3FFZA

Domain organization in clostridium butulinum neurotoxin type e is unique: its implication in faster translocation
Total Genus 344
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
344
sequence length
1251
structure length
1246
Chain Sequence
PKINSFNYNDPVNDRTILYIKPGGCQEFYKSFNIMKNIWIIPERNVIGTTPQDFHPPTSLKNGDSSYYDPNYLQSDEEKDRFLKIVTKIFNRINNNLSGGILLEELSKANPYLGNDNTPDNQFHIGDASAVEIKFSNGSQDILLPNVIIMGAEPDLFETNSSNISLRNNYMPSNHGFGSIAIVTFSPEYSFRFNDNCMNEFIQDPALTLMHELIHSLHGLYGAKGITTKYTITQKQNPLITNIRGTNIEEFLTFGGTDLNIITSAQSNDIYTNLLADYKKIASKLSKVQVSNPLLNPYKDVFEAKYGLDKDASGIYSVNINKFNDIFKKLYSFTEFDLATKFQVKCRQTYIGQYKYFKLSNLLNDSIYNISEGYNINNLKVNFRGQNANLNPRIITPITGRGLVKKIIRFCKNIVSVKGIRKSICIEINNGELFFVASENSYNDDNINTPKEIDDTVTSNDLDQVILNFNSESAPGLSDEKLNLTIQNDAYIPKYDSNGTSDIEQHDVNELNVFFYLDAQKVPEGENNVNLTSSIDTALLEQPKIYTFFSSEFINNVNKPVQAALFVSWIQQVLVDFTTEANQKSTVDKIADISIVVPYIGLALNIGNEAQKGNFKDALELLGAGILLEFEPELLIPTILVFTIKSFLGSSDNKNKVIKAINNALKERDEKWKEVYSFIVSNWMTKINTQFNKRKEQMYQALQNQVNAIKTIIESKYNSYTLEEKNELTNKYDIKQIENELNQKVSIAMNNIDRFLTESSISYLMKIINEVKINKLREYDENVKTYLLNYIIQHGSILGESQQELNSMVTDTLNNSIPFKLSSYTDDKILISYFNKFFKRIKSSSVLNMRYKNDKYVDTSGYDSNININGDVYKYPTNKNQFGIYNDKLSEVNISQNDYIIYDNKYKNFSISFWVRIPNYDNKIVNVNNEYTIINCMRDNNSGWKVSLNHNEIIWTLQDNAGINQKLAFNYGNANGISDYINKWIFVTITNDRLGDSKLYINGNLIDQKSILNLGNIHVSDNILFKIVNCSYTRYIGIRYFNIFDKELDETEIQTLYSNEPNTNILKDFWGNYLLYDKEYYLLNVLKPNNFIDRRKDSTLSINNIRSTILLANRLYSGIKVKIQRVNNSSTNDNLVRKNDQVYINFVASKTHLFPLYADTATTNKEKTIKISSSGNRFNQVVVMNSVGNNCTMNFKNNNGNNIGLLGFKADTVVASTWYYTHMRDHTNSNGCFWNFISEEHGWQEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Domain organization in Clostridium botulinum neurotoxin type E is unique: its implication in faster translocation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type E
molecule tags Hydrolase
total genus 344
structure length 1246
sequence length 1251
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2008-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3ffzA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3ffzA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3ffzA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3ffzA01
1BASA 5F8SA 4GWNA 2XHLB 3VKNA 1MS3A 1QQLA 3WG4A 2ZABA 3BTAA 1TFMB 1IT0A 1F82A 1ZL5A 4L4IA 4PCRA 1IKPA 1SCSA 5CNAA 4Q1PA 4LO2C 1V6NA 3B69A 3USUA 5DXDA 2ZGLA 1DYKA 3WG3A 2Q3NB 3C89A 3O5SA 2AXMA 1Q56A 3U4XA 2HYKA 2ZHKA 1JT3A 1M2TB 4XKIA 3I8TA 3I4IA 1LULA 1EPWA 1SLTA 3POSA 1KITA 2VSEA 1ENSA 1JXNA 3W59A 2AR6A 5FNWA 3WLUA 3N3HA 3UJOA 3WDVA 2VLCA 3WDXA 1ZKWA 4QBCA 4I6IA 5T52A 4K1ZA 2CWSA 3N7KA 1PUMB 3ILRA 3OY8B 1ISYA 3VSFA 3BOKA 3V0AB 2FHRA 2FFVA 3MW4A 1QQKA 4XHXA 5CA6A 1RMLA 2P3KA 3LLPA 2OUJA 2P39A 2NMOA 1BXHA 2E53A 4FPYA 3JUTA 3LTQA 4CZSA 3WA1A 4Q8LA 4Y1YA 4BLJA 2BFHA 2A7AA 5BYNA 1P63A 5FZYA 3O12A 4IHZA 2ZGKA 3AH4A 4JP0A 5CAZA 3ZXDA 3A0KA 4P0JA 4BQ1A 1IS5A 1KJLA 4M3CB 4GXLA 1HWOB 4K21A 1GKBA 1W6NB 1VIWB 4KUFA 4XHBA 1W6MB 1WUVA 2KLLA 2P2KA 3CRGA 4HL0A 1QNYA 2WRYA 3RTJB 1FNYA 3WZ1A 3P6JA 1T4QA 2W52A 1NZKA 1R8OA 2A5ZA 2ZHMA 4X38A 5E24E 3QW6A 2DTWA 5EHAA 4QO3A 5LK5A 1DJSB 4Q2FA 1BKZA 1QDOA 3O4OA 4I2SA 2GALA 3FJBA 4Q27A 3ZX7A 2HW9A 4FPCA 4M3CA 1LU2A 3MALA 1G9FA 5E8AA 3BRFA 4X3AA 1W6MA 1YXWA 1KNMA 4GKXA 1LCLA 2A6YA 1I1EA 4J23B 3LCPA 2E7TA 1WD3A 4MYEA 2Z42A 4FP3A 3M3CA 4LO7C 2VUAA 3FUOA 4HEVA 1K5UA 3DGTA 3CNAA 2DU1A 1DLLA 4FPFA 1CR7A 3O4CA 5IK5A 4I37A 1QDCA 3T1LA 2JDZA 3WNXA 2QYIB 1JN2P 3V64A 3NV4A 1YF8B 4ELCA 3SNVA 3QW7A 1J1TA 1MACA 3DDBA 1U0AA 3UD8A 1S0EA 4I4QA 3JU9A 1RY7A 1JLXA 4AN7B 2UUSA 1W3FA 1C1LA 3CA6A 4XFTA 4LO0A 3FJ9A 3UK9A 4ITCA 3RQ0A 4YG0A 2Y9FA 4I1BA 4YM2A 1YTOA 4F83A 1G9AA 4AN6A 1E1HA 1PWAA 1NXD1 1C4RA 1GNZA 4DRVA 2JD4A 1ZN3A 2JECA 2DS0A 3F62B 2WT0A 1DQOA 1YI7A 2ESUA 3BA5A 4XJ8A 4CJMA 3IM6A 4YG6A 2WSUA 1SR4C 2Y9WC 3WMVA 1Q04A 3WG1A 1S0GA 2VXRA 3QW5A 3FUQA 1GZ9A 5JOWA 5GALA 3V0BA 1SLCA 4Q91A 2ZBJA 1N1YA 4IZXA 4PBPA 5T54A 4KEIA 3WO2A 2P3IA 4KC3A 4I30A 1VAVA 3C8BA 2WLQA 4M01A 3WDTA 1XHBA 1AXZA 1UX6A 2DVGA 2X2TA 5SV8A 3AJZA 3FIEA 4JAWA 2ZAAA 2ISGA 3ZYRA 2CL2A 4BLIA 3CRHA 9ILBA 1GV9A 3INAA 2AUYA 4BOWA 1L2HA 2R1BA 1FN0A 1H30A 2A6WA 1A8DA 4JCKA 2NN8A 1Q8VA 1N4KA 2DVAA 3BAOA 3A21A 4FPLA 1ISXA 5EYYA 2ZGSA 1XTFA 1FV2A 2EALA 1S0DA 1DQGA 3JRRA 1AJOA 1BA7A 2ISHA 5BQNA 2EXKA 2XG3A 4FGFA 2GMEA 4RA0A 3WG2A 2D3SA 5F8YA 3CA0A 2DWRA 3VEQA 5IT6A 1AXYA 3ZUSA 4Y26A 3WDYA 5CBLA 3A0NA 4AVTA 1IHKA 1S0FA 3SH3A 5FREA 1FQ9A 1IOAA 5T5JA 4YGBA 1IRPA 1LEDA 1S0JA 5DZEA 4QKSA 4I4RA 3VKOA 4LO3C 4J2YA 4GWMA 2YMZA 4YFZA 5KXBA 5DZUA 4I8MA 3BRDA 3C2UA 3O4AA 4Y1UA 1EV2A 3BIWE 1ONKB 4CRQA 1ISWA 3CU1B 1IILA 3T2TA 3IM7A 2GN3A 1DZCA 5JOZA 4GAFA 4LO8B 1N1VA 5IK4A 3W9TA 3CA3A 1FWVA 3SLIA 2CTVA 1LOBA 3BAVA 4HJJA 5JDBA 1GSLA 1JW6A 3T8SA 2Z49A 1ISZA 1IOBA 4OEEA 3BOOA 4I3NA 5GLZA 4U2AA 5HCBA 4FPHA 1QXMA 1Z2VA 5BXTA 3RSJA 2ZMLA 2FPQA 3AH1A 1DQ1A 1PZZA 3C9ZA 2LIEA 1FNZA 3MPPG 1JT4A 3UJQA 1K5VA 4YGEA 4YW1A 1TWEA 4ZBVB 1OQLB 1CONA 1CPMA 1GBGA 5B2HA 5DG1A 2R16A 2P23A 2CY6A 3BODA 4JPZA 1ENQA 3K1XA 4BPZA 3AP5A 4YW4A 2ZGPA 4P9WA 2D7IA 3AJYA 2VW2A 1YRZA 1BFCA 4J1LA 2DU0A 5E88A 4IYBA 5BXPA 2DURA 2D7RA 3AP4A 1AXMA 1LOFA 1ULCA 2E6VA 3P53A 2GNMA 2GMPA 4P6AA 1LODA 3FIIA 1ULGA 1WBFA 4LBKA 41BIA 1HQLA 3ZSKA 3ZPYA 4IONA 4PQ9A 1AVWB 3AP6A 3S8JA 4YZ4A 5BQMB 2JE7A 1QNWA 1A3KA 2D20A 4FVVA 4OWJA 4H9WA 5GZCA 2KI4A 2ET2A 5F9TA 3PVOA 2W2DB 4ZOTA 3APBA 4LBJA 3D4KA 3UJ4A 1LHUA 4GALA 4ISRA 5DUUA 4OUJA 2A6ZA 4OWKA 1DGLA 5H9QA 4IQPA 4DCKC 4F34A 4XILA 1MS0A 1JOJA 1J0SA 1G9CA 1ZA4A 1OQ1A 5DUVA 1JUIA 4Z8BA 4R6UB 2A8AA 2FDBM 3O44A 1PC8B 4KEKA 4DQAA 4YM3A 3SISA 3WO4A 1AX0A 4D69A 2ZQOA 2G7PA 1IS4A 4QD2B 2AENA 2ES3A 3L2YA 2F2FA 1WW6A 5BQUC 1T9FA 5DUYA 1BFGA 3N0KA 2ZGUA 2KI6B 1AXKA 1JYIA 3PVEA 1Q1UA 4I4OA 1M16A 4AGGA 2FGFA 1TP0A 3AX4A 1HCEA 2ZGNA 3RMXA 3FLPA 4YLZA 3ZXJA 3ZC9A 1T3CA 2P37A 3V65A 1I1BA 3AP7A 1S0LA 4FPJA 2ZHNA 2MC2A 1SCRA 4IY8A 5I1BA 1JTCA 4Y1XA 2R49A 4ISQA 4UW5A 1AFCA 3BB2A 1FAYA 3O0XA 1F31A 3ZSLA 2GO2A 4ZJXA 2I1BA 2DRZA 4BM8A 2W39A 4FPGA 4AVSA 2BEBA 2V73A 3BAQA 4G6MA 4LBLA 1HKNA 1KDKA 5T5OA 1C57A 4C1XA 3AXDA 2WNEA 4EL4A 4I4VA 2G7NA 3ZYPA 2KKIA 2E4MA 3B9UA 1H9WA 3VT1A 1UZYA 5GLUA 4ZFWB 4I1EA 2D7FA 4IZEA 2JJ6A 3O4DA 1XYFA 3D7WB 2ZZJA 1V6KA 3FFZA 2YUGA 1G86A 4GKYA 3H6QA 1AJKA 3BRGC 2QN4A 3VKMA 1JQZA 1X50A 2D43A 2ZA9A 2R1DA 4I96A 1QOSA 3O0WA 3FJ8A 2PHXA 3FBYA 3NF3A 1FV3A 4W65A 3Q9OA 5JLVA 3FJKA 3I2AA 4LO2A 2NM1A 4C1WA 3QCWA 3OBTA 3MW2A 3NBDA 1S1AA 3FJAA 4H55A 1V6LA 4P14A 4I0YA 2GDFA 5HCAA 3OYWB 2Q9XA 3EF2A 3FJDA 4BMEA 1W6OA 1GICA 1AVBA 4XTMA 4ZKTB 1ULDA 5DZGA 1ONAA 5T55A 2D6PA 4QBVA 1WBAA 2D23A 4K20A 1HWMB 3SH4A 1H9PA 2W08A 3HN1A 5AVAA 1BFFA 4LBQD 4I4UA 3WUCA 2VXTI 2MLLB 5KXEA 2C9AA 4USPA 3KQRA 3KMVA 2ERFA 2IMBA 3PHZA 2YZ4A 3AH2A 1LHOA 3A22A 1N1TA 2LTNA 4I4PA 2DUPA 1WLDA 3OYWA 4AYUA 3DUIA 2A6XA 3OJ2A 1RIRA 3GNEA 1Q8SA 3DS9A 5GZGA 2E51A 1YYNA 2KM2A 3HMYA 3B9CA 7I1BA 4JC1A 2Q5TA 2P3JA 2ILPA 3OJVA 1MR5A 1ITBA 1BJQA 5GZEA 1FGAA 4WZFA 2EAKA 3FGMA 3V0BB 3AZXA 1Q8PA 2D6KA 5FZZA 3TB0A 2NVHA 3IAGC 4LO7B 1JY0A 1JLYA 1CIWA 2EXJA 2G7KA 1N3PA 1BFBA 1MD6A 1LEMA 5CB7A 3VUOA 4XBQA 4XBNA 2AQZA 3ZXEA 4YZ5A 1MVEA 1LJ7A 5JOXA 3POYA 4X37A 1MS4A 4Y20B 1WW4A 3O49A 4LBQB 4YZ1A 1KRIA 4LO1C 2D6LX 4QC4A 1Z7HA 2G7QA 5GZDA 1QGLA 3IM5A 3M3QA 2DVFA 3CA5A 1GLHA 1Q8QA 4BMBA 1AF9A 1D0HA 5HCFA 3AJ5A 4GAIA 3ZVXA 5FZUA 3D3XA 3ILAA 3FJEA 2RHPA 5H9SA 21BIA 1E0OA 4Y20A 5JOYA 2A75A 1G8WA 1Z78A 4LBQA 3BONA 5T5PA 1APNA 2Y9GA 1WW7A 4RL7A 4FPKA 3ASIA 1DFCA 3FJJA 4ZFUB 2A3XA 1LGCA 4FOVA 1XZZA 3VKFC 3M3EA 1HLCA 1WCSA 2TEPA 3BAGA 4CTEA 3FLRA 3I2XA 4I4XA 3UDAA 2H0BA 3H6SE 3MEPA 1KDMA 2A6VA 4FPEA 1FMMS 1S0BA 5DSSB 4L8QA 3UJ0A 3K3QB 1W6QA 3N7LA 3RG0A 2XOAA 3WUDA 5JMCA 3ZSMA 4XYXA 1SR4A 4Q9PA 1UKGA 3ZXLA 5DUWA 1KQRA 3QIXA 1BLDA 1B09A 4ZA3B 2NMNA 4OEGA 3A07A 3WHUA 4AGVA 2LALA 1Y7BA 4ASMB 4AVVA 4XFUA 5KXDA 3POKA 3SITA 2HWAA 1DHKB 3IMNA 4XTPA 2SLIA 3O0VA 4ZLBB 1UMZA 3A4UA 3PVNA 3VV1A 2OUHA 3PMEA 5D63A 1RITA 4Q9GA 4ATEA 4XJ9A 2YXSA 1DQ6A 3DEBA 3ZSJA 1IS6A 3BAUA 4GP0A 4ZGRB 1ABRB 2IMAA 2RG9B 4GA9A 2NP0A 4P0KA 4JKXB 1QOOA 2AAIB 1G82A 3UD9A 2DVDA 4EKXB 1VCLA 2KH2A 1Z4SA 2ZGOA 4EFPA 4U36A 4YGCA 2UWCA 1BYHA 5BP5C 2XB6C 1GGPB 3O4BA 3WCRA 3N7MA 4JQ0A 4Y1VA 3ILFA 3ZURA 4LO3A 2D3RA 1URXA 4G9NA 1HCDA 3QIZA 4FOQA 4EFQA 4G9MA 3UL2A 4OZXA 4I4YA 2CWMA 3CRIA 2AYHA 1BLAA 2R0FA 1DQ0A 4YW3A 3O3QA 2W68A 3LSEA 4Y1ZA 1SLBA 2NTDA 2K43A 4HANA 3AP9A 3AKIA 1S0IA 1FATA 2ZACA 4H04A 1LOAA 1FX5A 5D62A 1LTEA 3R05A 4IY9A 1LESA 3OGFA 1LOCA 3WO3A 3QR5A 4XJUA 5FNXA 3NWKA 1RG8A 1DBNA 3WINA 2ISEA 3ZC8A 5JVVA 1Q8OA 1LOEA 4FOWA 4XXAA 3W58A 1MS5A 3AZVA 2ZQNA 4M3CE 3H0OA 2YY1A 2R9KB 2BQPA 1JBCA 5GLWA 4TZDA 2D6NA 3WV6A 3UD7A 1SACA 4WVWA 3AZYA 1GANA 1UPSA 1LHVA 1DFQA 4R9AA 4QD2C 4NOTA 4DFSA 3AXEA 3AZWA 1MS9A 3IPVA 5BXSA 4FQ4A 3VT2A 3IKWA 3VKLA 5GJ6A 4FQZA 3GALA 5BVPI 3BWIA 1G9DA 3BA4A 5EC5A 3CAHA 4XJWA 1HWPB 1LENA 1N47A 3SH5A 3CA1A 2VSAA 4DPNA 3AKFA 5IK7A 1WD4A 3BAHA 3QJ0A 2D24A 3POWA 1CESA 3T1MA 2IHOA 4XFSA 4R9DA 1SFYA 2EXHA 2ENRA 2DVBA 2HWMA 4FOYA 3FJIA 1TTUA 1IJTA 4XOGA 3H6RB 3I29B 1XQNA 5IUQA 2D44A 3P6IA 2DUQA 1PZ9A 1AZDA 6I1BA 1ZL6A 3N36A 4J2SA 4UW3A 2WT1A 1MZ6A 1V6IA 3WOGA 1QMJA 3M3OA 1AVXB 4YOLA 2FMDA 4KBBA 3RRDA 3B00A 1FWUA 1VLNA 3AFKA 2JKBA 2PHRA 4R9BA 3WVJA 2XHLA 1YIFA 1TEIA 1CQ9A 3VT0A 2L5XA 3ZXFA 4JRAA 3H6RA 3CQAA 4USOA 1MS8A 4K1YA 4YM0A 4A7ZA 4Z9WB 3AYCA 4AWDA 4P9XA 2GZBA 1WBCA 3HALA 4L4HA 4GP3A 4TYSA 1GZWB 2C5DA 2PELA 3VWCA 4SLIA 5G00A 5HPZA 1W6OB 5BQUA 2VY0A 1SBDA 2SBAA 5DVHA 1BZWA 4XXPA 4XDQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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