5G1KA

A triple mutant of dsbg engineered for denitrosylation
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
LPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCGPCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVMPAIYYMSKENTLQQAVGLPDQKTLNIIMGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Sulfur Denitrosylation by an Engineered Trx-Like Dsbg Enzyme Identifies Nucleophilic Cysteine Hydrogen Bonds as Key Functional Determinant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Escherichia coli
molecule keywords THIOL DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN DSBG
total genus 67
structure length 228
sequence length 228
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 5g1kA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5g1kA02
2OKAA 4RQXA 3GX0A 2I3YA 2XBQA 5F8BA 4TW5A 2I9HA 2B5EA 2J9HA 1S3AA 4WBJA 1V9WA 2ES7A 3ED3A 1URMA 3DD3A 2WB9A 1WP0A 1NHYA 2DJ2A 1WRYA 2L5OA 5DJLA 4MF5A 1CQGA 5G31A 1M2AA 6GSXA 1JLVA 2VLTA 1XOBA 3MWHA 2JZTA 2B7JA 3ZITA 3H1NA 1QUWA 3KP8A 3TKSA 1HNBA 1O7UA 3ME8A 3IA1A 4XHMA 1JZDA 1NHOA 2L57A 1ZMAA 1XWKA 3LGCA 1GRXA 5JCGA 2EIOA 1A24A 5CO3A 4OFMA 4HDEA 2C0FA 1M7TA 2QKEA 2E0QA 1O8WA 2YOIA 2YZUA 4O5RA 1DE2A 1K3LA 3CSJA 3MDKA 4IP1A 2FNOA 4TVEA 1YZXA 1SL1B 2WGRA 3VLNA 3U6VA 2G2QA 2MMOA 1GTAA 4V2LA 1ON4A 2IYJA 4KDUA 16GSA 3GKNA 1OKTA 5J3RA 3W6GA 2P5RA 5D73A 1Y25A 3A2VA 4FO5A 2AV4A 2KUCA 2H19A 5G5EA 1Q98A 1PX7A 4I97A 4Q5FA 1AIUA 4ZBBA 1SKRB 3LEFA 1PMTA 1Z3EA 1G6WA 3QAVA 4PXOA 1PA3A 1JZOA 4N30A 3EE2A 4Q5QA 2NVLA 4BPYA 1TU8A 1EGRA 2GDRA 3SWLA 1OKDA 4GLTA 1HNAA 4HOJA 4LMVA 3M0FA 4K8MA 1XZOA 3CMIA 5EL8A 3QAWA 5D93A 2RUFA 4I2TA 3DWVA 3LYPA 1BX9A 5CRGA 1O85A 1GSYA 3APSA 1XW9A 3HZ4A 3K8NA 5IO0A 1E6BA 1F2EA 2RIIA 3QDNA 1ZGNA 1MDJA 1DBYA 4POMA 3D5JA 4YAVA 3ZMKA 4K1FA 1R4WA 3HA9A 3LQ7A 13GSA 3GIXA 4FH8A 4L8EA 2OJLA 2CAQA 3KJYA 1WIKA 2L5LA 4OCEA 3F3RA 1JZWA 2IL3A 3IBHA 1TK8B 2HFDA 4ZILA 3UIWA 4HZ4A 1A23A 2B5XA 3HJPA 3BD2A 2IN3A 3BJ5A 2LJAA 1GUHA 1T4YA 3GL5A 3HJOA 2O7KA 1B9XC 4HJ2A 1W4VA 2MMNA 1V57A 2YPMA 2H6YA 5D9VA 1OC3A 2KP1A 2NDOA 1VF2A 3BCKA 2CVBA 1QQ2A 1XVQA 1JFUA 5ECHB 1GSQA 3FK8A 2MBTA 1TP9A 1KBNA 2H76A 2HZEA 4PNGA 4OMVA 2HI7A 4EDYA 5LNKe 3H93A 3N9JA 3TRQA 3H79A 2LNTA 4POBA 2PU9C 5JCWA 2LV3A 4H86A 3F6DA 3ERGA 3FHKA 3HVSA 4ZXGA 1K0DA 2R5GA 2WDUA 1NSWA 1K0OA 5DQYA 2FGXA 5G1LA 2VLVA 3O76A 4KGIA 3DVWA 2XBIA 3PGTA 2H6ZA 3KMNA 1K0BA 1LBKA 2GZZA 3W8SA 1TTZA 4F03A 2R37A 3QFBC 1ST9A 2X8GA 3CRTA 2LQOA 3J7Yb 5F06A 1PKZA 1N8JA 2KLXA 1V2AA 5AIVA 4IJIA 5ENUA 2FWHA 2CQ9A 4MLYA 4L5OA 1M0UA 4LL4B 4DVCA 3ZZXA 7GSSA 4ZL8A 3F63A 4XRDA 3MSZA 4JR4A 4JEDA 4K2DA 3UVHA 3UL3A 5CAXA 3TGZA 3VPQA 3GNJA 2DJJA 3TJBA 1J08A 1G7OA 4HI7A 1KEBA 14GSA 11GSA 12GSA 5D9TA 3VWUA 3S9FA 2VCQA 3GSSA 5KN2A 2E2MA 1A8LA 2XC2A 4I2UA 5DCGA 4WXTA 3WT1A 4FYBA 2JL4A 3BBYA 2YWOA 4RQRA 1GUMA 2V6KA 4FYUA 2EC4A 2RLIA 1F3BA 1T8EB 5CYYA 4K9ZA 1SL2B 2RM5A 5IMDA 5B8AA 3GH9A 4EC0A 3FY7A 1Z7PA 5INYA 3EMPA 2GSRA 2OACA 3FR6A 3PR8A 1G0TA 3HXSA 4GTUA 5CREA 4V1Ag 2LS5A 4E8EA 2LNSA 2LRCA 3FRCA 2VCZA 2FHEA 5D9XA 1VRSD 1YQ1A 3CXGA 2GSQA 3GSTA 1MD4A 2C3QA 4N0ZA 3L9VA 2X99A 5E59A 2YZHA 1SKSB 3H8QA 2L4QA 4ZB9A 2YV9A 1GSFA 4JR6A 3ZREA 1FVJA 2C0DA 2FCHA 3ZRDA 4PQHA 2JZSA 1EGOA 2HZFA 1GTUA 2OBKA 5H5RA 1GL8A 3SBCA 2PPTA 4AJ7A 3HD5A 2KP2A 2TIRA 1E2YA 3IC4A 1PSQA 2L4CA 1GSUA 4TR1B 2C8UA 1ZYEA 1NW2A 2VOCA 5ECQB 1KTEA 1T3BA 1PX6A 2E2GA 4MZCA 3F0IA 3A2XA 2HLSA 3APQA 1V98A 3KXOA 1ERUA 3ZVJA 2N5AA 2I1UA 3LXTA 3UJ1A 2YWMA 3EYTA 1SU9A 2YANA 3ZIJA 5J41A 1DUGA 3LORA 3UAPA 4ZL7A 5CNWA 3ZIVA 4O32A 3IOSA 3EWLA 1UN2A 4I5QA 5DDLA 1TJDA 9GSSA 3CYNA 3KZQA 3O6TA 4ACSA 2OE3A 2ZNMA 1T7PB 2K8VA 1SK0A 2CVDA 4E8HA 5B8BA 3IE3A 5J4UA 2DMMA 1BAYA 1CQHA 3ZTLA 4NV5A 3IXRA 2CZ2A 1YJ6A 5DVBA 3HZ8A 1SK1A 4K7OA 3CRUA 6GSYA 5IOWA 1R7HA 2OADA 4PUAA 1SYRA 5C04A 4KAEA 1K3OA 5ECIB 2LEGA 3HCZA 1A2MA 2YN1A 5LD0A 4IQ1A 4HS1A 1OAZA 2YJHA 2DIZA 4KUNA 4G10A 2I81A 4HQZA 2H73A 1QFNA 1WE0A 2FY6A 3C8EA 3Q18A 3IDVA 1GLPA 3ERWA 3TKQA 5GAND 3P8WA 5GZZB 1K3YA 1AQXA 4N10A 4TR1A 2LQQA 4TR3A 1WPIA 4ECCA 2GVPA 3UBKA 4NXIA 2F8AA 3HVXA 5J9CA 2H71A 5DAKB 5KN3A 3D6IA 2TRXA 19GSA 5IOXA 3F8UA 3G7YA 4XTSA 2H70A 1GULA 2QSIA 1PQNA 5AGYA 5D9WA 4LMWA 4EO3A 2VL2C 2ON7A 4TR4A 4F9ZA 1F6MC 5ECMB 3ZMLA 2IMDA 1FB0A 1NM3A 4GXZA 5A4WA 1YEXA 1ZYQB 2VL9A 2L59A 3W8JA 2O8VB 1GNWA 4WR4A 2ZCTA 1A0RP 1RK4A 2VUPA 1GLQA 4TR0A 2P31A 2XPEA 2VCVA 2BTOT 2VD1A 1GUKA 1EV4A 2O85A 1T4ZA 5GAPD 1PGTA 4WEYA 3U5RE 2N5BA 6GSSA 2IWTA 1OC9B 5H5SA 3KCMA 2DJ0A 1F3AA 1MDKA 2PN8A 2GQLA 4DEJA 3LG6A 2VLUA 1R26A 1Q4JA 1PN9A 2L6CA 5CRHA 1W89A 2HE3A 3TJFA 5KEJA 4F0CA 2MYGA 3GL3A 4TKYA 5LCZA 2P0GA 4KCAA 1LU4A 2H1BA 2ON5A 2JSYA 1YF0A 3VWXA 5DAKA 2HRNA 1R5PA 4WETA 3GHAA 2I4AA 4EDZA 2IMIA 3A5WA 1SJZA 5HQPA 4YQVA 2O87A 3GURA 1YKAA 2FA8A 4DSQA 3WT2A 4JU5A 1U88A 3F3QA 2QC7A 5ECNB 3J7Yk 3EMXA 4HJMA 2KOKA 4OO5A 2H0HA 2IMEA 3V1WA 4ZB6A 1HQOA 3F4TA 4XS1A 6GSTA 2LRTA 1MEKA 2H0IA 3IHQA 1K0NA 1XCCA 3GX8A 3C1RA 3IK9A 5FWGA 4EKZA 1K0CA 3I6AA 1GSDA 1T00A 2DIYA 3TRPA 2V41A 1A8YA 4BWQA 3O3TA 2GGTA 5ECSA 4NWYA 1THXA 4K7NA 1OC9A 3P90A 2X64A 5AIXA 1TI1A 4PUFC 4GSSA 3GUSA 2GZPA 4O7HA 1AUCA 2NBSA 1M99A 5D8IA 2XPDA 3GFKA 5ECOB 3QAGA 2CT6A 1ZL9A 2NTOA 5IQYA 3ISOA 4BVXA 4ZB8A 2VIMA 1MD3A 3RBTA 1XW6A 4IW9A 2ALBA 2WULA 2YNXA 2H75A 4YQUA 4HEA2 3NIVA 2RM6A 3TKSC 5HR0A 4J2FA 4L0UA 2VAFA 3KEBA 2GLRA 1EP7A 3G7JA 2GT5A 4XIHA 3NOFA 1VF3A 3OR5A 3KTLA 5DBQA 4V2NA 4MA9A 1B4QA 2DSAA 1ABAA 2X8CA 1ACVA 1A2LA 4IBPA 5DJMA 4ZIJA 3VWVA 3RPNA 3VI5A 4TXVA 5ECLB 4N0VA 2WCIA 3GKKA 3EU3A 4MZWA 2REMA 2WRTA 6GSUA 2HSHA 2JACA 4IVFA 4OFNA 5ABRA 2C1YA 3PH9A 1BYEA 5EVOA 4WF5A 3L4NA 1V58A 1TRSA 1GSEA 4AJ6A 4OFTA 5AN1A 4IKHA 2C0EA 3F4RA 2CA8A 2L6DA 2GS3A 3CSHA 1TRUA 3VFIA 3VK9A 2GQKA 3I9V2 2O89A 1B48A 2M80A 4KSMA 2R4VA 5IPHA 5IMFA 3DGQA 3KP9A 4AGSA 3WYWA 10GSA 3TKSE 3G7IA 3Q6OA 4KSOA 5EPFA 4G2EA 2K18A 6GSWA 2GT6A 4K0GA 3EC3A 2IJYA 1SENA 1EZKA 4X1UA 3N5OA 1TI3A 4TOPA 4Q5NA 1Y6EA 3UVTA 2JZRA 4ZBDA 1ERWA 4GF0A 1AQVA 3ERFA 1O73A 4BL7A 3M3MA 1TXXA 2DJ3A 1K0AA 2PWJA 2GSTA 5JWRB 4KX4A 2K9FA 3DRNA 4EUYA 4IQAA 1F9MA 5F05A 1MDIA 5IMZA 2B7KA 4MDCA 4BVYA 3KMOA 2LJRA 3EU4A 1U6TA 4MH3A 1XVWA 2ZUPA 3F9UA 4V1Ap 4CHSA 4F0BA 4DSSB 2IPAA 2H1AA 5AISA 2JSZA 3FW2A 2VM1A 1XIYA 2X8HA 1SD9A 2DLXA 1B9YC 3WGEA 2MMAA 1IYHA 5IM9A 4PURA 1FHEA 2AB6A 2FWEA 1H75A 4IELA 4MJCA 4X0XA 2EIQA 1EOGA 3FKFA 3FZAA 1TOFA 1IYIA 2FLSA 1H4OA 4XS4B 3UARA 1DE1A 1FB6A 1XPVA 3HY2A 1XW5A 1TDIA 4MJEA 2C3TA 1EV9A 3ME7A 3FR3A 2CZ3A 2A4VA 3IV4A 1HD2A 1YF1A 5GSTA 3QR6A 2A2SA 2HT9A 2F3MA 1TRWA 2PMTA 3IAM2 4ZL9A 1OYJA 2IFQB 4Z7XA 2LKUA 1DSBA 4LLRA 3KTBA 1WOUA 4MF7A 4ML6A 1EEMA 1B4PA 1Z6MA 2C4JA 2B6MA 2DBCA 4TN8A 4P3YB 2LSTA 1GNEA 2VL3A 1ERVA 2GQMA 3GH6A 2PVQA 5ECRB 4KB3A 3E9JB 4EXJA 8GSSA 4CDOA 1V40A 4CW9A 2MMZA 1WMJA 2RUEA 4PGTA 1U3AA 5ELGA 4DSSA 1YKCA 1JZRA 5KN1A 5GSSA 2OBIA 3TUEA 3LFLA 2CX4A 2OE1A 4J56E 5DALB 2V1MA 1AW9A 2B1LA 3C1SA 4GWRA 5HFGA 1M2DA 4L0WA 5F07A 3LXZA 4MK3A 3M1GA 1SL0B 1PKWA 4RUVA 4EF0A 2VCWA 3QOUA 3M9KA 3MAKA 2CV4A 1T1VA 17GSA 2H66A 5E4WA 5IMCA 4XS4A 5HFIA 4J57E 1XWAA 4YH2A 2NPBA 3UMAA 1X9MB 3UBLA 3QD9A 1FVKA 5CRDA 5G2ZA 4BWSA 3APOA 3CTFA 4OD7A 3VPTA 4AJ8A 3DIEA 2PGTA 1ZZYA 2TRCP 5DCHA 3RDWA 3TJGA 5KN0A 1X0RA 1YY7A 3I43A 1O6JA 2HSYA 1QK8A 2GTUA 2WZ9A 4JE1A 4MABA 2IFQA 2FD3A 6GSVA 2F9SA 1GTBA 2BJXA 2PBJA 1HYUA 2DJ1A 2GZYA 2R3XA 1A0FA 4GSNA 4HU7A 3ZL5A 2OE0A 2WFCA 1SYXA 3TOUA 2H0GA 3GMFA 1AXDA 4MZBA 1AQWA 3KD0A 3ZVJD 4KNDA 2H72A 1XOAA 1EWXA 2H1GA 4Q5RA 5ID2B 5H5QA 1N2AA 2LTKA 5JWOB 2C80A 1X5EA 3QPMA 3IPZA 3QMXA 3C7MA 2AHEA 4MH2A 5DALA 1XWBA 1Z5YE 1FAAA 2H1DA 2YJ7A 4KDXA 1VF4A 1TK0B 5B6NA 1SD8A 5G1KA 4HQSA 2FUG2 1Z7RA 5JWQB 1YEPA 3WGXA 22GSA 3M9JA 1M9BA 4WBRD 2J23A 2IIYA 1QXHA 4K6XA 3L0HA 3PINA 3BCIA 3UOMA 5HR1A 2AUVA 3KH7A 2HZEB 3E3EA 3UEMA 3TKRA 2FWGA 2PUKC 1BJXA 4KCEA 1ZOFA 1ERTA 4XCSA 3C73A 2V6OA 2C3NA 2V2GA 4TXOB 1A2JA 4LL1B 3D0ZA 1SJ6A 3TKPA 1XBSA 4LA1A 3ZFLA 4KA0A 4WF4A 3RHBA 2XHFA 1J0FA 1B8XA 5A4UA 2FA4A 4ILFA 2F51A 4OWYA 5HR3A 5C00A 1JHBA 5HFKA 1GWCA 5G5FA 4JRRA 5IIZA 1VGLA 1WWJA 2QGVA 4PQIA 4GSTA 4I6XA 1RQMA 1G7EA 2HRFA 4GQCA 5L71A 3BOAA 1I5GA 5ID2A 1VF1A 3FR9A 2M46A 5B7CA 1ILOA 4EE0A 2MBSA 3H4KA 2LRNA 4GQFA 3GYKA 1BEDA 3QCPA 1TKDB 3JCML 1U3IA 3VWWA 18GSA 3HHVA 3E0UA 1OE7A 4RI7A 4OCFA 2G0FA 4EVMA 4ISDA 3HKRA 3TJKA 4MPGA 1GSSA 1O81A 3RPPA 1XFLA 1TU7A 2PVOC 3DMLA 2H8LA 4ULXA 4FIWA 3GN3A 1GTIA 3DYRA 2AAWA 4IN0A 3IK7A 4EL1A 2CVKA 3FYGA 2D2ZA 1M2BA 4YAPA 2YWIA 1FO5A 1M9AA 3L78A 3TOTA 1THOA 2C0GA 4RI6A 1FG4A 1SJIA 4IP6A 2BMXA 4F2IA 2AJQB 4PNFA 4OO4A 1OE8A 1X9WB 1ZCPA 3KGKA 3TCOA 4TXOA 1C72A 3IR4A 4NPBA 3HYPA 2OA7A 1EP8A 5G30A 3F6FA 4ML1A 3A3TA 2M72A 4PX1A 4QQ7A 3GKMA 1X5CA 2E7PA 3US3A 2A2RA 2YCDA 5ECPB 3P2AA 4NHWA 2VD0A 4KE3A 4NV2A 3IRAA 4MMMA 3GA4A 2CAIA 3QFAC 3DVXA 3F4SA 4K7IA 3EURA 4MF6A 3DEXA 1KNGA 3FZ5A 5CRWA 5J5NA 2VM2A 5IMAA 1UVZA 3TDGA 3LJRA 1XWCA 1PRXA 2H01A 4GCIA 2DJKA 4XS6A 2B3SA 2B5YA 2FWFA 4N11A 2JU5A 3DXBA 3MNGA 4MJBA 1UC7A 2VO4A 4MP4A 3LYKA 4QL7A 4XRAA 5A5KA 2B1KA 2H6XA 5ECKB 3GTUB 4NMUA 4MPFA 2IY2A 1TRVA 3Q74A 3FZ4A 5FT3A 3KIJA 1O8XA 3TJJA 4G9HA 2H30A 1YDKA 1Z9HA 2GSSA 2IMFA 1K0MA 3D22A 3CSIA 4ID0A 3L9SA 3FEUA 4IHUA 2YP6A 3C71A 20GSA 1SKWB 1F37A 2Z9SA 1RW1A 2AYTA 3D4MA 1I9DA 1J9BA 3P7XA 2LJKA 4KDYA 3GV1A 4F82A 3A2WA 5FHIA 5COHA 5IMVA 3AY8A 2VL2A 4ECBA 3WD6A 4JBBA 5F0GA 4GRFA 2H74A 3KM6A 4HU9A 4QL9A 2HNLA 2EIRA 1MTCA 3ZLPA 1GH2A 1QGVA 2JADA 2WS2A 3M8NA 1X9SB 5DQSA 1FOVA 4POKA 1BG5A 2DC5A 5D96A 3TB2A 5B6MA 4KH7A 2CX3A 4X43A 2MZCA 4MCUA 5JCUA 1SK2A 4D73B 1OC8A 4FYCA 3ZYWA 2F8FA 4ZBAA 3IAS2 3HDCA 4BA7A 4JZQA 3GTUA 2WJUA 2LUSA 4IS0A 4KW6A 3FZ9A 5HR2A 5EY6A 2DMLA 4I8BA 1PL2A 3DKSA 2YWNA 4G19A 1XWGA 4L5LA 5A4VA 5IO2A 4TRXA 2IMKA 1EEJA 1LJRA 3WGDA 3GKXA 1HNCA 5J9BA 3NZNA 1R5AA 3LWAA 4IJ3A 1XXUA 1UA5A 4NHZA 2PERA 2R2JA 3CBUA 5ELAA 1TW9A 4NAXA 3LSZA 1FW1A 2VCTA 4K0NA 3RAZA 3HJMA 2HXKA 4DSRA 1PL1A 3TRXA 3EINA 3EVIA 4HUAA 2YV7A 1S3CA 3CTGA 1ML6A 1WJKA 1G6YA 2N5FA 4ECIA 4PQ1A 3D4TA 5IPGA 4WR5A 3HVVA 1Z6NA 3VI7A 4ECJA 1S3DA 2K6VA 3G9BA 2R6KA 4IGJA 3Q19A 3VURA 4HZ2A 3RHCA 2HYXA 3ZFBA 2KHPA 4POLA 3KH9A 4YQMA 4MJAA 3GRXA 1U87A 3L9UA 1X5DA 1BQ7A 1GP1A 1EOHA 1AAZA 4WKWA 1AC1A 1QMVA 5CP1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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