2H0IA

Crystal structure of dsbg v216m mutant
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
ELPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCPYCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVTPAIYYMSKENTLQQAMGLPDQKTLNIIMGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Short-circuiting divergent evolution: laboratory evolution of one disulfide isomerase to resemble another
rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbG
molecule tags Isomerase
source organism Escherichia coli
total genus 65
structure length 229
sequence length 229
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 2h0iA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h0iA02
4XRAA 1ERVA 3KP9A 2GSSA 1WPIA 2LUSA 3QPMA 3H8QA 3H1NA 4N0ZA 1MDJA 2L57A 4TXOB 1EEMA 3UIWA 4E8EA 4ZL7A 4IS0A 1NM3A 2MMAA 4ZL8A 2KOKA 2X8HA 1V40A 3TJKA 3VLNA 3APQA 1LU4A 1Z6NA 4HJ2A 3TUEA 4PNGA 5LCZA 1DUGA 4FYUA 3UARA 2P0GA 4KDXA 4IHUA 1X9SB 4FO5A 5DDLA 3IA1A 3DIEA 2JZTA 1T3BA 3GNJA 2RIIA 3V1WA 1GSSA 3WYWA 1R7HA 2BJXA 1TP9A 5DBQA 4ZL9A 2H19A 2PVQA 2M46A 3GX8A 3AY8A 5J9BA 5AGYA 3CRTA 5CO3A 3TRPA 2IYJA 5C04A 4PUFC 4G19A 4MH3A 1OC9B 3F4RA 2IMDA 5EL8A 3TOUA 5ECOB 3ME8A 4BVXA 10GSA 2H1GA 1XW6A 3KM6A 2MZCA 2V6OA 2LQQA 1X0RA 3L9UA 2AV4A 1M2AA 5ELAA 1OKTA 3VK9A 3HVVA 1ML6A 3I43A 5F06A 3RDWA 4JRRA 4TXOA 5ECLB 3TKSA 1AXDA 3FEUA 4HOJA 5CRDA 1OKDA 4TW5A 4O32A 2OBKA 1XWKA 2IJYA 1FVJA 2C80A 3CSJA 1I5GA 1HNBA 1URMA 2X99A 3ZTLA 3EE2A 5IIZA 1S3AA 2PVOC 2AHEA 1EP8A 1Z9HA 4JE1A 2H0GA 3RPNA 5G5EA 3IBHA 1SJZA 2O89A 2IMIA 3N5OA 1AQXA 11GSA 3QAGA 4I2UA 4KE3A 1SKSB 17GSA 1TOFA 1PX7A 2B5YA 1SD8A 4ULXA 5B8AA 5D9WA 4E8HA 1LJRA 2DMMA 4HEA2 2XPDA 2HNLA 2GSTA 1V98A 3O76A 4J57E 3LJRA 4N30A 4X1UA 2OE1A 3DMLA 3H4KA 1A24A 2FLSA 3LORA 2NBSA 2VAFA 3W8SA 3M0FA 3EURA 4LA1A 2KLXA 4GWRA 2LNSA 1OC9A 2LJRA 5KEJA 1JZRA 2ON7A 1AUCA 5ECIB 4F9ZA 2DIZA 4NV2A 1DBYA 4ACSA 3GMFA 1SYRA 4WETA 5DJMA 2R2JA 1SJIA 4FIWA 1S3CA 1B9YC 2LV3A 3CMIA 4NAXA 4ML6A 4DVCA 4KH7A 3M9JA 3CTGA 1VGLA 1FOVA 2IMFA 1J08A 3LSZA 1Y6EA 5D93A 3TOTA 3C71A 1M0UA 4NHWA 4BPYA 2EC4A 2K9FA 3GX0A 1U87A 1R5PA 3KH9A 4TN8A 1O6JA 3RAZA 4KUNA 2JSZA 1HNCA 3PINA 3H79A 2V32A 5J9CA 5INYA 4I97A 4BWQA 4MZBA 4WEYA 3RHCA 1S3DA 4IP1A 4I5QA 2RM5A 3KP8A 2GTUA 3BCKA 3TDGA 5HR3A 1ZMAA 1XXUA 3DEXA 22GSA 1NSWA 1WJKA 2M80A 2RUFA 2AJQB 3NOFA 3APSA 2HXKA 2FUG2 5IMAA 1K0AA 2VL9A 4MJBA 2GDRA 2GT6A 1SK2A 2WDUA 18GSA 5HR2A 1KEBA 4XIHA 5F07A 1THOA 2OJLA 1M9BA 3TJGA 1A2JA 2EIQA 2GZPA 4FH8A 2IIYA 2YWMA 2I9HA 2K18A 2K6VA 1PMTA 2XC2A 3D22A 3EYTA 3CSHA 4PURA 3UOMA 2H30A 4TXVA 1Z7PA 2GZYA 4O7HA 3W6GA 3F9UA 4ID0A 3D4MA 3ERGA 3QAVA 4WF4A 5COHA 2YANA 2LNTA 3BCIA 2DC5A 4HJMA 3D0ZA 3C1RA 1J0FA 2H70A 2O8VB 5ELGA 3J7Yk 1BEDA 5H5RA 4IBPA 2R5GA 3FZAA 4G10A 3TJBA 1G7OA 3TB2A 2DIYA 2XPEA 5DALB 4OO5A 2NTOA 1AQVA 2CV4A 1EGRA 1PX6A 5J4UA 2QKEA 1K0BA 3D4TA 2E2GA 2H72A 3TKSC 3VWXA 4HU9A 3J7Yb 3HJPA 3UVHA 4EDZA 5KN1A 4BA7A 2PERA 3CRUA 2CVKA 4POKA 1A8YA 1YZXA 1V58A 1FO5A 3KEBA 5D9XA 4ZB8A 4CHSA 2GQLA 3LFLA 1OE7A 2L5OA 3LGCA 3VPTA 3ZYWA 3RPPA 2A2RA 1A0RP 3ED3A 2M72A 3LXZA 3L9VA 3M3MA 3DVWA 4IVFA 3A2XA 3E3EA 2F3MA 4L0UA 2K8SA 1OC3A 3NZNA 4X43A 2OADA 4HDEA 5JCGA 4K9ZA 1H75A 1WIKA 4KSOA 1K0NA 5ECSA 1XZOA 3GURA 3UL3A 4EUYA 1RQMA 4G9HA 1USBA 4KX4A 2WJUA 3TGZA 3KH7A 4F03A 5IMCA 3EC3A 1GRXA 1GLPA 1O8WA 1R26A 3P2AA 3L9SA 1K0OA 4XCSA 4CDOA 5IMVA 2MBSA 1ZZYA 1T4YA 4JEDA 3HA9A 1W89A 3KIJA 1GUHA 2BMXA 3F3QA 5F05A 2N5FA 2IWTA 2ZCTA 1WMJA 3TJJA 1XWGA 4DEJA 1PL1A 2VL2A 1TK8B 4IQ1A 1FB6A 2X64A 4ECJA 4GQCA 2KUCA 4YH2A 4ECBA 2H1DA 3Q18A 4HZ4A 3ZFBA 1PA3A 3KGKA 2QSIA 6GSXA 4QL7A 1QK8A 1TRVA 3E0UA 3IPZA 4Q5RA 1HNAA 4RQXA 2LSTA 1V57A 2QC7A 3OR5A 1ZYQB 3IAS2 1AIUA 3GN3A 2HSHA 2HE3A 3GKNA 2LJKA 5B6MA 2LQOA 3KTBA 4DSSB 5C00A 2CQ9A 4RI7A 3EWLA 4EO3A 4K7NA 3A5WA 4LMVA 1CQHA 4TKYA 1XOAA 1PD21 2DJJA 2JZRA 2N5AA 4MCUA 5CRGA 4WR4A 3MAKA 3HY2A 2J9HA 4K0GA 5G5FA 4MF6A 4HS1A 1O73A 2YP6A 1Z6MA 3GHAA 1F9MA 5H5QA 1M99A 2FNOA 3JCML 5LNKe 2MMOA 5IM9A 1HD2A 4YAPA 1TKDB 1TI3A 3F0IA 3PGTA 4I2TA 1EZKA 4ZB6A 4PXOA 4V2LA 1XCCA 1GTIA 1VF3A 2R4VA 1EGOA 3VPQA 4HQZA 3F63A 2KHPA 3N9JA 4NXIA 1H4OA 3TRXA 1AC1A 2FHEA 2C3TA 1N8JA 2H6ZA 3WD6A 3ERWA 5DQYA 3O3TA 2GSRA 1T4ZA 2BTOT 1T8EB 2I1UA 5DAKB 1PN9A 2LJAA 3IOSA 2MYGA 2VCVA 5DVBA 2KP1A 2H0HA 3P90A 2V6KA 1G0TA 4F82A 3QMXA 5AN1A 4MP4A 1GSDA 2AYTA 3G7IA 2PMTA 1MEKA 4KB3A 3I9V2 5LD0A 2H71A 14GSA 5JWQB 2L4QA 1UC7A 3CXGA 2ZUPA 5JCWA 1A8LA 3ISOA 1YF0A 3LYKA 4H86A 1K3LA 2DLXA 1U3IA 1B4QA 3EINA 6GSVA 1K3YA 1FG4A 4K7OA 2O87A 3FW2A 3ZFLA 5FHIA 2C0EA 4JR4A 5GZZB 1SYXA 3F3RA 4K8MA 3DYRA 1PRXA 1ZCPA 2EIOA 2CVDA 3DVXA 2HSYA 5GAND 4MABA 5G31A 3ZVJA 4YAVA 1BAYA 2DMLA 2VCXA 1F37A 2H1BA 1GSQA 2TRXA 5HFIA 1U88A 4TVEA 3D21A 4MJAA 2MBTA 4F2IA 1WP0A 2XBIA 2GQMA 1Z7RA 2IY2A 1BX9A 3EMPA 5DAKA 2R6KA 5A4WA 4MJEA 4V2MA 4GQFA 4OO4A 2VL2C 2HZEB 4OD7A 4ZIJA 5D9VA 1B9XC 3IK7A 4V1Ag 4N10A 3GTUB 2A2SA 4EL1A 2VLVA 1ERTA 3C73A 3GH9A 2YZUA 2WGRA 2YJHA 4ECCA 1SK1A 2CZ3A 4CW9A 1GTAA 1EEJA 2DJ3A 2YN1A 2P31A 5HFKA 1DE1A 2NDOA 5D96A 5DCGA 4NV5A 5IOXA 3SWLA 4WF5A 3P8WA 2VM1A 3IRAA 5J5NA 1HQOA 3ZREA 3MDKA 1V9WA 3HDCA 2PN8A 1JLVA 5A4UA 1DE2A 3BJ5A 2X8GA 3ERFA 3LEFA 4NHZA 4POLA 1QFNA 4RQRA 5DJLA 4AF2A 3IE3A 3TCOA 1Z3EA 1PKZA 4NWYA 5D73A 2OE3A 4BWSA 2O85A 2VO4A 3R2QA 3US3A 1EOHA 4OCFA 4ILFA 3FR3A 3FR6A 4JU5A 2YNXA 4JBBA 3ZMKA 1X5DA 3TKSE 4HZ2A 3VFIA 2WS2A 4ZXGA 4JR6A 4KSMA 3LWAA 3QAWA 4MMMA 5GAPD 2FA8A 2HZEA 3MNGA 1SL0B 1LBKA 4ECIA 1T7PB 4PQHA 3GTUA 1MD3A 5IMFA 2D2ZA 3GSSA 3F4SA 2GGTA 4KNDA 4K6XA 2H1AA 1GSUA 3LG6A 1XVWA 3UAPA 5FWGA 1T00A 2Z9SA 4TR3A 2GVPA 5ECKB 5ECQB 3RBTA 1XWCA 2GSQA 4IGJA 1GP1A 1TXXA 3FHKA 3VWUA 2V41A 2C8UA 2LKUA 5CP1A 2ZNMA 1UA5A 4GSTA 4MPFA 4N0VA 3HVXA 5ECNB 2IFQB 1K0MA 4X0XA 4MF7A 2IPAA 2YZHA 2GQKA 1BJXA 4WKWA 1JZDA 1ZL9A 2HZFA 3HJOA 1GUMA 4ML1A 2FY6A 4LLRA 2MMZA 4XS6A 2I3YA 5HFGA 1F2EA 1WOUA 4MH2A 4OCEA 4TR4A 3PH9A 4KDYA 1XPVA 2G0FA 2I81A 2FWEA 1YKAA 2HI7A 4XS4B 1GWCA 2CAQA 2RLIA 1UN2A 4GXZA 5JWOB 5CAXA 5J3RA 1XIYA 1A2LA 4N11A 2VM2A 2PUKC 4K7IA 3ZZXA 2B3SA 2FA4A 2VLTA 1GL8A 2AAWA 8GSSA 4O92A 3WGXA 2H0IA 3UMAA 1OAZA 3GH6A 4BL7A 5KN0A 4IP6A 2YCDA 2FWHA 4MDCA 3IV4A 4JZQA 2KP2A 4KW6A 3GFKA 2GZZA 4EVMA 4J56E 4AJ8A 2RM6A 1TDIA 2YOIA 2OE0A 3D5JA 2DBCA 9GSSA 2CAIA 2YV7A 3ZIJA 2VCQA 5ECMB 3DD3A 4TR0A 5KN2A 1MTCA 2H6YA 4MF5A 3U5RE 4ZILA 1ILOA 1AW9A 1N2AA 1SD9A 4TR1B 2IFQA 1G6YA 4XTSA 1X9MB 1VF4A 2VCZA 4P3YB 4K1FA 4Q5FA 5ID2B 3UJ1A 1SL2B 1YQ1A 3HD5A 3QOUA 1RW1A 3HYPA 5ECRB 5DALA 1FVKA 1KNGA 2J23A 1GSEA 2ON5A 20GSA 2LRTA 1M2DA 4XS4A 2IMEA 2OACA 3VI7A 4EE0A 5B7CA 6GSYA 5ABRA 4LMWA 1QUWA 1O81A 3KCMA 4HQSA 1VF2A 2PU9C 3L0HA 3KD0A 2VL3A 1U6TA 4ZBAA 5KN3A 1YEXA 4WBRD 4HI7A 4ISDA 5EPFA 2B5EA 2YWNA 5DCHA 4AGSA 2P5RA 2YWIA 4NMUA 1A2MA 3VWWA 1SKWB 2L6DA 1WWJA 5EVOA 3LYPA 5J41A 2VLUA 1ZOFA 1PKWA 5ECHB 5AIXA 1KTEA 5A4VA 1X9WB 2G2QA 2AB6A 3F8UA 1X5EA 4POBA 5HQPA 4KAEA 4OFTA 4OMVA 4HUAA 1XOBA 3HKRA 1F3AA 7GSSA 1EV4A 3WT2A 3MSZA 3GRXA 3PR8A 2V1MA 3RHBA 2L4CA 3ZL5A 1TU7A 4YQVA 4Z7XA 4TR1A 3FKFA 5B6NA 4XS1A 2B1LA 2VCTA 2HT9A 3FY7A 2R37A 3HVSA 3S9FA 4L0WA 2DSAA 4FYBA 3DKSA 4MPGA 3ZITA 4FYCA 2TIRA 2H01A 5A5KA 4O5RA 1YY7A 4EF0A 2WZ9A 2FWFA 5JWRB 2H76A 4RUVA 1A0FA 1B4PA 2TRCP 4LL1B 3P7XA 1WRYA 3L4NA 4OFMA 5L71A 1BQ7A 3BOAA 3EVIA 1ERUA 2ALBA 3I6AA 3IK9A 3MWHA 2C0DA 4BVYA 5IPGA 1E2YA 2FWGA 3EMXA 3HZ8A 1T1VA 1V2AA 2WRTA 1NW2A 2NVLA 4HU7A 2MMNA 6GSWA 2JSYA 4DSSA 1KBNA 2F51A 2NPBA 4KCEA 2F8AA 1GNWA 5G1KA 1ABAA 1O7UA 2B6MA 3I69A 4I8BA 2VIMA 2H8LA 4IELA 2CT6A 3KTLA 1TW9A 3FZ4A 3LXTA 1K0CA 3GL5A 1AAZA 3A2WA 2C1YA 1ERWA 1Q4JA 1MD4A 3DGQA 5IPHA 4G2EA 2CZ2A 2WULA 3TKQA 2H73A 5HR0A 3HHVA 3UVTA 1NHYA 5IMDA 3M9KA 2XBQA 3IDVA 1DSBA 1G7EA 2CVBA 3VI5A 4EKZA 4L5LA 2V2GA 1CQGA 5IMZA 2OA7A 1XW9A 4F0BA 2VCWA 4GLTA 1FHEA 5IOWA 1SENA 2LRCA 3DXBA 2OBIA 3GIXA 1U3AA 3F4TA 5CRWA 5FT3A 1C72A 2WB9A 1PQNA 4WXTA 3TKPA 1XWBA 4Q5QA 1TK0B 1W4VA 2PWJA 3K8NA 4QL9A 3GKMA 2JACA 4MZWA 3FYGA 2C3QA 2JADA 1K0DA 1JZWA 2RUEA 1SK0A 3QR6A 5CREA 3C8EA 3D6IA 5G30A 1PL2A 1GSYA 3LQ7A 2F9SA 5D8IA 1NHOA 1K3OA 2LEGA 3UBLA 3VURA 2YWOA 3H93A 3C7MA 2H75A 4J2FA 3M1GA 12GSA 1QGVA 4KDUA 3KZQA 2YPMA 1Z5YE 3TKRA 3A3TA 2H74A 2CX3A 1VF1A 4AJ7A 2DJ0A 2A4VA 4IQAA 1ACVA 4IW9A 4GTUA 5ECPB 2C3NA 3HJMA 1VRSD 3QD9A 1YEPA 2N5BA 1FW1A 2C4JA 1UVZA 2PGTA 3ME7A 2IL3A 1XBSA 3EU4A 4MJCA 4PQIA 3GA4A 1ZGNA 4ZB9A 1PSQA 3Q6OA 3E9JB 2GT5A 1OYJA 3QDNA 1YF1A 1SKRB 2PPTA 2FD3A 3FR9A 1RK4A 4K2DA 2ES7A 4MLYA 4ZBBA 1OE8A 2H66A 5IQYA 2LS5A 3KMOA 4PX1A 1TI1A 1O85A 2LRNA 2FCHA 1QMVA 2GLRA 2JZSA 3GV1A 4YQMA 4RI6A 1WE0A 4EC0A 2O7KA 1EWXA 4KGIA 1OC8A 5E59A 4WR5A 3KXOA 3ZLPA 3BD2A 2I4AA 1MDKA 1GTBA 1O8XA 1GNEA 1GH2A 4PQ1A 3GL3A 1OVNA 1E6BA 2FGXA 3CSIA 2VD1A 1YKCA 1R5AA 3IC4A 2E7PA 3HCZA 5IO0A 5ENUA 3ZIVA 3IHQA 4L5OA 5F0GA 4ZBDA 2C0GA 1SL1B 2K8VA 2LTKA 3TJFA 2P5QA 6GSSA 2E2MA 5CNWA 3GKXA 3GSTA 5E4WA 3HZ4A 1GSFA 2HRNA 5G1LA 2HYXA 5G2ZA 3VWVA 1XWAA 2CX4A 1SJ6A 1I9DA 3Q74A 1TTZA 3GUSA 4PNFA 1XW5A 3WGDA 2REMA 3QCPA 1BYEA 4L8EA 4IKHA 5JCUA 4PGTA 4F0CA 1G6WA 3HXSA 3TRQA 13GSA 4IJIA 3KMNA 1TRSA 1IYIA 2E0QA 1F6MC 2B1KA 4WBJA 2L59A 4PUAA 1JHBA 2IMKA 2R3XA 3CBUA 4OWYA 1TRUA 5DQSA 1GULA 3FK8A 2WFCA 4IN0A 1SU9A 1F3BA 3IAM2 5H5SA 4IJ3A 5B8BA 5GSSA 4XRDA 2B7JA 1QQ2A 2JL4A 5CRHA 2IN3A 3GYKA 1X5CA 3DWVA 2QGVA 3FZ5A 1YDKA 4V1Ap 2PBJA 3KJYA 3IXRA 1B48A 1GUKA 1MDIA 1A23A 2YV9A 3BBYA 1PGTA 1QXHA 4TOPA 2X8CA 1EOGA 3FRCA 5F8BA 3ZMLA 1THXA 4D73B 2OKAA 2HRFA 2VUPA 4MZCA 1FAAA 3SBCA 1M7TA 4GF0A 2VD0A 1FB0A 2YJ7A 4DSQA 3WGEA 1J9BA 1IYHA 1ZYEA 19GSA 2F8FA 2WCIA 2JU5A 3EU3A 3W8JA 4NPBA 4YQUA 4KCAA 3GKKA 3FZ9A 3ZRDA 1TU8A 3Q19A 1GTUA 4MK3A 3UEMA 3CYNA 3DRNA 2XHFA 1YJ6A 1BG5A 2DJ1A 4V2NA 3UBKA 1JFUA 5HR1A 3QFBC 3U6VA 4I6XA 2B5XA 4GSNA 5IO2A 3CTFA 1TK5B 3G9BA 2L6CA 3A2VA 4AJ6A 1TRWA 5GSTA 2HLSA 3M8NA 5EY6A 4TRXA 4Q5NA 1JLWA 5D9TA 2L5LA 4K0NA 3ZVJD 2HFDA 1B8XA 4GSSA 1EV9A 1R4WA 2DJ2A 3WT1A 2VOCA 3IR4A 5CYYA 2H6XA 4XHMA 1TJDA 1AQWA 2B7KA 4DSRA 3O6TA 3G7YA 1M9AA 1XVQA 16GSA 4GCIA 1ST9A 4MA9A 5AIVA 3C1SA 2GS3A 3QFAC 4D73A 4OFNA 1JZOA 4EDYA 4EXJA 2EIRA 1ON4A 1Y25A 6GSUA 3F6FA 1Q98A 3G7JA 1GLQA 2CA8A 3NIVA 5AISA 1XFLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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