2H0IA

Crystal structure of dsbg v216m mutant
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
ELPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCPYCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVTPAIYYMSKENTLQQAMGLPDQKTLNIIMGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Escherichia coli
publication title Short-circuiting divergent evolution: laboratory evolution of one disulfide isomerase to resemble another
rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbG
total genus 65
structure length 229
sequence length 229
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 2h0iA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h0iA02
3A2VA 3DEXA 3GSSA 2MMOA 4HQSA 1SJZA 5DCHA 2OE1A 3IHQA 3CSIA 2GZZA 4ZBAA 3D5JA 5D9TA 1OC9B 5EY6A 2CVKA 3P90A 2VM1A 1THXA 5G2ZA 2I9HA 2JSYA 4MMMA 1V40A 5JWOB 5G1KA 3UVHA 4HU9A 1AQWA 2K8VA 2V2GA 2FWFA 1W4VA 2MMNA 3EMPA 2WGRA 1K0NA 2B7JA 3VWXA 1MD4A 1V9WA 2O8VB 3QAGA 1SENA 3ZVJA 1YQ1A 2YJ7A 1EZKA 1WIKA 4IELA 4PGTA 5JCUA 1EOHA 2WB9A 9GSSA 2F51A 2B1LA 3TDGA 1SL2B 2HE3A 1RW1A 3IRAA 4TKYA 5IMZA 5DDLA 1JZWA 5KN3A 3EU3A 1B9YC 1TRSA 4IGJA 3TCOA 3ZRDA 2H6XA 2M46A 3Q19A 1OKDA 5HR1A 3FR3A 2VL3A 4N11A 3L78A 2L59A 2IYJA 1FB6A 3N9JA 5F8BA 3C71A 4MJBA 4N30A 4V2NA 1IYHA 3UEMA 6GSYA 2GDRA 3VPQA 3C73A 5ABRA 3LQ7A 4YQUA 1ERVA 1RQMA 1XWAA 3GYKA 2H0HA 4GRFA 3DIEA 3EU4A 1WMJA 4POKA 4OFMA 2CZ2A 4TXVA 4K8MA 3KIJA 3F3QA 3GMFA 4F9ZA 3U5RE 1TTZA 4EKZA 2VCVA 4KDYA 4K2DA 3CYNA 1F6MC 2NTOA 4HDEA 2M80A 4PQ1A 1IYIA 1E6BA 2R3XA 1JFUA 2AB6A 3HJPA 4K1FA 4JU5A 2VOCA 1OC9A 2PUKC 1K0CA 2DJ2A 4LMVA 2LEGA 5IMCA 1KTEA 5JCGA 2MMAA 4HEA2 1BYEA 1WP0A 3D6IA 1DSBA 2GSQA 2FWHA 1SK1A 2YWNA 13GSA 3FZ5A 3LWAA 3M3MA 2V6OA 2K6VA 2VLTA 4K0NA 1UC7A 1B48A 1B8XA 5D8IA 1AW9A 5AIXA 3DXBA 3HJMA 4AF2A 4BWSA 4TXOB 3IK7A 3ZMKA 1QQ2A 1BAYA 3GKKA 3KEBA 3NZNA 5AN1A 3D4TA 3ZL5A 3IA1A 3F0IA 4I2TA 2LJKA 2WCIA 5ECMB 2GT5A 2A4VA 4JR4A 1BX9A 5DJLA 4WETA 4X0XA 5INYA 3HZ4A 3WGXA 1QGVA 2V6KA 1UA5A 4NAXA 1M9BA 3M9KA 5G30A 2ON5A 4XTSA 1TI3A 3Q18A 1BJXA 1F3BA 2OE0A 3TKPA 2HT9A 2B7KA 2VIMA 1JZRA 5IOXA 3TKSE 4HQZA 5D9XA 1ZYQB 1G7EA 4WKWA 2L5LA 3TJKA 2LKUA 3D22A 4PUAA 1QMVA 2ZUPA 5IMVA 1FHEA 1LJRA 3GL3A 1YKCA 1XW9A 2VAFA 4EVMA 1MTCA 1TKDB 2GVPA 4KH7A 4KDUA 2LUSA 2LRTA 3GKXA 4KB3A 4MF6A 4ZL7A 1TK0B 3UJ1A 2QSIA 4CW9A 3GN3A 5HFKA 2B5EA 4XHMA 4XS4B 3KMNA 4KCEA 3LFLA 3TKSC 3HKRA 2C8UA 3GH6A 1ST9A 4KUNA 2GGTA 4RQRA 3J7Yk 1TRUA 3BOAA 4YAVA 1KEBA 3BCIA 4ZXGA 4MZCA 2VCTA 2KHPA 1XVQA 1K0BA 3HJOA 1FVJA 4OMVA 2GSSA 2WRTA 4TXOA 3VLNA 3LXZA 4IHUA 1U87A 5HR0A 5DQSA 2KUCA 2FA8A 5DCGA 1SK0A 4AJ8A 3TRXA 1T00A 3FZAA 1PX6A 2FHEA 2J23A 3PR8A 4N0VA 2O87A 4TR1B 2ZNMA 4AJ6A 5H5QA 4WEYA 4KNDA 3BCKA 5HFGA 5J41A 2GSRA 3L9UA 1Z6NA 1O73A 4MJAA 5GAND 2IWTA 4KAEA 3UBLA 2LQOA 1A23A 1ERWA 3WD6A 3BD2A 2FNOA 3TB2A 2PVQA 3GV1A 5L71A 2H72A 2NDOA 3GSTA 2C1YA 1AC1A 3HZ8A 3QMXA 2EIOA 4NPBA 4JE1A 1Z5YE 2E0QA 4KA0A 2FA4A 1HYUA 1XOBA 2XPEA 1A8LA 3RHBA 2OA7A 2XBIA 4IP6A 4X43A 4TN8A 5J3RA 3K8NA 1PSQA 2B6MA 4IN0A 2QC7A 1Z7PA 1PKWA 4MPFA 1T3BA 4I2UA 4E8EA 3ME8A 3UVTA 1GSQA 1N8JA 1M2AA 2IIYA 4ECBA 3SWLA 1AXDA 4MCUA 2VCQA 2IFQB 2JACA 5CRWA 1V57A 1TDIA 4HS1A 3VURA 5C04A 4NHZA 3C1RA 2ES7A 3LYPA 4NMUA 2A2RA 2FWGA 2HZEB 3F4TA 4J2FA 1K0OA 1OYJA 5H5SA 4TR4A 5A5KA 4GSNA 1YEPA 4I5QA 2IY2A 5ELAA 1PMTA 1TU7A 1PN9A 4HUAA 4GTUA 2FD3A 4LL1B 4G2EA 3WT2A 2FCHA 5JWRB 3G7IA 2WZ9A 4TR1A 4CHSA 2EC4A 4IBPA 3ERGA 3O76A 1ERTA 1A24A 4TVEA 1EGOA 3FYGA 2I4AA 1EGRA 3ZFBA 3TJGA 3KP8A 5CO3A 2VM2A 5FHIA 2GQMA 2AV4A 2R4VA 4H86A 1R7HA 5D9VA 3H4KA 1SKWB 4Z7XA 2O85A 1R4WA 3EURA 4BWQA 4XIHA 1SU9A 1XPVA 1AAZA 2GZYA 2L57A 4RUVA 2B5YA 2R5GA 3LG6A 1X0RA 1ML6A 1EV4A 2IMEA 4LL4B 4BVXA 3MDKA 2JZRA 3KZQA 4KCAA 1Z7RA 1WPIA 3ZMLA 2F9SA 2TRCP 3Q6OA 2YV7A 3APQA 5LCZA 5KN1A 1JZDA 1WWJA 5G1LA 5H5RA 3CMIA 4IQAA 4DEJA 2FUG2 2H75A 1I9DA 4HJMA 5HQPA 2IFQA 4Q5FA 1TOFA 3TRPA 4KSMA 3VI7A 5J4UA 1A0FA 3QR6A 3L4NA 5D96A 4K7NA 2RUEA 3DVWA 3GRXA 3KTBA 1NHYA 1PX7A 4BPYA 3S9FA 3HYPA 2HZEA 3H8QA 3TOUA 2ON7A 1NHOA 3DYRA 1Q4JA 1GTIA 3JCML 2NVLA 2V1MA 4ACSA 2VCWA 3ZVJD 1GNEA 1W89A 3VWVA 1TRVA 1U3AA 4ISDA 3UIWA 1LBKA 4TW5A 2B1KA 2NPBA 3R2QA 1CQHA 2E2GA 2H6YA 2H8LA 2HZFA 2AHEA 1BG5A 4TRXA 1QFNA 2H73A 1A2LA 2VL9A 3A2WA 3IXRA 4N0ZA 4MPGA 4KE3A 2L4QA 3F6DA 1G7OA 1O6JA 4O5RA 1XWBA 2PMTA 5ECRB 3TKSA 3D0ZA 2DC5A 2VLVA 1TU8A 3DKSA 3QCPA 2Z9SA 2OE3A 1T8EB 3P2AA 4MP4A 3LEFA 4PNGA 5EL8A 2MBTA 1GUKA 4F2IA 2X8CA 2E7PA 1GTBA 3KCMA 2O89A 1GSDA 3C8EA 2EIRA 4OCEA 3ZLPA 2OACA 4Q5RA 1F2EA 1Q98A 1TRWA 2HSYA 1U88A 4JZQA 2YWOA 3M1GA 1EV9A 2LS5A 1EP7A 4ID0A 4MH3A 1G0TA 4O32A 3UBKA 2PGTA 1ZMAA 1FO5A 1O7UA 1SKSB 2LNSA 3QAVA 4MLYA 4K0GA 2OKAA 3RDWA 2LNTA 4QQ7A 1M99A 2C0GA 2OJLA 3GHAA 1UVZA 1R5AA 3LORA 4D73B 4L5OA 1QXHA 5ECQB 1T1VA 4EXJA 3RPNA 3W6GA 2HYXA 4OFTA 2YP6A 4ZB9A 1V98A 2CA8A 1TJDA 3BJ5A 4MZBA 3KJYA 4ILFA 2PVOC 4GQFA 3IV4A 1DE1A 4NWYA 5F05A 4HI7A 4IKHA 2K8SA 1SD8A 2AJQB 2CV4A 5DALA 3UARA 4ZB8A 1O8WA 3CSJA 1X5DA 3ZZXA 5DAKB 3WYWA 3GIXA 5KEJA 3GX8A 3HXSA 2AYTA 3WGDA 4BVYA 4IQ1A 2C3NA 2IMFA 2DBCA 2VD1A 4BA7A 2GSTA 3VWUA 3GL5A 3KH9A 1TXXA 1FB0A 2R6KA 2AUVA 3IBHA 1GULA 1M9AA 3QAWA 2IN3A 1FOVA 4WR5A 2CX3A 3QFAC 1XOAA 2L6DA 1U6TA 1LU4A 1TI1A 2K9FA 1TK8B 1T4ZA 5EVOA 2GTUA 3KM6A 4ZILA 3EINA 4K9ZA 3G9BA 2P5RA 3GNJA 3GTUB 3HDCA 3CXGA 5DQYA 1F3AA 4DVCA 4QL7A 5DBQA 5B7CA 5KN2A 1B4QA 3APSA 3QDNA 1ON4A 1S3AA 1GL8A 1Y25A 2DIYA 2IMKA 5AISA 1HNBA 3FRCA 2VLUA 3D21A 2VL2A 3GKNA 4WF4A 4V1Ag 4D73A 1AQXA 4IVFA 2HRFA 4GQCA 1EOGA 3VWWA 1G6WA 5ECOB 1SJIA 2CAQA 4MF7A 4ECJA 5IIZA 3V1WA 1YF1A 1PA3A 1OKTA 4K6XA 1VGLA 2DJKA 1GSYA 4AGSA 2VCZA 5IO0A 3KGKA 5ECIB 4L0UA 5IMDA 3IC4A 1VRSD 2PN8A 5IO2A 1GNWA 2MMZA 1XCCA 2A2SA 20GSA 3HD5A 1MD3A 1J08A 2I1UA 2HLSA 3EE2A 5C00A 3FZ9A 5DAKA 1AQVA 3LJRA 3KTLA 5F0GA 2H6ZA 2JU5A 2H74A 4PURA 1WOUA 2IMDA 2QKEA 3HHVA 3MWHA 2F8FA 1OC3A 4O7HA 3NIVA 1K3LA 2L6CA 4GSSA 16GSA 4NV5A 2KLXA 2H76A 3ERFA 3H93A 5ID2A 1PGTA 1MDJA 5CP1A 1GSUA 2KP2A 4EDYA 5G5FA 3DWVA 2FLSA 3W8JA 2DJ3A 1FG4A 3DD3A 4FYBA 2C80A 2IJYA 1RK4A 5DVBA 4QL9A 1ZGNA 5FWGA 3GUSA 1XBSA 2H0GA 5ENUA 1GWCA 3PH9A 5A4VA 1X9WB 2H1AA 3D4MA 1MEKA 4J56E 2PERA 5E4WA 3GTUA 2XPDA 1MDKA 1PKZA 2CQ9A 1GSSA 4JBBA 3HY2A 2H1GA 2R2JA 3NOFA 1J9BA 3DRNA 5IPHA 2FGXA 2GZPA 1GTUA 2X64A 3ZIJA 2DSAA 3I6AA 4K7OA 3LSZA 2LRNA 4OO5A 1JZOA 4F03A 4EO3A 4POMA 2RM5A 5CYYA 4EE0A 4RI7A 2G0FA 5FT3A 1YKAA 1Z6MA 4PQIA 2LSTA 1QK8A 4MK3A 1PD21 3U6VA 11GSA 1JLWA 1XWKA 6GSSA 2VL2C 4MF5A 3M9JA 1AUCA 5GAPD 4TOPA 4DSSA 1O81A 2HI7A 1TK5B 4EC0A 3HA9A 1Z9HA 2H30A 1GLPA 1S3DA 2REMA 4ML6A 2DJ1A 2RIIA 1ILOA 14GSA 1CQGA 2V32A 3E9JB 3ISOA 5B8BA 2LRCA 1OAZA 2BJXA 2VCXA 4NV2A 2IPAA 4GLTA 4F0CA 3GFKA 4XS6A 3EMXA 4ZIJA 3UOMA 1BQ7A 2DJ0A 5E59A 1A0RP 3TOTA 3FKFA 3IOSA 3FW2A 3KXOA 2FWEA 4GXZA 2J9HA 1SKRB 2HXKA 3GX0A 4V2MA 1DBYA 6GSWA 2OBIA 1SL0B 2TRXA 4LMWA 2HFDA 4PUFC 2B3SA 3MSZA 1XFLA 4KGIA 2WS2A 4GF0A 2JSZA 1ZL9A 1A2MA 4ML1A 1VF3A 5GSSA 1DE2A 2N5AA 1SD9A 3F8UA 3ERWA 4FIWA 1M0UA 4I6XA 3TUEA 4YH2A 4MJEA 1XXUA 3CRUA 4BL7A 3VFIA 2YWMA 4XCSA 1B9XC 4PNFA 4L5LA 1M2DA 1F37A 4F82A 3TGZA 4XRDA 2HRNA 7GSSA 1BEDA 2VUPA 1YZXA 2EIQA 4NXIA 2C3QA 3APOA 5ELGA 5CRGA 3LXTA 2IMIA 5IMFA 3ME7A 6GSVA 4YAPA 1EWXA 3ZREA 4EF0A 2LV3A 4WXTA 1R26A 1M7TA 2F3MA 3C1SA 5ECPB 5J9CA 4OO4A 5IOWA 4IS0A 3DMLA 4OD7A 2VO4A 2LJAA 1KBNA 3FHKA 4Q5NA 5B8AA 5DALB 2LTKA 3F63A 4OFNA 10GSA 1K0MA 1VF2A 4WBJA 2RLIA 2GQLA 1NM3A 2CAIA 2MBSA 4L0WA 3OR5A 1ACVA 1AIUA 2N5FA 2P31A 3F6FA 4EUYA 3UMAA 2GS3A 3E0UA 2NBSA 2C0EA 4JR6A 1FAAA 3UL3A 1WRYA 1XWCA 1R5PA 4KX4A 4HJ2A 4MA9A 4ZL9A 1Y6EA 1TP9A 4KDXA 3W8SA 3KMOA 3CBUA 3ZITA 3HVXA 3FK8A 5ECHB 4MABA 4IJ3A 1K0AA 5AGYA 2OBKA 4F0BA 2C4JA 5D9WA 4ECIA 3MNGA 1QUWA 2DLXA 4XS1A 6GSUA 4ULXA 3ZIVA 5HR2A 3TJBA 3A5WA 3KH7A 4G10A 2XC2A 2YWIA 1EEMA 1H4OA 2C0FA 3LYKA 4IJIA 4RQXA 1WJKA 4MJCA 6GSTA 3SBCA 1ERUA 8GSSA 4X1UA 3RAZA 2X99A 1XW6A 3E3EA 5D93A 1A2JA 1SL1B 1X9MB 2DJJA 3F9UA 4FO5A 3PINA 2XBQA 4GCIA 5CAXA 3DGQA 3HCZA 2PU9C 3VI5A 4IW9A 2H70A 1USBA 3QD9A 4TR0A 4MZWA 4O92A 3I9V2 5GZZB 1C72A 1YEXA 1GLQA 4YQVA 1K3OA 4J57E 3US3A 3FY7A 3A3TA 3F4RA 3IAS2 1OE8A 2DMMA 1ZYEA 3HVSA 3LGCA 1ABAA 5LNKe 5F07A 5IPGA 1TW9A 4E8HA 2C3TA 1WE0A 2D2ZA 4FH8A 2GLRA 22GSA 2E2MA 2WDUA 5JCWA 4V1Ap 4G19A 1YJ6A 2WFCA 2CX4A 4POLA 5A4WA 2KP1A 3L9VA 3C7MA 4EDZA 2H01A 1K3YA 4MDCA 5ECLB 1N2AA 4FYUA 18GSA 3L0HA 1XW5A 2PPTA 5G5EA 1FVKA 5ID2B 1I5GA 2QGVA 1EEJA 2L4CA 4MH2A 5LD0A 3FZ4A 2YV9A 3F4SA 1XVWA 3IDVA 4V2LA 3UAPA 2CT6A 2WJUA 3G7YA 1PL1A 2CVBA 2YNXA 1GUMA 1GRXA 3EC3A 4N10A 2MZCA 1V2AA 4JRRA 2C0DA 2DMLA 4WF5A 1URMA 1GSEA 1ZOFA 4WBRD 4GWRA 2PWJA 5AIVA 1A8YA 3DVXA 2OADA 4POBA 5CREA 2BMXA 2ZCTA 3N5OA 2XHFA 3IE3A 1PQNA 3M8NA 3H79A 5CRHA 2R37A 1GH2A 1T7PB 1XWGA 3ED3A 2P5QA 2RUFA 5JWQB 1PL2A 3QFBC 2PBJA 4K7IA 3IAM2 5IMAA 3FR6A 4GSTA 5DJMA 3AY8A 1SYXA 3QOUA 3KP9A 1PRXA 4TR3A 4HZ4A 2H1DA 1MDIA 4CDOA 1GUHA 1S3CA 3RHCA 3EYTA 2CVDA 3O3TA 1E2YA 2YCDA 3BBYA 2F8AA 5CNWA 3HVVA 3G7JA 2M72A 5F06A 3I69A 3Q74A 1NW2A 2LQQA 2L5OA 4OCFA 1V58A 12GSA 3FEUA 4WR4A 4DSSB 3WGEA 1OC8A 1X5EA 1VF4A 2O7KA 1VF1A 3QPMA 1T4YA 3TRQA 2H66A 1HD2A 1XIYA 3CSHA 2DIZA 2HNLA 3RPPA 2X8HA 1FW1A 1GP1A 3M0FA 4LLRA 4P3YB 3H1NA 6GSXA 2CZ3A 1YF0A 1K0DA 1KNGA 2H1BA 2H71A 2I81A 4NHWA 1X5CA 4DSQA 1SK2A 4RI6A 4YQMA 5HR3A 2X8GA 1U3IA 5B6NA 1YY7A 2JADA 4ZB6A 19GSA 3ZTLA 3GURA 3VPTA 4G9HA 1OE7A 3FR9A 3I43A 3TKRA 1EP8A 5D73A 3WT1A 2YOIA 2IL3A 3CRTA 1UN2A 1H75A 2YPMA 3IK9A 4I8BA 4EL1A 3O6TA 1THOA 2WULA 3F3RA 5COHA 4ZBBA 3ZFLA 2I3YA 5KN0A 5J9BA 1HNAA 1XZOA 3GH9A 4IP1A 3L9SA 4XS4A 4KSOA 1GTAA 2GQKA 2RM6A 1O8XA 4XRAA 1SYRA 4HU7A 3IPZA 4ZL8A 1F9MA 2MYGA 2N5BA 2V41A 1O85A 5ECKB 5IM9A 1ZZYA 2FY6A 1G6YA 4I97A 2KOKA 5CRDA 4PQHA 5EPFA 1GSFA 3VK9A 3CTFA 3GKMA 2H0IA 3PGTA 1JLVA 3A2XA 5ECSA 4PXOA 2YZUA 5ECNB 2JL4A 3TJJA 1HQOA 2VD0A 5GSTA 5B6MA 1M2BA 1SJ6A 4HOJA 1YDKA 3EWLA 3MAKA 2P0GA 2K18A 5J5NA 3ZYWA 2LJRA 1OVNA 3TJFA 2HSHA 4ECCA 4HZ2A 1HNCA 3TKQA 2YANA 3CTGA 1Z3EA 2ALBA 3IR4A 4AJ7A 1B4PA 17GSA 1NSWA 4KW6A 2B5XA 2JZSA 5G31A 4L8EA 1X9SB 2YZHA 3KD0A 2AAWA 1ZCPA 3RBTA 4PX1A 2YJHA 4FYCA 1DUGA 3P7XA 2G2QA 4ZBDA 3J7Yb 4LA1A 2YN1A 3EVIA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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