3TDG | Genus

Total Genus 77

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	77
sequence length	232
structure length	232
Chain Sequence	QDNLVSVIEKQTNKKVRILEIKPLKSSQDLKMVVIEDPDTKYNIPLVVSKDGNLIIGLSNIFFSNKSDDVQLVAETNQKVQALNATQQNSAKLNAIFNEIPADYAIELPSTNAANKDKILYIVSDPMCPHCQKELTKLRDHLKENTVRMVVVGWLGVNSAKKAALIQEEMAKARARGASVEDKISILEKIYSTQYDINAQKEPEDLRTKVENTTKKIFESGVIKGVPFLYHY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structural and functional characterization of Helicobacter pylori DsbG pubmed doi rcsb
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Helicobacter pylori
molecule keywords	Putative uncharacterized protein
total genus	77
structure length	232
sequence length	232
ec nomenclature
pdb deposition date	2011-08-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF18257	DsbG_N	Disulfide isomerase DsbG N-terminal

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.450.520	Alpha Beta	Roll	Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,	Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,	3tdgA01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3tdgA02

1FOVA 4HJMA 4F82A 3GH9A 2F51A 2MMNA 4MA9A 6GSWA 5CRHA 1U3IA 4KB3A 2GLRA 2VM1A 3ME7A 3A2VA 2HI7A 2WZ9A 1EEJA 5G2ZA 1XW6A 6GSYA 5ID2A 2RUFA 1VF1A 2J23A 1ERUA 1GSUA 4BA7A 2E2MA 4IN0A 4PNFA 4NHZA 4KDYA 5AISA 4WR5A 1DE2A 5ID2B 3IRAA 5KN2A 3VWXA 4XRDA 4P3YB 3LYKA 3DEXA 3HYPA 1I9DA 4Q5NA 3BD2A 2VM2A 4I2UA 5LCZA 1PL2A 1DSBA 5ECLB 4POBA 2AYTA 1CQHA 3CRTA 3HHVA 4ML6A 4MJEA 2LS5A 2C0FA 2P31A 5B6MA 1THXA 1GNWA 3H4KA 1O81A 2GT5A 4RUVA 3DWVA 5D9XA 1ABAA 1YDKA 1NM3A 2XPEA 2X99A 3RDWA 1TTZA 3VPTA 5J3RA 4GF0A 1G6YA 4Q5QA 1EZKA 1N8JA 1WIKA 5FHIA 3MDKA 5GSTA 4ZB6A 3GRXA 4XS6A 1OVNA 4JZQA 1PA3A 2H6YA 3FZ9A 1K0NA 4KH7A 1TRWA 3FHKA 2LNTA 1PSQA 2LUSA 3DMLA 2F8FA 4OCFA 2PPTA 2D2ZA 1GUMA 3KD0A 1VF2A 3HCZA 3GX8A 5IPGA 1KEBA 1Z9HA 5DQSA 4E8HA 4MDCA 3W8JA 1T7PB 2A2SA 3TKSE 1OKTA 4HOJA 3FK8A 1OE8A 2V1MA 4GLTA 2JU5A 2H01A 4MH2A 5AN1A 3UJ1A 3TKQA 1BX9A 2WB9A 5JWOB 4IGJA 1F2EA 1M7TA 1TRVA 3HJPA 2FWHA 2OE3A 2V2GA 1PRXA 5E59A 2KP1A 3Q74A 2L59A 2V6KA 1G7EA 2K18A 3NIVA 1GTAA 4O7HA 4X1UA 3KMNA 3W8SA 2ZUPA 4NAXA 4MK3A 5D9WA 4MF7A 4ISDA 2WULA 4TW5A 5HFKA 1FG4A 2RLIA 4XTSA 3RPNA 2YZHA 1UC7A 4V2MA 1TOFA 2VCWA 1K0BA 3H1NA 2IMEA 4TR3A 3I6AA 2F3MA 2YJHA 5IPHA 1BQ7A 1GSDA 5ECPB 3UMAA 2NPBA 2LJRA 4RI6A 2CX3A 2H0IA 2JZTA 3ZREA 3DIEA 1OAZA 3FZAA 3FR9A 1ZCPA 2M72A 3F9UA 1O7UA 2YPMA 2YOIA 2K8SA 1XVWA 3WGEA 1B8XA 4AJ6A 3KXOA 4PQIA 3P7XA 2MBTA 2K6VA 1K0MA 3QAVA 1QQ2A 1U87A 3F8UA 2CT6A 4IJ3A 2NDOA 3VK9A 3HA9A 1EP8A 5ECOB 2FWEA 5ENUA 1EWXA 4AGSA 1XWKA 2HFDA 1PN9A 3EWLA 5LD0A 2KP2A 2LKUA 2CVKA 2YWIA 1YJ6A 3F4RA 2OBKA 5B7CA 4ZIJA 2HZEB 2AHEA 2FWGA 1G6WA 1FAAA 3IR4A 2X8HA 1USBA 1E6BA 4BPYA 4N10A 3O3TA 4MP4A 1WRYA 3ERFA 2V32A 4ML1A 4OO4A 1X9SB 4DVCA 1A2LA 4J57E 4BWQA 3G7JA 1WWJA 4IJIA 3F4SA 3QFBC 3HVXA 1JFUA 2YWMA 3HJOA 4TR1B 2C3NA 5ECNB 1R26A 4MPFA 3HJMA 3IK7A 2YANA 3RHBA 2O87A 2XBIA 2X64A 1YF0A 5EPFA 5FT3A 1VGLA 1OC9A 1ERTA 2JADA 4HDEA 5KN1A 1QK8A 5F07A 2VIMA 4KSMA 3KIJA 3QFAC 4Q5RA 2MZCA 3FYGA 3EINA 3UEMA 2YN1A 1ZGNA 4H86A 3NZNA 4ZXGA 4HQZA 3IHQA 3E9JB 4ZB8A 1O85A 2GT6A 1YEXA 5D73A 3GX0A 1J0FA 4YH2A 2DIYA 3WD6A 3L78A 2C0EA 1OC9B 5F0GA 3RAZA 2WFCA 2FGXA 3GIXA 1LBKA 3Q18A 2CQ9A 4EDZA 3ZMKA 2CVDA 3H93A 2IMKA 3ERWA 2FHEA 1EV9A 4L0UA 2OKAA 3FKFA 1NHYA 1BJXA 5IMDA 2B5YA 4ZB9A 4XRAA 3LWAA 1HYUA 1PKZA 3QOUA 1F3BA 3GTUA 1SU9A 14GSA 5IMCA 4IVFA 5JWQB 2CAIA 4DSRA 2FUG2 4DSSA 5J4UA 1F6MC 1O8WA 4K0GA 3IV4A 4PX1A 4Z7XA 2NTOA 2DJ1A 2VCVA 2ALBA 3GYKA 1X9WB 1XCCA 2VCZA 2EIOA 2I81A 1T4YA 1EEMA 3MSZA 1SYXA 5J9BA 1V57A 5DQYA 2YV9A 3D6IA 5HQPA 1JHBA 4DSSB 4MZBA 5L71A 4PQ1A 3SWLA 3EU3A 4GCIA 3VPQA 1HNBA 5CAXA 1HNCA 3HD5A 4EC0A 3TJFA 3GURA 1B4PA 5B8AA 3KCMA 5J5NA 2L5OA 2HLSA 2I4AA 3RPPA 2LJAA 4K1FA 3CMIA 5F06A 2MBSA 2XPDA 3F0IA 2L57A 2L5LA 3KGKA 2N5AA 1XXUA 1M0UA 4HZ2A 4PURA 5ECSA 4JU5A 4OMVA 3VI7A 1X9MB 4WF5A 1DUGA 3HKRA 3G7YA 5FWGA 3C1RA 1ZL9A 3CTFA 3ZL5A 1A2JA 2G0FA 4I5QA 4J56E 3IA1A 4ID0A 1GSYA 5C00A 1FHEA 2AV4A 4JE1A 4HZ4A 1SL0B 3PH9A 1SL1B 17GSA 1Z7RA 2PERA 1OC8A 4TKYA 3O6TA 5D9TA 4F0CA 1W89A 3VWWA 4NHWA 2V41A 1JLWA 2H6XA 1XIYA 4QL7A 2Z9SA 1A0FA 2XHFA 2YZUA 3LSZA 5DJLA 3DGQA 4IW9A 3EURA 3UBKA 5CRWA 4K6XA 5IM9A 3ZZXA 4HEA2 3TJGA 3QAGA 2EC4A 2DBCA 4GQFA 2C80A 2DJ3A 5J9CA 1N2AA 2DSAA 4XIHA 1PX6A 1SK1A 1ZZYA 4K7IA 3HVVA 2P5QA 3H79A 1YF1A 2TIRA 4I6XA 3GHAA 2H8LA 2H73A 4MF5A 22GSA 3I43A 5G30A 3UL3A 2VD0A 2AAWA 2IN3A 4TR0A 2PVQA 2QC7A 4HS1A 20GSA 1Z5YE 4NV5A 4V2NA 5D96A 4QQ7A 1R5PA 1OYJA 2H19A 4OFNA 2HNLA 4KUNA 1THOA 16GSA 5B6NA 3F3QA 4NPBA 3ZMLA 5DVBA 2GVPA 1GP1A 2CZ3A 3L9SA 3QCPA 3D4MA 1KTEA 2CZ2A 4DEJA 4L0WA 3ZIVA 2H74A 4FYUA 3RBTA 2YWNA 3FZ5A 2C1YA 2VLVA 1DBYA 2NBSA 4LMWA 4FH8A 4O92A 3P90A 2HSYA 1NW2A 1V40A 3KMOA 2OE1A 4KGIA 1GUHA 3J7Yb 1XVQA 1B9YC 2IL3A 4BVXA 3K8NA 2FLSA 4G2EA 5IMVA 4XS1A 1W4VA 1EGRA 3WYWA 2VUPA 1B4QA 4IQ1A 1OKDA 3DD3A 3KTBA 1Z3EA 3EU4A 4IQAA 1B9XC 5D8IA 5B8BA 3CBUA 2VL9A 4ZBDA 2LTKA 2DLXA 2JL4A 3AY8A 4K2DA 4N11A 2P0GA 1H4OA 2IMIA 1DE1A 1AIUA 4HJ2A 3D0ZA 1SKWB 1V58A 2E7PA 1M9BA 5CREA 2KHPA 2IPAA 5KN0A 3LGCA 2VCQA 5HR2A 5DBQA 2GQLA 1A8LA 4PGTA 4GSSA 4MCUA 4V1Ag 4WF4A 3LYPA 4F0BA 3IC4A 2X8GA 1XOBA 2FCHA 4XS4A 3UVHA 4FYCA 2ZCTA 3P8WA 1T00A 1R4WA 3TJJA 1IYIA 3CTGA 2QKEA 2L6CA 3APSA 4KSOA 3TJKA 2GSRA 4E8EA 4L5OA 4OO5A 1GLQA 3M9KA 1RQMA 5HFGA 3US3A 4N0ZA 2LNSA 1A2MA 1TRUA 1S3CA 4XS4B 1M2BA 19GSA 5C04A 3KTLA 1MEKA 4PQHA 1SD9A 4FIWA 3O76A 1E2YA 3JCML 1PD21 3TJBA 1MTCA 2KOKA 3LXTA 1GSSA 1JZWA 1VF3A 2A4VA 6GSVA 3MNGA 5A5KA 1URMA 4MMMA 2VCXA 2GSTA 4LA1A 4WXTA 3APOA 1O6JA 5G1KA 4G19A 2PMTA 4V1Ap 5KN3A 2H72A 2DJJA 2LRNA 4KAEA 4EKZA 1SD8A 4MPGA 2H30A 2OJLA 2N5BA 1ERWA 4NMUA 1HQOA 4EE0A 3GL3A 2GDRA 5F05A 2MYGA 4GQCA 4TXVA 1EOHA 4G10A 4OFTA 4EVMA 1GRXA 2H1BA 3GKNA 5EL8A 1EGOA 1GUKA 9GSSA 3C71A 4J2FA 2VLUA 1SYRA 4XHMA 3RHCA 2B7JA 4YAVA 1GNEA 1S3DA 2FNOA 2B1KA 1TDIA 2OA7A 5CO3A 2AB6A 3MWHA 1MDKA 3L0HA 4K7OA 3I9V2 2GZZA 3ZITA 2O85A 5IMAA 3IOSA 1F3AA 1WE0A 2ZNMA 1QXHA 2GSSA 2OBIA 5G5EA 1WMJA 3M3MA 4K8MA 1QMVA 8GSSA 2B6MA 2XBQA 4EL1A 1GSFA 6GSXA 3G9BA 2LJKA 4KDUA 1GLPA 2VL3A 1GSQA 1M99A 2EIQA 1K0OA 4F03A 2N5FA 3EVIA 4AJ7A 1TU7A 13GSA 3HVSA 3G7IA 3PR8A 2YNXA 5IQYA 4ZL7A 1UN2A 1GWCA 1I5GA 2TRCP 4EF0A 3F6DA 3WT2A 2E2GA 3ERGA 3A2WA 3F3RA 5GAND 1TW9A 2R4VA 5GZZB 1K3LA 3DVWA 3ME8A 4ECBA 1XWBA 4KCEA 2FWFA 2ON5A 2I9HA 1FVJA 1XPVA 4Q5FA 3ZLPA 4N0VA 2DIZA 2PBJA 2TRXA 5JCGA 3FR6A 1SL2B 5ECMB 1V9WA 3GH6A 3H8QA 1JLVA 3GFKA 2C3QA 2C4JA 3EYTA 3L9VA 4YQVA 2GQMA 2B5EA 2H1GA 3P2AA 1X0RA 4WKWA 1XW5A 4MABA 1JZDA 2YV7A 1GH2A 2YP6A 1U88A 4IBPA 1WOUA 6GSUA 2AJQB 5H5SA 3TKSC 1TI3A 4WBJA 2VO4A 3A2XA 3KH9A 5EY6A 1ILOA 5DCHA 2ES7A 3GTUB 4ECIA 3TKSA 1BG5A 1LJRA 3IXRA 1WJKA 2KLXA 2VLTA 3VWVA 1B48A 4TXOA 1T8EB 2GTUA 1VF4A 3ZRDA 1GL8A 4JR6A 3C1SA 1Y6EA 4EXJA 1Z7PA 1TKDB 4POKA 2HRNA 3DKSA 1SK2A 3GMFA 4IP1A 2IMFA 2RM6A 3GNJA 3ZFLA 3LORA 2MMAA 3EC3A 3UBLA 2DMLA 4NXIA 6GSSA 4JR4A 1K0DA 4TXOB 2C3TA 3HDCA 4AF2A 3BJ5A 3L9UA 1AQVA 2I1UA 2WRTA 4POLA 4YQMA 1F37A 4D73A 1QGVA 3SBCA 1YQ1A 1M2AA 4OWYA 2IFQA 1ERVA 1Z6MA 3GKKA 2E0QA 4WETA 2VAFA 1K3YA 2H71A 4ZL9A 2L4QA 1BEDA 4ACSA 2F9SA 1TK5B 1PMTA 1VRSD 1YKAA 4YQUA 5JCWA 1CQGA 3U5RE 1GTUA 2B3SA 3D22A 4GXZA 5ABRA 2HSHA 1FO5A 2IFQB 5ECHB 5ELAA 4MF6A 1SJ6A 5AIXA 18GSA 5KEJA 1TXXA 1UA5A 2VL2C 4G9HA 1LU4A 3IDVA 4BWSA 4I8BA 5HFIA 1YZXA 1FB6A 2VL2A 1RK4A 1TI1A 2O89A 2HRFA 3BBYA 2JSYA 1V2AA 2JZSA 1YEPA 4EUYA 1Q98A 4HU9A 2FD3A 1XWAA 3PGTA 2VOCA 5EVOA 1MD4A 3C73A 4IP6A 1AUCA 5CRGA 3TGZA 2P5RA 5A4UA 2LRTA 4JBBA 2C0GA 2FA4A 4ZILA 3IPZA 4GWRA 2MMOA 2CX4A 3CSHA 1GTBA 5JWRB 3KP9A 1BAYA 2LRCA 3TCOA 4LL1B 1KBNA 4PUFC 4KW6A 3DVXA 3LXZA 2GS3A 3GL5A 3UOMA 2MMZA 2NVLA 1PL1A 2J9HA 4IKHA 12GSA 3FRCA 4YAPA 5J41A 1SKSB 2GZPA 3A3TA 3M1GA 3IAS2 3BCIA 3W6GA 4KE3A 1GTIA 1EV4A 2BJXA 4ECJA 6GSTA 1O73A 2WGRA 4ZBAA 1KNGA 2GQKA 2L4CA 4CW9A 4I2TA 5INYA 3M8NA 3E3EA 2CA8A 3ZTLA 1WP0A 4RI7A 2H0GA 4BVYA 1R7HA 5A4VA 3GSSA 3A5WA 4WBRD 2K8VA 4IS0A 10GSA 5IOWA 1T3BA 2OE0A 1XOAA 1Q4JA 3DRNA 4BL7A 1G7OA 4NWYA 3F4TA 1ST9A 2DJ2A 1PGTA 1TP9A 3DYRA 1YKCA 2B7KA 2REMA 3TOUA 2ON7A 3C8EA 5ECKB 3BOAA 2LEGA 5D9VA 3HXSA 5ECRB 1TK0B 2R37A 4LMVA 1J9BA 1FB0A 1QFNA 3LQ7A 1NSWA 3Q6OA 2FY6A 1X5EA 4HI7A 3CSJA 3VI5A 1A8YA 3D5JA 3IE3A 5LNKe 4L5LA 4MJCA 3U6VA 1V98A 2CVBA 4JEDA 2IIYA 4MLYA 4TOPA 3D4TA 1JZOA 1GSEA 4O5RA 1XFLA 3KM6A 4WEYA 5JCUA 3L4NA 3CRUA 1AXDA 1AW9A 3KEBA 2LQQA 2M46A 1PQNA 2AUVA 2LQOA 5GAPD 3DXBA 1SK0A 3EMPA 4ECCA 2RM5A 4TN8A 5DJMA 4IHUA 2OACA 5ECQB 5IOXA 3GN3A 4V2LA 2PVOC 3TOTA 4GRFA 3PINA 3M0FA 3Q19A 1MDJA 2PGTA 1TRSA 3TKRA 1MD3A 3TUEA 2R2JA 3FY7A 2YWOA 2B5XA 2RIIA 1X5DA 2JZRA 4KNDA 1FW1A 3QR6A 1G0TA 1M2DA 1SJIA 5D93A 2HZEA 1K0CA 5E4WA 4X43A 2R5GA 4GSNA 1H75A 2O8VB 2L6DA 3GV1A 3VLNA 4XCSA 4L8EA 1OE7A 3VFIA 2WDUA 3F63A 1X5CA 4ILFA 3VURA 3KP8A 2CV4A 1SJZA 5CRDA 5DALA 5CP1A 5DAKA 1C72A 4LLRA 2GZYA 2H76A 2WCIA 3R2QA 1U6TA 2RUEA 1ZYEA 3TRXA 1AQXA 1A0RP 4TR1A 4TR4A 4K9ZA 3HZ8A 3GA4A 3CYNA 1ACVA 4DSQA 1PKWA 3QDNA 3N5OA 4MZCA 3LEFA 4CDOA 4KX4A 3FR3A 1TJDA 3TB2A 2HYXA 5DALB 2H1DA 1T1VA 5DAKB 1F9MA 5GSSA 3GUSA 3BCKA 1XW9A 2JACA 1RW1A 4HU7A 3EMXA 2G2QA 2H6ZA 1ON4A 3QD9A 2VCTA 5H5RA 2IWTA 4KCAA 4OCEA 3M9JA 5A4WA 3VWUA 4RQRA 3CSIA 4WR4A 3ZYWA 3KJYA 4NV2A 2M80A 2O7KA 2DMMA 2H1AA 5IO2A 2H70A 2K9FA 2YJ7A 3QAWA 5ELGA 7GSSA 3HY2A 3ISOA 3KZQA 1OC3A 3C7MA 4POMA 4FO5A 1AC1A 1SENA 3ZIJA 4MZWA 11GSA 1A24A 2H66A 3N9JA 1FVKA 4TRXA 4KA0A 4K7NA 4MJBA 4KDXA 3V1WA 3APQA 3TKPA 1WPIA 4RQXA 3TRPA 3IAM2 2JSZA 5IMFA 1Y25A 5HR1A 4JRRA 2C0DA 2A2RA 3TRQA 2EIRA 2V6OA 3TDGA 5DDLA 2GSQA 4EO3A 2FA8A 1Z6NA 5H5QA 3HZ4A 1ZYQB 1TU8A 1K0AA 5IIZA 1PX7A 1HD2A 3ZFBA 3GKXA 2DJ0A 4ZL8A 1M9AA 2XC2A 4F9ZA 1U3AA 3ED3A 3MAKA 4IELA 1J08A 3D21A 1XWCA 4O32A 3UARA 1K3OA 2I3YA 3UAPA 4GSTA 1EP7A 5AGYA 4OD7A 2H75A 4ULXA 1JZRA 4OFMA 2HZFA 4MJAA 1NHOA 3QPMA 5DCGA 4N30A 5F8BA 1O8XA 3KH7A 2PU9C 2R6KA 4ZBBA 1S3AA 4GTUA 3EE2A 3QMXA 4K0NA 1UVZA 3LFLA 1R5AA 5G5FA 5HR3A 2QGVA 1AAZA 3UIWA 1MDIA 5G1LA 1HNAA 4LL4B 4HUAA 4PNGA 2PWJA 2KUCA 1BYEA 1TK8B 3WGDA 2HE3A 4PUAA 1GULA 2BMXA 4MH3A 2CAQA 3I69A 2IJYA 3NOFA 4TVEA 1XBSA 3WT1A 3FW2A 2R3XA 2LSTA 3IBHA 2PUKC 3J7Yk 2PN8A 2YCDA 2GGTA 2HXKA 3ZVJA 5IO0A 1ML6A 2F8AA 3FZ4A 1ZMAA 4D73B 3CXGA 2DJKA 1IYHA 1QUWA 5CNWA 5COHA 2WS2A 5IMZA 5CYYA 5G31A 2DC5A 2BTOT 2IMDA 4PXOA 1SKRB 2HT9A 3GKMA 3S9FA 4HQSA 3UVTA 1YY7A 5AIVA 4EDYA 4F2IA 1T4ZA 5ECIB 2X8CA 1EOGA 3LJRA 3FEUA 3LG6A 2VD1A 1ZOFA 4X0XA 4CHSA 4I97A 2H0HA 4AJ8A 1XZOA 3E0UA 4FYBA 2WJUA 2B1LA 1A23A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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Chord Diagram

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