5G1KA

A triple mutant of dsbg engineered for denitrosylation
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
LPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCGPCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVMPAIYYMSKENTLQQAVGLPDQKTLNIIMGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Sulfur Denitrosylation by an Engineered Trx-Like Dsbg Enzyme Identifies Nucleophilic Cysteine Hydrogen Bonds as Key Functional Determinant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOL DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN DSBG
molecule tags Isomerase
source organism Escherichia coli
total genus 67
structure length 228
sequence length 228
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 5g1kA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5g1kA02
3M9JA 4TRXA 3IK9A 4ZB6A 2CZ2A 1RK4A 2R5GA 2YWIA 1K0DA 2LQOA 2HT9A 3F8UA 1K0BA 4F82A 1DBYA 3P8WA 3W8JA 1E2YA 5B8BA 2F3MA 4ILFA 3CSIA 5CNWA 2N5FA 2KOKA 2GQMA 2J23A 1YQ1A 1O8XA 1XOAA 3APQA 3IC4A 4J2FA 1TU8A 1ERUA 1FB6A 3ERGA 1B9YC 2JZRA 3A5WA 3KZQA 2ZNMA 4MZCA 3HXSA 4GSTA 5KEJA 4V2LA 1DSBA 4WBJA 1TI1A 3D4MA 1BJXA 2IL3A 4AJ7A 3O6TA 2RM5A 2J9HA 4L0UA 3HJPA 4IELA 3ZIVA 1YF1A 3JCML 3BCKA 1ILOA 2WGRA 3N9JA 2BTOT 2R3XA 1B4QA 2FUG2 1VGLA 2OBKA 3BD2A 5FWGA 1H75A 3SBCA 2OKAA 3F4TA 3LYKA 4YQUA 3QR6A 1XFLA 1A2JA 2K8VA 3GX0A 5DALA 4NHZA 4MF6A 3LEFA 5IQYA 3IA1A 3R2QA 1EWXA 3KEBA 2HFDA 2YN1A 3C8EA 5LCZA 5ECPB 6GSWA 3TOUA 5EPFA 1QK8A 1M0UA 5G2ZA 1FOVA 2D2ZA 2LQQA 3TKPA 1YY7A 4OFTA 4QQ7A 2H74A 2NTOA 1OKTA 5J9CA 5GSTA 1HNCA 3I69A 1NM3A 3UEMA 2H01A 4K7OA 5B6NA 4IQ1A 3DWVA 1A2MA 3GSTA 2NPBA 1H4OA 1WP0A 4KB3A 2X64A 2HZEA 4ID0A 2FNOA 2DJ1A 3TDGA 3KTBA 3TRQA 5DJLA 3O3TA 2IMIA 5E4WA 2H30A 3HYPA 1SJIA 4FIWA 1KBNA 1F6MC 1BG5A 5JWOB 2AUVA 2DJ3A 3GTUB 1XW9A 2K9FA 5EL8A 2YZHA 3EU4A 5ECKB 2MYGA 1ZL9A 4KCEA 5HFIA 1BEDA 4KE3A 2MBTA 3LJRA 4XHMA 4YAVA 1B4PA 3QDNA 3LFLA 1GSSA 3HZ4A 2H6XA 5G1LA 2JZSA 3I6AA 1S3DA 2DBCA 1TRVA 1GTUA 2IY2A 2N5BA 2H8LA 2GS3A 5A5KA 1QMVA 3FR3A 2FA4A 2YJ7A 4NWYA 1XXUA 2L4QA 2XC2A 1V9WA 4GQCA 2V6OA 4JR4A 1GSQA 5F05A 1A8LA 2CX4A 3W6GA 1SK0A 4G10A 4FYUA 5GSSA 1ON4A 3GL3A 2DJJA 1HNBA 2O85A 2CZ3A 3QCPA 1X9SB 1M2BA 5F07A 2CAIA 1X5DA 2H19A 5DBQA 1GUMA 4KNDA 3CSHA 2R6KA 1EOHA 1M7TA 1VRSD 1EEMA 1Z7PA 3MWHA 1JLVA 1SD8A 2FCHA 4RUVA 2MBSA 2C0DA 1U87A 4IP1A 4WR5A 4BVYA 5KN0A 5IIZA 3FEUA 4JZQA 10GSA 1HD2A 3OR5A 3EYTA 1ACVA 1B8XA 4HU7A 2H72A 3L9SA 2LSTA 2CVBA 2VM2A 1J0FA 5G30A 4WBRD 2H76A 1O7UA 3DMLA 2C3NA 3UVHA 4X0XA 3HVVA 4IKHA 2H6ZA 1DE1A 1G6WA 3ZRDA 4ML1A 1SJZA 2HRFA 3IR4A 1U6TA 4KSMA 2GSSA 1S3CA 4WKWA 3IAM2 1TI3A 1XWKA 1GSUA 4YQMA 3VI5A 1K0CA 3CBUA 5JWRB 3HHVA 5HR2A 4XRAA 4CHSA 2KLXA 4IQAA 2O7KA 5KN1A 2WFCA 1SYRA 1MEKA 1PX6A 2P0GA 4RQRA 3GYKA 3HVSA 4JE1A 4POBA 3EMPA 3GA4A 3GH6A 2GZYA 4MA9A 2X8HA 3G7IA 1R7HA 3MSZA 1PN9A 5DCGA 4GQFA 2VUPA 3K8NA 4GSNA 4MJEA 4PX1A 2GGTA 1K0OA 2VM1A 2R37A 1RQMA 3DKSA 1FW1A 1K0NA 2B3SA 1SK1A 2H1BA 3HA9A 4G2EA 3GV1A 1QFNA 2FWGA 2IMFA 1WMJA 3WD6A 3F9UA 5CAXA 5AIXA 1U3IA 2QGVA 1JLWA 6GSYA 4MJBA 3EC3A 1ST9A 4DSQA 1T4YA 5GAND 3F3QA 4TVEA 3F63A 4LL1B 5GZZB 1TOFA 3TKSC 2V1MA 4MMMA 3P2AA 2BJXA 4PUFC 4EKZA 9GSSA 4P3YB 3WYWA 2KP1A 4AGSA 2YPMA 3QPMA 4JRRA 2LRTA 4LL4B 1XW6A 2B6MA 3TJBA 4G9HA 3LG6A 4AJ6A 1TRSA 2A2RA 1PL1A 4EC0A 2HXKA 17GSA 2VOCA 4Z7XA 6GSSA 2WDUA 5AIVA 2PERA 5J9BA 5H5RA 3NOFA 2V32A 22GSA 5D9WA 2KUCA 2EIRA 4NPBA 3WGXA 1OKDA 1OE7A 1O81A 2DMMA 2OA7A 3UJ1A 1OYJA 2L5LA 3TRXA 5JCWA 3FR6A 5CRWA 3RHBA 5B8AA 3TUEA 3ZYWA 1Y6EA 4MH2A 2L5OA 5D73A 5IOWA 1Z6NA 2IYJA 1MD4A 3E0UA 3EVIA 3CRUA 3KJYA 3UVTA 2V6KA 4XTSA 3L9UA 3QOUA 3Q74A 1QGVA 1A8YA 3CRTA 2AJQB 3O76A 2TRXA 4V2NA 4NV5A 1G7OA 1X5CA 1GL8A 4K7IA 3M1GA 2WJUA 2FWFA 4V1Ag 2IWTA 4X1UA 1SU9A 5IO2A 1NHOA 3DEXA 5J3RA 3QD9A 4KGIA 4F03A 5IO0A 3VWXA 4TKYA 1TP9A 2FGXA 3D6IA 1AC1A 5J4UA 4JR6A 3TJJA 4POLA 1X9MB 1V2AA 2FA8A 4FYBA 2LNTA 2MMOA 1PKWA 1VF2A 5IOXA 2GQKA 2H1GA 2I4AA 5ID2A 2GVPA 3KH9A 2VCQA 4KW6A 4YH2A 1FVKA 2HNLA 3F4RA 5ABRA 4AF2A 2HE3A 3FZ5A 4TW5A 3GFKA 5HQPA 3WGDA 1KEBA 1TDIA 5HFKA 5ELAA 4MF7A 1X0RA 3KD0A 4OFMA 1YJ6A 1G0TA 3EMXA 1QQ2A 3UIWA 1XWBA 4HQZA 4HU9A 3TKSA 1OC3A 2AAWA 1URMA 5EY6A 2H70A 3ERWA 3GKXA 3BCIA 3MNGA 1TU7A 1XOBA 2HSYA 1GTIA 4HOJA 4BL7A 5ECOB 4ACSA 2B1KA 1XIYA 1UN2A 5DVBA 4GRFA 5AGYA 1JZRA 4WR4A 1GNEA 1WE0A 3IK7A 2RLIA 3U6VA 5HR1A 3M0FA 2OJLA 1B9XC 1XBSA 1JZDA 5DJMA 1F37A 1KNGA 4IVFA 5DAKA 3FKFA 3IE3A 3D4TA 1ERTA 3GUSA 4N30A 5DDLA 2LTKA 3HD5A 4G19A 4IW9A 1FAAA 2RUEA 1UC7A 5LNKe 3IDVA 4HZ2A 1OC9A 3RDWA 1GNWA 5IMDA 3LYPA 5HFGA 2PVQA 1V98A 2VLUA 4O5RA 3TJKA 3F4SA 4FH8A 3US3A 3EINA 2ON7A 4N0VA 3RPNA 3RBTA 4D73B 3LORA 4GLTA 4RQXA 1PSQA 2C1YA 3A2WA 4I8BA 1NW2A 1EZKA 1O85A 3ZMLA 3HY2A 4DSSB 3DXBA 3NZNA 2A4VA 5DQSA 5A4VA 4XIHA 5F0GA 1I5GA 4EL1A 4RI6A 3CXGA 3A3TA 1PKZA 1M2DA 4O92A 1O73A 2IIYA 2WS2A 3FZAA 5CP1A 4TXVA 5H5SA 4K1FA 1HQOA 4ZL7A 4MPGA 4X43A 4EF0A 3AY8A 5CRDA 2QKEA 2C80A 4OO5A 2O8VB 4TR1A 4ZBDA 3KIJA 2AHEA 4OMVA 5C00A 1GUHA 2VIMA 4Q5QA 5IPHA 4MPFA 5COHA 1T3BA 1GSYA 3C73A 2VLTA 4O32A 1TK5B 2ALBA 5IM9A 1PRXA 4POKA 2C3TA 2VCXA 3H79A 1BYEA 1U3AA 3ZIJA 1TK0B 2L6CA 1YKCA 5JCGA 4IGJA 4OWYA 4N11A 4NMUA 2CA8A 3DGQA 3GX8A 2CVDA 3DIEA 1AQXA 2PU9C 1J08A 2OBIA 4DSRA 1FB0A 3BJ5A 4EE0A 2C8UA 2YWNA 2BMXA 5LD0A 2JU5A 3CMIA 2PGTA 1XPVA 4E8EA 4N10A 4ZBAA 2QC7A 2YV7A 3QFAC 1T00A 2XHFA 5AISA 4ZB8A 4F9ZA 4L0WA 2LEGA 2VL2A 2CQ9A 1T1VA 2Z9SA 5DALB 4XS4B 2HZFA 5D93A 2ZUPA 3QAVA 1GWCA 1XWGA 2LNSA 1T8EB 1NSWA 2FY6A 1XW5A 1M9BA 2MZCA 5D8IA 4OCEA 3GURA 5INYA 3M8NA 3KTLA 1YZXA 1O8WA 3UL3A 2GSQA 2F51A 3E3EA 2H6YA 3ED3A 3RHCA 1WOUA 1EGRA 2L59A 3DYRA 2P31A 4K6XA 1JZOA 3DD3A 2K8SA 4MK3A 4HI7A 1BX9A 3PGTA 1AAZA 2FWEA 4OFNA 2CT6A 3Q19A 1USBA 1WIKA 4BWSA 4GXZA 3HJMA 2WB9A 1R4WA 4K0GA 2LUSA 3ERFA 1THOA 5ELGA 3P7XA 13GSA 2CX3A 2FWHA 2HYXA 2PPTA 2JZTA 1CQHA 3QAGA 3VWVA 1A24A 4JEDA 3ZTLA 1PX7A 1HNAA 1OC8A 1T7PB 3FW2A 1MDIA 2B7JA 3HZ8A 5ECHB 2XBQA 2NVLA 1EOGA 1ERVA 3WT2A 5GAPD 1GSEA 3EWLA 1YKAA 3KXOA 1F3BA 2CAQA 1EV4A 2JSYA 4I2TA 1PA3A 5IMZA 3FYGA 1JHBA 4Q5RA 1EP7A 1T4ZA 4HJMA 3ME8A 4HS1A 3VURA 2AV4A 3CTGA 3DRNA 2GT5A 2YANA 1LJRA 3CYNA 4K9ZA 4PQIA 1X5EA 2X99A 3FZ4A 2JL4A 4TN8A 4MLYA 2KP2A 3FR9A 3UMAA 1SKWB 5IMVA 1LBKA 1XWAA 2YCDA 5ECSA 1G7EA 1WRYA 5DCHA 2B5XA 2CV4A 1M2AA 2X8GA 2HSHA 2VO4A 1C72A 3H8QA 4NV2A 14GSA 1QXHA 5JWQB 3LXZA 2PN8A 2LJKA 1BQ7A 1DE2A 2LJAA 2TIRA 2DJKA 3LXTA 5HR3A 3E9JB 4OCFA 1WPIA 3ZVJA 4LMWA 3GHAA 4ZILA 1GRXA 1Z9HA 5ECNB 5EVOA 1E6BA 1J9BA 1SENA 3C71A 1GP1A 2VCWA 2ON5A 1GUKA 5CO3A 3CTFA 2VD0A 3ISOA 2VD1A 4RI7A 2MMAA 4AJ8A 5CRHA 4WEYA 3D5JA 2F8AA 2V41A 5A4UA 18GSA 2O87A 1WJKA 1PD21 4HZ4A 3HVXA 2K6VA 3EURA 4DVCA 2H0IA 3TKRA 4ECBA 8GSSA 2LV3A 3DVWA 3KGKA 4ECCA 5F06A 1OVNA 5AN1A 1B48A 4D73A 2H73A 1TW9A 1Z7RA 2YWMA 3IV4A 2C0GA 3F0IA 3RPPA 2H1AA 1GSFA 2H1DA 1ZYQB 1TKDB 3IAS2 4IJ3A 4GCIA 4WXTA 3UBLA 3GTUA 2JSZA 4GF0A 1I9DA 1VF3A 1OE8A 3QFBC 2NDOA 4L5OA 4I97A 2DJ2A 4MP4A 2YNXA 5IMFA 2JADA 2O89A 5CRGA 2EC4A 5F8BA 4GWRA 4TXOB 1SK2A 4IHUA 3F3RA 4IP6A 4KDXA 2IFQB 3BOAA 1GH2A 2C4JA 1EGOA 4BA7A 4EDZA 1A0FA 4PQ1A 3H93A 2RIIA 4QL9A 4DEJA 1AW9A 2XBIA 4E8HA 4TR4A 1F3AA 3HJOA 1V58A 2AYTA 5ECRB 1ZZYA 1Z6MA 6GSTA 2GSRA 5FHIA 3RAZA 4PNGA 4MJAA 4XS6A 1UA5A 5G5FA 1VF4A 2GLRA 1FVJA 4KAEA 1GLQA 2FD3A 3TJGA 1F2EA 5IMCA 1U88A 3UBKA 3FHKA 2I3YA 5C04A 4EXJA 2H71A 2L6DA 1Q4JA 5D9VA 4ZXGA 2GT6A 2PVOC 2WRTA 1AQVA 2B5EA 3FK8A 2R4VA 3Q18A 2VLVA 2JACA 3VI7A 3W8SA 3TB2A 2P5QA 1JFUA 4CW9A 5G5EA 4I5QA 4Q5NA 1SL0B 2E0QA 1HYUA 11GSA 4LA1A 2B5YA 2PUKC 1SJ6A 4ECJA 2F9SA 3ZMKA 1TJDA 2WCIA 4N0ZA 2MMZA 3HCZA 2LKUA 3APOA 2L4CA 3S9FA 4OO4A 1EV9A 4TR0A 4XS4A 1PGTA 2VL2C 4GTUA 1TK8B 1G6YA 4TR3A 1EEJA 2YWOA 1YF0A 1Q98A 4ZIJA 4ZL9A 2PWJA 2IJYA 2DIZA 1GTBA 2IN3A 1XZOA 2M80A 2GTUA 4I2UA 2DLXA 3M9KA 5ENUA 3H1NA 2H0GA 1ML6A 1LU4A 2HRNA 3D22A 2LJRA 5G1KA 4KDUA 2ES7A 3HKRA 2WULA 3KM6A 2VL9A 2VCTA 5B6MA 3VWUA 1R26A 4ECIA 4ZL8A 1TTZA 5DQYA 4MH3A 1GTAA 1SKSB 1PL2A 3G9BA 2M72A 4KSOA 3VPTA 3EE2A 3ZITA 2YOIA 4YAPA 4KUNA 4KX4A 3TRPA 5D9XA 3UAPA 2IMDA 3V1WA 4WETA 3TKSE 3HDCA 4BWQA 4IJIA 2C3QA 3TOTA 2VCZA 2YJHA 2LRCA 4MF5A 3KP9A 1KTEA 1N2AA 2VAFA 4IS0A 4CDOA 4MZWA 3WGEA 20GSA 3GKMA 1ZMAA 5ID2B 5B7CA 1OAZA 2DC5A 2LS5A 2YV9A 4F0CA 2VCVA 4WF4A 2DJ0A 2E7PA 1VF1A 4NXIA 3IOSA 2HI7A 1GLPA 2GZPA 3LWAA 3FY7A 3M3MA 4F0BA 2C0FA 4ZB9A 1M9AA 2GSTA 3IRAA 3LGCA 4BPYA 2I81A 5FT3A 1MDJA 3GL5A 3KMNA 1BAYA 1CQGA 2LRNA 4FO5A 3DVXA 2B1LA 3G7JA 3GMFA 3A2XA 1FHEA 3GNJA 1S3AA 2F8FA 3L9VA 4IBPA 4BVXA 3H4KA 3GN3A 4MCUA 1GULA 4H86A 2EIQA 1R5AA 3MDKA 2ZCTA 2OE0A 1JZWA 2G0FA 1MTCA 5HR0A 1A0RP 3FZ9A 4HEA2 5JCUA 5E59A 4XS1A 3Q6OA 2A2SA 2XPDA 2QSIA 4K2DA 4KA0A 3QMXA 1XVQA 3TGZA 1ZYEA 5IMAA 3C1SA 2H75A 4MABA 4NAXA 5DAKB 3KP8A 2DIYA 5G31A 3PR8A 2XPEA 6GSXA 4JBBA 4HDEA 3TJFA 3CSJA 4JU5A 5ECQB 1Y25A 4PGTA 2X8CA 2NBSA 2FHEA 3GKNA 1YDKA 2MMNA 3F6FA 4EDYA 1K3LA 1OC9B 1EP8A 1YEPA 4J56E 16GSA 3VFIA 1K0AA 3A2VA 12GSA 3L78A 1A2LA 1V57A 1THXA 2HZEB 3ZZXA 5ECMB 3G7YA 2N5AA 1MD3A 1ZOFA 3KH7A 1SD9A 1Z3EA 5KN2A 4V2MA 1TXXA 5IPGA 3LQ7A 4MZBA 1XCCA 3GKKA 1ZCPA 2REMA 3EU3A 4GSSA 19GSA 4POMA 1RW1A 3LSZA 1PQNA 3IPZA 2E2GA 2GQLA 2YZUA 3IBHA 1A23A 4QL7A 2IPAA 4MDCA 3ZFLA 4I6XA 3APSA 1N8JA 3GSSA 4PUAA 2K18A 3I43A 5D9TA 2V2GA 4TXOA 5D96A 3D21A 1AQWA 2IFQA 3TCOA 4WF5A 2H66A 4OD7A 3L4NA 1O6JA 3IXRA 2M46A 4V1Ap 1XWCA 2PBJA 3SWLA 4PXOA 3BBYA 5A4WA 4MJCA 2G2QA 1ERWA 3ZL5A 4TR1B 4KCAA 1IYIA 1FO5A 3J7Yk 3U5RE 2CVKA 3GH9A 7GSSA 1ZGNA 4ML6A 1W4VA 1V40A 2OE1A 4LLRA 4KDYA 3PINA 4FYCA 3TKQA 4Q5FA 2E2MA 4NHWA 4XRDA 5ECIB 2OE3A 3VLNA 2AB6A 1Z5YE 5KN3A 2WZ9A 5J41A 3J7Yb 2YP6A 2P5RA 3IHQA 1M99A 1SYXA 2VL3A 2EIOA 2I1UA 4ZBBA 3P90A 1NHYA 5CYYA 3N5OA 2RM6A 2KHPA 3NIVA 4LMVA 5L71A 4K8MA 2DMLA 4L8EA 2FLSA 4K0NA 1YEXA 4PURA 1MDKA 1AIUA 2HLSA 3PH9A 4ISDA 3F6DA 2GZZA 2DSAA 3ZLPA 4HUAA 2GDRA 2OADA 4F2IA 3ZREA 1R5PA 4EO3A 3GRXA 1UVZA 1FG4A 1K0MA 1TRUA 1AUCA 3I9V2 1F9MA 3QAWA 2TRCP 2RUFA 3VWWA 1ABAA 4XCSA 1TRWA 4KH7A 3ZVJD 5CREA 3GIXA 4YQVA 4PQHA 1X9WB 1K3YA 3ME7A 2IMEA 2L57A 6GSUA 3VK9A 1IYHA 6GSVA 1GSDA 3L0HA 5ECLB 2B7KA 1SKRB 3MAKA 3UARA 1SL2B 1XVWA 2R2JA 4EUYA 4PNFA 3C7MA 1PMTA 3KCMA 4O7HA 3FRCA 4ULXA 3KMOA 1WWJA 4DSSA 2OACA 2C0EA 3ZFBA 3UOMA 1QUWA 2IMKA 2H0HA 4EVMA 5H5QA 4L5LA 3VPQA 1DUGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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