2NYYA

Crystal structure of botulinum neurotoxin type a complexed with monoclonal antibody cr1
Total Genus 385
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
385
sequence length
1294
structure length
1267
Chain Sequence
PFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNVGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHELIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNRKTYLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEANISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin/immune system
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
publication title Molecular evolution of antibody cross-reactivity for two subtypes of type A botulinum neurotoxin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 385
structure length 1267
sequence length 1294
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2006-11-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 2nyyA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2nyyA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2nyyA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 2nyyA01
5FRAA 4X39A 4OWLA 3MW3A 4XJUA 1ZA4A 2LTNA 1LECA 4LBQB 1PZZA 5GAQA 2ZA9A 3KQRA 2YROA 3ZYRA 4Y1VA 3O4DA 2D7IA 1DJSB 2F2FC 4DQAA 5HPZA 4I8MA 2ZGPA 1V6LA 4J23B 4YW3A 4LO1C 1DYPA 3AP4A 3B9UA 4DCKC 3FGMA 4I4QA 1Z78A 3IAGC 3WDTA 1LOGA 2HZ9A 3ZXEA 1G8WA 2NTDA 5DZEA 1YO8A 2EALA 1LHOA 2YY1A 1AJOA 4LO3A 2WBCA 2W68A 2DU0A 4EJ5A 1V6IA 3APBA 2CWMA 1RG8A 3ASIA 4YZ4A 4LO0A 1SACA 3WG2A 3OJVA 2MLLB 1G86A 3MEPA 1N3OA 2MC2A 3PVNA 3AH4A 1WD3A 2OW4A 3BTAA 2DWRA 4DENA 4I1EA 4XKIA 1GLHA 5GZFA 4CRQA 3JRRA 3PG0A 2W2DB 2WNEA 1GKBA 2R0HA 3ZXGA 1UMZA 4H9WA 4FOQA 2ZGQA 2VH9A 1EV2A 4L4HA 4L4IA 3AP6A 1WLCA 1QNWA 4OEGA 3O5WB 5D61A 3QJ0A 4XYXA 5T50A 1IS5A 1MACA 4Q9PA 3V65A 2G7QA 1CN1A 1BFCA 3BRGC 3SISA 2A3WA 2Q3NB 1Q8OA 1ULFA 3AZVA 4QBCA 3HOMA 3DGTA 3WDXA 1J1TA 1DBNA 2GMEA 3DSEA 4I30A 4ZFWB 3MW2A 1TWEA 4HA2A 1NUNA 5F90A 1IT0A 3IIRA 4FGFA 2DRZA 1RITA 21BIA 1SCRA 3IN9A 4W65A 2A3XA 2G4IA 3BB2A 2QYIB 2GALA 4KEKA 1ENQA 5IK7A 2YXSA 1N4KA 4KUFA 2ZKNA 2GN3A 4PBPA 3D7WB 1O4YA 3AYDA 1XYFA 2FHRA 3AZXA 1LHNA 4M3CA 2HWAA 2KKIA 4Y26A 3AJYA 1FNZA 1NZKA 5DUYA 4YG0A 1IRAX 3WMVA 2WT2A 4M00A 2VW1A 3NBEA 1G7YA 1WW7A 2DURA 1LOFA 4D8HA 1LODA 3POYA 5AVAA 3IM0A 5T5JA 4YFZA 4HEVA 3OYWA 2XB6C 2D1ZA 3HMYA 4CZSA 3CRHA 3WMUA 4FPGA 3BA5A 3FJKA 2DVDA 4IZXA 4G9MA 1AVAC 2UUSA 3CA4A 3U4XA 2LALA 3NF3A 2AQZA 3FJBA 4Z8BA 1ISWA 1HWPB 5JOYA 2D24A 4Q2FA 2ZHKA 5F8SA 4A7ZA 1CQ9A 1LTEA 1DHKB 1S0IA 3AH2A 2J3PA 1V6JA 4FVVA 5F8YA 3A22A 5IK5A 2FMDA 2EXJA 5T5OA 1JHNA 3BAHA 3I8TA 5FREA 2D20A 3LCPA 1DQOA 4CJMA 4Q27A 4FOWA 2ZABA 4BMBA 3CA3A 1CR7A 4Y1YA 1YTOA 3CRIA 3B01A 2JE7A 4QC4A 4AN6A 3SH4A 2CTVA 3RMYA 3BOOA 1LGCA 4ZKTB 4K1YA 3OGFA 4GXLA 3IKWA 1BFGA 2EXHA 1S0DA 2K8RA 2ZGRA 5EHAA 1Q8QA 1ISZA 4BPZA 5GLUA 1AXYA 4IQPA 3FUOA 4ELCA 1D2SA 1AXKA 2WT1A 3FJHA 3FJIA 3WINA 4I7IA 2DUPA 4JPZA 3O0XA 3O0WA 2JE9A 2LIQA 3UDAA 3H6SE 4R9BA 3PUBA 4I4RA 3FFZA 2BQPA 1SBFA 3JU9A 4UW4A 4JKQA 1IS6A 3VEQA 2D44A 5DVHA 4QKRA 2WRYA 2PHXA 1JLXA 3AK0A 1V00A 1K5UA 3IMNA 1QU0A 1FNYA 2PELA 1ULGA 2OUHA 2DVAA 3OYWB 2FGFA 4I3NA 4FP3A 1CJPA 4P9XA 3FBYA 4UW3A 3WUCA 1V6WA 5I1BA 1QGLA 2ESUA 1JOJA 1FAYA 4XIOA 5GM0A 2CY6A 1E0OA 3AZZA 2PHRA 3HN1A 4XXAA 3UD7A 1S1AA 4YGDA 4XIKA 3WO4A 4L8QA 1LCLA 2FO1A 5DUXA 3AP9A 3QW5A 5F5QA 1MVQA 3O5SA 2FPQA 3RTIB 1S0CA 1IILA 4EFPA 1CE7B 4Y22A 1JBCA 1JYIA 1FQ9A 1IKQA 4A7YA 2VXRA 3M2MA 3VV1A 3IPVA 2ETFA 5BXRA 2P34A 3AJ5A 3FLPA 1PUMB 1YBIA 2AXMA 3ZURA 2BEAA 4LBNA 1SLIA 3PJQA 5BXPA 5HCAA 5DUUA 5GLWA 3UD8A 3WLUA 3UD9A 1HWOB 9ILBA 1ULCA 4FPFA 1PWAA 3LSEA 5DZFA 5CB7A 4Y1UA 5T52A 2Z42A 3QIZA 3BODA 1JT5A 4XJAA 1IOAA 4JC1A 4DFSA 3C8AA 1DQ5A 3O4CA 2DUQA 2E7TA 5DZGA 1F9KA 2WT0A 1ZL5A 4P14A 2KI4A 3FIEA 4GAFA 2FDBM 3UJOA 3UK9A 5F9TA 2ARBA 4QKSA 5H9RA 3VKLA 4LO3C 1DYKA 4OW4A 4DEPA 1DIWA 1T3AA 1LEMA 2GNMA 3V0BA 1KDMA 1QMJA 3B00A 4LO0C 4J2XA 1SLBA 2AYHA 1FV3A 3POSA 1TP0A 1BQPA 4YM1A 2JJ6A 3S8KA 1V6KA 4P0LA 1LOBA 2W2DA 1ISYA 4C1WA 2R49A 3AZYA 4PQ9A 2OVUA 1UPSA 3ILFA 1C1LA 2ZR1B 1F82A 1MS5A 4JP0A 4WZFA 2GN7A 3B69A 1H9PA 5GZGA 3ATGA 2FFUA 3BA4A 4GKXA 2ES3A 4YLZA 2Z48A 4RA0A 3SH3A 1ULEA 5E8AA 2JECA 4EFQA 2W08A 3JUUA 3BA7A 4UW5A 4Y22B 1W6NA 2C5DA 4GOYA 1Q04A 5EWSA 1GGPB 1ENRA 2AUYA 3ZXFA 1W6PA 3IPVB 3ZXDA 3AKHA 1KRIA 3M3QA 3ZSMA 1QQKA 1MS3A 4FQ4A 5T55A 4JRAA 4F83A 1BLDA 1ILR1 5H9SA 1D0HA 2GNTA 1DQ1A 1G9AA 1BFBA 2EXIA 1YIFA 5IK4A 2ZGKA 2AGSA 4YZ5A 1BJQA 4P0KA 1WW4A 3QW8A 1DLLA 5BXTA 4NOTA 5F8WA 2W52A 2A6VA 1ZKXA 1MS9A 3Q9OA 6I1BA 4ISQA 4PF5A 4I4YA 1BXHA 1LOFC 4J1LA 3N7JA 2HYKA 2VUAA 2I1BA 1JTCA 5DG2A 5EYYA 3AYAA 3V0BB 4ZBVB 1X50A 1GBGA 3ZC8A 3WDWA 3LSDA 1GANA 3I2AA 1MVEA 3UL2A 2VXTI 5BOWA 3H6RA 1HQLA 2AH2A 3BX1C 4P0JA 3VSZA 5FZYA 2PHUA 4HR6C 4XHBA 1SBEA 4M3CE 1I1BA 1CIWA 1JN2P 4Y1XA 2AFGA 1CONA 1AJKA 2MIBA 1KDKA 3NWKA 4LO7B 5B2HA 3DDAA 2P3JA 4WBCA 3QYDA 3OJMA 4H04A 1TOOA 1OQ1A 4J2YA 3FLRA 3WG4A 2VU9A 1WD4A 1A78A 1IS3A 1HDKA 5CNAA 4YZ3A 3FUQA 1V6NA 1ZL6A 1JYCA 1UKGA 1ZM1A 5KXBA 4XDQA 5FNWA 1BYHA 3N3HA 3POWA 1W6NB 1W6OB 4DRVA 4TZDA 1IKPA 3WDYA 1R8OA 1DQ4A 1W6PB 3BRDA 3QIXA 2IMAA 2IWTB 2UU8A 1BASA 3WO3A 2ZMNA 3PVOA 3T8SA 1RIRA 5T54A 1ENSA 5CA6A 5T5LA 1ULDA 3N0KA 3WINC 2IMBA 4XILA 3ZXKA 1UN1A 1GZCA 1I3HA 4ZA3B 1JT4A 2I2SA 1QOTA 1XG6A 1W3GA 3CA5A 3D5OA 4PBOA 4R9DA 1AX0A 4Q91A 1Q8SA 3ZXLA 2C9AA 5HCBA 1UL9A 3SH5A 3N7KA 1AXZA 2A70A 5GZCA 3ZVXA 1WBAA 1AVXB 2WSVA 3RRDA 3H0OA 3DS9A 3NBNA 5BXSA 3A07A 4Y24A 5SV8A 3OBRA 2ZGSA 1NLSA 1LU1A 2P23A 1QXMA 2FFVA 3B9CA 4EEEB 1GICA 2K4AB 3RTJB 2D3RA 1ISXA 3D3XA 4BM8A 3UJ4A 3W58A 4XBQA 4FPEA 2HW9A 1MS0A 4YM2A 4AVVA 1YVGA 3H6RB 2JDZA 3AKIA 1FATA 1MS8A 3NV4A 1FV2A 2B7YA 5JOWA 4I0YA 4DS0A 2WQZC 3WOGA 2YV8A 4K21A 1DZQA 3WV6A 2NP0A 1RZOB 4FOVA 4J2KA 2UWBA 5JOXA 3FJ9A 5BQMA 3ILNA 4I96A 3N35A 4XFSA 1AZDA 4K1ZA 1AX2A 3VSFA 4JKXB 2DYCA 3ZSJA 2AENA 3V0AA 4XMIA 1DQ2A 2VW2A 5DZUA 3ZUSA 5GZDA 4AVTA 1S0BA 2NMNA 1FN0A 1DZCA 2SBAA 1AFCA 1QF3A 3WNXA 4IZEA 1F31A 3QIYA 2KI6B 2DTYA 2CNAA 5EXOA 3ZYPA 1RY7A 2GZBA 4XJWA 2WSUA 3VT2A 3EF2A 1FWVA 3O0VA 3AJ6A 2E53A 1SLLA 3NJ5A 5JLVA 4CTEA 1I1EA 1LENA 4EFRA 2AR6A 4HANA 1LJ7A 1WBCA 2CL2A 2G7PA 1S0JA 5T5PA 3I4IA 3BONA 5KXDA 3HSMA 1XHBA 2ZZJA 4FOYA 3P53A 2ZACA 1HWMB 4WVVA 5DUVA 3HBWA 1T4QA 4XFTA 2TEPA 5H9PA 3CA0A 3SNVA 3TC2A 1FGAA 2R9KB 5H9QA 3DUIA 1FMMS 2DTWA 1MZ5A 1M2TB 2D6PA 1DGLA 3VKOA 1APNA 3OGGA 4Q8KA 1URXA 1MZ6A 1HKDA 3Q7WA 4AN7B 2ZGNA 5BQNA 1KJLA 5JVVA 3BAVA 1AX1A 4A7KA 4LBKA 7I1BA 3O49A 4USPA 1ISVA 4XJ9A 3W59A 2OUJA 5EG6C 3DEBA 5CBLA 3CA6A 3WO2A 1YXWA 2D6KA 4PCRA 1M16A 2KLLA 1MS1A 4XBNA 3M1HA 3BWIA 1TTUA 4YM3A 4LO7C 3MALA 2VY0A 2VSAA 3DDBA 3QW6A 2D3SA 1V6XA 4ZLBB 3FLTA 3C2UA 1SZ6B 1GSLA 1T3CA 4FP2A 3NV1A 3MPPG 5BQMB 3FJFA 1SLTA 2EF6A 1W3AA 3WCSA 3I29B 1OFSA 3WDVA 1W0PA 1JT3A 3UJ0A 3W9TA 3NV3A 3VT1A 1RMLA 4P6AA 1XTFA 1EYLA 3AJZA 3V0AB 3RQ0A 4Y20A 2D7RA 4LO2A 2GMMA 2G7NA 1WW6A 3BAQA 3TAYA 3WHUA 1Q03A 2ZHLA 4ENDA 4ZGRB 2A6WA 4UW6A 1QOOA 3MW4A 4R9CA 3JUTA 3N7MA 1NXD1 1W0OA 1AVBA 2Y9XE 1IOBA 3FJ8A 3O4BA 4Y1ZA 3GALA 4FPYA 1G9BA 1CVSA 2Z49A 2ENRA 3UJQA 5DUWA 3RS6A 4D69A 2KH2A 4OWJA 4GAIA 1QDOA 3WZ1A 1N1TA 4XHXA 2YZ4A 3CU1B 2H0BA 2BFHA 1VLNA 2ISHA 5IT6A 2RHPA 2WJSA 3QLQA 2JKBA 1C57A 4EKXB 1GV9A 4OUJA 1SBDA 4QBVA 1R1ZA 1BFFA 3CQAA 3O4AA 4YZ1A 1JLYA 4AGVA 3CRGA 5JMCA 1LHWA 4XMAA 3ILAA 2A6XA 4ATFA 5HCFA 2EAKA 5L73A 1II4A 4K20A 5JDBA 4EB2B 1XQNA 4D0TA 2GO2A 4LBMA 1N3PA 1Q8PA 3HALA 1G9FA 3Q7XA 2ARXA 2E51A 1E1HA 1LGBA 4U2AA 4I4XA 4QO3A 4YFWA 3OY8A 1W6QA 2UURA 2DS0A 4YOLA 1BARA 2X2TA 4II0A 5IUQA 3A23A 5JOZA 4GP3A 41BIA 1MC9A 4BOWA 2V5YA 4KTXA 3WG3A 4DRRA 2R1DA 2G7KA 2RG9B 1YF8B 4HL0A 3L2YA 1W6OA 2PHWA 2V73A 1GNZA 5BYNA 1IRPA 1U0AA 1MD6A 1N3QA 2A6YA 2Y9WC 2GNBA 3Q7YA 1JXNA 2A75A 4YW4A 2PHFA 4I6IA 1HWNB 4Y20B 5GLTA 1S0GA 4H55A 4YGEA 3AFKA 3D6EA 3AKGA 1HLCA 3C8BA 1V6VA 1YYNA 3A0NA 2E6VA 5KXCA 3AXEA 4M01A 1LOAA 4YW5A 1BZWA 3KMVA 1KITA 4I4SA 2YUGA 2DVFA 4XTPA 3LTQA 5EC5A 3ZSLA 1W6MB 4ZFYB 1C1FA 2Y9FA 2DVGA 3FIIA 4QD2B 3K3QB 1DZDA 1UAIA 2DU1A 3SLIA 2A3YA 1S0FA 3PMEA 4YZ2A 1WBFA 3I2XA 4JAWA 1VAMA 4BLIA 2E4MA 4GWNA 5LK5A 1GNHA 2GNDA 1K5VA 1FYUA 1LGNA 1TEIA 3ENRA 1Q1UA 4TYSA 4DPNA 4LBLA 1A3KA 4LBJA 1TIEA 4J2SA 1JUIA 2F8XC 2ISGA 3VWCA 2UWCA 2IHOA 3VKFC 1PZ9A 3A0KA 2QN0A 1AXMA 1F5FA 4G6JA 2AREA 1OQLB 1SR4A 1N1SA 2R1BA 1WBLA 4XZPA 31BIA 1UX6A 4I4UA 4AVSA 4XFUA 3OY8B 1W6QB 5FNXA 2NYYA 1WLWA 2A7AA 3AZWA 1FWUA 1CVNA 1BKZA 4LO8B 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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