3V0AB

2.7 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords BoNT/A
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0aB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0aB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0aB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0aB01
2F8XC 1V6NA 3ZXLA 5HCAA 4BLIA 3H6RA 4YGDA 3T1MA 2BEBA 3IPVA 2CNAA 1YTOA 3NF3A 2AENA 31BIA 4M3CE 1OFSA 3LCPA 1XG6A 3V64A 1ULEA 1FNZA 5DXDA 1JY0A 1EPWA 3V0BB 2ZGTA 4P6AA 1YVGA 4JRAA 3M1HA 4FOVA 1T9FA 1QNYA 4TYSA 3ZYPA 5JOWA 1HWNB 3WCSA 3R05A 3P6JA 5T5JA 3BRDA 3N7MA 3AJ6A 1CE7B 1A78A 3ZXEA 3N35A 1TOOA 1DQ4A 3P6IA 2ZR1B 3VKLA 1AX2A 1ZKXA 3JUUA 5HPZA 5KXBA 2DVDA 3N0KA 4P9WA 4KC3A 3AKIA 3VT2A 2VH9A 5JOXA 1Q8QA 2WT2A 4R9BA 4FP3A 2OVUA 3BA7A 3ZUSA 3DS9A 3VT0A 5BXPA 2ZACA 4R9CA 3A22A 4XXAA 3FFZA 1FWUA 1FV2A 4FGFA 4QBVA 5T50A 2DVGA 4I4YA 6I1BA 1N4KA 1FATA 2YXSA 2P3JA 5FREA 4LBQA 2V73A 4BMEA 3OJBA 4G1RA 1W6NA 1DLLA 3SISA 3C2UA 1QQKA 3PG0A 3AZWA 3WDWA 4C1XA 1S0CA 2H0BA 4I1BA 5I1BA 2AQZA 1TP0A 1PZ7A 1LHUA 4XXPA 3IIRA 2W2DA 1FX5A 1SBFA 1KQRA 4FPCA 1VALA 4I4SA 3PMEA 5T52A 5BQUA 2GMEA 2OW4A 1BFGA 4USOA 5F90A 1W6OB 3NJ5A 1F9KA 2GN3A 1Z78A 5H9PA 2P3IA 3M3OA 5JVVA 3FUQA 3LTQA 2WBCA 2KM2A 3O4AA 1NUNA 5DUYA 4Y20B 2A6YA 4QKRA 1S0JA 3T1LA 1ZL6A 4Z8SB 4I4OA 1K5VA 3VUOA 5DUXA 2ZGPA 1KJLA 1HQLA 1ULDA 1DFCA 4YFWA 2UWBA 2AXMA 5H9SA 4I4UA 3O5SA 3AKFA 3IN9A 1W6PB 1ZB7A 2SLIA 3M2MA 4HR6C 3ENRA 3WG3A 3POKA 1QNWA 1LHWA 3WO4A 3ILAA 4YZ5A 3BAQA 4LO7C 3C88A 1TWMA 3OJVA 4P9YA 3VV1A 1Q04A 1AXKA 4GP3A 4A7ZA 3KQRA 3FJIA 1JLYA 2TEPA 1V6VA 2XHLA 3NBEA 1EYLA 1DIWA 4X3AA 3ZC9A 3RMXA 1ABRB 5F5QA 3QW6A 3MW3A 3V0AB 2KLLA 2A75A 1F31A 4Z8BA 4YGBA 2D3SA 1R8OA 3HR9A 2PHXA 2D22A 2WLQA 2GO2A 1LEDA 3I8TA 5T5LA 3WG4A 1LHNA 2E4MA 1S0EA 4WVVA 1GICA 3MW4A 1WD3A 3QLQA 1SLTA 2IMBA 4EFPA 4YM2A 3FJ9A 4J2KA 1MS0A 1G9BA 1EVTA 2UWAA 2ZGSA 4OWJA 4GAFA 3AP7A 1SR4C 2D23A 4RA0A 1O4ZA 2W39A 3N36A 1QU0A 2A6VA 3CA4A 4ZJXA 3WOGA 1IS6A 1GV9A 3UD9A 2GN7A 1GZ9A 5BQMB 3OYWA 1RY7A 3H6SE 1CONA 4M3CF 2DUOA 4ZFWB 5DZUA 2Q5TA 2D7FA 3CRGA 2CY6A 3QIYA 2ERMA 1MACA 3OGFA 1JUIA 1Z0HA 1J0SA 4LO2A 1T4QA 5GZGA 4I4QA 3ZX7A 2GMPA 2E53A 2OUJA 3IKWA 4X39A 1BFFA 4QALA 2WQZC 1UN1A 3WMVA 2YY1A 4Y22A 4QC4A 1IS4A 1FV3A 2DVFA 4SLIA 1WD4A 2D43A 1V6WA 3BX1C 3A21A 9ILBA 2WJSA 1LOBA 3GALA 1HLCA 3BADA 4FQZA 2DWRA 4GWMA 4EB2B 3CU1B 4BMBA 3BOPA 1XZZA 2D6OX 1DGLA 2EXHA 1HCDA 1ULFA 4FOWA 3B3QE 1ULCA 5L73A 4I0YA 3CAHA 3INAA 2F2FA 4OEEA 1QDOA 3HALA 4M01A 2W2DB 3C8BA 1JHNA 1LGBA 3V0BA 3USUB 1PZ9A 4LBQD 4JQ0A 2FFUA 5DUWA 2ARXA 1LEMA 3C89A 1UMZA 5FZUA 2A71A 3B9UA 3A4UA 5EYYA 5IK4A 4LO1A 3SITA 1AVAC 1JT5A 3BAVA 4YW3A 4YW2A 3FGMA 2A3XA 1BLDA 1S0FA 1LU1A 1NLSA 1Z4SA 1AJKA 1WBAA 3FIEA 1Q8VA 5HCFA 4HA2A 3ZSJA 3CQAA 2FHRA 2WSUA 3OJMA 4JAWA 2ZGMA 4XMIA 2DUQA 1N3PA 4AGVA 1SZ6B 1ZKWA 2WT1A 3RSJA 2D7RA 3HSMA 1LCLA 5GJ6A 5JDBA 3QW7A 1AX1A 1IRPA 1JT4A 3BONA 2G7PA 3AH2A 1V00A 2D6LX 5FZYA 3APBA 4M3CA 1QMJA 4EEEB 4J2SA 1CQ9A 2GALA 3BRFA 2EXJA 5DG1A 3R4UA 4Q26A 1SFYA 3AH1A 3Q7XA 4I4VA 5EXOA 4FPKA 2XG3A 2IWTB 1ENQA 3NV1A 3NBNA 5B2HA 1IS3A 1Z7HA 1LHVA 4XMAA 1LOFC 4AVTA 1KNMA 1UZZA 4AN7B 2DURA 2ZHLA 1R8NA 4YM3A 3ILRA 1LULA 1I1EA 3B00A 1V6MA 1FQ9A 4Q8LA 1W6OA 4GAIA 3BAUA 1S0LA 4HJJA 1AXMA 5BOWA 4CRQA 2GZBA 1LGCA 5IUQA 2WRYA 4Y20A 5FNWA 5DZEA 4USPA 3QIZA 1LECA 1G86A 1WUVA 3RQ0A 5G00A 5T54A 5T5OA 1IKQA 1D2SA 5GM0A 1SCSA 1UPSA 2D24A 1IHKA 5CA6A 2ET2A 3D3XA 4XIOA 4U36A 4XHBA 1JBCA 3POSA 4FP2A 1QXMA 1BASA 4G9NA 4Y24A 4UW4A 1AXZA 5GZFA 5JOYA 1QGLA 1VIWB 1V6XA 2JKBA 3AK0A 3I2XA 3QYDA 1U0AA 1GZWB 1A8DA 4LBLA 3SH5A 2DU1A 2KH2A 2ZMKA 5H9RA 4YG6A 4PCRA 4QKSA 1AX0A 3BA5A 2ARBA 3WLUA 1W3AA 2Y9XE 4DRRA 3AYCA 2ESUA 4LBKA 2R49A 4XBQA 3KMVA 2A6XA 2BQPA 4K1YA 3WINC 1V6JA 3V0AA 2YUGA 4LBMA 4PQ9A 1QOSA 1MZ6A 4R9DA 1E1HA 3UDAA 1LHOA 4JC1A 1AZDA 3AYEA 2A70A 1GANA 3VT1A 1ISWA 1H9PA 3WDYA 3AFKA 4YZ4A 2HWAA 1CJPA 3UJOA 4LBNA 4I96A 3AZYA 2Z49A 2W68A 2GNTA 4KS6A 4R9AA 4CZSA 4I4XA 4UW6A 3UJ4A 4LO3C 3ATGA 1FMMS 2VU9A 4M00A 5KXCA 2K4AB 5BQMA 2Y9GA 1KJRA 1DYPA 1QOTA 5FRAA 4K21A 2VLCA 5DZFA 4K1ZA 4TLPA 3FBYA 1JYIA 2YROA 1TTUA 4AVVA 3SH3A 1Z2VA 4H9WA 3BODA 4MYEA 1KDKA 3DUIA 2IHOA 4HEVA 4DEPA 3D4KA 3MALA 2AH2A 3BOKA 3QCWA 4M3CB 4XJ9A 4YZ1A 3D7WB 2FGFA 3WCRA 4IYBA 3O4CA 1DZQA 1W0OA 3GNEA 3WHUA 1Q8OA 1W3GA 1RITA 4PBOA 5GLWA 7I1BA 4Y1ZA 1HKNA 1ONKB 5IT6A 1SLCA 1DBNA 1SLIA 4ISQA 4XJWA 5T5PA 3PUBA 1JXNA 2DVAA 3USUA 2ZMNA 2M49A 1I3HA 4P0JA 1NZKA 2R1DA 4I3NA 3RS6A 3CNAA 1SLLA 1BFBA 3C9ZA 4FPGA 1CVSA 5D62A 3NBCA 3S8KA 3ZXJA 2K43A 2VXRA 2ZAAA 2ZQNA 3TC2A 3WG2A 2HW9A 4Q9GA 3AJZA 4XBLA 4NOTA 4A7YA 4HL0A 2Q9XA 1QF3A 3ZYRA 3U4XA 3HMYA 2CL2A 1ISYA 5T55A 2GNMA 2DYCA 2IMCA 5F8WA 4DFSA 3WHTA 3WDXA 1GLHA 1S0BA 1Y7BA 3VSFA 3CA5A 3FJFA 2ZMLA 1QQLA 3IMNA 2D1ZA 1MS5A 1HDKA 1N3QA 1RINA 1EV2A 3K1XA 3A07A 1W0PA 3RRDA 2RHPA 2HZ9A 5E24E 1MS1A 1FYUA 4OWLA 3DDBA 4XJ8A 3RMYA 1QKQA 3AXDA 1HKDA 1WBLA 1BARA 1JYCA 4YM1A 2ETFA 3F1RA 2ZHMA 1WBCA 3JU9A 2EXIA 4Q91A 4XJAA 2Y9WC 4YGEA 3AJ5A 2PHFA 4WV8A 2LTNA 4OWKA 1N47A 1PUUB 1ILR1 3N3HA 4AWDA 2NMOA 3PVNA 3CA0A 4J2XA 4F34A 1LOGA 2I2SA 5BXSA 1G9CA 1AVBA 3I4IA 1C57A 4W65A 1KRIA 3MEPA 3NBDA 4Q27A 3O12A 2ZGRA 5GLUA 1JT7A 4P0LA 5BQNA 1DQ0A 3CRIA 1MS9A 5FNXA 1II4A 4FPJA 2AR6A 3QW5A 3WG1A 2VXTI 2B7YA 2A7AA 5BP5C 2PHRA 2UURA 5CNAA 5GLZA 5IK8A 3BB2A 1SLBA 4Y26A 3H6QA 1WW5A 4XOGA 1TWEA 4UW3A 4I7IA 4XBNA 1DQ1A 2G7QA 4P14A 3AZXA 4PF5A 4X37A 2GMMA 3B9CA 3AH4A 3A23A 1LTEA 4AGRA 1ISZA 1GZWA 3CA1A 1YF8B 3WV6A 1JN2P 1UZYA 2P34A 3V65A 1MVEA 1FWVA 3QIXA 3T2TA 1AF9A 1K5UA 4EJ5A 4TZDA 2UUSA 1ZM1A 3RTIB 1HCEA 2R16A 3PJQA 2D6MA 4J1LA 1YRZA 4Y1XA 2W08A 4D8HA 2OUHA 3N7JA 2NMNA 4GKXA 2XB6C 2LIQA 4LO7B 2D6KA 1RG8A 1UX6A 4KUFA 3KM5A 3VEQA 1OQLB 4ZOTA 2EAKA 2ZGQA 5F9TA 3BAOA 2EALA 2ISHA 2SBAA 1AVXB 4WBCA 2X2SA 3BAGA 1VCLA 2ERFA 4H55A 1LOFA 5EG6C 1HWMB 4DS0A 3OPZA 4C1WA 4Q9PA 2PELA 3FJEA 4G9MA 4OEGA 2NZ9A 1UAIA 1GSLA 4ZFUB 1N1YA 2HYKA 2ZGOA 1XHBA 1YBIA 3ILFA 2PHWA 2DTYA 1ENSA 1JT3A 3A0NA 3S8JA 2VUAA 1WCSA 4QD2C 3AJYA 5CAZA 2QN4A 4YGCA 2FPQA 1ISVA 21BIA 2HWMA 1MS8A 1BJQA 2AFGA 4YW1A 2PHUA 2ZQOA 4QBCA 4I30A 2VW0A 2WKKA 1CN1A 2D7IA 5F8SA 5KXDA 3WO2A 2KKIA 3VWCA 2AUYA 2ISGA 1FMZA 2EXKA 3UD7A 4GXLA 1BXHA 1SBEA 1S0DA 1DJSB 3W9TA 1WBFA 1R1ZA 2CYFA 4GKYA 1IILA 2ENRA 1PZZA 4J23B 2A8AA 4XDQA 2DUPA 1JW6A 2JD4A 3AYAA 1RMLA 4EKXB 4BQ1A 1C1LA 3LSEA 4GWNA 1C4RA 2DU0A 3BOOA 1KDMA 3C8AA 2F2FC 2ZHKA 2NN8A 5H9QA 4ZGRB 2VW2A 4YLZA 1QOOA 1JTCA 1M2TB 4II0A 4ENDA 3RTJB 4FPEA 1PWAA 4ELCA 4CJMA 2MLLB 3W58A 2NVHA 3UJQA 1AJOA 4LBOA 2R0FA 2XOAA 4LO1C 4L4IA 4OZXA 3F62B 3HN1A 4BM8A 4KBBA 1HWPB 1W3FA 1LENA 3QW8A 4DENA 4ATFA 3QJ0A 5GZDA 5BVPI 3WA1A 2P39A 5EHAA 2ISEA 2YMZA 4LO0C 1W6QB 2VSEA 1IOBA 4FPHA 2R9KB 4UW5A 1BYHA 2WSVA 4ASMB 1Q1UA 1Q8SA 4FPOB 1QDCA 3PHZA 1V6KA 3VSZA 1O4YA 4XJUA 4X38A 4I4RA 3DSEA 1TEIA 4I8MA 1N3OA 1TFMB 4YW4A 2ZGKA 4RL7A 5GAQA 4QD2B 1ENRA 4ISRA 1VAMA 2ILPA 3BIWE 4FOQA 1WW7A 3AZZA 2BEAA 1LOCA 1PZ8A 4ZXKA 4KEKA 1V6UA 1XTFA 3PVOA 4Q1PA 4OUJA 3JRRA 3QR5A 4XIKA 2ZZJA 1T3CA 4FVVA 2JDZA 3VKFC 5JLVA 4Z9WB 4XZPA 3O0VA 3AZVA 3O0XA 4DRVA 1W6MB 4JCKA 5BYNA 4KTXA 3BTAA 3M3QA 3ZSKA 5DSSB 4ITCA 4KEJA 3POYA 1H9WA 2V5YA 4AVSA 2DVBA 1V6OA 4EFRA 2DS0A 2A6ZA 4XFSA 1IJTA 3AP9A 2D3PA 4FPLA 3FJHA 2UU8A 2NM1A 2DRZA 1CPMA 4AGGA 1Q8PA 1UKGA 1JQZA 1PC8B 3WUCA 2YZ4A 2NYYA 2ZA9A 3OBRA 4ZFYB 4IHZA 1X50A 1G9FA 2GDFA 2DV9A 5E88A 3OBTA 4PBPA 4XHXA 2A3YA 3UL2A 1JOJA 3RG0A 1CPNA 2E7TA 3IM0A 3FLRA 3OY8B 3W59A 3WO3A 2QN0A 4GOYA 2GNDA 4DPNA 2WNEA 3H0OA 1Q03A 1TIEA 1LESA 3POWA 2G7NA 3L2YA 1I1BA 8I1BA 1DZCA 3UK9A 1IS5A 2DRYA 3PVEA 3FJBA 5DUVA 5CB7A 3JUTA 3Q7WA 4D0TA 3FJ8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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