2NYYA

Crystal structure of botulinum neurotoxin type a complexed with monoclonal antibody cr1
Total Genus 385
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
385
sequence length
1294
structure length
1267
Chain Sequence
PFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNVGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHELIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNRKTYLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEANISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Molecular evolution of antibody cross-reactivity for two subtypes of type A botulinum neurotoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
molecule tags Toxin/immune system
source organism Homo sapiens
total genus 385
structure length 1267
sequence length 1294
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2006-11-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 2nyyA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2nyyA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2nyyA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 2nyyA01
3I4IA 1LEDA 4CRQA 31BIA 4Z8SB 3AYDA 2ERMA 1RZOB 3O49A 4JCKA 1IS5A 1QQKA 3B00A 2GN3A 4YZ2A 4LO7C 2ILPA 3JUUA 2W52A 2DV9A 1HKNA 4LO3A 1WBCA 3QIYA 3BA7A 3KM5A 1ZA4A 1MS0A 1N1VA 2ISHA 3BB2A 3B9UA 3DEBA 2JJ6A 4XILA 3H0OA 1J1TA 3BRDA 2CYFA 1UPSA 3FJHA 1CVNA 3CA6A 2E4MC 3WHUA 4FOWA 4G9MA 3PVNA 3QW8A 4XTPA 2Z48A 4I96A 2F2FC 4I1BA 4ZOTA 3BIWE 3H6QA 1WW5A 3KMVA 1QNYA 1V6NA 4I4YA 2CY6A 2D6OX 4PBPA 4XMAA 4KBBA 4J2YA 2FPQA 5DUYA 3NV2A 4DFSA 1KDKA 5KXDA 5BQMB 1GKBA 1QDCA 4GXLA 1CR7A 3W9TA 4BMBA 3NBEA 2NN8A 1BFBA 1A8DA 4FPGA 2GNBA 1LCLA 5GJ6A 5KXBA 3N36A 3SH4A 2YUGA 4GAIA 3NV4A 2Z42A 4UW6A 1Q8VA 4PQ9A 1HWMB 3QJ0A 2WQZC 4R9CA 1JW6A 2ARXA 3BAOA 1BLAA 1G9FA 4I4OA 4EB2B 3UD7A 3T2TA 3POWA 2WNEA 3WVJA 2VU9A 2LIEA 1A78A 1C57A 2YY1A 3AK0A 3AX4A 1PZ9A 5CB7A 4P0JA 4IQPA 1YYNA 2PHUA 3ZXKA 3NV3A 2ZR1B 2AENA 4FPJA 4M3CE 2ZMLA 1RMLA 4M3CB 5GLUA 2VXTI 3RG0A 5CA6A 1IHKA 2L5XA 4XXAA 4L8QA 1ULFA 3M3QA 2JDZA 1G9AA 1XYFA 1RY7A 4J2KA 3BADA 3Q9OA 3LSDA 4R6UB 3WV6A 3P6JA 3HR9A 4BM8A 3V79C 3ZUQA 3FUQA 2XHLB 1S0JA 3ZC9A 4EEEB 3POYA 1WUVA 2AGSA 2DWRA 2JD4A 2AH2A 1FYUA 1N1TA 3M3EA 3WINC 4ISQA 5DZEA 4XFUA 3CA1A 3AKIA 2D3RA 4I6IA 3BRFA 3PVEA 2E51A 3VKMA 5DZGA 1K5VA 2QN4A 1JUIA 1Z0HA 1LOGA 3VKFC 2ZBJA 2W68A 3AYAA 1TOOA 1LULA 3ZX7A 2ZKNA 2ZGRA 3PMEA 5IK8A 3IM5A 1LOEA 1DQ6A 3ZSKA 1XTFA 4FOYA 2WT0A 2D23A 5E89A 1ISWA 1S0IA 1UZZA 5JOXA 3FLPA 1CESA 1MC9A 3UJ4A 3A22A 2PHWA 2GNTA 4HJJA 3FGMA 5BQMA 3LSEA 1BFFA 2RQ9A 4Z8BA 4FPCA 2UURA 3BX1C 1DZQA 3WG4A 1Q8PA 3QW5A 1V6XA 2D1ZA 1WCSA 3FLRA 3AFKA 4Q9GA 5BQUC 1MACA 2DRYA 5T55A 1R1ZA 3MW4A 5GALA 5DZFA 1N47A 3A0KA 2DTYA 1T9FA 3AZZA 1G82A 1LHWA 2A70A 5I1BA 3WG1A 5DUXA 2KM2A 2R0HA 4DQAA 1S0BA 1JY0A 3UK9A 3FFZA 3N0KA 2VW2A 1WLDA 1LTEA 3V64A 3CRHA 1L2HA 4LO0C 2K8RA 3VT2A 3AJYA 3N7KA 3DUIA 2KI6B 4JPZA 1GZ9A 2BQPA 4FP3A 2P2KA 2OVUA 3V0BB 1U0AA 2W2DA 1SCRA 2F2FA 3F62B 2DVBA 4ISRA 1V6JA 3NBCA 3NJ5A 4Q1RA 2AFGA 4HEVA 4ZLBB 3FJ8A 5FZUA 1QU0A 5IK5A 1K5UA 3WLUA 2XHLA 3Q7YA 3A21A 2MLLB 4GOVA 2R16A 1LOAA 3LLPA 1ISYA 2AAIB 5F8WA 3WUCA 3ZSMA 5BQNA 4IHZA 4EL4A 2ZMNA 3AYEA 5BVPI 3AXDA 2AUYA 2D6LX 1WBAA 1G8WA 5FNXA 1JTCA 3WNXA 2GMPA 3O0XA 4P6AA 4GAFA 5JLVA 4ZGRB 4R9AA 1HKDA 1CIWA 2QYIB 3AJ6A 1V6OA 1A3KA 1ZL5A 1AZDA 5JOZA 1N4KA 2WKKA 3D5OA 4WZFA 3SNMA 3SH3A 1Q1UA 1G7YA 2FO1A 3WCSA 5HCAA 5BOWA 1ITBA 2EAKA 2DYCA 1BA7A 3DSEA 1VALA 3WMVA 1M2TB 4QKSA 2G7NA 4FPHA 3BTAA 5GZGA 4AVSA 4XMIA 2ZGOA 3A0NA 1SLTA 3ZYRA 4LBQA 1JYIA 3QW6A 4YW5A 2D24A 2NP0A 1H30A 2Q3NB 1FAYA 1ULGA 3JUTA 1O4YA 2A3YA 2QN0A 1SR4A 1S0LA 1D2SA 2Q9XA 3SLIA 3O4CA 3SISA 2PHFA 3WDWA 3USUB 1DHKB 1SLLA 1IOBA 4I3NA 1HLCA 3I2AA 1FV3A 3WINA 2FMDA 2NMNA 1HQLA 4H9WA 4YLZA 1V00A 3VT1A 2VXRA 2ZZJA 4BMEA 2BFHA 4QALA 2G7KA 1ENQA 1VIWB 1YVGA 3FJEA 3ZC8A 2ZHKA 3IAGC 3ZXDA 4D8HA 5T5LA 2GN7A 2UWAA 3ZPYA 2CL2A 3QYDA 3BOKA 3AYCA 3O12A 3N3HA 1UL9A 2KKIA 4XIKA 4A7YA 3LTQA 2P39A 4I2SA 3V0BA 1AF9A 1GICA 3IM6A 3VKNA 4FP2A 3Q7WA 3FJKA 3AH4A 1CE7B 1FN0A 4YW2A 4P9XA 1W6MA 4XXPA 1SBFA 4XJUA 5F8SA 5E24E 4QD2B 2KH2A 2ZABA 2OW4A 4LBMA 2FFUA 1LESA 3UJOA 4Q8KA 3APBA 4A7ZA 5T54A 1DQ2A 4G9NA 2MC2A 3AP6A 3RMXA 5GLWA 3HBWA 2A75A 4OZXA 4XFTA 3N35A 3VKLA 1KJLA 1YXWA 4JC1A 1II4A 5T50A 1WLWA 3N7LA 2Z49A 3WG3A 2PHTA 3POSA 2E53A 5CNAA 4YOLA 1PC8B 4I30A 4LO1C 3S8JA 5F8YA 1N3PA 4WVVA 1W3AA 1BASA 2ZGLA 4KEKA 3WO4A 3RRDA 1URXA 4LO0A 1MZ6A 2DVFA 4LBJA 4SLIA 2ZAAA 5BXPA 2NTDA 3ZUSA 4DENA 4I4VA 5JDBA 3EF2A 2YV8A 3FBYA 4YZ3A 5HCBA 4USPA 2FFVA 1HCDA 3WDUA 3O5WB 5T5JA 4XTMA 4JKQA 4YZ1A 2FGFA 4Y1XA 5GZEA 3OJ2A 1ZB7A 3RQ0A 4LO2C 3NF3A 1OKQA 4P14A 1W6OA 1UZYA 4P9WA 3E8LC 2D20A 1ZL6A 1MS9A 1LHOA 1DQ1A 4XOGA 4CZSA 3USUA 1LGBA 1MS3A 4XJ8A 1AFCA 1J0SA 1EPWA 3AZWA 2D6KA 4P0LA 2DVDA 1DQ4A 2P34A 3MW3A 3MPPG 3M3CA 4ZFUB 3UJQA 4KS6A 5FZYA 2W08A 1PWAA 1JXNA 2ISEA 2AR6A 3CU1B 4FPLA 4QC4A 3ASIA 3VUOA 1LJ7A 2IHOA 3Q7XA 1GNZA 1C4RA 1GGPB 4J1LA 1GANA 3B01A 1XTGA 2TEPA 1AX2A 1QOTA 2LALA 4LO7B 2GMEA 4U2AA 1GLHA 2A5ZA 4Q27A 1V6LA 4LBQD 3SNVA 5BP5C 3WOGA 4RA0A 2LTNA 1UKGA 2YZ4A 4I4QA 4DRVA 4QBCA 1G9BA 2B7YA 2H0BA 2A6XA 3F1RA 2WT1A 2R49A 3QCWA 4WBCA 1MS4A 1C1LA 4K20A 2Y9WC 4KTXA 4P0KA 3JU9A 3BAUA 2GALA 1LHVA 4EJ5A 1DQ0A 1GV9A 1LU1A 2AREA 3O4AA 3U4XA 2W2DB 2SBAA 4OWKA 1YRZA 5JOWA 4M3CF 2A3XA 5L73A 1SACA 2E7TA 1NXD1 3ILFA 2GNDA 1W6PA 1TEIA 5D62A 4D69A 1DFCA 2XB6C 4JRAA 2ARBA 5G00A 2RSTA 4PCRA 3PJQA 4Q8LA 4FPOB 1AJOA 2YMZA 4GP0A 3I2XA 4Z9WB 3D6EA 2BEAA 2HWMA 3C2UA 4XHBA 2EXHA 2P3IA 3AH1A 4I4UA 3R05A 3WA1A 1ONKB 2VW1A 4JAWA 2P37A 2MIBA 3INAA 3AZYA 5BXRA 2GDFA 1T3CA 2VW0A 1FQ9A 4XIOA 2ZGPA 4CJMA 4Q9PA 4UW5A 4EKXB 3OJMA 1BYHA 3WDVA 3FUOA 3BRGC 2EF6A 2VSEA 5DVHA 3RMYA 4IY9A 1I3HA 3MALA 2CNAA 1JT7A 4LBOA 3UL2A 4BQ1A 2WBCA 1TP0A 3D3XA 4I0YA 4HR6C 4QBVA 5F5QA 2VY0A 2BEBA 5EC5A 4NOTA 1O4ZA 3C89A 2ERFA 4I4XA 2DUPA 3IM7A 1FX5A 4GALA 3C9ZA 4ZJXA 1MD6A 4GOYA 1QKQA 1PZ8A 4YZ4A 4LBQB 3IM0A 1S0GA 4G1RA 1W6NB 1N1YA 3MW2A 1V6KA 2YROA 4X37A 1Z2VA 1S0FA 4LBKA 2D7RA 2DU1A 3BAGA 2IMAA 4YZ5A 3TAYA 4AN7B 3ILNA 2R0FA 1NZKA 3BAHA 21BIA 1ULDA 4Y1VA 1YTOA 3M3OA 3OJVA 1I1EA 3OBTA 1GBGA 4OEGA 1OQLB 1T4QA 3ZXFA 3HOMA 4HANA 1S1AA 3I8TA 1N3OA 1JT4A 3M1HA 4XZPA 2D6MA 4DPNA 5EWSA 3VV1A 2EXJA 7I1BA 2E4MA 1UN1A 3QR5A 3HSMA 4I37A 2J3PA 1BXHA 3WCRA 3AJ5A 2VH9A 5DSSB 2ZGNA 5E8AA 1AVUA 3GNEA 4X39A 3BONA 4XJWA 4FOQA 1V6VA 1AVXB 1HWPB 4ZFWB 1BFCA 1SLBA 1XG6A 3A4UA 1ULEA 5DUVA 4LO3C 3WG2A 5DG1A 1W6MB 2D43A 3O3QA 1T3AA 1KNMA 2CTVA 2D44A 1F82A 1F31A 5H9QA 5BXTA 5DZUA 4C1XA 3WDTA 1I1BA 3FJBA 3ZSLA 5FREA 4LBNA 1IKPA 1LHNA 1ISXA 2D7IA 5CAZA 3MEPA 2WLQA 3WO2A 3AZVA 1JLXA 1WLCA 1JQZA 1W6QA 3N7JA 2UWCA 5DG2A 3VWCA 4DCKC 4H04A 5FNWA 5BYNA 1S0CA 2W39A 3PVOA 1SLAA 2WSVA 5EG6C 1M16A 2HYKA 2PHRA 4I4SA 1DQOA 4M01A 2D3SA 4EFPA 1WD4A 1Z7HA 2D6PA 1DYPA 1MS5A 2RG9B 3ATGA 4FVVA 1FNYA 4ZKTB 1DZDA 1SLCA 1N3QA 1W3GA 1PZ7A 3L2YA 1RITA 1MVEA 3UD8A 1SBEA 1ENRA 5T5PA 3K3QB 1ABRB 4YGEA 4KEJA 3HMYA 3UD9A 3OYWA 1B09A 4D0ZA 5GZCA 2VLCA 1MS8A 1W6NA 5GLTA 5JOYA 1W6OB 1BKZA 2CWMA 1BLDA 4IZEA 3FJIA 1AVBA 2ZACA 2DUOA 1GZCA 1ILR1 1XZZA 3NV1A 1RIRA 1X50A 3WUDA 1P63A 2ZHMA 1R8NA 1CQ9A 2I1BA 3S8KA 3AP9A 4EFQA 1RINA 1R8OA 1TFMB 2EXKA 3SITA 3CRIA 3OGFA 2ET2A 5GM0A 4XBNA 1FATA 3CNAA 2ZGKA 5HPZA 3WDXA 1Q8OA 3CQAA 2D6NA 2WT2A 3IMNA 3BAVA 1JYCA 4D0TA 3V0AB 1CPNA 4YFZA 4Y26A 3HALA 3CRGA 2IMBA 4AYUA 2E6VA 3BOPA 3UDAA 4XFSA 4X3AA 4YM3A 1IS3A 4I8MA 4GKYA 3C8AA 2A6YA 1UAIA 4USOA 3QIXA 2JECA 2HW9A 4A7KA 4J2SA 4GWMA 3WZ1A 3R4UA 2NVHA 1TWEA 2ZMKA 1MZ5A 4R9BA 1IRAX 1AVAC 1TTUA 4Y22A 2DS0A 2VUAA 2XOAA 4IONA 5E88A 1FNZA 5BQUA 1LGNA 3CA5A 1LU2A 1WW6A 3ZXEA 1W6PB 1DZCA 2ZGMA 1WW4A 4XE9A 5EXOA 1ONAA 5H9SA 4OEEA 4K1YA 3FJDA 4PF5A 4KC3A 4FQ4A 3JRRA 4WVWA 4ITCA 1EVTA 4XHXA 3B69A 3SH5A 1AX0A 2G7QA 2R9KB 2CWSA 4KEIA 5EYYA 1YI7A 5SV8A 5T5OA 1KQRA 4DS0A 3BAQA 4BLIA 2YXSA 1H9PA 1DQ5A 1DQGA 2A7AA 2FDBM 1VAMA 1NLSA 4Y20B 1SZ6B 3FJ9A 2I2SA 1PZZA 4J23B 3O4DA 5D63A 3RSJA 4ZFYB 1SFYA 1E0OA 4R9DA 2GO2A 1SBDA 2D3PA 4XJ9A 1FWUA 1MR5A 5GLZA 4U36A 1N1SA 3RTIB 2WRYA 2C5DA 4GWNA 4AGGA 3GALA 3A07A 4GP3A 2A3WA 1F9KA 2ZGSA 1QDOA 5F9TA 1HQWA 4II0A 3T8SA 3VSFA 3OJBA 4OEFA 1BFGA 1KJRA 3FJAA 1DIWA 1WBLA 2UWBA 2GMMA 2Q5TA 1Q56A 4OUJA 5LK5A 1W0PA 3FJJA 2ZQOA 1YBIA 2KLLA 3V0AA 1ISZA 2C9AA 1IT0A 2ETFA 1CVSA 5F90A 2GZBA 4ZA3B 1AXMA 1APNA 5B2HA 3POKA 4YFWA 3ENRA 3NBNA 5GZFA 5D61A 1ISVA 1DJSB 4BPZA 2R1BA 1HCEA 4GKXA 3H6RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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