3V0AB

2.7 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
2004006008001000050100150200250300350
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/A
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0aB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0aB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0aB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0aB01
2M49A 3ENRA 2DWRA 2W68A 5BQMB 1FNYA 4QC4A 2RQ9A 1IOAA 3FJFA 2VSAA 1CE7B 1IT0A 4XE9A 1W6MB 5H9SA 5CNAA 4KS6A 3WDVA 3SH3A 5BQUA 1Q1UA 3K3QB 1MS3A 1DLLA 2D20A 2A6WA 3O4BA 4LBKA 4XJ8A 3O4OA 2W52A 2E7TA 3A07A 4FVVA 3FBYA 1ZN3A 2HYKA 1LOEA 1LOGA 3ZC9A 3DS9A 2AGSA 1S0LA 1CR7A 2EALA 3NJ5A 4ZFYB 1WLDA 2ZHKA 3AP5A 3AXDA 1C57A 1YF8B 1TEIA 1JLXA 4FP3A 3GALA 1DJSB 2ZA9A 2R0HA 4XXAA 3AYEA 2E51A 2DTYA 2UURA 3AKFA 4DCKC 1FGAA 2AREA 3BONA 1F9KA 1HKDA 4LO1A 1JTCA 1AXZA 1V6NA 4FPLA 4BLJA 4PBPA 3IM6A 2DVAA 1GZWB 2C5DA 5T54A 4YW4A 3O12A 4KEIA 4OWJA 3PVOA 4GP0A 4BPZA 2G7PA 3H6RB 2SBAA 2AFGA 2D6LX 2A70A 1LHUA 2DVDA 1T3CA 1DBNA 2D44A 1BFBA 3N7LA 5E89A 4GKYA 1LHOA 1W6PB 2ESUA 3A22A 4LO2C 1SCSA 2VXRA 4FPEA 1KJLA 1KITA 1YTOA 3CQAA 8I1BA 4YM0A 4FOQA 4M3CB 3C9ZA 2VY0A 3CA3A 3V0AB 2FDBM 4Y1UA 2YZ4A 1LHNA 1ULDA 1Q8SA 3VV1A 1WCSA 1G9FA 4GWNA 3AZZA 3QLQA 1CESA 5DZFA 1T9FA 4J2XA 2NN8A 1ZL5A 1ZA4A 1JOJA 4EEEB 4H55A 2C9AA 2G7KA 3O0WA 7I1BA 5FZYA 1AVAC 3BA7A 1G9AA 1QGLA 1S0JA 3UJOA 1BFFA 3BAQA 4FPKA 1F31A 3M3OA 3E8LC 3AYCA 2DU1A 1ISXA 1LODA 1SZ6B 5G00A 4DQAA 1I1EA 1AFCA 4LBQD 1V6KA 1MS0A 5JOYA 4ATFA 5FNXA 3I4IA 4YLZA 5DG2A 4BOWA 1OQLB 4IYBA 4DS0A 5DZEA 1LHVA 3L2YA 1Z2VA 5KXEA 3FLRA 4QBCA 5F8YA 4Q1RA 3W58A 4FP2A 1WW5A 1EPWA 1AXKA 3CRHA 2BFHA 1MVQA 1G9DA 1WBAA 3FJAA 3OJVA 2Y9WC 2CTVA 1AVWB 4WVVA 1JN2P 4Y22A 1MZ5A 2E7QA 4LBJA 2AR6A 1JYCA 4Q27A 3TAYA 3O4CA 4D8HA 4ATEA 4W65A 5EC5A 3PG0A 3VUOA 4DRVA 2XG3A 4PQ9A 2WSUA 2P23A 4D0ZA 2I1BA 1Q56A 3BAHA 3DGTA 1R1ZA 4I37A 3VT1A 1IHKA 1ENSA 3POKA 1GZ9A 5IUQA 1N1YA 1PZ7A 5BQUC 2V5YA 5BXPA 1DQGA 1SLIA 4K20A 3V65A 4AVVA 3ATGA 5BP5A 4XXPA 3PUBA 2LALA 3QW5A 4H04A 2PHXA 1FYUA 1LU1A 2AQZA 2Z49A 1LGNA 1PUUB 1Q8VA 3W59A 3F1RA 2ZGRA 4GALA 3A21A 5T5PA 4Y20A 3KM5A 4JCKA 3H6SE 2JE9A 4XILA 4Q2FA 4X39A 4XDQA 4GA9A 5IK8A 5GZCA 2ARXA 4QKRA 1AX1A 3WDXA 2VU9A 3UJQA 2ISHA 1S0BA 4Q9PA 4ZKTB 1Z0HA 2F2FA 3QJ0A 3QCWA 5BXRA 2D3PA 4LO1C 3ILAA 4GXLA 3WG1A 2DV9A 1GNHA 2NMOA 3TB0A 1LOBA 5DZGA 1LESA 3ZPYA 1IS5A 3FIEA 3FUOA 3I8TA 5IK7A 2DTWA 1NZKA 1AXMA 4AWDA 1Z4SA 2ZR1B 2D6KA 3KQRA 3PMEA 1DHKB 3IM0A 1VIWB 1UAIA 4FOVA 3FGMA 1HDKA 2AYHA 4FPYA 5FREA 3MEPA 3QIXA 5EYYA 1RITA 4F83A 1FNZA 2A8AA 2FPQA 3K1XA 1HLCA 1ULEA 3VKMA 2GMEA 1JY0A 1BASA 4DENA 4I8MA 1EVTA 3O5WB 4P9WA 2V73A 2YUGA 1DZDA 1S0FA 3NV3A 3M2MA 3Q9OA 3ZSLA 2P37A 2WSVA 1SLAA 2R1BA 4Q8LA 3HOMA 2ZAAA 3RG0A 2FMDA 1PC8B 3AFKA 1AF9A 1ITBA 1MZ6A 4YW1A 2JD4A 1S0CA 5GLVA 1IKQA 3ZXKA 2D7FA 4EB2B 4IHZA 1CIWA 1JYIA 2QN0A 3BA5A 4BQ1A 4C1WA 2ETFA 3OY8A 5GZFA 5FRAA 5F8SA 3B9UA 3AYDA 1CN1A 3WMVA 1LGCA 1CVSA 1AZDA 4P6AA 3WG4A 2CL2A 3I2AA 3WDWA 1PZ8A 3IIRA 3AKHA 3AZYA 4I4OA 3IPVA 3OBTA 1J0SA 1RY7A 1ZKXA 1FV3A 4AN6A 1VCLA 4EFQA 4LBMA 2P3JA 3MW2A 4G1RA 2MC2A 4ZOTA 1N4KA 3CA1A 3FJKA 1W6OA 4XFTA 3N35A 2PHUA 4YW3A 3DSEA 2EAKA 5T50A 2KI4A 4XKIA 1BA7A 2D3RA 3USUA 4FGFA 5BXTA 1HIBA 4I4VA 1P63A 2P3KA 2D6NA 4P9YA 5HPZA 2YMZA 5T52A 3FJHA 4UW5A 3SH5A 5E24E 3O0XA 1SBFA 2EXIA 5IK5A 3DDBA 5DUWA 5JOZA 3BADA 5GLZA 3JU9A 2R16A 2ZHLA 1EYLA 4M00A 4YM3A 4XHXA 1TWEA 4I4YA 1LENA 3WDYA 4JQ0A 5BP5C 2PHRA 4YG6A 1WBFA 3VKOA 3N3HA 6I1BA 1SCRA 3LTQA 3B3QE 4EL4A 3VSZA 1S0EA 3AZXA 3OGFA 2UUSA 1TIEA 1JW6A 4PC4A 3FJEA 4LBLA 5DUYA 4WVWA 3HBWA 2D7RA 2DU0A 4SLIA 2PHFA 4Y22B 1WLWA 4HL0A 1DQOA 1G8WA 1LCLA 3LSEA 1GV9A 4KTXA 1DIWA 1Y7BA 1DYPA 2F2FC 1YI7A 3C8BA 1IOBA 2E53A 2DRZA 2FFVA 1MS9A 4YZ4A 3LLPA 1XYFA 4PCRA 3QYDA 5EWSA 5FZZA 3AH4A 2D3SA 9ILBA 1WLCA 1OKQA 1BKZA 4Z8BA 4BLIA 5BOWA 1DQ1A 1V6WA 3AX4A 1GBGA 4XFSA 1UN1A 3EF2A 1QNYA 3RS6A 1HWOB 3HSMA 3WDTA 3OYWA 2JJ6A 3SITA 1HQLA 1OQ1A 1HQWA 4XMAA 1MS5A 3OJMA 4Y20B 2HW9A 1SBEA 1KJRA 3PVNA 1XHBA 1DQ2A 2CWSA 3BIWE 4M01A 1YO8A 2KH2A 5EYXA 2P2KA 4I4RA 5FNWA 1LOFA 3AZVA 1MR5A 3A4UA 4YM1A 3FJIA 3ZURA 2ZMKA 5H9PA 5T5OA 3WINC 1TOOA 4J2SA 4XFUA 4YW5A 3OGGA 4I3NA 3RSJA 4LBQA 1GNZA 3N7KA 2FFUA 4I96A 3RTIB 1V6LA 1FX5A 1Q8QA 2KKIA 4YZ2A 3BAGA 3Q7WA 4R6UB 4IY9A 3WA1A 2LIEA 1CQ9A 3O49A 4XBLA 2K8RA 2ZKNA 4I1BA 1LHWA 2J3PA 1LJ7A 3BRFA 4IY8A 3R05A 1DQ5A 2R1DA 4BM8A 4DFSA 5GALA 4R9BA 4P9XA 4K1YA 1MS8A 3H6QA 1W6QA 2VW1A 4I4QA 4TYSA 4C1XA 3ZYRA 1C4RA 4JRAA 4Y1YA 4X3AA 4HA2A 4YGEA 3LCPA 4LO3C 3IM5A 2OVUA 2DUQA 4GAFA 5GJ6A 2EIGA 2GN3A 2L5XA 3P6IA 1YYNA 3OY8B 1RIRA 4Q9GA 3JUTA 4R9DA 2GZBA 2D43A 1BFGA 1HCDA 5JOXA 5JOWA 3KMVA 1WW4A 5F9TA 2ZBJA 4TZDA 4JKXB 1IKPA 1PZ9A 4GOYA 1II4A 4YFWA 4UW6A 2YV8A 3S8KA 3AK0A 3IPVB 4QKSA 1PWAA 3NV2A 3WO4A 1LECA 4ELCA 1SFYA 3CRIA 5CA6A 2MIBA 1LULA 2A3YA 2ZABA 1W6OB 2WNEA 4LBOA 4BMBA 2ZMNA 1QXMA 1LEDA 2UU8A 3USUB 4BMEA 2ZGQA 4UW3A 1YVGA 1IILA 4P0JA 3UD9A 3ASIA 3U4XA 1JLYA 4OEEA 4ZXKA 4X37A 2Y9GA 1SLCA 4K1ZA 4YGCA 3BOKA 5GZGA 1AVBA 4JC1A 1TWMA 2JDZA 3CNAA 3VKFC 2ISEA 1M16A 1IRPA 2Q9XA 3T1LA 4AGRA 3I2XA 1N1VA 3WNXA 2A6YA 3IKWA 1BFCA 1F82A 5D63A 5KXDA 4OZXA 2PHWA 1LOCA 1NLSA 3GNEA 4ZBVB 1TTUA 3DDAA 1UKGA 2ZGPA 2WKKA 1LU2A 1JT4A 5DUXA 4WBCA 3QIYA 5EXOA 4YM2A 3N7JA 3HMYA 4TLPA 3POYA 2ZZJA 5KXBA 2RG9B 1HKNA 3AXEA 1O4YA 1HWPB 2GDFA 5CAZA 3AH2A 4AGGA 3AYAA 4XJAA 2IMCA 2WT2A 1LOFC 1XG6A 5GZDA 1S0DA 1BXHA 2P3IA 1MVEA 1E1HA 1Q8OA 1A3KA 3AP9A 2A5ZA 4I7IA 2W39A 3D4KA 4M3CE 3CA6A 3NBCA 4YZ3A 4ZFUB 1W3AA 2XOAA 1G82A 1SBDA 2ENRA 2FO1A 5GLUA 2G4IA 1BLDA 3OBRA 1WW7A 3D3XA 1FV2A 1UL9A 4ZJXA 2GMPA 3D6EA 3ZUQA 2XHLA 3QW6A 2WT0A 2ERMA 1CVNA 2ZGNA 5HCFA 1JQZA 2YROA 2W2DA 1FATA 2GMMA 4RA0A 1N1TA 3N36A 4D0TA 4XJWA 3FJJA 1V6XA 3OYWB 1TP0A 1U0AA 4Z8SB 3I29B 1BJQA 2WQZC 3BODA 1HCEA 3MW4A 5GLTA 1WUVA 4YGBA 4USOA 2D6MA 5DG1A 1WBLA 1D2SA 1W3GA 1UZYA 3UD8A 1KQRA 2UWCA 1GSLA 3CRGA 2HZ9A 1UPSA 2D6PA 1BQPA 1NXD1 1GKBA 1HWNB 3V79C 1JXNA 4YW2A 4ITCA 5JLVA 1Z78A 2GN7A 2ZGMA 3O0VA 3BAOA 1ONAA 2F8XC 4IQPA 3ZSMA 3WINA 2OUHA 3AP6A 3R4UA 3ZSKA 3FLPA 4II0A 2ZGOA 4HJJA 3BA4A 4Q91A 3AKGA 1IJTA 4LBQB 3FJ9A 3ZC8A 3SISA 1XTFA 1N3PA 3Q7YA 1QU0A 3VWCA 1QDOA 2WT1A 3BTAA 4L4IA 1UMZA 1B09A 5HCAA 2OW4A 4HR6C 4DEPA 5HCBA 3CA0A 1PZZA 3VSFA 4AN7B 4YFZA 1S0IA 1RG8A 5KXCA 3ZUSA 3ZXJA 3FJCA 1Q8PA 1O4ZA 2DVGA 4GP3A 1H9PA 4IZXA 2VW0A 2WRYA 1AVUA 5F5QA 5F8WA 3UD7A 3RMYA 4JPZA 3WO2A 4X38A 1GZCA 2ZGUA 2JECA 3CA5A 4L8QA 3ZXDA 3S8JA 5BXSA 2QYIB 3WMUA 1PUMB 3AJYA 1ENRA 4QO3A 2UWAA 1SLBA 3WDUA 3FJBA 4GKXA 3T1MA 1W6QB 4AVTA 1DFCA 41BIA 3WCSA 4AVSA 1KDMA 1ISYA 1S1AA 1ZKWA 3A23A 1YIFA 3C89A 4LO3A 1XTGA 1V6VA 3JRRA 3QIZA 4WZFA 2RSTA 1CONA 2D7IA 4YG0A 3POWA 1QF3A 4HEVA 2AENA 4PF5A 2HWAA 1J1TA 3O5SA 4JKQA 1V6IA 5GZEA 4CJMA 1DQ0A 1APNA 1WD3A 5JMCA 1Z7HA 2CYFA 1M2TB 3AH1A 4FPFA 4XZPA 4OWKA 2ZACA 3ZYPA 3AKIA 2FGFA 5FZUA 1GYKA 2ARBA 3N0KA 2VXTI 4Y1VA 5IT6A 4G9NA 4ISQA 3O44A 4A7YA 1AJKA 2WLQA 1ENQA 2RHPA 3D5OA 1KDKA 2I2SA 3FLTA 4NO4A 2ZGTA 2LTNA 3MW3A 4I4PA 1AX2A 1QNWA 3WVJA 3V64A 4R9AA 5E88A 4LO8B 5LK5A 4XIOA 3R4SA 1V6JA 4J2KA 2P34A 3AJ5A 5JDBA 4Y24A 3SLIA 2EF6A 4FQZA 3CU1B 1SLLA 3B00A 1MS4A 3AJ6A 1MC9A 3RQ0A 1QDCA 5CB7A 2VUAA 2AUYA 1QQLA 2B7YA 1IS3A 3MALA 1OFSA 4A7ZA 3BX1C 3MPPG 4R9CA 1ABRB 1AVXB 4I2SA 1DZQA 4A7KA 3NF3A 3FUQA 4AYUA 3FIIA 1W3FA 3NBEA 3C8AA 5E8AA 1NUNA 3WG2A 2BEBA 1G7YA 1YRZA 2GO2A 1N3QA 2KM2A 3NBNA 5DVHA 1V6UA 4YG3A 3W9TA 2OUJA 1ZL6A 1QOOA 4F34A 3QW8A 2DUPA 3BRGC 4I6IA 2GALA 2R9KB 2VW2A 3BAUA 1E0OA 1RZOB 4FPOB 2ZHNA 1BARA 4GOVA 2W08A 5B2HA 2ZGSA 4IZEA 4FPJA 4XIKA 2D1ZA 3SNMA 1T3AA 1L2HA 4Y1XA 1S0GA 3IM7A 3H0OA 3P53A 4MYEA 1ISWA 3RTJB 3LSDA 4YZ5A 4ASMB 3BB2A 4XOGA 3PVEA 3BOOA 1I3HA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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