2NYYA

Crystal structure of botulinum neurotoxin type a complexed with monoclonal antibody cr1
Total Genus 385
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
385
sequence length
1294
structure length
1267
Chain Sequence
PFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNVGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHELIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNRKTYLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEANISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin/immune system
source organism Homo sapiens
publication title Molecular evolution of antibody cross-reactivity for two subtypes of type A botulinum neurotoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
total genus 385
structure length 1267
sequence length 1294
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2006-11-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 2nyyA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2nyyA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2nyyA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 2nyyA01
1WUVA 4XE9A 1I3HA 4C1XA 2XHLB 3WINC 1JT5A 2WNEA 3UD8A 2ISGA 1H9PA 1JN2P 1GZWA 5JOYA 4YW5A 2C9AA 5KXCA 3ZSLA 1VAVA 4TYSA 3AKFA 2TEPA 5BP5A 4L4HA 2FHRA 4A7ZA 2QN4A 3VV1A 3ZURA 1HCDA 1DGLA 1UL9A 3AX4A 2ZBJA 3IM5A 3BX1C 3QW5A 3CNAA 3VT1A 5FZUA 1Q8QA 1W0PA 4I4PA 3A0NA 3ZXGA 4LO0C 3BODA 4JKXB 4UW5A 1WBCA 1Q8OA 1LECA 5GLVA 1V6UA 4HA2A 3K3QB 1GANA 2DVDA 3WCRA 4G6JA 4Q91A 1II4A 2ZACA 1D0HA 5DZFA 2H0BA 1LEDA 4I4OA 3DS9A 1JQZA 2AAIB 1JXNA 3D7WB 3FGMA 2D3PA 3AXEA 3GNEA 1JUIA 5BXRA 2OW4A 3QLQA 4IYBA 1WD3A 4R9AA 2JDZA 2D6NA 1FNZA 1LU1A 1V6NA 5D63A 4YGEA 2IHOA 4DFSA 4YFWA 2VH9A 4GAFA 2A71A 3VKMA 3IN9A 1AVUA 2JKBA 1ZL5A 3RMXA 3P6JA 3RTIB 3TC2A 4WZFA 2EXHA 4GOYA 3V0AB 2NMOA 1R8OA 3KMVA 2W68A 2V5YA 2NVHA 3OGFA 3FJIA 1G9AA 1VALA 2ZGUA 1SLIA 3E8LC 4M00A 5T5PA 1XHBA 3O5WB 5CAZA 1Z0HA 1LOFC 2XOAA 3N7MA 3WCSA 4BMEA 4L8QA 1W6OB 5BQUC 3USUB 3T1LA 3AJ5A 5HCFA 1BYHA 3FUOA 3M3CA 1JLYA 3CA6A 3M2MA 1LEMA 4M3CA 5DG1A 4FOQA 1F82A 4Y1VA 5GZEA 1KITA 4I4VA 3AH4A 3RTJB 2EF6A 4P0LA 3POYA 1EYLA 3D5OA 2AYHA 3P6IA 3HBWA 1WBFA 1MS4A 4K1ZA 4YGBA 2ZR1B 2P3IA 4AN7B 4DRVA 1MR5A 4J23B 3UDAA 1YO8A 3PVNA 4ZFWB 3MALA 2D20A 4CRQA 3CA1A 3IM6A 2KM2A 1F31A 4FPHA 1S0CA 5DUXA 1BJQA 2RG9B 2FO1A 3SITA 4SLIA 1PUUB 4LO3C 4LO2C 3AJYA 3WG2A 1N3PA 2ARXA 2A6WA 4R9CA 3AJ6A 1BFGA 4XFUA 4IZEA 3A23A 3PUBA 4CJMA 3NBCA 4XKIA 4EKXB 4LBOA 3VKLA 9ILBA 1TWEA 4KEKA 1QXMA 3WVJA 3QW6A 2J3PA 2K4AB 2ZMNA 1BLAA 4K1YA 5JOZA 1WD4A 1PZ7A 3FIIA 2ZGTA 4BPZA 3FJ8A 2FFVA 3SISA 2ZA9A 1T3AA 3ZXJA 3WUCA 2DVBA 4Y1XA 1PUMB 3V0BB 3QYDA 1W6NB 1R1ZA 1KRIA 1SR4A 5DUUA 2FFUA 2ZQNA 5LK5A 3AKGA 1LHOA 4JAWA 1WBAA 3CQAA 1UX6A 3LSEA 4JC1A 3MW2A 4XOGA 1P63A 2YMZA 3HMYA 4Y22A 5B2HA 2X2TA 1SCRA 2QN0A 3WG1A 3FBYA 4BOWA 2PHXA 3F1RA 3I8TA 5F8WA 3H0OA 2W2DA 2UU8A 4XTPA 1K5UA 3QCWA 3O0VA 5IK8A 1H30A 1Q03A 1S0JA 1F9KA 3S8JA 3C8BA 4LO7C 1YBIA 2A6ZA 1IT0A 2R0FA 3PG0A 3C88A 1LOAA 1N1YA 1W6PA 4XFTA 3Q7YA 2P3KA 4IY8A 1AXZA 2FPQA 1IKPA 3T1MA 1YTOA 1YIFA 2D1ZA 1NLSA 1N1TA 4GXLA 2ZKNA 1A78A 3BB2A 1Z7HA 2EALA 1IOBA 1DQ1A 3BTAA 6I1BA 4HEVA 4Q8KA 1RITA 4YGCA 4I4SA 1GV9A 3M3QA 4P0JA 1LCLA 4XJUA 3QIYA 2ZGSA 3R4UA 3OBTA 4FPFA 3QIZA 3JUTA 1A3KA 3AYEA 3ZUSA 4CTEA 4AWDA 3HR9A 5JLVA 2VSAA 1Z2VA 1KJLA 4AN6A 1T9FA 1MZ5A 1RY7A 3SH5A 1W6QB 2IWTB 3VSZA 1X50A 1W0OA 4GOVA 3V64A 5BQMA 4FPJA 4FPOB 3B9UA 2WBCA 1TEIA 1BKZA 1Z78A 4ZFYB 3BAOA 4YW4A 1V6IA 3UJOA 5DUWA 3EF2A 2R0HA 1AX2A 2KI4A 5IK5A 2D43A 5H9QA 1QNWA 1H9WA 4OEEA 3VWCA 1BQPA 4P14A 1ISZA 3WHUA 5JVVA 3N3HA 1Y7BA 4YZ5A 3POWA 5T55A 1FX5A 1DIWA 1Q8PA 2FMDA 1IRPA 4LO7B 3M3EA 2UWBA 4MYEA 3O49A 1T3CA 3UJ4A 1WLCA 3O4AA 4XHXA 3NBNA 4J2SA 2A3YA 1DZCA 2BFHA 1D2SA 1XTGA 2F2FC 4Y24A 1LHNA 4ITCA 5T54A 1FGAA 3O0WA 3I4IA 2ZGNA 1CE7B 4LBJA 3H6RB 4LO1A 5HCAA 1BASA 2E51A 4ZA3B 4EJ5A 3NF3A 3SNVA 2AXMA 5G00A 5DZUA 5BVPI 5F90A 4PCRA 4I0YA 2KH2A 4EL4A 1C4RA 3ZC9A 3WG3A 4YW2A 4KUFA 5EG6C 3N7JA 2KLLA 5DSSB 4PBOA 3Q7WA 4QKSA 2B7YA 4XMIA 4M01A 4BLJA 2RSTA 1MS3A 3ILFA 1LOGA 4I96A 1MS9A 2VUAA 3ENRA 1ISVA 3T8SA 1JBCA 3V0AA 3MW4A 1RINA 1YXWA 3R05A 3WDYA 1I1BA 2G7NA 5T50A 3WMVA 5I1BA 1EVTA 1ONKB 5AVAA 4I4UA 3M1HA 4GWNA 5DG2A 2ERFA 3NV2A 2VW0A 3IM7A 4LBQD 4ELCA 2DUQA 2E4MC 1KDMA 4D0TA 1ISWA 4JQ0A 5IK7A 2ZMKA 3USUA 2ZMLA 1IS5A 1HDKA 5CBLA 3PJQA 5T5JA 3S8KA 4LBMA 2E7QA 2UURA 4I1BA 1J0SA 2CL2A 2R1DA 3FJDA 4G1RA 4EFQA 4FP2A 3OJ2A 3FJCA 1JLXA 2AR6A 2D3SA 1NXD1 2VW2A 4BMBA 4M3CF 3D3XA 4YG0A 3AFKA 3DEBA 4LBQB 1WW4A 2ZZJA 3AP5A 3ZYRA 1GNHA 2ISHA 4U2AA 1U0AA 2R16A 1SBEA 4WBCA 1AXYA 3AXDA 3LTQA 5GZGA 3ZSJA 1NUNA 3WNXA 4FOYA 2UWCA 1FV3A 2Q9XA 3H6QA 1DQ4A 2DV9A 1ZL6A 1DHKB 4R9DA 3WHTA 1W6MB 2A6XA 3VT2A 1SLCA 1UPSA 1C1LA 4W65A 4FP3A 4PF5A 2DU1A 1DZDA 3O4CA 2CTVA 1SLTA 3UL2A 3AJZA 3DDAA 1M2TB 4Q2FA 1BFBA 1ITBA 2Q3NB 4Q9GA 3NWKA 1W6NA 5IUQA 3ZX7A 3QW7A 3N7LA 2DVFA 2IMBA 4YOLA 3OYWA 4GKYA 1RG8A 2AUYA 3UK9A 1YRZA 4IQPA 4K20A 1JW6A 1TWMA 3DUIA 1SBDA 5H9PA 4I37A 4PQ9A 3P53A 5BP5C 4XJAA 1G9CA 1S0EA 4XIOA 2G7QA 2D44A 1DZQA 3BAUA 1G82A 4Q26A 4X37A 3WDXA 1PZ8A 2RHPA 2M49A 2A5ZA 1OKQA 2P37A 1JTCA 2HYKA 1CESA 5DXDA 3B9CA 1IKQA 1FWVA 2ILPA 3N7KA 4PC4A 2YROA 1ISXA 4NOTA 2A70A 4IY9A 1GGPB 3INAA 2GO2A 4XMAA 1WW7A 1GZ9A 2D7IA 4U36A 1LOBA 1TOOA 4ISRA 1S0BA 3CA4A 5EC5A 4Q27A 2D6LX 5E89A 2LALA 1V6LA 4ENDA 3I29B 2Z42A 1TFMB 4YZ2A 1IJTA 1CPMA 1ULEA 4QO3A 2GZBA 3N0KA 1FAYA 1BXHA 1LJ7A 3KM5A 5T5LA 1ONAA 1G86A 4BLIA 3VKFC 2GN3A 4GP0A 3ZVXA 1DQOA 4I30A 3RG0A 4H9WA 3C9ZA 4KS6A 2P34A 2Z49A 2ZGKA 4KTXA 1CR7A 5FREA 1HWOB 2FGFA 3BRDA 3NBDA 4XXPA 1S0LA 1JT4A 1GZWB 3BIWE 4YZ3A 2D6PA 1IS4A 1ZKWA 3CRGA 1JYCA 3FJEA 2ZABA 1OFSA 2DREA 3IIRA 4H04A 1QQLA 1JT7A 3QIXA 3AZXA 3ILNA 1DQ5A 3FJAA 2A6YA 2BEAA 2DWRA 4BM8A 4XXAA 1FWUA 1ENQA 4XJZA 4HR6C 1KDKA 1HQWA 5JMCA 3NBEA 1WCSA 1DQ2A 4FQ4A 4FVVA 5KXBA 4D69A 2ZHLA 4XJ9A 1DQ0A 4XJWA 3FUQA 3AKHA 3APBA 1BFFA 4XILA 1UZYA 3H6SE 3I2XA 5HCBA 3CA5A 1E1HA 3Q9OA 2MLLB 1IS3A 4R6UB 1CPNA 3ZXEA 3HN1A 1EV2A 3HOMA 1CVSA 3VSFA 4FQZA 4RA0A 3FJFA 2D6KA 1G8WA 2EXJA 3SH4A 4GP3A 2CWMA 2P39A 4A7KA 2AH2A 5CB7A 4Y20A 3IPVA 3O44A 4Q1PA 1FV2A 1QMJA 4P9XA 4A7YA 4P6AA 5JOXA 4FPGA 1LHVA 4DEPA 2GDFA 2DVGA 5HPZA 7I1BA 1QDCA 3WUDA 3OY8A 2VW1A 2GMEA 1SR4C 4FPCA 3BRGC 2LTNA 1G9DA 3AP9A 3FJKA 1O4YA 4AYUA 4AGVA 4M3CB 3QR5A 1ULCA 2R9KB 2WLQA 1GICA 2E7TA 3C8AA 4FPYA 2ISEA 3UD7A 1BARA 5KXEA 2KI6B 2DUOA 5DZGA 4J2KA 3FJHA 2Q5TA 3PMEA 4XBLA 1TTUA 1W3AA 1CJPA 2HWMA 2K43A 4Q1RA 1AXKA 2GNBA 3V65A 4DENA 5BXPA 1XZZA 3W58A 2XHLA 1FATA 3O4BA 4UW3A 3FJBA 1V6XA 4D0ZA 4YM1A 3AP4A 1T4QA 1APNA 2GNDA 3ZXKA 5FZZA 3D4KA 3R4SA 4USOA 4P9YA 4QALA 4Y1YA 2AENA 2PHRA 5T5OA 4QBCA 1GKBA 3N35A 3JUUA 2I1BA 3WO3A 2YV8A 1AVWB 3PVEA 2BEBA 1XQNA 2IMCA 1W6MA 2GNMA 1JYIA 1PZ9A 5CNAA 4WVVA 2GN7A 4QKRA 4QBVA 3POKA 4ZOTA 1BA7A 1LTEA 3NV1A 2HW9A 3WG4A 2VLCA 1S0IA 4JPZA 2PHWA 2P2KA 4YM0A 4ATFA 5BXTA 1LHUA 1LU2A 3FLTA 1JHNA 2NZ9A 1IILA 1HQLA 4XDQA 3VUOA 4FOWA 4NO4A 2D6OX 3ZC8A 1AXMA 2ZQOA 3FJ9A 2AFGA 5GLWA 4HL0A 2W2DB 4X3AA 2WJSA 5DUVA 4L4IA 4UW4A 4ZBVB 4YZ4A 2NN8A 2JD4A 1JT3A 1Q04A 3DSEA 3O3QA 3CRIA 4XTMA 3RQ0A 1IHKA 1LHWA 4Z8BA 2CY6A 3BAHA 5EYXA 4TLPA 3OJMA 2VSEA 4J2XA 1YF8B 4KEJA 3AZZA 2NYYA 1W6PB 1SLLA 1ISYA 4LO1C 1QQKA 3WINA 1ENRA 1YYNA 1FQ9A 3AZYA 1VLNA 3OGGA 3O0XA 2ES3A 31BIA 1L2HA 4Y26A 2EXIA 3UD9A 2K8RA 1W6OA 1N4KA 3CA3A 3BADA 4X39A 4LBLA 2UUSA 1SACA 4Z9WB 4RL7A 1MACA 4YM2A 3N36A 4OEFA 2D22A 3ZYPA 1QDOA 4ASMB 1FNYA 3ZSKA 1C1FA 2D6MA 1IRAX 4LO0A 3WLUA 3MPPG 4KBBA 2ZGLA 1YVGA 1V6VA 1PZZA 5BQNA 3ZXDA 2GMMA 5F8YA 5BQMB 3AZVA 4YGDA 2P23A 1F5FA 2SBAA 4F34A 4P0KA 1RZOB 4Q8LA 2NP0A 3JRRA 3VEQA 1CIWA 3W9TA 4FPKA 5GJ6A 4AGGA 4YW1A 21BIA 1DJSB 4IZXA 2PHUA 1V6JA 1WLWA 1V6KA 2E53A 1FYUA 4Y1ZA 2D23A 1MS5A 2SLIA 1PWAA 1OQ1A 1QKQA 3VKNA 2WKKA 1S1AA 5FRAA 1QU0A 4YW3A 4G9MA 2F8XC 2R1BA 4GKXA 1AX0A 5L73A 3AP7A 2A75A 1ZN3A 3B3QE 2YXSA 2DRYA 1SFYA 5CA6A 1A8DA 1M16A 3LLPA 2VY0A 3AYAA 2WSVA 1HWPB 1URXA 5DUYA 1W3FA 3WZ1A 4EFRA 4I1EA 1HKDA 3V0BA 1LOFA 3AZWA 1LESA 4K21A 3WDVA 5BQUA 1SLAA 3FJJA 1GSLA 5GLUA 2IMAA 1BZWA 5BXSA 1UKGA 4JKQA 3RSJA 2A3XA 5IK4A 2X2SA 1FMMS 4I4RA 3OJBA 3B69A 4OWLA 2OVUA 2C5DA 1JY0A 1BLDA 3BOPA 3BONA 2AGSA 3T2TA 4AGRA 1CVNA 4GA9A 2WRYA 3CU1B 1PC8B 4BQ1A 2DTYA 3ILRA 4Z8SB 1DYKA 3IM0A 5E8AA 1N1VA 4C1WA 2CNAA 4J2YA 5D62A 1FMZA 3ILAA 3VT0A 1ZM1A 4G6MA 1ZB7A 2LIQA 5IT6A 3WDWA 8I1BA 4LO3A 4LO2A 5E24E 2DU0A 4JP0A 2DUPA 3MEPA 5GZFA 1SBFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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