1EPWA

Crystal structure of clostridium neurotoxin type b
Total Genus 401
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
401
sequence length
1290
structure length
1287
Chain Sequence
PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
publication title Structural analysis of the catalytic and binding sites of Clostridium botulinum neurotoxin B.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE B
total genus 401
structure length 1287
sequence length 1290
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2000-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 1epwA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1epwA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1epwA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 1epwA01
3CA0A 5GZEA 2ZGRA 2PELA 4R6UB 4D0ZA 4LO0C 2WJSA 4XDQA 5F90A 2MLLB 2DVBA 3K1XA 3WLUA 2DVDA 1QDCA 2LTNA 1ISVA 3QJ0A 1SR4C 3RRDA 4ZKTB 3IN9A 3WMVA 4FPKA 1T9FA 1XTGA 3O0XA 1WLCA 1W6QB 1SFYA 2A7AA 3IM5A 1LHUA 3W59A 2ZACA 4II0A 2D6MA 2A6VA 2R1DA 3OJ2A 1ULDA 2NZ9A 1AXZA 3AP9A 4QBCA 3AYAA 2W2DA 1G82A 2B7YA 5H9RA 3FBYA 1LTEA 2AAIB 2PHRA 3FLPA 3AKIA 3R4SA 3NBNA 4I6IA 4YG3A 4ATEA 2ZABA 3I4IA 1YI7A 1V6LA 4XFSA 1XQNA 5E24E 1ZKWA 4AYUA 3AJ5A 2IWTB 5FREA 1EYLA 4XMAA 3QIYA 3HN1A 1QDOA 2UWCA 2VW0A 5DZUA 2VXTI 1W3AA 1TEIA 1N1VA 1W6NB 4AN7B 5DUYA 3Q7WA 4KTXA 1F5FA 1P63A 3SNVA 1WW4A 2ZBJA 1ULFA 3PVEA 5BOWA 5EC5A 2DU0A 2LALA 1S0IA 3NWKA 2ZHMA 3CA3A 3AYDA 3TC2A 2LIQA 3A23A 3IM0A 2ERMA 3F62B 3A21A 3LSEA 3APBA 3Q7YA 4LO7B 1WBCA 1ABRB 3QW8A 2FMDA 2GNTA 1DIWA 5DG2A 3USUB 3OBRA 3O4OA 3WA1A 4ENDA 1QKQA 1J0SA 4AN6A 1YIFA 1JQZA 3SH5A 1LOCA 4YM2A 1DQ5A 2D20A 4XHXA 1URXA 1W3GA 1ZA4A 1HKNA 5DSSB 4CTEA 2VH9A 5T54A 5G00A 2ZGUA 4AGVA 4FPJA 4DQAA 1IKQA 3QLQA 5BQMA 2P3JA 4FOQA 5BQNA 3A0NA 3C8AA 3C88A 1IKPA 2BEBA 3ZXDA 5BXPA 1HIBA 4DPNA 2LIEA 2ERFA 5IUQA 5JOYA 2CL2A 3BOOA 1N1TA 3NV1A 4Y24A 1G9AA 3UD9A 1IT0A 3LLPA 3INAA 1D2SA 4SLIA 1JOJA 1W0PA 1XHBA 3ZXLA 1HQLA 1AFCA 5T5LA 4I4PA 3OYWB 5DZFA 1SLIA 2K4AB 2OVUA 1BARA 2UWBA 3WUDA 2BFHA 3CAHA 2D24A 1GICA 4M01A 2DS0A 4EEEB 1DQ2A 1LGBA 1ILR1 2D43A 1KRIA 2GO2A 1PZ7A 1LEDA 5BYNA 4UW3A 2C9AA 1DQOA 1IS5A 1MC9A 4I4UA 2CWMA 4I4SA 5IK8A 3WHTA 3ILNA 4YLZA 2D6NA 3M3CA 4DCKC 3FFZA 4LBKA 4EL4A 5T55A 4BMEA 4D69A 4M3CF 4P14A 2WSUA 4J2SA 4LO3C 4FOVA 2UURA 2PHFA 1LGNA 3BAGA 4HR6C 2GNBA 4FVVA 3VWCA 1CVNA 1LCLA 3IMNA 3DUIA 1QQLA 3OJVA 4IY9A 3WZ1A 5T52A 1BQPA 3U4XA 4XIOA 2HZ9A 5D62A 2G7QA 2CWSA 2P3KA 4J23B 4FP3A 1HWOB 1IRAX 4F34A 4CJMA 2DRZA 2A6ZA 2WKKA 1QMJA 4ZGRB 3BOKA 2Q3NB 4BLIA 2WSVA 1II4A 2VXRA 5DUUA 1HKDA 1JYCA 4MYEA 2CYFA 1T3CA 1LECA 4QKSA 3Q7XA 4IY8A 2ETFA 4Y22A 1PZ8A 4FOWA 4YZ5A 3DGTA 3NV2A 1JT5A 2D7IA 3AXDA 1R8NA 3N0KA 2EALA 1WLWA 2RHPA 3BAUA 2CNAA 3AP5A 1IS3A 1V6WA 4X38A 1CJPA 3H6RB 4WV8A 1WW6A 1YO8A 2W39A 4LO7C 4K1ZA 3RMXA 3NV3A 3I2AA 3WCRA 3K3QB 3ZYPA 4BLJA 2KM2A 4LBMA 5JOXA 1YYNA 2IMAA 1FAYA 4JKQA 4FQ4A 1N47A 1YRZA 4YZ2A 3IPVB 1A8DA 3OBTA 1GZ9A 4Q26A 1JT7A 4G6MA 3KQRA 2WT2A 2ZGKA 2NM1A 2A3XA 1LOEA 2FO1A 3LCPA 1HCEA 1JN2P 4I4OA 3NBEA 3VKMA 1YF8B 1IILA 2BQPA 2G4IA 4ZFYB 3SLIA 3QIXA 5E8AA 2ET2A 2A8AA 4FPHA 5FNXA 5LK5A 3MW2A 5DXDA 4XZPA 2FDBM 2I2SA 2E6VA 3VKNA 1AF9A 1LEMA 3ATGA 1X50A 2ZMLA 3UJ4A 5EXOA 1PZZA 2ZHKA 3DS9A 1V6JA 2CY6A 1KQRA 1TFMB 3BA4A 1SBEA 1LOGA 1LENA 1MS9A 3NJ5A 1ZN3A 1WLDA 3AYEA 4M3CB 4LO2C 1V6MA 3POKA 4IQPA 5GJ6A 1HWPB 1QQKA 3AFKA 1GZWB 4OEFA 2ZQNA 1LOFA 2E7QA 1BKZA 1C1FA 4Y20A 2ESUA 4A7KA 1FQ9A 3O4AA 4JPZA 2AGSA 3ENRA 1NLSA 4KEKA 1IS6A 3AP7A 5EYYA 4XYXA 1O4ZA 4I37A 1JXNA 1LOBA 3BADA 4Y1ZA 3E8LC 2OUHA 2XHLB 1S0CA 1XTFA 1QNYA 1F9KA 5GLZA 3R05A 3CA4A 3RSJA 3AZZA 1GZCA 3C2UA 3RTJB 1LU1A 1W6PB 5EWSA 4RL7A 4WZFA 3QW6A 1CQ9A 2NP0A 1N3QA 2ZGMA 4A7YA 4LO8B 6I1BA 3RTIB 1AZDA 2GNMA 3BB2A 1SR4A 4I2SA 2IMBA 1LULA 1S1AA 3WDWA 4IZXA 3AJYA 3OGGA 3D7WB 1V6XA 5GZGA 2PHWA 3POYA 4Z9WB 2ZAAA 1K5UA 5FZZA 5BP5C 3JUTA 1JT4A 3N7LA 2D3RA 2SBAA 2JDZA 2FGFA 4L4HA 3O3QA 4XBLA 2DUOA 1MS8A 3JUUA 1LGCA 5CAZA 3AZYA 1Q8QA 4H55A 2ISEA 4J2YA 4JQ0A 5GLTA 3BA5A 1TIEA 1UAIA 4K21A 4AWDA 3B9CA 3WMUA 1U0AA 2EXKA 4GP0A 4UW4A 4UW6A 2JECA 2Z42A 4DRVA 4D0TA 3UD8A 1GV9A 4ELCA 1SLTA 4YGEA 1G86A 4OWJA 3FJIA 2WT1A 4AGGA 5KXCA 4HANA 3GALA 3VKFC 2DREA 1Q8PA 1WW5A 2A97A 2KKIA 4FPYA 3CRHA 1Y7BA 1IS4A 4AVVA 2V73A 1FX5A 4LBJA 4G6JA 3BRGC 3RG0A 3V64A 1C57A 3N7MA 2ZR1B 4Q8LA 2PHXA 3AP4A 1NUNA 5F9TA 2GN7A 3HALA 5GZFA 2OUJA 4XJUA 3O0WA 2D3SA 3CRGA 3CQAA 3GNEA 1EV2A 2Z48A 2KH2A 3P6IA 1FATA 3WG1A 3WUCA 1UMZA 2EAKA 2E53A 3WHUA 1WBLA 3BRDA 3H6SE 2VUAA 3WINA 3B3QE 3ZXJA 5H9QA 1JHNA 2ZGNA 2DTYA 5BQMB 3WG2A 1Q8VA 4I4VA 1ZM1A 2FFUA 4XBQA 1W6MA 3UK9A 3FJKA 4R9BA 2GN3A 1AXKA 1ISWA 4ZOTA 2NYYA 1DLLA 2W68A 3ZUQA 5CBLA 2VW2A 5EYXA 3PHZA 3AZVA 4XOGA 3M3EA 2GALA 1CVSA 3AKHA 3MPPG 2IHOA 1B09A 4FPOB 4HJJA 5BXRA 3BIWE 3HBWA 2WLQA 2J3PA 3AKFA 1GANA 1QNWA 1M2TB 3MALA 2D6LX 3B69A 1VCLA 1ONAA 4I30A 2D7FA 3VKOA 1AVUA 5GLUA 1FWVA 2VU9A 4XFTA 1VIWB 1OKQA 5JOZA 1OFSA 3SNMA 3ILRA 2G7KA 4FPGA 1D0HA 2D6PA 1FWUA 5GZCA 1W0OA 5DG1A 1FV3A 1G9FA 3DDAA 2DUQA 3N7JA 1DZCA 1FYUA 4KS6A 4H04A 3WDVA 4XJAA 3PVOA 1R8OA 4XHBA 1FNYA 1W6QA 1WUVA 3ILFA 1BFFA 5F8SA 4YGDA 4YW3A 2WT0A 1RIRA 1CE7B 3AJZA 4XJWA 4ZBVB 3AX4A 3ZC8A 4LO3A 4BMBA 1APNA 4EFQA 4GP3A 3FJFA 1JW6A 3VV1A 1TWMA 1XYFA 3I29B 4P0KA 1XZZA 1E0OA 3BWIA 4EJ5A 3UDAA 1ZL5A 4GA9A 2JE9A 2JJ6A 4XFUA 4JRAA 4J1LA 3W58A 2W52A 1N1YA 4LO1A 1MACA 1S0BA 2AFGA 1QF3A 4EB2B 3VEQA 4PBPA 2A6WA 2QN4A 3AYCA 1ULEA 4OW4A 2ZGLA 1ONKB 5BQUC 1H30A 1LHOA 1QOTA 2JE7A 1W3FA 2Y9FA 3V0BB 1W6OB 2ZGQA 2V5YA 3N3HA 3ZXEA 5B2HA 4J2XA 4R9AA 4GALA 5AVAA 3H6QA 4KBBA 2E4MC 1PUMB 3D5OA 2XB6C 2NVHA 1MS0A 2HW9A 4USPA 4R9DA 5GM0A 1V00A 3USUA 4J2KA 2UWAA 4LBNA 1LESA 31BIA 3BAQA 1F82A 3CNAA 3A0KA 2D7RA 1ENRA 1FN0A 5CNAA 1DYPA 5BXSA 1JYIA 3FJ9A 2DVGA 4GAIA 3UJOA 4P0JA 1JTCA 1YBIA 4DENA 4AVTA 3VT2A 5E88A 4QD2B 5H9SA 3I8TA 4BQ1A 2D6OX 5F8YA 1AX1A 4YW4A 3BRFA 3OY8B 4LBQD 5FRAA 3ZURA 1MVEA 2ENRA 1N1SA 2QYIB 2YXSA 1DZDA 3O5SA 4JC1A 2AYHA 4G9NA 3WOGA 4G9MA 3UJQA 1Q04A 4BOWA 3BTAA 1ULCA 4PBOA 3P53A 4LBQB 5IK4A 2TEPA 1O4YA 4YFWA 5IK7A 2ZMKA 4X39A 2SLIA 1GKBA 3NF3A 3OYWA 2ZGPA 3WG3A 1MZ6A 2FFVA 1KDMA 3F1RA 1NZKA 3QIZA 1FV2A 1T3AA 1SBFA 1V6OA 2RG9B 3WO3A 2K43A 3QCWA 2W08A 2FHRA 5DZEA 1XG6A 3OGFA 1DGLA 3WVJA 4YG6A 2XOAA 5HCAA 1DYKA 3T8SA 1LJ7A 1VALA 2EXJA 1MS1A 2VLCA 1MZ5A 4XIKA 1SACA 3VT0A 5FNWA 3M3OA 4ZLBB 1CN1A 3I2XA 4HA2A 3AH1A 4K1YA 2AQZA 2DU1A 3ZUSA 4GKYA 4Y1VA 3DEBA 3VSZA 4ISQA 1SLCA 41BIA 3QR5A 1AVBA 3N35A 4EFPA 3FJDA 1DQ6A 1KJRA 1CR7A 2C5DA 3M2MA 4YFZA 3D3XA 5KXBA 3JU9A 2RSTA 2A70A 2ZHNA 4DRRA 4IONA 4JAWA 1JT3A 1TTUA 2AH2A 4BPZA 2RQ9A 4YGCA 1Q1UA 1QU0A 1IRPA 1V6UA 1BFCA 2F2FC 5BP5A 1TOOA 3V0AB 5GLWA 3M1HA 4GKXA 1IJTA 3FLRA 4OEEA 1RMLA 1MVQA 1KDKA 5DUWA 2A6XA 4YW1A 3O0VA 2YZ4A 3H6RA 4I4QA 1RITA 3UD7A 1I1BA 4XTMA 4YM0A 5JOWA 1SCSA 2Y9XE 1V6IA 3VKLA 2DYCA 2H0BA 2GMPA 4I0YA 4IYBA 4U2AA 3A22A 2NTDA 1QOOA 3BAHA 2R1BA 1RY7A 4L4IA 4XE9A 4TZDA 4XJ9A 1WCSA 2G7NA 1JLXA 2EXIA 2P23A 3T1MA 1GSLA 3IPVA 4OWKA 4Z8SB 1BYHA 2AREA 4LO0A 2P34A 5FZYA 3HMYA 3RS6A 1CPNA 2D1ZA 5T5OA 4RA0A 1LU2A 1PUUB 2YUGA 2AUYA 1G7YA 1LODA 1LHWA 3CRIA 4GWNA 3ZXFA 4GXLA 4I4RA 4QD2C 1WBAA 3ZVXA 2W2DB 5IT6A 1SBDA 1Z4SA 4XILA 3MW4A 5HCFA 5DVHA 3FJBA 3N36A 1AXYA 2QN0A 4M3CE 2ZGOA 1LOAA 2EIGA 7I1BA 1BLDA 2UUSA 2ZKNA 4U36A 4USOA 3HR9A 1Z7HA 4PF5A 3ZXKA 1IOAA 4M3CA 1HWMB 1N4KA 3ZX7A 3N7KA 2WBCA 5EG6C 3PMEA 1GZWA 1ENSA 1AJKA 2EF6A 2VSEA 2JKBA 4TLPA 3FJEA 2R0HA 5IK5A 4KEJA 4OWLA 1T4QA 4JP0A 1S0LA 1HDKA 1YXWA 2WNEA 1DFQA 4XXPA 3EF2A 1UN1A 3NV4A 4DFSA 1SLBA 3C89A 4FGFA 1GNHA 2ZA9A 2KI4A 4WBCA 3AH2A 3O4CA 5H9PA 1BJQA 4I8MA 2XHLA 2ZGTA 4GAFA 2NN8A 4P9XA 4I7IA 1MR5A 5HCBA 3QW7A 4Q9GA 1BA7A 2IMCA 4KEIA 4NOTA 2UU8A 4FP2A 3FUOA 4PCRA 1PZ9A 4I3NA 4Q1PA 4W65A 4YW2A 2GDFA 3R4UA 1H9WA 3KMVA 1WW7A 4I96A 2OW4A 1AX0A 1W6PA 1LHVA 5BXTA 1ULGA 3JRRA 1QXMA 3C9ZA 1UKGA 3ZXGA 4XMIA 3BX1C 3BA7A 3WG4A 2WQZC 1BLAA 2ZQOA 2X2TA 2R9KB 4Q27A 3AP6A 4K20A 3BAVA 2I1BA 2YMZA 2R0FA 4D8HA 3O49A 1MS5A 1Z0HA 1DBNA 1G9CA 4H9WA 4I1BA 2ILPA 1A3KA 4Z8BA 5CB7A 3FJCA 2R49A 1SZ6B 4P6AA 3PVNA 1NXD1 4I1EA 4OEGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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