3V0AB

2.7 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/A
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0aB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0aB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0aB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0aB01
8I1BA 4CZSA 1AX1A 1G86A 3AYEA 1SLIA 1QU0A 5DUXA 1F31A 1TOOA 3NJ5A 4ATEA 1FMMS 2NYYA 4A7YA 3WG1A 3T1MA 3OYWB 5FZZA 4KEKA 1ISVA 1N1VA 3BAUA 3AP4A 4FPCA 4USPA 2UWAA 3O4CA 1FYUA 4GXLA 1JT3A 4L4HA 2ZGRA 5BXTA 4XIOA 4W65A 1F9KA 1MC9A 5H9RA 3ILNA 3WVJA 3FLRA 3WHUA 1SLLA 5DUWA 3LTQA 4JAWA 2HZ9A 1FN0A 1VAVA 4QKSA 1MVQA 3KQRA 4EL4A 3N7JA 3NBEA 2WSUA 3FJHA 3O3QA 3BRDA 4KTXA 1CIWA 2NMOA 4FPLA 2FMDA 3A0NA 5GAQA 1WLCA 2D43A 1V6JA 5DZFA 2GMEA 2FO1A 4LBLA 4IY9A 4LBNA 2FHRA 3S8KA 2P23A 3WG3A 3OGFA 4FOQA 4XYXA 4M00A 4PC4A 1SCSA 1LEMA 2IWTB 2EIGA 4RL7A 4QBCA 1IRAX 1JT5A 5HPZA 1LGCA 2GDFA 1AF9A 1KJLA 2ERMA 5H9SA 4K1ZA 2D3SA 2GNMA 2A6ZA 1GGPB 3QJ0A 3W9TA 4AVVA 5DSSB 4I6IA 4FPYA 2UUSA 1RINA 2YMZA 1V6IA 3UJQA 3B69A 4FQZA 2Z42A 1JYIA 4ZGRB 4P14A 1VALA 1V6OA 3HMYA 5F8WA 3D6EA 3WDUA 3MEPA 3BAQA 1JLYA 1FWUA 1KDKA 3HSMA 5FNXA 3CA3A 4QD2B 1CJPA 2D22A 1JW6A 4JKQA 4NO4A 3OJBA 3AKIA 1LGBA 5F8YA 4USOA 5GALA 4D8HA 3DSEA 4YLZA 1L2HA 2JDZA 4FOYA 1IKPA 3AJZA 1MACA 4H9WA 1BZWA 2ETFA 4WZFA 3ZPYA 4AVTA 4YG3A 1NZKA 3B3QE 1PZ8A 3VUOA 4CJMA 3Q7XA 4Q9PA 5EG6C 3B9CA 2WSVA 1IT0A 3M3EA 2E4MA 4YZ5A 2Q9XA 1T3CA 4QALA 2W2DA 3F62B 4Y1UA 1SZ6B 1UAIA 1XTGA 1TEIA 1BFBA 3V0AA 3Q9OA 1S0JA 3UD8A 2CWSA 2JE9A 4BMBA 2JJ6A 1VCLA 2KKIA 4DEPA 1VAMA 1MS0A 3BAGA 3SNVA 2W68A 1F5FA 2KM2A 3ASIA 1KJRA 4J2XA 3ZSMA 1TP0A 4TYSA 2P2KA 3T1LA 4XXPA 1ONKB 4L4IA 2ZZJA 3IPVA 1W3AA 5T50A 3AZXA 3HR9A 5KXCA 1PUMB 1AZDA 3ZXJA 1G9AA 5LK5A 1S0GA 3GNEA 1LTEA 1T9FA 3O44A 3OGGA 3FLPA 2YUGA 5FNWA 4YZ2A 4FOVA 1D0HA 1WW6A 4I4OA 3WZ1A 4GAIA 1WW5A 1DFQA 1N1YA 5L73A 3WUCA 1ZL5A 2E51A 4I3NA 5GLWA 1SR4C 2D6KA 4HANA 3PVNA 2OUJA 3PVOA 1K5VA 3C88A 4MYEA 2DRZA 1DQ5A 3AXDA 3OBRA 1WBCA 4P0KA 1GICA 2NVHA 3V0AB 2YY1A 1BA7A 3QIZA 31BIA 1LECA 4K1YA 1R8NA 2OVUA 1DQ4A 4EFQA 1WUVA 3AP6A 4ATFA 3HBWA 4J23B 3FFZA 5IK4A 3UJOA 41BIA 2NM1A 5FREA 5H9PA 4H55A 5GZDA 4OEEA 1N1SA 1PZZA 5EWSA 4IHZA 2ZGOA 1W6OA 2YZ4A 3K3QB 1AXZA 5GZEA 3IPVB 1YYNA 3OJMA 1YI7A 5CAZA 4XFTA 5JVVA 2WLQA 2FPQA 3IN9A 1OQLB 3HOMA 3JUUA 1ULEA 3WO2A 4LBMA 2G7KA 2ZGQA 2X2SA 4K21A 4Z8SB 1JYCA 3R4SA 2Y9XE 1LENA 2QN0A 3BOOA 4ISQA 4LO3A 1LOAA 3AKFA 4G9NA 3UJ4A 3AH2A 1LOFA 4DENA 2LIEA 5B2HA 2DYCA 4FOWA 1U0AA 1EPWA 1KRIA 1JLXA 3R4UA 1I1BA 5KXBA 2Z49A 2ZGPA 1MS8A 3WCRA 1N47A 3IM7A 5GLZA 3MPPG 4Q1PA 1LOCA 2E7TA 3POKA 5DG2A 4FGFA 1PZ9A 4X39A 5AVAA 1RG8A 1HCDA 2ET2A 3P53A 2ZACA 1W6NA 4F34A 2VXRA 2D3PA 2A70A 1Q1UA 2D23A 1LODA 1W6OB 5EC5A 2DRYA 5GLUA 1V6XA 1URXA 3H0OA 3N35A 4M01A 1LEDA 4YFWA 4YM3A 2WT2A 1UX6A 9ILBA 3BA7A 1DQGA 3UD9A 2FGFA 4FQ4A 2NP0A 3POYA 4AN7B 4YM2A 4XFSA 5BP5A 5EXOA 4YW2A 4P0JA 2P39A 2ZGTA 5IT6A 3FGMA 2PHRA 3WDYA 3SITA 4Z8BA 4Q27A 2ESUA 4ZJXA 3PMEA 1NUNA 2V5YA 2RSTA 3DGTA 3A4UA 2D7FA 3I4IA 4FPFA 2Y9WC 1J0SA 1GANA 4Y1VA 2IMCA 1GLHA 1FV3A 5JOYA 4FPGA 4D69A 4M3CA 1FAYA 3V64A 4LBKA 3PVEA 1LHUA 4AVSA 1AVXB 1ZL6A 2A6YA 4YW3A 1W6NB 2DURA 2MLLB 1M16A 4LO2A 4YZ3A 4KBBA 2ZHMA 4PF5A 3POSA 5DUUA 1I1EA 3I29B 4QBVA 3MW2A 1ZM1A 4EB2B 2A71A 3IM5A 3N7MA 1AVBA 2DUOA 2L5XA 2VLCA 1RY7A 4LO0C 4ISRA 2PHFA 2XG3A 2G7PA 4DQAA 1XTFA 2DVFA 1IS5A 3P6JA 1T3AA 3MALA 2HWMA 1Q8SA 5I1BA 3ZX7A 1CVSA 2ZQOA 4BMEA 4EEEB 5F5QA 4Q8LA 5KXEA 1LHVA 1KQRA 2G7NA 1MS3A 1JHNA 3ZSKA 1A78A 4XJ9A 1G9FA 4U36A 4GOYA 3OBTA 5DZUA 2GNBA 3QW8A 3Q7YA 2YXSA 1AXYA 5E88A 3N7LA 5HCAA 2NMNA 1G9CA 3AKGA 3I2XA 3N0KA 1HQWA 2FFUA 1CPMA 4XJZA 3A22A 4M3CB 1MZ5A 4XIKA 1SLAA 4LO2C 1IILA 4Q2FA 3WDTA 4BOWA 4DCKC 2DTYA 2LALA 2SBAA 2AQZA 3BRFA 1SBFA 4YM1A 3NV3A 2KI4A 1CVNA 6I1BA 2AH2A 1APNA 4AGGA 4JKXB 3DDAA 1BLAA 2HWAA 2ZA9A 2AYHA 3ZUQA 1GV9A 4H04A 2VSAA 2DVBA 1QDCA 3IM0A 2M49A 1TWMA 2OUHA 4CRQA 3BB2A 3B00A 3FJAA 2BEAA 1W6QA 1Q04A 1LHNA 1FQ9A 2F2FC 2CTVA 2DWRA 4YZ1A 3DS9A 4L8QA 1IJTA 4J1LA 5BQNA 1AVAC 4I4RA 3FBYA 2CYFA 1UKGA 3AZWA 2P3IA 2K43A 4WBCA 4XBLA 4FPOB 1LOBA 4GP0A 2BQPA 3D3XA 2D24A 3UDAA 4LO7C 4WV8A 1SACA 1JQZA 4AN6A 3FJ8A 2XHLA 2WT1A 1WCSA 5T52A 3CQAA 1ULFA 4CTEA 4KEJA 4XE9A 2AREA 3WHTA 4ZFUB 3BRGC 3C2UA 2R0HA 2C9AA 3C8BA 2Y9FA 4XJUA 3B9UA 1RMLA 1C57A 3ZURA 1HDKA 1AXMA 4AGVA 4GAFA 5JOZA 2A8AA 4JP0A 3FIIA 3ZXEA 3O12A 4JCKA 4M3CE 1BQPA 3LLPA 2ERFA 3NV2A 1DZQA 4IYBA 2DUPA 2C5DA 2Q3NB 1W6MA 1TFMB 3WINC 3AP7A 3GALA 3KMVA 3CA4A 1O4ZA 4II0A 2XOAA 1Q8PA 4PCRA 1FMZA 5BXRA 4GKYA 1QOTA 1W6QB 5FZUA 1OQ1A 5BQUC 1R1ZA 3QR5A 2WQZC 4J2YA 1S0FA 2D3RA 2CWMA 4P9YA 2P37A 2EXIA 1B09A 4HL0A 1WBAA 4F83A 4I1EA 4YW5A 3BA5A 2ZMNA 1YF8B 1LGNA 1AFCA 3VKOA 3A0KA 1YO8A 3PUBA 3BADA 2XHLB 3FUOA 1JN2P 1WBFA 3RS6A 1XHBA 4Q91A 3WA1A 3RTJB 3D5OA 3R05A 5T5LA 1HLCA 3OJ2A 1Q8VA 1DZDA 1IOBA 1SR4A 4XMIA 3FJDA 4ZA3B 4GKXA 3FJIA 2Y9GA 1MS5A 2VW1A 3VKFC 2NN8A 5F8SA 3H6RA 1DBNA 1V6UA 3NBDA 5D62A 5BQMA 1QQLA 4I0YA 3K1XA 1MS4A 4I7IA 1W6MB 4LBOA 1C4RA 2KLLA 4YGDA 4XMAA 4PBOA 1Q8OA 2CY6A 3VV1A 4OWLA 3F1RA 1IS3A 4ZXKA 3WOGA 2QN4A 2ILPA 4LBQA 3O4BA 2AAIB 2D20A 3NBCA 1ISWA 3JUTA 1N1TA 4IY8A 1JY0A 4I4SA 4OUJA 1DIWA 3OY8A 4JPZA 1S0BA 4I96A 4HA2A 2D6MA 4YG0A 4AWDA 2D7RA 1V6NA 1UMZA 3O5SA 1PWAA 3BOPA 1LCLA 1S0IA 3BONA 4XXAA 1W3GA 2BFHA 1W6PA 1QOSA 4FP3A 2CNAA 2W2DB 3AP9A 1EV2A 4ZKTB 2ARXA 5GLTA 4GWNA 4R9BA 3T2TA 5D61A 3UK9A 1UPSA 2VU9A 2JKBA 2ZGUA 1AVUA 2AUYA 3H6RB 4QKRA 1C1LA 5G00A 2A6WA 4WVVA 3VKMA 1G7YA 2ZBJA 3JRRA 1AX0A 5BQMB 1Z4SA 4EFRA 3IAGC 2MIBA 4IONA 1BYHA 3H6SE 2ZHNA 3WMUA 1UN1A 3S8JA 3NBNA 4ZFWB 1GNZA 4D0TA 3VWCA 1MD6A 2SLIA 3SH5A 2EALA 2PELA 3W59A 2ZMKA 2LTNA 2ZGKA 2ZHKA 2ZGNA 5E24E 4DRRA 3SLIA 4YM0A 4X38A 4LBQB 2CL2A 2Q5TA 4KS6A 3SNMA 1YBIA 2ZHLA 3BA4A 3ZXFA 1HWOB 4J2SA 1LOEA 4QO3A 2AXMA 1YXWA 2D44A 3OY8B 4A7KA 4I30A 3N7KA 2DVAA 1G82A 1YTOA 1BFGA 3ILAA 2PHTA 1O4YA 3AJ5A 3W58A 2R0FA 3IIRA 2RG9B 4KC3A 3FJBA 3CA0A 1W6PB 1FV2A 4LO8B 4Y1YA 3AX4A 1SLCA 4X37A 1WLWA 2ISGA 3UD7A 4I1BA 1MR5A 3ENRA 2AFGA 5JDBA 1FWVA 2RQ9A 3SISA 4C1WA 2PHUA 1ZA4A 4G9MA 2AENA 4AGRA 1G8WA 2PHWA 1AVWB 4D0ZA 5EYYA 1II4A 1XG6A 4AYUA 3O4OA 5GZCA 4X3AA 2YROA 2D7IA 2W52A 1PUUB 4KEIA 5E89A 1ITBA 4PQ9A 3O0WA 2DU1A 1GBGA 4DFSA 1AXKA 2GZBA 2UURA 3ILFA 3WMVA 1MZ6A 1JUIA 2ZKNA 2WRYA 1Z78A 3D7WB 4XHBA 3ZUSA 1QKQA 3WG2A 4FVVA 4I4UA 1VLNA 4I4VA 3VEQA 1PC8B 2F8XC 1AX2A 1N3OA 2UWCA 3JU9A 4LO1C 2J3PA 4I37A 1TIEA 3AKHA 5D63A 2HYKA 1DFCA 2ARBA 4LO0A 1LHOA 5T55A 5FRAA 1JOJA 1EYLA 1H9PA 1XZZA 2A7AA 3AYDA 2IMBA 1S0CA 3BAOA 1E0OA 1KITA 4WVWA 2HW9A 2P34A 3WDXA 3WV6A 1ENRA 5JOXA 4C1XA 2E53A 5T5OA 3MW3A 4JRAA 2P3KA 2K8RA 1N4KA 4IQPA 3D4KA 3NV4A 4Z9WB 4ZBVB 4DPNA 3WNXA 1V6VA 4I4QA 4FPHA 3NWKA 1FX5A 4IZXA 4P0LA 1Q8QA 4OWKA 5IK5A 4Y1XA 3CAHA 2A6XA 1WLDA 3I8TA 1IRPA 1LULA 1RZOB 4YG6A 1H30A 3OJVA 1HIBA 4GP3A 3VKLA 1SBEA 1Z0HA 1DQ6A 3VKNA 3WDVA 3WG4A 3ZXDA 3O0VA 3QIXA 2F2FA 3VT0A 1UZYA 1A8DA 3AH1A 1OKQA 4YFZA 1DQ0A 4TZDA 3BOKA 2IMAA 3WO4A 5DUVA 4YOLA 1LHWA 3WLUA 3Q7WA 4ZFYB 5F90A 1H9WA 3M3OA 2A75A 1ZKXA 1LU2A 2EXKA 2VUAA 2DS0A 4HR6C 2ZAAA 2V73A 3IMNA 1JBCA 3NF3A 3AJYA 2JECA 3USUA 5GZGA 1LU1A 4KUFA 3RMXA 1CE7B 1WW4A 5T5PA 3RQ0A 1T4QA 2QYIB 3L2YA 1DQOA 2EXJA 2W39A 1E1HA 2VW0A 3QW7A 3LSDA 1SFYA 4A7ZA 3VT1A 4Y22A 1NLSA 1ISZA 2PHXA 4XZPA 3NV1A 4UW4A 4FPJA 3CU1B 2FDBM 3N3HA 3WINA 3FJJA 3M1HA 2W08A 2E6VA 4ASMB 3KM5A 2TEPA 2GNDA 2R9KB 4OEFA 1QQKA 3CA5A 3QCWA 3U4XA 1NXD1 1IKQA 5BQUA 2GALA 5DZEA 4YGEA 5E8AA 3O49A 5DVHA 1V6MA 3WDWA 5DXDA 3VSZA 1GZCA 3FJKA 4I4YA 3QW6A 2R1DA 2LIQA 1BARA 1RIRA 4LO7B 1V6KA 5KXDA 4LBQD 3BAHA 4EFPA 1AJKA 1ILR1 3M2MA 3USUB 4K20A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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