4NPBA

The crystal structure of thiol:disulfide interchange protein dsbc from yersinia pestis co92
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
ADDSAIQQTLKKLDIQQADIQPSPIPGISTVMTESGVLYISADGKHLLQGPLYDVSGDQPINVTNQALLKKLEALSSEMIVYKAPEEKHVITVFTDITCGYCRKLHEQMKDYNALGITVRYLAFPRQGLSSQAEKDMRSIWCMADRNKAFDDAMKNNDISPATCKTDISKHYQLGVQFGIQGTPAIVLQNGTIVPGYQGPKEMLQMLNAHQASLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of thiol:disulfide interchange protein DsbC from Yersinia pestis CO92
rcsb
molecule keywords Protein disulfide isomerase II
molecule tags Isomerase
source organism Yersinia pestis
total genus 59
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 4npbA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4npbA02
3W6GA 1XWBA 4H86A 2QKEA 4GSTA 1TRVA 2DBCA 3VPQA 2PUKC 4ECIA 1FVJA 3Q19A 3ZVJA 1TRSA 1E6BA 3MDKA 3QOUA 4FIWA 5J3RA 4OCFA 2AAWA 4OFNA 2LSTA 3KZQA 4LL4B 1XW9A 3CRTA 3VWUA 3TKSA 1QXHA 2WULA 2ON7A 2YZHA 3V1WA 5J9BA 3ME7A 10GSA 2TRCP 4TKYA 3ZZXA 1GNWA 5KN0A 1ACVA 3SBCA 5IOXA 1A8LA 4RUVA 3UL3A 1Z3EA 5HR3A 5CNWA 1GSYA 3CTGA 2MBSA 4WR4A 1BG5A 1Q98A 1OYJA 4JU5A 2I81A 5JCGA 3I6AA 2H73A 4Q5NA 2B5XA 4MK3A 4DEJA 2FWFA 3HZ4A 2YWOA 2AB6A 3UBLA 3DD3A 4EVMA 1T3BA 2YN1A 5IMAA 4TN8A 4GQFA 3GL5A 1WOUA 1K0BA 1B4PA 2BJXA 2CV4A 3C1RA 1SJZA 5B6MA 2B3SA 2O8VB 4NHWA 4KH7A 2HSYA 1TI3A 2N5BA 3ED3A 4F0BA 3GV1A 4MDCA 1F9MA 3CBUA 1AQWA 2XBQA 5JCWA 3UEMA 2M80A 2VCVA 3GH6A 2QGVA 3IAM2 2WDUA 1AC1A 1Z6NA 3UARA 3ZREA 2X8GA 3KTBA 3LXTA 2IMDA 4WKWA 5DQSA 4KE3A 2H6ZA 5DJLA 3TJBA 4IJIA 1V57A 3O6TA 1TW9A 2C3QA 3EWLA 5G31A 2VOCA 2V2GA 3D6IA 3ME8A 3D22A 1SU9A 3IDVA 4YAPA 3GH9A 1ERUA 2J9HA 3CSIA 4AJ8A 2IWTA 3NZNA 4F2IA 1MD4A 4MPFA 2RM6A 4ZB8A 1B4QA 3ZITA 4OO4A 2GQKA 3GKKA 4KCEA 5J9CA 2FWGA 3KEBA 5ECMB 4YAVA 3U6VA 2JZRA 2FWEA 4I2UA 3WT1A 1SD8A 1EP7A 1RK4A 4POKA 4HJ2A 3GX8A 3HD5A 2ES7A 1FVKA 1PL2A 1SKWB 4K2DA 1EWXA 3DXBA 3GFKA 2PVOC 1SK2A 4JEDA 3VPTA 2B7JA 4TXOB 3WYWA 2YP6A 2V41A 4F82A 2GZPA 3APSA 1A23A 5D9XA 1XW5A 2HE3A 1M0UA 2BMXA 1MDIA 4O92A 3IK7A 4ZL9A 4XTSA 5KN1A 3FZ5A 5DCGA 3RAZA 4ZBDA 3M8NA 4DSQA 3QFBC 4FYCA 5ECHB 1GSSA 2C0FA 4K7NA 3KIJA 2V6KA 2GSQA 1TOFA 2V1MA 4TXOA 1FB6A 2J23A 1V9WA 5IO2A 1OC9A 2A4VA 1GSFA 3A5WA 2RUFA 1AQVA 5JWQB 3H93A 1TKDB 1HD2A 1TK0B 2NDOA 1V98A 2E7PA 4IELA 2ZUPA 2YCDA 1X5EA 1EEJA 4N0ZA 3WT2A 1J9BA 1O8XA 3UJ1A 1EP8A 1S3CA 1GTAA 2M46A 3M3MA 6GSUA 4LLRA 19GSA 1LJRA 4OD7A 3KXOA 2WB9A 2GZYA 1B48A 3L9SA 4OCEA 5CREA 3R2QA 1IYIA 4KB3A 1GUKA 1WRYA 2P0GA 2OA7A 4ZXGA 3HJPA 3I43A 5CRWA 2O7KA 1Q4JA 1X9SB 2H0HA 1F3BA 2C4JA 3UMAA 1ZGNA 5B8AA 2H6XA 3RPNA 2JSZA 5A4VA 4ML6A 5IPHA 3DIEA 3UAPA 5H5QA 2N5FA 3GHAA 2H0IA 4ECJA 5E4WA 2L6CA 4ZIJA 1ZMAA 1BEDA 7GSSA 2WFCA 1M99A 5JWOB 1QGVA 2QSIA 3D0ZA 1DE2A 1XBSA 2GSRA 4HZ4A 2H1DA 4TW5A 9GSSA 2NVLA 3HKRA 2B6MA 5ECSA 5ABRA 4LMVA 2D2ZA 4N11A 3TKSC 2WJUA 3EU3A 3BD2A 1MDKA 2OJLA 2GT6A 2LQQA 1TU7A 2LRNA 2DJKA 1Y6EA 2WCIA 3ERGA 2DSAA 2N5AA 3F3QA 6GSWA 4KDUA 4QQ7A 2RM5A 3D4TA 2FY6A 5IOWA 2VCQA 1DE1A 3P2AA 2V32A 2C80A 2CA8A 1ZZYA 2DJ2A 3LXZA 4WF4A 3ZIVA 1T4ZA 2VCZA 1G6WA 1K0MA 4AF2A 2B5YA 4ACSA 2YJHA 1BQ7A 1XWKA 5F8BA 2H0GA 3LORA 5ECLB 1OKDA 3HVVA 3FYGA 3C8EA 1FAAA 3C71A 4KSOA 2QC7A 2GDRA 2YNXA 4HEA2 4JZQA 1T8EB 5F05A 4MA9A 1GSEA 2L59A 2GQLA 11GSA 3QAWA 3FHKA 4O5RA 2MMOA 2YWMA 3DVWA 1V58A 4IBPA 3IE3A 1TK8B 4GWRA 4NAXA 2VL3A 3F6FA 4MCUA 3TKQA 3UBKA 3U5RE 2ZCTA 1AUCA 5G1LA 4EDYA 3BJ5A 1F3AA 1YEPA 1H4OA 3BOAA 4BPYA 2RUEA 3L4NA 4GLTA 1EGOA 1LU4A 2OE0A 2CQ9A 4V2MA 4ZBAA 1SKRB 5INYA 2B5EA 1UVZA 2LKUA 1FB0A 3EMPA 2F8FA 4PXOA 3GYKA 1GH2A 3VFIA 4MABA 3A2WA 3TRQA 5C04A 2P5QA 2IIYA 1NHOA 4EDZA 4TRXA 3CSJA 2HRNA 5ELGA 3ZRDA 4DSSA 3ZVJD 3SWLA 2JSYA 5IMDA 1UA5A 2CAIA 1A2LA 3WD6A 4MH3A 1ZL9A 2MZCA 4N30A 1YJ6A 1M7TA 1V2AA 4K6XA 1QFNA 3HY2A 1OAZA 2JZSA 3LGCA 1XWCA 3KJYA 3TJKA 1BAYA 4GRFA 1SL0B 4HJMA 4L5OA 4ZL8A 4DSRA 2DJ3A 2GSTA 3ERWA 4POMA 5F0GA 4IGJA 3PGTA 4EO3A 3UVTA 5JWRB 1T4YA 2C1YA 4MH2A 5CRHA 4GXZA 2VM2A 3CRUA 4O7HA 5F06A 3UIWA 1KEBA 2F3MA 2PERA 2REMA 1GWCA 1YF0A 5LD0A 4EL1A 3A3TA 5HR2A 4FO5A 4XCSA 3RPPA 3ZL5A 4WXTA 2YV9A 4BVYA 3ZFLA 5IM9A 5B7CA 1O85A 1VF1A 4KAEA 3FZAA 1SD9A 5IIZA 2WS2A 3HHVA 1R26A 1EOHA 1PL1A 2PWJA 3IPZA 1HNAA 5J4UA 2H1BA 5HFGA 5B8BA 4GSSA 4NWYA 2VCTA 1JZOA 2FNOA 1GSUA 2FHEA 3W8JA 2Z9SA 4OFTA 4TXVA 4WR5A 2GQMA 2H76A 1YKAA 1AAZA 1ERWA 5DBQA 2RLIA 3TJJA 1T00A 4NHZA 4ID0A 1WMJA 4QL7A 3F4RA 1JZDA 5FWGA 4MF7A 5IMVA 3FR9A 5IPGA 3D4MA 6GSXA 4E8EA 2L5OA 2KP1A 3DYRA 4G9HA 3LJRA 1JZWA 2RIIA 5D73A 4K8MA 2OADA 2XBIA 5G5FA 6GSVA 4X43A 3ZIJA 2LNSA 4IVFA 1SJ6A 1PX7A 3S9FA 3FEUA 4NMUA 4PGTA 1Z5YE 2F51A 3HYPA 3F3RA 3HCZA 1SENA 3GNJA 3M9KA 4RI6A 2C0EA 5AIVA 2DIZA 4XIHA 3F63A 3IHQA 1FG4A 2HFDA 1HNBA 4MF6A 2FA4A 3RDWA 3QMXA 1VF3A 1V40A 3GURA 3EMXA 4ECCA 2GLRA 3HA9A 5CAXA 2KLXA 3OR5A 1PSQA 2YWIA 1WE0A 4QL9A 2B1LA 4MJEA 2OE1A 4KCAA 4BL7A 3LSZA 4ZBBA 3KP8A 4HOJA 4TR4A 5G1KA 3G9BA 1UC7A 1AQXA 2JACA 4PQIA 4WEYA 1QMVA 3MWHA 5ECIB 2VL9A 3GSSA 5DALB 4RQRA 2YV7A 1K3OA 4K0GA 1OE7A 4HQSA 4CHSA 2WGRA 2K6VA 1NM3A 3M0FA 4MF5A 1R4WA 4AJ7A 1A0FA 1JLWA 5D96A 1CQGA 3HJMA 1XWGA 3UOMA 1XW6A 2YPMA 1NHYA 4G10A 3QFAC 3GL3A 5DALA 2K18A 3QAGA 1O81A 2H01A 1K3LA 4PX1A 2WZ9A 3I9V2 2VIMA 5ECNB 3H79A 2JL4A 3O76A 2DLXA 2V6OA 22GSA 1GP1A 3J7Yb 5DDLA 1M2AA 2R37A 3LYKA 3KMNA 3QCPA 1B8XA 1R7HA 2I4AA 5AN1A 4K9ZA 2H8LA 5HQPA 4WBJA 2PU9C 3VURA 5ID2B 4F0CA 4ZB6A 2NTOA 4PURA 1T1VA 2E2GA 1Y25A 1XCCA 5LCZA 2OBIA 12GSA 2JZTA 1GRXA 20GSA 3F0IA 5IMZA 2LTKA 2EC4A 3TDGA 3FRCA 4OMVA 4GF0A 1G0TA 1BJXA 1X9WB 3HDCA 2CVBA 4L5LA 1EV9A 13GSA 5JCUA 4MJBA 4EE0A 5HFIA 1GTIA 2A2SA 4HUAA 2GZZA 3IR4A 3IA1A 3HJOA 2WRTA 1S3AA 3A2VA 2VLUA 1K0OA 1PX6A 1M9BA 5H5SA 4L0WA 4JE1A 2VD1A 5KN2A 1F6MC 3GN3A 1X5DA 6GSYA 2I9HA 5DAKB 1VF4A 3N5OA 5KEJA 1TI1A 2LNTA 3BCKA 4XS4B 1XOBA 3M1GA 4HU7A 1GLPA 2GVPA 2X8CA 1F37A 4ULXA 4NV5A 5ECKB 4ILFA 1T7PB 4Z7XA 2HXKA 1JHBA 1ML6A 2LRCA 2O85A 2R3XA 2MMNA 5J41A 2MBTA 2H75A 3TKPA 2YZUA 2CX3A 3ERFA 3CMIA 4KDXA 1U87A 2I3YA 1ST9A 4PUFC 1K0CA 1CQHA 2CZ3A 3EYTA 3N9JA 3IAS2 5CRGA 2H72A 2G0FA 2YOIA 4KNDA 4V1Ap 5J5NA 3G7IA 1EGRA 2DIYA 4EUYA 2GTUA 2R4VA 1Z9HA 4Q5FA 3DRNA 2IN3A 4TR1B 2C8UA 2G2QA 1VRSD 4YQMA 4JRRA 2K9FA 1SYXA 4GSNA 3TKRA 1LBKA 2R6KA 2VCXA 3H4KA 1TXXA 4D73B 4XRAA 2VAFA 1MDJA 1UN2A 3P7XA 2HRFA 2VLTA 2C3NA 1F2EA 1OKTA 5CO3A 1EEMA 2NPBA 3J7Yk 1K0DA 3PR8A 3QDNA 3TJFA 3TRXA 4OFMA 4PUAA 3G7YA 2DC5A 1SK0A 3QAVA 3A2XA 3O3TA 4CW9A 4I97A 3D21A 4X1UA 3E9JB 2IMIA 4E8HA 3TJGA 2C0GA 2PGTA 3LG6A 2PMTA 2TIRA 1TRWA 3L78A 1N2AA 1URMA 4I8BA 3F9UA 1XZOA 2MYGA 3E0UA 3PH9A 4Q5QA 3KGKA 2LV3A 4IQ1A 2IFQB 4K7IA 1G7EA 4WF5A 3NIVA 2HI7A 3KP9A 1A0RP 1GTBA 1K0AA 4NV2A 5AIXA 2B1KA 3DMLA 5ECPB 1TK5B 1XPVA 1FW1A 1SYRA 1PRXA 3KH9A 3ZMKA 2EIQA 1NW2A 4FH8A 1YEXA 1DUGA 2LJAA 1ZYQB 3E3EA 1TTZA 1GL8A 4PQHA 2A2RA 1G6YA 5E59A 1WPIA 2ON5A 1R5PA 1OC3A 3Q74A 2FA8A 2FWHA 4IHUA 4K7OA 2VO4A 2GSSA 2KHPA 1J08A 3IK9A 3PINA 3TGZA 3GX0A 2GT5A 18GSA 5IMCA 2PVQA 3CYNA 3DVXA 3FZ9A 4YH2A 1QUWA 1Z7PA 3TCOA 5ECOB 3LEFA 2AYTA 2DMLA 2OBKA 2K8VA 5D9TA 4P3YB 3ZTLA 3FKFA 1OE8A 5G5EA 2GGTA 2YWNA 3RHCA 1GLQA 3MSZA 2OE3A 3VK9A 3TB2A 3VI5A 1SJIA 5CYYA 3FW2A 3GUSA 4GTUA 4MPGA 4G19A 2X64A 5GSTA 5DQYA 1HQOA 3GKMA 2IY2A 4MP4A 5DJMA 2IPAA 1B9XC 1W89A 2PN8A 1PA3A 3F6DA 2JADA 3DEXA 1YDKA 2L4CA 3ISOA 1THXA 2XC2A 3EC3A 4N10A 1ON4A 3IXRA 3FZ4A 4Q5RA 1GULA 3L0HA 3HVSA 5AISA 4F03A 4TR0A 1KBNA 3L9UA 4HS1A 1BYEA 1YKCA 4BA7A 4POLA 1PQNA 4HQZA 5AGYA 4CDOA 3KH7A 4IS0A 3US3A 2E2MA 4FYBA 1U6TA 4JR6A 4PQ1A 4TVEA 1EV4A 2XPDA 3LYPA 4YQUA 3QD9A 3IV4A 2AJQB 3Q6OA 2L5LA 2X8HA 4I5QA 1OVNA 4RI7A 1SL1B 5IMFA 1PN9A 17GSA 4IP6A 4KX4A 2CAQA 2K8SA 3GA4A 2E0QA 1RQMA 3TOUA 4FYUA 2FCHA 3JCML 1YZXA 3C7MA 4MZWA 2IMKA 4XS6A 2AHEA 3Q18A 3QR6A 4EF0A 2IYJA 4ZL7A 2IMFA 4XRDA 3HZ8A 1THOA 5A4UA 3IRAA 2YANA 4MZBA 5G2ZA 3FR3A 4KDYA 1GTUA 2CZ2A 2P31A 4KA0A 3VLNA 2LS5A 3HXSA 1S3DA 3TUEA 2ZNMA 1R5AA 2F9SA 3G7JA 4TOPA 5D8IA 3ZYWA 4EC0A 2OACA 1MEKA 4LL1B 3VI7A 1I5GA 2LQOA 3GRXA 3RHBA 1O7UA 3H1NA 3FR6A 4GCIA 5GZZB 3TOTA 4IP1A 4HDEA 5D9VA 3QPMA 1Z6MA 5FHIA 1A24A 1WIKA 2DJ0A 4J2FA 4LMWA 3VWXA 2H30A 1G7OA 4AJ6A 4NPBA 2H71A 3TRPA 3H8QA 2I1UA 4NXIA 3F4SA 2VL2A 3EE2A 4F9ZA 5L71A 4EXJA 2HZFA 5HR0A 2XHFA 3APOA 5A4WA 2KUCA 1X5CA 4HZ2A 1YY7A 3M9JA 3VWWA 1XWAA 16GSA 3CXGA 1ERTA 3ZFBA 2L57A 2VCWA 1EZKA 4ECBA 1GSDA 2P5RA 3NOFA 4JBBA 4ZILA 4G2EA 3F8UA 1VGLA 1GUHA 4POBA 1WWJA 5GAND 4J57E 2HZEB 1DSBA 1TJDA 3KMOA 1AW9A 1EOGA 1QK8A 2JU5A 1OC9B 4N0VA 4PNFA 3VWVA 5DVBA 4BWQA 2L4QA 3GIXA 4O32A 3GTUB 1J0FA 4ML1A 1GSQA 3IC4A 4BWSA 3RBTA 2HSHA 3DGQA 2H6YA 4IQAA 1DBYA 3BBYA 1ZCPA 2H70A 4LA1A 3MNGA 5GSSA 1SK1A 1YF1A 2HZEA 1N8JA 1U3AA 2FUG2 4KUNA 3HVXA 2L6DA 4MJAA 1YQ1A 4PNGA 1GNEA 3WGDA 2C3TA 4WBRD 4OWYA 2CVKA 2H66A 3EINA 4RQXA 2HNLA 2XPEA 1NSWA 2HYXA 4KSMA 3GTUA 5ID2A 1JZRA 1PGTA 2C0DA 1QQ2A 1B9YC 4KGIA 6GSTA 2DMMA 2KP2A 1XVQA 1U88A 1TRUA 2AV4A 3K8NA 4X0XA 1ERVA 1GUMA 4K0NA 2B7KA 3KM6A 2R2JA 2EIRA 3BCIA 3KTLA 1PKZA 2FLSA 1SKSB 5ECQB 1U3IA 5B6NA 1O8WA 1MD3A 1MTCA 2BTOT 4TR3A 3GKNA 2H1AA 1A2MA 4ZB9A 2GS3A 1O6JA 1XXUA 3EVIA 14GSA 2FD3A 5D93A 3WGXA 1K3YA 5ELAA 3GKXA 4V1Ag 5EL8A 1XFLA 3FK8A 1FOVA 2IL3A 5IO0A 3TKSE 2LRTA 1TU8A 2F8AA 5DAKA 1C72A 1TP9A 4XS4A 2MMZA 3KD0A 2MMAA 4BVXA 2DJ1A 2ALBA 2LJKA 2DJJA 1ZOFA 4IN0A 4GQCA 3LWAA 4L0UA 2LJRA 5LNKe 2CVDA 3GSTA 5HR1A 3IOSA 2EIOA 4I2TA 4YQVA 1HYUA 1PMTA 4XHMA 5COHA 4EKZA 1M9AA 2TRXA 3P90A 1O73A 2M72A 1K0NA 1IYHA 4WETA 1PKWA 5D9WA 5C00A 3FY7A 2H74A 1SL2B 3C1SA 3WGEA 4HI7A 5A5KA 4IJ3A 3I69A 3AY8A 5IQYA 5EVOA 5GAPD 3ZLPA 4HU9A 1X0RA 3L9VA 1VF2A 1ABAA 2H19A 3LFLA 4TR1A 2VD0A 5EPFA 2VUPA 5DCHA 1ILOA 2H1GA 2PBJA 2KOKA 5F07A 1KTEA 4DVCA 4AGSA 1W4VA 3W8SA 4L8EA 1USBA 3GMFA 5FT3A 4D73A 1XIYA 5ECRB 1E2YA 2FGXA 2VM1A 3LQ7A 2HLSA 1BX9A 8GSSA 3P8WA 4K1FA 1A2JA 1OC8A 5CRDA 2AUVA 4KW6A 3UVHA 5CP1A 2O89A 2PPTA 1X9MB 1ZYEA 4MMMA 4DSSB 1TDIA 1WJKA 4I6XA 1M2BA 2X99A 2OKAA 2YJ7A 4V2NA 4ISDA 3C73A 1XOAA 1JFUA 3CTFA 4IW9A 1XVWA 4OO5A 4J56E 1AXDA 3DKSA 3F4TA 3IBHA 5KN3A 5EY6A 2IJYA 1I9DA 2LEGA 1A8YA 2IFQA 2VL2C 4XS1A 3EU4A 5HFKA 2O87A 3EURA 4MLYA 3ZMLA 2NBSA 4V2LA 2IMEA 3MAKA 2VLVA 4MZCA 1M2DA 1HNCA 2HT9A 6GSSA 1AIUA 1PD21 4MJCA 2R5GA 4JR4A 5H5RA 3CSHA 5G30A 2LUSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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