4NPBA

The crystal structure of thiol:disulfide interchange protein dsbc from yersinia pestis co92
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
ADDSAIQQTLKKLDIQQADIQPSPIPGISTVMTESGVLYISADGKHLLQGPLYDVSGDQPINVTNQALLKKLEALSSEMIVYKAPEEKHVITVFTDITCGYCRKLHEQMKDYNALGITVRYLAFPRQGLSSQAEKDMRSIWCMADRNKAFDDAMKNNDISPATCKTDISKHYQLGVQFGIQGTPAIVLQNGTIVPGYQGPKEMLQMLNAHQASLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Yersinia pestis
publication title The crystal structure of thiol:disulfide interchange protein DsbC from Yersinia pestis CO92
rcsb
molecule keywords Protein disulfide isomerase II
total genus 59
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 4npbA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4npbA02
3C7MA 3GV1A 4LLRA 4G9HA 4HQZA 1SK0A 3CSIA 1TK0B 3HA9A 5AN1A 1GTUA 5IPGA 1YY7A 5JWOB 1EEJA 1SJZA 4GTUA 5DDLA 3GKXA 3KTLA 4MK3A 1NSWA 1XW6A 3C73A 4KA0A 4HJ2A 2VL9A 2WS2A 1FHEA 3HYPA 4GQCA 2JZSA 5DALA 3TKSA 3O6TA 1EZKA 2VCZA 4KB3A 3P90A 3TJKA 2Z9SA 3MNGA 3LEFA 4FIWA 18GSA 1LJRA 2LKUA 3WT2A 3F3RA 4NWYA 4TRXA 2H0IA 4GSNA 5E59A 5B6NA 5IMCA 2P0GA 4PQHA 5IO0A 5HQPA 2H01A 4FYCA 2AAWA 1GTBA 3GUSA 5KN0A 5J9CA 1TU8A 5IO2A 4HZ2A 1YJ6A 5D8IA 3FW2A 4HJMA 5G2ZA 3MSZA 2FGXA 5FHIA 3HVSA 3KP9A 3M8NA 5JWRB 1I9DA 4HU9A 4IJIA 1F6MC 4ZBDA 14GSA 1TRWA 5FT3A 2RUEA 3GL3A 3RHCA 5E4WA 4JR4A 4TKYA 4TVEA 1XFLA 1SJ6A 5DCGA 4ML1A 2V6OA 1K0BA 9GSSA 3LXTA 2RM6A 4OCFA 5HFKA 3TGZA 2EC4A 1V2AA 3DXBA 2GQKA 2YV9A 4Q5NA 1KTEA 3H79A 1EP8A 1SKWB 1X9MB 2A2SA 2VIMA 2VD1A 1TRUA 4FO5A 1QUWA 1EGOA 1PD21 2MMOA 2YANA 3QR6A 5EY6A 4J2FA 5ID2A 5J4UA 2VCXA 3GH6A 2X99A 1V98A 3VI5A 4OWYA 3L0HA 4MPGA 4GRFA 3TOUA 3KTBA 4FYBA 2L5OA 1USBA 4IJ3A 2GSTA 4V2NA 1SL2B 4Z7XA 5ELGA 5DJLA 2FCHA 3CRTA 5D9VA 4WXTA 3KMNA 3TKRA 1M9BA 3ME7A 2H0GA 4F0BA 2VM2A 1H4OA 3I6AA 5LCZA 3FZAA 3LGCA 4OO4A 3GX0A 1XIYA 3TKPA 2ZNMA 1XVQA 1ERUA 3KJYA 1S3AA 1GNEA 1XWBA 2H74A 1BG5A 2L4CA 4TN8A 3I43A 2HYXA 1GP1A 3DMLA 2PN8A 3GIXA 1SENA 2ALBA 4F03A 2BJXA 2R2JA 2FWFA 4IP6A 4DEJA 1A0FA 3IRAA 1Z6NA 1T00A 1ST9A 1T4YA 3HZ4A 1XCCA 1HYUA 1GSYA 4PURA 4ACSA 2LJKA 3EURA 3EU3A 4GSTA 2WCIA 2O87A 1M2BA 4YH2A 3IHQA 5LD0A 2F9SA 5KN1A 4PX1A 13GSA 3ERWA 1GSQA 4Q5QA 4ZBBA 1YKAA 3UJ1A 2WFCA 3DD3A 5CRDA 4J57E 1PQNA 1VF2A 2VLTA 1K0MA 1OC8A 4K1FA 2IPAA 2H1BA 2DJ0A 4F9ZA 4KNDA 2ZCTA 4YAVA 2K8VA 2HNLA 3HZ8A 2R37A 4TW5A 2LS5A 3L9VA 4NV2A 1FW1A 4MZCA 3UBLA 3TOTA 4J56E 3F4RA 3M3MA 2GZPA 4DSSB 3TDGA 3LFLA 3GA4A 5ECSA 3BJ5A 1ZOFA 3PH9A 3DKSA 1MD3A 1C72A 3LXZA 2FY6A 2MMAA 5IPHA 4OFMA 5C04A 2C3TA 4MJCA 3C1SA 5CRHA 2R3XA 5A4WA 3RAZA 1N2AA 2I4AA 20GSA 5G31A 1YKCA 1F37A 1PKWA 2J9HA 1XWKA 3IBHA 2YV7A 3KD0A 2JSYA 1WOUA 4IHUA 2GSRA 3LG6A 2EIQA 4BL7A 3F4TA 2I1UA 2YZHA 4JU5A 4LA1A 3TKSE 1GSUA 2H66A 3BCIA 5HR1A 4F0CA 3UMAA 5F06A 1RW1A 4ZBAA 1U88A 1JZDA 1PL2A 4PQIA 4YAPA 2PGTA 4MABA 3V1WA 7GSSA 4QL9A 1R4WA 1TOFA 4BWSA 5DJMA 1BQ7A 3CTGA 1EEMA 2FNOA 3FK8A 2GTUA 5DVBA 2YN1A 1GSDA 1TW9A 1OKTA 1M99A 5J41A 2H30A 4TR1A 1U3IA 1T7PB 2G0FA 4RQXA 5DQYA 2H71A 4IW9A 10GSA 1XOBA 4MZWA 5DCHA 2B1LA 4BVXA 5KN3A 3L78A 1O85A 3IDVA 5H5RA 1J0FA 2HSHA 2VO4A 2QSIA 4PUFC 1FG4A 2WZ9A 1BYEA 3ZMLA 3KIJA 3HD5A 3A3TA 4EF0A 3HKRA 3E0UA 2YNXA 1BEDA 3M0FA 1XBSA 2IFQA 5D96A 4OFNA 2H1GA 2YWMA 1A8YA 1MTCA 1PA3A 5B8BA 1E6BA 3H4KA 5FWGA 1Q98A 3KM6A 4POMA 4XHMA 2C0EA 1F2EA 3QCPA 1B8XA 3CMIA 3FY7A 1H75A 3UARA 8GSSA 1W89A 5IMFA 3WT1A 1GSFA 3TJGA 1Z9HA 1A2JA 3ZRDA 2CT6A 5IOWA 4L0UA 4WEYA 3HJPA 4IN0A 4IBPA 2VOCA 2A4VA 5ENUA 1EV4A 3LORA 3TJBA 2RLIA 5GZZB 3W8JA 3DVWA 4JBBA 4DSRA 3QAVA 4MP4A 4MH2A 4ECCA 3P2AA 1YDKA 3Q18A 2WGRA 1KBNA 1V40A 6GSSA 5D9TA 4XS4A 3UVTA 3UBKA 3VWXA 1R26A 4RUVA 4WF4A 3Q74A 4JEDA 1B48A 1HNCA 2IMEA 3VPQA 1DE1A 5HR3A 3FYGA 2TIRA 2OKAA 4K7IA 1X5EA 1JZRA 3J7Yb 3KH7A 1Z5YE 4XTSA 4QQ7A 2GSSA 3LWAA 5GSTA 5J3RA 2YPMA 1TJDA 2B7KA 1SL0B 4WKWA 4ULXA 2NDOA 4NMUA 3ISOA 5GAND 4ECIA 4IKHA 4PXOA 3VFIA 4X1UA 1MDIA 2M80A 4OMVA 5G30A 4X43A 1K0OA 2L5LA 1GUKA 1OC3A 2IY2A 4MDCA 4ID0A 2XBIA 4H86A 2WJUA 2JZTA 6GSXA 2C1YA 1A0RP 3UOMA 4TR0A 5CNWA 3VI7A 1K3LA 5C00A 4BWQA 3WGEA 3DYRA 1K0AA 1AC1A 4KE3A 5G5FA 2H70A 3KEBA 5B8AA 2PERA 2HRFA 3G7IA 4OD7A 3PINA 4MPFA 1OAZA 3C71A 3CBUA 3QDNA 4BVYA 2HZFA 1ZYEA 4HDEA 5ECIB 1RQMA 3UL3A 4MMMA 1WE0A 5IMZA 5GAPD 2FA8A 1TDIA 1TI3A 4NHZA 5INYA 2VL2C 1K3OA 2B5YA 4G2EA 2DJJA 1TXXA 2C8UA 3UAPA 1MDJA 1B4PA 1EOGA 4O32A 4HEA2 3ZZXA 3G7JA 1Q4JA 5ECNB 3VLNA 2KLXA 5ECPB 3VURA 4XS1A 1O6JA 3IA1A 5CREA 4MF7A 2B5EA 5IMAA 4XCSA 2OBIA 3MDKA 3Q6OA 4MH3A 1GULA 4N0ZA 1VGLA 4XS6A 2DMMA 3VK9A 2QC7A 4I2TA 1B9YC 4PNFA 3LYKA 3F9UA 2V2GA 3DIEA 3DVXA 3D4MA 3ZVJD 2L6CA 2NPBA 1ZYQB 2QGVA 5ECMB 6GSTA 2FWEA 3WYWA 2AHEA 1ERVA 1WPIA 2IL3A 5LNKe 1EGRA 2H72A 4KCAA 3HJOA 5HR0A 3TB2A 3IXRA 3RDWA 1WP0A 4GWRA 3FEUA 5F05A 4LL4B 4EDYA 4LL1B 2XC2A 2H8LA 5DALB 1M0UA 1AQVA 4KGIA 1OVNA 4JR6A 3GTUA 5ABRA 2JACA 2AB6A 3LQ7A 4CDOA 1NHYA 1EOHA 5DAKA 2E2MA 4F82A 1AQXA 3LYPA 1N8JA 3I69A 3GKMA 4L5LA 2VAFA 1WRYA 2PVOC 3ED3A 2GT6A 3IR4A 1MDKA 3U5RE 1V9WA 4YQVA 2GLRA 3D0ZA 1GTIA 2AUVA 2H73A 2MZCA 6GSWA 1BX9A 4AJ7A 1O8WA 3D21A 1W4VA 1CQGA 2LV3A 1ZL9A 3F6DA 5F8BA 2FWGA 4ISDA 1YF1A 2DIYA 1XWAA 3DWVA 4LMWA 2I9HA 2D2ZA 4N11A 5IIZA 5G1LA 3GH9A 2VCVA 3ZMKA 2HZEA 3CXGA 3GN3A 1GSEA 4K9ZA 1AIUA 2B7JA 1WIKA 4F2IA 4E8HA 1O81A 2GZZA 3N9JA 1XW9A 5EL8A 2CA8A 2LTKA 1AXDA 1KEBA 1PGTA 2IWTA 3ZYWA 2C80A 1PRXA 3BCKA 3L4NA 4HI7A 2K6VA 2DJ2A 4FYUA 3BOAA 4EKZA 4K2DA 1R5PA 1X5CA 1NHOA 1YF0A 3EINA 4KDYA 4KH7A 5CP1A 1I5GA 3S9FA 1FOVA 2BTOT 3FR9A 4P3YB 4K6XA 3FZ9A 6GSVA 1UVZA 1SK2A 2MMNA 3VPTA 2LJRA 3A2WA 1SK1A 3F6FA 4I8BA 1SL1B 1EWXA 2HLSA 1M2DA 2DJ1A 5ID2B 3UIWA 1JZWA 1X5DA 4HU7A 2AYTA 3CTFA 1TKDB 1O7UA 4AGSA 5HFIA 1F9MA 3GKKA 2C3QA 2CX3A 1EP7A 3QMXA 2HRNA 3BD2A 3BBYA 4NXIA 4XRAA 4WR5A 4ZB9A 2PVQA 4RI6A 3M9JA 2LEGA 5AIVA 4TXVA 4IP1A 2MBTA 2YJHA 3FZ5A 2KHPA 3HCZA 3TKQA 2JSZA 4ECBA 3NIVA 4LMVA 2VD0A 3H93A 5J9BA 1B4QA 5DQSA 1X9SB 5ECOB 1ABAA 2GS3A 2OJLA 1JLWA 1U6TA 1GWCA 1DSBA 1KNGA 2LNSA 1TP9A 2O7KA 3F3QA 1S3CA 1ERTA 2IIYA 1GRXA 1THXA 1G7EA 3D22A 1GSSA 1Z6MA 1VF3A 4GQFA 4OO5A 4DVCA 5D73A 4TXOA 2F3MA 3W6GA 2DIZA 4V2LA 2CQ9A 4KDUA 2JZRA 2WDUA 1PX6A 3CRUA 4MZBA 3N5OA 4EO3A 2CVKA 2NVLA 3APOA 1SJIA 3Q19A 5EVOA 5ECRB 1U3AA 1FVKA 2F8AA 2F51A 4HS1A 1VF1A 2N5BA 2GZYA 1ON4A 1UN2A 1YZXA 4EE0A 1T3BA 3ZVJA 4IELA 1HQOA 3F0IA 2EIRA 2PUKC 1T4ZA 3FR3A 3RHBA 4X0XA 3AY8A 3G9BA 5CYYA 1TRSA 2H75A 2PU9C 4PGTA 1F3BA 1J9BA 1URMA 2OE0A 2NTOA 3SBCA 4WF5A 3CYNA 3G7YA 2CAQA 2YWOA 1S3DA 1AQWA 3IPZA 4D73A 2KP2A 2REMA 1GLQA 1U87A 4K8MA 2C3NA 1QK8A 3TJJA 2C0FA 1FO5A 3D4TA 3SWLA 1IYIA 1FVJA 2M46A 4ZL9A 1X9WB 1MD4A 3F4SA 19GSA 3GKNA 4PUAA 1UC7A 1K3YA 2VL3A 2JL4A 2XBQA 1NM3A 5IMDA 3DGQA 2OBKA 1MEKA 1TK8B 1NW2A 3F8UA 3DRNA 2VLVA 5H5QA 1ERWA 3VWUA 1Y25A 4V1Ap 4KDXA 3KMOA 3NOFA 2X64A 2L6DA 5CRGA 5IM9A 4NPBA 3VWVA 3EE2A 1HNAA 1QFNA 1O8XA 3WGDA 2GDRA 2B3SA 2E0QA 2HI7A 4ZL7A 2H0HA 2C0DA 2B1KA 4ZB8A 3FR6A 2HE3A 4EXJA 4O7HA 3TRXA 1XW5A 2VUPA 3FZ4A 2VLUA 1FAAA 4O5RA 2V1MA 3APQA 4EC0A 3QAWA 3WGXA 5F07A 2IYJA 4GLTA 3IOSA 1THOA 4ZILA 4TR1B 4L0WA 3HDCA 3OR5A 2HXKA 1Z3EA 3GL5A 4MJAA 4CHSA 3H1NA 2OA7A 1OYJA 1PX7A 2X8GA 1T1VA 1Z7PA 3RBTA 5G1KA 4FH8A 2MMZA 2LRTA 3MWHA 3CSHA 4RI7A 1ZMAA 4N0VA 22GSA 2B5XA 3ERGA 2IFQB 2K18A 2WRTA 2H6ZA 2MBSA 2LQOA 3C8EA 1FB6A 2LNTA 2DMLA 3GX8A 1GUMA 3TRQA 3TKSC 2O89A 5CAXA 1ZZYA 5CRWA 2I3YA 2XHFA 4I2UA 1K0NA 2LQQA 3HJMA 6GSYA 2VCQA 5JWQB 4ZB6A 4KCEA 2FWHA 4AJ6A 1Y6EA 4BA7A 1YQ1A 1ZCPA 1AAZA 1O73A 3GNJA 4GCIA 3QFAC 2GGTA 1G0TA 3RPPA 4MJEA 3GYKA 1OC9B 5EPFA 4L8EA 2CAIA 2QKEA 5DBQA 4OCEA 1BJXA 3IE3A 2DLXA 2LSTA 4HQSA 3QFBC 2OACA 4PNGA 4GSSA 5IOXA 3GSTA 2WB9A 3ZIVA 4XS4B 3KXOA 5J5NA 4POBA 1WJKA 5CO3A 1XOAA 1TRVA 1T8EB 3DEXA 1GH2A 2H19A 1SKSB 3KP8A 3EVIA 1DE2A 3W8SA 3UEMA 1XVWA 2VL2A 4JE1A 4AJ8A 1G7OA 2PPTA 2ZUPA 1JFUA 4XRDA 1DUGA 1JLVA 4G19A 2L4QA 3VWWA 1TU7A 1HD2A 4KUNA 5HFGA 1J08A 2AV4A 4QL7A 4NAXA 2YCDA 2CV4A 4IGJA 3K8NA 4YQUA 2DBCA 2V41A 1ILOA 2ON5A 3P7XA 3KGKA 4V1Ag 3O3TA 2RM5A 2IN3A 2O85A 1IYHA 3E3EA 2CVDA 4I5QA 1SKRB 2FA4A 2PMTA 5HR2A 1YEXA 2E2GA 1LU4A 5D93A 3MAKA 5JCGA 1SD9A 2DC5A 2JADA 2IMKA 2KP1A 3ZFBA 4DSQA 3FKFA 3IK7A 1F3AA 2GQMA 3KCMA 1X0RA 2MYGA 2K9FA 2R6KA 1QGVA 3HVVA 4PQ1A 5A5KA 3I9V2 3QD9A 2O8VB 1DBYA 1PN9A 1VF4A 2XPDA 2JU5A 2AJQB 3NZNA 2DJKA 3A2VA 3RPNA 3KZQA 4POLA 4DSSA 2RIIA 3HY2A 4Q5RA 3ZLPA 2KOKA 4EDZA 1GLPA 2CVBA 3ZL5A 4MF5A 4GXZA 3EU4A 3ZREA 1JZOA 5D9WA 1PKZA 3GURA 4KAEA 1GTAA 1R5AA 1V58A 1V57A 2IJYA 3PGTA 3LJRA 4KX4A 4TOPA 2X8CA 3R2QA 2FUG2 2G2QA 4HZ4A 2L59A 1XWGA 5A4UA 4EL1A 3KH9A 4ZL8A 1M7TA 4O92A 4EVMA 3ERFA 3FHKA 3QAGA 4RQRA 4KSMA 1QQ2A 3TRPA 4WBJA 4KW6A 3H8QA 1A8LA 4MLYA 4YQMA 5D9XA 4BPYA 4K7OA 1G6WA 2M72A 3GFKA 2CZ3A 3GTUB 2LRNA 3ZTLA 2CX4A 2IMIA 5JCWA 3ZFLA 3QOUA 2R5GA 2VM1A 5DAKB 1Z7RA 4MJBA 1XPVA 2FD3A 2EIOA 2XPEA 2J23A 2WULA 5L71A 1TI1A 1AW9A 1A2MA 1XXUA 2LJAA 1CQHA 4KSOA 2PBJA 4N10A 4WETA 1HNBA 5JCUA 4HUAA 3O76A 3D6IA 1EV9A 4V2MA 2BMXA 4TR4A 2FLSA 4AF2A 2H1AA 3D5JA 2YOIA 5ECQB 2DSAA 1PMTA 1A24A 3GHAA 2IMFA 1K0DA 3J7Yk 3C1RA 5ELAA 3QPMA 3U6VA 1SYRA 3IAS2 2L57A 4JRRA 4NHWA 4IVFA 2HZEB 1TTZA 2F8FA 2YWIA 1OKDA 2E7PA 4I97A 3L9UA 2PWJA 5KN2A 3GSSA 2H6YA 4G10A 2C4JA 4XIHA 4NV5A 4IQ1A 3E9JB 5ECLB 2P5QA 4HOJA 1SD8A 3ZITA 4GF0A 1GUHA 1WWJA 2V32A 2X8HA 3GRXA 2C0GA 2N5FA 2TRCP 3IV4A 1G6YA 1OE7A 1R7HA 4K0NA 16GSA 5B6MA 1AUCA 1UA5A 5ECHB 2H76A 2YZUA 3TCOA 2NBSA 2KUCA 2OADA 2H6XA 4ECJA 3FRCA 4L5OA 3US3A 3IC4A 2LRCA 3EMPA 2N5AA 1TK5B 3EMXA 2OE1A 3PR8A 4ILFA 2GQLA 1JHBA 1SYXA 4ML6A 1VRSD 4WBRD 4Q5FA 4MA9A 2P31A 2K8SA 5B7CA 3JCML 1RK4A 4EUYA 1YEPA 5IMVA 3UVHA 2H1DA 1ZGNA 1GNWA 5GSSA 3F63A 2ES7A 2TRXA 1A23A 3CSJA 3APSA 4WR4A 2LUSA 5ECKB 3HVXA 3IAM2 2HSYA 4IQAA 1ML6A 3GMFA 4ZXGA 2B6MA 4TXOB 1GL8A 1XWCA 3A5WA 4CW9A 2YJ7A 2GSQA 3EWLA 2OE3A 2ON7A 3P8WA 2P5RA 4POKA 5IQYA 1OE8A 2VCWA 4K0GA 2RUFA 1A2LA 1FB0A 3A2XA 2IMDA 3ZIJA 1K0CA 3TJFA 3IK9A 1OC9A 2YP6A 1PL1A 2HT9A 2V6KA 3EC3A 2YWNA 4TR3A 3WD6A 5H5SA 1ACVA 1SU9A 4N30A 2A2RA 2GVPA 3HHVA 5COHA 4ZIJA 2I81A 1QMVA 4MCUA 3L9SA 1BAYA 2GT5A 2FHEA 4JZQA 5AIXA 3LSZA 4K7NA 2DJ3A 1WMJA 5A4VA 2CZ2A 5G5EA 2VCTA 4D73B 6GSUA 11GSA 5KEJA 3TUEA 3M1GA 12GSA 1QXHA 3HXSA 1M2AA 3M9KA 17GSA 1B9XC 1E2YA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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