1S0EA

Crystal structure of botulinum neurotoxin type b at ph 6.0
Total Genus 407
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
407
sequence length
1290
structure length
1287
Chain Sequence
PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin, hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
publication title Role of metals in the biological activity of Clostridium botulinum neurotoxins
pubmed doi rcsb
total genus 407
structure length 1287
sequence length 1290
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2003-12-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 1s0eA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1s0eA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1s0eA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 1s0eA01
4J23B 2A3XA 2P3KA 4BMEA 2CL2A 3B01A 5L73A 2DVFA 2E7TA 1NUNA 3AP5A 1WBLA 1NZKA 4ZJXA 1YXWA 1JXNA 1I1EA 3OY8A 1JT3A 3OJBA 5E24E 3NV1A 4J2SA 3ZSKA 3JU9A 2D6MA 1PUMB 2K43A 1SLLA 3I4IA 4GOVA 3PVNA 2P23A 1SR4A 3AP6A 3USUA 1LEMA 3T1LA 4OEEA 1FV2A 4XJ8A 1LHWA 5AVAA 2YMZA 1FGAA 1KRIA 2PHXA 4YG0A 1JQZA 3AP9A 1Z4SA 4XKIA 4M00A 4UW6A 1BJQA 1G9CA 5BQMB 4G6MA 3BOOA 4QO3A 5BXPA 2Z42A 4LO3C 1AJKA 2NP0A 2D6LX 4LBQD 4Y22B 2C5DA 3WO3A 4SLIA 3UDAA 4HA2A 1SLAA 3O44A 2ZHKA 2VW2A 4FOQA 1SLBA 1F9KA 2P37A 2DV9A 4K21A 1AXKA 5GM0A 3BTAA 1Z2VA 5HPZA 3VT0A 3A0NA 4EKXB 2YY1A 3OPZA 5KXCA 4FPFA 3BAOA 2YUGA 2I2SA 3FGMA 3T1MA 1RINA 4ZFWB 4ATEA 1FWVA 5GZCA 3UJOA 2A3WA 2JJ6A 3H0OA 1PUUB 1CPMA 4X37A 4XE9A 2D23A 1R8NA 1DZQA 1BFFA 3QW6A 4XHBA 3UJQA 2AREA 1R8OA 4R9CA 1MZ6A 3BRDA 1DLLA 4KS6A 1MC9A 2A8AA 1W6OB 4XMAA 1UMZA 3N7LA 1IS6A 3IM6A 2DUOA 2SLIA 1DQGA 2ZBJA 5HCFA 2QN0A 3WDTA 1A8DA 1HIBA 5JOYA 3ILRA 4I1BA 4GOYA 4YM2A 1VALA 5B2HA 1B09A 2CTVA 4XYXA 1HQWA 3R4UA 1W0OA 3FJFA 3DSEA 1DHKB 4XXAA 2GN3A 1DQOA 1HLCA 3A4UA 2XHLB 3VEQA 2D6KA 2ZGKA 2AGSA 3PG0A 1W3FA 3CA1A 1RG8A 3AP7A 3M3EA 2KKIA 2G7PA 3WMVA 2YZ4A 4Q8LA 2AXMA 1QOTA 1GANA 3AH2A 1D0HA 3SH3A 3PVEA 1O4ZA 3FJBA 1MS3A 1WCSA 2LIEA 1KJRA 3VWCA 1LGBA 4A7ZA 4FPKA 4FP2A 3OBTA 3TB0A 3JRRA 4OEGA 1NXD1 2NVHA 4I4PA 4XZPA 2ZQOA 4Q26A 2AENA 3S8KA 1C1FA 1FNZA 4DQAA 1LOAA 3AZZA 1VLNA 1KDMA 2R1BA 3SH4A 4JKXB 1AX1A 3FBYA 2HWMA 2ET2A 3H6RB 2ZGQA 1LTEA 3PHZA 3C2UA 5GJ6A 4ATFA 4BPZA 3Q9OA 1WLCA 2XG3A 3W9TA 1DZCA 1CPNA 3LTQA 5G00A 2WT0A 4ITCA 4M3CB 2WSVA 4QBVA 1IRAX 1SLIA 2PHUA 1GKBA 3V0AA 3DGTA 4PBOA 1JLXA 5F8WA 2BFHA 4I1EA 3FLRA 4BQ1A 4LO1C 4QALA 3QIYA 1ISXA 1AVAC 4YZ3A 2D22A 2VW0A 3KQRA 3INAA 1QQLA 3S8JA 5JOWA 3NBCA 5FZUA 2OUHA 1ZB7A 4YG3A 4JQ0A 3ENRA 1DBNA 4XXPA 4GP0A 3C9ZA 2V73A 2EF6A 1ITBA 3RMXA 1G82A 3GALA 2E7QA 3L2YA 4PF5A 5T55A 5HCAA 1V6MA 2FFUA 1DQ5A 1HKDA 2CWMA 2ARBA 4ASMB 3WINC 1MR5A 5T5PA 1PZ7A 1YYNA 2PELA 1V6WA 3WMUA 3D4KA 1M2TB 4OW4A 5BOWA 1II4A 3DUIA 1HWMB 5EHAA 2FHRA 5DUUA 1BFGA 5GLTA 2YV8A 2AFGA 5JOXA 3RG0A 4J2KA 3OYWA 1EYLA 4LBOA 1APNA 3MALA 1MS8A 1ZA4A 4H04A 1QQKA 1JT7A 1LU1A 3P6JA 3QR5A 3ZC8A 4LBNA 3BRGC 1AX0A 1BFBA 1FYUA 4OWKA 1RY7A 4K1ZA 1LOCA 1V6KA 1TEIA 4I4QA 4Y20B 2RSTA 3M2MA 1QNWA 4Y1XA 4YZ4A 1YTOA 2VU9A 2PHWA 3QLQA 3N0KA 1LGNA 1HKNA 1JUIA 1QNYA 3AX4A 5GALA 3HBWA 4I6IA 2FO1A 4I4YA 1GBGA 1G9FA 3C89A 1ULDA 4KBBA 4DENA 3WCRA 3N3HA 1JLYA 4Y1YA 4CZSA 1S1AA 2ZMKA 3OBRA 4M3CF 1JT4A 4YM3A 4Y1VA 4AN6A 2GDFA 5GLUA 3O49A 4GAIA 1PC8B 7I1BA 3WHTA 4ISQA 2D24A 2CWSA 4FVVA 2GNDA 2UWBA 1GZWB 3QIZA 3ZXFA 1TWEA 4TZDA 2NZ9A 3IIRA 2D20A 4LO7C 1N3PA 3QW7A 3BAGA 3VKLA 4M01A 4XJ9A 1IT0A 3NF3A 1I3HA 2DYCA 4LO0C 2GNTA 4IONA 2NN8A 2UU8A 1BASA 2MLLB 4ZA3B 1S0FA 1TOOA 4G6JA 1HQLA 1Q8PA 3I29B 2DS0A 1Q8OA 4GXLA 4Q9GA 3BAVA 2DURA 4WV8A 4XJAA 1HDKA 2EXKA 4HEVA 2D3SA 2ZGPA 3ZSLA 5D62A 3RSJA 3ZURA 1LOEA 3FUOA 1IILA 1LCLA 1IOBA 1F82A 4OUJA 5H9SA 2R16A 2W08A 2A71A 2R9KB 4UW5A 3ZXLA 3QJ0A 3AKIA 2Q9XA 2WRYA 4QKSA 3NBEA 4IY8A 2ZKNA 4L8QA 5HCBA 2EAKA 5IK7A 4LO0A 1SBFA 3ZC9A 5FREA 2ILPA 2E51A 3LSEA 1ZL5A 3A22A 1SLCA 21BIA 2W2DB 3CAHA 4Q1PA 1WW6A 1W6QB 2A6WA 4OWJA 3ZUQA 5T54A 2HWAA 2Y9FA 4YOLA 4HJJA 1ISYA 5BQMA 1N1YA 5JDBA 4FPJA 2ZGNA 1SR4C 1R1ZA 2VY0A 2P3IA 5DZUA 1HWNB 4Y22A 3N7KA 3AXDA 2DTYA 5KXBA 4JC1A 3AJ6A 1DQ2A 1QOSA 5CNAA 3TC2A 3VSZA 3ILNA 2MIBA 5SV8A 1IJTA 4ELCA 1ZKWA 4USOA 1AZDA 2VXRA 5T5OA 1QXMA 3ZYRA 3HALA 3IN9A 3Q7WA 2W39A 3QYDA 4YW1A 3WDUA 4TYSA 3WVJA 1Q1UA 2D7FA 4YZ5A 2P2KA 5IK4A 1SFYA 1V00A 2JECA 1LEDA 4JCKA 4DRVA 2VUAA 2Z49A 1QKQA 1FMMS 2GALA 3FFZA 1W6OA 3QW8A 1LHNA 1V6JA 1W6MB 4JPZA 1RMLA 4IHZA 4F83A 1HWOB 3W59A 5DUWA 2DTWA 2KLLA 4G1RA 3M3OA 1F5FA 4CJMA 3RMYA 4XTMA 2DVGA 2HYKA 2VH9A 3AH4A 1FN0A 1Z7HA 3IAGC 6I1BA 2C9AA 4EFQA 2A6ZA 8I1BA 4NOTA 2NTDA 5E8AA 1IS3A 4ZFUB 2EIGA 3WG2A 1N3QA 2ERFA 1W6NB 3BA5A 2W52A 3LCPA 3UJ4A 3O12A 1G9BA 2ZGTA 1WW4A 4ZOTA 2RG9B 4FOVA 1V6NA 1GZCA 2ZGUA 5DUXA 4BM8A 3NJ5A 1RITA 4CTEA 1XHBA 2WT2A 2K4AB 3FLTA 1VAMA 5IUQA 3ZXDA 5GLWA 5BVPI 3D6EA 5BXSA 2ISEA 4XBQA 4M3CE 4XFTA 1TP0A 4XHXA 2FDBM 4I4VA 3PVOA 1DQ1A 2D6NA 5DG1A 1MVEA 2ISGA 4RL7A 1BARA 2UWAA 1AFCA 1DFQA 4AWDA 4Y1UA 1LESA 3OY8B 3BIWE 2KI6B 1T9FA 1OQ1A 4GA9A 3OGGA 5FZZA 1TWMA 3WZ1A 3UL2A 4PC4A 1NLSA 1GLHA 3O0VA 1MZ5A 1AXZA 5BQUC 3QW5A 3CRIA 2E6VA 4ZBVB 1S0GA 1V6UA 1T3AA 1IRPA 4G9MA 4YLZA 1IS5A 3F1RA 2Q3NB 5GLZA 1CJPA 3FJDA 1FNYA 1LECA 4QD2C 4XFUA 4K20A 4JAWA 2IMCA 4A7KA 4PCRA 1BA7A 3V0BA 3DS9A 1MACA 3B9UA 5FRAA 4Q8KA 3AH1A 4EFRA 1QDCA 3FIIA 2E53A 4P9XA 5F5QA 2WLQA 2WJSA 3AJZA 2Y9WC 2A70A 1YO8A 3R05A 2W68A 4KEJA 3TAYA 2P34A 5GZFA 4J2YA 2DU0A 5CAZA 3IPVA 1JW6A 2KH2A 3MW4A 3AP4A 1A3KA 3N7MA 1UX6A 3BA7A 1UAIA 3WNXA 1E0OA 4I30A 3FJCA 3O5WB 4L4IA 3BADA 3AYCA 4AVTA 3KMVA 1XTFA 5BQUA 4FPOB 4ZGRB 2D44A 4EJ5A 4MYEA 2LALA 1BQPA 1IHKA 5T5JA 3Q7XA 2F2FC 5DUYA 3AXEA 1VAVA 3PUBA 5BQNA 2FPQA 1KNMA 3AKFA 2ZGLA 1QOOA 1MS1A 1LOFA 5FNWA 5EG6C 3AZYA 1AVWB 1IKPA 1FAYA 5IK8A 1YBIA 4LBJA 1UL9A 3SISA 3CA5A 4Q27A 2A5ZA 3BX1C 2R1DA 4IY9A 1ULGA 2DRYA 1ENQA 2AQZA 4YM0A 4FPHA 1E1HA 5BP5C 1FWUA 4ZKTB 4P9YA 2WSUA 4BLIA 3H6QA 3K3QB 3PJQA 1C57A 4P0JA 2DUPA 3T8SA 3ASIA 3WG1A 4W65A 2A6VA 3HN1A 1HWPB 4C1XA 4LO8B 5GAQA 2XOAA 3A23A 2J3PA 2F2FA 1QGLA 5IT6A 3V65A 5T52A 1Q04A 3O0XA 4HR6C 4A7YA 1EV2A 2DRZA 4IZXA 2E4MC 4X39A 1AVBA 2QYIB 1LHUA 3ATGA 2VXTI 1WUVA 2X2TA 3QIXA 1G7YA 2CYFA 5JMCA 5KXEA 3DDBA 4USPA 1BXHA 4WZFA 3AJ5A 3JUUA 1ILR1 2Y9GA 1IKQA 3T2TA 1KJLA 1Q03A 1MD6A 4Q91A 2GZBA 3UJ0A 4AYUA 3FUQA 4UW3A 3D3XA 1N1TA 1ISWA 1DYPA 5BP5A 1ZN3A 2UURA 2FFVA 4WBCA 3WG3A 2ZA9A 4FP3A 1N3OA 2D43A 3WOGA 2LTNA 2NMNA 4HANA 3CA0A 3O3QA 1UN1A 2WBCA 4I3NA 4DCKC 4I4UA 3BAQA 1Z0HA 3WLUA 5GLVA 3AZVA 2FMDA 3O0WA 2JDZA 1UKGA 2GMPA 1DQ0A 1G9DA 4IZEA 1UPSA 3ZSJA 1M16A 5GZEA 2E4MA 3AYEA 1SBEA 1LENA 1AJOA 1LODA 1G9AA 4Y24A 4DFSA 2YROA 1HCEA 3NBDA 4LBQA 2D6PA 1XZZA 5DZEA 2ZGMA 3ZPYA 4BMBA 1X50A 2DWRA 1GYKA 1TIEA 1LULA 3CQAA 4YFZA 5DZFA 1WBAA 5H9QA 3N36A 2BEBA 2GO2A 4XOGA 5H9PA 5D61A 3VT2A 5BXRA 4AN7B 1ULEA 3PMEA 1LGCA 2GMEA 5DUVA 5DXDA 2SBAA 4AGRA 3IKWA 5EYXA 1FX5A 3BAHA 1K5VA 1W6QA 4GKYA 2ZABA 1DQ4A 4FQ4A 4WVWA 3Q7YA 1VIWB 4LBMA 1D2SA 1Q8QA 3AKGA 1CVNA 2MC2A 1JT5A 3N35A 4FOYA 1BLDA 1FATA 3D5OA 2A75A 5BYNA 2DREA 1WD4A 2EXHA 4J2XA 4R9AA 2R0FA 1URXA 1Q56A 4YW5A 3FJ9A 1ABRB 1SLTA 2P3JA 3UD7A 1S0IA 3AFKA 1LU2A 3AZXA 5DVHA 5E88A 3HMYA 3WO4A 3O4BA 1ULFA 1K5UA 1CVSA 1T3CA 3FJHA 2UUSA 3VKNA 2WKKA 2PHFA 5CB7A 2HW9A 2NMOA 4J1LA 3U4XA 5IK5A 1V6LA 4GALA 3NWKA 3IM7A 4OWLA 2CNAA 4DS0A 1DQ6A 31BIA 2JE9A 2D7IA 1Q8VA 3FJKA 3UD9A 1LOGA 2A3YA 1BYHA 5JLVA 4XTPA 1YI7A 2D6OX 3I2XA 3BAUA 2AUYA 3B3QE 4R9DA 1V6VA 2IMAA 4YGCA 1GSLA 1EPWA 3I2AA 5FNXA 1C4RA 4GWMA 5GZGA 2BEAA 5DSSB 2DUQA 5JOZA 4KC3A 1QF3A 1IS4A 3ZUSA 1W6NA 3ZYPA 1OFSA 3WDXA 1ZL6A 1UZZA 1S0EA 3E8LC 4YG6A 1WW5A 3SNMA 1BLAA 4XMIA 4JRAA 1N1SA 1O4YA 3OJVA 1AXMA 1ULCA 2WT1A 3CA6A 1S0CA 1JYCA 4YZ2A 4GAFA 4DRRA 1PZZA 2H0BA 3APBA 4PBPA 3CA3A 4XJUA 1W6PB 3H6SE 2A6XA 3FJJA 2G4IA 1WBCA 1IOAA 2DVAA 4X3AA 4Q2FA 4GKXA 3MEPA 5H9RA 4QBCA 5FZYA 1LJ7A 3V79C 1H9PA 4K1YA 1N1VA 2ZGOA 1SCSA 4DPNA 5EXOA 2ES3A 2L5XA 2FGFA 4AVSA 3ZX7A 1DZDA 2GNMA 4LO7B 3GNEA 5EYYA 2ISHA 1WD3A 3DDAA 1DFCA 1JN2P 1Z78A 3O4OA 3MW2A 1OKQA 1GZ9A 2PHTA 3M3QA 5JVVA 5BXTA 2G7KA 3RQ0A 2JE7A 2AR6A 1CE7B 3NBNA 2XHLA 3BONA 2R49A 1ZM1A 4U36A 5EC5A 2ZMLA 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