1G9AA

Crystal structure of clostridium botulinum neurotoxin b complexed with an inhibitor (experiment 3)
Total Genus 395
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
395
sequence length
1290
structure length
1287
Chain Sequence
PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A Novel Mechanism for Clostridium botulinum Neurotoxin Inhibition
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE B
total genus 395
structure length 1287
sequence length 1290
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2000-11-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 1g9aA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1g9aA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1g9aA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 1g9aA01
1Q8OA 2HZ9A 6I1BA 4Y24A 3OJBA 3Q7WA 3RTJB 1V00A 1LGBA 2PHXA 4KS6A 3TC2A 4YGBA 4FPHA 1SBEA 5BYNA 2D6KA 3C8AA 3QLQA 3WINA 3AJYA 3Q9OA 5DZGA 2D6LX 1DJSB 3AXEA 2R0FA 3N0KA 1DZQA 1W6NB 2Y9XE 1TEIA 3VKNA 1V6WA 2HWAA 4J2XA 5IT6A 1G86A 2RG9B 2JJ6A 3ZXGA 4EFQA 1DQ0A 2HWMA 3BAQA 3IN9A 4FPGA 3GALA 1VALA 2Y9WC 4OWKA 1W6QA 3BONA 4KBBA 1Q8QA 3ZSMA 4ZXKA 1JT3A 2UU8A 4FPOB 3M1HA 2KLLA 3V65A 1LOAA 1TWMA 2XOAA 1DIWA 3BA7A 1S0DA 4YGEA 3IM5A 1UPSA 4USPA 3AP5A 3WINC 2DU1A 1IRAX 1Z0HA 3U4XA 1LU2A 5DXDA 2CNAA 3SNMA 5DUVA 4XTPA 4P0JA 2JDZA 1RZOB 3WDUA 1WW7A 1BARA 1TP0A 2FHRA 1IS4A 4FPYA 4GWNA 4YW3A 3PVNA 2ZGPA 3R4SA 2EIGA 1CONA 5DUXA 1AVWB 1ULDA 3USUB 1IILA 1HCEA 1CESA 1RINA 4IQPA 5EYXA 3UJOA 4HL0A 4EFRA 1JTCA 3FLTA 3I8TA 2BFHA 1AVXB 3AH1A 3A0KA 1G9DA 4YGDA 2A8AA 5T50A 1IKPA 4GOVA 1H9PA 3AYDA 1JOJA 1GANA 4XMAA 2C9AA 4JKQA 1MACA 1UL9A 1Q03A 4GALA 1UX6A 1FNYA 1JT7A 3A21A 1URXA 1YTOA 5B2HA 3CA1A 1HCDA 3R05A 1O4YA 3SH5A 3ZC9A 3PG0A 2A6ZA 1HQLA 1FN0A 1N3PA 1LHOA 5JMCA 4JAWA 4I4XA 1H30A 2WJSA 3OYWB 5AVAA 3N35A 4HA2A 2MLLB 2PHUA 1YRZA 5D61A 2ZMLA 5BOWA 4QO3A 1BFCA 1W6PA 3QR5A 2G7PA 1JT4A 3WO3A 2ZGTA 1G7YA 3QW6A 4EEEB 2R0HA 4UW4A 3WDVA 3UD8A 4OEFA 1WBCA 1Z4SA 2V5YA 1AX2A 2HW9A 4ZKTB 4J2SA 1A78A 1YO8A 1OQ1A 3V0AB 1QU0A 4TZDA 4LBQA 1RG8A 3AJ5A 3SLIA 2HYKA 1N1YA 4FOQA 4X38A 1JYCA 4XMIA 4ASMB 3PVOA 1WBAA 7I1BA 5E89A 1IS6A 2CL2A 3FJDA 1W6OB 5L73A 3A23A 2FFUA 4I6IA 5HCBA 4AVTA 3FLRA 1V6MA 4XXAA 1JW6A 1DQ6A 1O4ZA 5F8SA 1ISZA 1N1TA 5EC5A 31BIA 3AP7A 4WVVA 4F34A 4XXPA 2A6WA 5CB7A 2NTDA 2QYIB 2D6MA 1MD6A 2WRYA 2EAKA 4FPFA 2GALA 2YXSA 2D43A 3AP4A 1XHBA 5FZYA 4R6UB 4D8HA 4PBPA 4XJ8A 5BXRA 1FATA 1LODA 2GNBA 2A75A 3OGGA 4Y20A 1CQ9A 3N7LA 3BRDA 3FJ8A 1KJLA 1DFQA 5BQMB 1FMZA 2D1ZA 2R1DA 4HANA 4K21A 1XYFA 1DQOA 4LBQB 5T54A 3BAVA 1ZA4A 1PZ7A 5GLTA 1YI7A 4ZOTA 2YUGA 1ULCA 1XG6A 3QJ0A 4R9CA 2TEPA 2ZGRA 5BVPI 1V6IA 4EKXB 3NF3A 1U0AA 4HEVA 2JE9A 3FLPA 3AZVA 5GZGA 1EV2A 3E8LC 2DVGA 3DDBA 4Z9WB 1P63A 4YFZA 3FJEA 5I1BA 4XJUA 3C89A 1H9WA 3BAUA 2DVFA 4FGFA 3UL2A 1QOSA 1DQ5A 3IAGC 4WVWA 4ZBVB 3AZXA 1V6XA 1LTEA 4J23B 1RIRA 3BB2A 1LJ7A 4I4VA 2R49A 2GMEA 3PJQA 4JKXB 2CWSA 3FUQA 5JLVA 4XIKA 1GZWA 5T5PA 3ZSJA 2PHTA 4I4YA 3ZPYA 5DG1A 4XBQA 3RS6A 2R9KB 1FX5A 3DUIA 2PHWA 2DREA 1S1AA 4GWMA 1LESA 2ZHLA 1LHUA 4Z8SB 2W2DA 1S0FA 4JRAA 1QNYA 3A4UA 5H9PA 4XJAA 4F83A 4I4SA 2ZHNA 5KXBA 4I2SA 3OGFA 2ZMKA 1NXD1 2FMDA 4QD2B 1LECA 5IK8A 3OJMA 2ERMA 1ENSA 2NP0A 4XJ9A 4R9BA 2WT0A 3CAHA 3OJ2A 4XE9A 4BQ1A 1FV2A 1EYLA 2XG3A 1F31A 3O4AA 3QYDA 2BEBA 1W6MB 2DV9A 1R1ZA 1QGLA 3AKHA 3FIIA 5DUYA 2XHLA 1W0OA 3FBYA 5EWSA 1HWNB 1YIFA 5DZFA 1IKQA 2IMAA 4ZLBB 4P9WA 1IRPA 4FVVA 3CNAA 4FOWA 3LCPA 2M49A 2I2SA 2C5DA 2GN3A 2P37A 1G9AA 2K43A 1PZ9A 5GM0A 3IM0A 2UURA 1EPWA 2KKIA 2NN8A 1SCRA 4K20A 1TWEA 1ULEA 3WLUA 1LHWA 4JQ0A 1JHNA 4XFSA 1ULGA 3ZYRA 3NV3A 5KXDA 2VXTI 4KC3A 4Q8LA 2LTNA 2WKKA 5E8AA 2Q9XA 2ZGUA 1Q8PA 2ESUA 3LSDA 1FWVA 1MS4A 4KTXA 1WLDA 2A6YA 3IM6A 1UN1A 2DTWA 5IK7A 1ISXA 1MS1A 4XIOA 1WD4A 5EG6C 4ELCA 3FJHA 2VY0A 2DUQA 1N1VA 4RA0A 1T3AA 4Y1UA 4FOYA 3VKOA 1ONKB 4X39A 4LBKA 4YGCA 3CA5A 4IZXA 1DYKA 1NLSA 1IS5A 1F82A 1S0LA 1BZWA 2F2FA 2D24A 3AP6A 4QC4A 3RTIB 5JOZA 2LALA 4ZA3B 3BX1C 3SH4A 5DUUA 4IYBA 1R8NA 4XJZA 1SLAA 2P39A 4LO8B 1AJOA 3WDWA 1WUVA 3AJ6A 4DEPA 1JY0A 3WV6A 1WD3A 4G6MA 4WZFA 1BFBA 3DGTA 3W58A 1I1EA 2G7NA 2GNMA 3FJJA 4BLIA 3WHTA 2Z49A 4UW3A 3A07A 4ITCA 1C1LA 2F2FC 5CAZA 3FIEA 5BQUC 3WMUA 1ABRB 3D4KA 3AZYA 1FWUA 1QDOA 4DQAA 5FZUA 1FYUA 1BKZA 3N7MA 5JVVA 5DG2A 3CRIA 4GAIA 1MZ6A 2AYHA 3PUBA 4YZ3A 3V0BB 2DUPA 3QIXA 1FNZA 1SR4C 3AXDA 3O4CA 4WBCA 1Q04A 4I4QA 3RG0A 4LBMA 1ULFA 2D3RA 4I96A 2DUOA 4CZSA 3NJ5A 3BA4A 2E4MC 1LOEA 3O4BA 5D62A 2EALA 5JOWA 2AUYA 1SCSA 3MW3A 2L5XA 4YW5A 1K5VA 1XTFA 3C2UA 3N3HA 1ZKWA 2YV8A 1JLXA 3VT1A 1KRIA 1GNHA 4BMEA 1KITA 2SLIA 4I1BA 2A3XA 2R16A 1HWMB 2YROA 2A3WA 2ZABA 1TFMB 1HKDA 1Q8VA 3HN1A 1BFGA 4KEKA 1ISVA 1S0GA 3BAOA 1V6KA 5IK5A 2Q3NB 4D0ZA 4CJMA 2WQZC 3FGMA 4G9NA 3O5SA 2NMOA 1G8WA 2JE7A 4PBOA 1WW4A 1ITBA 1OQLB 3CRGA 4PC4A 3FJBA 5F5QA 4OWJA 3SNVA 3TAYA 3K3QB 3FJIA 3WG3A 4L4IA 1GLHA 1PUMB 4YLZA 3D5OA 3PVEA 1AXKA 3IPVA 4GA9A 3SISA 3OPZA 3N7JA 2VUAA 4LO7C 4QKSA 5IUQA 3KMVA 3KM5A 2P3KA 3FJAA 1LGNA 3I2XA 4IY8A 4XTMA 1W6QB 1LOGA 2P2KA 1AX0A 4FQZA 5GZEA 4EB2B 3WNXA 1LU1A 4ATEA 4K1YA 2XB6C 1F5FA 2A7AA 2GNDA 1WCSA 1X50A 2V73A 1Q56A 3H6RA 1ZN3A 3OY8A 2CTVA 4LO0C 1TTUA 4KEJA 4AN6A 3B00A 1T3CA 4EL4A 3AKIA 1PUUB 1MR5A 4X37A 4ZJXA 5EYYA 2ILPA 2CWMA 2Z42A 2G4IA 2ZZJA 4GXLA 3FUOA 3HMYA 4LBQD 4P9XA 1Y7BA 4Q27A 1DQ1A 1GBGA 2NYYA 1WLCA 4CTEA 4II0A 1IOBA 1I1BA 1ILR1 2GO2A 3VT2A 1MS9A 2WSVA 2WNEA 2A6XA 4I4RA 1KDMA 4DRVA 4YFWA 4IHZA 1GZCA 3ZXJA 1BXHA 4R9AA 1MS5A 2QN0A 1HIBA 1SBDA 3WCRA 1DQ4A 5JOYA 4GKYA 2EXJA 3ATGA 5GLWA 4P0LA 1BA7A 1Z78A 1T4QA 3WVJA 2X2SA 4ZGRB 2DRZA 3B01A 4I1EA 5FZZA 1XTGA 1ENRA 4FPJA 4P9YA 1WBLA 3B69A 3I2AA 1AXMA 5F8WA 2ZGMA 3ZXDA 1LOCA 5GALA 2OUHA 1QQLA 1LGCA 1S0JA 5CBLA 4BOWA 4Y1XA 1SACA 4LBOA 4YM1A 3M3CA 3FJKA 1W6PB 2P23A 1LULA 5BXSA 2P3JA 4GKXA 3JUTA 2ZBJA 4U36A 5DZUA 2GNTA 3WDYA 2E6VA 3ILAA 1FMMS 4OZXA 3Q7YA 2KH2A 3I29B 1CR7A 3QW8A 2SBAA 4IZEA 2ISHA 1CPNA 3W59A 2EXHA 4YZ2A 2IHOA 2DTYA 4A7KA 5EHAA 1CE7B 1EVTA 1TOOA 4QBCA 2VW0A 3VKLA 2DU0A 3S8JA 4Y26A 3ILRA 1UMZA 3IIRA 1UAIA 4QKRA 1GZ9A 3AYAA 3UJQA 3ZX7A 2AENA 4DRRA 5EXOA 5JDBA 5DZEA 2AQZA 4QBVA 4JCKA 4M00A 4Y1VA 4AYUA 3WCSA 3ILFA 5HCAA 2OW4A 1C4RA 2ZMNA 5CA6A 5CNAA 4Y20B 4G1RA 2ZAAA 3O3QA 3ZSKA 2P3IA 4P14A 1M16A 3POSA 4HR6C 5HPZA 3A0NA 1E0OA 1AXZA 4OWLA 4X3AA 2DRYA 3WO2A 1K5UA 2OUJA 5E24E 3AK0A 4ENDA 3BOOA 4QD2C 4FPCA 2ZHKA 3HBWA 4L8QA 1VIWB 2MC2A 2D7IA 3N36A 3MW4A 3ZVXA 1MC9A 1V6JA 1R8OA 1HLCA 3W9TA 1FAYA 4JC1A 1ZL5A 1E1HA 4Z8BA 3WG1A 2PHRA 1CPMA 5GLUA 4UW6A 2JECA 2A3YA 1AVAC 1BYHA 2ZGSA 4TLPA 4I4PA 3BRGC 1DZDA 2A97A 1SLLA 5BP5A 2Y9GA 4I3NA 3ZXLA 1QOTA 2ET2A 4SLIA 3IMNA 3LTQA 1GZWB 3VT0A 3WMVA 4FPEA 5GZCA 3APBA 1KNMA 1Q8SA 2NM1A 3QIZA 2D20A 3BA5A 1HKNA 4G9MA 3UK9A 4GP3A 4Y22A 2W2DB 4LBNA 2EXIA 2WSUA 4XFUA 3NV2A 4XKIA 1GGPB 2D6OX 2K4AB 4ZFWB 4IONA 3P6IA 4YM2A 3UD7A 2VSEA 3BOKA 3HALA 2Y9FA 2AH2A 2VW2A 5BP5C 2IMCA 4ZFUB 1MS0A 1CJPA 4A7ZA 3WUCA 2WLQA 1V6LA 3CA0A 1N4KA 4Q8KA 2Q5TA 3WG4A 2A70A 1DYPA 3BWIA 1LCLA 3QW5A 5BXPA 1BLDA 3ZURA 2DURA 3AH4A 2VW1A 3SH3A 1NZKA 3FJFA 1D0HA 3NBEA 2XHLB 1LOFA 41BIA 3FFZA 3FJCA 1ENQA 4PCRA 5GJ6A 2YY1A 1BASA 3Q7XA 5HCFA 3POKA 1M2TB 4BPZA 4AGVA 1DBNA 4XFTA 1A3KA 5BQUA 2F8XC 1QF3A 2ZGLA 1JXNA 3UJ4A 4LO2C 1V6OA 4AWDA 1HDKA 4Q91A 4I4UA 3UDAA 3BRFA 1DLLA 2D3SA 3H6SE 3M2MA 3AKGA 4Y1YA 1W6NA 3RMXA 3O0VA 4FOVA 2D44A 3N7KA 1PC8B 1SR4A 3T2TA 4JP0A 4UW5A 3VKMA 3WG2A 1LOFC 3POYA 3ZYPA 3ZUSA 4FP2A 2I1BA 3RQ0A 3NBNA 2VH9A 1GSLA 1NUNA 3ZC8A 1YVGA 1IT0A 2JD4A 3DS9A 1ISYA 2AGSA 3WDTA 1AX1A 2E4MA 3VSZA 4LO1C 4QALA 2W39A 5DUWA 1CIWA 3WHUA 2LIQA 3CRHA 2KI4A 3BODA 4GOYA 4Q9GA 2UWBA 1CVSA 3ASIA 4NOTA 3VKFC 3WA1A 3ZXFA 4AN7B 3R4UA 3WZ1A 2D7RA 3WUDA 2D6PA 1V6VA 4EFPA 1TIEA 9ILBA 5SV8A 1UKGA 1SLCA 1DHKB 1N3OA 21BIA 5GZFA 3PHZA 1AFCA 3VV1A 5BQNA 5FREA 3NBDA 1S0CA 1L2HA 3USUA 4D0TA 2AR6A 4LO3A 1A8DA 2DVDA 3L2YA 3O12A 3LLPA 2K8RA 1QXMA 3QIYA 3WDXA 2RQ9A 3C88A 5T52A 3CA4A 1GYKA 4XBNA 1DGLA 4ISRA 4K1ZA 2ZA9A 4R9DA 2QN4A 5T55A 3JRRA 1DZCA 1C57A 2EF6A 1Q1UA 2RSTA 4DCKC 4M3CA 1YF8B 2DYCA 3ZXKA 4Q2FA 4NO4A 4M3CE 1LHVA 2CY6A 3AX4A 4H9WA 3H0OA 3O4DA 3O4OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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