3V0B | Genus

Total Genus 409

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	409
sequence length	1295
structure length	1280
Chain Sequence	MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex. pubmed doi rcsb
molecule tags	Toxin
source organism	Clostridium botulinum
molecule keywords	BoNT/A
total genus	409
structure length	1280
sequence length	1295
ec nomenclature	ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date	2011-12-07

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1120.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain	Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain	3v0bA02
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	3v0bA03
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	3v0bA04
3.90.1240.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Zincin-like	Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like	3v0bA01

4HANA 1IOBA 1I3HA 3PUBA 4BQ1A 2A6ZA 1G82A 3SNVA 3C89A 2V5YA 5BQMB 4WVWA 1SR4C 2Z42A 1ISVA 1QOTA 3QLQA 1N1YA 5DZUA 3ZC9A 2Z48A 1XHBA 3OBTA 3KMVA 5BYNA 3VSFA 1ENQA 1OFSA 3D5OA 3DGTA 3W59A 4HEVA 4JQ0A 1IOAA 1Y7BA 3SH3A 1DIWA 4Q27A 2R49A 4KEKA 2AREA 5GZEA 4ZXKA 4PC4A 3NBDA 2ERMA 4UW5A 1CESA 1O4YA 4QO3A 4ZOTA 2PHFA 2D7IA 1N3PA 1SLIA 4ATEA 3HBWA 2WQZC 1PZ8A 2NP0A 2YMZA 4GWNA 4I6IA 4LBOA 4XJAA 2A6VA 1LGNA 3T1LA 1ZM1A 1W3AA 5F8WA 2DU0A 3CA1A 4IY8A 2EIGA 1E0OA 4YW1A 1PC8B 4I1EA 3QIYA 3VUOA 1DLLA 4HL0A 2E4MA 1DYKA 1AX0A 1ILR1 4GKXA 4FPFA 4FQ4A 3WG4A 5IK5A 2FMDA 4EJ5A 1WLDA 1FATA 4PQ9A 1Q8OA 5HCFA 2OUHA 5KXCA 1QOOA 5CNAA 3FJEA 1IS3A 3AYCA 3ZSMA 2GDFA 1BA7A 1BYHA 4YM0A 2ZHKA 3ASIA 5BQMA 4FPYA 1IS5A 3LCPA 2G7PA 3AH2A 2YROA 2D6PA 4P9WA 2ZGRA 4XBQA 4ISQA 1BZWA 4BPZA 1AVAC 5KXEA 1AVBA 1DQGA 1BXHA 3AYAA 5GM0A 4M01A 2ZGKA 3FJKA 3V0BB 5H9PA 1G7YA 2G4IA 1WBCA 4LO1C 2GMEA 1JT5A 2A6WA 1TIEA 1C1LA 2DS0A 3P6JA 4GAFA 1Q8VA 3ZXEA 4I4OA 4JKXB 2JD4A 2F8XC 1GZCA 4Y1VA 4XXPA 1LOAA 2L5XA 4FPLA 2DVBA 4U36A 3LTQA 1UAIA 1PZZA 1CIWA 1YO8A 3OYWB 3HALA 2W68A 4ZFYB 1GYKA 1S0EA 4Y22B 5IK4A 2D1ZA 3TB0A 1PWAA 3CNAA 1JLYA 4LBLA 1GNZA 4ELCA 4XFTA 5CAZA 1C1FA 1HQLA 4A7YA 3LSEA 4XMAA 3FJBA 3BAOA 1LHVA 4L4HA 4XHXA 4EB2B 2A3XA 1LGCA 2ERFA 4OEEA 2EXJA 2DYCA 4YGEA 1Z2VA 4R9BA 5T5JA 1EV2A 1LOEA 1HQWA 3UK9A 1ONKB 3FJ8A 4I8MA 1Z78A 4M3CB 2Q3NB 1N1SA 2ZMKA 4LO1A 3RMXA 3V0AB 2EXKA 3V0BA 2ZZJA 1CQ9A 1V6IA 4Q9GA 1IJTA 3CU1B 2Q9XA 4J23B 4LO8B 1BLDA 1X50A 1K5UA 1IHKA 2P39A 4XJ9A 1KDKA 4Q2FA 3AYEA 3PHZA 4R9AA 4EFQA 2D24A 1GICA 5F90A 3OJBA 4Q26A 3IM7A 3OYWA 4ZFUB 4PBOA 1FWVA 1S0CA 1RZOB 4FPEA 2FDBM 4XKIA 4ZJXA 1MZ5A 3ZYPA 1GBGA 2A5ZA 1PZ7A 4KC3A 3LSDA 1IKQA 4EFPA 1C4RA 1IRAX 2K43A 5BP5C 3W58A 1CVSA 5B2HA 1AXKA 2XB6C 3S8KA 1TOOA 1JT4A 1V6UA 3BODA 2HYKA 2NM1A 4I4QA 3P6IA 3AP9A 3ZSLA 3DSEA 2ZQNA 2ZGMA 1DQ2A 1V6JA 1HWOB 1N47A 1LHNA 4P0LA 1YF8B 3C9ZA 1EPWA 3AZXA 4ZBVB 1AJKA 4OW4A 3OBRA 4M3CA 5CBLA 2W39A 4FPHA 5FZUA 5BXSA 2CWMA 2H0BA 1HWNB 5BQUC 2GALA 2P3JA 4GOYA 3V0AA 4JAWA 2ZA9A 1LTEA 3WHUA 1SCRA 3WMVA 4OEGA 4I0YA 4MYEA 4ASMB 3VSZA 1DFQA 1LOFC 2AH2A 2A97A 3EF2A 1O4ZA 1LHWA 3VWCA 2VXTI 2AUYA 2HWMA 1JW6A 3FJIA 5CB7A 3I2XA 4D0ZA 4PBPA 3FUQA 4Z9WB 5DZGA 5IK7A 3OGFA 2HZ9A 1CPMA 1AZDA 3UJQA 3WV6A 1FWUA 2DRYA 4GOVA 4X38A 3VT1A 1KITA 2ZHMA 4DCKC 1NXD1 1QKQA 1AVXB 2FFVA 1F82A 2OVUA 5D63A 2DV9A 1ONAA 4JKQA 1Q1UA 2CY6A 2W08A 2PHTA 5FZZA 5BP5A 2WLQA 3APBA 5F8YA 5EXOA 3AZVA 3FLTA 1W0PA 4YG0A 1WUVA 1FAYA 2ZABA 5IUQA 1W6NA 1S0FA 1F5FA 2E51A 3WCSA 4GA9A 3V79C 3IMNA 1VLNA 21BIA 3BA7A 3H0OA 5FNXA 1ISWA 4P6AA 9ILBA 5EWSA 3O4AA 3BOKA 5BQUA 4NOTA 2DVFA 4AN7B 4XE9A 3A0KA 2K8RA 3I2AA 3WDTA 2JE9A 4F34A 1QNWA 4I3NA 5T5PA 3ZPYA 1LOFA 2P37A 3FIIA 3UJ0A 5GLWA 2XHLB 4EL4A 4YZ4A 1G9FA 1PZ9A 3CAHA 1LODA 1Z4SA 1A3KA 4AVSA 1GGPB 2YZ4A 3BOPA 4LBNA 2UUSA 3RTIB 2IMCA 1V6WA 1W6QB 2EALA 1KNMA 1RINA 3FLRA 1MZ6A 1HWMB 5DZFA 4BMEA 3CA0A 2K4AB 3O49A 2Y9XE 4Y1ZA 2ZGNA 4CTEA 2ZGPA 5KXBA 1II4A 1WCSA 7I1BA 2VW2A 1SBEA 3FJCA 4GALA 1OQLB 1YTOA 3O4OA 3WHTA 1LCLA 5DG1A 3AX4A 3RSJA 2AAIB 1DQOA 1BLAA 4XTMA 5BVPI 2IMBA 1RITA 2ZMLA 4IONA 5JLVA 1GKBA 2MIBA 3QR5A 3N36A 4M00A 4I4UA 2JJ6A 4II0A 2VU9A 4FOVA 1M2TB 3WDWA 3ZX7A 2ENRA 3Q9OA 31BIA 2QYIB 4IZEA 1GSLA 3SH5A 4KS6A 4R6UB 3FGMA 4EEEB 1DJSB 3DEBA 3HMYA 3O4DA 1R8NA 2XHLA 3BWIA 5HPZA 1AXYA 4Y26A 1RMLA 1DHKB 2D44A 2D6MA 4YM1A 4BM8A 4Z8BA 3JU9A 4WVVA 1ULEA 3POKA 4X3AA 2ZQOA 2NYYA 1SBFA 1UKGA 4P0JA 1W6QA 4F83A 3ATGA 1ULGA 3MW4A 4DPNA 3O12A 1QXMA 4WV8A 4XIKA 1LESA 5DSSB 2ZMNA 3N3HA 1ZKWA 5JDBA 1VAMA 3T2TA 4TLPA 1LJ7A 3TAYA 1BASA 3FIEA 1HKDA 2TEPA 1HWPB 3WINC 5GZGA 3ZSJA 3FJFA 2ZHLA 4LBQB 3NJ5A 1N3OA 1AX1A 1MS3A 2PHUA 2A6YA 3O4BA 3AH4A 1PUUB 1WBLA 3QW6A 3IIRA 4Y1YA 3USUB 3AFKA 4LO2C 4AVTA 3W9TA 3POWA 2UURA 1R8OA 3WG3A 1V6OA 3AP5A 1H30A 3O0WA 1RIRA 2R1DA 4I4SA 3N7MA 1FNYA 2C5DA 1M16A 1AXMA 3OGGA 2KM2A 3DDBA 2AFGA 1CVNA 2NN8A 1ISZA 1TWMA 3V65A 4X37A 1UX6A 2DUQA 5GLVA 2CYFA 5I1BA 3AKGA 5E8AA 5SV8A 5FZYA 3MPPG 1LU2A 1FQ9A 3BA4A 4XIOA 2BQPA 5H9RA 4OWJA 4M3CF 3F1RA 3UD7A 3RMYA 4I4YA 4QKSA 4DRVA 1URXA 2P3KA 3ILAA 2D6KA 2CNAA 3WINA 3MW3A 2LTNA 4L8QA 2PELA 2R16A 3NBCA 2EXIA 3FJDA 2PHRA 2E6VA 4LBQA 4IHZA 2ZGTA 3SLIA 1W3FA 4DEPA 3PVNA 4Y24A 1LENA 4USPA 4LO2A 3VKOA 1CJPA 3USUA 1DZQA 2EAKA 2XG3A 1QGLA 4LBJA 3SITA 4LBMA 3ZXFA 2ISEA 1JOJA 4I2SA 1QDCA 3ZXJA 5H9SA 4OEFA 5DUUA 3S8JA 3AP4A 3BIWE 5FREA 3WNXA 4JRAA 4I1BA 2G7KA 2BEBA 2ZAAA 2WSVA 2MLLB 1JUIA 3OJMA 4GP0A 3AZZA 4G6JA 4BLIA 1KJRA 3UJ4A 2A75A 4J1LA 3M2MA 4QBVA 3IPVB 3N35A 4QD2B 3JUTA 4P0KA 3UL2A 1YVGA 4QD2C 2X2TA 3HOMA 4QALA 1DFCA 4D8HA 3C8AA 3BRFA 2GMPA 2Y9GA 3WCRA 3ZC8A 2ILPA 1ENRA 4XJUA 3QIZA 1EVTA 3O44A 4YW4A 3ILNA 4DRRA 3WO3A 3MW2A 1L2HA 2GNTA 5T5OA 2JDZA 2D6OX 3BAHA 4I30A 1V6NA 2SLIA 3FJ9A 1TEIA 1AF9A 3V64A 3D4KA 3Q7YA 1LGBA 3DDAA 1J1TA 5DG2A 1FV2A 1V6MA 4P14A 4AGVA 1S0DA 4FPJA 2GMMA 4PF5A 3RQ0A 2FO1A 3WDYA 1IKPA 2DTYA 2DU1A 1Z7HA 3NV3A 5L73A 5T54A 3IPVA 4Y22A 1J0SA 3AH1A 1ZKXA 2D43A 4I37A 3QYDA 3GNEA 1BJQA 1F31A 1IS6A 3C88A 2RG9B 3OY8B 1BFGA 1ABRB 3I8TA 2R1BA 1AXZA 3E8LC 1ZB7A 5EYXA 5GLTA 1W6PB 4Y20B 1QQLA 4XTPA 5G00A 1YI7A 3IM5A 2YY1A 3M3EA 3PMEA 3A23A 1IRPA 3B00A 2E53A 2M49A 1JYIA 2DRZA 4HA2A 5DUVA 3WUDA 4HR6C 2XOAA 4CJMA 3B3QE 2ZR1B 3WDVA 2VUAA 3WA1A 4W65A 3QW5A 1LOGA 2GNDA 3T8SA 3AJ6A 1V6XA 3IM0A 1FYUA 4I4VA 1Q56A 3AJZA 3BAGA 4WZFA 5BXPA 3N7JA 4C1XA 3NV2A 1DQ1A 2GO2A 3FBYA 4Y1XA 2MC2A 4LBQD 1QQKA 2I1BA 1JBCA 1XG6A 3B9UA 2AGSA 3FLPA 3CA3A 1VCLA 3D3XA 2CWSA 1NUNA 1AVWB 1MR5A 4K1YA 4XZPA 3N0KA 2UU8A 3OJ2A 4DENA 1LHOA 3AKFA 4YG6A 1XTFA 3LLPA 4OUJA 1K5VA 2WBCA 3GALA 3AJ5A 3A0NA 1G9AA 1WW4A 4UW4A 4QBCA 2D3RA 5GAQA 3IAGC 3OY8A 4JP0A 2C9AA 2D3SA 2FPQA 1HIBA 1C57A 1TP0A 3Q7WA 3IM6A 1W6PA 1IILA 4Y20A 2CL2A 4YZ5A 1LEDA 4I96A 4GAIA 1GZ9A 1GLHA 4D69A 3AXEA 1Q8QA 3NV4A 4P9YA 2A6XA 3UD9A 1WD4A 2P34A 4KEIA 4EFRA 4XJ8A 3NBNA 1G86A 4K1ZA 1V6VA 2WKKA 3ZXGA 1GZWB 1SLTA 2WJSA 2AR6A 1OQ1A 2A3YA 2VXRA 5F8SA 2YXSA 2QN4A 2I2SA 3QCWA 3I29B 3VT0A 2D7FA 1BARA 1CONA 2CTVA 3O3QA 4K20A 8I1BA 1EYLA 4ZGRB 3AK0A 3CRIA 1AX2A 4H04A 3HSMA 3A07A 1WBAA 3VKMA 4OWLA 5BOWA 1XQNA 3ENRA 2X2SA 1GV9A 3CA6A 1MACA 4FVVA 1LULA 1LOCA 1NZKA 3A4UA 5EG6C 3RRDA 5EYYA 4LO3A 1CE7B 3CA4A 4G1RA 2LALA 4IZXA 3BTAA 2R0HA 5JOXA 2NMNA 2UWCA 3KQRA 2E7QA 5T50A 4AYUA 3FUOA 2DURA 2B7YA 1Q04A 1FNZA 3INAA 1AVUA 3IKWA 5D62A 2VY0A 2VSAA 4QC4A 5EC5A 2A8AA 1VIWB 1JXNA 4Q1PA 1DQ0A 3ZYRA 1SACA 1DQ4A 4KBBA 5T55A 1V00A 3POYA 4DS0A 4YGBA 1GZWA 1ISYA 5HCAA 5E88A 3M3OA 1P63A 1KJLA 4XBLA 5DZEA 1Q8PA 1CPNA 1T3CA 2ZBJA 2Q5TA 1FV3A 1FGAA 1WW7A 1PUMB 3PG0A 4DQAA 1JN2P 2F2FC 1TFMB 4XFUA 1QDOA 1KRIA 1QU0A 3NF3A 3IN9A 3BB2A 1YXWA 5AVAA 1BFBA 3AP6A 2RHPA 1S1AA 5GZCA 4Z8SB 1YRZA 3P53A 4DFSA 2JECA 4FOQA 3D6EA 4UW3A 3CQAA 2IHOA 4G9NA 4AGGA 5E89A 3RG0A 2DVAA 1JY0A 1LOBA 4C1WA 4QKRA 2DVGA 1U0AA 1MS5A 3MEPA 4YFZA 4XOGA 1S0IA 3BADA 2P23A 2WT2A 1SBDA 2DUOA 2WT1A 1ZA4A 2V73A 4GKYA 3WG1A 2LIEA 1W3GA 2WRYA 3FJAA 1QMJA 3UJOA 1LEMA 2ZKNA 3SNMA 1VAVA 2WSUA 1YIFA 1DZDA 3JRRA 4GWMA 2VW1A 4J2XA 3ILRA 2SBAA 4ITCA 4FP2A 2D23A 1MC9A 4KEJA 2UWAA 1DGLA 1HKNA 2G7QA 4FPKA 3BAQA 5GLUA 2ARBA 3DS9A 2F2FA 2OW4A 4RL7A 5EHAA 3BA5A 3POSA 4OWKA 4YZ3A 2ISHA 3K1XA 4FOYA 1MD6A 4FGFA 4YGDA 1WLWA 1AFCA 3QW7A 3ZXLA 1DBNA 2ET2A 3BX1C 1UL9A 4OZXA 1TWEA 4LO0C 1YBIA 3M1HA 4XXAA 2D20A 4J2SA 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2GZBA 3M3QA 4Q8LA 2AXMA 3BAUA 1MVEA 2A71A 1W6NB 2WT0A 4XBNA 3WDUA 4XFSA 1SLCA 6I1BA 1RG8A 3PVOA 1XTGA 3NV1A 1ZL6A 1I1EA 1WD3A 2GNBA 5D61A 4AWDA 3F62B 1E1HA 3AP7A 4WBCA 1ULCA 4PCRA 4LBKA 2W2DB 1ISXA 3O5WB 2VW0A 4R9DA 2PHXA 2GNMA 5T5LA 4Q91A 4I4RA 5JOWA 1LU1A 2P2KA 3H6SE 3I4IA 4A7ZA 5DUYA 3HR9A 1LECA 1H9PA 1SFYA 5JOYA 4UW6A 1A8DA 1GNHA 4ATFA 2R9KB 1WW5A 3WVJA 4GP3A 2PHWA 4XHBA 2D22A 5GZDA 1ZN3A 3N7LA 4H55A 3M3CA 2AYHA 2ETFA 1BFFA 3WDXA 1ENSA 3PVEA 4XJZA 5CA6A 3ILFA 4JC1A 2OUJA 1SCSA 4LO3C 2ES3A 1W6MB 3BAVA 4Q9PA 1SLLA 1HLCA 1AJOA 1V6LA 1SZ6B 3AJYA 3R4UA 4ENDA 4AVVA 1WW6A 1ZL5A 4XYXA 5BXRA 5DUXA 4GXLA 3WO4A 2QN0A 1UN1A 3FFZA 4M3CE 2BFHA 1OKQA 4YZ2A 3O0XA 5BQNA 1JT7A 3OJVA 5JMCA 4CZSA 3O5SA 2A3WA 5BXTA 1JLXA 2ZGLA 1WLCA 1DQ6A 2W2DA 1HCDA 3BOOA 2JE7A 3VV1A 4YLZA 2EXHA 1KQRA 1W0OA 1I1BA 2IMAA 1NLSA 2NZ9A 4FPGA 3WUCA 2AENA 1ULDA 4JPZA 1GANA 2GN3A 3U4XA 4KTXA 5DXDA 5H9QA 3AKIA 1MS9A 4EKXB 3UD8A 3B69A 2IWTB 1ITBA 3AXDA 3R4SA 4IQPA 4AGRA 1H9WA 4XDQA 3AKHA 4Q8KA 2FFUA 4K21A 4U2AA 4ZKTB 3WOGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3V0BA

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