1S0EA

Crystal structure of botulinum neurotoxin type b at ph 6.0
Total Genus 407
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
407
sequence length
1290
structure length
1287
Chain Sequence
PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Role of metals in the biological activity of Clostridium botulinum neurotoxins
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
molecule tags Toxin, hydrolase
total genus 407
structure length 1287
sequence length 1290
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2003-12-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 1s0eA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1s0eA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1s0eA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 1s0eA01
3CRHA 4JP0A 3MEPA 5BQUC 5T50A 2AAIB 1Z2VA 2JDZA 2VSEA 3M3QA 3BAGA 1WBLA 1UZYA 4XZPA 4KBBA 1S0FA 3QW7A 2R49A 3PVEA 3FJ9A 1AVAC 2HWAA 3VSZA 4IONA 3PVOA 2MIBA 2W39A 3ASIA 1BASA 1HCEA 3H6QA 4FVVA 3A21A 2W68A 1ZL6A 1QNYA 4Q8KA 3C88A 3E8LC 2IMBA 3WLUA 1G9FA 1LOCA 5DZEA 3OYWA 2D7RA 3CRIA 3QW6A 4LBOA 2D24A 4OEEA 2ARBA 2DURA 3UDAA 1QF3A 1JN2P 2D3SA 3Q7WA 1IILA 4ZJXA 1ZN3A 4HEVA 4Q1PA 1N47A 1AXYA 3ENRA 4OWLA 1TTUA 1Q04A 2FPQA 1UX6A 3O44A 2D43A 5GAQA 1W6PB 1SBFA 4D0ZA 2B7YA 1QGLA 2ZABA 3O5WB 4EB2B 2QN4A 1HLCA 1ZL5A 2WKKA 2EAKA 2ZHMA 1WW5A 1AX1A 3AP7A 2ZGLA 2DVFA 1ONAA 4CTEA 7I1BA 4XXAA 4ZBVB 2DVAA 2CY6A 2A6XA 5F9TA 1N1TA 5L73A 2BFHA 2UUSA 5KXDA 2AR6A 4J2KA 2RSTA 1JT3A 2R16A 1YRZA 1JW6A 4FOVA 2JECA 3FJHA 4Y26A 4GOYA 1W6OA 2P3KA 3WMUA 3V0BB 1WD4A 3M3OA 2PHRA 3ILFA 4M3CE 1W6NA 3IPVB 1ULFA 4ZFUB 4XYXA 3A0KA 1IOAA 2YXSA 1XQNA 5F90A 1GZCA 3WINA 4I3NA 3RTIB 3JUTA 4XILA 4UW5A 1FMZA 1IOBA 4I7IA 1S0LA 1ABRB 4XDQA 4YGCA 4BMEA 3CA0A 1V6NA 5E24E 5DG1A 3IIRA 1TEIA 5BQNA 2GDFA 1RITA 4XBNA 3VKLA 3INAA 4TLPA 3AP6A 2AH2A 3OPZA 1LOGA 1W3AA 2RG9B 4XJAA 5F5QA 2A71A 4FPGA 1DJSB 3HR9A 3GALA 1VAVA 1N3OA 3NBCA 3O0XA 31BIA 1XTFA 3V65A 1DZDA 2X2SA 1ISWA 1WBCA 2CYFA 1KJLA 4LO0C 5FREA 3ZSKA 3FFZA 3WDUA 2GALA 2EF6A 4YW5A 1G9CA 4YZ5A 2ZGSA 1ILR1 1SLLA 4DRRA 3BOOA 2W08A 5DUYA 1UKGA 1SLIA 5HCBA 4Q26A 5T5OA 1FWUA 5EC5A 1N4KA 3DGTA 1BLAA 4YW2A 2UWAA 3UL2A 4XJ9A 1HWOB 1HWNB 1LHWA 3AYAA 5GLZA 1WD3A 2AUYA 4L4HA 2PHUA 3HN1A 3AJZA 2ZZJA 4YW3A 1ZKXA 1LGNA 3Q7XA 5GALA 1JQZA 3T2TA 3WVJA 8I1BA 5FRAA 4FP2A 3IM6A 2KLLA 1LOEA 2A8AA 5KXCA 5CAZA 4BOWA 4I37A 5JOXA 1GSLA 4XFSA 2FMDA 4Y1ZA 4LBMA 4D8HA 4HR6C 1ONKB 4ASMB 1QMJA 3C2UA 1PUUB 1IRPA 4J2XA 4DRVA 4FPLA 1Z4SA 4I4XA 3B3QE 4UW6A 4I1BA 4LO1C 2HZ9A 1LOFC 4KC3A 2ZR1B 1SLCA 5BP5C 1JTCA 1JYIA 2ILPA 1DYPA 2Y9GA 1N3QA 4TYSA 4DQAA 3VT2A 4AN7B 2KKIA 3MW2A 3WUDA 4KUFA 4I4RA 1FN0A 4MYEA 2Q3NB 3WG1A 4YLZA 1SR4C 2P39A 1VLNA 1DIWA 5DG2A 3USUA 4F83A 2L5XA 1RMLA 4I4PA 5G00A 3OYWB 2QYIB 1H30A 2FGFA 4M3CF 2DU0A 2VU9A 1XHBA 2A75A 2DV9A 2DTYA 1PZ7A 1LU2A 3BIWE 2F2FA 3AYCA 4KEIA 1T3AA 4XTPA 3BA4A 1X50A 5DUVA 5EYXA 5GLWA 4YM3A 2DRZA 1WBFA 3W59A 5IK8A 3O49A 2AYHA 4LO3C 4Q8LA 4OZXA 2DU1A 4I4QA 1A8DA 5BXRA 4KS6A 2AENA 1N3PA 2LIQA 3AKHA 4LO2A 1K5VA 1IHKA 3AKIA 3I2AA 4IZEA 1MS5A 3A07A 4XMIA 4CJMA 3FBYA 3NBEA 4Y1UA 2YROA 3OBTA 2SBAA 4DFSA 4NOTA 4YM2A 4AGGA 4G9MA 4WZFA 3H6RB 1MS9A 2ESUA 4BM8A 1V6IA 1RZOB 3JRRA 2E53A 2WJSA 1WW4A 5D63A 3AP9A 5FNXA 1MVEA 4I4UA 1K5UA 1WBAA 2GZBA 2R9KB 3FJJA 1IKPA 1G7YA 2Y9WC 1AXKA 1O4ZA 1WUVA 5JOWA 3FJDA 1BKZA 1W6OB 4K1ZA 3C8AA 2CTVA 5DUXA 2NZ9A 1W6NB 5EWSA 3DEBA 4ISQA 2DRYA 1MS8A 5CBLA 2ZGPA 2AQZA 2ISGA 1HCDA 1CVNA 3BOKA 3ILRA 4Y1XA 1CN1A 3FLPA 4IHZA 3BA5A 1RG8A 5H9PA 3WV6A 4I2SA 1V6LA 4QD2B 1UL9A 2P23A 3AZXA 2V5YA 3CNAA 3ILNA 4X3AA 4ATFA 2A6YA 1ZM1A 3V64A 1FWVA 4XIOA 3WHUA 1DQOA 2NM1A 4QO3A 4ITCA 4EFQA 1AXMA 4ZKTB 3IM7A 1OQ1A 4GA9A 3PVNA 2AFGA 1LOBA 4PQ9A 4UW3A 1JYCA 2XB6C 2FDBM 3O4DA 2KM2A 4XMAA 4K1YA 4AGRA 4P0JA 4I1EA 1E1HA 4FQ4A 5F8WA 4R9AA 3S8JA 3WINC 1YI7A 3WO2A 3WG3A 5E8AA 1QQLA 2NTDA 4FPYA 4XJUA 2DS0A 4QD2C 1SZ6B 1II4A 2ETFA 2R0HA 1CONA 3UD9A 3NV4A 3OY8A 3A0NA 4Y22A 1DQ0A 1Q8SA 1Q8OA 2P34A 3NV3A 1HKDA 1EVTA 3CA6A 2ZGOA 3MALA 2DUQA 4X38A 2A6ZA 1JHNA 2ES3A 1BXHA 4A7KA 3HMYA 3BAQA 1PZ9A 2R0FA 4OWJA 2JD4A 4H55A 4J23B 1BFGA 2D6NA 3VT1A 1AF9A 2WSVA 5F8SA 3DUIA 2EXIA 4GXLA 1ULDA 3I4IA 4JKQA 1TOOA 1W0OA 3IMNA 2ZHLA 4EKXB 1F9KA 4Q1RA 4KTXA 3HSMA 1LHNA 5GLVA 1G86A 3TC2A 2ZMNA 3P6IA 1Q8QA 3CA4A 3ZC8A 1YO8A 3TAYA 3SNVA 4M00A 2DVDA 2C5DA 3D5OA 1QNWA 1PWAA 4EEEB 4I4YA 4YM1A 3UJ4A 1KRIA 4I0YA 2KI6B 5EXOA 5AVAA 3O4AA 3GNEA 2KI4A 3POSA 3O0WA 4P0KA 5T5LA 1CE7B 5DVHA 3C8BA 2Y9XE 4C1WA 2ISHA 2ZQOA 3AK0A 1AX0A 1SLBA 3BA7A 4FOQA 3VT0A 3LLPA 2ZKNA 4IQPA 4DEPA 3AKGA 1IS3A 1F82A 2LIEA 3FJFA 4AYUA 1QKQA 4IY9A 2ISEA 1VCLA 5GZEA 5BXSA 2OUJA 1G9DA 3W58A 2FFUA 1I1EA 2TEPA 1DBNA 3V79C 3JUUA 3I8TA 1Q56A 1YVGA 3RS6A 1P63A 3WDVA 5JOYA 4OUJA 1UPSA 1MS1A 1A3KA 4QBVA 1C1LA 3QW8A 2E6VA 3USUB 2D6KA 4JQ0A 1Z0HA 5CA6A 1TIEA 4P9YA 2A7AA 2GN3A 4M01A 3VKFC 2A3XA 2G7NA 1ZA4A 2D6MA 4OEFA 5T54A 4XIKA 1S0BA 3BAOA 2P37A 4ATEA 3MW4A 2EALA 3RSJA 1IS5A 1AFCA 2EIGA 1R1ZA 3BRDA 2DVGA 4FPKA 4YW1A 3AH1A 4ZXKA 3F62B 4G9NA 1URXA 3A23A 1JT5A 1I1BA 2CL2A 5BQUA 1ULCA 1SACA 3P6JA 3AJYA 4HJJA 3RRDA 4WVVA 1MVQA 1GZWA 2G7KA 3IM0A 3AXDA 3PG0A 5JOZA 1DQ4A 5JVVA 1JLYA 1Y7BA 3WG2A 4USOA 3RTJB 1GNZA 3BRGC 4Q9GA 2F2FC 2DUPA 3UD7A 3MPPG 3POYA 2VUAA 2Z42A 2F8XC 1T3CA 4QALA 2D6LX 1LGBA 1C4RA 3N7MA 1IJTA 3QIXA 1FV2A 4AVSA 4GOVA 1LULA 3SLIA 1AVXB 4WV8A 5JDBA 4EJ5A 1HKNA 4Y1VA 1B09A 4I96A 2ZGUA 4Q91A 1IS4A 3SH3A 2D1ZA 1BLDA 2VXRA 4LO2C 21BIA 2A6WA 1UZZA 1LECA 2P3IA 4XHXA 3ZYRA 3CAHA 2DYCA 3APBA 2A6VA 1O4YA 1ZKWA 2JKBA 2WLQA 1KNMA 4I4OA 3O3QA 2VSAA 1ISXA 2Z48A 1DQ5A 1HQLA 5GZDA 1QDOA 4NO4A 5JLVA 5KXEA 4XE9A 1ULGA 4FPCA 4YZ3A 3FJBA 5E89A 3O4BA 3VUOA 4Q27A 4Y1YA 2JE7A 3JU9A 9ILBA 5T52A 3QCWA 41BIA 1Q1UA 1I3HA 3ZPYA 4FQZA 4QC4A 3WDYA 3DDBA 3NF3A 4SLIA 4AVVA 3A22A 2K8RA 2GNMA 4JKXB 1ISVA 4AGVA 1V6JA 4EFRA 2KH2A 1AXZA 3UK9A 4XJ8A 4Y20A 2CNAA 1PC8B 3FUOA 4OEGA 2W2DA 2M49A 1W0PA 2WT0A 4DENA 5CB7A 2VH9A 1FATA 1S0CA 3B69A 2I2SA 3OY8B 1W6MA 4Y22B 1S0GA 1NUNA 2RHPA 4J2SA 4X39A 1QXMA 2PHXA 2YZ4A 2G7QA 1YTOA 1D2SA 1UAIA 2NN8A 3FIIA 2ZMLA 4ELCA 5HPZA 3IN9A 4Q2FA 1SCRA 4WBCA 1KDKA 2XHLA 4U2AA 3F1RA 1FGAA 4J2YA 2Y9FA 2D3RA 4XTMA 3LSEA 2WT2A 4K21A 1QDCA 3IAGC 3DDAA 2I1BA 1V6KA 2W52A 4LBQD 2VW1A 3CA5A 1ULEA 5H9QA 4GKXA 4GKYA 2VXTI 3QJ0A 5DZUA 2GNBA 2JE9A 3ZXEA 3LTQA 1CESA 4P0LA 1MS0A 4G1RA 3FJKA 2GO2A 1NXD1 3ZSJA 1SLTA 4XBLA 2ZA9A 3IPVA 1LHUA 3AZVA 3PJQA 2IWTB 3VSFA 3OBRA 3ZSLA 1A78A 1BFFA 3AZWA 3WZ1A 3V0AA 3P53A 2E7QA 3T1LA 3I2XA 2E4MA 1XZZA 1W3GA 1Z78A 3ZX7A 4I8MA 5IK5A 1QOOA 1CPNA 1AJKA 1FYUA 3S8KA 2GN7A 1DHKB 1SCSA 2D6OX 3AJ5A 4H04A 3KM5A 3N35A 4ISRA 3BWIA 2QN0A 1BFBA 2ZHKA 3QIYA 3POKA 1V6WA 1KDMA 3NV2A 5GZCA 2FHRA 1KJRA 4Z8SB 4L8QA 1YXWA 2PELA 3WHTA 1CPMA 2A3WA 2G4IA 5DUWA 4R9CA 4XFUA 1V6OA 3WOGA 4YOLA 1TFMB 3BAUA 5LK5A 3AJ6A 3C89A 3N7LA 1N1VA 5T5JA 1DQ1A 4YW4A 5EHAA 1OKQA 1GBGA 5D61A 4ENDA 1G9BA 2WNEA 2ERMA 4M3CA 3EF2A 5KXBA 2BEAA 1LEMA 4FPEA 4P9XA 3W9TA 4W65A 4R6UB 4KEJA 2X2TA 2YUGA 3FJAA 1UN1A 1IRAX 4PBOA 2UU8A 5DSSB 3N7KA 4EFPA 1DZQA 1EPWA 3M3EA 2WQZC 3ZUQA 1G9AA 3VEQA 3BODA 3BAVA 2XG3A 5T5PA 3AYDA 3TB0A 1RY7A 1RINA 4LO8B 1C57A 4LO7B 1APNA 1FV3A 4X37A 3ILAA 4HA2A 4JC1A 3WNXA 1AJOA 1GZWB 5BP5A 5HCFA 2E7TA 4BMBA 4I30A 4YGDA 3FJCA 3IM5A 1YF8B 2CWMA 1LEDA 3QIZA 2YMZA 2JJ6A 5FNWA 2NYYA 1DGLA 3BX1C 4ZGRB 2AXMA 2DVBA 2IMCA 4YZ4A 3CU1B 3FIEA 4YG3A 3CQAA 3SITA 1AVUA 3B9UA 4XJWA 1FNYA 1PUMB 1V6VA 2OW4A 4P14A 1DQGA 1RIRA 1GGPB 2P2KA 1LOAA 4LO7C 5IUQA 1IT0A 1HDKA 1YYNA 3BTAA 4F34A 3WDWA 1FAYA 4CZSA 5FZYA 4IYBA 4D0TA 3R4UA 1TWEA 2ZBJA 4AVTA 1ENRA 3NV1A 3O4OA 2IMAA 3D7WB 1ISZA 3AX4A 2GNDA 2ZGKA 4YFWA 1T4QA 4GALA 4BLJA 2G7PA 1AVWB 4DS0A 1MC9A 4LO3A 4QKSA 4FGFA 1NLSA 1V6MA 4Q9PA 3SNMA 1AZDA 4XHBA 1BJQA 3ZXFA 3MW3A 1QOSA 2EXJA 2ZGTA 4USPA 1JT4A 4IY8A 3RG0A 1ENSA 4GP0A 2ZAAA 2D20A 5D62A 4GAFA 4Y20B 3K1XA 2VLCA 1JOJA 3H6SE 5EG6C 3OGFA 2W2DB 1Q03A 1CJPA 2IHOA 2D3PA 2PHTA 3IKWA 2D44A 3WG4A 4KEKA 2A70A 5EYYA 1GLHA 4LBQA 2DTWA 3ZC9A 3UJQA 1W6MB 3ATGA 2ZGNA 1BARA 4PBPA 5HCAA 3RMYA 3N0KA 5BOWA 4DPNA 1BA7A 3N7JA 1GANA 3DSEA 4BQ1A 1WLDA 2ET2A 2ENRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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