3V0AA

2.7 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 408
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
408
sequence length
1295
structure length
1280
Chain Sequence
MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/A
total genus 408
structure length 1280
sequence length 1295
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-12-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0aA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0aA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0aA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0aA01
5BXPA 1QNWA 3CA3A 5B2HA 1ULFA 3BA5A 4DRRA 1XZZA 3FIEA 1Z2VA 3IN9A 3IM5A 4IZXA 2YV8A 3HSMA 3S8KA 2GALA 5KXCA 1CESA 3FBYA 5T5OA 4IHZA 1C4RA 2QN4A 3VKOA 1ISZA 5DUVA 5CA6A 2D24A 1MACA 4ASMB 1GKBA 4W65A 2HZ9A 3O0XA 1V6MA 3WCRA 1EV2A 3AJZA 41BIA 1SLAA 3WV6A 1KNMA 1UKGA 1UAIA 1ONKB 1BLAA 4ZFWB 3BRGC 4YW5A 1BZWA 1N47A 1Z78A 3WDYA 4GALA 4Y1ZA 3AH4A 1DZCA 1AJOA 4ZJXA 2ZGPA 1IS4A 2D44A 3QW6A 1PZ8A 1AZDA 1JXNA 1F31A 1A8DA 3WDWA 3BWIA 1YO8A 2UU8A 3B9CA 2YXSA 4YG0A 4I2SA 1QDCA 1O4YA 3AK0A 2SBAA 2A3WA 2ZHKA 4ZA3B 3A4UA 2NTDA 1N1SA 4WV8A 4A7KA 1AXYA 3RTIB 1G82A 1N3QA 2CL2A 2EXIA 4YG6A 1SCRA 3QR5A 1ISWA 1LODA 3VSZA 1TOOA 3AP6A 3KQRA 4GAIA 3OBRA 3ZSJA 3WNXA 4JQ0A 1WBAA 5BQUA 2EXKA 3AXEA 3W59A 2CWSA 3AX4A 3HR9A 1FMZA 3MW3A 5H9SA 2VUAA 1FN0A 4P0LA 3C8AA 3PJQA 1MS8A 1KRIA 2K8RA 1ZM1A 2NM1A 1CR7A 3ZUQA 4ZKTB 4GAFA 3AP5A 4FPEA 1N1YA 2M49A 4ZXKA 1JOJA 4GOVA 4UW4A 4Y1UA 3AKFA 4FVVA 1W6QA 3O49A 2FFUA 2Z49A 2DRZA 1LGNA 3U4XA 3M2MA 4FPLA 5CAZA 1JLYA 1MVEA 4ELCA 3GALA 3POSA 2QYIB 1AVUA 5FREA 2UWBA 4FPGA 3V0AA 2GMEA 1JY0A 1TTUA 2GNTA 2VXRA 1W0PA 1W6QB 4OEFA 1YYNA 1ENRA 3NWKA 3OBTA 1GANA 5F8WA 3OYWA 1JW6A 5EG6C 4I4QA 1AFCA 2D6LX 1JQZA 3V0AB 1AXKA 3Q7YA 4PQ9A 3QIYA 2AGSA 2DVDA 3OYWB 2NP0A 2WLQA 3TC2A 1FAYA 1SLCA 3AZWA 1HIBA 4I4VA 1HWNB 1SBDA 4XFUA 3FLPA 2KI6B 3BAHA 3HN1A 4PC4A 1F82A 4FOWA 3UL2A 4XFSA 4UW5A 2DVGA 3BADA 1DZDA 3FFZA 2BEAA 3R05A 1BFCA 4WZFA 4FOVA 5EWSA 4YFWA 3FUOA 4XTMA 4XJAA 3WDVA 4M00A 3MW4A 5T55A 1HKNA 2CTVA 3OY8A 2NZ9A 5DUWA 4KBBA 1EYLA 4P9XA 4XXPA 1R8OA 4GKXA 2OVUA 5H9RA 1BKZA 2PHTA 5BXSA 3OY8B 4I4UA 2I1BA 4HL0A 3WHTA 3FJAA 3I29B 4G9NA 2ZGNA 3AP9A 3ILAA 1YF8B 5DVHA 3UD7A 3INAA 4K1YA 1PZZA 4OWLA 3WMUA 1CE7B 5GJ6A 4XIKA 1LGCA 4AWDA 2VSEA 1Q56A 1IRAX 4DCKC 4XJZA 3RTJB 3WO4A 5D62A 3NBDA 3Q7XA 4I4OA 1WBLA 5HCAA 1E1HA 3BA7A 2A6WA 3ZXDA 1S0JA 1G8WA 3IPVB 2A75A 4FPCA 4BM8A 1ITBA 1HWPB 1ILR1 1WD4A 6I1BA 5IK8A 1DQ4A 4BPZA 2P34A 1CIWA 3IKWA 1AF9A 4FPJA 1LOCA 1SCSA 4BLJA 4Z8SB 3AJYA 2KKIA 4JAWA 3SITA 1CN1A 3CRHA 5IUQA 1G86A 1V6JA 4EFRA 2A70A 2W2DA 2YY1A 1LHOA 1VAVA 2XG3A 5T5LA 2ERMA 2PELA 1C1FA 2FDBM 4EFQA 3NBNA 1OQLB 3O0VA 3N7LA 3O4DA 2IMAA 3HBWA 3SNMA 1DZQA 1R1ZA 4JCKA 4P0KA 1JTCA 3FJEA 5IK7A 2PHUA 2ARXA 4Q1RA 1PZ7A 2F2FC 4HEVA 2OUHA 4Q2FA 5E8AA 1HCEA 5BQMA 3OGFA 2A97A 2Q9XA 2KI4A 1JYCA 1MZ5A 5T54A 1GZ9A 1H9PA 3P6IA 4ZLBB 2ISGA 2XOAA 4QC4A 1SBEA 2D23A 5FZUA 5T5PA 4Q27A 4U36A 3R4UA 2GNMA 3AKHA 1MS5A 1P63A 2FGFA 1BLDA 1Q04A 4EKXB 1ZL6A 5BP5A 1QOOA 1NUNA 4R9DA 4QD2C 4Y1XA 1J1TA 3SH3A 4M01A 3PMEA 1VCLA 2VSAA 1ISYA 3SLIA 4DPNA 1DQ6A 1DBNA 1BJQA 2HWAA 5E24E 1DYKA 4P9WA 4YGEA 2WT0A 1SR4A 1WD3A 3VKLA 4DRVA 1Q03A 2K43A 3B01A 5GZCA 2R9KB 1XQNA 1KJLA 1DIWA 4LO0C 3AP7A 3UK9A 3OPZA 2RHPA 1ZKXA 9ILBA 4I96A 1LHNA 3FJKA 2WQZC 3FJJA 2W39A 1S0GA 1AVAC 1W6OA 4IYBA 5E88A 5SV8A 5CBLA 1V6KA 3N36A 4L8QA 2VW1A 3QIXA 4BMEA 2Y9WC 4I3NA 2ISHA 3DDBA 2ZHNA 4I37A 1N4KA 3FIIA 4X3AA 3FUQA 2DU0A 3BAQA 5T52A 1SBFA 1BASA 1DJSB 3O5SA 1HDKA 1CVNA 2NMNA 3K1XA 1S0DA 3CAHA 1W3AA 4UW6A 4Y22B 3DS9A 5LK5A 1CQ9A 2DURA 3O12A 4ITCA 4GWMA 2DVAA 3O0WA 2LIQA 2P3IA 2H0BA 2V5YA 2PHWA 2BQPA 2A6XA 2D43A 3PVOA 4XBQA 2AFGA 1UPSA 4AVVA 1R8NA 8I1BA 3HMYA 3O4AA 2L5XA 3A22A 1KQRA 4NOTA 2VW2A 2R0FA 2NYYA 2A3YA 4BLIA 2OW4A 2RSTA 3BAOA 1CVSA 1IOBA 1MR5A 1AVXB 3UDAA 3BIWE 4PF5A 1OFSA 4FPKA 4QBCA 1B09A 5DUXA 2Y9FA 2K4AB 31BIA 1GZCA 5BXTA 2D6MA 2UUSA 2DV9A 2ZGKA 3A0NA 4A7ZA 3AYEA 2E4MA 2MIBA 1AX0A 1HWOB 1HLCA 1FWUA 5GZEA 4QKSA 2MC2A 2LIEA 3B00A 3BB2A 1MVQA 4XZPA 1N1VA 1QOSA 2AAIB 4UW3A 4XHXA 2YROA 2LTNA 3I2AA 2W52A 3WDUA 1DHKB 1PZ9A 3UJ4A 2WSVA 1V6UA 1G7YA 3WZ1A 4HANA 2RG9B 4FOQA 2YUGA 4L4IA 1ENSA 3VT2A 2FO1A 1LOFC 2WRYA 3B9UA 4Q26A 1T3CA 3BONA 2Y9XE 2CNAA 4Y24A 3VSFA 4Z8BA 3WINC 1GNHA 2B7YA 4KC3A 1W6PA 4I4YA 2R49A 2F8XC 2D1ZA 3ZYPA 1PWAA 3C8BA 4WBCA 1FX5A 3BA4A 2AR6A 1ULCA 4YLZA 5F90A 4M3CA 1SLBA 2WBCA 1W6PB 2D7IA 2VW0A 3A23A 5F9TA 2G7KA 4DEPA 2JKBA 3ZXEA 4M3CB 4XBNA 2C5DA 2ZMLA 4XJ8A 3NBEA 3NV1A 1T9FA 4XILA 3IM7A 3BOPA 1M16A 4OEEA 4H9WA 1U0AA 3L2YA 4I8MA 5JOZA 2AH2A 2R0HA 5F8SA 1WW7A 4PBPA 5L73A 3FJIA 1FV2A 4L4HA 4LBOA 5BVPI 4AVTA 2DTYA 3VT0A 2D6OX 4CJMA 4YM0A 1QXMA 1AXZA 1RZOB 1Q1UA 3WOGA 1IKPA 2GDFA 4K21A 3IAGC 3WUCA 1S0IA 4P14A 5DZEA 3CRIA 4XBLA 1W3GA 4DS0A 4OW4A 1ZA4A 1RIRA 1IS5A 1LHUA 2D3RA 1JYIA 1JN2P 2DUPA 2ZAAA 5EYYA 4M3CF 1WW4A 2XHLB 3N35A 3PUBA 2ZHLA 3AZZA 2P3KA 4USPA 1LECA 3JRRA 2WT1A 3T1LA 1OQ1A 1AX1A 3AYDA 3A07A 5DUUA 1MS9A 4XTPA 3F1RA 3H6RB 1MZ6A 4LO1C 5E89A 1LEDA 1WLWA 3Q9OA 2ZGTA 3GNEA 1WW5A 4I30A 1V6VA 5DG2A 2A7AA 2DUOA 2UWCA 2VY0A 3QJ0A 2WNEA 3TAYA 4J2KA 2ZA9A 2AREA 3DEBA 4AGVA 2X2SA 4AVSA 1V6XA 1WUVA 1JHNA 1F5FA 4GA9A 1BFBA 3KMVA 1G9CA 4FPOB 2IWTB 3IM6A 3QW7A 4XFTA 2D6NA 1JT3A 4FP2A 3KM5A 4X37A 4X39A 2PHRA 1PUUB 2GO2A 1MS3A 1TWMA 3O4BA 3WG2A 1UL9A 3ZC9A 2GZBA 3AJ6A 5F5QA 1URXA 2E53A 5GALA 4I1BA 4YGCA 1CJPA 4TLPA 3VKNA 1GBGA 4LBJA 1EVTA 2ES3A 3RG0A 3CRGA 4GKYA 1RINA 1GICA 1DLLA 3SISA 4PCRA 4F83A 3RMXA 1S1AA 1BFGA 4FPYA 4XKIA 4LBNA 2ZMNA 1ZB7A 2YMZA 3O4OA 4QD2B 1ULEA 4Y20A 4D69A 1SLTA 2EAKA 2WJSA 3ZXJA 4RL7A 4LO0A 2W68A 1L2HA 4D8HA 3CA1A 4HJJA 3T2TA 3ZXLA 4R6UB 3ILFA 4ISRA 4YG3A 4JRAA 1JUIA 4FOYA 3T8SA 3ILRA 4XIOA 1LENA 3ZVXA 4Y20B 4I1EA 4ZBVB 5GLZA 1ONAA 2X2TA 4XHBA 3V64A 3WA1A 1DQ1A 2UURA 3NJ5A 3PVEA 3VKFC 3IPVA 1QMJA 1SLLA 5HCBA 5DZGA 1BYHA 1D0HA 1S0BA 2Q5TA 4Z9WB 3A21A 3N3HA 4QBVA 3A0KA 4OEGA 3P6JA 1QQKA 3CQAA 5F8YA 3VUOA 1QDOA 3MPPG 1QQLA 2DRYA 1APNA 1FV3A 5D63A 5FZYA 4XYXA 3TB0A 1ZN3A 3WVJA 1Y7BA 2ESUA 4G1RA 1LOBA 4K20A 4M3CE 1MS4A 3M1HA 1QNYA 2ZKNA 2DUQA 2DREA 1LTEA 4C1XA 3FJCA 4Q9GA 2JE9A 3WDTA 1FMMS 4XJUA 4XE9A 3BRDA 4II0A 3V0BA 1AX2A 2TEPA 3APBA 4PBOA 3AKIA 1I1EA 1LCLA 1UZYA 2ET2A 3OGGA 1IILA 4LO8B 4NO4A 3C9ZA 3V0BB 1IKQA 1MS1A 3FJBA 3WO2A 2GNDA 2P2KA 1ULGA 1CPMA 2W08A 1LGBA 1V6IA 5GAQA 2DVFA 1S0EA 3BX1C 1FNZA 2YZ4A 2A5ZA 3FJHA 3W58A 2ZGOA 3LSEA 1TP0A 1AVWB 4LBQD 1D2SA 1LOAA 4LBMA 1V6LA 4ZFUB 1PC8B 3N0KA 1UZZA 5GLUA 3QW5A 3IIRA 2CYFA 3VEQA 3B3QE 5BOWA 4LBQA 1V6OA 1BARA 4R9BA 1RITA 1V00A 5CB7A 1DGLA 3VWCA 3NV3A 1LOFA 2VU9A 2AQZA 3Q7WA 1ISXA 3FLRA 1G9DA 5IK4A 1ZKWA 3WINA 1V6WA 1UMZA 4R9AA 4DENA 4LBQB 4X38A 4XDQA 1XTGA 1LU2A 1G9AA 5BQNA 2ZMKA 3RMYA 1HQWA 1JT4A 4F34A 3FJ9A 4P9YA 2R1DA 3DGTA 4YW4A 3WO3A 2D6KA 1LOGA 3H6SE 2FHRA 1GV9A 1RY7A 1I1BA 4GOYA 3MW2A 2V73A 4I4SA 4TZDA 4WVVA 1W0OA 3WDXA 1AXMA 3UD9A 2GN7A 3D4KA 4OWKA 3O3QA 4H04A 1RMLA 2HW9A 2ISEA 2VLCA 2IHOA 2XB6C 4Y22A 2BFHA 3N7KA 1M2TB 1JBCA 3ZXGA 3CA4A 5JOXA 1LESA 1VIWB 3BOOA 1N3PA 4KUFA 1VAMA 2JE7A 3M3OA 1K5VA 1II4A 5GZDA 1KJRA 5GLVA 5BXRA 2CWMA 2HYKA 1RG8A 3WCSA 2EIGA 1ENQA 5JOWA 2D22A 4P6AA 1LEMA 5DG1A 1JLXA 4R9CA 4YZ1A 2JJ6A 5GM0A 3AZVA 2KH2A 2JDZA 4RA0A 4LO1A 1NLSA 2J3PA 1NZKA 1Z4SA 2WSUA 4EB2B 1ZL5A 1CONA 1A3KA 4I4XA 4LO2C 1O4ZA 1GZWA 1PUMB 1IS6A 2DYCA 3NV4A 3JUTA 4ATFA 4ZOTA 1DYPA 3AYCA 4QO3A 1WBFA 4QKRA 4G6JA 1G9FA 3JUUA 2D20A 3T1MA 2DU1A 1VLNA 1WLCA 3DUIA 5H9QA 1GZWB 4K1ZA 4I4PA 3AYAA 1FQ9A 3ZYRA 1BA7A 1VALA 2EXHA 3CU1B 4J2SA 3C88A 4CZSA 3VV1A 3BOKA 4EJ5A 5KXBA 1KDKA 1IS3A 2P23A 2ARBA 2ZHMA 3AFKA 2G7NA 2QN0A 1IHKA 4YOLA 1Z0HA 3MEPA 3IMNA 4XXAA 5FRAA 5DSSB 4AGGA 3F62B 2KLLA 1UN1A 3VKMA 3I4IA 5DZFA 3RQ0A 4HA2A 3FGMA 1S0FA 1E0OA 2ZQOA 2JECA 3JU9A 3NBCA 4DQAA 1QGLA 1LJ7A 5CNAA 3WG3A 2G4IA 5BP5C 4A7YA 2UWAA 2Y9GA 4GWNA 1C1LA 1IOAA 2ZABA 1SR4C 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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