2NZ9A

Crystal structure of botulinum neurotoxin type a complexed with monoclonal antibody ar2
Total Genus 379
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
379
sequence length
1294
structure length
1267
Chain Sequence
PFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNVGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHELIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNRKTYLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEANISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Molecular evolution of antibody cross-reactivity for two subtypes of type A botulinum neurotoxin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin/immune system
source organism Homo sapiens
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
total genus 379
structure length 1267
sequence length 1294
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2006-11-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 2nz9A02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2nz9A03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2nz9A04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 2nz9A01
4G9MA 1UMZA 3UJQA 4BMEA 3ATGA 3CA3A 1SBFA 5GZCA 2ZGLA 4GOYA 2E4MC 2KLLA 3TAYA 2E51A 3SNVA 2JE9A 4OEGA 3AZYA 4XILA 1IOBA 3V65A 2CWMA 1H9PA 3LSDA 4PBOA 3F1RA 2EAKA 1GGPB 5EYXA 4YW5A 3ZXJA 1MACA 3QW6A 1YYNA 3AP4A 1W3AA 1N3PA 3O5WB 3S8JA 4YGEA 5T5JA 1H30A 3FGMA 4JQ0A 1I1BA 2Z48A 4ZOTA 1QKQA 1WW4A 2NZ9A 2ARXA 4I96A 4KC3A 4J23B 1RITA 3V64A 3UD7A 3RQ0A 3B01A 3A0NA 3NBNA 2ZGQA 2PELA 1SLLA 3WG4A 3LLPA 1WLDA 4HA2A 4IQPA 4Y1ZA 2K8RA 4Y20A 2NP0A 1AXMA 5H9QA 3PVOA 4OW4A 2OUJA 1O4YA 4LO7B 3N36A 1CIWA 3V0BA 4K21A 4HJJA 4Q26A 5FNXA 2D6MA 3AJ5A 2DUQA 1G86A 2R0HA 2UWAA 1EYLA 2D7IA 5DG1A 3NJ5A 2ISEA 5D61A 1HLCA 2D6KA 2XHLA 5DSSB 1SBEA 3O4OA 4LBQD 2YXSA 1AF9A 1MC9A 4YW4A 1FMMS 3CRGA 1ZM1A 1UX6A 1PWAA 2HYKA 4OWJA 1N47A 2LTNA 2CL2A 2IWTB 1W6PA 1DQ5A 3ZXKA 2DREA 4K20A 1W3GA 3JUTA 4QD2B 1EPWA 5BXPA 1UPSA 3M3QA 4P9XA 5JMCA 3O12A 1KDKA 4YZ4A 2FO1A 3APBA 4Q91A 2EXJA 3ILAA 4XYXA 2ZGNA 1HCEA 1AXZA 3BAHA 5T5LA 1Q8SA 4DS0A 4LO8B 1AX2A 1W3FA 5EG6C 4YM1A 1CR7A 1N1YA 3BOPA 4Y26A 4F83A 1Q03A 1J0SA 1ENQA 5F9TA 5JOWA 4KTXA 1IS3A 3KM5A 1LOFA 2KI4A 1DHKB 2EXIA 4AN6A 2WLQA 1BKZA 4P9WA 1QNWA 2RHPA 3AK0A 2DS0A 4FPKA 4Q1RA 2ENRA 2GNBA 3K1XA 2ZHMA 3BAUA 1BLDA 3AP9A 5T55A 1NLSA 4XJZA 4YG0A 1DQOA 1LHWA 31BIA 3ILNA 1XYFA 4YW3A 2GNDA 2MC2A 1F5FA 2RSTA 3ZSLA 2A97A 4GXLA 4LBQB 3N0KA 2D3PA 4H9WA 3D7WB 3SITA 4QC4A 1APNA 3AFKA 1Q8QA 3OBTA 1VCLA 4XJ9A 4I1BA 3HALA 3NBCA 4XZPA 4Q8LA 3CU1B 1SR4A 3RMYA 1VAMA 3QW5A 4XFUA 4USPA 4DFSA 2AQZA 1ZL5A 2Q5TA 4LBJA 3AJYA 1W6NB 1AZDA 1JUIA 1KJLA 3ZSMA 2WT0A 5D63A 5E8AA 1TOOA 4I30A 1OQ1A 1FV2A 3OYWB 1ZN3A 4OZXA 1Z7HA 2PHUA 1D0HA 3FFZA 1KJRA 1QMJA 4XJAA 3MALA 1V6UA 3H6RB 4R9DA 4XBLA 2NMOA 1TEIA 2YMZA 5LK5A 1AJKA 4LO0C 1C1LA 1R1ZA 3QIYA 1VIWB 4DEPA 4FP2A 5BQMA 1HKNA 4USOA 5F90A 2BEAA 5JOXA 1IILA 1TIEA 2Z49A 1Q04A 2D6NA 1LU2A 2V73A 3AP6A 5GLZA 1V6KA 2A8AA 2ZGPA 2WRYA 2P37A 4IONA 3I2AA 1BYHA 3WDWA 4AVSA 1IKQA 2AFGA 5DVHA 4ZGRB 2W39A 4YZ3A 1UZYA 2PHWA 4YGDA 2C5DA 2G7KA 3IM0A 4RL7A 5H9RA 4J2YA 2ARBA 1S0JA 2PHFA 5CBLA 3L2YA 5DXDA 1HQLA 1AXYA 1JOJA 2CTVA 2OW4A 2D6OX 2E4MA 2D3SA 4FQ4A 4MYEA 5FNWA 5T52A 1I3HA 2Q3NB 2L5XA 2WT1A 4XJWA 2HW9A 4M3CA 4SLIA 5FZYA 2HZ9A 3O0VA 4LO2C 1AVWB 3AP5A 1ZKXA 4KS6A 3M2MA 2SBAA 3SNMA 3BOOA 1LGCA 4GP3A 4ISRA 2M49A 1FV3A 3FJJA 1W6MB 1IRAX 1LULA 1JQZA 4X3AA 1SACA 1W0PA 2ZMKA 2GN7A 2D6LX 3MPPG 2NM1A 5F5QA 4XIKA 1KQRA 1BFCA 4EEEB 1S0FA 1N4KA 4R9CA 2Z42A 2EALA 1YXWA 1E0OA 2R1DA 3WHUA 3CA4A 4ZJXA 5GZDA 1NUNA 1W6QA 1YF8B 5GAQA 4FPFA 1F31A 3VWCA 5GLWA 2E7QA 2PHRA 3WMVA 2ZZJA 1FX5A 5GZGA 3AZWA 4YG3A 5IK4A 4F34A 1XQNA 4Q1PA 2VW2A 5BQUC 2DURA 2DVDA 2EXKA 1H9WA 3POKA 1HCDA 3OY8B 3BAQA 3WG2A 3AYAA 3ZXFA 1MS8A 3AYEA 4Y1YA 2DRYA 4P0JA 2QYIB 4R6UB 1PUMB 3ZXGA 2UURA 4XHBA 1DYKA 4DQAA 3VKMA 3ZYPA 3WA1A 3DUIA 3GALA 2Y9FA 1IKPA 3UDAA 2NN8A 4AVVA 1BA7A 2IMBA 1GKBA 3WOGA 4XHXA 4BLJA 4GKXA 1YI7A 4XXAA 1ULEA 4IY9A 2A75A 3ZURA 3UD9A 1K5UA 3AYDA 3BTAA 2EF6A 1N1VA 1GV9A 2A7AA 2K4AB 1R8NA 4FOYA 5FRAA 1QQLA 5DZGA 3H6SE 1OKQA 4DPNA 3AZZA 4JAWA 4FPOB 4Y22B 2VLCA 5FREA 1J1TA 1WBLA 3FJ8A 3VKLA 1WW5A 3DDBA 3PVEA 5BP5A 3O4CA 1G9BA 2NYYA 4LBLA 5BYNA 2ET2A 2UU8A 3AZVA 4YG6A 3NV1A 2ISGA 4HL0A 3BX1C 1U0AA 3R4UA 4YW2A 1SLBA 4H55A 2BFHA 2AENA 5H9PA 1MZ5A 3T8SA 1QOOA 4LO1C 1NZKA 3FLPA 4LO3C 1XTGA 1Z2VA 4M3CB 3FIEA 1GNHA 5L73A 5JDBA 3LCPA 3HN1A 1LJ7A 3RG0A 5FZUA 1SLIA 2P34A 1DQ4A 4EFPA 3I4IA 5IUQA 2W68A 4XOGA 1PC8B 2DU1A 4ZFYB 4I0YA 3ZSKA 2ZGTA 1EVTA 2W2DA 1GICA 2A6XA 1LHUA 4OUJA 4FPEA 2SLIA 1A3KA 4XXPA 4ZFUB 1JBCA 3V0AB 1CVNA 3QW8A 3POYA 2CNAA 4LO0A 2X2TA 1LOGA 2A70A 4ZXKA 4JPZA 1JT3A 3PVNA 3FJDA 3T1MA 2I2SA 2YUGA 1QDCA 3FJCA 4K1YA 3NV2A 1CE7B 5KXDA 4I8MA 5GLUA 2D6PA 5BVPI 1DLLA 4EJ5A 4Z8BA 2D20A 5GALA 4DENA 2AH2A 4XBNA 4M3CF 4I4VA 3ZXDA 5SV8A 1ONKB 1BFBA 5DUVA 4FOVA 1K5VA 4UW4A 4GAIA 4I7IA 3OGGA 2A6ZA 1LCLA 1DZCA 4I1EA 4X39A 4XFSA 3FJEA 1ITBA 2Y9XE 1LGBA 3FBYA 4TLPA 2UWBA 1LOCA 1XHBA 3JUUA 1AVAC 2YZ4A 2IMAA 3FJ9A 5I1BA 4A7KA 1SZ6B 3AH2A 3WHTA 4QKRA 1JYCA 3ENRA 1S0CA 1PZ7A 2A71A 4EL4A 4TYSA 2RQ9A 2A3WA 3NV4A 1BLAA 4LO2A 2G7NA 3FJHA 3UJ0A 2ES3A 1YIFA 3SH3A 3IKWA 1YTOA 3VSZA 5B2HA 3P6JA 1V6XA 1N1SA 1ZL6A 2VSAA 4DCKC 1G7YA 1QNYA 3BAOA 4YW1A 1D2SA 1T9FA 3IM5A 3IM7A 1ONAA 1Q8OA 1T3CA 3AYCA 3LTQA 4BQ1A 4C1WA 3B9UA 4LO7C 3B00A 4HANA 3ZSJA 3S8KA 1LHNA 3O49A 4YOLA 4NO4A 2Y9WC 2ZAAA 1BFFA 2IHOA 4YM3A 3JU9A 3WO3A 3AXEA 3IPVA 1PZZA 4YFWA 4J2KA 1ABRB 3AXDA 1XZZA 3ILRA 4YM2A 1WD4A 4YGCA 1TP0A 4WVWA 1IOAA 1ILR1 1JLXA 3DEBA 1JTCA 2E6VA 1HWPB 1V6JA 1OFSA 2ETFA 4OEEA 1FATA 1V6MA 5BQUA 5DZEA 1QU0A 4FGFA 2G7QA 4QD2C 5BP5C 1CPNA 5EXOA 3CQAA 4XBQA 2ZQNA 1S0BA 3B9CA 3AJZA 4Q27A 3O0XA 4FPYA 1SCRA 1BQPA 3Q7XA 1DJSB 3FIIA 1DQ0A 2ZKNA 5HCBA 4C1XA 1FWVA 1ZKWA 2E53A 2R0FA 3WMUA 3R4SA 5DUUA 3ZX7A 3HMYA 1ZA4A 2ZGRA 3RSJA 1WBCA 1WBFA 4FVVA 3TC2A 2QN4A 3T2TA 3P6IA 3BB2A 1JT5A 3U4XA 3UD8A 3VSFA 3USUA 1KNMA 4KUFA 3NV3A 1Z4SA 2ZMNA 2KKIA 1IRPA 3AKFA 1WCSA 2ZHLA 3BADA 4PF5A 1AFCA 5BXTA 1DQ1A 2ZGMA 4Y20B 4OEFA 3FUQA 3WG3A 1TWEA 2ESUA 5CA6A 1LOBA 1UZZA 3BOKA 2LALA 4ATFA 3HR9A 3V0BB 1RZOB 2WT2A 1LECA 4Y1UA 2W08A 3C89A 1SFYA 2KI6B 1Q8PA 1GANA 1QXMA 1YVGA 4M00A 2WNEA 4DRRA 5DUYA 2XHLB 1V6NA 2FDBM 4P0LA 1MZ6A 1KDMA 1GZWA 4ENDA 2DVBA 1S0DA 4XJUA 4LO1A 1DQ2A 4LO3A 1DIWA 5DZUA 1W6PB 3JRRA 3C8BA 1NXD1 3H0OA 3NBEA 2P3IA 2QN0A 1GNZA 2R49A 3N7JA 3N7KA 3AJ6A 1DBNA 3PHZA 3ILFA 4QBCA 3VT1A 2NMNA 2GNTA 3OBRA 3UL2A 3UK9A 5CAZA 1SCSA 2VXTI 1RG8A 4AWDA 4P0KA 1CESA 3A07A 3A4UA 5DZFA 3ZXEA 2UWCA 1FN0A 3D5OA 1RINA 1FGAA 2YROA 3BAGA 4YM0A 4Y24A 3FLTA 1V6LA 1W6OA 4AGVA 1OQLB 4ZKTB 4D0TA 3BIWE 3ZUQA 2C9AA 5DUWA 3BRGC 5IK5A 2DRZA 1ISWA 1IHKA 2EXHA 4YLZA 4K1ZA 3DS9A 2VUAA 1II4A 5T50A 1MS4A 4G6MA 5GJ6A 1Q56A 2D43A 1I1EA 1G82A 4AYUA 5GLTA 1TFMB 2D24A 5IK7A 3Q9OA 3WV6A 3W59A 4IY8A 5EHAA 3K3QB 4TZDA 1MS9A 1HWNB 4ZFWB 4PCRA 5GZEA 1V00A 3ZUSA 3D6EA 4I4PA 1DYPA 2F8XC 2JD4A 1CVSA 1G9DA 3QJ0A 2D7RA 4XMIA 3BA5A 1C1FA 3WDXA 4WBCA 2FFUA 2Y9GA 4XMAA 4D0ZA 3QW7A 3HOMA 2D1ZA 2I1BA 2LIEA 4EKXB 1S0GA 1SLAA 5IK8A 2D7FA 3WVJA 3IN9A 1WW7A 4I4QA 4GWNA 1AX1A 3Q7WA 3WUDA 1JYIA 1UL9A 3WO4A 1E1HA 1XG6A 3CRHA 4UW5A 2D22A 4KEIA 4UW6A 3C2UA 4OWKA 2R1BA 3AH4A 3VUOA 3AKHA 5BQMB 1HDKA 1ULCA 1KITA 4GKYA 5D62A 1T3AA 5DUXA 2OUHA 1MS0A 4GOVA 2E7TA 7I1BA 1N3OA 3MW4A 3OJMA 4U2AA 8I1BA 3M3EA 1LOAA 3MEPA 3PJQA 4FPJA 3MW3A 4BPZA 4ITCA 1HWOB 3EF2A 2P3KA 4D8HA 4I4RA 2UUSA 1O4ZA 4XE9A 4P9YA 4BM8A 1IS4A 1SLCA 3VKNA 1S1AA 1HKDA 5G00A 2A6YA 4ELCA 5T5PA 2BEBA 3OJBA 1FYUA 3A21A 1ULGA 1P63A 2A6VA 1JT4A 2G7PA 1V6VA 5H9SA 3ZYRA 3GNEA 3ZVXA 3OPZA 2A3XA 3QLQA 4XKIA 2ZA9A 2A3YA 1QOTA 2AUYA 4PC4A 2ZHKA 4KEJA 2V5YA 1PZ9A 4L8QA 3AZXA 2VXRA 3WUCA 3BA7A 4LBMA 5F8YA 3BODA 1TTUA 1RMLA 3DDAA 2WSUA 3RRDA 4J2SA 4Y1XA 3CA0A 4Q9PA 4FPLA 1T4QA 1BFGA 1JLYA 1AVXB 1F9KA 1VLNA 3Q7YA 3AKIA 2GZBA 3N7MA 1GZ9A 2ZR1B 1ZB7A 2F2FC 2VW1A 1BJQA 4FPHA 1W6QB 4PBPA 3ZC9A 3RTJB 5CB7A 3WINC 1AX0A 2VH9A 1DQGA 4JCKA 3O4AA 1MVQA 1CONA 1HIBA 4NOTA 4I2SA 3I29B 5E24E 4LBQA 2CWSA 4Q2FA 2PHTA 1FQ9A 2VU9A 1N1TA 4A7ZA 2LIQA 3CA6A 2YY1A 2ZMLA 1IT0A 3CA1A 2DVAA 4CRQA 3SLIA 4I4OA 3P53A 3BRFA 2B7YA 4FOWA 1WUVA 3WCSA 1BARA 2ZABA 1GBGA 1WLWA 4U36A 2R16A 1AXKA 5CNAA 3OJVA 4PQ9A 1G9CA 4ATEA 1W6NA 3WDTA 3BRDA 1LTEA 2GMEA 1JXNA 3OYWA 3WDYA 4ZLBB 4JRAA 2WQZC 1G9FA 1RY7A 2AREA 3WDVA 3H6RA 3N3HA 4HR6C 1PZ8A 3ZPYA 5IT6A 1KRIA 2XOAA 1B09A 3VKFC 1V6WA 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