3V0BA

3.9 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 409
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
409
sequence length
1295
structure length
1280
Chain Sequence
MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/A
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 409
structure length 1280
sequence length 1295
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-12-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0bA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0bA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0bA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0bA01
1SLAA 3OJ2A 2ZKNA 1N3QA 2RQ9A 5BVPI 2R16A 5F5QA 1T3AA 2UU8A 1A8DA 5T5JA 4P9WA 4XILA 3K1XA 4JPZA 4FQZA 2E53A 3WDWA 1LEMA 2ESUA 3B9CA 3O4OA 4YFZA 1IS3A 4KEJA 4A7YA 2K43A 2E4MA 4I4RA 5BXTA 1WLWA 3DDBA 5BQMB 5JDBA 2DS0A 1S0IA 4Y22A 4GAIA 4R6UB 4DEPA 1VALA 4JP0A 1UPSA 4KEIA 1I1EA 3N7JA 2W68A 2WT2A 3FJIA 4GKYA 5EHAA 4BLIA 4L4IA 3QW5A 3R4SA 2D3RA 2DVFA 2DYCA 2VH9A 1VCLA 3RG0A 3QW6A 1LU1A 2QN4A 4LBNA 3WCSA 1D0HA 1DZDA 1KDMA 1MZ5A 3VT1A 3N36A 3ZC9A 4FOWA 4DCKC 3JUUA 3O49A 1SBFA 4FPFA 1QXMA 3SH3A 4IHZA 2FHRA 5GZCA 5KXDA 1SLTA 2PHWA 2VUAA 3VSZA 1ZN3A 2ZGNA 4GP0A 2XG3A 1BLAA 1S0LA 2E6VA 3MALA 5DZUA 4ZJXA 2D7FA 1TWMA 3N0KA 4OZXA 2CWMA 4TYSA 3OBTA 2ZGUA 3DDAA 1KJRA 4XXPA 2IMCA 1LENA 1HLCA 4I4QA 3D3XA 5DZGA 4LO0A 5GLTA 4I1BA 1BFFA 1NUNA 1VIWB 1Q04A 3CAHA 1DYKA 3Q7YA 4Q8LA 3USUA 2VLCA 1DLLA 4Y26A 1HWNB 4IQPA 3SH5A 4BMEA 1QDCA 2A6WA 1ABRB 3C8BA 3T1LA 3B00A 2I2SA 1V6NA 1QDOA 4A7KA 1LOBA 1W6OB 3CRGA 3UK9A 2WKKA 3POKA 4AN7B 1AXMA 4AWDA 4P6AA 2P3IA 2A70A 4YGCA 4LO3C 2CTVA 2K8RA 1W0PA 3PJQA 1HCEA 3MEPA 1X50A 1ISYA 5CNAA 2BFHA 2VY0A 1MACA 4WVWA 5GZGA 1W3AA 2FMDA 4AGGA 3HN1A 4DRRA 2A75A 2G7PA 2C5DA 3ZXLA 1LU2A 3UJ4A 1DFQA 1MC9A 5H9PA 4XBQA 4Q9GA 3OJMA 3A4UA 3ZXFA 1YVGA 3BWIA 1YF8B 1GLHA 4LO8B 3VT2A 3WG3A 1LTEA 4Q1PA 2ZQNA 3CRIA 1DGLA 5BYNA 1AX2A 4I96A 1IKPA 5KXBA 1PWAA 3QIXA 1S0CA 3ENRA 2VU9A 1DIWA 2ZR1B 4I6IA 4KS6A 2JE9A 2Y9FA 2Z42A 2WSUA 4RA0A 2ZMNA 4Y20B 3BRFA 2ZBJA 1AF9A 2NP0A 4ELCA 4AGRA 1PC8B 3UDAA 2DURA 4D0ZA 3E8LC 2WT1A 3IM7A 3H0OA 5GZDA 4YG6A 3FLTA 2R1BA 2GALA 2KI4A 4EFRA 2EXIA 4OWKA 4AYUA 1W0OA 1LCLA 4AVSA 1K5UA 1M2TB 3WNXA 1FATA 3AYDA 4USOA 2YUGA 2A97A 4BM8A 3MW3A 1ISXA 5GLWA 2HWMA 5DUYA 4JKXB 1MZ6A 3AYCA 3C2UA 4J1LA 2ZGSA 5FNXA 5EYYA 2E7TA 4DFSA 1S0GA 1S0EA 4HL0A 4XXAA 4XFUA 5T54A 4YGDA 5DG2A 4QBVA 1UN1A 3A07A 4LO3A 5BOWA 1V6LA 1V6WA 4FPEA 1AX1A 2B7YA 1QOOA 8I1BA 4Q1RA 2EXKA 3O12A 4GWNA 5JOZA 4I0YA 3UD8A 1W6QB 3WO4A 2D44A 2M49A 4IZEA 1APNA 3P6JA 1Q03A 2R1DA 2GNBA 2DU0A 1ISWA 1OKQA 3WDTA 4HA2A 4Q2FA 1FNYA 3SITA 3MW4A 1V6IA 1HQWA 4YW2A 2L5XA 1MVQA 1DQ4A 4FP2A 3A0KA 2BQPA 5L73A 3UD9A 1SLLA 2VXRA 5BP5C 4UW6A 4J2KA 4FOQA 3T8SA 1W6OA 4D0TA 1Q8VA 3LSDA 3LSEA 2CL2A 5E88A 5DG1A 1EVTA 4K20A 3SNVA 3RS6A 3Q7XA 3VKNA 1IS6A 1WW5A 1H9PA 2A6XA 3ILFA 1GZ9A 3NBNA 1HCDA 1IILA 1ZL5A 2A7AA 4OW4A 3NBCA 3Q9OA 3WHUA 1MS5A 1URXA 1F5FA 2MLLB 1R8NA 3D7WB 3VWCA 5DUVA 3QJ0A 1HDKA 2A6ZA 1XZZA 1Z78A 1SFYA 1V00A 4PCRA 2D6OX 1F9KA 2R49A 4DS0A 5GJ6A 1JUIA 5FZYA 2ZGTA 3ILAA 5BQNA 1R1ZA 3M2MA 2DRYA 3O4DA 3POYA 1MS8A 2D43A 3T1MA 3ZYPA 5H9QA 5HCFA 2ZQOA 1Q8QA 2F2FC 3WO2A 1AXYA 1JT5A 3CA5A 3LCPA 1RY7A 1LOAA 1JN2P 1LESA 3O3QA 4DRVA 4ZA3B 4P0LA 4OEFA 4F83A 4WBCA 1Z2VA 2V5YA 1JYIA 2F8XC 5GZFA 4LBOA 3O4BA 2UURA 2ZGMA 1AVUA 4Q8KA 3JRRA 4ITCA 1DQ0A 4A7ZA 1Q1UA 1CN1A 1O4YA 4QC4A 1ZA4A 3FJFA 3OJVA 4XJZA 1IT0A 4GAFA 1GGPB 3S8KA 2V73A 2ZGLA 4QBCA 2BEAA 4I4YA 4CRQA 1FWVA 2ZGQA 4H04A 4OWJA 1BASA 3NWKA 4XTMA 1G82A 1ISVA 2EF6A 1TTUA 4Y24A 3ZX7A 5BP5A 1GBGA 3BRDA 5KXEA 4XJAA 2DV9A 3WMVA 2KI6B 1XQNA 4K21A 1OQ1A 2E51A 2JKBA 1LHOA 1V6XA 2AREA 5FZZA 1JLXA 3AXEA 4XZPA 1S0FA 3QW7A 1PUMB 1Z7HA 1YIFA 2X2TA 1LECA 4H55A 3VT0A 1JT4A 1W6QA 1UAIA 3AZYA 4ZFWB 3WDUA 1AZDA 1C4RA 4XJWA 4FPLA 4CTEA 1ULFA 1GNHA 3CA3A 4WVVA 3HALA 3R4UA 5GALA 1ITBA 4EFQA 3ZC8A 4XTPA 1BXHA 2JE7A 1S0BA 1GV9A 3I2XA 2DU1A 3AP7A 1H30A 1N4KA 2F2FA 3M3EA 5F8SA 1AJOA 2XB6C 3B9UA 3JUTA 4XHXA 2VSAA 3AP4A 3FFZA 1G9DA 3FLPA 4U36A 3FJJA 2GN3A 2BEBA 4JAWA 3AJZA 1AXKA 2GNDA 1TEIA 1JYCA 2DWRA 4OEGA 1RMLA 1AFCA 1DQOA 3NV3A 3FJAA 4QKRA 4CZSA 3AK0A 1WLCA 3VV1A 1RZOB 1LGBA 1J1TA 4QO3A 3BOKA 1O4ZA 4J2XA 2K4AB 3B01A 4I8MA 2NM1A 1SLBA 5EXOA 2A3YA 2E7QA 2P34A 5BXSA 1A3KA 3FIIA 2FDBM 4AVTA 3APBA 1HKDA 5BQUC 3NV1A 5G00A 2QYIB 1MS3A 2NTDA 5JLVA 4XJ9A 3EF2A 2NN8A 4WZFA 1KITA 3UD7A 2A8AA 3FJHA 2IHOA 4FQ4A 2LIEA 4XJUA 4P0JA 2FFUA 3M1HA 1W3FA 1G9CA 4I4UA 5DUUA 1D2SA 1N3PA 4I37A 3AH1A 2GO2A 3W58A 3FJKA 5T50A 1MS4A 4YM0A 1IHKA 3TAYA 3ZXEA 1PZZA 1GYKA 1LHUA 4XIKA 2GMEA 1EPWA 7I1BA 4LBJA 2Q9XA 3VKLA 1S0DA 2ISEA 1GZWB 1DJSB 3BAUA 3FJDA 4FGFA 3RMYA 4BOWA 2JJ6A 4M3CA 4K1ZA 1UX6A 1WBAA 3DGTA 3P53A 1RG8A 2YV8A 2DRZA 1JTCA 2Y9GA 4YFWA 4XHBA 1W6MA 1N3OA 3FJ8A 3NBEA 2Z49A 2R0HA 1B09A 4FPKA 3H6RA 4GALA 2PHUA 2ET2A 5DZEA 5HCAA 1LJ7A 3QYDA 2AAIB 4EEEB 4ZKTB 4ZGRB 3ZXDA 2AENA 3AKHA 1XG6A 1AVXB 1QGLA 5JMCA 3V0BB 4XDQA 1Y7BA 4YZ3A 2ETFA 4I4VA 1SBEA 1BLDA 3O4CA 3V65A 1UKGA 1IKQA 31BIA 2FFVA 3ZUSA 1JLYA 2AQZA 5BQUA 1BFBA 3IPVB 2ISHA 1BFGA 1C1LA 5H9SA 3AKIA 4GP3A 4I2SA 1CVNA 1ULDA 2DVGA 2D6NA 3IM0A 4JC1A 3HSMA 3IMNA 4FPOB 4ZXKA 3AH4A 5CAZA 5JOWA 4P9YA 5CA6A 3V0AA 3O0WA 5E8AA 4IZXA 1WD3A 4D8HA 3A21A 1UZYA 5D61A 1GKBA 3AFKA 4GWMA 4ISRA 3AKGA 4EB2B 4PQ9A 2AGSA 4JRAA 4PC4A 5F8WA 2DUQA 4U2AA 1AXZA 1ZM1A 1Z0HA 4YG0A 2IMAA 3WCRA 1DQ6A 4AGVA 4R9DA 5EWSA 2NYYA 2ILPA 2A3XA 5CB7A 3PVEA 3N7MA 3WINC 3WMUA 3C8AA 1XHBA 3CA0A 1FV2A 1DQ5A 1NZKA 4BLJA 3AX4A 2ARBA 1WBLA 3OYWB 4KBBA 1MS0A 2D6MA 2VW0A 4IY9A 1E0OA 2Y9WC 3BA7A 3AZWA 4LBQD 4IY8A 2OUJA 2ISGA 4JCKA 3TB0A 3DSEA 4XFTA 1CQ9A 2GN7A 4M01A 4EFPA 1N1YA 1Z4SA 2KKIA 3LTQA 2NMOA 4IONA 3WDXA 5IK8A 4L4HA 1YBIA 3KQRA 1BFCA 1GZWA 5FREA 1IS4A 1DZQA 2DUPA 4NO4A 2GNTA 2P3JA 1JXNA 4UW4A 1ULEA 1ZB7A 2GMPA 1DZCA 5LK5A 2NVHA 2UWBA 3ZXJA 3O4AA 4I3NA 1R8OA 2D3PA 4Z8BA 1DQ1A 1KDKA 4OEEA 2WT0A 4H9WA 4XYXA 5T5PA 2Z48A 4UW3A 3C9ZA 2ZMKA 3N35A 1KQRA 1W6PB 2FPQA 1G7YA 1LEDA 2DVDA 2D20A 1QU0A 1DYPA 3L2YA 3HR9A 3V0BA 3ZSKA 4BPZA 1G86A 1PZ8A 4ENDA 1FGAA 3BAGA 4P14A 2KLLA 4ATFA 3BIWE 5IK7A 2EAKA 4XMAA 2A6YA 2WBCA 3OBRA 1FN0A 2HZ9A 4ASMB 2QN0A 1V6OA 2PHTA 3U4XA 5B2HA 1NLSA 3AJYA 4YM1A 3IPVA 1A78A 1WLDA 1XYFA 3BOPA 3M3OA 4YM2A 5DZFA 2ZABA 2ZHMA 3QCWA 2WSVA 3KMVA 2J3PA 3BAOA 2GDFA 2X2SA 5IT6A 4LO2C 5HCBA 2RSTA 2JD4A 3I4IA 3A22A 1BARA 3RRDA 1GSLA 3AYAA 1CR7A 3BAHA 5D62A 3ZURA 1LODA 3AP9A 4J23B 2ZA9A 3BRGC 3ATGA 4OUJA 1AJKA 2Y9XE 4EKXB 9ILBA 1S1AA 5T52A 1JW6A 1VAMA 1BKZA 1UL9A 5E89A 3INAA 3O0VA 1MR5A 1SR4C 2EALA 3PUBA 4XE9A 4K1YA 2WLQA 6I1BA 3T2TA 1HQLA 2RG9B 3AZVA 4XKIA 1W6NB 3IM5A 2TEPA 2MIBA 2A5ZA 1WW4A 3BODA 5E24E 5H9RA 3OYWA 2W39A 4M3CB 3QLQA 2D6LX 1LOCA 2A6VA 1JY0A 3UJQA 2E4MC 3CA4A 5DSSB 2YROA 2WRYA 1V6UA 4HANA 3BA4A 2G7NA 1W6MB 4YZ1A 4G9NA 3D4KA 1TOOA 4J2SA 1QQKA 1WW7A 2W2DB 3VKFC 2OVUA 4LO7C 3FLRA 3UJ0A 3H6RB 1SLIA 4YW1A 1T9FA 4M00A 3RTJB 3AZXA 3POWA 5DUXA 2NMNA 3AP6A 4AVVA 3H6QA 4ZOTA 3FGMA 5T55A 4XOGA 1GZCA 2ERFA 2EXHA 3N7LA 1C1FA 1OQLB 1PZ9A 1BQPA 3WVJA 4X3AA 4YZ4A 2G4IA 1OFSA 2YXSA 1FMMS 2HWAA 2DTWA 3VKMA 4R9CA 3VKOA 3ZSMA 1AVWB 2ZMLA 4PBPA 1W6PA 3IM6A 4W65A 1LHWA 1Q56A 2ZGKA 5EG6C 1LHVA 1S0JA 2FO1A 1KNMA 2SBAA 1IJTA 2WJSA 2W52A 3V0AB 5AVAA 4DPNA 1CVSA 2D24A 3QR5A 2HYKA 1ZKXA 4I4XA 2ZAAA 2IMBA 1FMZA 1SCSA 2D6KA 2P2KA 3FJ9A 1SR4A 1XTFA 4LO0C 4PBOA 1NXD1 2D22A 1QQLA 2YMZA 2AR6A 4DQAA 4LBQB 3OY8B 3CU1B 3A0NA 4Y1YA 4Y1ZA 5IK5A 3BADA 4QD2C 3AXDA 2YY1A 4DENA 4FPJA 4I30A 1IS5A 3AP5A 3QIYA 3FIEA 2UUSA 1SACA 4X38A 1IOBA 1HWMB 2Q3NB 1FV3A 2AYHA 5JOXA 1QNWA 1E1HA 1IRPA 1LGNA 1JHNA 4G6JA 4YG3A 5HPZA 2DVBA 3WHTA 3BB2A 1WUVA 1HWPB 3VEQA 4R9AA 1N1SA 3P6IA 3HOMA 1G8WA 2AXMA 2PHFA 4EL4A 4HJJA 1W6NA 3VSFA 1N47A 2ZZJA 2ES3A 3O0XA 3UL2A 1MVEA 4YM3A 1CJPA 3Q7WA 3H6SE 3C88A 3ZUQA 4WV8A 1TIEA 5SV8A 3BX1C 2GMMA 1JBCA 1LHNA 2EXJA 4KTXA 2YZ4A 1V6JA 4ZFUB 4HR6C 1YXWA 3DUIA 2W08A 2PHXA 5DVHA 3PG0A 1GNZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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