2NYYA

Crystal structure of botulinum neurotoxin type a complexed with monoclonal antibody cr1
Total Genus 385
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
385
sequence length
1294
structure length
1267
Chain Sequence
PFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNVGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHELIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNRKTYLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEANISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Molecular evolution of antibody cross-reactivity for two subtypes of type A botulinum neurotoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
molecule tags Toxin/immune system
source organism Homo sapiens
total genus 385
structure length 1267
sequence length 1294
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2006-11-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 2nyyA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2nyyA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2nyyA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 2nyyA01
4P9WA 5F8SA 3WZ1A 2P37A 2RQ9A 1G86A 2RG9B 2DURA 1D2SA 2GNMA 4DCKC 4I7IA 2ZA9A 3OJBA 2R0FA 4G1RA 4XJWA 3T8SA 3BAVA 4XMIA 2DU0A 4X38A 4YW1A 1CPNA 3AZYA 1BFFA 1N1SA 5BXTA 1KITA 1E1HA 1JHNA 2OVUA 1O4YA 2VW2A 1NZKA 2NP0A 3AYCA 1ONKB 3JUTA 4Q8KA 2A70A 1S0LA 1AX1A 3WVJA 1LOAA 1ZM1A 3AP6A 1UZYA 3QIYA 1YIFA 3NBDA 4PC4A 4YGEA 5F90A 3B01A 2AFGA 2D6MA 3BAUA 3AP9A 1APNA 2CNAA 2ZHKA 1A78A 2NYYA 3O0XA 2Y9XE 7I1BA 2GALA 2WBCA 1RMLA 2AQZA 2PHXA 5DUUA 3AKGA 2WNEA 4I4VA 5IUQA 5KXEA 4BLJA 5GLZA 5CAZA 1N3PA 1E0OA 5BXSA 1UX6A 1QNWA 4KC3A 1R1ZA 1QXMA 1NLSA 1QDOA 2YZ4A 1N3OA 3H6QA 2E53A 3BONA 4L8QA 1CPMA 3O3QA 3AXDA 2CY6A 3RSJA 5BVPI 1QQLA 4GWMA 1K5UA 3BA4A 3QCWA 4GAIA 3VT0A 2LALA 1GNZA 3AJ5A 1BFCA 2ZQNA 4GKXA 1WLCA 3B00A 3NBCA 1IRPA 5CB7A 4H9WA 3P6IA 5DXDA 1LENA 2AAIB 3A0KA 4A7ZA 3WG4A 3CU1B 3WINA 2V73A 4FPYA 1YXWA 2PHFA 2OW4A 4NOTA 3P53A 3FJJA 1CJPA 2R16A 3V0BB 1LU2A 2WT1A 2ZR1B 1TP0A 3ZXKA 2ZGRA 5H9SA 1BKZA 4TZDA 1WW5A 2XB6C 2TEPA 1LHWA 2E7QA 4LO1A 1GANA 3IN9A 4M3CA 4FPKA 4I2SA 3WDXA 1AVUA 4J2XA 2A6YA 1MS1A 4USPA 4QKSA 4J23B 4FQZA 1MZ5A 5D61A 1G9CA 4WBCA 2GMEA 3ZVXA 3F1RA 3CA1A 3N7JA 1DFCA 3ZUSA 3ZC8A 5G00A 1J1TA 4YZ5A 1QDCA 1JQZA 3OYWB 1MS0A 1WLWA 2E4MC 1HWNB 2EXHA 5EYXA 21BIA 1BASA 3A23A 3C9ZA 4GXLA 4KS6A 3LLPA 4DS0A 3AXEA 1W6OB 2KKIA 2DU1A 3VKOA 3HSMA 3OY8B 4Y20B 3VKNA 2BEBA 3S8JA 1W6PA 5GZEA 1QMJA 3ZXDA 5H9RA 3AK0A 3BB2A 3PJQA 2C5DA 1I3HA 2HWAA 1ZB7A 5D62A 2EALA 2ILPA 1QGLA 5KXCA 1MS9A 2VY0A 1V6UA 2IWTB 1DQ6A 1LOGA 2UWAA 1AFCA 1PWAA 2MLLB 2DVBA 5BOWA 1DLLA 1XTFA 4ISQA 4ZBVB 3WLUA 3DSEA 1S0JA 4H04A 1OQ1A 4YOLA 4BMEA 1CQ9A 1DYPA 1N1TA 2JECA 3RMYA 3ZSJA 5T50A 2EXIA 4IZXA 3ZXGA 3QYDA 1O4ZA 3FGMA 4FGFA 3H6SE 2HW9A 3ZYRA 4Q26A 3A22A 4I4QA 5GAQA 3NBEA 4H55A 5CA6A 5BQUA 2ENRA 3WDUA 4USOA 1IILA 1PZ7A 1RINA 3ZUQA 4J2YA 5F5QA 2F2FC 1ENRA 3BRGC 2IMBA 1FN0A 3D7WB 3WG1A 3RTJB 3WUDA 2VLCA 3FJ8A 4YW5A 4DFSA 3O0VA 1KDMA 4L4HA 1ISXA 4I8MA 4QBVA 2D7FA 1GNHA 5DZUA 4M00A 2D6LX 1ONAA 1IJTA 1GICA 1F5FA 1BA7A 2UURA 3CAHA 3BAGA 1FYUA 5JVVA 3EF2A 4XBLA 3H6RB 4XJAA 2D3PA 3AYAA 3KM5A 3SITA 3K3QB 1VIWB 2YY1A 3ZPYA 4FOVA 3V64A 1BYHA 2Z48A 4EB2B 4FPFA 1GSLA 1V6LA 4G9MA 5AVAA 1WUVA 3Q7YA 1DQOA 1V6VA 1W3GA 2WT2A 2FFVA 3WO4A 3NV4A 4R9AA 1IOAA 3BOOA 2H0BA 4UW3A 1DFQA 4FPGA 4KEIA 4Q8LA 1MS5A 3BRFA 4ISRA 4YG3A 3QW7A 4LBQD 2ZKNA 2PHRA 2Y9WC 5FNXA 1SR4A 3AZVA 1W6NA 3IKWA 1YO8A 3QLQA 2EF6A 1HWPB 1LOFC 2A6VA 3BOKA 4I4YA 3DUIA 3IM7A 3USUA 3ILFA 3HBWA 3UJ0A 4LO7C 2A3YA 1LOBA 1FGAA 3N7LA 4J2KA 4BQ1A 1CE7B 1VCLA 2ZAAA 3D6EA 1G7YA 1MR5A 3W59A 2D6PA 5GZGA 3UD7A 5BQMA 1N3QA 1W3FA 1GV9A 4I30A 4XTPA 2A71A 4LO7B 1G9DA 5JOXA 1Z4SA 1Z2VA 4M3CF 3OBRA 4LBMA 2ES3A 4DEPA 1SCRA 1ABRB 5E89A 2I2SA 1Q8PA 1FWUA 1JYCA 2ARXA 1I1BA 1WLDA 4CRQA 2ZHMA 3AJYA 3O0WA 5IT6A 3O49A 3UJOA 1LEDA 4OWLA 5JMCA 2WQZC 5FZZA 5T5LA 1IS3A 1KJLA 3JUUA 3M3EA 4LBQB 2Y9GA 1V6XA 3I2XA 2DS0A 4FPOB 3SISA 2K4AB 3DEBA 2BEAA 1FQ9A 1PZ8A 1QNYA 2D20A 3BWIA 4AVSA 1IKQA 4I1EA 3C8AA 4YZ2A 1XG6A 2NTDA 4A7YA 1WW7A 2GMPA 4XE9A 4FPHA 1C1LA 3UJQA 1CR7A 5HPZA 2KM2A 2AENA 4QC4A 1R8OA 1XTGA 4RL7A 2W39A 3WUCA 5KXBA 4XKIA 3OGFA 5EYYA 1Y7BA 3DGTA 2DTYA 3ILAA 1FNYA 3ATGA 4LO2A 2AUYA 2NM1A 1N1VA 5EWSA 2DVDA 3BADA 3RRDA 4A7KA 2D6KA 5DG1A 1BLAA 1YBIA 4ZFYB 1DBNA 1TTUA 2R1BA 1W6MA 1FAYA 1HIBA 2ZGLA 4G9NA 1W0OA 4LO3C 4YZ3A 4I6IA 2FO1A 2GMMA 3BX1C 1V6KA 3FFZA 4D0ZA 5HCAA 1ISZA 4BMBA 2G7PA 4JCKA 4XZPA 4I4PA 5IK4A 3V0AB 3A21A 4XMAA 1PZZA 4FPEA 2D23A 3QW5A 2WT0A 1YRZA 4Y1UA 1DQ4A 3WCSA 1S0GA 3AYEA 1HCEA 4ENDA 1Q1UA 4ATFA 2FHRA 3O4BA 31BIA 1EV2A 1ZN3A 2KI4A 2VW1A 1OKQA 2LIQA 1KJRA 1Q8QA 2UWBA 4XHBA 2K43A 5T5OA 5E88A 1JY0A 4Q9PA 4IYBA 1C57A 1RY7A 2YXSA 1HDKA 3I29B 3IMNA 3BOPA 3AH4A 2A3XA 1ENQA 1DYKA 1BZWA 4XJZA 3APBA 1WBCA 4OWKA 4JKXB 2P3KA 1GZ9A 2Q3NB 1DZCA 2UUSA 1FNZA 3OPZA 2ZGUA 3NWKA 4UW5A 1A3KA 4Q9GA 3V79C 1IS5A 4P0JA 2GDFA 2P3JA 1HKDA 4LO0C 2EAKA 4EEEB 5HCBA 3FUQA 3FUOA 1KDKA 1GBGA 1RIRA 1G8WA 2DREA 2FMDA 1Q03A 1YYNA 2OUJA 3C89A 3WG2A 3L2YA 3VEQA 2DV9A 1YF8B 1KQRA 1DQGA 3POYA 2ZBJA 2K8RA 2GNBA 4YZ4A 3C88A 1UL9A 4C1WA 4ZA3B 4D0TA 2ISEA 5GZFA 1GZCA 3WMVA 2AYHA 3N36A 4P9YA 1DQ1A 4GWNA 3MW4A 5BYNA 4WZFA 2BQPA 1TOOA 2AXMA 2D1ZA 2YUGA 4FOWA 3POWA 1ZA4A 1AXKA 3FLRA 3CRIA 1SACA 3NV3A 1WD4A 2NVHA 1LGBA 1W6QB 1T9FA 2VXRA 1DZQA 5JOYA 1PZ9A 1KNMA 4JQ0A 2A7AA 1HQLA 1XZZA 3VT1A 4NO4A 4PCRA 2W2DB 1URXA 4FOYA 1HWOB 3ZXEA 3AH1A 4JKQA 3AKIA 1JW6A 2ISHA 4UW4A 2ERFA 1T3CA 4XIOA 3M3OA 1LHNA 8I1BA 4BM8A 3HALA 1W3AA 2ISGA 3WNXA 1LGCA 4P14A 5EHAA 1AJOA 9ILBA 3POSA 3I4IA 4Z8SB 1YTOA 1LCLA 2DYCA 2E7TA 3CA0A 3D3XA 2P39A 1CESA 2F8XC 3SLIA 5H9PA 1JTCA 3VWCA 1AX0A 5BXRA 3SH3A 4OEGA 4IONA 4AGVA 4XJ9A 3P6JA 1SLLA 2P34A 4II0A 1JT3A 5GLTA 4Y22A 1D0HA 3LSEA 2DWRA 3VSFA 3MW3A 3A0NA 2ZMLA 1G9AA 4K1ZA 41BIA 4I3NA 5T55A 5GM0A 3VV1A 3SH4A 3C2UA 5FZUA 1NXD1 2ZGQA 3AJZA 2XOAA 5L73A 3NF3A 3HN1A 4ELCA 3O44A 5EG6C 3WDWA 1AF9A 1S0IA 3LTQA 1QOTA 3AKFA 4OWJA 5GALA 3BAQA 3TAYA 3CA4A 3FJFA 4JAWA 2ZGKA 3O4AA 3V0BA 2ZMKA 1CONA 2VUAA 4LBLA 5GLWA 4FPJA 1BARA 1DQ2A 1H9WA 4Q1RA 3ZXLA 1EYLA 1FMMS 1JT5A 1GKBA 1JN2P 1I1EA 1CIWA 3IM5A 1JYIA 1LODA 2GNTA 4G6JA 1JT7A 4LBOA 4ASMB 4EFPA 3IPVB 3AZZA 4RA0A 4KTXA 2EXJA 1PUMB 4AN6A 3FBYA 2W68A 2ZGPA 3OYWA 5E8AA 1SBDA 3O4CA 1Q8OA 4ZOTA 3ZSLA 2IMAA 4XXAA 3BIWE 3MEPA 3QIZA 1HQWA 2A75A 2P3IA 4UW6A 1WBAA 4Y1YA 3RMXA 1LGNA 3AX4A 2A6ZA 2WJSA 3RTIB 3WO2A 2G7KA 3GALA 2G7QA 2QN0A 3OY8A 1GYKA 4Y20A 5BQMB 4FPCA 3VKFC 4R9DA 2R9KB 3Q9OA 1S1AA 4FQ4A 2E4MA 3WHTA 4YFZA 4M01A 2AGSA 2D22A 2XG3A 3WA1A 3R05A 1S0EA 2VXTI 1PUUB 1DQ5A 4U36A 1SLCA 5DZGA 4XBQA 2MIBA 3H0OA 1LU1A 3PVNA 3ZSMA 3DDAA 3BA5A 4FPLA 3UJ4A 4IZEA 2ZHLA 4Z8BA 1Q04A 1LULA 5DUXA 2DVFA 5EC5A 4X37A 3DS9A 2Z42A 4AGGA 1TEIA 3NJ5A 2JDZA 4IY8A 1S0FA 2W52A 2NMOA 5FRAA 4Y26A 1GLHA 4Q1PA 4IHZA 1IS6A 2NMNA 3M3CA 5BP5C 2ZGTA 1WBLA 3ILNA 2ZGNA 5T52A 5T5PA 3ENRA 3FJIA 2DUQA 4Q2FA 3VKLA 4XFSA 1DHKB 2VU9A 3BODA 1UPSA 4ZLBB 3Q7XA 4OEEA 4P6AA 3FLPA 3IM6A 4IY9A 4DPNA 3OBTA 2X2TA 3HR9A 2ZQOA 1SBFA 3WO3A 1LECA 1GZWB 3WOGA 1QU0A 1RZOB 4YW4A 4JPZA 4XHXA 3OJ2A 1PC8B 4YLZA 5GJ6A 3WG3A 2ZGSA 3QW8A 4Y24A 2F2FA 2WRYA 1FV2A 2D44A 1AXMA 2ETFA 1VLNA 2XHLA 1V00A 4QD2C 3H6RA 1SLBA 1IT0A 1BFGA 1XQNA 1VALA 1T4QA 1V6OA 4M3CE 3AP4A 1JLYA 1BXHA 2P2KA 4X3AA 3B3QE 1Q56A 3SNMA 3O4DA 5BQNA 3QIXA 4WV8A 4KUFA 4FP2A 2KI6B 2PHWA 4FP3A 4QD2B 2PHUA 1ULGA 2CWSA 1F31A 4PF5A 5CNAA 1MC9A 1UMZA 3K1XA 1NUNA 2YMZA 1LOCA 2OUHA 5DUWA 4XXPA 3M3QA 1H30A 5DG2A 1MS8A 1BLDA 1G9BA 1CVNA 3FJDA 3M2MA 4XILA 4I4OA 4I37A 1Q8SA 3MPPG 3AZXA 3VSZA 2E51A 1XYFA 4OUJA 3POKA 4R9CA 1LOEA 2GN3A 2SLIA 3I8TA 4ZJXA 2V5YA 5F8YA 3UDAA 5GLVA 4R6UB 4ZKTB 1HKNA 1ZKXA 4Q27A 1LHUA 1ITBA 3ASIA 3TB0A 1JXNA 3R4SA 4P0LA 3AKHA 3IAGC 3ZSKA 2D43A 1BQPA 1LOFA 4IQPA 4GP3A 4HL0A 1T3AA 3O5WB 3W58A 4D69A 2Z49A 1ILR1 1JLXA 1LHVA 1P63A 1TIEA 3FJBA 3VUOA 2D3RA 4LO8B 1A8DA 4OEFA 1MS4A 5I1BA 3N0KA 2JE9A 5DUVA 4P9XA 1DGLA 1QOSA 5BXPA 5GZCA 1V6JA 4HEVA 2VSAA 4EFQA 5DSSB 1DIWA 2DVGA 4XBNA 2VSEA 2ARBA 2DRZA 4GA9A 4LBQA 3WINC 5F8WA 2A6XA 1RG8A 4YM0A 2FGFA 1AVXB 3OJMA 4XTMA 1WD3A 4I96A 3ZXFA 4G6MA 2DTWA 4GKYA 4ZXKA 1WW6A 3WCRA 1HWMB 4OZXA 2Q9XA 1W0PA 3WDYA 4HR6C 3W9TA 1MVQA 2WSUA 4LO1C 3FJAA 4WVWA 4Y1VA 2WLQA 2IMCA 2KLLA 2BFHA 2AREA 1UKGA 3RG0A 4DRVA 5FNWA 2FDBM 3A07A 5SV8A 5IK5A 2Y9FA 1TFMB 5FREA 4YM1A 1CVSA 4JRAA 2YV8A 4P0KA 4ITCA 4M3CB 4YGDA 4XYXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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