1S0EA

Crystal structure of botulinum neurotoxin type b at ph 6.0
Total Genus 407
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
407
sequence length
1290
structure length
1287
Chain Sequence
PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Role of metals in the biological activity of Clostridium botulinum neurotoxins
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin, hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
total genus 407
structure length 1287
sequence length 1290
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2003-12-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 1s0eA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1s0eA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1s0eA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 1s0eA01
5KXEA 2H0BA 3NV1A 4PC4A 1QDOA 2C9AA 4EEEB 3AP6A 4Z8BA 1FX5A 4EFPA 3MEPA 4J23B 2A3YA 4FVVA 3AZXA 3ILFA 1V6MA 2JJ6A 3O5SA 1WBFA 2A75A 4LO3C 5GM0A 3WCRA 2Q5TA 1CPNA 3ZSKA 4U2AA 3UD8A 3H6RB 2G7KA 1MD6A 4CJMA 1O4ZA 5HCBA 4LBJA 2A8AA 4XFUA 5IK4A 1ENQA 1ULEA 2NTDA 2GNBA 1WUVA 1D0HA 5JDBA 4YGDA 3DUIA 2ARXA 2W68A 1VAMA 1YIFA 4M00A 3N36A 3CA4A 3IKWA 1I1EA 3HR9A 5BXSA 2FO1A 2D24A 1R8OA 1QOTA 2VUAA 4XXAA 1W3AA 3SNVA 4KEKA 1Y7BA 3I4IA 4F83A 3BWIA 2GN3A 2ET2A 3OJVA 3A0KA 1KJRA 3FJDA 3WO4A 1FMZA 4Y22B 3V0AB 1ZB7A 3POKA 2D7IA 1SLBA 4BM8A 1TWEA 5BQUC 2Y9GA 1IJTA 4I3NA 4XFTA 3QJ0A 1JLYA 1BA7A 2DUQA 1N1VA 4Q26A 1GKBA 2W08A 4XIKA 3H0OA 1ISYA 5EC5A 4KC3A 3AYEA 3ZYPA 4R9AA 3L2YA 1B09A 1G9DA 3RQ0A 3BOKA 2VSAA 4I4VA 3T1MA 4LO2A 4GAFA 1TTUA 4K1ZA 1AJKA 4J2YA 4QKRA 1LGBA 1MACA 2UWCA 4LBQD 2DTWA 5DSSB 5T5PA 4EFRA 4XMAA 2LALA 1OQ1A 2XOAA 3C2UA 2P23A 3FLRA 3NBDA 2DREA 1W3FA 1HQWA 1T9FA 4DENA 3M3QA 3H6RA 2ERFA 3OJMA 4AGVA 2CWSA 3K3QB 3AKIA 4FPLA 4K1YA 4JP0A 3RTJB 3I2XA 1FQ9A 4RA0A 1PUMB 3R4UA 1SLAA 1HWOB 1LOBA 1D2SA 2JKBA 4A7ZA 2VW2A 3A22A 1I3HA 2DURA 4FPGA 1LENA 3KQRA 1P63A 2EXJA 5G00A 4YOLA 4U36A 1QOOA 4QALA 2Y9FA 3LTQA 3D7WB 2OW4A 3PVEA 5T5LA 1TWMA 4YFZA 4Y22A 3V0AA 2W2DB 3IAGC 4G9MA 2GZBA 5IT6A 4X3AA 1AXMA 3ILNA 3PVOA 3A07A 3M3CA 4GWMA 3WDTA 3APBA 2OVUA 3VSZA 2EF6A 4HR6C 2PELA 1V00A 2XHLB 1MS3A 1Q8OA 2ETFA 3BA4A 1BFBA 5EWSA 4LBKA 5T52A 3SLIA 1UZYA 3FJCA 2SLIA 1XTFA 2FHRA 4GP3A 2P37A 2RSTA 3N3HA 2ZKNA 4FQZA 4JKXB 2UUSA 4LO2C 3AP9A 5BYNA 2TEPA 3WCSA 2AREA 1SBDA 1HKDA 3SH5A 1YRZA 2AGSA 3Q7XA 3M3OA 2KH2A 1JQZA 5BXPA 3E8LC 2G7QA 1HWPB 4OWKA 4ISRA 4P9YA 1IS4A 3H6SE 1DQ5A 4XZPA 3B00A 1SLTA 4A7YA 2DVFA 2YROA 4TZDA 1BJQA 2UWBA 3HALA 2IWTB 1DHKB 3U4XA 5JOYA 3NBEA 4QD2B 1JYCA 1URXA 4ATEA 3BRFA 2E4MC 2L5XA 4DPNA 2D3PA 3FJKA 2R16A 1AJOA 3WUDA 4YM2A 5EYXA 3B69A 3VT2A 2AR6A 1FMMS 4G6JA 4DRVA 1LCLA 1H9PA 4K20A 2D43A 1AX2A 4DQAA 1AVAC 2W2DA 1F5FA 1UX6A 1DYPA 1BXHA 5GZGA 4I0YA 2WT2A 1PZ9A 5BQNA 2W39A 2XHLA 2R1BA 1IS6A 2ZAAA 1FV2A 4OWJA 2AXMA 1K5VA 1CVNA 2D1ZA 4GA9A 3FGMA 3ZXGA 1S0LA 1UMZA 2WQZC 3FJHA 3C88A 2D44A 2XB6C 3AK0A 2RQ9A 1KDMA 1MS8A 3BX1C 4D8HA 2DVDA 2D3SA 3D5OA 3WOGA 1LHOA 4GP0A 2DRZA 1BLDA 5DZFA 1F9KA 1AVBA 2LIEA 1YI7A 5DUUA 3DDBA 3HN1A 2K8RA 2ZHKA 3BIWE 4JC1A 3VKMA 1G9CA 4Y20B 4YW3A 1RIRA 2FFUA 1V6KA 2AAIB 4HEVA 2ZA9A 2ZABA 5B2HA 2KM2A 1IILA 3OJBA 2BEBA 3OGGA 1WBLA 1C57A 3CNAA 4ZLBB 1S0GA 1APNA 2ZMNA 4DRRA 1ULGA 2IMAA 1SCRA 3BONA 2K4AB 4FOVA 1W6NB 2DYCA 3ZURA 2JD4A 4JAWA 4ELCA 4FPYA 4FQ4A 3C8BA 1F31A 4I1BA 4JRAA 2GNTA 2BEAA 4LBLA 1DFCA 4Z9WB 5HCFA 1KRIA 3OBTA 3MW4A 1SLLA 3BOPA 3NV4A 4LO1A 4USPA 2ENRA 3SH3A 4UW3A 1WBAA 1CE7B 3FJAA 1MR5A 4I7IA 4EFQA 1PUUB 3S8KA 3O0XA 3BAQA 4M01A 3ILRA 2ES3A 3POWA 2XG3A 4YW1A 1C1FA 4XXPA 3AJZA 4ENDA 2MLLB 4LO7B 5F9TA 3MW2A 3W58A 1BARA 3PUBA 4X38A 1LOFA 3O3QA 5JOXA 4FGFA 4KS6A 1QQLA 1ULFA 1NXD1 4Q27A 1SBFA 1Q8SA 2ZGNA 1BASA 2AQZA 2MIBA 2X2TA 3ZXLA 5JLVA 1LU2A 1LULA 4Y20A 1IRPA 1G9AA 2ZACA 3ZVXA 1PZ7A 3NBNA 3A21A 3ZSLA 2A70A 1DZQA 1IOBA 3QIYA 3UK9A 4X37A 4FP2A 1R1ZA 4AVVA 4IZEA 1YTOA 3QW7A 3AX4A 4QD2C 3IIRA 1LU1A 3P6IA 3BAGA 2HWAA 2Y9WC 4IHZA 2NP0A 3WZ1A 4Y24A 2I2SA 1W6NA 2UURA 1ITBA 2PHTA 3PJQA 2K43A 3FLTA 2IMBA 1Z78A 5GLZA 2G4IA 2AH2A 3P53A 3TC2A 4AVTA 1DQGA 5CBLA 4BOWA 3AH4A 2Y9XE 1JT7A 3O4BA 3V79C 4I30A 4Q91A 2DVBA 1WCSA 2R49A 1LEDA 4FPHA 1UKGA 3AYDA 4JKQA 5KXCA 1ZL6A 2DUPA 4M3CF 3JUTA 3W59A 4R6UB 1WD3A 2KI4A 1W6OB 2Z49A 4Y1YA 4ASMB 1KDKA 1ZM1A 4XJ8A 1IS3A 2NVHA 4FOWA 4NO4A 1UN1A 1NLSA 5F8SA 3WVJA 1AVXB 4IYBA 2YXSA 3B3QE 1ZA4A 2NN8A 3SISA 2ZGTA 5GZEA 1LOFC 1CJPA 4XOGA 1YBIA 4XE9A 2ILPA 3BAOA 4I4YA 3O44A 4UW4A 3HOMA 5IK8A 2ZGMA 1V6IA 3M2MA 1FATA 1DGLA 4CRQA 2IHOA 4TYSA 3B01A 1SCSA 4OW4A 3VT1A 1DQ6A 5IK5A 3AZYA 4XDQA 3WG3A 2D6OX 5BVPI 1HKNA 2ZGSA 4Y1XA 1HCDA 4ZGRB 1QOSA 5EG6C 5FZYA 2ZQNA 3WINA 1V6XA 5CA6A 5T5JA 5BXTA 9ILBA 4IY8A 2DWRA 4YG6A 4I37A 3M1HA 2F8XC 1JHNA 3QW5A 3VKNA 3ZXEA 3ZC8A 1XQNA 1I1BA 2M49A 5BOWA 3IPVB 1XZZA 4USOA 3PVNA 4QKSA 1WBCA 1CPMA 4YZ4A 1V6WA 2YV8A 3IM6A 5BQMB 3RMXA 5H9SA 3KM5A 2VXTI 1FNZA 3OJ2A 4A7KA 4PBOA 3NWKA 1W6OA 2YMZA 3PG0A 1ULCA 2ZHMA 4Y1VA 2GMEA 3O0WA 3B9UA 3ILAA 1JYIA 2DVGA 3GNEA 3WHTA 4P0LA 3ASIA 4LO7C 1LGNA 2FDBM 3FJ8A 4YGCA 1Q56A 4FPKA 41BIA 2E51A 4GKYA 2KI6B 4YLZA 4BLJA 5DG1A 2CY6A 5FZUA 2CWMA 2HYKA 4ZKTB 2P2KA 3FUOA 3CRHA 2HZ9A 2WSVA 3FIIA 2KKIA 2OUJA 2A97A 4UW5A 4QO3A 3RMYA 2GN7A 1BLAA 2AENA 3SNMA 4P6AA 2UU8A 1U0AA 2CL2A 1DQ2A 2AUYA 3SITA 4II0A 4AGRA 3UL2A 3DDAA 2NMOA 3WINC 3C8AA 3FJJA 4UW6A 1JBCA 3O4AA 3QLQA 2AFGA 2R9KB 4ZFYB 4OZXA 3QYDA 1C1LA 2GDFA 5DVHA 5HCAA 3IPVA 1JT4A 4M3CE 2CNAA 1GZCA 2WNEA 1ENRA 1V6OA 5T5OA 1AVWB 4BLIA 1G8WA 3ZPYA 5BQMA 1VAVA 4PQ9A 2D6LX 1G7YA 2ZHNA 2MC2A 2RG9B 2Z42A 4YGBA 3BAVA 3C9ZA 4R9CA 1WLCA 1MS9A 3RTIB 3A4UA 4YM3A 2JE7A 3N35A 1GNZA 4ZFWB 4EKXB 1AFCA 1QQKA 3VT0A 1ENSA 4OEGA 2ZGOA 4XJ9A 2ZBJA 3KMVA 3PMEA 5GLTA 3ZXKA 1LODA 1JTCA 2P34A 3WNXA 2ZGPA 4ISQA 4GALA 5BXRA 3AJYA 3MPPG 1IKPA 3AJ6A 1LHVA 5FNWA 5FRAA 1KJLA 4KBBA 2EXIA 3RSJA 4FPCA 3BB2A 1MS5A 2ZHLA 3AZZA 4GWNA 4XKIA 3OGFA 3QW8A 2IMCA 4I96A 4Q9GA 1ISXA 5IK7A 3A23A 1ZN3A 1AZDA 2A6ZA 1GICA 4OUJA 1IHKA 1QF3A 1K5UA 1G9BA 5KXBA 4XHBA 1V6JA 4L4IA 1H30A 1SLCA 1FWUA 3RG0A 1AVUA 1M16A 3UJ4A 1S0EA 4Q8LA 3VSFA 3IM5A 4FP3A 1TP0A 1HDKA 4Q1RA 2YY1A 1QXMA 3ZYRA 3POSA 1CVSA 1YO8A 3ZXFA 2F2FA 1BFFA 3FFZA 1WW5A 3B9CA 1FNYA 3AXEA 3N7JA 3AKGA 4XJWA 1BFCA 2NZ9A 3ENRA 1HQLA 4RL7A 1IKQA 4J1LA 5CAZA 3FUQA 4AN6A 1CR7A 3AH1A 5L73A 1YF8B 4GOYA 1N3PA 5JMCA 3VWCA 1DZDA 1UL9A 2JE9A 2DRYA 1DZCA 2BQPA 4EB2B 2VLCA 3ZUSA 1RZOB 1G9FA 3BAHA 4JPZA 1J0SA 4KEJA 2VW0A 1AXKA 1W0PA 1II4A 2FGFA 3FJIA 2Z48A 5F8WA 1V6UA 5DUWA 3HBWA 1W6MB 1IT0A 4ZFUB 3WHUA 1F82A 4R9DA 1PC8B 4G9NA 4KUFA 3VKLA 2VSEA 2GALA 3QCWA 3JRRA 2E7TA 3TB0A 3WDYA 1Q04A 3CAHA 4PF5A 2P3JA 4P14A 2I1BA 1AX1A 4FPFA 1CONA 3F1RA 1S0FA 1Z2VA 1RITA 3TAYA 5GLVA 2ISEA 3I29B 3POYA 2VH9A 2EXHA 4I4UA 1Q1UA 3QIZA 4Q1PA 1JT3A 4Z8SB 5F5QA 3IM0A 3ZSMA 3WO3A 1JN2P 4GKXA 4IZXA 2F2FC 1DBNA 1TIEA 4K21A 1G82A 3AFKA 3OBRA 1VCLA 4YZ1A 3BAUA 3UJQA 4YG3A 1DYKA 3CQAA 4ZBVB 3JUUA 3BA5A 4YZ2A 5GLUA 2ZZJA 4I1EA 3T1LA 1UZZA 3NBCA 1V6VA 4LBMA 2ZGQA 4I4OA 3D6EA 3P6JA 3GALA 3V65A 5T55A 4LBOA 5FNXA 1SR4A 3VV1A 2DS0A 1H9WA 1DQ1A 1N1TA 1GZWB 5DZGA 2PHWA 5GZDA 1E0OA 3C89A 4Y26A 4YG0A 2QN4A 1T4QA 1DIWA 3H6QA 1QMJA 2CTVA 4XJAA 5GLWA 1GNHA 5D61A 1PWAA 3O4DA 2E6VA 3VKOA 1Q8QA 4OEEA 1FWVA 1W6MA 3CA6A 4H04A 2DV9A 3WG4A 4YZ5A 3EF2A 2R0FA 3I2AA 1A78A 31BIA 3WDWA 1WW6A 5FREA 4I2SA 4WVVA 4LO8B 4ZXKA 4EJ5A 2A71A 4F34A 2A5ZA 2ERMA 3WO2A 3N7MA 3V64A 1OFSA 1DQ4A 4D0ZA 5GJ6A 2PHFA 1LJ7A 1S1AA 4LO1C 1BFGA 4GAIA 4I4XA 2R0HA 4IY9A 3LLPA 2PHUA 4L8QA 2A6WA 2YUGA 2X2SA 1MC9A 4X39A 3D4KA 4M3CB 2WSUA 4WV8A 2D20A 4DFSA 3AH2A 2A3XA 3ZX7A 2VU9A 4SLIA 4JQ0A 1GGPB 1XG6A 4CTEA 1LHUA 1A3KA 2CYFA 2NM1A 4I4PA 1XTGA 1ILR1 1GZWA 1SR4C 2DVAA 1TOOA 4CZSA 5GALA 4NOTA 4IQPA 2WT1A 2ZMLA 4HANA 3WDUA 4IONA 3A0NA 1DQOA 3CU1B 5H9RA 1JT5A 4TLPA 2QYIB 3BRGC 5E8AA 6I1BA 1ISVA 3HSMA 1W6QB 4AN7B 3BOOA 3FJ9A 3WV6A 1CN1A 2ZMKA 1WLDA 3CA0A 3O49A 3ZUQA 1N3QA 1BQPA 2LTNA 4YM0A 1FN0A 1S0BA 1QGLA 1M2TB 2LIQA 4YGEA 2EAKA 1AXYA 2BFHA 1W6PB 5JOZA 2WBCA 3FJEA 2EALA 3Q7YA 1MVEA 2GNDA 4G1RA 4DS0A 1AX0A 1MS4A 1S0CA 5JOWA 3IN9A 1Q8VA 4Q9PA 3CA3A 1CESA 4I4SA 1SBEA 2D23A 1N1SA 1EVTA 1MVQA 1LECA 1BYHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3SH4 A;  4AYU A;  1GYK A;  4LBQ A;  3T8S A;  4FOQ A;  4LBN A;  3R4S A;  2Q3N B;  5DUV A;  3V0B A;  1MZ6 A;  2YZ4 A;  3FJF A;  1IRA X;  4P0J A;  2A6Y A;  3FBY A;  1LGC A;  2A6X A;  4AWD A;  5F90 A;  3UD7 A;  3UDA A;  1UAI A;  4P9X A;  1EYL A;  4D69 A;  5BQU A;  1J1T A;  2ZGL A;  5DUY A;  3F62 B; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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