1S0EA

Crystal structure of botulinum neurotoxin type b at ph 6.0
Total Genus 407
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
407
sequence length
1290
structure length
1287
Chain Sequence
PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin, hydrolase
publication title Role of metals in the biological activity of Clostridium botulinum neurotoxins
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
total genus 407
structure length 1287
sequence length 1290
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2003-12-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 1s0eA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1s0eA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1s0eA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 1s0eA01
1IOBA 2E7QA 3PVNA 1AVUA 2JE7A 1RITA 3TC2A 4MYEA 4OWJA 3VSFA 2LTNA 1LTEA 4FP2A 2DREA 5FZYA 3IKWA 1L2HA 1WW5A 2D6KA 1QNWA 3CU1B 3BIWE 2ZZJA 1BXHA 1J1TA 2AQZA 3VKNA 1SBEA 4X38A 3VKMA 3WG1A 1JT3A 3LTQA 2BEBA 2IMAA 1WLCA 1V6XA 1VALA 2GMEA 2GALA 1W6MB 4I96A 2DVFA 5T50A 3AP9A 4GALA 4LBLA 2DVAA 1QGLA 1C4RA 1RMLA 2EIGA 3ZYRA 2IMBA 2AXMA 4ISQA 4GAIA 2GNBA 1VAMA 1GGPB 1D0HA 1K5VA 3CNAA 1LULA 5GZEA 1LGBA 1QXMA 2LIEA 5IK4A 3D5OA 2D3RA 4R9AA 3VT2A 2DU0A 4LBKA 1ULDA 3BA7A 3WDTA 4XXPA 1FQ9A 3RTIB 3HSMA 3CAHA 1YIFA 4FQZA 4Q8LA 2HWAA 3PHZA 4I0YA 1S0CA 4NO4A 2ISHA 1HWMB 5T5OA 3ILRA 4QBCA 1G9BA 4I4OA 4I37A 1WBCA 1Z7HA 3WV6A 2KI6B 4Y1VA 5T54A 4ZFWB 1LJ7A 3V0AB 4G1RA 4XIKA 3FUOA 3MALA 1G8WA 1WBLA 3WVJA 2CL2A 1DQ5A 1W0OA 4L4IA 2WJSA 5SV8A 3UJOA 3BRFA 1IT0A 2DUQA 3AP4A 1W6OA 4LO8B 5F8YA 1ISYA 3OGGA 3WDXA 3U4XA 1GICA 5JDBA 2WLQA 3QW7A 2GDFA 2FPQA 1ULEA 2PHRA 1JY0A 1AVBA 2WKKA 1KDMA 3IPVA 1OKQA 4YG0A 7I1BA 3O12A 4Q9PA 4Q1PA 4YW3A 4YM1A 4C1XA 2ZQOA 5JOXA 4ZJXA 1V6KA 4EFPA 2C9AA 2CYFA 1HKDA 3O5SA 5CA6A 3N36A 1BFCA 3NBEA 4DCKC 4M3CE 1LOAA 4BMBA 1P63A 1V6UA 3ZURA 3C89A 3BOOA 3K1XA 4P6AA 1DQ2A 4XMAA 4XKIA 1CJPA 3H6SE 3C2UA 1W6QA 1Q8PA 2ET2A 5CAZA 2IMCA 3ZYPA 1GZWB 2Y9GA 3D7WB 4AVTA 2Z49A 1OQLB 1R8NA 1H9PA 4HA2A 4FOVA 3SLIA 1NZKA 3TB0A 1HQWA 4GAFA 1SLCA 1BFFA 1DZCA 1LESA 3RRDA 4YW4A 2GN3A 3WLUA 2XHLA 3WMUA 1QU0A 3FBYA 4TLPA 2ZACA 3PG0A 1CVSA 2F8XC 4Y1UA 3M2MA 5CB7A 2W68A 4YZ5A 3VT0A 2IWTB 4P9YA 4Z9WB 2GNMA 3V0BA 3NBDA 1XTFA 1SBDA 1KJRA 5DZFA 1F5FA 5GZGA 4G9MA 4I4SA 4XFUA 2E4MA 4QO3A 1VLNA 1D2SA 4LBJA 1AVXB 1FAYA 2M49A 1SACA 3ZUQA 2ZGLA 3C88A 2UWBA 2SBAA 2DVBA 2OW4A 1IRAX 5BQNA 1WW6A 1ISXA 4LO3C 2I2SA 5GLWA 5EXOA 1S0LA 4IY9A 1O4ZA 2E6VA 2CNAA 4FPCA 2KKIA 3WDYA 4DRVA 2ZGOA 2PELA 5GLZA 1DIWA 1TP0A 2LIQA 3B9UA 5EHAA 2X2SA 1M2TB 5GJ6A 1Q1UA 2TEPA 4UW4A 5KXDA 3SISA 4AVSA 3KM5A 3B3QE 4AN7B 4A7YA 4XIOA 4Q27A 5FREA 4BLIA 1E1HA 2ZHKA 4UW3A 4CZSA 2XOAA 2ZGNA 3AKHA 1IS6A 1SLIA 3AYDA 4Y1YA 4OWKA 3NV2A 4YGEA 1BFGA 1DBNA 1NLSA 3O0WA 3A07A 4D0ZA 2NN8A 1R1ZA 3OPZA 1IKPA 2DURA 3QW8A 3BX1C 4LBQA 3USUA 1N3QA 1WUVA 1EPWA 3WG3A 4CRQA 5JOWA 3POKA 4Y1ZA 3BAOA 3NBCA 1YVGA 2ZGRA 4W65A 1N4KA 1JHNA 1JLXA 1MS4A 1HCDA 4XBLA 2VUAA 3A0NA 3BA5A 4QD2B 4DRRA 3ZPYA 4GOYA 2VW1A 2Q3NB 4YZ4A 2CY6A 1ABRB 2DRZA 2KH2A 5BVPI 1JT5A 1RZOB 5BXRA 1FMZA 2VSAA 2ZGSA 2PHFA 4I4PA 2AENA 1FATA 2BEAA 4G6JA 3OJ2A 1Y7BA 1PZZA 3AJ6A 2Y9WC 1N3OA 1BARA 3QIZA 1J0SA 3N7MA 2ZMNA 5E88A 2DWRA 5BXPA 1K5UA 4OEGA 3FJ8A 1ZN3A 4FPFA 2A6VA 3AKIA 2NMNA 2BQPA 1QDCA 1N1YA 5KXEA 2DTWA 3VKLA 2ZGMA 5GZDA 1Z78A 4D69A 1I1BA 3AH4A 3IAGC 2KI4A 3FIEA 3FLPA 4FPLA 1MS0A 3UDAA 4XZPA 1OQ1A 1F31A 2UWAA 3ZSLA 2D20A 3BAQA 4EEEB 4ATEA 1KJLA 4KUFA 3DEBA 1AFCA 4P0KA 1A3KA 3UK9A 2ZABA 21BIA 3W58A 3VKFC 3ZSJA 4YGDA 3ZXJA 2D6LX 4U36A 5B2HA 4KEKA 4PQ9A 2D6MA 2ESUA 4XFTA 1YTOA 2NP0A 3T2TA 1JT7A 2YXSA 3UJ4A 3M3CA 4KS6A 1AZDA 3CA6A 2A6XA 1F9KA 2DUOA 4Q1RA 2WT2A 2RSTA 3LLPA 1ZL6A 4G9NA 3AKGA 4XILA 4ITCA 1FYUA 3C8BA 1DHKB 1II4A 3ZXDA 3OJBA 4XBNA 31BIA 4ZFUB 3CRIA 4BM8A 3BADA 4H9WA 5HPZA 3JUTA 1Z4SA 5E89A 4YW5A 3FJ9A 4DFSA 2MLLB 2ES3A 1KDKA 1MR5A 2Y9XE 1CPNA 2P3IA 4M01A 1APNA 4RA0A 1JUIA 1W6OB 3QIXA 1DLLA 5T55A 3R4SA 2AR6A 3OYWA 2D6PA 1ZA4A 3IM7A 4K21A 3HN1A 4IONA 3A0KA 3IPVB 3ZSKA 3AZWA 4I7IA 2UUSA 4IHZA 1DQ6A 1MVEA 1V6IA 4D8HA 4R9DA 1GBGA 2DVGA 5BYNA 3UD9A 1S0JA 5DUVA 2A70A 4ZGRB 3D3XA 4G6MA 4LO3A 1YXWA 2JDZA 4FPOB 4XHXA 5IT6A 3VSZA 2BFHA 4A7KA 3CQAA 1JQZA 5BQMA 2PHXA 5CBLA 1DQ0A 2W2DB 1MZ5A 1ENQA 1WBFA 2OUHA 5GLUA 1PWAA 2YROA 1W6QB 4Y26A 5LK5A 2WSVA 3PVOA 3FJFA 1LHVA 4AWDA 2W39A 4ENDA 4YGCA 1W0PA 3F1RA 1TWMA 1G7YA 1FV2A 1JOJA 1EVTA 1W6PA 1PZ9A 3LSDA 5F90A 4WVVA 4BPZA 4K1YA 3D4KA 4TYSA 1MVQA 2AFGA 2XHLB 1G86A 1HWPB 1FGAA 3QIYA 2D1ZA 1CN1A 3MW2A 4XXAA 1LCLA 4Y24A 1IILA 1E0OA 4AGGA 3H6RA 4L8QA 2SLIA 3B00A 1ULFA 4D0TA 1QOTA 3OBTA 4HL0A 3V0BB 3AP5A 1H9WA 5GLVA 2CWMA 5AVAA 1JBCA 4YOLA 4YM2A 1QKQA 4GKXA 1IS4A 3DUIA 3QW6A 5DG2A 2OVUA 3H6QA 2ISGA 4P0LA 3SH4A 3WUDA 1LEMA 3GNEA 5H9SA 1YI7A 2X2TA 2AH2A 1QNYA 3CA1A 4X3AA 3ILNA 1JTCA 3WO3A 4LO2C 2DYCA 1LOFC 4GXLA 5GZCA 5JLVA 3M3OA 3O5WB 3AH1A 1WBAA 1S0FA 3I2XA 2VW2A 5T5PA 1BFBA 3CA4A 3NBNA 1ISZA 8I1BA 3N7JA 3BTAA 4P0JA 4LO7B 1JT4A 3FJKA 3WHUA 1ONAA 2ZMKA 4PBOA 2D6OX 3HBWA 2AAIB 4II0A 2D22A 4DEPA 4YM3A 3N3HA 2FGFA 1XG6A 5E24E 3O0XA 3HOMA 2D3SA 4H04A 4J1LA 1BASA 4JCKA 4J23B 2EAKA 2D3PA 3O4DA 3O49A 5I1BA 4LBQB 4J2XA 1Q8QA 4JP0A 2A3XA 1JYIA 4ZXKA 5T5JA 1QQLA 1BLAA 5FRAA 1ZB7A 1Z0HA 5DUYA 1BLDA 1PUMB 2WT0A 4GKYA 3NWKA 4LO1C 4OW4A 1TTUA 3BWIA 1JYCA 1MACA 3WDVA 3VWCA 1GYKA 4NOTA 2HWMA 1S0GA 4LBOA 3Q7XA 4R9BA 3BAVA 3NV3A 1DFCA 4QD2C 1XTGA 1M16A 2GN7A 4QKRA 2GMMA 2A75A 5DUXA 2YV8A 4YG3A 4YFWA 3AJZA 3BOPA 1UMZA 4DQAA 3ZX7A 2ETFA 4R6UB 3UJQA 3A22A 4USPA 1S1AA 4FPJA 1JLYA 1DZQA 1BYHA 1Q04A 3JRRA 2QYIB 1ISWA 2RG9B 1ENSA 3VV1A 3L2YA 1IS5A 2AUYA 4FPKA 2ARXA 2ZMLA 4ATFA 1N1SA 1UX6A 1VCLA 4BOWA 3ZVXA 5HCBA 3ILFA 1URXA 2D44A 3ZSMA 1YBIA 2DU1A 4BQ1A 2D23A 1QDOA 2ZGUA 3O3QA 2UWCA 2HZ9A 4M00A 3AJYA 3AZZA 2D6NA 4LBMA 3PUBA 3LSEA 4LO0C 1WW7A 3FJHA 3NV1A 5CNAA 3M3QA 3FJBA 1UAIA 1R8OA 3DDAA 3WOGA 3AYCA 1BQPA 2R0HA 1UN1A 2G7NA 2ZHNA 4Y22B 1NXD1 1ILR1 1MC9A 5JMCA 3OGFA 4L4HA 3M3EA 1VAVA 4I2SA 4ZFYB 1LENA 2FDBM 3EF2A 1MS8A 5DZUA 3BONA 1ZM1A 2G7PA 5D62A 1Q8VA 4FGFA 1GZCA 3UD8A 4U2AA 5FZUA 5H9QA 3JUUA 1YF8B 1Q56A 3RS6A 3B69A 3BODA 3GALA 5GALA 4IZEA 2P37A 2ZGPA 1WCSA 2FFUA 3SNMA 2ERMA 2DVDA 4YLZA 5EYXA 1Q8SA 2V5YA 1LHOA 1DFQA 1LOGA 4PCRA 3O4AA 4K1ZA 4YM0A 1ENRA 3AYAA 2ENRA 4I4QA 2VY0A 5H9PA 3K3QB 4X39A 4ZA3B 1FX5A 1DQ4A 4M3CF 2C5DA 5DG1A 3RMXA 1S0DA 4F83A 3RTJB 1LODA 3FJDA 1A8DA 2WBCA 1GV9A 2E51A 3C9ZA 2FO1A 1B09A 1FMMS 1W6NA 3OY8A 4QKSA 2FFVA 1SLLA 2NYYA 4GA9A 3NV4A 2G4IA 2NZ9A 4JC1A 4XJWA 1G82A 3A4UA 3VT1A 4XYXA 2NVHA 41BIA 3QLQA 2R0FA 3POYA 3OJVA 2DUPA 1MS9A 3AP6A 5JVVA 1W3FA 1MD6A 4JPZA 4Z8SB 1LOFA 2VLCA 4KC3A 4QBVA 3WCRA 2ZHMA 2XB6C 5BQMB 4ZKTB 3M1HA 2JECA 2ZR1B 3HMYA 2W08A 1PZ8A 2Q5TA 1AX0A 1SZ6B 2Z48A 2NTDA 3INAA 1V6WA 3OJMA 2DS0A 3SITA 2EF6A 3KMVA 4C1WA 1VIWB 1O4YA 2WQZC 3AJ5A 1W6PB 2GNDA 3AXDA 1AX2A 2NMOA 2Y9FA 4LBQD 1SFYA 3P6IA 3PMEA 3CRHA 1SLAA 1RIRA 3WUCA 2ZGTA 3I8TA 2WNEA 4I1BA 2ZGKA 4M3CA 1NUNA 1IHKA 5E8AA 5BOWA 4GP0A 4EB2B 1CESA 3H6RB 1FN0A 1MZ6A 3TAYA 9ILBA 3QCWA 1HWNB 4CJMA 1IKQA 3OBRA 3ZXEA 1KQRA 3WG4A 4LO1A 1UKGA 4Y1XA 1GNZA 3BRGC 4HEVA 3SH5A 4XTPA 3A21A 3DS9A 4YG6A 4Z8BA 3RG0A 3W59A 4YZ3A 2A8AA 4R9CA 5GZFA 3HALA 1HLCA 3O44A 4OWLA 4Q9GA 3NF3A 1ONKB 4X37A 4LBNA 3MW3A 4I4RA 1KNMA 4RL7A 1BKZA 2A3YA 3V64A 4QC4A 2K43A 3S8JA 2ZKNA 3FLTA 3FJEA 4OEEA 4XE9A 4FOYA 1MS3A 4YW1A 2A6YA 1C1FA 4LO7C 4XDQA 1FNYA 3BOKA 2AYHA 4QALA 2P34A 4Q2FA 4KTXA 2ZBJA 4F34A 2A6ZA 3WO2A 3I2AA 4FVVA 3WO4A 4AGRA 1U0AA 3N0KA 3WINC 3FUQA 2DRYA 1G9DA 3QJ0A 4Y20A 2D24A 1AXYA 3UD7A 3MW4A 3I4IA 5IK8A 5IK5A 1SBFA 3D6EA 4I8MA 3FFZA 3APBA 1G9CA 3RQ0A 2QN0A 4JKQA 1AXKA 1XQNA 4LO0A 2EXIA 2FMDA 4JRAA 5BQUC 1TOOA 4YZ2A 2ZAAA 4FPGA 2H0BA 1LHUA 1IRPA 2I1BA 1CIWA 1GKBA 2LALA 1RINA 2VW0A 3FJCA 1GNHA 4XMIA 4FPYA 3ZXLA 3B9CA 3WNXA 3Q7WA 3FJAA 4AYUA 5G00A 1CONA 1LU2A 1UZYA 5DZGA 1FWVA 4OZXA 1AJKA 1CQ9A 4IY8A 1DQOA 1JW6A 4Q8KA 1W3AA 4PBPA 1IS3A 2E7TA 2QN4A 1SLTA 1YO8A 1W3GA 3VKOA 4YZ1A 1SR4C 2JJ6A 5HCFA 4XFSA 2GO2A 1GANA 1RY7A 3WHTA 2EXKA 1SLBA 2ZHLA 3KQRA 2DV9A 4UW6A 4P9WA 2P3KA 3SH3A 1F82A 3IM5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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