1G9AA

Crystal structure of clostridium botulinum neurotoxin b complexed with an inhibitor (experiment 3)
Total Genus 395
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
395
sequence length
1290
structure length
1287
Chain Sequence
PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A Novel Mechanism for Clostridium botulinum Neurotoxin Inhibition
pubmed doi rcsb
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE B
molecule tags Hydrolase
total genus 395
structure length 1287
sequence length 1290
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2000-11-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 1g9aA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1g9aA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1g9aA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 1g9aA01
4Y1UA 3I2AA 3V0AA 3H0OA 4QC4A 2VH9A 4HA2A 2CL2A 1QNWA 3CRIA 3WLUA 1LHOA 4K1ZA 3VKOA 4EKXB 2WT0A 1WBAA 6I1BA 4HEVA 1JYCA 3O4OA 3C9ZA 1FWUA 3ILNA 2V5YA 1DQOA 3NBEA 3KM5A 4Y24A 5F9TA 1FGAA 2A5ZA 1GNHA 2C9AA 2Y9WC 2G7KA 1UPSA 1WLDA 2PELA 2SBAA 4GKYA 2CNAA 2ZZJA 5EWSA 3V0BA 3QW8A 3MW2A 4FOQA 4XXAA 2A97A 2LALA 1N3OA 5BXPA 3FJHA 4M3CB 2ZGQA 2XB6C 3USUB 4SLIA 1ILR1 5EHAA 1MZ5A 1N3QA 1DLLA 3ENRA 4IONA 4Y1VA 4JCKA 3Q7WA 1Z7HA 3FUQA 1AX1A 3O0XA 1I1BA 2YZ4A 3QIXA 5BXRA 1EPWA 2OW4A 3AP4A 2AGSA 1LULA 5HCAA 5AVAA 2FO1A 1HWNB 3WG1A 3U4XA 4KEKA 5JMCA 4Y1YA 3UD7A 4DRVA 5IK5A 3OBRA 3BRFA 1IS4A 5CBLA 1K5UA 3CQAA 3W59A 3ZPYA 2WSUA 2UU8A 3LCPA 5KXDA 2D3SA 2GZBA 5DSSB 2W08A 3NV3A 5JLVA 3O49A 3VV1A 3AKIA 3UD9A 4J1LA 3SH4A 1C4RA 1AXMA 2W39A 4KEJA 2A3WA 1WW4A 5JOZA 3VKMA 3ILRA 4YG3A 3N7JA 4FQZA 4XIKA 3T1LA 2P37A 2HW9A 4LO0C 2ZGRA 1V6MA 2ZACA 3QIYA 5DUXA 4YM3A 3NV2A 3A0NA 2IHOA 2DREA 4OEFA 5HCBA 4YG6A 1SBFA 5GZGA 4R9AA 4PF5A 3AP6A 2VUAA 2D43A 1WBCA 2ZBJA 1UKGA 3QW7A 3SH3A 2ZQNA 4IYBA 2I1BA 3AYCA 4XE9A 2W68A 4ITCA 4CTEA 2UWAA 3BA4A 3WO2A 3OYWA 3FFZA 3HMYA 1AVAC 1S0GA 1QOSA 3FJKA 4PBOA 4DEPA 2WNEA 2A70A 4RL7A 4IQPA 3Q7XA 4EB2B 2PHWA 4LBQA 1EVTA 4YZ4A 1E0OA 3O5SA 3P53A 5EYYA 2A6VA 1YIFA 3MW4A 1NUNA 3M3CA 1JOJA 1JTCA 4G9NA 1N3PA 3AZYA 4ZBVB 2WBCA 4I1BA 1LGCA 2KM2A 1DQGA 1QU0A 4JAWA 3OPZA 1BFBA 4I6IA 4Q91A 1GICA 5DG2A 1HQLA 4R9DA 3WG2A 2EXIA 2NVHA 1PC8B 41BIA 2GNBA 2ZHKA 4I7IA 1XTGA 1W6PA 4TZDA 4EL4A 4PC4A 1BXHA 2P3IA 4NO4A 1UZZA 4M00A 3HR9A 3A21A 1DBNA 2NP0A 4H55A 2Z49A 4FOVA 4FP2A 1TIEA 1XG6A 4ZFYB 3ZXDA 4XFTA 1AXYA 2L5XA 2ZHMA 5FNXA 2ISEA 4NOTA 5CB7A 3B01A 3B9UA 1UN1A 2NYYA 1DZCA 1SACA 4CJMA 2ILPA 4MYEA 1JT5A 2NM1A 3EF2A 3MALA 2ZR1B 2JD4A 1GANA 5IK4A 1R8NA 1N1YA 3F62B 3FJ9A 4D0ZA 1FV2A 4FP3A 1ISVA 3O4AA 4FPCA 2NTDA 3V0AB 3C8BA 2DURA 1GBGA 4ZJXA 1Y7BA 3DEBA 1QOOA 5GLUA 1K5VA 3IM6A 5GLVA 3IIRA 5KXCA 1CVNA 1JT4A 1PZ9A 4DS0A 4LO8B 1ULFA 4D69A 4LO0A 4I4PA 1LOGA 4Q9PA 3MEPA 4I4SA 2BEAA 5JOYA 4OWLA 3B9CA 4IHZA 1YO8A 1DQ1A 5DZFA 4GALA 3RS6A 4I37A 1IS6A 1LECA 1SCRA 3V0BB 3WHTA 1S0BA 2ISGA 2DVDA 4P9XA 4Q8KA 2ARXA 4XILA 1ZKXA 4JRAA 4FQ4A 4BMBA 4ZFUB 3IKWA 3CU1B 1APNA 1N4KA 1IKQA 3AJ5A 3DGTA 3LSDA 1VCLA 2R1BA 3QW5A 1FYUA 4QD2B 2P2KA 1ZL6A 2E4MC 3FJBA 2PHTA 2D1ZA 1C1LA 5DZGA 1IJTA 2GMEA 1DFCA 4LBMA 5IT6A 1AVXB 3QLQA 3BA5A 2WLQA 1IOBA 1MZ6A 3I8TA 1FV3A 1JQZA 1SBEA 4P14A 3NJ5A 3C2UA 4L4IA 1LOBA 2DU0A 1YBIA 1F5FA 1I1EA 3K3QB 1ENQA 5DZUA 1ISYA 3KQRA 1TWMA 3WINC 1Z78A 1LHWA 1Q1UA 3JRRA 2BFHA 1FX5A 1ZKWA 2DWRA 2R49A 5FZUA 3H6RA 4GA9A 2ZMNA 1G7YA 5H9SA 1SBDA 4X38A 2DYCA 2UWBA 2JECA 2MC2A 4XYXA 2HZ9A 1OQ1A 3WDXA 2KI4A 4U2AA 4LO7B 1V6KA 3NWKA 5IK8A 1D2SA 4I0YA 4YGBA 3AJZA 4K21A 4YW1A 1Q8OA 1AF9A 4W65A 2C5DA 1LODA 1JUIA 1T3CA 2VU9A 1R8OA 3WMVA 3RQ0A 3RMYA 1LHVA 4LO2C 1S0LA 5E8AA 5BQMB 5GLTA 3CA4A 1LOAA 31BIA 5BXSA 3BOKA 3OYWB 4A7KA 1WD3A 4LBQD 3R05A 3O4BA 5FREA 1AJKA 4YZ3A 2WSVA 2I2SA 3RTIB 1GYKA 1MD6A 4I4OA 2AFGA 4AGRA 1HWPB 2G7PA 1G9FA 2YUGA 3DSEA 4XBQA 1V6JA 3C89A 1W0PA 3BX1C 3CA3A 4XHXA 1ISWA 4II0A 3CA0A 2R1DA 3R4UA 1BLDA 1XTFA 5FZYA 2WQZC 3OJVA 3BOOA 2W2DA 1H30A 4LBNA 3T2TA 1BLAA 1SLBA 1FN0A 3BAGA 1CN1A 1G9DA 4G6JA 3IN9A 4GP0A 5F90A 2ERFA 1N1TA 4LBOA 1PZZA 4FGFA 3VT2A 4KS6A 1SLAA 2E4MA 1ISXA 5EYXA 3UJ4A 1VAVA 1Q03A 1IILA 2P34A 4P0KA 2ZGUA 4EJ5A 4DENA 1ZL5A 2BQPA 2V73A 4DPNA 1LJ7A 1BQPA 2G7NA 4K20A 3A07A 4YM0A 2D6KA 3N3HA 1W0OA 2Q5TA 2Y9XE 4PQ9A 1XZZA 3WINA 4L8QA 2VXTI 3QIZA 3IM7A 4XXPA 5E24E 2D23A 1AXZA 3M3EA 5HCFA 5F8SA 3RSJA 3SLIA 4BOWA 1YF8B 3NV1A 2PHRA 1IRAX 1UZYA 1SR4C 4ISRA 4BLJA 3PVEA 1XHBA 2DU1A 1GKBA 2DRYA 4I4RA 1GZWA 3SNMA 3FLTA 4UW4A 5GM0A 1Q8QA 1AFCA 5DG1A 4R9CA 4U36A 1RY7A 4YW5A 1FNZA 4BQ1A 3E8LC 3ZYRA 1KQRA 5GZCA 5HPZA 4ISQA 3FJFA 1YYNA 3RMXA 2Y9GA 2OVUA 3OGGA 2EXJA 4Q1RA 3N7KA 3UK9A 1HQWA 5BQNA 4XIOA 4OWKA 1FATA 3CAHA 1MS5A 4LO2A 2CY6A 2P39A 2SLIA 3FBYA 4IY9A 4G6MA 2VY0A 4P9YA 3FJCA 3B69A 1W6MA 2E51A 4JC1A 4XKIA 2ET2A 3ZSJA 4ATFA 4FOWA 3ZVXA 3RRDA 4YZ2A 3WO3A 3AXEA 2AENA 2QN0A 1HDKA 4XJWA 4UW6A 2D7RA 4H04A 1WUVA 2ZMLA 5H9RA 2DUPA 1DIWA 3HOMA 3FLPA 4AVVA 3UL2A 3N0KA 1AVBA 2JDZA 2HYKA 4XDQA 1FMMS 1S0IA 3O0WA 3SH5A 1AVUA 1PZ7A 4K1YA 4WZFA 4FPHA 1IHKA 3WDVA 1LU2A 4HR6C 3AFKA 1NZKA 4GXLA 1RZOB 2GNMA 5BQUC 3PMEA 2R9KB 2D6PA 4LBJA 1S0CA 1LHUA 4ZOTA 2KLLA 5BXTA 3FUOA 3ZURA 2ZGNA 3H6RB 2FDBM 4IY8A 2XHLA 3IMNA 5GALA 4LO1C 3POWA 1ULEA 4BMEA 2A7AA 2M49A 1Q8PA 2AR6A 3A22A 5BOWA 3AXDA 1S0DA 1V6UA 2VW1A 5T5JA 3M3QA 1JYIA 2A8AA 3AZWA 7I1BA 1LU1A 3AZZA 4XBNA 1W6QB 3CRGA 3QJ0A 1LENA 2XG3A 4I96A 4YM1A 4M3CF 1MC9A 4QALA 1BKZA 3NBCA 5SV8A 2RHPA 3OY8A 4OW4A 3ZXFA 4GAIA 1W6NA 2ISHA 4FPYA 1NXD1 4Y22A 5GLWA 4ZFWB 1MS3A 3OJ2A 4YFWA 3M2MA 2HWAA 2K4AB 3BB2A 3QYDA 4P0LA 2K43A 4EEEB 1G82A 3VUOA 1ULGA 3FJ8A 1LOCA 5BYNA 5F8YA 2J3PA 1YRZA 5JDBA 2ZGKA 5F5QA 4UW3A 1GGPB 3ZXJA 3WA1A 1WW5A 1JLYA 3T1MA 1SR4A 4LO3C 3SNVA 1ZM1A 3JUTA 3AKHA 1JXNA 4PCRA 2ZA9A 2ZGTA 2VW2A 1LEDA 4OWJA 3C88A 1IRPA 1DQ0A 3CA5A 3WDUA 3FIEA 1LTEA 4XZPA 1Z4SA 1KDMA 8I1BA 4PBPA 4FPFA 3ZSLA 3I4IA 1XYFA 5G00A 4LBKA 3N7MA 5T50A 2GN3A 1PUMB 4Y26A 3ZXKA 1S0JA 2OUJA 4G9MA 1YTOA 2PHXA 1MACA 4TYSA 3RG0A 3VKLA 3VWCA 1QKQA 1SCSA 3BAOA 4GAFA 3H6QA 1FWVA 4J2KA 4I4QA 1SLLA 4G1RA 4X3AA 1CESA 1HLCA 1G9CA 1GV9A 1V00A 1N1SA 4I1EA 1MS9A 2A3XA 1G9AA 4XFSA 1T4QA 2ZAAA 5D63A 5I1BA 1YVGA 5B2HA 2Z42A 3IPVA 2HWMA 3I2XA 9ILBA 2EF6A 3A23A 1KITA 3USUA 5BQUA 2ZHNA 4R9BA 1LHNA 4YM2A 2ZABA 4GWMA 2VSAA 2D6NA 1KJLA 2GNTA 1DJSB 3WDTA 2ZGMA 1ZN3A 4GOYA 2FGFA 4LO1A 2PHUA 1SZ6B 2VW0A 1GZWB 2ETFA 2ES3A 1PUUB 3NV4A 3BWIA 1ENRA 1PZ8A 4ASMB 2FHRA 1QMJA 2ZQOA 3WZ1A 4JKXB 2NN8A 1VAMA 4Q26A 4XMAA 2ZGOA 2YROA 3ASIA 3NBDA 1ABRB 4AN7B 3FLRA 3BOPA 1WLCA 3ZSKA 1V6WA 4A7YA 3DDAA 1BYHA 4C1XA 2D6MA 2MLLB 1W3FA 3NF3A 2QN4A 1W6MB 4AVSA 1ITBA 3TC2A 3WVJA 2FFVA 2D44A 3O5WB 3AH4A 1TOOA 4Q2FA 3S8KA 1Z2VA 2Q9XA 2YY1A 3H6SE 4HL0A 4Q27A 2H0BA 4LO3A 1QNYA 3ILFA 5T5OA 2RSTA 1V6XA 4KC3A 3IM5A 3WG4A 4I4VA 1W3AA 4YOLA 1DHKB 1EYLA 4M01A 4YLZA 3O0VA 2KKIA 3BODA 4FOYA 3WUDA 1OFSA 2P3KA 4L4HA 2WT1A 5LK5A 2ERMA 2EALA 3HN1A 3WDWA 4XJUA 4YGEA 2NMNA 2D20A 3AZVA 4ZA3B 3GALA 2VLCA 3D3XA 4YFZA 5GAQA 3MPPG 1E1HA 4TLPA 4XTMA 5BP5C 3MW3A 3W58A 4EFQA 2XHLB 3O4DA 1LGNA 4CZSA 5F8WA 1GNZA 2FMDA 4ATEA 3AH1A 3B00A 2JE7A 3KMVA 5KXEA 5EG6C 1ONKB 3BTAA 4FPGA 1J1TA 1V6OA 5GZFA 4LBQB 1M2TB 1F31A 5T54A 2RG9B 3ATGA 2B7YA 2CWSA 4FPKA 2P23A 3UJ0A 4ZKTB 1CE7B 3OY8B 1EV2A 4QKSA 3ZYPA 2E53A 3N7LA 5IK7A 3WHUA 3ZXLA 4XOGA 1H9WA 2ZGSA 1CQ9A 5T5LA 3POKA 3M1HA 3PVOA 1CPMA 1W6PB 1RG8A 2EXHA 4DFSA 1O4ZA 4XTPA 1QOTA 3DUIA 2ZGPA 1MS0A 2ZMKA 3CA6A 2D7IA 4BPZA 1IS5A 4KUFA 4KBBA 3ZUSA 1ULCA 1IKPA 4FVVA 3BRGC 4FPLA 2AAIB 2VXRA 3ZXGA 2X2SA 3JU9A 2X2TA 4P9WA 4HANA 1JW6A 4Z8SB 3N36A 4X37A 1YI7A 4OEGA 5GZEA 2P3JA 5DVHA 4XFUA 1SFYA 3ZC8A 5L73A 1SLIA 2ENRA 2D3RA 1PWAA 2ZHLA 2UWCA 3QCWA 3ILAA 5H9QA 1A78A 2ZGLA 4J2YA 5EXOA 1C57A 2DV9A 4XBLA 3WDYA 1WW6A 2AUYA 3POYA 2CTVA 1UL9A 3O3QA 3AKFA 2R0HA 2WT2A 3APBA 2IWTB 2DTWA 2DVBA 2G4IA 2R0FA 3PG0A 3CRHA 3B3QE 5JVVA 1V6VA 1CONA 3DDBA 1S0EA 1JN2P 3AYEA 2KI6B 1DFQA 2D6OX 4Y1ZA 4ZLBB 4GOVA 4R6UB 2IMBA 1CIWA 3VSZA 1GSLA 3IPVB 3P6JA 3WCRA 1TTUA 1AJOA 3WCSA 1MR5A 1CR7A 2W52A 1FAYA 2WJSA 4YZ1A 3VKNA 3OJBA 5D62A 1T3AA 4YGDA 3UD8A 4ELCA 1G8WA 5BP5A 3M3OA 2GO2A 2EIGA 3BONA 1UAIA 1B09A 3UJOA 2A6YA 2GMPA 4AGGA 1W3GA 1OKQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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