1S0C | Genus

Total Genus 399

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	399
sequence length	1290
structure length	1287
Chain Sequence	PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Toxin, hydrolase
molecule keywords	Botulinum neurotoxin type B
publication title	Role of metals in the biological activity of Clostridium botulinum neurotoxins pubmed doi rcsb
total genus	399
structure length	1287
sequence length	1290
ec nomenclature	ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date	2003-12-30

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01742	Peptidase_M27	Clostridial neurotoxin zinc protease
A	PF07951	Toxin_R_bind_C	Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A	PF07952	Toxin_trans	Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A	PF07953	Toxin_R_bind_N	Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1120.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain	Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain	1s0cA02
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	1s0cA03
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	1s0cA04
3.90.1240.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Zincin-like	Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like	1s0cA01

2LIEA 3QYDA 4YM2A 2FHRA 4LO0C 1VIWB 3USUA 1ZL6A 1M2TB 4UW6A 4A7ZA 3FJ9A 2D1ZA 3A0KA 3KQRA 2DTYA 4DRVA 1Q56A 1FATA 3F1RA 2EXHA 4R9CA 2DREA 4I96A 1HCEA 1S0DA 4FGFA 3HOMA 1G7YA 4XHBA 1VAMA 2SLIA 2HW9A 3IMNA 3QIYA 5HCBA 1HKNA 1AVUA 3UD7A 3AJYA 2A70A 1OFSA 3OJMA 1B09A 4YGCA 2MIBA 3AK0A 3AJ5A 4L8QA 5IK5A 4I1BA 4HANA 1PUMB 2YY1A 3OYWB 3CRHA 1BJQA 3PMEA 1ULCA 1ISVA 3C2UA 1CQ9A 1R1ZA 2JE7A 2WBCA 5EHAA 3D5OA 3ZYPA 1TWMA 4K1ZA 4XTMA 3QW8A 5FNXA 2ISHA 1JQZA 1Q8OA 2FPQA 2DWRA 4GKYA 1Y7BA 2DURA 1BARA 3UJ4A 4AN6A 1AXYA 2Y9WC 1FNZA 1UMZA 1DQ2A 9ILBA 4J2XA 1LHVA 2E6VA 5DZUA 3RS6A 3CA5A 4LO1C 1MS3A 1FAYA 3AFKA 2AYHA 3JUUA 4CJMA 1JYIA 1PUUB 3WDXA 4PBPA 1K5UA 2GMMA 1TP0A 2GNMA 1LHNA 1L2HA 2GNTA 4D69A 1PZZA 2G7PA 2LALA 5BP5C 3H6RB 4K21A 4PQ9A 4I4YA 3NV3A 3I4IA 1A3KA 2ENRA 5F5QA 4XYXA 3T2TA 4EKXB 3HSMA 3WCRA 2R1BA 3PHZA 3DEBA 2ZHLA 3ZURA 3I2XA 2W08A 1DZCA 1C1FA 2P3JA 2YV8A 3OY8B 3HALA 2ZGUA 4I30A 3AXDA 2ZMNA 1S1AA 2EXKA 1LEDA 1MZ6A 1WBLA 1AFCA 3BOPA 4DRRA 4I4OA 5GLTA 1MVQA 1CESA 3IN9A 4P9XA 3TC2A 1N1TA 4GOVA 2D6LX 1SR4C 3FUOA 3FJ8A 1SACA 1XZZA 2PHUA 4FPFA 1C57A 3CNAA 3DS9A 4M3CF 2SBAA 1KDKA 3M2MA 4Z8BA 4ZA3B 2EIGA 5F9TA 3QCWA 1XTFA 1V6MA 1G82A 1QXMA 4FPLA 4BLJA 2VW1A 1H9PA 1II4A 3T8SA 3E8LC 4YG3A 1QDCA 1I1BA 3D3XA 1AZDA 1ZB7A 2CY6A 2ZMLA 4YOLA 4DQAA 3M3EA 3K3QB 1IHKA 1ZM1A 4LO0A 4TZDA 4JCKA 4ZFYB 2UUSA 4II0A 1GSLA 4M3CA 4QD2C 1ENRA 4UW3A 3WG2A 1W6OA 2LTNA 5AVAA 2GZBA 4HA2A 3C8BA 4M00A 1C4RA 4I1EA 4LBQD 4ZFWB 3UJOA 3FJBA 1JW6A 1WUVA 3O12A 1FNYA 2PHXA 3WV6A 1FMZA 3BADA 4MYEA 2MC2A 2V5YA 3FUQA 2ZGMA 2R1DA 5GLZA 3SH4A 1V6NA 4XJAA 1K5VA 4I4RA 3FJHA 3V0BB 2M49A 3I2AA 3IM6A 3ZXLA 1XQNA 1RMLA 3FJCA 5EYXA 4CRQA 3ILAA 2ZBJA 3O4DA 2IHOA 3IM5A 2GN3A 5T5PA 1TIEA 2JKBA 4WVVA 1JYCA 4LBLA 1QKQA 3M3OA 4YGDA 3C8AA 1HWNB 1CIWA 4Q1PA 4YFZA 1WBCA 4H9WA 4Z9WB 2P34A 5DZGA 2F2FC 1TEIA 3VKFC 4Q9PA 2D6KA 1UPSA 4IY8A 2A6VA 4R9DA 4FPHA 4FPGA 2EXJA 1JT4A 3POSA 4GKXA 3O5WB 2G7QA 4L4IA 4LO1A 2CWMA 5DUVA 1M16A 1YTOA 2JDZA 1AVWB 1AJOA 1F31A 2PHRA 5DUYA 4WZFA 3FLTA 3V0AB 2K43A 5GLUA 2XHLA 1LOFC 2WT1A 2GMPA 2R9KB 1JY0A 3WDUA 1DLLA 4KUFA 3W9TA 2VUAA 3WG4A 2DTWA 3N3HA 3H6SE 4WVWA 2E4MA 3ATGA 4HR6C 3N7LA 4M01A 1HWOB 1W6PB 1LOGA 1MS0A 7I1BA 5FNWA 5KXCA 3EF2A 3LLPA 3N35A 3RQ0A 1ONKB 1HQLA 1Q8VA 3CQAA 1PWAA 2RQ9A 4ATEA 2NP0A 4EFQA 4JRAA 2WQZC 3A0NA 1ZL5A 2KH2A 1BYHA 1N3QA 1DZDA 3RSJA 3PG0A 5G00A 4FOWA 1IOAA 1ZA4A 1BFFA 4PBOA 4TYSA 4GP0A 4P6AA 2VY0A 3BA5A 2GALA 3N7MA 1RY7A 4LO7B 4QALA 1GICA 1JBCA 2HWAA 2DV9A 1YVGA 3SH5A 3ZXJA 5T55A 4Y1UA 4BPZA 3WUCA 4KS6A 2G7KA 3BWIA 5FZZA 3QW7A 3FJEA 4IONA 3A07A 3AX4A 1DYPA 4D0TA 1Z78A 4QKRA 1IT0A 5GAQA 3H6RA 1O4YA 5E8AA 1W0PA 4FPJA 1H9WA 4FOYA 4OWKA 3QIZA 3AP6A 2K8RA 3KM5A 1SBDA 1AXMA 1EVTA 4USOA 1RITA 2AGSA 1HWMB 1MS9A 3QJ0A 1DQGA 1A8DA 2BEBA 3PVNA 2DVBA 4XXPA 1MS4A 1D2SA 5CBLA 2KLLA 4YZ2A 3F62B 5BXPA 1TOOA 4Z8SB 3IAGC 5CB7A 1S0FA 1QOTA 4IYBA 3A4UA 3WA1A 2P39A 3WOGA 4Q2FA 1QNWA 2D24A 2OUJA 3O44A 3SNMA 4Q27A 2A6ZA 1CR7A 1JXNA 1HLCA 1XG6A 4AGGA 3AYDA 2W68A 1GZWA 3ZVXA 3MW2A 3UD9A 2D22A 2ZGLA 3KMVA 2D3RA 4ATFA 3NV2A 4GALA 5FRAA 2ZHKA 3PVEA 1HWPB 4F83A 1ULGA 3AP5A 5EXOA 2YZ4A 1KRIA 4X37A 5D61A 2ISGA 1Z4SA 4I2SA 1T3CA 8I1BA 2DU1A 3ASIA 3QLQA 2NTDA 3MALA 3JUTA 1ZN3A 1FV2A 2A71A 5JVVA 1BQPA 4I0YA 2ZGOA 2RSTA 3ZXFA 2VU9A 3UJ0A 4K1YA 1CPNA 1OQ1A 1CVNA 2GDFA 4PF5A 1KITA 4LBQA 4DCKC 5SV8A 1JT5A 1AX2A 2DVAA 2NVHA 3W59A 4RA0A 4I4UA 1AJKA 1OQLB 1G9DA 2VLCA 4QBCA 1Z0HA 4YW4A 1ZKXA 3BRDA 3DUIA 4BMBA 4YGBA 3RG0A 4Q9GA 1SLAA 2VW2A 3AJZA 3WO4A 5KXEA 1YYNA 1WD3A 4OUJA 5KXDA 1QQKA 2UU8A 4I4SA 4Q91A 4EB2B 1IOBA 4FPYA 2BEAA 4OEFA 2WT0A 1S0JA 4YM3A 1WBFA 2WJSA 1W0OA 1CPMA 4P0JA 1VALA 3C9ZA 3M3CA 2C9AA 4BOWA 3Q7WA 1IS3A 3O4AA 1LHUA 1S0LA 1GKBA 3AXEA 2D7RA 4KEIA 4YZ1A 4LO8B 4OEGA 2QN4A 3OGGA 3NWKA 5GZGA 1BZWA 1LULA 2QYIB 2VSEA 2ZAAA 3FIIA 3ZSKA 5BQMA 3MW3A 4G6JA 1MS1A 4NO4A 5JOZA 2XB6C 4XMAA 2E4MC 5DXDA 2EAKA 4ISQA 4QC4A 1GZ9A 2GNBA 1IRPA 3OPZA 4ZFUB 2IMAA 2OVUA 4I4VA 1AVBA 2IMCA 1OKQA 4RL7A 1ISYA 5JOWA 2Z49A 3QR5A 2AENA 1YBIA 5D63A 3FJDA 5HPZA 4H55A 4M3CE 3IPVA 4GWMA 4Y20B 1FN0A 2WT2A 4I3NA 2B7YA 3Q7XA 3UJQA 4XMIA 2A97A 3WMVA 1LENA 4FP2A 1ULFA 2A3XA 1S0BA 4R9AA 1WLCA 2I1BA 2Y9FA 1LOBA 1V6IA 4G1RA 2JJ6A 5JLVA 4KEKA 1W6MA 3TAYA 4ENDA 2ZABA 2NMNA 4IZEA 4U2AA 5F8YA 5DSSB 4YZ3A 3CRIA 3WZ1A 1JN2P 4KBBA 4XJUA 2ZGPA 1SLIA 4XIKA 1JT7A 3HR9A 3ZSMA 1E1HA 2G7NA 1ENQA 1HKDA 2FFUA 4AVTA 3ZPYA 3FLRA 4G9NA 3AKFA 4YLZA 4Y26A 5L73A 2DVDA 1Q04A 4QKSA 1WW7A 2ETFA 1PZ9A 3OGFA 4AGVA 3NV4A 3BA4A 5DZEA 3MPPG 3FJAA 4CTEA 5IK4A 4Y1VA 1QF3A 1FX5A 2ZHNA 4Y1XA 2D6MA 2FMDA 3B9CA 5B2HA 1QNYA 2D6NA 3D6EA 1PZ7A 3ENRA 1AVAC 3BAVA 3C89A 5BQNA 4JQ0A 5D62A 1LGNA 2MLLB 4R9BA 3V79C 3CAHA 1WW6A 2P37A 2FO1A 5DG1A 1LOAA 2XOAA 3AJ6A 1QQLA 4XTPA 4PC4A 1MS8A 1IKPA 2Z42A 3R4UA 3SNVA 1X50A 1KJRA 2ILPA 3GALA 3VEQA 1MVEA 3AH2A 5DUUA 4WBCA 3V64A 1BFCA 2PHTA 4ZXKA 2GN7A 5JMCA 2WSVA 1W3AA 1WLWA 1T9FA 2AAIB 3AZWA 1JOJA 2AREA 4YG0A 5T5JA 4KC3A 3L2YA 1S0EA 2D6OX 1H30A 1MACA 1KNMA 3PJQA 3PVOA 3UK9A 2NZ9A 3D7WB 2NN8A 2V73A 3O0XA 3OYWA 3WUDA 4ISRA 1AX1A 2HZ9A 4Y22B 3JRRA 1GBGA 2ZA9A 3ZXKA 1MR5A 3NJ5A 4H04A 1LHWA 4DS0A 3AYAA 2AH2A 2P3KA 4XBQA 4AVSA 1FQ9A 1RZOB 2KI4A 1SCSA 2E7QA 2YXSA 4R6UB 1TTUA 1UN1A 1IJTA 2Q9XA 2DRZA 1CN1A 1SFYA 3B00A 4U36A 3FJIA 1UX6A 4P14A 4GAFA 2P23A 2I2SA 4Q1RA 1GZCA 3VKNA 1NZKA 2HWMA 1BFGA 2ISEA 1I1EA 1AF9A 3C88A 3FJJA 1UKGA 4LBKA 3WHUA 4IY9A 2PHWA 4XKIA 1ZKWA 3DDBA 3WDWA 1GNHA 4FQ4A 1IILA 3OJBA 1V6XA 3BB2A 1SLTA 3WCSA 1W3FA 2GMEA 2IMBA 4SLIA 1TFMB 4W65A 1V6JA 4AN7B 3ZUSA 1LHOA 1UAIA 1A78A 2E53A 2DUOA 3O0WA 2OW4A 4XJZA 1P63A 3BX1C 3OY8A 3BRGC 4ZKTB 3NBEA 4I6IA 4OW4A 5CA6A 4J23B 1DQ4A 1DGLA 4GWNA 2ERFA 2ZACA 2VXRA 1N1YA 4I8MA 3O4BA 5GLVA 3T1LA 5DUXA 1W6QB 3I8TA 2JE9A 3FJFA 2UWAA 4ZOTA 5EG6C 3T1MA 1ONAA 5T54A 1FV3A 2ZGTA 4KEJA 3AKGA 3WNXA 1UZYA 5H9SA 4YZ5A 5EYYA 1N3OA 3AZVA 4XXAA 2GNDA 4X3AA 3AYCA 4YGEA 2OUHA 4BM8A 3FGMA 1N3PA 4YW1A 4DPNA 3WINA 2Q3NB 5BXSA 4XDQA 2KKIA 1AXZA 1BXHA 5BVPI 1QMJA 2AR6A 1LECA 5JOYA 3DSEA 4FVVA 4YW5A 2R0FA 1W6OB 2D44A 2EF6A 3CA3A 4G6MA 3WG1A 3VT0A 2P2KA 3DDAA 2PHFA 4FOVA 4ZLBB 1FYUA 4A7YA 5IK7A 2W2DB 4EJ5A 5E88A 4AGRA 1N4KA 4I7IA 1W6NB 5BXRA 1WLDA 5DZFA 4A7KA 1CVSA 3NF3A 3ZYRA 4YFWA 4DFSA 1SLLA 1BFBA 2KI6B 3QW5A 4LBMA 1V00A 2P3IA 1V6LA 1LJ7A 3V0BA 3AP7A 5JOXA 1Z7HA 1EYLA 2CYFA 2VW0A 3CU1B 4Q8KA 3NBNA 1EV2A 1URXA 3ZXDA 1DZQA 4JP0A 2A6YA 2E51A 3VWCA 1LCLA 4Q26A 3S8JA 3ZC9A 3IM7A 2Y9GA 1W3GA 2KM2A 4QO3A 3CA1A 2G4IA 1IRAX 3O4CA 4GP3A 3CRGA 1J1TA 3OJ2A 4XOGA 3BOKA 1CONA 1N1VA 2Q5TA 4P9WA 3CA6A 3AZXA 5HCAA 3AKIA 4DENA 1HIBA 4OWJA 1R8OA 2BFHA 3LSEA 4QBVA 5EWSA 1ISXA 1FGAA 1Q1UA 3APBA 2XHLB 4YZ4A 3BRFA 3WDTA 3BAGA 1ULDA 4BQ1A 3V0AA 1G9FA 3WVJA 4GOYA 1BKZA 2WRYA 3UDAA 5BOWA 1DHKB 1XHBA 4CZSA 2F8XC 1QDOA 2ZGRA 3CA0A 5IK8A 5F8WA 1JTCA 1D0HA 1SZ6B 3AH1A 4ASMB 2ZGQA 1W6PA 1PZ8A 2ZGNA 2AXMA 3ZXEA 3VT2A 2ZZJA 2UURA 1APNA 4Y22A 4LO2C 3SITA 3BTAA 2PELA 3FIEA 1DBNA 1LGCA 5GM0A 3R4SA 4EL4A 5DG2A 5E24E 3BODA 4I37A 4IHZA 3QW6A 2E7TA 1N47A 31BIA 2WKKA 4AYUA 3POWA 4XBNA 1MZ5A 1R8NA 2A6WA 2A7AA 2WSUA 1BA7A 1TWEA 1V6KA 1LOCA 1LODA 4D8HA 2ZQNA 2WNEA 4XJ9A 1G9CA 3OJVA 1J0SA 2YMZA 3ILFA 1F82A 1YIFA 2VSAA 1WCSA 1KQRA 3ZSLA 5DVHA 2Y9XE 3W58A 4I4XA 1YF8B 4J1LA 1SBFA 3POYA 3AZZA 1PC8B 3H6QA 2D3SA 2ESUA 2DUQA 4QD2B 1ILR1 3FBYA 3NV1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1S0CA

Total Genus

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Chain Sequence

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