3V0AB

2.7 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/A
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0aB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0aB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0aB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0aB01
2A6YA 2NM1A 1FQ9A 4LBJA 1QDOA 1LGBA 4FPFA 4PBOA 4OEFA 3V65A 3PVEA 1IILA 2ISGA 1S0IA 1JYIA 4IYBA 1PZZA 1GNZA 3ZYRA 3T8SA 4FOVA 4I4VA 2XB6C 3B9UA 4P0JA 3HMYA 1AZDA 3ZXEA 4YFZA 2GNTA 1T3AA 1ILR1 4OWJA 4X39A 4GP0A 1T4QA 4PC4A 3OY8A 1X50A 2B7YA 4DENA 4JRAA 1ZL5A 1PUUB 3WO3A 1EPWA 3P6IA 2ESUA 1R8OA 5DZGA 2PHTA 3MPPG 1GBGA 5T5JA 5D63A 2UU8A 2A7AA 2D7IA 3H6RA 5DG2A 1DQOA 2WKKA 3T1MA 1XTGA 3A0KA 3CRHA 5EG6C 1KJRA 5KXEA 4YZ2A 4JKQA 1DGLA 3UK9A 1RIRA 4F83A 4XJ9A 3QLQA 4P0KA 1N1YA 4P9WA 1CIWA 2WLQA 2R0HA 1W6MA 3LSEA 3BX1C 1P63A 3Q7XA 2CWMA 4LO1A 3OJBA 3OY8B 4AGGA 3CA6A 4USOA 4QALA 4EFPA 2FFVA 4JKXB 3SLIA 1FV2A 1U0AA 4IY8A 2CYFA 3SH4A 1BLDA 3H6RB 4I4OA 3S8KA 1LHUA 1OKQA 2HWAA 2E6VA 1G86A 5H9RA 1XQNA 3FJDA 1XTFA 3LSDA 3ZURA 3QW8A 1LOBA 4Y22A 4IY9A 1G9CA 3R4UA 2P3IA 2TEPA 2I2SA 1URXA 4M01A 4P0LA 1GZ9A 1W6MB 3O0WA 5EYXA 1H9WA 1HDKA 3QW7A 3CA5A 3ILFA 1SBEA 4QKSA 2AREA 1EV2A 5AVAA 1IRAX 3BODA 3I2AA 2ZGMA 4YG0A 2QN0A 4FPOB 1IKPA 2R1BA 2Y9XE 4YW5A 3RMXA 4IHZA 2W68A 5JVVA 3O3QA 3POYA 1C1FA 4KEJA 4QO3A 4WVVA 2NMNA 3LCPA 2E4MC 4KEKA 2ZQNA 5BP5A 4FPYA 2ILPA 3P6JA 1AXKA 3NF3A 2D22A 1ISZA 2C9AA 2AXMA 1WW5A 2JD4A 1UKGA 3QR5A 4RL7A 4HA2A 1TIEA 2D6OX 1Q8QA 4D0ZA 3OYWA 4Y22B 3VWCA 4U2AA 4II0A 3O4AA 3WOGA 4Y1UA 1JT5A 3BAUA 4Q8LA 1DQGA 3N7MA 4LO7B 1BFBA 1G9AA 3WG1A 2HYKA 3R4SA 5DZUA 1NUNA 2VW1A 4I37A 3WO4A 2VY0A 1ZB7A 2KLLA 2YROA 3RSJA 3WG2A 1JTCA 4I8MA 1BJQA 3WCRA 2D24A 4OEEA 1C1LA 2EXHA 3AJ5A 1H9PA 2ZGTA 4M3CA 1S0EA 1T9FA 1CVNA 3E8LC 2Q5TA 1DBNA 4I7IA 3FJAA 1XYFA 1MVEA 3FJFA 4I96A 31BIA 2RG9B 2GNDA 1KITA 4LO0A 1JY0A 4FVVA 1UMZA 3AYAA 2YZ4A 1AXYA 2NMOA 2W08A 5E89A 4J2KA 1ULCA 2C5DA 5GZFA 2X2TA 2FFUA 4WV8A 2E53A 1Q8VA 3RS6A 3NBCA 2G7PA 4YZ1A 4Y1ZA 2Z42A 2WQZC 3R05A 1Z7HA 2J3PA 3M3EA 4USPA 1QQLA 3O4CA 3AZVA 1SR4A 5FREA 5F90A 2WJSA 4YG3A 3AKFA 3D3XA 4M3CB 3B00A 2EIGA 5DZFA 4BMBA 5DVHA 2F2FC 3WHUA 3QJ0A 2YUGA 4J1LA 9ILBA 5E24E 2D6MA 4ZLBB 3N7KA 3UJOA 3POSA 3RTIB 1G8WA 5F8WA 4LO2C 2ZZJA 2IMCA 4BQ1A 3ZUQA 3FIEA 2FPQA 1QF3A 3BADA 1TEIA 1SCSA 2IMBA 3CA0A 1JQZA 4P6AA 1OFSA 1Z4SA 1BQPA 3AYCA 3V0AA 4IZXA 4FGFA 4ISQA 3ZPYA 4Q1RA 4ZOTA 1AVAC 4GWMA 1RZOB 5BVPI 2GMMA 4ATEA 1W6NA 4AN7B 3FJ8A 1AJKA 5KXDA 2D23A 4LBNA 3AP7A 1GKBA 4Z8SB 2ZR1B 1MACA 1O4ZA 2Z48A 2UWCA 1IHKA 1DIWA 4K1YA 3I29B 3BRDA 1JBCA 5HCBA 2ZGKA 2L5XA 4QD2B 4AWDA 1SLTA 4KTXA 1LGCA 2KKIA 1UL9A 4GWNA 1JLXA 3FIIA 1HQWA 3DEBA 1AVXB 3QCWA 3V0AB 3SNMA 3QIZA 3MEPA 2GZBA 3VT2A 1W6NB 5CBLA 3AH4A 3N36A 5DUUA 3RG0A 3Q7WA 4Q2FA 3L2YA 3SITA 2NN8A 3VV1A 5GZGA 3PUBA 4OWKA 3QIYA 1BXHA 1WCSA 1V6VA 1S0GA 1KDMA 1ENRA 3MW2A 1FWUA 3N3HA 3N7JA 1JW6A 2P3KA 1AFCA 4YGEA 1WD4A 5BQMA 3VT1A 1FYUA 3WDXA 3AFKA 2D3RA 4GXLA 3VKNA 4ZGRB 4X3AA 1AJOA 2BEBA 1Q8OA 2R1DA 4G9NA 4UW4A 4I4YA 1I1EA 4P14A 4YGBA 3FJEA 4ZA3B 2OUHA 5T5OA 1MZ6A 5FRAA 4I4XA 1LHNA 1CR7A 4I3NA 4QKRA 4WZFA 3VSFA 1LOFA 3A07A 2AAIB 1IJTA 3C89A 3VSZA 4K1ZA 5H9PA 1V6UA 4FPEA 4XTMA 4LO7C 1LEMA 1RY7A 3S8JA 3IPVA 1DQ2A 3AYDA 1LEDA 3PMEA 5GZEA 2DUPA 3HOMA 3LTQA 3TB0A 4XMAA 1DYPA 3UL2A 5IK5A 5BQMB 1VCLA 3B3QE 1YI7A 2A6XA 2A3XA 1V6IA 3CU1B 1E0OA 4Y20A 5BP5C 1IS3A 2YXSA 2K43A 3O4DA 2SLIA 2VUAA 1N1VA 2DUOA 2Y9WC 4OEGA 2E51A 4A7ZA 5BXTA 1AXMA 2KI4A 2WT1A 3OPZA 3ZYPA 2D44A 2OUJA 4A7KA 1DFQA 3Q7YA 4FQ4A 2UWBA 4C1XA 6I1BA 1LOEA 1FNYA 4ZJXA 4FOQA 2CL2A 1DFCA 3OBTA 4P9YA 3SISA 1DYKA 3KMVA 2GO2A 1ZL6A 1N3QA 3CNAA 3CA3A 1UX6A 4FOWA 2R0FA 3C88A 1LTEA 1DQ1A 3TC2A 2BQPA 3APBA 2ISHA 4Y20B 1DQ6A 1LJ7A 1CVSA 4IONA 3VUOA 5T52A 5DUWA 4I4SA 2NP0A 4GAFA 1N3PA 4XIKA 2HWMA 1ISYA 2WRYA 4AGVA 1GICA 4Z9WB 1SBDA 4YM1A 4ZXKA 1BYHA 4LO0C 4FPGA 3AYEA 3BAVA 1JXNA 1ENSA 1IRPA 3QYDA 2R49A 4GAIA 2WNEA 4D69A 2DVAA 4QBCA 1I1BA 1ISVA 3RTJB 4GP3A 3KM5A 3OGGA 1W6QB 3WLUA 2JDZA 4YW4A 3NBEA 4OWLA 1SR4C 4DRRA 3DUIA 2ERMA 3ZX7A 5HCAA 4JCKA 4G6MA 2BFHA 4PCRA 3B01A 2P39A 3LLPA 4BPZA 3O0XA 4UW6A 1AX2A 1RINA 4QD2C 1W6PA 1H30A 1Y7BA 2Q3NB 4DS0A 4EL4A 1Q8PA 4YZ5A 3A22A 3AH1A 3EF2A 1BLAA 4XFUA 1NXD1 4YM0A 1AX1A 2AGSA 5IK7A 1LU1A 2WBCA 1W6OA 1ONKB 1SLIA 5LK5A 2HZ9A 1GYKA 1Q03A 5JOWA 1QNYA 1AVUA 3KQRA 4EB2B 5EC5A 5GZCA 3H6SE 2ETFA 2K4AB 5SV8A 1TP0A 2JECA 3VEQA 1S0DA 4XBLA 3POWA 3M2MA 4BLJA 2KI6B 3AKHA 3A4UA 3PVNA 2ARBA 1S0LA 4AN6A 4XMIA 1TOOA 1W6PB 3ILAA 3ZSKA 2EF6A 1FV3A 4I2SA 1V6WA 1W0OA 1QNWA 2NTDA 3ASIA 1CJPA 5F5QA 1BFCA 3C8BA 3INAA 3IM6A 2R9KB 1ONAA 1GV9A 3MALA 1VAMA 1GLHA 3ZSLA 2G7NA 4YM3A 5DZEA 1HLCA 3IIRA 4GOVA 1V6MA 5DXDA 1SLLA 2YMZA 3BA7A 1N1SA 3UDAA 1QDCA 1W6OB 3M1HA 3WVJA 1MS4A 1Q56A 2FGFA 3PHZA 4Y1XA 2PHFA 4JC1A 1D2SA 4I30A 1ISWA 3M3OA 4WVWA 2PHUA 2IMAA 4LBLA 2RSTA 2MIBA 3POKA 2ET2A 1TTUA 2A6WA 1FWVA 4HEVA 3DDBA 1JYCA 1WLCA 2DVDA 1V6KA 4IZEA 1Z0HA 1V6XA 3RQ0A 1SBFA 2ENRA 4I6IA 5KXBA 2EXKA 2G7KA 41BIA 4I1EA 4NOTA 4U36A 4G9MA 3ZVXA 1EYLA 2NVHA 4ASMB 1ULGA 1HKDA 1SLAA 2AH2A 1J0SA 5T55A 1MR5A 3NV3A 1LOFC 2VXTI 3O4BA 2W39A 3BRGC 4R9AA 5BYNA 2X2SA 3O5SA 1ZN3A 1XHBA 1QKQA 3BAHA 1APNA 3FJIA 1CPNA 3BONA 2ISEA 3B9CA 4ZBVB 1AVBA 4HR6C 3OYWB 1JT4A 2A8AA 4FPCA 5T54A 5JOYA 4G1RA 3ZUSA 4H9WA 5BOWA 2W2DA 3JRRA 1EVTA 4YZ4A 1DQ4A 1BA7A 5EWSA 1MZ5A 3ZXKA 5JOXA 3D6EA 4FPLA 3WINA 4PF5A 1SFYA 3D5OA 1HWOB 2UUSA 5IK4A 3CRGA 4Y1YA 1FN0A 2WT0A 3O12A 3P53A 2M49A 3AX4A 4PQ9A 4YFWA 4XOGA 2D1ZA 3DSEA 1R1ZA 2D6NA 3NJ5A 4XXAA 1ULDA 2DREA 3FJCA 4M3CF 1K5UA 4LBQD 3PG0A 1CQ9A 4XDQA 1CONA 5GLZA 1M2TB 1G9BA 1QXMA 4YM2A 1BFFA 1DJSB 3UJ0A 1GNHA 4DEPA 4TLPA 1UPSA 3CQAA 4I1BA 4UW3A 4AVTA 2AFGA 2QYIB 1G7YA 1BARA 4XJAA 1XG6A 2V73A 4XJWA 4OUJA 3AKGA 2JJ6A 3BRFA 3FUQA 3BB2A 2VLCA 3BOOA 1IOAA 2VW2A 1Q8SA 1QOOA 4XBNA 3AP9A 8I1BA 3SH3A 3T1LA 1IS5A 1RMLA 2I1BA 1AX0A 4UW5A 1ITBA 1A78A 3HSMA 4YW3A 1BASA 1WLDA 3AP5A 1CESA 5F8SA 3CAHA 3MW3A 4FPJA 2P37A 4XXPA 5JOZA 2NZ9A 2KH2A 1PUMB 3N7LA 4XIOA 3AH2A 4LBKA 1HWMB 2ZHLA 3ATGA 1HCEA 1V6JA 3NV1A 4J2SA 1F31A 1VALA 3H0OA 4LO3A 4LBMA 1SLCA 2DWRA 4K20A 3AP4A 4KUFA 1QQKA 1WW7A 2A5ZA 4XYXA 3WO2A 2F8XC 4Q27A 2ZQOA 4KBBA 5GLWA 1W3FA 2P2KA 5D62A 1W3AA 3OBRA 2ZGRA 2LTNA 1Z78A 3BOPA 3RRDA 5BQNA 3NV2A 1LHOA 3VKLA 1IT0A 3U4XA 5T5PA 4P9XA 2BEAA 2G7QA 3AP6A 4GKXA 1HCDA 1TFMB 1ENQA 1F5FA 3WMUA 4EFRA 4JPZA 3D7WB 5CAZA 1RITA 2JE7A 3UJ4A 1L2HA 4LBOA 4H55A 1TWMA 2DS0A 1MS5A 2D20A 3D4KA 2Y9FA 3A23A 2DVBA 1F82A 3FLRA 3F1RA 3WV6A 2SBAA 1LENA 3W59A 1PZ8A 3T2TA 2YY1A 3O0VA 3MW4A 1JOJA 1HQLA 3UD8A 3WDTA 1LCLA 4IQPA 5DG1A 2VXRA 2A3WA 4HL0A 3AZYA 4XHBA 1M16A 1MC9A 1C4RA 3BIWE 2YV8A 1IKQA 4Q91A 4R9CA 4SLIA 3ZXFA 3USUA 5BQUA 4DRVA 4EFQA 4L8QA 4Z8BA 3UJQA 2A97A 3HBWA 1W3GA 2WT2A 3UD7A 3SNVA 1DZQA 2D6LX 4ZFUB 1YBIA 4RA0A 3M3QA 4X38A 5GLTA 3IPVB 5BXPA 3NWKA 2P23A 3FUOA 4YG6A 2V5YA 3WZ1A 1MS3A 4Q8KA 3WG4A 3OGFA 3HALA 4I0YA 3N35A 4JP0A 1BZWA 4EJ5A 4CJMA 1MS0A 2ZGQA 1HKNA 3VKFC 4FPHA 3ZXJA 3WDVA 2ZGOA 2Z49A 1IS4A 2QN4A 3USUB 5BXRA 4D0TA 5GLVA 2ZMLA 2ZKNA 4Q1PA 4XHXA 1SZ6B 2FMDA 2P3JA 4BOWA 3AZXA 4AVVA 2Y9GA 2E7TA 1Q04A 2JKBA 2A6VA 5H9QA 3DS9A 2ZACA 2VSAA 4WBCA 3CRIA 1FMMS 1G9DA 4LO8B 4FOYA 1JLYA 3A21A 3C8AA 1FATA 4GKYA 3ZC9A 2ZGLA 3FJJA 2ERFA 2HW9A 3WINC 2DTYA 4YOLA 2LIEA 1WBLA 1ABRB 1WW4A 1PZ7A 1GSLA 3QIXA 4YW1A 5I1BA 1CN1A 1YXWA 1F9KA 3VKMA 1J1TA 5HCFA 2EXIA 1W0PA 2ZABA 1N3OA 1BKZA 1ZKXA 2ZBJA 1HWNB 1Z2VA 2GNBA 3F62B 1XZZA 1IS6A 1QMJA 4KC3A 4XJ8A 4DFSA 2AQZA 4M3CE 2ZHNA 3NBDA 3WA1A 3BOKA 2VSEA 2DYCA 4X37A 1LESA 2AR6A 2RQ9A 3K3QB 3M3CA 3WCSA 5DUYA 3WHTA 2VH9A 4I4QA 3AZZA 2PHWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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