2H0IA

Crystal structure of dsbg v216m mutant
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
ELPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCPYCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVTPAIYYMSKENTLQQAMGLPDQKTLNIIMGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Short-circuiting divergent evolution: laboratory evolution of one disulfide isomerase to resemble another
rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbG
molecule tags Isomerase
source organism Escherichia coli
total genus 65
structure length 229
sequence length 229
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 2h0iA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h0iA02
2JU5A 2ON5A 3KGKA 1O8XA 5HFGA 1ML6A 1TRSA 2YANA 2KP1A 3QMXA 4I2UA 1ZOFA 3V1WA 2GZPA 1PD21 4PX1A 4BPYA 4CHSA 2H72A 3C1RA 1TU7A 4EUYA 3N9JA 4NV2A 2H01A 3ZRDA 3TOTA 3TKRA 3PR8A 1YEPA 5DALB 2GVPA 5B7CA 4I6XA 2HI7A 1V58A 3U6VA 4JEDA 5B8BA 1GNEA 3QR6A 2IMIA 2VUPA 3IA1A 4BWQA 3ERGA 2K6VA 4EE0A 5AGYA 3UEMA 3QAGA 4OWYA 1Y6EA 3GRXA 1GNWA 2JSZA 3I9V2 1OVNA 4XS1A 1GTIA 1Y25A 3TRQA 1M2DA 18GSA 2VCQA 4F9ZA 2DSAA 4YQVA 4POBA 5G5FA 5GAPD 2C0DA 2H70A 2FWGA 3IV4A 1ERVA 4D73B 1WJKA 1ZCPA 3GH6A 1U87A 1TI1A 2X99A 5ECNB 4EL1A 2B7KA 1BYEA 3UARA 3FR6A 1ZZYA 4XRAA 2CAQA 2P0GA 3G9BA 4MZWA 4E8EA 6GSYA 2QSIA 4MDCA 2BJXA 2N5FA 3TKSE 3VWVA 1GL8A 4HQZA 5ELGA 3NIVA 1C72A 1HNBA 2QGVA 1OC9B 3SBCA 3RHCA 3ZFBA 5IOWA 2DJKA 1F3BA 3MSZA 1I5GA 4K7NA 1EZKA 3MDKA 1OE8A 2CVKA 3LSZA 2C0GA 1OKTA 4HQSA 3TKSC 1Z5YE 5B6MA 5H5QA 4GQFA 4MH3A 5AN1A 4BVYA 1O8WA 3TJFA 5HR1A 3H93A 4J2FA 1ZL9A 4TR3A 3FR9A 3QPMA 2I81A 2HSHA 3TRPA 1SKRB 4ML1A 1NSWA 5DDLA 3FRCA 5E59A 2CV4A 1MD4A 2AB6A 3KTLA 2PGTA 1BQ7A 2KOKA 1SJ6A 4MLYA 4KE3A 5H5RA 2IMKA 1XVWA 1K0AA 1TXXA 4KB3A 2HZEB 2JACA 5D96A 5ECMB 4V1Ap 1WIKA 3P2AA 4ECJA 1XXUA 1KEBA 2H0IA 1UC7A 4JU5A 6GSWA 4EF0A 2H76A 3IE3A 1FVJA 4BL7A 1SYRA 3IC4A 1XOAA 2OE1A 1JZWA 4PGTA 3J7Yb 4CW9A 3IXRA 3VFIA 3D4TA 2LRNA 3LYPA 1A8LA 3DEXA 1RW1A 2LJAA 1WRYA 1HQOA 3IBHA 5ECIB 3DVXA 5G30A 5CRHA 4MK3A 4Q5FA 2AAWA 4N0ZA 4X0XA 1GSUA 2LEGA 2OE0A 1PL2A 4GQCA 2B5YA 3IRAA 1M9AA 1S3DA 1XCCA 4YQUA 2FLSA 2A2RA 3H1NA 1K3LA 3I6AA 4PQHA 1VF1A 2HNLA 2F8FA 2GLRA 4DEJA 3FZ4A 2P5QA 3W8JA 5ENUA 1ZGNA 3D21A 2IPAA 2MMNA 2IMFA 3MNGA 3KCMA 4HU9A 1TK5B 3C71A 3WGXA 1QMVA 2EIOA 3L9VA 2C8UA 3CYNA 4HU7A 3F6DA 2H1GA 1F2EA 1X5DA 4WBJA 3BCIA 4MABA 4OD7A 2O7KA 3ZYWA 2MBSA 2LQOA 4HJ2A 3EINA 1PX7A 3D5JA 2R2JA 3EWLA 3LYKA 2HE3A 5D9VA 4ZILA 2C0FA 4POLA 1G6WA 4L0WA 1M2BA 5HQPA 1EV9A 4OFMA 5A4WA 2PERA 1XW6A 1PN9A 5GSSA 5G1KA 1YF1A 3DMLA 4XHMA 1NHOA 2JADA 5IMVA 4EVMA 5IO2A 3GKXA 3K8NA 4GLTA 1JZRA 4KCEA 1RK4A 5EY6A 4KCAA 3UL3A 1AW9A 2O87A 2O89A 2B6MA 1W89A 3C8EA 4P3YB 1VF4A 1Q98A 3KMOA 1GSDA 1G0TA 3FZAA 1XVQA 1ST9A 3QOUA 4EO3A 1UA5A 5DAKA 1PGTA 3CTGA 3W8SA 3DXBA 11GSA 3IK7A 3F8UA 2RM6A 1PRXA 1VF3A 1TU8A 2AV4A 2X8GA 5F0GA 3LXTA 4NXIA 4ZL8A 1GH2A 2ES7A 3BBYA 4WF4A 2YWOA 2HLSA 1WPIA 4MPFA 4N10A 2C0EA 3F9UA 4TXOB 3HVSA 2C3TA 6GSTA 1V2AA 4DSQA 3HY2A 1SK0A 2DIZA 2X8CA 3CMIA 4HS1A 3UMAA 6GSVA 4MF6A 1YY7A 1EP8A 3EE2A 2CT6A 4V1Ag 3IPZA 1M99A 1SYXA 2YWNA 3FY7A 4IHUA 2N5AA 5IOXA 2H1BA 1VF2A 3DKSA 2YP6A 2GGTA 4IGJA 3L9SA 4TVEA 2ON7A 3GKNA 1GSSA 5KN0A 2LRCA 4V2MA 1GSEA 3FHKA 5IMCA 2ALBA 4NV5A 2FUG2 4KH7A 2H71A 2VCVA 5ID2A 5FT3A 4TR1B 2J9HA 1XWGA 3ED3A 3O6TA 2QKEA 2B1KA 3F63A 3H8QA 3KM6A 4KSOA 4PURA 3EMPA 4F2IA 1LBKA 2LUSA 2IN3A 3QD9A 2PPTA 2PWJA 3GTUB 4MF5A 10GSA 2F8AA 3LQ7A 4EDYA 1ACVA 5KN2A 2R37A 2H1AA 2F9SA 1R26A 5CYYA 4IQAA 4IKHA 4LMWA 1XZOA 1YEXA 2GSTA 3JCML 4BA7A 5IO0A 3GN3A 3S9FA 4V2NA 3FZ5A 2DJ0A 3M9JA 1A2JA 2V6OA 1W4VA 2OBIA 1QXHA 4FO5A 4OFTA 1T3BA 2OE3A 3TJGA 2LQQA 1Z9HA 3I43A 3HJMA 3F3RA 1F9MA 2WGRA 3PH9A 1QGVA 4F0CA 2IL3A 3CRUA 4PXOA 3HYPA 2L5OA 3HZ8A 3L78A 2FHEA 4GWRA 3IDVA 3IOSA 1K0CA 1USBA 2LJRA 3R2QA 1WMJA 4LMVA 2VD0A 3KTBA 5DVBA 3WGDA 5D9XA 2PUKC 4NAXA 1A2LA 2IMDA 3F4TA 1GUMA 2VL2A 2H1DA 3VURA 2PBJA 1A23A 1THXA 2M72A 5CRGA 1G7EA 2V1MA 2YWIA 2OJLA 2VM1A 2DMLA 4ILFA 3Q19A 4HZ2A 1U6TA 2CA8A 1HYUA 2JZTA 2E2MA 3VWUA 2CZ2A 5A5KA 3CSHA 1K0DA 1YQ1A 3D6IA 5ECPB 3GUSA 3EVIA 4ZB6A 3TCOA 4K6XA 3IR4A 1MDIA 3QFAC 2FCHA 3TDGA 3HD5A 1GSQA 4IBPA 2NBSA 3KIJA 4JE1A 2VO4A 2IFQB 1SU9A 4GTUA 2MMOA 4O5RA 4ECIA 1HNCA 1GTBA 6GSSA 2TIRA 3APQA 2YOIA 3HHVA 1X5EA 1V9WA 4F03A 2GT5A 1BG5A 3WT1A 1XBSA 4XS6A 1ERWA 4NHWA 5HR0A 2DMMA 4H86A 3VPQA 1TTZA 3LFLA 4EC0A 3P90A 2K9FA 2HXKA 3PGTA 1M2AA 3J7Yk 3LJRA 1THOA 4PQIA 2MBTA 1FB0A 4MJBA 3M0FA 2M80A 1O73A 3A3TA 1WE0A 1PA3A 4K9ZA 4XCSA 4XS4B 7GSSA 8GSSA 5B8AA 2WULA 5DJLA 2DJJA 2B3SA 3HJOA 2K8SA 1R5AA 3WGEA 3A2WA 3GKKA 5ECKB 1HNAA 5LNKe 3G7IA 3ME8A 1GSYA 4MCUA 4ID0A 1NW2A 2IYJA 2VCWA 1PKWA 4MZBA 3D0ZA 3ISOA 4G10A 4GXZA 2XBQA 1B48A 2WDUA 3ZL5A 4BWSA 4HJMA 4FYBA 4ISDA 2PMTA 3HDCA 1N2AA 1EOGA 2K18A 3WD6A 1OAZA 1TRUA 2YZHA 5CRDA 1ZMAA 4TN8A 1ZYEA 1EV4A 4ZL9A 1JLVA 2H75A 1OC8A 2DLXA 2NDOA 2A2SA 2LKUA 3EMXA 3EU3A 2OBKA 2OA7A 1SL1B 2L4QA 2YZUA 1JLWA 4K0NA 2VIMA 2RM5A 1A24A 3EC3A 3EURA 3KXOA 1J9BA 3IHQA 3M8NA 5D73A 1K0NA 2X8HA 3US3A 3HZ4A 4X43A 3RPNA 3HCZA 2LSTA 4V2LA 1GTUA 2DJ1A 1YKCA 4GRFA 3GYKA 5J4UA 5IPGA 4HUAA 4MJCA 4I5QA 1GP1A 5IMFA 5IM9A 5GSTA 4WR5A 3CTFA 1PSQA 5J5NA 3LGCA 1UN2A 3MAKA 3KJYA 2NTOA 3A2VA 1YKAA 1B9YC 3APSA 4G9HA 1ERTA 4GSTA 2YV9A 2AHEA 5DALA 5DQYA 1H4OA 1TRWA 3QAWA 1AUCA 2KHPA 2MZCA 3BD2A 5G31A 2E2GA 4JR4A 4KGIA 4DSSA 1YF0A 3RBTA 4MF7A 4KNDA 4G19A 1URMA 1XPVA 2B5EA 4IW9A 3LEFA 4TOPA 2DIYA 2LJKA 4K8MA 1N8JA 1Z7PA 1K0MA 5IPHA 1S3AA 3KH7A 4J57E 2LRTA 3GSSA 3ZTLA 5JCGA 3MWHA 5JCUA 2IWTA 4YH2A 2L6DA 3GHAA 4O7HA 2I3YA 3DVWA 2DJ3A 2H74A 2V2GA 5JWQB 4KW6A 4OO4A 2KLXA 3DIEA 2GQLA 2P5RA 1AIUA 1FW1A 2MYGA 3AY8A 5INYA 3RPPA 3VPTA 1SJIA 1YZXA 2PU9C 1O85A 4RI6A 3GSTA 3QCPA 1VRSD 4ECBA 4ZL7A 3C7MA 2FA8A 3L4NA 4PUFC 2HSYA 3C1SA 2YWMA 2VL9A 2XPDA 4QQ7A 1OC9A 4IQ1A 3F3QA 2J23A 3GKMA 3EYTA 1TP9A 2N5BA 3F0IA 5B6NA 4F82A 3KD0A 2IMEA 5IMDA 5J9CA 3ZIVA 2L6CA 1TJDA 1XW9A 4N11A 2GSRA 2V41A 2H0GA 2C80A 1B8XA 3PINA 4O92A 1A0FA 3NOFA 4IS0A 2L5LA 3FKFA 3GL5A 3TJJA 1A2MA 3ZREA 2GDRA 5IMAA 2YV7A 1DUGA 1M0UA 2B7JA 5A4VA 5DJMA 3TKQA 1QK8A 3LXZA 1AQWA 1Q4JA 5F05A 4IP6A 1T8EB 5F06A 4KDUA 1GSFA 4KDXA 2KUCA 2HRNA 3U5RE 1SL0B 1U3AA 2HZEA 4ZBAA 1MD3A 4MPGA 4N30A 3P8WA 2ZNMA 2KP2A 1BAYA 13GSA 2XC2A 2HT9A 1M7TA 4K1FA 2L59A 2R4VA 4K7IA 2WRTA 3RDWA 4Q5NA 1EP7A 1FB6A 4J56E 3E3EA 3VWXA 1GUKA 4YQMA 1RQMA 3TKSA 2LS5A 3TJKA 4OMVA 2PVOC 1JZDA 4LA1A 1AXDA 2RIIA 2C3NA 4ZXGA 4I8BA 1IYIA 3WYWA 3WT2A 3OR5A 5E4WA 1X9WB 2EC4A 1KTEA 1R7HA 4ZBDA 2EIRA 5HFIA 1O6JA 4ULXA 5HFKA 1FHEA 2V32A 2VD1A 1K3OA 1X0RA 1EGOA 1XOBA 2JSYA 5EVOA 3LORA 2JZRA 1PX6A 1R4WA 1WOUA 5ELAA 1U3IA 4N0VA 2F3MA 1MTCA 5CAXA 1XWCA 3I69A 1LU4A 1V57A 4NHZA 2YCDA 1X5CA 2AYTA 4G2EA 1ZYQB 17GSA 2IJYA 5H5SA 1QQ2A 5A4UA 2VLUA 3HVXA 3H79A 5D93A 3LG6A 3G7JA 4LLRA 1BX9A 3FYGA 4JR6A 3DD3A 5EPFA 1AC1A 2JZSA 2FWFA 3RAZA 1YDKA 1ERUA 1K3YA 3DGQA 2RUEA 1EEMA 3CXGA 5ABRA 2G2QA 3UOMA 4LL4B 1PKZA 1B4PA 9GSSA 2X64A 2YNXA 2B1LA 3RHBA 2H73A 3IAM2 1B4QA 2FWHA 1JHBA 1SK2A 1EOHA 4HOJA 4Q5RA 4ACSA 4DSSB 2ZUPA 5AIVA 3UVTA 4QL9A 1PMTA 5FWGA 3F4RA 5D9TA 3F6FA 2GT6A 5ECHB 4PQ1A 5CNWA 1SENA 4TRXA 1GULA 1ABAA 4X1UA 5CRWA 5G2ZA 3FK8A 5F8BA 2L4CA 4TXVA 1FG4A 2PN8A 3P7XA 3VI5A 3NZNA 2LNTA 3UAPA 4IP1A 5ECLB 4GSSA 2E7PA 1Z6NA 2L57A 4AJ7A 4GSNA 1PL1A 3VI7A 3DWVA 1CQHA 4RQXA 2C4JA 2XPEA 1T7PB 4GF0A 4L8EA 4FYUA 1XWBA 1T1VA 1TK8B 2R5GA 3Q18A 1SK1A 1DSBA 4ZBBA 3ZVJD 2VCXA 2LV3A 1KNGA 2CX4A 1K0OA 3ME7A 3UVHA 4KSMA 1SJZA 1R5PA 5D8IA 5KN3A 5DAKB 5C00A 5IMZA 2DC5A 1FVKA 1OKDA 3LWAA 4IJIA 4TKYA 1KBNA 4TXOA 5DQSA 4XIHA 1E6BA 4KUNA 4TW5A 2GSSA 4ZIJA 4FYCA 1MEKA 4YAPA 4K0GA 1OE7A 1EWXA 1XWAA 2R3XA 3QAVA 1SKWB 2JL4A 3TGZA 3HXSA 1XWKA 5G5EA 2OKAA 3IAS2 6GSUA 3APOA 4LL1B 4AJ8A 1V40A 3FZ9A 2Z9SA 4IN0A 2B5XA 1YJ6A 2K8VA 2O8VB 5GAND 4IELA 3M3MA 4RUVA 2DBCA 3ZLPA 2GSQA 4K2DA 3O3TA 1XW5A 1TI3A 4JRRA 4NMUA 4NWYA 3GNJA 3GURA 2HZFA 1S3CA 4RI7A 4POMA 1SKSB 2WCIA 1HD2A 3L0HA 3L9UA 4ECCA 4I97A 4TR1A 5JWOB 2RLIA 3DRNA 3TB2A 3ZMKA 4POKA 3DYRA 1A8YA 2F51A 3FR3A 5DCGA 3GFKA 1Z6MA 1WWJA 2GQMA 2OADA 4RQRA 2VCZA 3UBKA 1PQNA 3VLNA 4OCFA 1VGLA 2FY6A 1AQVA 5ID2B 3D4MA 1QUWA 2DJ2A 2H6XA 4MA9A 3HKRA 2D2ZA 3KP9A 1J08A 3FW2A 3TJBA 3GTUA 2I9HA 3GX8A 4DSRA 1TKDB 1IYHA 3A5WA 5LD0A 4ZB9A 3ERFA 3BCKA 1F37A 1T4YA 3TUEA 3BJ5A 5IQYA 3KMNA 2RUFA 5DBQA 1T00A 3ZITA 4CDOA 1OYJA 3GL3A 5HR3A 4PNGA 2VL2C 1X9SB 4WKWA 5JCWA 2LTKA 2C1YA 2G0FA 2FNOA 4YAVA 4FH8A 4HI7A 2ZCTA 1LJRA 4MP4A 16GSA 1TOFA 2FGXA 1GLPA 2CZ3A 1TK0B 3BOAA 2WS2A 1OC3A 4OO5A 4QL7A 1DE1A 2FWEA 3TRXA 2V6KA 3KZQA 5J41A 3C73A 1F3AA 2QC7A 1SD9A 3D22A 5ECOB 2IIYA 2BTOT 2MMZA 1G7OA 1G6YA 3HA9A 1CQGA 1I9DA 1AAZA 4IVFA 1H75A 1GTAA 1GUHA 5L71A 1XIYA 2CAIA 2EIQA 2FD3A 3CSIA 5EL8A 3VK9A 5HR2A 3CBUA 1EGRA 1BEDA 4HEA2 3W6GA 1Z7RA 3UJ1A 3ZIJA 14GSA 3GH9A 5COHA 2VOCA 4D73A 22GSA 1J0FA 20GSA 4KAEA 1M9BA 5CO3A 4EXJA 3E9JB 2VAFA 1SD8A 4OCEA 4EDZA 2VM2A 3ZVJA 4TR0A 5ECQB 4TR4A 4MMMA 3QFBC 4JBBA 4E8HA 5C04A 6GSXA 4HZ4A 2OACA 2IFQA 4IJ3A 4F0BA 4AGSA 4AJ6A 2HRFA 3ZFLA 2IY2A 19GSA 12GSA 2CQ9A 4ZB8A 2WZ9A 3G7YA 3GIXA 1E2YA 4L5LA 1EEJA 4PNFA 1SL2B 1O7UA 3ZZXA 1Z3EA 5IIZA 3KEBA 2VLTA 4MZCA 3GMFA 1X9MB 1TW9A 2VL3A 1FOVA 5CP1A 4WEYA 3ZMLA 3KH9A 5CREA 2YJ7A 2GZYA 2H66A 2YJHA 2C3QA 2CX3A 2FA4A 2H6YA 5DCHA 4I2TA 2REMA 5FHIA 4WBRD 3SWLA 1GRXA 2PVQA 3GX0A 4K7OA 4MJAA 1MDJA 1TRVA 4WETA 1T4ZA 3UIWA 3O76A 5G1LA 4XS4A 1FO5A 2I4AA 2XBIA 3CSJA 2R6KA 3GV1A 3N5OA 4NPBA 3F4SA 4O32A 1A0RP 4PUAA 2CVDA 4KX4A 2H6ZA 3A2XA 5GZZB 3HVVA 3VWWA 2E0QA 5ECSA 2LNSA 1XFLA 2HYXA 4WF5A 4AF2A 2GTUA 1K0BA 2NPBA 2A4VA 2GZZA 3UBLA 1FAAA 3CRTA 3FEUA 3M1GA 1TDIA 2TRCP 5AIXA 1JFUA 3EU4A 1QFNA 2AJQB 2TRXA 4WXTA 2H8LA 3E0UA 3M9KA 4Z7XA 2NVLA 2WB9A 5J9BA 3TOUA 5J3RA 2MMAA 2VCTA 2GS3A 2H19A 4OFNA 1GLQA 1JZOA 4L0UA 2WFCA 4DVCA 2WJUA 2P31A 3ERWA 1DBYA 5F07A 5KN1A 3TKPA 2HFDA 5KEJA 1NM3A 2XHFA 2CVBA 1O81A 2O85A 4GCIA 2YPMA 3KP8A 1U88A 1V98A 2H30A 4KDYA 4HDEA 4FIWA 3Q6OA 4KA0A 3IK9A 3QDNA 3H4KA 4L5OA 5AISA 1GWCA 1AQXA 4XRDA 4WR4A 1NHYA 1ON4A 1B9XC 1F6MC 1BJXA 2I1UA 2YN1A 5JWRB 2BMXA 1WP0A 1MDKA 4ML6A 4JZQA 4MH2A 5LCZA 3HJPA 4Q5QA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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