2NZ9A

Crystal structure of botulinum neurotoxin type a complexed with monoclonal antibody ar2
Total Genus 379
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
379
sequence length
1294
structure length
1267
Chain Sequence
PFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNVGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHELIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNRKTYLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEANISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Molecular evolution of antibody cross-reactivity for two subtypes of type A botulinum neurotoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
molecule tags Toxin/immune system
source organism Homo sapiens
total genus 379
structure length 1267
sequence length 1294
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2006-11-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 2nz9A02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2nz9A03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2nz9A04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 2nz9A01
1CR7A 3ZVXA 3QYDA 1XG6A 4IY9A 2MC2A 1Q8PA 3AK0A 3FUQA 2D7RA 1SLTA 2A3WA 1V6VA 2DRYA 1F82A 2ZGMA 5GLWA 4A7YA 3N7KA 4XJAA 1DIWA 1R8OA 1PWAA 3ILRA 2K43A 6I1BA 3PUBA 3IPVA 1WBCA 3JU9A 1Q1UA 3CRHA 4K21A 4YOLA 3POWA 1QXMA 1F5FA 3DGTA 1S0FA 1Z0HA 3NF3A 1IS4A 2DURA 1HLCA 5H9SA 3FIIA 1KJRA 2ZMLA 1J1TA 1JTCA 3WDVA 2DYCA 1QQLA 2ZMNA 2HW9A 3UDAA 1GKBA 3AXDA 2WQZC 4FVVA 4YGDA 4YM3A 1TOOA 3CU1B 4BMBA 4G6MA 1IOBA 3SH3A 1SFYA 1FNYA 4X39A 3QIYA 4FOQA 4Y1ZA 2HWAA 1W6PA 4LO3A 5JOXA 4P9XA 1Z78A 3K3QB 1X50A 2ZZJA 1TWMA 1K5UA 5BXRA 3FLTA 1YO8A 3WA1A 4J23B 5HCAA 4H55A 1LHUA 2A8AA 3BOOA 4U36A 1TEIA 2GO2A 4FPEA 2D6KA 5EYXA 4YGCA 2HYKA 1WLWA 2VLCA 3V0AA 2OUHA 1LESA 2PHFA 2WJSA 4Y1XA 4Z8BA 2KI6B 2D20A 3NJ5A 4HR6C 5IUQA 1ZM1A 1D2SA 1XYFA 3OGFA 4KUFA 4QD2C 4R6UB 3ZYPA 5JOYA 5GZDA 2FPQA 2DREA 1QU0A 4YZ5A 3V65A 3AP7A 4KC3A 1M2TB 2Z49A 4Q8KA 3I29B 4YW4A 4OWLA 4EFRA 1HQWA 1EYLA 4XIKA 4OEGA 2VUAA 4RL7A 3IKWA 1LENA 1W6NA 3INAA 31BIA 2ZGNA 2D3PA 2RHPA 3AKGA 3K1XA 3P6IA 4KBBA 1DQOA 3OJMA 2D6OX 3UL2A 4GKXA 2BFHA 4R9DA 1SLLA 5DZGA 4D0ZA 4XJUA 4XZPA 3E8LC 4GWNA 3QLQA 2ZR1B 3MW4A 4EKXB 1WW7A 1BYHA 2I2SA 2WNEA 4J2XA 3RS6A 4Q9GA 5D61A 1ULGA 3IMNA 2ZGUA 1IOAA 3AZXA 4FQZA 1DZQA 3ZXGA 3WINC 1BA7A 1CESA 1NXD1 2UU8A 5DUYA 3CNAA 1G7YA 4XJWA 4Q8LA 3OBRA 2PHWA 1I1EA 4ZGRB 21BIA 3AKHA 4PCRA 3USUB 1JT4A 3ILNA 3KQRA 1DZCA 1C57A 2AYHA 4G9NA 1YTOA 4QKRA 4JKQA 2B7YA 5DG2A 5T50A 4ZXKA 5BXTA 3FJDA 4YFZA 1V6LA 2GNMA 2GDFA 3NWKA 4WVWA 4YLZA 3NV1A 1G9CA 3ZUSA 1GBGA 1YF8B 3WO3A 5CB7A 1G86A 4M3CE 4AN6A 5BQMA 4TZDA 1MS8A 3AZWA 4AGVA 1WW6A 3HMYA 2GN7A 4YW3A 4FQ4A 2UWBA 3C89A 4YG6A 3VT2A 2ZGRA 2NM1A 1AVBA 5L73A 1RIRA 1GNHA 3JUTA 3FJFA 3V79C 2VH9A 2ETFA 4ELCA 3SISA 1H9PA 4P6AA 3V64A 2AENA 4RA0A 3N7LA 4ZFWB 2F2FC 3A4UA 5D62A 4FPKA 2ERFA 5IK5A 1DQ5A 3ZXDA 1MR5A 5GZFA 2Y9GA 4XOGA 5GLZA 3F1RA 3BOPA 3PHZA 2FMDA 2OW4A 5IK7A 3BADA 2F8XC 2E7QA 1Q8SA 3FJHA 1WCSA 3QW8A 3EF2A 4L4HA 4MYEA 4XHXA 3CAHA 3A21A 1ONKB 2VXTI 4I2SA 4R9CA 3VKLA 3WG3A 3UK9A 3CA6A 1V00A 4YZ1A 4LO1C 3WG2A 4BPZA 3N35A 1KNMA 1O4YA 2W2DA 3GNEA 1BZWA 4AVVA 1ZB7A 1PZZA 2FDBM 2GNDA 1GZWB 2ZQNA 4TLPA 4LBOA 2FO1A 4K20A 4ATEA 1CONA 3BA5A 5F8WA 4IZEA 3O49A 1FGAA 3O4BA 4P9YA 4R9BA 1W6QB 4Z9WB 4P0JA 1AVXB 5BXPA 2CY6A 3HALA 1BQPA 5BOWA 3MPPG 5H9RA 2EALA 4DRVA 1UN1A 5KXCA 4P0LA 2CNAA 2GZBA 3ZXFA 4OEFA 1VAMA 3DSEA 3QW5A 1XTFA 1A3KA 2P2KA 1DYPA 1PZ8A 2KH2A 1MACA 2FGFA 1QDCA 1UMZA 3AJZA 3AP6A 3C8AA 4YZ4A 1ISYA 5DUVA 2UURA 4X3AA 4DFSA 2K8RA 1LOGA 1DYKA 3LLPA 4Z8SB 1S0DA 3PVEA 2IMAA 3MW2A 2P39A 4D0TA 3VSFA 3AKIA 5D63A 3Q9OA 1ULDA 3AP5A 3R4UA 1SR4A 2YMZA 1FATA 2ISEA 4PBOA 2ZA9A 3AZVA 3S8KA 1SCSA 3FLPA 1ZL5A 4BLJA 2DVGA 5B2HA 3OYWA 2WBCA 2P23A 1NUNA 2P3IA 4BM8A 1OQLB 1S1AA 4FGFA 1SLCA 4Q27A 2LIEA 3QR5A 2CYFA 8I1BA 3GALA 4I4YA 2R0FA 4JRAA 3MALA 3P53A 2XHLA 4LO3C 4M3CB 1LULA 4W65A 2ZHKA 2P34A 2WT1A 5FZZA 3BAVA 1ULCA 1QGLA 4AVTA 4L4IA 5IK8A 1C1LA 2R1BA 4G9MA 4I0YA 1CN1A 1RINA 41BIA 2GN3A 1Z7HA 3BAHA 2J3PA 4YZ2A 1CE7B 3RSJA 2DTWA 5GJ6A 1G82A 1TTUA 3VT0A 1HQLA 3O5SA 1VALA 2W39A 1BFFA 2GMPA 2GNBA 2ZHNA 1LOFA 3NV2A 1HWOB 4HANA 2A7AA 1A8DA 1MZ5A 5GLVA 1ONAA 2D7FA 1RY7A 2XB6C 4XTPA 1TFMB 2D43A 3ZSMA 2E6VA 2D7IA 1XHBA 1LJ7A 4YGBA 3WLUA 1SBEA 2PHRA 1W6OB 3R4SA 4LBQB 4Y22A 2UUSA 2D6PA 3AZYA 2E4MA 1D0HA 1LU2A 3WO4A 2EXHA 4YG3A 2OVUA 3O4OA 1RZOB 3WMVA 5F90A 2EF6A 3N0KA 4ZBVB 1VLNA 4I30A 3RQ0A 4P14A 4FPGA 3OY8B 3O0WA 3H6RB 1ABRB 3HBWA 4WVVA 3WDYA 5FNXA 2A6WA 3BRFA 5FZUA 5BQUA 4XIOA 1S0IA 3AH1A 2CWMA 4XFTA 3CA0A 1EV2A 2A6ZA 2D22A 5KXEA 2EIGA 2DU0A 4OWJA 4DEPA 3D7WB 4OUJA 4Y20B 4ATFA 2LIQA 4JCKA 2R16A 2AUYA 3QW6A 2A70A 4TYSA 3AJ5A 3ZC9A 1Q8QA 4DCKC 2KM2A 1Y7BA 4CJMA 1DQ4A 2A3YA 3BAOA 4J2SA 1LCLA 1LOCA 4I3NA 4FPCA 3AYDA 3HOMA 3I8TA 4XXPA 1VCLA 5BYNA 4X37A 1ULEA 4AGGA 2TEPA 1Q56A 2JE7A 4GOVA 2ERMA 3BB2A 3T1MA 1YYNA 1S0BA 3PMEA 3JRRA 4GAFA 3VKNA 3H6QA 1YXWA 4Y1VA 4LO7C 2BEBA 3AX4A 2QN0A 3CA1A 1YI7A 4FPFA 1JQZA 3B3QE 4I4SA 1MS0A 1N1YA 4M3CF 4I4PA 4YZ3A 1MS4A 4D69A 3Q7XA 4QBVA 4Y24A 2E51A 1VIWB 5BXSA 2DVAA 3CRIA 2ZABA 4XJZA 3BTAA 3TB0A 4EFQA 3WDUA 4ZOTA 1FX5A 3WVJA 3BAUA 4DPNA 1C4RA 3FBYA 1V6OA 3ZXJA 1G9FA 1AXKA 1HCEA 3CQAA 3N36A 2AGSA 1JT3A 3BODA 5JVVA 2DS0A 5FZYA 1MS1A 2XG3A 4M00A 3C88A 1BJQA 4FOWA 2YY1A 4I4VA 4XXAA 4JAWA 1NLSA 3WG4A 3WG1A 3D6EA 1V6WA 1LHNA 3IN9A 1L2HA 3AJYA 1S0CA 2NZ9A 1ITBA 4F34A 2DUOA 3QIXA 3D5OA 1LODA 2ZGOA 5T5JA 4R9AA 2C5DA 2M49A 3LSDA 1MS9A 5HCBA 3VWCA 3O3QA 2ZGTA 2X2TA 3FJBA 1E1HA 2ZGPA 3VUOA 4QD2B 4IONA 1LHOA 2IMBA 3CA4A 1SLAA 4C1XA 1FQ9A 2VU9A 3IM0A 4AWDA 3ZXLA 2A75A 1MVEA 4Q1RA 4QO3A 3RRDA 4KTXA 1FWUA 1N1SA 1G9AA 1DBNA 1II4A 5GZEA 2EAKA 3SITA 3A07A 5CA6A 2C9AA 2R1DA 4GA9A 4SLIA 1IRPA 1Q04A 1CPNA 1QQKA 1ZKXA 3FJIA 3AH2A 5E88A 5BP5A 1PC8B 3V0BB 7I1BA 1PZ9A 1HCDA 2KLLA 2E53A 3BA4A 3FUOA 1LEDA 5LK5A 4QKSA 4M01A 2IMCA 4I4RA 2UWAA 3POYA 3M3EA 3JUUA 3ZSJA 1IJTA 1CVNA 4FPHA 4P9WA 5GLUA 4FP3A 2ZHMA 4Y26A 4DS0A 1Q03A 1UKGA 5E8AA 2A5ZA 4GALA 2AFGA 3P6JA 5EHAA 2ZMKA 3T8SA 2G7PA 1QDOA 1HDKA 4LBQD 2DU1A 4XILA 1TP0A 1MZ6A 2W68A 3DDBA 3M3CA 1UAIA 1SLBA 4H04A 4L8QA 2RG9B 4LO2A 1JBCA 1SR4C 3USUA 1HKDA 2EXKA 1HWMB 5EXOA 5EWSA 5GALA 1DLLA 2Y9FA 3WHUA 4G1RA 2RSTA 3WO2A 2JE9A 1AXMA 3A0NA 1IKQA 4YW5A 1A78A 1AVUA 4I7IA 1LHVA 2P3JA 3QIZA 2JECA 3B9UA 2FFUA 2BEAA 3ZXKA 5BQNA 1SZ6B 9ILBA 2PELA 2JJ6A 3ZXEA 1AF9A 4QALA 2ILPA 2A3XA 3OJBA 1HKNA 4II0A 5CNAA 4GXLA 1BFCA 1LU1A 2BQPA 4GP3A 2P3KA 2QYIB 3WZ1A 1Q8VA 4ENDA 3R05A 1W0OA 4LBKA 4UW6A 2R49A 5HCFA 1IILA 3M3OA 4YGEA 3NBDA 3BRDA 3M1HA 3CA5A 1GZCA 5F9TA 3LCPA 5EG6C 3S8JA 2LTNA 5FREA 1Z2VA 4K1ZA 3HSMA 2ZGSA 3VEQA 3BONA 1LOFC 1IS3A 3ENRA 1EPWA 1JLXA 1LGNA 4FOYA 1TIEA 4JPZA 2W52A 4ISQA 5DZFA 4UW5A 3WUDA 4YW1A 2DVFA 3CA3A 3CRGA 2CTVA 2ET2A 3RTJB 4NO4A 2WKKA 2A71A 2E4MC 4UW4A 1WD3A 3FGMA 1AVAC 1QNYA 1UPSA 4EEEB 1DJSB 2E7TA 1MS5A 4FP2A 3QCWA 2DVBA 2D23A 3PVNA 3VKFC 2L5XA 1SBFA 2YUGA 4FPLA 3AYAA 4ZFUB 1KDMA 4XFSA 5FRAA 1IS5A 2ZGKA 2CL2A 4ZLBB 5BQUC 1FNZA 1G9DA 2A6VA 4CTEA 1ZKWA 3DEBA 4OEEA 1GZWA 1JW6A 2NMNA 3FJJA 5F5QA 4U2AA 2LALA 4FPOB 1WUVA 4J2KA 4QC4A 3FJ9A 4Y1YA 1W6QA 4YM1A 4BLIA 3FIEA 5CBLA 3PG0A 1E0OA 1S0JA 3ZSKA 4ZA3B 1JYCA 4EFPA 3O4AA 3H6SE 4LBNA 1QNWA 1AVWB 1RITA 3B9CA 2AQZA 4ZFYB 1LTEA 1OQ1A 3ZYRA 1ISWA 3C8BA 4AYUA 5GZGA 3NV3A 4K1YA 1LOEA 4I1BA 3B01A 3B69A 3MEPA 1PUUB 2ISHA 3RMYA 3FJCA 3SNVA 4LO0A 1DGLA 5T54A 1MC9A 5HPZA 3A0KA 2CWSA 1AXZA 2D6MA 1GSLA 3IPVB 2PHTA 1ISVA 1YIFA 5JOZA 1KRIA 4D8HA 1FAYA 1FN0A 3I2AA 3VSZA 1HWNB 1EVTA 4ASMB 4XBLA 1DFQA 1GNZA 3O44A 1V6JA 4GWMA 2PHXA 4BOWA 1HIBA 4IHZA 2NTDA 1IKPA 1Z4SA 1QOOA 2ESUA 3AH4A 3O0VA 4XBQA 3ZSLA 4LBLA 3WDXA 1R1ZA 1WBLA 3KM5A 1BARA 3BA7A 2ARBA 1BFBA 1JT7A 1UZYA 1LGCA 1MD6A 3UD9A 4GOYA 3DDAA 3RMXA 3D3XA 2WT2A 1N3OA 1W6PB 3DUIA 2I1BA 2YROA 4M3CA 3WDTA 3ATGA 1BFGA 1Q8OA 2EXIA 3FJEA 2OUJA 3D4KA 3VKMA 4ISRA 1N4KA 1J0SA 2AREA 4IY8A 1V6XA 1IS6A 5DZEA 4YM2A 3AYCA 4LBJA 2G7NA 1ENRA 4BMEA 4USPA 1GICA 1ZA4A 4YG0A 1DQ6A 4YW2A 3FJKA 2HZ9A 3V0AB 1S0GA 1ENQA 2VW2A 5DXDA 2K4AB 2VSEA 1DHKB 2D1ZA 1MVQA 5DG1A 5I1BA 4XJ9A 3UJOA 3AJ6A 3N7MA 2VW0A 2WSUA 1T9FA 1AXYA 1M16A 1PZ7A 4CZSA 1GZ9A 3PVOA 3ZX7A 5E24E 3OJ2A 3WNXA 5AVAA 1W6MA 3VV1A 5DUXA 4FOVA 2NYYA 1OKQA 4GKYA 4KEJA 2DVDA 1SBDA 1NZKA 3I2XA 4JKXB 3IM5A 3UD7A 1W6OA 4LBQA 4LO8B 1ENSA 2D44A 5DSSB 1W6NB 1AJKA 5BP5C 5GM0A 3N7JA 3AZZA 3RG0A 3IIRA 1YRZA 1CQ9A 5T5PA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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