1G9AA

Crystal structure of clostridium botulinum neurotoxin b complexed with an inhibitor (experiment 3)
Total Genus 395
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
395
sequence length
1290
structure length
1287
Chain Sequence
PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A Novel Mechanism for Clostridium botulinum Neurotoxin Inhibition
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE B
total genus 395
structure length 1287
sequence length 1290
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2000-11-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 1g9aA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1g9aA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1g9aA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 1g9aA01
3B9UA 3F62B 1AX2A 4JAWA 1JY0A 4LO1C 3A4UA 3ZSMA 2D6MA 2ZA9A 3FUQA 3C88A 5DG2A 1NLSA 2WKKA 5L73A 4BMEA 1YF8B 2KI4A 1Q56A 3FBYA 7I1BA 5DUWA 2PHTA 4YW1A 4PC4A 5JVVA 1WBCA 4KTXA 1GZWA 1Q03A 1XQNA 1JOJA 3BOKA 4TLPA 3SH3A 3OGGA 4M3CE 3R4SA 1W6OA 1S0CA 4FP2A 4UW5A 4OEFA 4J2YA 2P23A 3QYDA 3HSMA 1T4QA 1LOFC 3ATGA 3O3QA 5T54A 2XHLA 3C9ZA 1HWOB 3MPPG 5LK5A 3QIXA 3CRIA 3WO2A 1W3GA 5KXDA 4QKRA 4FPJA 4PBPA 3A07A 3Q7WA 5EG6C 3P53A 5BQUA 3O4AA 4P9XA 1AVBA 3U4XA 1W6MB 1HCEA 3A21A 1HQLA 1ENQA 3IM7A 4YZ4A 1AF9A 1Q1UA 4P9YA 4Y20A 3RTIB 1PWAA 1ONAA 1WLWA 2JECA 4GOVA 2K4AB 1G9DA 1CQ9A 3IIRA 3POWA 4XJUA 3ZURA 4SLIA 1UMZA 2GALA 2RG9B 5DUXA 4YZ1A 1QDCA 3ZUQA 1TFMB 3O44A 4ZLBB 2GMMA 5IK5A 4M3CF 4Y24A 4XMAA 1MC9A 1ULFA 4YW3A 3I4IA 2AAIB 1E0OA 2J3PA 2DVDA 4YFWA 2ZGRA 4K21A 3AZWA 4DQAA 3AP6A 3CU1B 1YBIA 5DSSB 2ILPA 3I8TA 3Q9OA 2A6XA 4ATEA 2NYYA 3MW3A 3VWCA 5GLTA 4ELCA 3BA7A 4XJWA 1T3AA 5GLZA 1DLLA 1LHNA 2R0FA 1FNYA 2A75A 1LEDA 2YROA 3FGMA 1BLAA 4H55A 3IMNA 3WZ1A 3OJMA 5BQUC 1ZL5A 3VSFA 3AJ5A 4Y22B 1Q04A 2A97A 3IM5A 4D0TA 5DZUA 4Y1XA 5D62A 4FQZA 3O4OA 1QGLA 5GAQA 3Q7XA 1OQLB 3LCPA 4LBOA 4R9AA 2MLLB 2G7NA 2E7QA 1ZN3A 2E53A 3VKFC 3CQAA 2BEAA 2UWAA 3AK0A 5BXTA 2FPQA 4H9WA 4HR6C 1HWPB 2ISGA 4FPGA 3FLRA 2GN7A 2NMOA 1S0EA 2A7AA 1ULEA 4I4RA 1N3QA 4U36A 3DGTA 1O4ZA 5F90A 1SLLA 1IRAX 1BFGA 4NOTA 4G9MA 4X38A 2WBCA 5E8AA 1F31A 1LESA 5GALA 3I2AA 1A3KA 3AJYA 2E4MA 2KKIA 1CN1A 2AENA 3BAOA 4HJJA 5BXPA 1DQ0A 4UW6A 3SLIA 4EL4A 1S0JA 4JQ0A 1LOAA 3O5SA 4GALA 4GOYA 4YZ2A 3FLTA 1FX5A 2EXJA 1CESA 3CNAA 4I1BA 3AFKA 4LO7B 4D69A 2I2SA 4WZFA 2IMAA 2ZAAA 1A8DA 2W39A 3FFZA 5T55A 4YM3A 1LULA 3K3QB 3B01A 1RY7A 3VT2A 1V6JA 2ISHA 9ILBA 5EXOA 1T9FA 3PVEA 3ZXJA 1DQOA 1Q8QA 2D3SA 3WO3A 5HCFA 3ZXFA 2B7YA 1YIFA 2RSTA 4F34A 3BWIA 4IQPA 2VW0A 5DZGA 4KEKA 2XB6C 1SR4C 1WD4A 2ZGLA 1HCDA 2LIQA 2A6WA 3VEQA 3RS6A 3N7KA 4LO2A 3GALA 2A71A 3N35A 2ESUA 5DUUA 4XXAA 1AXKA 4X39A 2ZHMA 4XOGA 1LGBA 4GAFA 4YGDA 1ULCA 1DQ1A 1G8WA 1Q8OA 2E4MC 3BX1C 3W58A 4AGVA 1XZZA 1WW4A 1GZCA 4AN6A 3A0NA 3WCRA 2ZBJA 4IONA 2WJSA 2D6LX 2LALA 5FZYA 1MZ6A 2ZACA 2CY6A 2ZKNA 4QD2B 5BXSA 2E7TA 2MC2A 3AZVA 1IKPA 3OYWB 4YLZA 1O4YA 3WDTA 3RG0A 2DYCA 3WG4A 4AVTA 4QBCA 3C8AA 2YMZA 3PG0A 3AP9A 1FN0A 1BJQA 1OFSA 1HWNB 3BAVA 2A6ZA 1Z78A 2SLIA 4AWDA 1HWMB 5GZFA 1AJKA 2G7QA 1MVEA 5BOWA 2D6OX 3W9TA 1EV2A 1W6MA 5KXEA 1Z2VA 1F82A 2K8RA 1II4A 3OBRA 3MW2A 2DRYA 2DVAA 3BODA 3F1RA 3ZSKA 1M16A 1VALA 4LO2C 1HKNA 4ZA3B 1RIRA 1AVXB 4ZXKA 1BXHA 2Y9FA 3AKGA 3FJKA 1AXMA 4II0A 1ISZA 3QLQA 1B09A 2R1DA 1GZ9A 4GAIA 2EF6A 2E6VA 2W52A 1IS4A 2NP0A 3WINC 2P39A 3KQRA 3ZSLA 2ZGUA 4R9BA 4AVSA 5FZUA 3M3CA 3BTAA 3LLPA 4QC4A 5GZGA 3HALA 5E88A 3VV1A 2XG3A 2XOAA 1ENRA 1LECA 3AXEA 1W0OA 4XIKA 3M3OA 2NVHA 3WA1A 3BAGA 3AYDA 4HA2A 1GV9A 4I0YA 5D61A 4FGFA 1LU2A 1V6UA 4P14A 3UL2A 5F9TA 4I30A 2WNEA 1WW7A 1EYLA 2V73A 3PVNA 3QIZA 2OUHA 1V6VA 1UPSA 2W2DB 3RSJA 3AX4A 4Y22A 2CL2A 4XJ8A 4ENDA 4ZOTA 3CA0A 5T5LA 1I1BA 1DQ2A 1DYPA 5G00A 5BVPI 4AN7B 3PJQA 5HCAA 1RG8A 4XTMA 1W3FA 3AJZA 4F83A 1K5VA 3CA3A 3TB0A 5CNAA 1LGNA 2HZ9A 4XHBA 5T50A 2I1BA 4IY8A 5CAZA 5E89A 5F8WA 1FMMS 4ITCA 2GZBA 1IS5A 4K20A 2A6VA 2JDZA 4NO4A 2GNBA 3PMEA 2L5XA 3B9CA 2CYFA 3ZXDA 2P3KA 2AREA 5IK8A 3WUDA 1X50A 1G7YA 1URXA 2ZGKA 3D4KA 3ZC9A 1LENA 3O0WA 1ITBA 1W6NB 4U2AA 1ILR1 1N1TA 3FUOA 1WCSA 1CVNA 4FPFA 1C1LA 3QIYA 1AX0A 3N3HA 4ZKTB 2VSAA 1S0IA 3WDYA 4JKXB 1HIBA 31BIA 3QW5A 3ZSJA 4Q26A 3BOOA 1JYCA 2KH2A 4H04A 1SLCA 3R05A 2FO1A 3PUBA 4FQ4A 4WV8A 2WT1A 3FIEA 3ZX7A 5T5PA 2DTWA 5JLVA 3AH4A 3CRGA 5E24E 2VSEA 1DQ6A 1DZCA 2P3IA 3HN1A 3UD9A 3NWKA 1W6QB 2MIBA 2ENRA 2ARBA 1N1SA 1V6MA 1LEMA 1G9FA 4J2XA 1N1VA 1QNWA 6I1BA 2HYKA 1DHKB 3APBA 2C9AA 4OW4A 3JRRA 3SH4A 3O4BA 2AQZA 3BRGC 1MS5A 5F5QA 1DBNA 5H9QA 4CRQA 5JOYA 3VT1A 3HOMA 1FWUA 3KMVA 4I8MA 2NZ9A 3D3XA 4I4SA 4YW5A 4YW4A 1K5UA 2D3RA 4EB2B 2X2SA 4QKSA 3E8LC 4I4OA 1GGPB 2RQ9A 4AYUA 1PUUB 2A3WA 3OYWA 4L4IA 4C1XA 2D6NA 1Z0HA 4XJAA 4LO7C 1TIEA 4K1YA 1CPNA 1L2HA 4JC1A 1FQ9A 1QQKA 3SNMA 3USUB 2YV8A 4KBBA 3WLUA 4ASMB 1R8NA 2Z48A 1WUVA 2A8AA 1G9CA 1YI7A 1JT5A 4Q1PA 3M1HA 2OVUA 1ULGA 2ZMLA 4AGGA 3BONA 4J2KA 3M3EA 1SBFA 1BA7A 4P6AA 4IZXA 1MACA 1YYNA 4I4UA 2IHOA 1WLCA 1YXWA 2ZMKA 1LCLA 3BAQA 1SFYA 1PZ9A 2G4IA 1ZKXA 4HL0A 3DUIA 1OQ1A 3AYCA 2D7IA 4AGRA 1QQLA 4XJZA 5BQMA 3UDAA 4XXPA 1H9PA 3FJEA 1XHBA 5CB7A 3UK9A 1VLNA 2BQPA 2C5DA 1UAIA 2PHXA 1DJSB 1UKGA 2P37A 4XHXA 4Q2FA 1QMJA 4XE9A 4PQ9A 4Y1ZA 2IMBA 4I4XA 1YRZA 3AH1A 3V0AB 2A6YA 3FJCA 1GNHA 2ZHNA 4XFTA 3RMXA 4C1WA 4QD2C 4Y26A 1VIWB 1VAMA 2NM1A 1G86A 1BFCA 4ZFUB 2ZGMA 2GN3A 3SISA 2R49A 2YZ4A 3JUUA 1SR4A 4LO8B 1UL9A 1GKBA 1DQ5A 4DPNA 1MR5A 4XJ9A 2K43A 4FPEA 1F5FA 3NJ5A 2ZGTA 1ABRB 1MS9A 4EEEB 1WLDA 2DU0A 2AXMA 3WV6A 4OWLA 3WG2A 3A23A 3FIIA 2DUQA 2NMNA 4DENA 3CAHA 2HWAA 1DIWA 3HBWA 2BEBA 4I4VA 3UD8A 3NV1A 1QOTA 5FREA 4FVVA 4ZFWB 3POKA 1CVSA 3H6RB 3MW4A 4FP3A 4LBQB 1HDKA 4FOWA 4WVWA 3POSA 3V64A 2P3JA 4K1ZA 3D5OA 4DFSA 3V79C 2ZGNA 1S0FA 2W08A 8I1BA 4DEPA 5JOZA 2JD4A 1MS8A 3BA4A 2AUYA 1U0AA 2AH2A 2X2TA 2ZGOA 3RMYA 3VSZA 4UW4A 5DUYA 5IK4A 5DG1A 1TTUA 3OGFA 1G9AA 3C2UA 3B69A 2R9KB 1GZWB 3CA5A 2ERMA 4G6JA 1NXD1 1M2TB 2GDFA 1WBAA 1IKQA 4WVVA 3OJBA 3UJQA 3BADA 3T8SA 1JT4A 4FOQA 5EYXA 4GKYA 2PHFA 3IM6A 4M00A 3B00A 1BARA 3QW6A 3R4UA 2DTYA 4LO0A 3OJ2A 3CA4A 2UURA 2DV9A 1RINA 2YY1A 1G82A 1KJRA 4R9CA 2Q9XA 1GICA 5GM0A 1V00A 2VXRA 2GO2A 1W0PA 1DFCA 1Z7HA 3WINA 3P6IA 1V6WA 4D8HA 4J2SA 1ZKWA 5GZDA 4BOWA 2DURA 4DCKC 2GNMA 1ZL6A 1MS1A 1V6NA 3A22A 2FMDA 4JCKA 4YW2A 3WDVA 4YM1A 5HPZA 4OWKA 4Y20B 3BIWE 3ILFA 3NV3A 4D0ZA 5DZFA 4L4HA 2AGSA 4M3CB 1QOSA 1TP0A 4XFSA 2NTDA 4Q9GA 1WW5A 2DWRA 5KXCA 4FPYA 2W68A 2YXSA 1SBEA 1DYKA 1Q8PA 2E51A 3WCSA 2PHWA 5CA6A 1KDMA 1LGCA 1FNZA 3VKOA 3W59A 2QYIB 1XYFA 2VLCA 3WG1A 4XTPA 3BRFA 4YM0A 2GMPA 3FJAA 3DDAA 2ZZJA 4XBNA 5H9RA 4I37A 4LO0C 1DZQA 3VUOA 3ILRA 3Q7YA 2D3PA 3AYAA 2GNDA 2WQZC 5GZEA 4IZEA 2D24A 3AZXA 2LTNA 2OW4A 2VUAA 2EAKA 5BYNA 1Y7BA 1YO8A 3USUA 3WHUA 1SLIA 2CTVA 1KQRA 5EWSA 3FJDA 3H6QA 3FLPA 1AXZA 3RTJB 3QJ0A 1JN2P 3LTQA 1KNMA 1UN1A 3WOGA 5SV8A 2F2FA 1A78A 1IILA 3AZYA 3C89A 3P6JA 4PCRA 5EHAA 3IN9A 4LBMA 1BFFA 3UJ0A 2P2KA 4I3NA 1QU0A 3QR5A 3NF3A 2Z42A 5H9SA 1XTGA 3VT0A 4BMBA 4DRRA 2VW2A 4RA0A 1LOGA 2EXKA 3GNEA 4TYSA 2D44A 3IPVB 3T1MA 3WNXA 1BYHA 4Z8SB 3IKWA 4MYEA 2P34A 4I6IA 2KM2A 2DREA 4M01A 3WVJA 3N0KA 21BIA 5JOXA 4Z8BA 1AVAC 1AX1A 4HEVA 1FMZA 1T3CA 3AKIA 1MS3A 1N4KA 3ZXKA 2ZR1B 1QF3A 4QO3A 2V5YA 1S0LA 1BQPA 1JHNA 3OBTA 3AP5A 2FHRA 4JPZA 5T5OA 3N7MA 3AKHA 2ZGQA 3BRDA 1TWEA 2QN0A 1Q8SA 1PZ8A 2QN4A 4DRVA 1RZOB 1PUMB 2ZMNA 4CJMA 4I7IA 4YGBA 2F2FC 4A7YA 3IM0A 4GA9A 4Y1VA 1S1AA 1LOBA 5FNXA 2D7RA 1TOOA 2DVFA 4YZ3A 2VU9A 2G7KA 2VXTI 3JU9A 3K1XA 2UUSA 3V0BB 1SZ6B 5JMCA 5FRAA 4I1EA 1PZ7A 4LO3A 4OUJA 4LBQA 1QXMA 3OPZA 4USPA 1WD3A 3CA6A 1HKDA 1QDOA 5GLVA 3WMVA 1GANA 2D22A 4RL7A 1JLXA 4WBCA 3UJOA 4R9DA 2UWCA 1E1HA 2Z49A 3LSEA 2WSVA 1PC8B 4ZGRB 3JUTA 1IT0A 4BLIA 3N7LA 4OEEA 5KXBA 2D7FA 4FPCA 4OWJA 4KUFA 4ISRA 3PVOA 2GNTA 4YGEA 3RRDA 1LU1A 1LHUA 2Y9XE 4YZ5A 3ILNA 1KRIA 4LBJA 4Q9PA 3WO4A 2FFUA 3N36A 1H9WA 3AZZA 4KEJA 4ATFA 2KI6B 3T2TA 4R6UB 4FPOB 3S8JA 1HLCA 1S0DA 3POYA 4YM2A 3N7JA 3OY8B 1BLDA 1RITA 4XBQA 4J23B 1V6IA 1D2SA 1GYKA 3CRHA 4LBQD 1RMLA 3SH5A 3S8KA 3VKLA 3FJIA 1EPWA 1CR7A 5EC5A 4G1RA 3DEBA 1DFQA 1N47A 4W65A 2ERFA 3D7WB 3DSEA 2UWBA 2PHRA 1AZDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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