3V0A | Genus

Total Genus 408

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	408
sequence length	1295
structure length	1280
Chain Sequence	MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex. pubmed doi rcsb
molecule keywords	BoNT/A
molecule tags	Toxin
source organism	Clostridium botulinum
total genus	408
structure length	1280
sequence length	1295
ec nomenclature	ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date	2011-12-07

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1120.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain	Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain	3v0aA02
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	3v0aA03
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	3v0aA04
3.90.1240.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Zincin-like	Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like	3v0aA01

5DUUA 1J1TA 1W3AA 3D3XA 2FHRA 4SLIA 2UU8A 5I1BA 2F2FA 3NV4A 1ISXA 1VLNA 2R49A 1FWVA 1BARA 4USOA 5BVPI 4YGBA 2XHLB 1IS5A 1JN2P 3T8SA 3WNXA 4LBQD 3WG4A 1Q04A 5FNXA 3ZXEA 4K20A 4YW5A 4I4YA 4Z9WB 1APNA 3B9CA 4ZGRB 4ATEA 4C1XA 2VSAA 2DU1A 1QOSA 1ULEA 1WBLA 2D1ZA 3H0OA 3BB2A 4DEPA 1G9AA 4GWNA 4Q8KA 2Z48A 4QBCA 4FOVA 3DDBA 2PHWA 1W6MB 2ESUA 5G00A 2W68A 1H9PA 3U4XA 1ZL6A 3AP9A 1G82A 3BONA 2D6NA 3B69A 3FUQA 2VW0A 2DYCA 2NN8A 2E7TA 2Z42A 5HPZA 3LLPA 2W08A 1PZ9A 4QKRA 3O4AA 1DQ0A 3FJDA 3BTAA 4XZPA 2QN0A 3FGMA 4XBNA 1G9FA 2ZGMA 3IM5A 3VT0A 2IWTB 2ZGNA 1UN1A 1HWMB 2DVAA 1LEMA 2VW1A 3FJCA 1BKZA 1VALA 1SZ6B 4HA2A 3F1RA 4ZFYB 4LO2C 4I1BA 2AH2A 4XJ9A 4FQ4A 5F9TA 3POYA 3A21A 1K5VA 4BLIA 4M3CA 2DUQA 2GMPA 2MC2A 5LK5A 1TTUA 1N3OA 3PVNA 3I2AA 3A0KA 1JBCA 4JQ0A 3O4DA 5JMCA 4YW3A 2NTDA 5T5JA 3AP6A 3CRHA 2NZ9A 2HYKA 1CVSA 5E88A 1AZDA 4IYBA 4EB2B 1ZN3A 4Y1ZA 3M3QA 2A3WA 1CPNA 3OYWB 1LESA 4J23B 1FN0A 1SLBA 3ZUQA 1WCSA 3MW3A 3VKFC 4XDQA 3L2YA 4M01A 2R1BA 2AXMA 3FJBA 2ZAAA 4IY8A 4II0A 4QC4A 1SCRA 1UAIA 2B7YA 2CNAA 4LO7C 3PG0A 2GNBA 2KKIA 1EV2A 3AKGA 4L4HA 5DG1A 1YIFA 4FPOB 4XE9A 3MW2A 4DFSA 1S0JA 1V6WA 3UJ4A 2ZZJA 1Q56A 1PUUB 4XIOA 2G7KA 1Z0HA 1W6OB 2P23A 3WLUA 2F8XC 3ZXDA 4FPFA 1W6MA 4P9XA 1XG6A 2DRZA 4FVVA 4OZXA 1DQ4A 2JD4A 3C88A 3R4SA 1W6NB 1SLCA 4M3CF 5BQNA 1S0CA 1IOBA 5E89A 1V6OA 4YFWA 2PHFA 1MZ5A 5JOWA 3CRGA 5BOWA 3O44A 3Q7XA 3A07A 5GLWA 1SBDA 1ITBA 3FJJA 2ZGSA 3K1XA 1T9FA 1LOGA 3BAVA 3LTQA 3NJ5A 5CB7A 2KI4A 4Y26A 2YY1A 2NM1A 4J2XA 3RSJA 4AVTA 3W58A 5T52A 8I1BA 3WDXA 4CZSA 3WDTA 4BPZA 1IS6A 4Y22B 2K4AB 3POSA 3CQAA 2D22A 3DUIA 2R9KB 3ZYPA 2G4IA 3WINA 1EVTA 3RS6A 4GAFA 1V6JA 3W9TA 2W39A 4OEFA 2AGSA 3WCRA 3TB0A 3N0KA 3N7JA 1QXMA 2A8AA 4IZXA 2ES3A 1QF3A 3OGGA 2ZMLA 2A6VA 1IOAA 2P39A 3H6SE 3NV3A 2WQZC 1SLLA 3BA5A 3IMNA 2ILPA 4AN6A 2ERMA 3C8BA 1V6NA 1NUNA 2ET2A 1SLIA 1LENA 1ENQA 5AVAA 2ZHKA 5T54A 4IHZA 1OQLB 2NP0A 1LEDA 4K1YA 2XOAA 2D24A 1AVAC 3RRDA 1FV2A 2GN3A 5E24E 3NBNA 3RQ0A 1MVEA 2IMAA 5F90A 4XXPA 1JTCA 4ZA3B 1Z7HA 2J3PA 2IHOA 1QQKA 5GLZA 2ZGRA 4BLJA 4Y1VA 3WMVA 1GZCA 1T3AA 1D0HA 3I2XA 3HR9A 2LTNA 2BEAA 2WSUA 4BMBA 1GGPB 2GZBA 4XYXA 1ZA4A 1F9KA 2Q5TA 1JT7A 1I3HA 2V73A 1SBFA 3JUUA 4EL4A 2ZACA 1R8NA 2Y9FA 1RY7A 1WLWA 4EJ5A 2EXJA 2R0HA 1IKPA 1S0BA 4I0YA 1PUMB 1URXA 5B2HA 4Q2FA 2ISGA 3WDWA 5IT6A 4Q27A 5GALA 1FNZA 3CNAA 5T50A 6I1BA 1ISYA 1NZKA 2ERFA 1UPSA 3AP5A 2UURA 1RZOB 2KH2A 2HWAA 1MZ6A 1SR4C 1JLXA 4XJ8A 3WUCA 1AXMA 3Q9OA 1DQ1A 1F5FA 5GJ6A 3VUOA 2PHTA 4ZXKA 1KDMA 4A7KA 3SH4A 1II4A 3BADA 1OKQA 4LO2A 2P3KA 2YV8A 3I29B 4Y22A 4QKSA 3VSFA 1CONA 3BAGA 1CE7B 1AXYA 1AF9A 4DCKC 1WBFA 1KJRA 2I1BA 3CRIA 3WO4A 4I2SA 1G8WA 1AVWB 2OUJA 4I4RA 3RG0A 4LBNA 3AX4A 21BIA 4NOTA 1R8OA 1TIEA 2ISHA 4OWJA 1EPWA 3V65A 5DUYA 2MIBA 1JT4A 4YM0A 1LTEA 3OJMA 1FNYA 1UMZA 4R9DA 4XFUA 1FYUA 1V6IA 4YM3A 4FPYA 4FPEA 5BQMB 4UW3A 2ZMKA 2LIQA 4H9WA 1WLDA 2BEBA 2ZGOA 2Y9GA 1V6UA 4JP0A 2K43A 1JY0A 4ITCA 2D43A 1H30A 3C9ZA 3N35A 2HZ9A 4YW2A 1Q8VA 2ENRA 4RL7A 4YG6A 3IM6A 4G9MA 1QDOA 1BA7A 1GV9A 1HCEA 4I1EA 4ZJXA 1MS9A 1CJPA 4D69A 1MR5A 2D3RA 1ZB7A 3BA7A 4LO3C 4A7ZA 2GMMA 1FV3A 3SLIA 1ONAA 3SISA 4CJMA 2D7RA 1OQ1A 4YZ1A 4LBKA 1BFBA 4I4VA 5BXRA 3AZZA 3QIYA 4UW4A 4ISQA 3B01A 4KTXA 1VCLA 1L2HA 4JCKA 2G7NA 3WHUA 5GZEA 3ZXKA 2K8RA 2HW9A 5D61A 2VXRA 1WW4A 2E53A 3KQRA 5IK5A 3AZWA 1SLAA 1ULFA 1MD6A 3ZXGA 1B09A 4X38A 1LGBA 2OUHA 1W6PB 1LCLA 4G6MA 1S1AA 4J2SA 4YZ4A 5H9RA 2AQZA 1QOTA 3WDVA 3POWA 1HQLA 4CRQA 4JKQA 2C9AA 1LHWA 3OBRA 2DV9A 3KMVA 5IK4A 3PUBA 4ENDA 4KEIA 5BXPA 1MC9A 2FMDA 3LSEA 3UD9A 1KJLA 1QKQA 3V0BA 1HWPB 5HCBA 1N1YA 3PMEA 4QO3A 3ZX7A 2A6ZA 4FQZA 3ATGA 3V79C 3ZXFA 4ZLBB 1JYCA 4WV8A 3AH2A 1FATA 3BOOA 5D63A 5KXEA 2LALA 4Q9GA 5BQMA 2DVBA 1XYFA 2D6PA 4PC4A 3CA5A 1GYKA 3LCPA 4AWDA 1DZQA 1J0SA 2DS0A 3BIWE 2WT2A 1AJOA 2NYYA 2VXTI 4A7YA 1LHUA 2P2KA 1FGAA 4WVVA 3CAHA 2ZGLA 3AH4A 1N1TA 4XXAA 1W0OA 4U36A 1YVGA 3B00A 4YM1A 1I1EA 2GO2A 5GM0A 2ARBA 1NXD1 2W2DA 1DBNA 2ZR1B 3AZYA 4LO1C 5GZCA 1HQWA 4Y20B 3IKWA 4XKIA 3P6IA 4HL0A 4KS6A 1FAYA 1IILA 5DUWA 2NMOA 4Y1YA 1QDCA 3HALA 2A6XA 3JU9A 5EWSA 4G9NA 2NVHA 1W0PA 3QW8A 1LHNA 1MACA 2ZHLA 1RIRA 1ISZA 3D6EA 1O4ZA 3VT1A 2DURA 2GNDA 1S0GA 1SR4A 3APBA 1FX5A 4R9CA 3BAUA 3UJQA 5GLTA 1HDKA 1GZ9A 2WBCA 2XHLA 1N1VA 1W6PA 1VAVA 3WO3A 3D5OA 3OBTA 4FOYA 1DQGA 3O12A 1DLLA 5FNWA 4J1LA 5JVVA 2JECA 3HN1A 2GNTA 1AXZA 3FJEA 2BQPA 3NBCA 3K3QB 2VU9A 1YTOA 2SBAA 3FJ9A 1ZKWA 1GNZA 1QMJA 1DFQA 4FPCA 5KXDA 5DZEA 1JT3A 2KLLA 1BLDA 1C4RA 1O4YA 3EF2A 5DSSB 4R9BA 4L8QA 2VY0A 1WD4A 4TYSA 2GDFA 4PBPA 3AJ5A 1MS1A 1DQ5A 4TZDA 2OVUA 4OUJA 3UJOA 2ETFA 4KC3A 4QD2C 5FZYA 3ZSKA 4W65A 1V6LA 4GAIA 1AX0A 3FJ8A 1N47A 3WA1A 1KQRA 2YZ4A 4BQ1A 1LGCA 1JXNA 4P9WA 4ASMB 4G6JA 3N7KA 4TLPA 2AR6A 5EYYA 1BXHA 3H6RB 5DZFA 3JRRA 4D8HA 2DREA 7I1BA 3V0AB 5T55A 1TP0A 4Z8SB 1ENRA 2AFGA 3SITA 4LO3A 2E51A 2I2SA 1VIWB 3AYEA 5SV8A 5JOYA 3CA0A 3ZUSA 2BFHA 5DUVA 4Y20A 1IJTA 1SACA 1C57A 1IS3A 3T1MA 3O4BA 2D23A 3A23A 2AAIB 3AK0A 3M1HA 4LO0C 2A70A 3QIXA 1GZWB 1G86A 3IM0A 1ISWA 1Q03A 5EYXA 3FLTA 3FIEA 3BRGC 4XIKA 4K21A 2DTYA 2WJSA 1PWAA 2ZHMA 3WOGA 3O5SA 2FO1A 3PVOA 3AYDA 3QLQA 1A8DA 3NWKA 1JW6A 3QW7A 1SLTA 3UJ0A 2P3JA 4K1ZA 2IMBA 1S0LA 2DRYA 4KBBA 1LOFC 5EHAA 2ZGPA 1G9BA 1M2TB 2D7IA 2VUAA 3O5WB 1YF8B 3QCWA 4F34A 5D62A 3TC2A 2ISEA 3OYWA 3R4UA 2NMNA 2YMZA 4U2AA 1CR7A 4M00A 41BIA 4XTMA 4UW6A 1RG8A 5GLUA 3BAHA 4R9AA 4I7IA 1U0AA 1AJKA 4JRAA 2FPQA 3QIZA 1ULCA 1MS3A 4YZ3A 4PCRA 1WW6A 2RG9B 1CQ9A 2UWCA 1P63A 3F62B 1VAMA 1DZCA 2DVFA 3VT2A 2XB6C 2OW4A 1F82A 1HWOB 1ZL5A 5DVHA 1IKQA 1MS8A 3Q7YA 2D6KA 3M3OA 5GAQA 4Q8LA 1BLAA 3VKLA 3MALA 1W6OA 4F83A 3O4OA 1GLHA 1BYHA 3VKNA 1ULDA 4OWLA 5BQUC 1HIBA 4R6UB 2DUPA 4QD2B 1GICA 1RITA 4Q1RA 4I4SA 2WT1A 1W6NA 5GLVA 1ABRB 1PZ7A 1OFSA 3TAYA 2CY6A 5F8YA 1WW7A 1ISVA 1Z4SA 5JOZA 1NLSA 1M16A 1BFGA 1DQOA 1YI7A 1DQ6A 3H6RA 1W3FA 4JC1A 3QW6A 3D7WB 4WBCA 2D20A 2H0BA 2QYIB 3MW4A 5DZGA 5FREA 3AH1A 5HCAA 3FJIA 1N4KA 1Q8QA 1AX1A 3BRDA 4AVVA 4GP3A 2EAKA 1E1HA 2SLIA 1WUVA 5GZFA 3BRFA 4GOYA 3FJHA 4KEJA 1F31A 2A3XA 1GZWA 3AP7A 3ILFA 1BFFA 3AXEA 4HANA 5IK7A 2JE9A 2UUSA 1XTFA 4KEKA 1HCDA 5F5QA 4NO4A 3OGFA 1TWMA 2D3SA 5E8AA 3O4CA 4PBOA 3A0NA 4GA9A 3IM7A 3E8LC 4I96A 1IRAX 4MYEA 1GANA 1A78A 2D6MA 1DQ2A 4HJJA 5IUQA 4LBLA 1Q8PA 1G9CA 1E0OA 5JDBA 5JLVA 3IIRA 3SNVA 5BP5C 2D44A 4YGCA 4YW4A 3HBWA 3OY8B 3NBEA 4G1RA 4YW1A 2VLCA 1KNMA 3UDAA 2DTWA 3O0WA 4DRRA 2A6WA 3BX1C 2G7PA 4P0JA 4FOQA 2P34A 1LHVA 2A7AA 3AFKA 2FDBM 1K5UA 5FZZA 2PELA 1FMZA 3NV2A 4H55A 1LOBA 4AGRA 3BAQA 1YO8A 1ONKB 4BM8A 2P37A 2AREA 5F8WA 2DU0A 4LO8B 1H9WA 2VH9A 4GOVA 1QGLA 9ILBA 4QBVA 3UD7A 1DJSB 4XMAA 5BYNA 2JKBA 1AVXB 3UK9A 4LBQB 5EC5A 4GXLA 3WG2A 3HOMA 4HR6C 3USUB 2GN7A 3O0VA 4M3CE 4I4XA 1G7YA 1ENSA 1KITA 3INAA 1GBGA 3UD8A 3ASIA 1LOAA 2YROA 3S8JA 4I30A 3V64A 4IZEA 3ILRA 3ZURA 1MS5A 1TWEA 1WD3A 1JQZA 1A3KA 3WDUA 3ZSMA 4ATFA 2A71A 4Q91A 4YOLA 3WDYA 4X37A 5BXTA 2DVGA 3DSEA 4XFSA 2WKKA 5H9SA 4LO0A 1QU0A 5GZDA 2EIGA 1AVUA 1DHKB 2ZGUA 4D0ZA 4ISRA 2D6LX 2ZHNA 2ZABA 4GKYA 3A22A 2ZGKA 4XBQA 5CNAA 3QW5A 1SCSA 1V6XA 3DDAA 2WLQA 3SNMA 1JOJA 4IQPA 3VSZA 4DRVA 1DYKA 2GALA 1GSLA 3ILNA 3SH5A 4I4QA 1LOFA 4ZFUB 1LECA 3CA1A 3AKHA 4PQ9A 2GMEA 5EG6C 4IY9A 2HWMA 2KI6B 1ZM1A 3S8KA 3D4KA 1CIWA 2IMCA 2A6YA 3OY8A 2Q3NB 2E4MC 3WO2A 5CAZA 3HMYA 2R0FA 4Y1XA 5CA6A 1LGNA 2CYFA 2V5YA 1CVNA 1XQNA 2RQ9A 2EXIA 4DENA 4P14A 1Y7BA 1LU1A 1CN1A 1V6MA 4JPZA 4AVSA 3WZ1A 4AN7B 4Y1UA 1HWNB 3RMYA 3AYAA 4GKXA 2EF6A 4EFQA 4ZKTB 2JDZA 1MS0A 4ZBVB 1HKNA 5KXBA 3N7LA 1RMLA 2ZQNA 3CA4A 3WHTA 5KXCA 5BQUA 3AXDA 3B9UA 4LBMA 3AJ6A 2ZGTA 2E6VA 3FUOA 1LULA 4LBQA 1BQPA 4BMEA 4J2YA 3WV6A 3WG3A 3USUA 4XTPA 4XJAA 4YZ2A 4XHBA 1Z78A 5DZUA 2KM2A 1PZZA 4GALA 4H04A 2JJ6A 1FMMS 3BOPA 4EKXB 4FOWA 3VV1A 1FWUA 3H6QA 3IPVB 1GNHA 3ENRA 3AZVA 3FLRA 4DPNA 1V00A 4DS0A 3N36A 3BWIA 1PZ8A 2X2TA 5HCFA 2Y9XE 3O49A 3GALA 1PC8B 1S0EA 2R16A 3I4IA 4I37A 3BODA 1BJQA 3O3QA 1HKDA 1DGLA 2W52A 1FQ9A 5DG2A 1Q8OA 4AGVA 4GP0A 3DS9A 2WT0A 4LBJA 4P0LA 2EALA 2E7QA 1W6QB 2A3YA 3WCSA 1DIWA 1YRZA 5F8SA 1MVQA 4FPHA 4DQAA 2TEPA 4CTEA 1G9DA 5BP5A 1UZYA 2D7FA 4YZ5A 3ZXLA 2X2SA 2ZMNA 1S0FA 4XBLA 3M3EA 4EEEB 3PHZA 3CU1B 3GNEA 4FPJA 1SBEA 3JUTA 4Q9PA 5T5PA 1Q1UA 1W3GA 2LIEA 3CA3A 3CA6A 3PVEA 4XFTA 1LOCA 2CTVA 3SH3A 2DWRA 2WSVA 1ZKXA 4ZFWB 4EFRA 3ZXJA 1XTGA 3OJBA 1S0IA 3WUDA 3WMUA 1N1SA 1D2SA 3P53A 3ZC9A 4X3AA 4LBOA 4I3NA 1JUIA 5EXOA 4C1WA 3RTIB 4RA0A 3C89A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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