3TDG | Genus

Total Genus 77

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	77
sequence length	232
structure length	232
Chain Sequence	QDNLVSVIEKQTNKKVRILEIKPLKSSQDLKMVVIEDPDTKYNIPLVVSKDGNLIIGLSNIFFSNKSDDVQLVAETNQKVQALNATQQNSAKLNAIFNEIPADYAIELPSTNAANKDKILYIVSDPMCPHCQKELTKLRDHLKENTVRMVVVGWLGVNSAKKAALIQEEMAKARARGASVEDKISILEKIYSTQYDINAQKEPEDLRTKVENTTKKIFESGVIKGVPFLYHY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structural and functional characterization of Helicobacter pylori DsbG pubmed doi rcsb
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Helicobacter pylori
molecule keywords	Putative uncharacterized protein
total genus	77
structure length	232
sequence length	232
ec nomenclature
pdb deposition date	2011-08-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF18257	DsbG_N	Disulfide isomerase DsbG N-terminal

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.450.520	Alpha Beta	Roll	Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,	Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,	3tdgA01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3tdgA02

1GSUA 8GSSA 4TXOB 3HXSA 5KN2A 3QDNA 3EINA 4EXJA 4MJBA 2H70A 3TUEA 3M1GA 2XC2A 1T8EB 2RM6A 3HZ4A 1USBA 1GLQA 2DIZA 2WRTA 4PURA 3A2XA 1OC3A 4IKHA 1U87A 2PVOC 2R5GA 2OE3A 3QPMA 3WGDA 3UARA 4EKZA 2VM2A 3C1SA 1ML6A 4HU7A 2VL2A 1T7PB 1SENA 2MBSA 2L6DA 2H75A 4WBRD 5GSSA 3IOSA 5G1LA 4TRXA 4YAVA 3G9BA 3ZFBA 2C4JA 2DJ0A 1GULA 2OE0A 3ZVJA 1JZRA 3TDGA 1ST9A 3O6TA 1WWJA 3VURA 5ABRA 4E8EA 1AUCA 2VLTA 1K3YA 4ML1A 4MABA 4NHZA 1F37A 5DAKB 2L5LA 1A2LA 1BJXA 2L5OA 1K3LA 1Q98A 4KDUA 3G7YA 3ZRDA 1KNGA 1TOFA 2ZUPA 1EEMA 4IVFA 4GTUA 1LU4A 2LTKA 3FRCA 4EO3A 3CBUA 2KP2A 3VPTA 3WT2A 2LRNA 2VL9A 5B8BA 1F3BA 3ZL5A 3KMNA 1GUHA 1GTUA 4K7IA 1SJIA 4KSMA 2HZEB 3W8SA 3WGEA 4ULXA 1V57A 2QSIA 3Q6OA 4OWYA 1AW9A 4DVCA 2VLVA 12GSA 3U6VA 2ZCTA 4V1Ap 1Q4JA 1BEDA 4EF0A 5KN1A 3EWLA 3VK9A 1GTAA 1ERWA 5KN0A 2FY6A 1GP1A 2VAFA 1AC1A 2LRTA 1V98A 5H5SA 4POMA 1ZL9A 4I97A 3UIWA 5CRDA 3ZMKA 5D9VA 2FWHA 2YCDA 1ZGNA 4RUVA 3GX0A 2RUEA 2VCTA 4N11A 1HNBA 1Y25A 2P31A 2VD1A 3KJYA 2OADA 1MTCA 2AHEA 1K0MA 2JZTA 3J7Yb 1H75A 5CREA 4NMUA 1S3DA 3U5RE 4TKYA 4CDOA 4FYUA 5F05A 3KMOA 1VF2A 2DMMA 2GZPA 4J2FA 4XTSA 2KHPA 3A5WA 1BQ7A 5A5KA 4XS4B 2LJRA 3LWAA 1XPVA 3RHCA 4N0ZA 2GGTA 3GTUA 1EWXA 3MDKA 2DJKA 2LS5A 4D73A 4V2NA 1Z6NA 1BYEA 5IMDA 2C80A 4BA7A 1B9YC 1EV9A 3IV4A 1YF1A 1KBNA 2A2SA 3H4KA 5DJLA 3WYWA 4TR0A 3GSTA 3EURA 5IIZA 1T1VA 4MF5A 2M72A 1K0CA 1CQGA 3PH9A 3HDCA 5FWGA 2FNOA 2EIQA 1PX7A 3CRTA 5INYA 1ZCPA 3D6IA 2I81A 2IPAA 1EP8A 3UOMA 2H01A 2PWJA 2YV7A 2YPMA 5IO2A 3GKMA 4MZBA 2H6XA 2P5QA 3TJKA 2GTUA 2HE3A 4JR4A 2K8VA 4KAEA 4GXZA 4BWSA 4WF5A 2OACA 2GLRA 3KP9A 4LL4B 3RBTA 4PX1A 2C0DA 1AQVA 2NPBA 3FW2A 1QMVA 1M0UA 1MD3A 1AAZA 3TJGA 1CQHA 3D4MA 2H0HA 4QL7A 2X8GA 1K0DA 3JCML 5ECMB 3NOFA 4BVYA 2ON7A 2HFDA 5ECSA 3EU4A 1M7TA 2PUKC 3RHBA 4F0BA 5DALA 3GUSA 1EZKA 3UMAA 6GSXA 5EPFA 3M8NA 1ILOA 1R5PA 4GLTA 5DCHA 1PX6A 3GH6A 2LNTA 4J56E 4IGJA 5L71A 3IR4A 3BCKA 5G2ZA 4P3YB 1TK0B 2CQ9A 1GSDA 4PXOA 5ELAA 2LQQA 3LQ7A 3EC3A 2VOCA 5F0GA 2GSSA 2LV3A 3KTBA 3Q19A 5JWQB 4OO4A 2X64A 4YQVA 5GZZB 2VIMA 3V1WA 2CX4A 1XWAA 2WZ9A 1Z9HA 3ZREA 1GSEA 2A2RA 3CSHA 1FW1A 3SWLA 3F6DA 3QFBC 3TCOA 4ECBA 4IW9A 2DC5A 1K0OA 4F9ZA 2FHEA 4KH7A 3FEUA 3FHKA 5IMFA 3F4RA 1SK0A 5D9TA 5HR0A 2WS2A 4OFNA 4BPYA 1TRSA 4YQUA 4ID0A 2LRCA 3HA9A 3D0ZA 2HYXA 3QD9A 4Q5NA 2BMXA 1XVWA 2WULA 10GSA 3I43A 2HNLA 1LBKA 2GT6A 4QQ7A 1K0BA 3HVSA 1TTZA 1RW1A 3ERGA 2XPEA 4ZBBA 1GNWA 2QKEA 4OFMA 1PA3A 5FHIA 4XRAA 4XS1A 4MJEA 1XXUA 4ECCA 2PMTA 4CHSA 2O87A 2FLSA 2I3YA 1SK2A 4OO5A 2NTOA 3LSZA 3GV1A 1T4ZA 3CSJA 4XHMA 3DIEA 4K8MA 4KW6A 2O8VB 3KP8A 3GX8A 1OC9A 1TP9A 3A2VA 4GSTA 6GSWA 2E7PA 3HYPA 2LSTA 5ID2A 1TJDA 3TOUA 1EP7A 2A4VA 2EIOA 1ZZYA 1ERVA 2L4CA 1SJ6A 3D22A 2NDOA 3EMXA 1T4YA 1GNEA 4HS1A 9GSSA 3QCPA 1SD9A 3GKNA 3TKRA 2X8HA 4I6XA 4NPBA 3W6GA 3IRAA 1PL2A 2FD3A 4MPGA 2DLXA 4YAPA 4H86A 2CV4A 2HLSA 4HZ4A 1NHYA 3GKXA 5LNKe 3FR3A 3ZZXA 5JWOB 2GZZA 2H73A 1JZOA 1MD4A 3I69A 3VWUA 2H71A 4JE1A 3G7JA 2XBIA 3LXTA 4OCFA 1N2AA 1WJKA 1M2DA 3Q18A 2Z9SA 2H6YA 2GT5A 2HXKA 2YZHA 5J4UA 2XBQA 2IMEA 3QOUA 1PQNA 4KE3A 2RIIA 4RQXA 5COHA 2LQOA 1XZOA 5HR2A 1XWGA 2WCIA 4WF4A 2H6ZA 3LORA 3IA1A 5CO3A 3KH7A 2CVKA 3UBKA 5H5QA 1X9WB 5IMVA 1XWCA 3DKSA 1EEJA 2TIRA 4YQMA 4BL7A 4O92A 4DSSA 1NW2A 3NIVA 4IN0A 5DQSA 5ECHB 2VCZA 5CNWA 1JZDA 4X1UA 2V32A 2MBTA 2GQLA 4V2MA 2D2ZA 3TJBA 3VWWA 2R6KA 2H8LA 1XW5A 3GHAA 4WBJA 19GSA 5CRWA 1DE2A 2R2JA 3GFKA 2L57A 5DCGA 1ACVA 1YDKA 1THOA 3APSA 4TVEA 4IQ1A 2YP6A 3IXRA 2YWIA 4KUNA 1SKWB 2X8CA 3OR5A 3DWVA 2C0FA 2VL2C 2GQMA 1HNCA 1PL1A 2C3NA 5H5RA 4MCUA 1O7UA 1ERUA 3WD6A 4QL9A 5AIVA 3RAZA 4NWYA 1G7OA 4PQ1A 3SBCA 1EGOA 3KD0A 5D9XA 3QR6A 2IN3A 4KB3A 3KTLA 4L0WA 1WPIA 1JLWA 2EC4A 3TKSA 4K1FA 3F4SA 3PINA 3FK8A 2GSQA 4GSSA 5DAKA 3FZ9A 2H19A 3VFIA 2LEGA 1UVZA 4KDYA 3ERWA 3IPZA 4PNGA 4KNDA 1DUGA 2VUPA 1Z3EA 4WEYA 3E3EA 1G6YA 1KEBA 5F8BA 3HD5A 1TW9A 2FWGA 1OE8A 3CYNA 2IJYA 2IL3A 2F9SA 3MWHA 3KXOA 5B6NA 2YJ7A 2HZEA 1FHEA 1WP0A 1ZYQB 2G0FA 1DSBA 4ZL9A 1Z6MA 2CX3A 3GSSA 2F8FA 4TW5A 4EL1A 4DSRA 5IPHA 4J57E 3HCZA 3S9FA 4EUYA 1Z7RA 2HSHA 5ECPB 2AYTA 1HYUA 2HRNA 3CSIA 3F6FA 4F82A 1XWKA 4ZB8A 3L9UA 2F3MA 3MAKA 4TR1A 5A4UA 1OKDA 2PERA 3ZITA 1X5DA 3GL5A 1SK1A 2YOIA 1GLPA 3P8WA 1QGVA 4MF6A 4NV5A 3KIJA 1FVJA 1MDJA 5ECLB 1UC7A 4V1Ag 4EDYA 1O85A 3ZIVA 1VGLA 5LCZA 1SD8A 1GL8A 5DJMA 4ISDA 3NZNA 4OD7A 4XS4A 4RI7A 4MDCA 2F51A 3FKFA 4WR4A 2VCXA 1WOUA 3APOA 2AAWA 4JU5A 3I6AA 3CRUA 3DMLA 1F6MC 1PD21 5A4VA 3GTUB 1OAZA 2O7KA 3UEMA 3F0IA 3F3QA 4L5OA 4ZBDA 1GRXA 3TRQA 1C72A 5IOWA 2JZSA 2R37A 2C0EA 3P7XA 2CVBA 2K8SA 6GSTA 1SKSB 1TRUA 2MMAA 5G31A 3RPPA 5IQYA 2CZ3A 4MZWA 2VL3A 2H66A 3ZFLA 2H76A 2IMKA 3FZAA 2H72A 4MLYA 4OMVA 4RQRA 5EVOA 3N5OA 1S3AA 1O73A 2AB6A 3IBHA 1V2AA 2IMIA 5JCWA 1FAAA 1TK8B 1A2JA 2ALBA 3M9JA 1WMJA 3D4TA 4ZIJA 5J9CA 3ZVJD 1SL2B 1YJ6A 1YKAA 4WR5A 1O8WA 4K0NA 1XW9A 4MJCA 5GSTA 2IMFA 2HSYA 3FR6A 1X0RA 3VI7A 1BG5A 3KGKA 4G2EA 4ZILA 3KZQA 1FB6A 1X5EA 1YEPA 1YY7A 3QAVA 2MYGA 1W89A 4XS6A 5C00A 1NM3A 4ECIA 1DE1A 3US3A 4TR3A 4MH2A 2JSYA 3IAM2 2QGVA 3FYGA 2TRXA 2L4QA 4KDXA 1GUMA 1SYRA 2IMDA 20GSA 1B4PA 5DALB 13GSA 3DXBA 1I9DA 4LMWA 3H93A 3KEBA 3HVVA 1TKDB 1VF4A 3C71A 1TXXA 2IFQB 16GSA 3GL3A 1TDIA 5KN3A 1ZYEA 5D93A 1FVKA 2WB9A 3QFAC 3CTGA 2CZ2A 5IPGA 3LGCA 4IHUA 5G5EA 4FIWA 2LUSA 2PN8A 3TOTA 5EY6A 2IIYA 2JL4A 2YNXA 4F03A 2JSZA 5GAND 3UL3A 2HRFA 3F4TA 1Z5YE 1I5GA 4BVXA 5IM9A 1OE7A 3APQA 1OVNA 5DVBA 3K8NA 4IBPA 1O81A 1G7EA 1Z7PA 4PQIA 3ZMLA 2CVDA 3ZTLA 1XOBA 1U3AA 4PNFA 2VCQA 1BX9A 2DIYA 1JZWA 4G10A 4K9ZA 2XPDA 4GCIA 3GURA 2YWNA 5IOXA 1AIUA 4K7NA 1PSQA 2KOKA 3LFLA 1PMTA 4OCEA 5JCGA 1WIKA 2N5AA 5C04A 4EE0A 3PR8A 1M99A 1AQWA 2N5FA 1VRSD 1SU9A 3GH9A 1FO5A 3L9SA 2V1MA 3GMFA 1T3BA 5F06A 1AQXA 3VWXA 2ON5A 2CAIA 3IAS2 22GSA 4K0GA 1T00A 2V2GA 1U3IA 1QQ2A 3FY7A 2REMA 4L5LA 3ERFA 5ELGA 3M3MA 1A2MA 1UN2A 3BJ5A 1SL0B 2OKAA 1O8XA 1OC9B 3LXZA 1PKWA 4KCAA 4PQHA 5FT3A 3ED3A 4IJIA 3L9VA 1W4VA 2M46A 5AISA 4N0VA 1NHOA 4XRDA 3QMXA 4POLA 5ID2B 2OBKA 1M2AA 2GVPA 2L59A 2LKUA 5B7CA 5D73A 2N5BA 4KGIA 2BJXA 3ZYWA 1GSSA 3H1NA 3FZ5A 2GQKA 5A4WA 1YQ1A 1FG4A 2RUFA 2OBIA 1X5CA 6GSVA 4NV2A 3FR9A 1QUWA 2C1YA 2J23A 4V2LA 4JBBA 4GRFA 1EGRA 1HD2A 3P2AA 1G0TA 4TOPA 3R2QA 4K6XA 2YWOA 4Q5FA 1U6TA 4KSOA 3IE3A 5IMCA 2NBSA 4AJ8A 3TRXA 2GZYA 2JADA 3DRNA 3BOAA 1XFLA 6GSSA 3TGZA 2NVLA 2EIRA 1JHBA 5DQYA 3W8JA 5E4WA 1X9MB 2YJHA 4NXIA 3IK9A 3I9V2 4Q5RA 5CP1A 4TXOA 5IMAA 5DDLA 2JU5A 2PVQA 3LEFA 1R7HA 2AJQB 1QK8A 4MK3A 4FO5A 1ON4A 4N30A 2LNSA 4DSSB 1HNAA 4G19A 2E0QA 1SJZA 2YANA 2CAQA 4HQSA 1A24A 4JEDA 3UAPA 4AJ7A 3ZIJA 3VI5A 3G7IA 4GQCA 2B1KA 4WKWA 3UJ1A 2VM1A 6GSYA 1M9AA 2XHFA 3H8QA 3O3TA 2H1AA 1EOHA 2O85A 2RLIA 4I8BA 1XIYA 2C3QA 3F3RA 1PRXA 2LJKA 2MMOA 4TR4A 1N8JA 3D21A 3LG6A 2WGRA 1V58A 1URMA 1MEKA 5CAXA 3O76A 3VPQA 2H0IA 1YEXA 2QC7A 2B5XA 5F07A 1A8YA 4MP4A 3E0UA 2R4VA 3TKSC 2HZFA 1TRWA 1PGTA 1F3AA 2RM5A 4AF2A 4NAXA 5IMZA 2O89A 4E8HA 4I5QA 5CYYA 2BTOT 3RPNA 3QAWA 17GSA 1B4QA 4OFTA 3HJOA 5D9WA 4N10A 4HQZA 4AJ6A 1VF3A 4ILFA 5J41A 2DMLA 5EL8A 4LL1B 1B48A 1GSYA 2FWFA 3GYKA 3IK7A 3HJMA 3J7Yk 3L78A 1RQMA 3KCMA 5JWRB 1ABAA 1UA5A 3C8EA 4IJ3A 2B5YA 2I4AA 5AGYA 5IO0A 1R4WA 3IC4A 3BCIA 4YH2A 4O7HA 4JRRA 3VLNA 4WETA 2TRCP 1A0RP 5HFIA 1TRVA 1S3CA 3M0FA 14GSA 2DSAA 2B7JA 1MDIA 4X0XA 1VF1A 4F0CA 4MPFA 3C1RA 2V6KA 5HR3A 5ECKB 2VCWA 2B1LA 1M2BA 3WT1A 1TI1A 6GSUA 4IQAA 5GAPD 3GN3A 4G9HA 1ERTA 1TI3A 4NHWA 2M80A 4GQFA 4GWRA 4MZCA 1OKTA 2FA8A 1M9BA 4MF7A 4TR1B 1GWCA 3A2WA 3C7MA 3C73A 2VD0A 5G30A 2FGXA 1GH2A 2B6MA 3ISOA 1YZXA 1K0NA 2I9HA 3N9JA 3ME7A 4I2UA 5D96A 1PKZA 2YN1A 3TKSE 4ZL7A 1V9WA 4MJAA 2ZNMA 4HI7A 3LYPA 1QXHA 4MA9A 4IELA 5G5FA 4HDEA 3WGXA 1V40A 4LMVA 1EV4A 3CTFA 4XIHA 1J9BA 3FZ4A 3CXGA 3DD3A 4RI6A 1U88A 4DEJA 3E9JB 1NSWA 4AGSA 2K18A 1G6WA 4MMMA 1GTIA 2B5EA 2WFCA 1A0FA 2K6VA 4D73B 2H1GA 2H0GA 3DVWA 3LJRA 4FH8A 5HR1A 2V41A 5LD0A 1A8LA 2YV9A 1SYXA 5J5NA 2C3TA 3HVXA 4HZ2A 3L4NA 4PGTA 4POKA 1XVQA 3BBYA 3TKPA 4I2TA 3HY2A 4Q5QA 3EYTA 1YF0A 1SL1B 5G1KA 2VO4A 18GSA 4DSQA 1LJRA 2DJ3A 1B9XC 2YZUA 5ECQB 4FYBA 1TK5B 1GSQA 2PPTA 3EMPA 4KCEA 3PGTA 3HZ8A 1XBSA 2B7KA 2PGTA 4PUAA 1TU8A 4ZL8A 1JFUA 2H74A 3GRXA 2DBCA 3F63A 5AIXA 4HJMA 4HJ2A 2OE1A 5J3RA 1H4OA 5ECNB 2P5RA 1E2YA 1JLVA 2HT9A 3TKQA 4ACSA 1FOVA 3GA4A 1THXA 2C8UA 3DYRA 3TJFA 1R5AA 4KX4A 1Y6EA 4O5RA 1QFNA 4FYCA 4BWQA 3ZLPA 2FA4A 3HKRA 4IS0A 3HJPA 4ZXGA 1IYHA 3H79A 4ECJA 3M9KA 2G2QA 1TU7A 2FWEA 2AUVA 2YWMA 4L8EA 3GIXA 4O32A 4L0UA 3MNGA 2ES7A 1GTBA 3P90A 4HUAA 5KEJA 2B3SA 4KA0A 2VLUA 2X99A 2R3XA 3AY8A 1F9MA 4EDZA 2LJAA 2IFQA 4HU9A 1B8XA 5ECIB 4IP1A 4HOJA 4GSNA 1KTEA 2V6OA 1K0AA 3RDWA 4GF0A 5ECRB 2DJJA 1HQOA 3VWVA 4EC0A 1EOGA 2I1UA 1E6BA 1MDKA 3GKKA 2GDRA 1A23A 3TB2A 3UBLA 4CW9A 2DJ2A 3D5JA 3A3TA 3EU3A 1F2EA 3HHVA 5HFGA 2GSRA 4K7OA 2DJ1A 5B8AA 1WE0A 2H1BA 2C0GA 3F8UA 3BD2A 4F2IA 2KLXA 5HFKA 2IWTA 4K2DA 3TJJA 3ME8A 2KP1A 2PBJA 4JR6A 4POBA 1GSFA 4ZB9A 2H30A 4PUFC 5E59A 2L6CA 5AN1A 2K9FA 3TRPA 4ML6A 1FB0A 1O6JA 1BAYA 3EE2A 3DGQA 3IDVA 2CT6A 4MH3A 2MMNA 1ZMAA 3LYKA 2JZRA 1YKCA 4TN8A 2AV4A 3L0HA 5HQPA 3QAGA 3IHQA 1OYJA 7GSSA 3CMIA 11GSA 1XW6A 4LA1A 3F9UA 2JACA 1WRYA 2HI7A 1RK4A 5JCUA 1SKRB 2WJUA 2GSTA 2VCVA 5ECOB 2E2MA 2MZCA 1R26A 1DBYA 1XWBA 2E2GA 2H1DA 2F8AA 1K3OA 4XCSA 4HEA2 2P0GA 4WXTA 1X9SB 2FUG2 2OJLA 3GNJA 5CRGA 4ZBAA 3KH9A 1XCCA 3UVTA 3UVHA 2KUCA 4LLRA 1XOAA 1PN9A 3DVXA 5ENUA 2MMZA 3KM6A 1IYIA 4JZQA 4EVMA 2PU9C 2GS3A 1J08A 3MSZA 5CRHA 1GUKA 1ZOFA 5J9BA 4IP6A 4ZB6A 5DBQA 1J0FA 2CA8A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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Chord Diagram

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