRA 7GSSA 4L0WA 3UVHA 4DVCA 3DXBA 1ACVA 2GDRA 3L0HA 2HYXA 4KDXA 3GURA 1JLWA 5IO0A 2MBTA 2IMIA 1VF3A 2JSYA 4JRRA 3H8QA 4IELA 2B1KA 4ZBDA 1TU8A 1KNGA 3RAZA 4MZBA 3TJGA 2MZCA 1PMTA 2F3MA 4OFMA 4TXOA 5ECRB 4ECIA 4PQHA 3UMAA 4QL7A 1B9YC 1TRUA 1X9SB 11GSA 2H73A 4LL1B 2KP1A 5G1LA 2V6KA 4KCAA 2QKEA 1U87A 4AGSA 1VGLA 3ZMLA 2HZEB 2QGVA 2K8VA 3RPNA 4F0CA 5ECOB 2MMNA 4F9ZA 4NPBA 2TRCP 2ALBA 3RHCA 5JWOB 1RK4A 4BL7A 2AYTA 1BJXA 1Z6MA 4LA1A 4NHWA 2XPDA 3KP9A 3L4NA 4TR1A 5KN0A 3QAVA 4MJBA 3W8JA 3J7Yb 3VPQA 2FD3A 5C04A 1NHOA 2EIOA 1PRXA 2VCTA 3V1WA 3US3A 4CHSA 1AW9A 5HR0A 4WF4A 1ZOFA 2B5XA 5ELGA 3MAKA 3GKMA 2YV7A 3CMIA 4KNDA 4HDEA 5IMCA 3A2XA 2LJAA 1ZMAA 4K0NA 3HJMA 4FH8A 5HR3A 4L0UA 4F03A 3I6AA 1ERVA 3M3MA 3VURA 5AIXA 1H75A 5IMFA 3DIEA 2R3XA 3DEXA 1XCCA 1V2AA 1GSYA 2IWTA 5HFIA 2IMFA 1YKCA 2F9SA 4DEJA 4I2UA 3BCKA 2P5QA 4L5OA 1GSSA 2WRTA 1IYIA 1F3BA 2GSRA 2O87A 1KBNA 3CTFA 2R6KA 3PGTA 4KW6A 5IO2A 2GLRA 2I4AA 2NPBA 5ECNB 4MMMA 2GQKA 1MDJA 1MDKA 2HXKA 3KH9A 3UIWA 2H30A 4TRXA 1M2BA 2JACA 1T8EB 2NTOA 5KN1A 2ZUPA 2O8VB 1K0AA 3DYRA 2LNTA 6GSYA 3LFLA 5CNWA 2F8AA 2DJKA 4XCSA 1WMJA 4ZB6A 4KX4A 4Q5QA 3KTLA 4IQ1A 8GSSA 2YZUA 1YY7A 5A4WA 2B3SA 1DSBA 3VK9A 5J9CA 3IHQA 2IMKA 1GUKA 2K8SA 5ID2B 10GSA 1A8LA 1QFNA 2R37A 2E2MA 1QUWA 3EYTA 2P0GA 2WCIA 3GHAA 1S3DA 3CTGA 2YWIA 3P8WA 1T1VA 5DBQA 3BCIA 4N0ZA 2OJLA 3GKXA 4EVMA 3GX8A 3WGDA 1WOUA 2LS5A 5F05A 1AQVA 2YWMA 2CZ3A 3D5JA 4GLTA 2GZYA 2LJRA 2VCXA 2PN8A 5HQPA 5F07A 3UL3A 1YQ1A 1OVNA 1KEBA 4WR4A 5FT3A 1HYUA 2E2GA 3SWLA 4MPFA 3QFAC 3BD2A 5J41A 4O32A 2F8FA 4HQSA 4H86A 2VOCA 3TUEA 1EWXA 5E59A 1LU4A 4HQZA 2WULA 2C0EA 1K0OA 1SJ6A 2YANA 3HVSA 3RDWA 3ERGA 4OD7A 1XVWA 3G7IA 1V40A 2CV4A 4KDYA 2X8CA 1O7UA 3NIVA 4HOJA 2D2ZA 5DQYA 3ISOA 4DSSA 3HVXA 3TJJA 2PERA 4ZXGA 5DDLA 1BAYA 2KUCA 5D8IA 4JU5A 4X1UA 1XVQA 4ECJA 5ECHB 4I6XA 1XBSA 1O8XA 2FCHA 4ZL8A 2GZPA 3EE2A 1WPIA 1XW9A 2VIMA 4EKZA 3DWVA 4OO4A 1GWCA 1OC9B 1BQ7A 3IK7A 2TIRA 1XFLA 1B4PA 4N11A 3BBYA 4KSOA 1RQMA 1XWGA 5CREA 1SJZA 6GSTA 3DKSA 4Q5FA 1R4WA 3ZZXA 2WB9A 4KE3A 1F3AA 3IBHA 1YF0A 2H1AA 2X8HA 5H5QA 3ZRDA 2H76A 3MSZA 2FA4A 2LV3A 4MJCA 2O85A 2WJUA 2JZSA 1PQNA 2R4VA 1Z7PA 3UBLA 1M99A 5CRWA 5KN2A 4NV2A 2M46A 3DRNA 4ZILA 4CW9A 2DSAA 1A2LA 1K0DA 2ON5A 1EZKA 1QXHA 1FOVA 4EC0A 1V57A 3Q18A 4PURA 4PQ1A 2GS3A 1B9XC 2EC4A 1YEXA 3F9UA 5CRDA 2GSQA 4TW5A 1ERUA 2H71A 4ACSA 4TR4A 1EOGA 1Z5YE 2C0DA 4K6XA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2RM5 A;  4MCU A;  5B7C A;

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1V57A

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations