1G9CA

Crystal structure of clostridium botulinum neurotoxin b complexed with an inhibitor (experiment 4)
Total Genus 405
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
405
sequence length
1290
structure length
1287
Chain Sequence
PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
publication title A Novel Mechanism for Clostridium botulinum Neurotoxin Inhibition
pubmed doi rcsb
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE B
total genus 405
structure length 1287
sequence length 1290
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2000-11-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 1g9cA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1g9cA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1g9cA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 1g9cA01
2EXKA 3FIIA 1T3CA 3FJAA 3AJYA 5EYXA 3OYWB 4XILA 5JOXA 3POYA 1LGCA 4YZ2A 3QCWA 1CIWA 1SR4A 3CRGA 4I4OA 4FPYA 5T50A 4M01A 1LOBA 3NJ5A 3OGGA 2R0FA 1W6QA 1HWOB 3DEBA 3UD9A 4FPKA 5E89A 1MVQA 1CONA 1XQNA 5FREA 4I7IA 3VKLA 3IM7A 4XE9A 4FOYA 1HDKA 3O49A 5GLWA 4KC3A 3TAYA 3H6SE 2LTNA 2DU0A 5EXOA 1VCLA 4QBVA 1SR4C 2A70A 1W6QB 4OZXA 4OWKA 2ISGA 2GNDA 1Z78A 1GZCA 3UJQA 1TFMB 4ZA3B 4C1XA 4QO3A 3OY8A 4ISRA 4G9NA 1OQ1A 4A7YA 3APBA 4FOVA 1AXMA 1LCLA 4AVSA 2D6OX 1SZ6B 4YM1A 1V6MA 1BFBA 1M2TB 3OBRA 4AWDA 2PELA 4ZFWB 3VT0A 4EEEB 4WZFA 4YG0A 1PZZA 3AJ6A 2X2TA 1QGLA 3DSEA 4Q26A 3O4OA 3CQAA 1SLBA 5FRAA 1KNMA 5T5PA 2E6VA 3ZYPA 1GZ9A 4X3AA 4FVVA 3BWIA 7I1BA 1LGNA 3WMUA 3WDXA 1DQ5A 3EF2A 4HJJA 4Q1RA 3QW8A 2P37A 3PMEA 2P3JA 1PWAA 3FJ8A 2CWSA 1V00A 3AZXA 3V64A 2E51A 3AJ5A 3NBNA 3HN1A 2SBAA 2C5DA 4R9AA 2ZHKA 1V6XA 1S0EA 3WG1A 3JU9A 4TZDA 5DG2A 4DS0A 1IJTA 4I1EA 1G9FA 4K21A 4PQ9A 3GNEA 3TB0A 2NMOA 4W65A 1Q03A 3M3CA 2F2FC 1G9AA 1CPNA 2KM2A 1ZN3A 4LBLA 5DSSB 3KM5A 5H9PA 1WBFA 1A78A 4K20A 2BFHA 4SLIA 5HCBA 2HW9A 3MW3A 3AX4A 3IM5A 3S8JA 2D22A 4F83A 4IQPA 1GLHA 4DEPA 3INAA 2MLLB 5JMCA 3M3EA 1AJKA 3PJQA 1N1VA 4XKIA 1AFCA 5SV8A 1V6OA 2JKBA 3BOOA 1UZZA 4Z9WB 4AVTA 3O44A 1N3OA 3WDYA 4CTEA 4PF5A 5GZCA 8I1BA 4I96A 2DRYA 4R9BA 3BA7A 5F90A 4YG6A 3ZC9A 3P6JA 1W3FA 1RINA 3WHTA 2VW1A 4AGGA 4KUFA 2G4IA 1T4QA 1DJSB 2OVUA 3ZXFA 2IMBA 2D44A 5IUQA 4H55A 4XJ9A 3UJOA 2WSVA 2VSEA 2W08A 1UZYA 1MVEA 4LBOA 1GNZA 4FPGA 3NBEA 1YIFA 1Z2VA 4FPEA 3OPZA 2NVHA 1KQRA 4LO7B 4AVVA 1FX5A 3AZYA 4D0ZA 1UAIA 5T52A 3WDTA 2GNBA 2ZGPA 3QLQA 1X50A 1AXKA 4Y26A 2D24A 1WW5A 4LO7C 1MS9A 5BQMA 2NTDA 3N7MA 2VY0A 4ZKTB 2X2SA 1IRAX 1SLTA 1LHWA 2D7IA 3RTJB 4P6AA 4A7KA 5T55A 1N47A 2ET2A 1BFGA 4OWLA 2PHXA 1Z0HA 1BQPA 3BRGC 3WCRA 2A5ZA 4P14A 5BQMB 1DQ0A 2ZQNA 4I0YA 1URXA 4ISQA 1IHKA 3TC2A 1LOFA 4XJ8A 2WSUA 4Y20A 3ZXJA 4GKXA 3C89A 1QU0A 3CA3A 3V79C 3ZXGA 3WHUA 1QDOA 3BB2A 5IK7A 1C4RA 1LOAA 2A6ZA 1D2SA 3E8LC 1P63A 3R05A 1FNZA 1BFFA 1TWEA 4FQ4A 2A3XA 4BOWA 4Y1UA 3A23A 3WO2A 3WLUA 2A6XA 4Y20B 4Y24A 4II0A 3ILFA 2UWBA 3R4SA 2K4AB 4AGVA 2A71A 5BP5C 21BIA 3SLIA 3WCSA 3PVNA 4J23B 2XHLA 1SLLA 3FBYA 1DQ2A 4G6MA 2Y9XE 1NXD1 1CVNA 1HWMB 1DYPA 1YO8A 1CQ9A 1PZ9A 2A6WA 5KXCA 4XTMA 3UD7A 4ZLBB 2F8XC 3O0WA 2DVGA 2BEBA 4TLPA 5G00A 2ZGOA 2XHLB 2GDFA 1VAVA 4I8MA 3LSEA 2D23A 4YW5A 4XOGA 1V6NA 2HWMA 1IKQA 3IAGC 3B69A 1UL9A 4CRQA 1WCSA 3FJCA 5JOWA 3A07A 4D0TA 3NF3A 2KLLA 1SLAA 1HQWA 3A0KA 2IHOA 1XHBA 3ZSKA 4YFZA 1FN0A 9ILBA 4ZJXA 3VSZA 5T54A 4TYSA 2XG3A 4WV8A 4EJ5A 2Q9XA 1W0PA 1H9PA 2R9KB 2A7AA 4Q9GA 2VXTI 2ZR1B 3AFKA 3AP5A 4FQZA 3SH3A 3AYAA 1Q8PA 1J0SA 4GWNA 3HSMA 2EIGA 4GKYA 4I4RA 4LO0C 4P0JA 4NO4A 4KTXA 1R8OA 5GZEA 3O4AA 4YOLA 3WZ1A 1EVTA 4XJZA 4QD2C 1M16A 4XFSA 3WINA 3AP7A 1CJPA 3JUUA 4EFPA 4YM3A 2PHTA 4ATFA 4XBLA 3CA6A 2P2KA 3CRIA 3Q7XA 4PBOA 4Q1PA 2UU8A 3DGTA 1WBCA 1ISZA 2RG9B 3HBWA 1QMJA 4K1ZA 1S0LA 2Z42A 4P0KA 3Q7WA 3WOGA 1T9FA 5DVHA 3PVEA 3P6IA 1QQLA 5JLVA 4KS6A 3B9CA 1DQOA 3AH2A 2EXJA 2E4MA 4P9WA 4GP3A 2ERMA 4J2SA 1AXYA 3I2AA 2YMZA 2WT1A 1QOTA 4JCKA 2A75A 4QKSA 4YZ4A 1DZQA 1LOGA 1F5FA 1DBNA 3AXEA 2W52A 3SNMA 3FUOA 1LTEA 3UJ4A 2YY1A 1ISXA 3C9ZA 1GSLA 4XBNA 1OKQA 1O4ZA 1S0CA 1LHVA 3Q7YA 3BAUA 2ZGTA 3POWA 5T5LA 1YYNA 2YXSA 1WLWA 3BX1C 2ZGNA 1HLCA 1OFSA 3HMYA 4LBNA 4BM8A 2P23A 5DG1A 5JDBA 1IOBA 1MS1A 3UDAA 4MYEA 1E0OA 1APNA 3N7KA 1UX6A 3R4UA 1W6NA 1DLLA 1V6VA 1LHOA 1HWPB 1JBCA 4YW3A 3AZVA 4FPFA 3BAHA 1H9WA 5EHAA 4Z8SB 3WG3A 4BLJA 2D3SA 4LO1A 3AP4A 1BKZA 1MR5A 5BXTA 4FP3A 4OWJA 1W6NB 4JP0A 3ZVXA 2XOAA 2ZMNA 2P34A 4YZ1A 2ZGUA 1V6IA 4XTPA 1WUVA 2EALA 1GNHA 2V73A 5D63A 3AKFA 3IM0A 3ZSJA 1DZCA 1LOEA 1XYFA 3CNAA 4XJAA 5DUXA 1VLNA 1LESA 4LO1C 4G9MA 3H0OA 3RMXA 3OGFA 3A0NA 2GZBA 3BA4A 2Z49A 1QOSA 4HEVA 1JLYA 1CPMA 3ASIA 1HCDA 1IS5A 4D8HA 2UUSA 4DQAA 3W9TA 2ZGSA 2AENA 2ERFA 1KDKA 5CAZA 1AVUA 3A22A 3ZXDA 1N1TA 1LHNA 1N1YA 2KI6B 2JECA 2ARBA 5CA6A 3A4UA 2NZ9A 1CN1A 3WDWA 3N0KA 1I1EA 5F5QA 1CE7B 4GP0A 2VXRA 3M3OA 1ZB7A 2SLIA 2ESUA 2F2FA 1XTGA 1I1BA 4XBQA 2DWRA 1JQZA 1Z7HA 3Q9OA 3O4BA 3ILAA 1IILA 2K8RA 2W39A 1R1ZA 3UJ0A 2WNEA 3ATGA 3O3QA 2FGFA 2UWAA 2GALA 4FPCA 3AK0A 1Q8QA 5CNAA 5GALA 4PCRA 2LALA 3D5OA 1LGBA 4LBQB 1Q1UA 1B09A 1G9DA 3M3QA 2OW4A 2P3KA 2E53A 3IMNA 4YFWA 3ZX7A 2ZMLA 4Q9PA 1II4A 1FYUA 1MS8A 1QOOA 2RHPA 4WVWA 3PG0A 4G6JA 5GZFA 1UN1A 4ZOTA 3C88A 5T5OA 2PHWA 1SBEA 2A8AA 3ILRA 5L73A 2AQZA 1DIWA 2M49A 3AKHA 4I30A 1QKQA 1E1HA 4XYXA 3K1XA 1WW7A 1FQ9A 4BMEA 1ZL6A 1JT5A 4FOWA 3T8SA 2ZHMA 1GZWA 2B7YA 4D69A 1DQ6A 3BOPA 1EV2A 4LBJA 2RQ9A 3C8BA 4I4QA 5I1BA 2MC2A 1BLAA 4AGRA 5BOWA 1PZ8A 3ZXLA 3O0VA 2CYFA 3BRFA 5E88A 3FJFA 2QN0A 1W6PB 1ZA4A 1JY0A 3OJVA 5JVVA 1GZWB 2C9AA 1JOJA 4C1WA 3NV1A 3FJIA 4LO8B 3OBTA 2ZHLA 4YM0A 3I29B 4NOTA 4AN7B 3MALA 4QBCA 1YI7A 1YTOA 1ZM1A 4IZEA 3FJJA 4OEEA 1KJLA 2CY6A 3KQRA 1ISYA 2UWCA 4GALA 1GICA 4P9YA 5EC5A 4A7ZA 3BRDA 1YF8B 3POSA 3I2XA 1ULDA 1LEDA 1JT7A 1S0DA 2ZGRA 5KXBA 2DVDA 3AZZA 4UW5A 4XFTA 3BAVA 1QNYA 3F1RA 3QR5A 3NV4A 4HANA 1FAYA 1QXMA 2VW2A 4XJUA 1RMLA 4OEFA 1G9CA 3QYDA 2D6NA 2WJSA 1FMMS 3W59A 4ZXKA 3V65A 3IN9A 4DCKC 5BQNA 3AP9A 4U36A 3AKGA 3ZUQA 2ZQOA 5GLTA 2WKKA 1V6JA 2FDBM 1MZ6A 1MZ5A 2KH2A 4Q8KA 5BP5A 1ZL5A 5GAQA 3IM6A 4BLIA 5KXDA 4XXAA 5IT6A 3HOMA 3FFZA 4Q91A 1BARA 4GOYA 4IZXA 1PUUB 2Y9GA 3DS9A 4FPJA 5BVPI 4ENDA 1KDMA 2CL2A 1RZOB 3W58A 1MS3A 4CJMA 2DUOA 2JJ6A 4EFQA 2OUHA 5H9RA 1YVGA 5GLUA 4L4IA 4UW6A 4IY9A 1S0GA 1XZZA 1L2HA 5BXPA 3WVJA 3VWCA 2I2SA 2DVBA 2EXHA 2XB6C 4XHBA 1Q8SA 2GMEA 4P9XA 4X39A 2D1ZA 4GA9A 3BODA 3RRDA 4YM2A 5DZGA 3O12A 1G7YA 3BIWE 1W3AA 2QN4A 1SBDA 1A3KA 1GYKA 2FFUA 3BAGA 1ISVA 3WUCA 4WVVA 2FPQA 3FJBA 2Y9WC 2CTVA 3PHZA 4K1YA 3VKNA 2ISHA 4I4SA 2DU1A 1S0BA 4ZGRB 4LO0A 4YGEA 5T5JA 2R49A 2IWTB 1ZKXA 1MS4A 4DRVA 1W6OA 3VUOA 1NLSA 5GM0A 4YG3A 4I4YA 3D6EA 1SBFA 3IPVA 1DGLA 4LBQD 3P53A 4QKRA 3HALA 3BAQA 1R8NA 1Q8OA 1AJOA 5DZUA 4FOQA 4P0LA 1ULGA 3DUIA 3VKOA 1GV9A 3MW2A 6I1BA 3FLRA 2HWAA 1D0HA 1W6OB 5EWSA 4GAIA 2AYHA 4XFUA 4FPOB 4KEIA 4IYBA 4YGCA 2AAIB 3SH4A 4I1BA 4QD2B 3T1MA 2R16A 3IPVB 5JOYA 2HZ9A 3ZYRA 2L5XA 1DYKA 1WBLA 4LO2C 1AX1A 3QW7A 3ZURA 2DRZA 2DREA 2OUJA 4JRAA 2E7TA 3M1HA 5GLVA 4Q27A 2YV8A 1AVWB 3AZWA 3POKA 3B00A 3FLTA 1AVBA 3V0BA 4Y1ZA 3AYCA 1OQLB 3VT2A 4GOVA 1NUNA 3H6RA 2D6KA 4JC1A 3AH4A 3FJKA 3JRRA 1Q8VA 3CU1B 5DZEA 2ZZJA 3JUTA 5FNWA 1XG6A 4XMIA 3FJHA 3V0BB 2Y9FA 4J1LA 4J2XA 3C8AA 1HCEA 4FGFA 5BQUC 3RS6A 3H6RB 1BLDA 2WRYA 1WW4A 41BIA 2NMNA 4Q2FA 1Q56A 4FPLA 3HR9A 2ZGQA 2ZA9A 1K5UA 3CAHA 1G86A 2GMPA 3D7WB 3SITA 4PC4A 2P39A 4I4VA 3LCPA 2LIEA 2AFGA 1FV3A 1JYIA 2ETFA 2IMAA 1Q04A 3IKWA 4Y1VA 4AN6A 1DHKB 4AYUA 2WT2A 1XTFA 3CA0A 5D61A 3KMVA 1LEMA 5DUWA 1GANA 4JAWA 3MPPG 2NN8A 2I1BA 1V6WA 1ULEA 3N7JA 4JPZA 1K5VA 2DTYA 1FNYA 2VU9A 3ILNA 2ZMKA 2ILPA 3CRHA 4I2SA 4DENA 1UMZA 4QALA 1ENRA 1YRZA 2E7QA 1AZDA 1FMZA 4Y1XA 1QNWA 2RSTA 3FJEA 3RQ0A 3DDAA 2GNMA 1AF9A 4I4PA 3DDBA 1V6LA 2WLQA 2KKIA 1VIWB 4BQ1A 4XXPA 2VLCA 1Z4SA 3SNVA 1T3AA 2IMCA 3UK9A 2NM1A 3BTAA 1C1FA 4USOA 3CA1A 4DRRA 1AXZA 4JKXB 3ZSLA 4OEGA 1LULA 2D6PA 3AJZA 4YW2A 4YZ3A 1F9KA 2P3IA 1DQ4A 4LO3A 1MS0A 1N4KA 1ISWA 3H6QA 2ISEA 3WG2A 3IIRA 3NV3A 2AH2A 4GWMA 3GALA 2Q5TA 3ZXKA 1YXWA 4DFSA 2DVFA 5FZZA 2D6LX 5F8YA 1TOOA 1WD3A 4KEJA 4PBPA 4YZ5A 1SACA 2VH9A 2YUGA 2EF6A 5CB7A 1RITA 3QIYA 1AVAC 1LOCA 1KJRA 4LO3C 1LHUA 5F8SA 1Y7BA 1SCRA 1W6MA 1V6UA 2EAKA 3LTQA 3N7LA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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