1EPWA

Crystal structure of clostridium neurotoxin type b
Total Genus 401
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
401
sequence length
1290
structure length
1287
Chain Sequence
PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE B
publication title Structural analysis of the catalytic and binding sites of Clostridium botulinum neurotoxin B.
pubmed doi rcsb
total genus 401
structure length 1287
sequence length 1290
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2000-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 1epwA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1epwA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1epwA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 1epwA01
2DU1A 5JOXA 4NOTA 2Y9XE 1BFCA 2FFUA 3FJIA 3IM6A 2EAKA 4JQ0A 3NV4A 1FATA 3AZZA 5FNWA 4AN6A 2Y9GA 5AVAA 1OKQA 4XMIA 3CA0A 3FJHA 2WKKA 4Y20A 3AJ5A 3C88A 3CRHA 3VSZA 4LO1C 3EF2A 1U0AA 4OWLA 3S8KA 2P3KA 4CJMA 3OJ2A 3I2XA 4GWNA 1N1VA 5GLVA 4KS6A 4MYEA 4XHBA 1F31A 2DV9A 2D3PA 1ZA4A 1ZM1A 4I4SA 4FPCA 4I1EA 3BTAA 1DYKA 4P14A 1PZ8A 4CRQA 2NTDA 2H0BA 3ILFA 2GO2A 4FP2A 2K4AB 2CWSA 1PWAA 2DVFA 5KXDA 3NBNA 1SFYA 2GNDA 1Q8QA 3SNMA 4WV8A 3CA4A 4IZEA 4JKQA 1EPWA 3DS9A 3D5OA 4H04A 2DURA 1MS4A 1QOSA 1ISVA 1PC8B 2VW0A 3ZSJA 3ZUQA 3OJMA 3WINA 3UJ4A 2AYHA 1LESA 4YZ1A 1V00A 3F62B 3MW3A 2ZKNA 4I4VA 3SISA 4YGCA 3AK0A 1IT0A 2YUGA 3M3CA 3OGFA 3QIZA 2Z42A 4LO8B 2UURA 1HKNA 3D7WB 1FWUA 1AVBA 5F8SA 5BQMA 3WCSA 1DQGA 4LBJA 1LOFC 2A75A 1NZKA 1APNA 2MLLB 2I2SA 3ZVXA 1EV2A 4YW3A 4YFZA 4DENA 1SLIA 3ZXKA 3LLPA 1YIFA 3NWKA 1DQOA 8I1BA 4WBCA 1XG6A 1LODA 4ZFWB 4I0YA 5BXSA 4FPOB 1DYPA 1G86A 4Q2FA 3B9CA 1ZL5A 1UKGA 1OFSA 4M3CB 3V0AB 1JHNA 3AJYA 3NBDA 2K8RA 2DVAA 3FUOA 4IQPA 1LCLA 3QW8A 5HCBA 2VW2A 4XMAA 3N7MA 5JOYA 1NXD1 5BXRA 1FQ9A 4ZKTB 1DGLA 2ZHMA 3BAQA 2Z48A 2FHRA 1LTEA 5D63A 4GALA 1YF8B 4WZFA 4USPA 3FFZA 5F90A 4R9CA 4YW1A 3AP9A 3WDUA 1F5FA 4K21A 1MD6A 1LENA 4SLIA 3H0OA 2EXJA 5F8WA 4AGGA 1BZWA 4LO3A 4ZFYB 3WVJA 4Q26A 2AUYA 1DQ2A 1W6PA 2DVGA 3TB0A 4FPFA 2YV8A 4I4XA 4KUFA 1ISXA 1JW6A 1JYCA 1LULA 1KRIA 4TYSA 4GOYA 4PQ9A 3IM5A 2CL2A 1CVNA 1BJQA 3ZUSA 2DTWA 4FGFA 4U2AA 1VIWB 2ZGKA 4FVVA 4P9XA 5DUXA 4RA0A 2B7YA 1ULGA 4Q1PA 3O4OA 1Q56A 3WLUA 1IS3A 1UZZA 4M3CE 4LBLA 1WLWA 2ZGMA 2EF6A 4KEJA 3OYWB 1ZKXA 1JLYA 1S1AA 3ILRA 4PBOA 3M1HA 3WUCA 4YLZA 5DUVA 4KC3A 1BKZA 1R8NA 2ARXA 2P39A 2ZHLA 2EXIA 4Y20B 3WINC 4Q9PA 3POYA 3UJQA 4CZSA 1IS5A 1DJSB 2UU8A 3DGTA 5IK5A 1FMZA 2R49A 3BOKA 5IK8A 4PF5A 3OJVA 2ZA9A 2D6MA 4LBNA 3C9ZA 3B3QE 3O4DA 2Y9FA 3UD9A 4IONA 1EVTA 1LHNA 3RQ0A 4X37A 4GWMA 3RS6A 1AVUA 1GLHA 3HBWA 3FJ8A 3QIXA 3AH2A 1X50A 4HJJA 1JT7A 1DLLA 1JXNA 5CNAA 3KMVA 4II0A 5T55A 4Z9WB 2ISEA 1WW4A 4I8MA 3I2AA 3CA6A 3FJ9A 1SLAA 4NO4A 1GYKA 1GKBA 4DPNA 1Z4SA 4Z8BA 1QDCA 4HA2A 4OZXA 4XJUA 1LOBA 3RMYA 3WDTA 5T52A 3CNAA 1Q1UA 1QKQA 3PUBA 4J2YA 1CE7B 5BQMB 3PVNA 4J2SA 1DZDA 1QNWA 3POSA 1T3AA 4XOGA 1WW6A 4GA9A 2PHWA 3IIRA 1Q8PA 1R8OA 2ZHNA 4UW5A 5GALA 1AX1A 4LO3C 2R1BA 4Y1YA 4A7ZA 3PVEA 5KXEA 2W08A 3AP6A 3AJ6A 5E24E 2GMMA 2IMAA 5GLUA 3FJBA 4QD2B 3P6JA 4X3AA 2VH9A 1HDKA 4R9DA 4YM2A 1AJOA 3RTJB 4KEIA 2C5DA 4IY8A 1HWMB 3B00A 3WCRA 5HPZA 1N3OA 2R16A 4ZFUB 3H6RA 4I3NA 6I1BA 2WBCA 2HYKA 3SLIA 2NMNA 1WUVA 4YOLA 2JKBA 1UAIA 3LCPA 1FYUA 1DBNA 5DG1A 3BA5A 21BIA 3ZXFA 4ZBVB 1QOOA 2Q5TA 3AKHA 2A7AA 3Q7WA 1MS8A 1TOOA 4FQ4A 4Y1VA 1QQLA 1ZL6A 2A5ZA 1G9BA 2D23A 2GMEA 1YBIA 5HCAA 2OUHA 3MALA 3O12A 2ETFA 4XILA 4XJZA 4CTEA 1BFGA 1CVSA 1Z2VA 2PHFA 1I1BA 1BXHA 2YMZA 2KKIA 1RMLA 5IT6A 1TTUA 1W6PB 1R1ZA 1EYLA 2TEPA 1PZ9A 3N36A 3V64A 1W6QB 2F2FC 5BP5A 3UJ0A 1FNYA 1BA7A 5GLZA 3IPVB 1LGNA 1G9CA 1RZOB 5JLVA 1HLCA 1PUUB 4BMEA 3UK9A 1W6OA 2ZGSA 4X38A 4A7YA 1DHKB 4G9MA 4XFSA 2ISGA 1Z0HA 1GNZA 1NLSA 1SLTA 4C1WA 1KNMA 1QGLA 2A6ZA 2PHRA 3V0BA 4BPZA 5DZGA 4I96A 3GALA 3HSMA 3ZXGA 5JOZA 3T1MA 2AQZA 1ULFA 1SZ6B 1LOAA 1CIWA 2JD4A 5GAQA 1I3HA 1K5UA 4G6MA 1AXYA 3NBCA 3LTQA 4I7IA 1CPNA 1HIBA 1WBCA 1QF3A 4ZGRB 3INAA 5DG2A 1HCDA 3DSEA 2FMDA 4GP0A 4LBOA 1UPSA 5FZZA 5BXPA 1DQ1A 4EFPA 4F83A 4LO7B 3HMYA 4QO3A 2BEBA 2AREA 4WVWA 4ENDA 4FPJA 2GN3A 1N3PA 2CWMA 1HWNB 5FRAA 4D69A 3TC2A 3UL2A 3BOPA 3FUQA 4I37A 2WNEA 2X2SA 3QJ0A 1BASA 3RTIB 2A70A 4R9AA 5T5LA 5H9SA 1W3FA 3W9TA 2ARBA 1S0LA 3BRFA 2DYCA 2G7KA 1GZCA 5BQNA 2GMPA 1AVAC 3HALA 1JBCA 3CQAA 5BQUC 1IS4A 2XG3A 3N7LA 4J2KA 4QKRA 3O4AA 4HL0A 4JRAA 4L4HA 5T5OA 2HWAA 1AF9A 2JECA 4BQ1A 3OJBA 4YG6A 2XHLB 1MS3A 4GKYA 3ZC9A 1DZCA 1CR7A 2D22A 5FREA 2WSVA 1S0FA 4K1ZA 9ILBA 4TZDA 1H30A 3MW4A 4XIOA 3VKOA 4UW3A 1AVXB 5I1BA 2ES3A 2PHTA 3RMXA 3I4IA 3ZSLA 3E8LC 3QCWA 4XJ8A 2A97A 1YTOA 4JAWA 3JRRA 4I2SA 5GJ6A 1MS5A 1WCSA 1LHOA 2SLIA 1W6MA 4XKIA 2RQ9A 3VKFC 3UD8A 3H6RB 4M3CF 2Q3NB 2PHUA 1AFCA 3AKFA 3KM5A 2DREA 1SR4C 1SCRA 3A22A 2WSUA 5CA6A 3CA1A 3APBA 4Z8SB 1ZKWA 3R4SA 4JCKA 3FJKA 4FOVA 4PBPA 3RSJA 2EIGA 1MVEA 3BA4A 3BADA 2QN4A 4DRRA 3D4KA 4AGRA 4BMBA 2M49A 2LTNA 2ISHA 3CRGA 3RRDA 3NV1A 2R0FA 1IS6A 2VY0A 4UW4A 2NVHA 1LHWA 2OVUA 4YZ2A 5JDBA 1V6XA 2AXMA 3OBRA 1LHVA 2E51A 1D2SA 4FPYA 1NUNA 4YFWA 4I4QA 2GNMA 3BOOA 4DS0A 4FOYA 1G9AA 4LBQD 3OGGA 2WLQA 3SITA 2FFVA 1GICA 3ATGA 3WO2A 1FGAA 1YVGA 3NV2A 2D6PA 2AAIB 2V5YA 4XXPA 3VT2A 1L2HA 3UDAA 4DFSA 4I6IA 1W6QA 1M2TB 2AFGA 1JUIA 1V6JA 2VW1A 1C1FA 1W6OB 3A21A 3IPVA 1H9PA 2UWCA 2WT1A 4I1BA 1MR5A 2R0HA 1ISWA 4ISRA 1SLCA 3VKLA 1V6KA 4GKXA 2ZGNA 2NN8A 3VKNA 3H6QA 5GLTA 1SACA 4YM0A 3N0KA 41BIA 2FDBM 3V0BB 1GGPB 1VAMA 2AH2A 3AZWA 4HR6C 4QBCA 1UMZA 1MS1A 3AJZA 3WZ1A 3O5SA 1SCSA 1TIEA 3O44A 1IILA 1WD3A 2A6WA 3IMNA 3DUIA 2D6NA 1GZ9A 4YW2A 4ASMB 3H6SE 4ZJXA 2A6YA 3P53A 2FPQA 2ZAAA 3I29B 2D7IA 1Z78A 4EEEB 3Q9OA 3AP7A 1P63A 4OEFA 1SBDA 3JU9A 3BA7A 1UL9A 1N47A 4YG3A 3BRGC 2KI6B 2ERMA 3ZX7A 1UN1A 2EALA 4D8HA 4D0ZA 2E4MA 4XXAA 4ITCA 2UWBA 3CA3A 1AJKA 3FLPA 5E8AA 2W2DB 2G4IA 3QIYA 3WDXA 5D61A 3WMUA 4JKXB 1IKPA 2AENA 1DZQA 1BARA 1BYHA 3QR5A 3ZYRA 2VXRA 1C4RA 1HKDA 3JUUA 5CBLA 3HR9A 1CN1A 1ISYA 1V6IA 2ZBJA 3WOGA 3WDYA 4YGBA 1J1TA 2GALA 2RHPA 2LIQA 1HWPB 3DEBA 1G9FA 2C9AA 1YXWA 5DUWA 3AKGA 5CAZA 1IOBA 4QD2C 1PZ7A 3T2TA 5DVHA 3DDBA 2DRZA 1RY7A 3FJDA 1MS0A 5DXDA 2IHOA 3A0NA 2DVBA 3AH4A 2J3PA 2W52A 1LHUA 1WW7A 3ENRA 1F9KA 3GNEA 3WMVA 4XBQA 1LECA 2ZQNA 1LOCA 1MS9A 4Y1XA 2D6OX 3QW6A 1ITBA 1S0EA 3AH1A 3O0VA 4FPGA 3ZXEA 1S0BA 3O4BA 3AYDA 4EB2B 2CY6A 4GAIA 3ILNA 2P3JA 1ZN3A 2XHLA 3ZYPA 1VAVA 2ZMNA 1JT4A 4OW4A 1RITA 2XB6C 3PJQA 5JOWA 1ENQA 2DU0A 4LO1A 2I1BA 4YW5A 4U36A 5IK4A 1FN0A 4ZOTA 1AXKA 4P0JA 5LK5A 2DTYA 3KQRA 3U4XA 1N1TA 1WBLA 2ZQOA 4G1RA 7I1BA 4FP3A 3USUA 1W6MB 4IHZA 3AXEA 5IUQA 3LSEA 4P0KA 1J0SA 4I4PA 2JDZA 1QDOA 5DZFA 4IY9A 3POWA 4IYBA 5H9RA 4LBQA 2NZ9A 1ILR1 2ENRA 5EHAA 1QMJA 5EYXA 4QKSA 2DUOA 2NP0A 2EXKA 3Q7YA 3B9UA 4ISQA 4OWJA 5D62A 1GV9A 2ZACA 4AN7B 2DWRA 1YO8A 1W6NA 1W0OA 2DUPA 3VSFA 4XDQA 1T3CA 2ZGQA 1XQNA 4XJAA 3BWIA 3AXDA 5JMCA 3CA5A 4ZLBB 2VLCA 4AVSA 4G9NA 4XZPA 2ZGPA 4GXLA 5EG6C 1HCEA 5EYYA 2Q9XA 5T5PA 1JT5A 3WHTA 3BONA 2V73A 1G82A 3NV3A 4K20A 4JP0A 4XBNA 4OEGA 2MIBA 1Q8VA 2DVDA 4XIKA 3ZXLA 2ILPA 4HEVA 1MACA 1LEMA 4AVTA 1LOFA 1W3GA 2ZABA 2JE7A 4DRVA 3W59A 1DQ6A 3HN1A 3FJFA 1GBGA 2IMCA 2UUSA 4LO7C 3FLRA 1DFQA 1TFMB 1FX5A 2WRYA 1N1SA 2IWTB 5EWSA 2PELA 3ZSKA 4X39A 2A6VA 3D6EA 2R9KB 1N3QA 4RL7A 4GAFA 5E89A 4QBVA 3AFKA 2X2TA 4EKXB 1JN2P 5BXTA 5EXOA 1JQZA 2Y9WC 4GP3A 1BFFA 3O0WA 4XTMA 2CYFA 1CPMA 1LJ7A 5DUUA 4ZA3B 2FGFA 1RIRA 3BRDA 1W0PA 5CB7A 5T50A 1JLXA 1ZB7A 2KLLA 2A6XA 2W68A 4K1YA 2AGSA 1DQ4A 4FOQA 3BIWE 3R4UA 5T54A 5DSSB 1TWMA 1II4A 1LOEA 1ONKB 1E0OA 4JC1A 4Q91A 2D6KA 1O4ZA 4XYXA 3IM0A 1RG8A 5E88A 4BM8A 4FOWA 3AYCA 1DQ5A 3OY8A 3LSDA 3D3XA 2ZGUA 3L2YA 3N35A 4XJ9A 4LO2A 2W2DA 4GOVA 4BLIA 4Y1UA 3PMEA 4XBLA 5FZYA 4YGEA 3N7JA 1V6NA 2DS0A 4KBBA 4P0LA 1LOGA 4AYUA 2NMOA 3SH3A 3C2UA 1FAYA 1GZWA 1GANA 1H9WA 3PG0A 3WG3A 1C57A 2D44A 3WG1A 2D20A 1OQLB 3FJAA 3BB2A 3C89A 1IKQA 3SNVA 3VKMA 1KJRA 3BAVA 2ZGLA 4Y26A 2P34A 2ZR1B 4L4IA 3TAYA 3K3QB 4G6JA 3CU1B 3O49A 1KDKA 3VV1A 4H9WA 2KI4A 3M2MA 3UJOA 1QU0A 4W65A 3MPPG 3ZXDA 2DUQA 1SBFA 2BFHA 4EFRA 3WDWA 4AWDA 1AZDA 1GSLA 4AVVA 5FZUA 2VSAA 5DZEA 1S0IA 3FIIA 1G7YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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