3V0BA

3.9 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 409
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
409
sequence length
1295
structure length
1280
Chain Sequence
MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/A
total genus 409
structure length 1280
sequence length 1295
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-12-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0bA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0bA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0bA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0bA01
4IY8A 5T52A 3QR5A 4X37A 3OJMA 3VT1A 1I1EA 1AXYA 3ZXJA 3BAOA 6I1BA 1ZM1A 5DG2A 1EVTA 4R9AA 4QD2C 3H0OA 4KS6A 3NV4A 2A75A 2FO1A 1AVWB 3N35A 5DUWA 2JECA 1NZKA 3CQAA 5JVVA 1Y7BA 3AJYA 4OW4A 1JYIA 2RSTA 3OJBA 3WG1A 3HOMA 4XILA 2A6WA 1Z2VA 2IMCA 3C88A 5JLVA 3HALA 3POWA 2E7TA 2CY6A 4YW5A 3O0WA 4YG0A 1O4YA 3ZPYA 2YXSA 4XMAA 2PHWA 1URXA 4YW2A 4OWLA 2JDZA 3WINC 1WW7A 4XFTA 4F83A 1HDKA 4P9WA 4I6IA 3IPVB 1ABRB 5GJ6A 4G6MA 1WLWA 1WW5A 3O44A 1ENQA 3IPVA 2ZMLA 1HCEA 2P2KA 2E4MC 1V00A 2ZGUA 2WKKA 1H9WA 3QW5A 3AJ5A 1W6PB 4I3NA 4Y1UA 4LO1A 4ZKTB 3M3CA 3BAUA 1W6PA 3O5SA 5GLVA 3DDAA 4J2YA 1ITBA 2ZZJA 3BWIA 3I4IA 1CQ9A 3VT0A 2WSVA 4IONA 1MS0A 2DWRA 3TAYA 1GZCA 1JTCA 1WW6A 4YZ2A 3CA1A 1LOCA 4TLPA 4Z8SB 1GZ9A 5FZZA 3POKA 4XKIA 3VT2A 4ZFUB 1JT4A 1KRIA 1AVXB 2DRYA 2ZHNA 1HQLA 3OBRA 5FNWA 1CPMA 2BQPA 5DZFA 5DZEA 1DZQA 1FNYA 4FVVA 1GKBA 3AXDA 5F9TA 4W65A 2ZA9A 2G7QA 2ZQNA 3NV3A 1AZDA 1G9BA 1Z0HA 5H9SA 2CL2A 5EYXA 4XHXA 3P53A 3UD7A 1HWNB 4LO0A 1C1FA 2GN7A 4XE9A 4Q9PA 3BAVA 2C5DA 4G6JA 2E7QA 5BXSA 2G7NA 1CJPA 3S8KA 2VW2A 1IKQA 4I30A 1JT7A 41BIA 1LOGA 4GWNA 4ZGRB 1AXKA 4YGBA 1TOOA 3WUDA 1LEDA 4YZ5A 4P14A 2D23A 1HWOB 1JLYA 1WLCA 4XJZA 3F1RA 4WVVA 1GANA 2DRZA 1XHBA 3V64A 3GALA 2E6VA 2ZMNA 2QN4A 2RHPA 3SNVA 1KNMA 3N3HA 5EC5A 1S0EA 2A6YA 5DUXA 3BRDA 4YM2A 1HWMB 3OBTA 1R8NA 4LBQB 1DZDA 3BOKA 3V65A 3PVEA 3FLRA 1W3GA 1CVNA 1BYHA 4XMIA 3AZYA 2AFGA 4OZXA 5E88A 1DFCA 4I2SA 1MS1A 5LK5A 1UMZA 2G7PA 3AYAA 3MW3A 1SCRA 4DFSA 2ZGTA 5BVPI 1DHKB 2ZACA 31BIA 2XOAA 4IZXA 3PMEA 2ISHA 1V6JA 3AP6A 4ISQA 2P3JA 2CNAA 4QD2B 2WJSA 3AJZA 1WBAA 2D7IA 2DVAA 4HANA 3FJCA 1ZL6A 4AYUA 1GSLA 1YO8A 2R16A 4JP0A 4L4IA 4P0KA 3SISA 1FYUA 2DYCA 5IK7A 1MZ6A 1YVGA 2ZGQA 4R9BA 4FPLA 3NJ5A 1YYNA 1WD3A 2W68A 4YFZA 1RMLA 4GA9A 2ZABA 3UDAA 1F5FA 3KM5A 2G4IA 1RZOB 5CNAA 4XBLA 3HR9A 2ZKNA 1AVBA 5KXDA 3I2AA 3UJ4A 1AVUA 1N1YA 1DZCA 4GXLA 3N7MA 3OGGA 3WINA 1FV3A 2DVDA 1XG6A 4DRVA 5GZFA 3M3EA 1FV2A 1CE7B 1V6WA 2AYHA 4AGRA 3RSJA 3CRHA 3WOGA 3H6QA 3HMYA 5IK8A 4WVWA 4AN6A 1RY7A 4GAIA 3C89A 4XJUA 2J3PA 5SV8A 1CVSA 2E4MA 4NOTA 5T5OA 4I1BA 3AFKA 4YZ1A 5T50A 1FAYA 3VKMA 4QO3A 2YROA 4XOGA 1G86A 2ES3A 1DQGA 4GAFA 4YGEA 5GALA 3BX1C 4DRRA 4BMBA 3B3QE 4ATEA 1VAMA 2WNEA 1N47A 2YMZA 2NTDA 4XXPA 1LHNA 2EXJA 3FUOA 5T5JA 3WA1A 4M3CE 1BA7A 1H9PA 1HIBA 4YGCA 3IM7A 3A22A 3RG0A 3OJ2A 1JW6A 2WBCA 3M1HA 1O4ZA 5FRAA 3Q7YA 4I37A 4KEIA 1SLIA 1W3AA 3ZSMA 2TEPA 3POSA 1TTUA 4AGVA 4LBKA 4Q9GA 2PELA 4ZLBB 2UWAA 1LGNA 3L2YA 4UW6A 1LOAA 4XJ8A 5HCAA 1F31A 2GO2A 3QYDA 3RMYA 4QBCA 4Z8BA 1Q1UA 3VWCA 3S8JA 4FPYA 3O0VA 5BQNA 2C9AA 2VUAA 2FHRA 1TWMA 3FLPA 2AUYA 2Y9XE 4AWDA 5D62A 3WHTA 3A0KA 3MALA 3HBWA 3ZXGA 3USUB 4TZDA 2BEAA 4ZBVB 3Q9OA 1KITA 3WDVA 3KMVA 3USUA 1QOOA 1BFGA 4I4XA 4CJMA 2CWSA 4LBOA 3SH3A 4DQAA 5JOWA 3C8AA 2NP0A 2KI6B 4FPJA 1KJLA 2D6PA 5HCFA 1W6QB 1LECA 2ARBA 5IK5A 3CAHA 1LGCA 3ENRA 3BA5A 3N36A 1W6QA 5H9RA 1W0OA 5DZGA 3R4UA 1DBNA 3FIEA 1IT0A 3RQ0A 5F90A 1TP0A 3TB0A 4J2XA 2FMDA 3AK0A 4XHBA 1JT3A 3A21A 1LHUA 3SH5A 1AXZA 3N0KA 5FNXA 1UKGA 2ZHKA 4I4VA 4H9WA 1M2TB 1LHWA 3FJFA 3Q7WA 5BQMB 3BOOA 4K1YA 4LBNA 2CYFA 4K20A 1JBCA 5BQMA 2W52A 1JN2P 3ZSLA 2GNDA 5FREA 1S0LA 5L73A 3POYA 1GLHA 1QQLA 1UX6A 3O4BA 2VXRA 3FFZA 1IS3A 8I1BA 3EF2A 1PC8B 5DXDA 2EF6A 3ZC9A 2Q3NB 2GDFA 3WZ1A 4WZFA 4CZSA 1ISVA 1LOFC 2LTNA 1ZKXA 4XDQA 1IOAA 2ZGRA 3CA6A 2I1BA 3AH4A 3IM6A 3FJ9A 1OQ1A 4I4RA 2NVHA 1TFMB 2NM1A 1DYKA 5HCBA 1DQ1A 3N7LA 1NUNA 4BM8A 2KLLA 4XXAA 3WLUA 1W6OB 3AP5A 2WT2A 5T54A 1QU0A 1XZZA 1QDOA 2Q5TA 1W6OA 1DQ6A 3WDUA 1T3CA 1S1AA 2D3PA 3BODA 4XTMA 1LODA 5GAQA 4YW3A 1HQWA 3WDWA 1EPWA 1LOEA 1P63A 3BRFA 1PUUB 1IJTA 2AAIB 2A5ZA 3NWKA 4P9XA 2JE7A 1MVEA 1Q56A 4XYXA 5DUYA 3PVOA 4YGDA 1MZ5A 2V5YA 3CRGA 5H9QA 2K43A 4BQ1A 2SLIA 1WBFA 2YY1A 2OW4A 1GGPB 2F2FC 4LBJA 5DUVA 5GM0A 4A7KA 2DREA 4ZOTA 2A3XA 1SCSA 3FJHA 3MPPG 4DEPA 2IHOA 4AGGA 4H04A 1AX0A 3AJ6A 3QIYA 3O0XA 5D63A 1C57A 4WBCA 4ATFA 3AP7A 4Z9WB 1JHNA 1GV9A 4GOYA 3WCSA 1LENA 1ONAA 2VY0A 4I4OA 2Q9XA 2D44A 2D7RA 2P34A 4XBQA 1XYFA 1FX5A 4MYEA 5FZUA 3R05A 3B9CA 4PCRA 3WG3A 3O4OA 2ZGOA 2DV9A 2E51A 5BQUC 3UJ0A 3M3QA 2UUSA 4YZ3A 4ZFYB 1EYLA 4R9DA 1RITA 2K4AB 1LGBA 2VW1A 3QLQA 4DS0A 4LO3C 3AYDA 3D5OA 3VKLA 4ISRA 3VSFA 1A3KA 2UWBA 1QOTA 2GN3A 4FPFA 1BZWA 1G9DA 1E0OA 3A0NA 4J2KA 2PHTA 2NZ9A 3FBYA 4SLIA 1V6MA 1TWEA 1QQKA 3ZUSA 4TYSA 1DLLA 1DQ2A 3DUIA 3M2MA 1OFSA 1G9FA 3WV6A 2ZGSA 3CA0A 2JKBA 4JKXB 1N4KA 4UW5A 1ISZA 2A71A 4YW1A 4JRAA 1MS3A 3SITA 3JUTA 1QMJA 2ZMKA 4BMEA 5EXOA 5EYYA 2HWAA 2VSAA 3BB2A 3AZVA 2DUPA 1JOJA 2DU1A 3OJVA 4Q1RA 3WUCA 3ZXLA 3FJKA 1MS5A 3KQRA 3NBDA 1YBIA 2FFUA 1AJKA 2AXMA 1HLCA 1CPNA 3WO3A 1RIRA 5AVAA 4Q2FA 3OPZA 3ZX7A 4LBQA 5DSSB 2Z49A 3BA7A 1IS5A 3BTAA 1IRAX 1JUIA 2DTYA 1NLSA 2ERFA 1WBCA 1GNHA 2ETFA 3P6IA 1N1VA 2WRYA 2YV8A 9ILBA 4KUFA 3QW8A 2HWMA 5BXRA 4G9NA 4YG3A 1JY0A 4EFQA 1GZWB 5GZEA 1D0HA 4KEKA 2UURA 3W59A 4HR6C 4BOWA 1GZWA 1JXNA 1QKQA 1SACA 1R8OA 3PG0A 3MW4A 1YXWA 3LSDA 1LOFA 1W6NB 1IS6A 3IM0A 1CN1A 3WCRA 3LCPA 4I4YA 4IY9A 1W6NA 4YM3A 2PHXA 1AX2A 3ZXKA 1JT5A 1ZN3A 5CAZA 1WCSA 3DS9A 3FJDA 5E8AA 4QKRA 2A70A 3ZSJA 4JC1A 3W9TA 1S0DA 4XZPA 2ZGKA 1DQ5A 4C1WA 2VW0A 1ISXA 2ILPA 1S0IA 3CA3A 1FMZA 1V6IA 1GICA 1QDCA 5KXBA 2GZBA 1QXMA 1PZ7A 1QF3A 4WV8A 3CA5A 4OEFA 2DU0A 2EAKA 4XJAA 1CESA 3RS6A 1SLBA 2GALA 1C1LA 2WT0A 4D0ZA 1Z4SA 4I7IA 1Q8QA 1V6NA 4USOA 3ZURA 2F2FA 3WDXA 4C1XA 1BASA 3IKWA 5DUUA 4G1RA 1JQZA 1SBFA 3T2TA 7I1BA 2VU9A 4YM0A 1DGLA 1ONKB 4I4UA 1YTOA 3ATGA 4Y1XA 4U2AA 2Y9GA 2ISEA 2EXHA 4XJWA 2ISGA 1EV2A 1S0GA 1S0FA 3QJ0A 5E89A 1AF9A 3V0BB 2D22A 4I0YA 3JUUA 4Y20B 4KTXA 4OWJA 1AJOA 2FPQA 3A23A 3WDYA 3V0BA 4FP3A 1AX1A 3WO2A 1W0PA 2Y9WC 4Y20A 1LU2A 1MR5A 4OEGA 1BFCA 5IK4A 1VCLA 2PHRA 4GKXA 2R9KB 2D1ZA 3K3QB 1BJQA 1KJRA 1F9KA 5BQUA 3B9UA 4AVSA 1OQLB 3JU9A 1M16A 3RTJB 4Q91A 2E53A 1ENSA 2K8RA 3WNXA 3RRDA 2LIQA 3BONA 1LEMA 1LESA 4LO3A 3AKGA 1Z7HA 4LO7C 2QN0A 2ZAAA 4HL0A 4PC4A 3R4SA 5EWSA 1KDKA 5EG6C 1Q8PA 3H6SE 4QALA 3O4DA 1OKQA 3WMUA 3FJAA 3LLPA 1ULFA 1LTEA 1L2HA 2A6VA 1ZB7A 3M3OA 2D6MA 1ILR1 2FDBM 3ZSKA 4FPOB 3DGTA 3P6JA 1G7YA 4YFWA 4BLJA 4QBVA 1YF8B 3UD9A 2D24A 2DUQA 4QC4A 2GMEA 5BYNA 2VXTI 5IT6A 4JAWA 1AVAC 4EFPA 5GZDA 1DQ4A 1V6VA 3LSEA 3QW7A 3SH4A 1N1SA 3WMVA 4YOLA 5GLTA 5B2HA 2AREA 3AH1A 5EHAA 2QYIB 1R1ZA 1ZL5A 1FGAA 3ASIA 4YZ4A 3ILAA 1V6UA 2DVFA 4GALA 2EALA 4Q8KA 2R0FA 4K1ZA 3OGFA 2A6ZA 3O4AA 2A8AA 1CONA 5E24E 1SLCA 2KM2A 4II0A 3OYWB 2ERMA 3SLIA 4AVTA 1N3PA 4P0JA 4ENDA 3OYWA 3RMXA 1V6LA 21BIA 5BOWA 1LOBA 5CB7A 2ZQOA 2W39A 4RA0A 4YW4A 1VAVA 2NN8A 2WLQA 1G9CA 3I8TA 5KXEA 3O4CA 3BADA 2ZBJA 1GBGA 3PUBA 2NMNA 5DVHA 3PHZA 1T4QA 3FIIA 5GLUA 3NF3A 2OVUA 4FPHA 4A7ZA 2Y9FA 2ARXA 1ZA4A 3BOPA 3E8LC 3T8SA 2WT1A 1MS9A 3AKHA 1J0SA 3C8BA 1SFYA 2P3KA 2BFHA 1VALA 3IAGC 4PQ9A 3ZC8A 1UAIA 5KXCA 2LALA 5DZUA 2YUGA 3H6RB 3VKFC 1V6XA 3A4UA 3F62B 1DJSB 4Q8LA 2M49A 3PJQA 1FATA 3H6RA 2PHFA 4Y26A 3GNEA 4YLZA 2DTWA 2LIEA 3AZXA 1HKDA 2BEBA 3WDTA 2NYYA 2XB6C 3AP9A 3AP4A 1Z78A 4GWMA 4PBOA 3AZWA 4EKXB 4XIOA 4Y1ZA 1WBLA 4BLIA 2RG9B 3IM5A 2R49A 4OWKA 4ASMB 3VKOA 4G9MA 4M00A 4XFUA 1LULA 3A07A 1V6KA 2PHUA 2XG3A 3DSEA 2XHLB 2OUJA 4JQ0A 2UWCA 1S0CA 2ZHMA 2AH2A 1K5VA 2MC2A 4KEJA 2XHLA 1SBEA 5T55A 1H30A 3O3QA 4USPA 1E1HA 1C4RA 2ZGNA 4LO2C 3FLTA 1IKPA 1HWPB 1SLAA 1XQNA 1UZZA 5F8YA 3T1MA 2A6XA 2ESUA 1K5UA 2AGSA 3V0AB 2D6OX 1CR7A 3BRGC 1RINA 1FWUA 1W3FA 4IZEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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