3V0AB

2.7 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/A
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0aB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0aB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0aB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0aB01
4WVWA 3O0XA 3KMVA 1II4A 2HWAA 1OQ1A 4EL4A 1VAMA 1FN0A 1S0FA 2CY6A 4G6MA 3AZYA 3FJIA 1S0GA 1OQLB 1S0EA 2W39A 3ZXLA 1TEIA 3R05A 4Q27A 2ZGSA 1Q1UA 1IOAA 3M3QA 3WUDA 3W9TA 5GZCA 3WO2A 1KDMA 4P9YA 5FZUA 1UMZA 1HCDA 1SLCA 1FV3A 1ONAA 1SLLA 3B01A 5H9RA 1FAYA 3ZURA 4LO7B 1MS0A 2HW9A 2Q5TA 2V5YA 3POWA 3ZUSA 1QOSA 1KRIA 2I2SA 3FLTA 3C2UA 3DUIA 3FJHA 2ZHLA 3WHTA 3BADA 2CNAA 1LOAA 4H55A 3QW5A 1CN1A 2AYHA 1UPSA 2K4AB 1W6NB 1DFCA 2WSUA 4D0ZA 2M49A 1LULA 1YI7A 3O44A 1NXD1 4XXPA 1QOTA 1AX0A 3AJ6A 3FJ9A 3AP4A 3WINA 3FJAA 4YG3A 1CJPA 3OYWB 41BIA 3I4IA 5T5PA 1OKQA 5T50A 3BOKA 3O49A 1SCRA 4YZ1A 1JUIA 1PUUB 1S0JA 2Q9XA 5JOZA 4Y20A 4XTMA 4Z9WB 1HLCA 5CB7A 4P6AA 2VW0A 1TFMB 3FJDA 3O0WA 2PHFA 3D7WB 5L73A 3AJZA 4M01A 1O4YA 3PVEA 4HANA 2DUPA 5HCAA 4IY9A 3TAYA 3AZXA 5HPZA 4Y22B 5T5LA 4YGDA 5FRAA 5FNXA 3USUA 2CWSA 2VSEA 4BLIA 4KUFA 1S0DA 2A6VA 5GLUA 3AKGA 5SV8A 1E0OA 2E51A 1G7YA 5IK5A 1HQWA 2A7AA 1G82A 1GZWB 1N3PA 1MS8A 2JKBA 4EB2B 1ZL5A 1DYPA 3AKHA 2VW2A 2ZGNA 3OJVA 4CZSA 4ZXKA 3A22A 4ZOTA 2Z48A 2ZMKA 3AYDA 1W6PA 2A6WA 3N36A 1W6QA 3A0NA 3CA1A 2EXIA 2PHUA 3O4CA 4FPLA 4I4RA 4LO3C 1XYFA 1XTGA 4H9WA 3MPPG 3FJBA 4OWJA 5BQUC 1WLCA 1YVGA 1DZDA 3ILAA 2ARBA 3BOOA 5GJ6A 5F90A 4I4OA 1AF9A 4C1XA 1RG8A 4FPFA 3P53A 3BB2A 3H6SE 2IHOA 2A6YA 2KKIA 3EF2A 1TOOA 4Z8BA 4JQ0A 1WD3A 3LSEA 4XTPA 3U4XA 3VSZA 3CA5A 4G1RA 4YM1A 4K20A 4NO4A 3S8KA 2R0HA 5BXRA 4ZGRB 2ZGRA 2DVDA 2RHPA 1P63A 2DUOA 4WV8A 4UW4A 2AAIB 3P6JA 1WW5A 4GAFA 3QIYA 3ZX7A 1ISWA 4XIOA 1X50A 1ULFA 2GNMA 3D3XA 1JLXA 4ZFYB 1TTUA 1KDKA 1LOEA 3GNEA 2G7PA 2ZMLA 2K43A 3V0AB 3B00A 2WT2A 3WDXA 4AYUA 3UK9A 3CA0A 1D0HA 3FIEA 1ZKXA 3NV2A 3B69A 1BFGA 1JBCA 3WDWA 1IRPA 4XMIA 4IY8A 2D6NA 4XHBA 5CA6A 4BM8A 3KQRA 3LSDA 2EXJA 2ZZJA 5GLTA 3FGMA 2E7QA 1MVEA 4BOWA 1YXWA 1LOCA 3ZC9A 3R4UA 1L2HA 1D2SA 5IK7A 2R1BA 1IS4A 3AYEA 5JDBA 2ILPA 1V6UA 1LHWA 3BONA 2D7FA 4QD2B 1V6XA 3VKFC 1SBDA 2JDZA 1I3HA 4LO3A 1JTCA 1ULDA 4P0JA 1ZKWA 4HEVA 4EEEB 4HJJA 3T1MA 4C1WA 1CE7B 4D69A 5BQUA 3K1XA 4Q2FA 1AVAC 3B9CA 4A7KA 1LOBA 2Z49A 1URXA 5FREA 1B09A 2NMOA 1LU1A 2ESUA 3B3QE 4XJWA 3RTIB 4KBBA 4XBQA 2FHRA 4IONA 3Q7WA 3O4OA 3OPZA 3VV1A 3V0BA 2JE9A 3L2YA 1S0IA 3VT1A 1Q8VA 2ES3A 3AZVA 1U0AA 3IKWA 3M2MA 2GN7A 1EPWA 2FO1A 5GLWA 4X38A 1MZ5A 3WA1A 1ISXA 1A8DA 2R0FA 5CBLA 1CR7A 2QYIB 5HCFA 3K3QB 4FPYA 5EXOA 2ZKNA 1IS6A 3ATGA 1DIWA 2Y9GA 1UKGA 1YBIA 5DXDA 4JRAA 3ZXJA 1LHUA 1LODA 1E1HA 2ETFA 3E8LC 4I1BA 1BARA 2KI6B 2ZGPA 2Y9WC 1LEDA 3PUBA 3BAOA 4Q9GA 1MACA 1W0OA 2A3WA 4YM2A 3WG3A 2UWBA 5E8AA 2D1ZA 5EYYA 3WMVA 1BZWA 2D6MA 3BODA 4YGCA 3HALA 4J23B 3NBEA 2LTNA 3HN1A 4M3CE 1GLHA 1BFCA 3T1LA 4YM0A 4J1LA 1R1ZA 3FIIA 1BASA 2SBAA 1JT3A 3I29B 4ZLBB 3M3OA 1GICA 2ZHNA 3UJ0A 4QKRA 5DUVA 2D3SA 3IIRA 4AVTA 4KEIA 5CAZA 3RSJA 1HWNB 4AGGA 1WD4A 3A4UA 1WLDA 1BLDA 3IAGC 3IMNA 1M16A 2WRYA 1F82A 1QMJA 4WZFA 5BXSA 2R16A 1DJSB 3FBYA 4LO2C 1XG6A 5F5QA 2ZAAA 1DQOA 4IYBA 1AVBA 5F8WA 1LESA 3OGFA 2AR6A 3UD9A 4YW3A 1JYIA 3FJ8A 2P34A 2ZACA 1LOGA 4Y20B 1Q56A 4XDQA 3FJJA 4I37A 1BJQA 3POYA 6I1BA 2BEBA 2FGFA 5IK8A 4FP3A 3JUUA 2W68A 3CA6A 1NLSA 2YXSA 1SLBA 3QIZA 4I0YA 3USUB 1V6KA 5GLVA 3BA7A 4K21A 1GNZA 9ILBA 3ILNA 5FZYA 1ENQA 1VCLA 4KEKA 3IM5A 2F8XC 2DWRA 4HR6C 4A7ZA 1KJLA 4FPEA 1GKBA 1SLIA 2L5XA 2ZQNA 4QBCA 1HWOB 1Q04A 2ISHA 4TYSA 2ENRA 4JC1A 3JRRA 1ULEA 1W6PB 2XHLA 1W6QB 1HWMB 4LBLA 1V6VA 4J2YA 3CQAA 2VXRA 3WG1A 5GZDA 1BQPA 4X3AA 3AYAA 1WBFA 1YO8A 2P3IA 1TIEA 4FP2A 3A23A 5H9PA 4XJ8A 4U36A 4XJZA 2WQZC 5LK5A 2OUHA 4YLZA 5KXCA 2WT1A 1Y7BA 1V6MA 1A3KA 1BYHA 3CRIA 1V6WA 1G9AA 2WKKA 4Q1RA 2ARXA 5DUWA 1PWAA 1V6OA 3BA4A 1AXZA 2DYCA 1GV9A 4XE9A 4LO2A 4FPGA 1EVTA 1GGPB 3ZSKA 4OWLA 4LBMA 2J3PA 1V6IA 3AP9A 2R49A 3UD7A 1N1YA 5D61A 4YOLA 1FWVA 4M3CF 1LJ7A 3NWKA 4CJMA 1HKDA 4QO3A 1I1EA 2EXHA 1YIFA 2KM2A 2UUSA 1W6OA 2BFHA 4ATEA 5KXBA 3TC2A 3C88A 5JOXA 4R9AA 2X2TA 4L4HA 3WUCA 1DQ1A 2GN3A 1JN2P 4YZ2A 2F2FA 1LGCA 2DUQA 1RINA 2NN8A 1AJOA 1AVUA 5BP5A 1GNHA 3C89A 3AH1A 3WG4A 4JAWA 4FPJA 2ZHKA 3AP6A 2WBCA 5BVPI 1BFFA 1N1VA 2JJ6A 4XYXA 3N0KA 3VSFA 4P0KA 2ZGUA 4J2XA 3WDUA 3AKIA 3ZXDA 3F62B 3WOGA 2ZBJA 4Q9PA 2DVBA 4F34A 2ZGKA 3CA3A 1SBEA 2ZMNA 1IKQA 4PBOA 5GAQA 3AXEA 2VU9A 3HOMA 2AENA 3FUQA 2D6PA 2DTYA 1QDOA 4LBNA 1NUNA 2FMDA 3SLIA 3MALA 4I3NA 3D4KA 4K1YA 3QLQA 3KM5A 3BAGA 3PVOA 2PHRA 3O4AA 3VEQA 2QN4A 4USPA 3ILFA 1EYLA 3V0BB 1W6MA 4AGVA 1W3AA 3O0VA 4OEGA 2CWMA 2D44A 3FUOA 2IMCA 2JE7A 2VW1A 4AGRA 1Q8PA 1TWEA 4G9MA 2XG3A 3F1RA 1S1AA 5D63A 2WT0A 4I4XA 3NBDA 4R6UB 4ZJXA 4J2SA 2HWMA 4PBPA 2EALA 4XXAA 3MW3A 1CPNA 2YZ4A 1RY7A 4L8QA 3GALA 4XHXA 5BXPA 2CYFA 2D6KA 3PMEA 5F9TA 3WVJA 1H9PA 2K8RA 2GALA 4P9WA 3O5WB 2GZBA 1CESA 3VKOA 4XJUA 5G00A 2GDFA 4XFTA 3DDBA 2NMNA 2A75A 3DSEA 3SH3A 3RMXA 8I1BA 2OUJA 5DZEA 3AFKA 3W58A 4HA2A 3SH4A 3BRDA 1WBLA 5JMCA 1QQLA 1RMLA 2G7NA 5JLVA 4DEPA 2MLLB 4CTEA 3FJCA 4UW3A 5DZGA 2R1DA 3IPVA 2H0BA 2ERFA 4XIKA 4AN7B 1CONA 3FJFA 3NF3A 1GSLA 3QIXA 3CRHA 3UL2A 3FJKA 2UURA 1ILR1 2GNBA 2R9KB 1MS5A 4R9DA 2BEAA 1FMZA 3UD8A 1G86A 5DG1A 4DQAA 3ILRA 3O4DA 1N3OA 3NBNA 1JQZA 1G9CA 2ZGLA 2A97A 3UJOA 3AP5A 5F8YA 4AVSA 4YZ5A 1F31A 3PHZA 4OEFA 3BWIA 2DS0A 3NJ5A 4WVVA 3OY8A 3BAVA 4ZFUB 1PZ9A 3O5SA 2P3JA 4ASMB 1NZKA 3ZYRA 4LBQA 3TB0A 1Z4SA 2VLCA 3BAQA 3POSA 1ENSA 1EV2A 3ZPYA 1RIRA 4DFSA 2KLLA 4YW1A 3CRGA 1MR5A 4UW6A 4XJ9A 2D3PA 4OEEA 2LIQA 1Q8SA 5JVVA 1K5VA 1LGNA 4DS0A 2AXMA 2WSVA 2VSAA 1W0PA 3WMUA 1FNZA 3IM0A 4D0TA 3Q7XA 5DUXA 1Z7HA 2Y9XE 3D5OA 1KQRA 4G6JA 3CNAA 4BQ1A 3JU9A 1MVQA 2VH9A 3BAUA 5H9QA 1IOBA 1N1SA 1G9FA 4P9XA 5FZZA 2P2KA 5IT6A 1IJTA 1WW7A 1HCEA 1RZOB 2EIGA 3AYCA 1N47A 2WNEA 1KJRA 4Y1UA 3OJMA 5I1BA 1HIBA 1ISYA 1MS4A 2XHLB 1J1TA 1AX1A 1QNWA 2RQ9A 1LENA 1LTEA 4QKSA 4FOQA 5T5JA 2D24A 4OZXA 4XZPA 2NM1A 3N7MA 3S8JA 2D20A 1H30A 4Y1XA 5D62A 4DENA 4YW5A 3ZVXA 4USOA 3QCWA 2W2DA 2KI4A 3P6IA 2QN0A 1S0LA 2P23A 3N7JA 4GALA 4ATFA 1SFYA 3WHUA 4GOVA 2ZGTA 2YY1A 4FPHA 1YRZA 5DSSB 4FPOB 1YYNA 3ZXEA 3AK0A 1LHNA 4G9NA 3T8SA 1SLTA 4PCRA 3SNVA 5FNWA 2A6ZA 4CRQA 5DUUA 3V65A 4I6IA 1ABRB 1AVXB 2WLQA 4DCKC 2WJSA 2E6VA 4FOVA 3M3CA 3RRDA 1V00A 1JT7A 3H0OA 2D3RA 5GALA 4Q91A 1CIWA 1W6OB 1YTOA 3JUTA 1AJKA 1ENRA 5H9SA 1BKZA 1FGAA 1LCLA 4YG0A 3ZSMA 4AVVA 3WDTA 5JOWA 5BXTA 3I2AA 1CQ9A 2DREA 1R8NA 1F5FA 3M1HA 3INAA 3WNXA 4SLIA 1JOJA 3QYDA 2P37A 4LBOA 1UZYA 1WW4A 4GAIA 1AXYA 2UU8A 2GMEA 3HR9A 4LBJA 3WCSA 2G7QA 1WLWA 2EF6A 1W3GA 2F2FC 3OBRA 2ISEA 5KXDA 5F8SA 3VT0A 3R4SA 5BP5C 3ZXKA 2D23A 1DZCA 2DVGA 5HCBA 2A5ZA 4OWKA 2GNTA 1ONKB 2PHWA 1WBCA 3Q9OA 1QF3A 5GZEA 4M3CA 2XOAA 4QC4A 3SNMA 2IMBA 2DU0A 1CPMA 2YV8A 3AJYA 1QOOA 4I4QA 4JPZA 1SCSA 4XFUA 2W08A 2A6XA 1Q8OA 3H6RA 3V79C 1FWUA 1C57A 2ZHMA 1AX2A 4I4UA 1Q03A 3WDYA 3LLPA 3SITA 3O4BA 3MW2A 1W6MB 3N3HA 2DRZA 1C4RA 4D8HA 2RG9B 3WO4A 2E53A 3VT2A 1KNMA 2NTDA 4TLPA 3Q7YA 1VALA 1ULGA 4I8MA 5BQMA 1O4ZA 4ZKTB 5DVHA 4GA9A 1DYKA 4LO1A 2AUYA 4ZA3B 4IQPA 2TEPA 1DQ4A 2NZ9A 1PZZA 1W3FA 3A07A 2ZABA 4OW4A 4TZDA 1S0CA 2G4IA 4XBNA 1DQGA 2E4MA 1DHKB 1HQLA 3LCPA 1T9FA 2OW4A 3AH2A 4Q8KA 5B2HA 1TP0A 4KEJA 2VXTI 2PHTA 2NP0A 1WBAA 1MS1A 4FGFA 3QW7A 4IHZA 3NBCA 4FOYA 1HWPB 1LOFC 5DG2A 1LECA 3NV4A 2ZGOA 2DVFA 4LO7C 1UL9A 2NYYA 5EYXA 1OFSA 1MD6A 2D6LX 2FFUA 2HYKA 2GNDA 2GMMA 4I7IA 4GP0A 1AVWB 1JY0A 2JECA 3C8AA 4I4SA 3IPVB 4YZ4A 1T3AA 4Y1VA 2FFVA 4HL0A 5EWSA 3RS6A 4I4PA 1SZ6B 1H9WA 3WCRA 1LU2A 5GM0A 3CAHA 3AH4A 1QU0A 2DURA 4MYEA 1SBFA 2IWTB 3WLUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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