3V0BB

3.9 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
2004006008001000050100150200250300350
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/A
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0bB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0bB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0bB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0bB01
3BOOA 3AKFA 4LBOA 5T5JA 4LO8B 2XG3A 2UU8A 3W58A 3QIYA 3R4SA 1IILA 1GNZA 4AN6A 4LBLA 5CBLA 1H30A 4XHXA 1K5VA 4Q9PA 1JBCA 3OBTA 2G7QA 1HIBA 5E88A 1U0AA 4BOWA 2A6VA 4YOLA 3FUOA 1V6NA 2XB6C 2C5DA 5GLVA 3HN1A 5DXDA 2E6VA 2WRYA 1BQPA 2D23A 3WO2A 1N3QA 3O12A 4XBQA 3WUDA 2AGSA 4EEEB 1DJSB 2DRYA 3SNMA 2G7KA 2ERFA 1CIWA 5GLUA 4LO0C 1QXMA 4YZ4A 2Z49A 4NOTA 5EHAA 5D63A 1II4A 5FRAA 1CONA 3A21A 5DUUA 3ILAA 4X37A 3PVNA 4TYSA 4LO3C 4LO7C 2B7YA 3QW6A 2A3WA 1RY7A 4BMEA 1FN0A 3ZVXA 2D3PA 1IRPA 3OJBA 3AZWA 4K21A 1WLDA 3RQ0A 4I4QA 2EIGA 3WDUA 4IY9A 2YMZA 4YM1A 4EJ5A 5DSSB 1LOEA 2ZGLA 1MS4A 2OUJA 2F2FA 5FZUA 4XTPA 1JY0A 1N3OA 2JDZA 4XXPA 2R16A 2Q9XA 4Q27A 9ILBA 3O5SA 2RQ9A 3N0KA 2ZHMA 2AYHA 2VW2A 1S0LA 3O0WA 4HJJA 2D6PA 4XOGA 4IONA 2WSUA 3WG3A 2GMEA 2PHTA 1GZCA 3T8SA 3PVOA 1IS6A 5GAQA 1W0PA 3BWIA 2A6ZA 3OY8A 4L4IA 1MS9A 2YZ4A 4YM3A 1R8OA 1J0SA 2X2SA 4LO0A 5GJ6A 3VSFA 4DRRA 2F8XC 1W6OB 5BP5C 3ZYRA 1BA7A 5GZDA 4LBQA 5L73A 3ZYPA 4JPZA 1G9FA 5FZYA 4XXAA 4LO3A 2FGFA 1LECA 4OWLA 4LO1C 5BQMA 1XZZA 4FP3A 3WG1A 4CTEA 2R0HA 1SR4C 4Y1ZA 5B2HA 1S0EA 1R8NA 3N7JA 3JRRA 1FMMS 5IUQA 2IWTB 4I1EA 2A5ZA 3IPVA 1DQ4A 5IK8A 2VW0A 1MZ5A 1FAYA 4K20A 4M00A 4Q9GA 2DURA 3W59A 2FPQA 4I4RA 1MR5A 1LTEA 3WDTA 1SCSA 3QCWA 2D20A 1LODA 5F90A 1WUVA 2LIEA 2R9KB 1JYIA 3FIIA 2QN4A 2ZHNA 1LHOA 2ENRA 2RSTA 4KEJA 3DDBA 3FJAA 3LCPA 1CQ9A 3AJ6A 2EAKA 1LHUA 2UWAA 2IMCA 1L2HA 2GDFA 4D69A 3CRGA 4EFPA 3AYCA 4USOA 4A7YA 1QKQA 2D6LX 1PC8B 1QMJA 1IHKA 3BADA 3ZURA 5LK5A 4YZ1A 2DVFA 1H9PA 3H6QA 3IKWA 4XILA 3IMNA 1SR4A 5KXCA 1S0JA 4I0YA 2WSVA 3Q7WA 3C89A 4OW4A 3OY8B 4XE9A 1BASA 2UWCA 1CN1A 1IJTA 2KLLA 1LULA 1LGNA 2P23A 4LBQB 4Y26A 1AVUA 4XFUA 4Q8KA 2D3RA 4YLZA 3QIXA 1DQ5A 3WCSA 2ZABA 1H9WA 1NUNA 1QGLA 4GWMA 1O4YA 5BQMB 2I2SA 2DVDA 3KM5A 1MS8A 4D0ZA 3N7LA 5BQNA 1I1EA 1G82A 1IOBA 4G1RA 2V73A 3WDYA 2ET2A 1C57A 5JVVA 1TOOA 4EKXB 1DBNA 1V6UA 3IPVB 3QLQA 3GNEA 2GO2A 3CNAA 2CYFA 4I4PA 3AYEA 3UK9A 3AP4A 5H9QA 4HL0A 5GZGA 5H9SA 4Q8LA 3AXEA 4I37A 1AJOA 3BOPA 2ZGRA 4YFWA 3AP5A 3B01A 2WJSA 3FJDA 1S0DA 1HQLA 2E53A 4XDQA 3BIWE 1ISYA 3NBEA 1Q03A 3QIZA 1OFSA 2JE9A 1W6MA 1BYHA 1GZWA 3FJ9A 2KI6B 3WUCA 1C1FA 1XTGA 4HA2A 2ZGOA 4AVSA 2OUHA 3CA3A 2YV8A 5F5QA 4OUJA 3LLPA 5SV8A 3M3EA 1HWPB 3ZUSA 3M3QA 1ISXA 2DU0A 5JOXA 4YFZA 1KJRA 3FFZA 2D3SA 5DZEA 3FJIA 3Q9OA 1JTCA 2HYKA 4QBVA 1LJ7A 4WVWA 4GWNA 2DUQA 1AF9A 1XG6A 4UW3A 4Q1PA 3I29B 5JOWA 1AVWB 2DV9A 4LBNA 2EXIA 1TWMA 3VSZA 3MPPG 2E4MA 1CVSA 1HWNB 3ZXFA 5BXTA 3O4AA 1HKNA 3SNVA 4I4UA 1G9AA 4G6JA 3UJOA 4J1LA 3UDAA 3B69A 2AAIB 1WW6A 3FLTA 2K4AB 2A3YA 2CNAA 2A70A 3V65A 3N35A 1YIFA 4D8HA 2ZGMA 3QYDA 3AYAA 2VU9A 5DG2A 1BFGA 2D7IA 1DQ0A 1DYPA 4K1ZA 3RS6A 2A6XA 4ATFA 4IQPA 21BIA 4KS6A 1W6NA 1JLYA 3SISA 2Y9XE 3HBWA 4EFRA 2M49A 3FIEA 1GZWB 5KXEA 1Y7BA 1P63A 3OJVA 5BVPI 3O0XA 2LIQA 2ZKNA 3CA5A 4J2KA 5G00A 3PUBA 4FP2A 3ZX7A 2DVGA 4EFQA 1N1YA 1JT7A 1WW7A 1RG8A 2DUPA 3RMXA 4YW5A 1LHWA 3RSJA 4ZOTA 3AH4A 3WG2A 3OPZA 1BARA 1KDKA 2AFGA 4GKYA 1GZ9A 1GSLA 3B9UA 2P2KA 1JN2P 4QD2B 5F8WA 1EV2A 1Z2VA 1TTUA 2WNEA 3PVEA 2NZ9A 1HLCA 2AQZA 2D6KA 3BODA 1ZKWA 3FJCA 4JC1A 4J2XA 3ASIA 5KXBA 1KJLA 1OKQA 2A6WA 1HCEA 2ZGUA 3O49A 2GNDA 3D3XA 1DFQA 2KI4A 5GM0A 3UD8A 1YF8B 1CVNA 3Q7YA 4KEKA 3POSA 4JKXB 3C8AA 3T1MA 3FJFA 4YG3A 2VW1A 5F8YA 3WINA 2VXRA 1XYFA 2DS0A 2R49A 3NV4A 1MZ6A 4P0JA 1SZ6B 3POWA 3A0KA 2BEAA 4XFTA 1DQGA 1UPSA 5CB7A 1FX5A 3TC2A 3T1LA 4IZEA 1BXHA 4QBCA 2EXHA 3VT2A 4I3NA 2W39A 1IT0A 3ZPYA 2A8AA 3HMYA 3IM5A 1FNZA 3NF3A 4CRQA 4ELCA 1S0IA 2ZMNA 2DYCA 5GALA 2C9AA 3AJYA 4Z8SB 1PZ7A 3VEQA 4KC3A 1HKDA 2R1BA 3ZXDA 3I2XA 1VAMA 2P3JA 1W6NB 1QU0A 4XYXA 3AP6A 3AKHA 4LBMA 3WCRA 2GNTA 3CA6A 3MEPA 5EYYA 4YZ2A 4FQZA 3FJEA 3K3QB 4MYEA 1G9DA 4XMAA 2KM2A 3QR5A 1JYCA 3BRGC 4H9WA 2GALA 3VKMA 3TB0A 2ETFA 3WHTA 4PC4A 1ENQA 1MS3A 2GNMA 3HR9A 4YW1A 2VXTI 4GP0A 4C1XA 2OVUA 4AGRA 4GOYA 1PUMB 2ES3A 5E89A 3NV1A 4AVTA 2D7RA 3DDAA 3O4OA 4UW4A 4I4YA 5F8SA 2NM1A 1S0CA 4YGEA 2VSEA 2SLIA 4FQ4A 1X50A 3O5WB 3P6IA 3QW5A 3ENRA 2BQPA 5CNAA 1JHNA 4DRVA 1BFBA 3CA1A 1AXYA 2GMPA 4XJAA 4XJWA 4OZXA 3ZUQA 2AUYA 2LTNA 1ZKXA 5JOYA 1JLXA 4ZFWB 1GNHA 1RZOB 2ZGNA 2V5YA 4PBPA 2D22A 3ZXEA 1WD4A 4P0KA 4TLPA 1F5FA 2TEPA 1AVBA 3O44A 3ZXGA 5KXDA 2ZHKA 3U4XA 3MW4A 2FO1A 2PHWA 1DLLA 4II0A 1RIRA 2DU1A 1K5UA 1DZCA 3C88A 3O4BA 3ZSKA 5D61A 3IM7A 5H9RA 5DZUA 2ZQOA 4A7ZA 1WW4A 1S0GA 1ENRA 1AX0A 2KH2A 1ULDA 3WO3A 4OWKA 1PZZA 2P37A 1V00A 1CPMA 5BQUC 1ULCA 1WLCA 2WQZC 5IK7A 1NXD1 3FGMA 1BFFA 2JE7A 1JOJA 2PHXA 1KNMA 4D0TA 2HWMA 3F62B 4FPYA 2Q3NB 3VKFC 3WZ1A 3BOKA 4ITCA 2CY6A 3BA7A 3OGFA 4TZDA 4FOYA 2Z48A 2E51A 1W6PA 4L4HA 5BXPA 1LGCA 1DFCA 2WT2A 1LESA 2MIBA 4Q1RA 4RL7A 3UJ4A 4ZKTB 2ISGA 4ENDA 5BXSA 4GXLA 3NV2A 5JMCA 1EYLA 1UKGA 1PWAA 5E8AA 3NBCA 5BP5A 2IHOA 4YGBA 2AENA 4Z9WB 1YI7A 4XJ8A 4BMBA 5BYNA 1LOAA 2JKBA 4PCRA 5CA6A 4LO1A 5CAZA 4HR6C 2G4IA 1LOCA 3I2AA 3HALA 2AREA 4DEPA 5EYXA 2Y9FA 4KTXA 2R0FA 2E7QA 5DZFA 4J2SA 1W3FA 5IT6A 2ZGKA 2WBCA 2E7TA 1M2TB 41BIA 2DWRA 5F9TA 3DUIA 3AJ5A 1HDKA 4LO7B 4ZJXA 1Q56A 3FJKA 3JUTA 1RITA 4QC4A 5JDBA 1T3CA 2LALA 1HQWA 1SLAA 1VCLA 2K43A 5D62A 3A4UA 4Y20A 1AX2A 2WKKA 3O3QA 3DSEA 3NJ5A 4Y22A 4GALA 2D6MA 3NBNA 3WDWA 3BRDA 3NWKA 3IIRA 1G7YA 5GLTA 4FOQA 1DGLA 4Q91A 2NYYA 3D5OA 3ILFA 4H55A 3SLIA 1GKBA 1Z0HA 1W6PB 1ONKB 2J3PA 5T55A 2HZ9A 1HCDA 2ISHA 1IS4A 1MC9A 4HEVA 4I8MA 4YG0A 3OJ2A 2PHFA 3F1RA 3MW3A 3AZYA 2ZGQA 3VV1A 1Q8QA 1FV2A 1GLHA 1ULFA 2Y9GA 1Q8OA 1EVTA 1DYKA 3B00A 3NV3A 1XQNA 2WT1A 4AWDA 4JP0A 4LO2C 3AZXA 5FNWA 2QN0A 1YRZA 1TP0A 3WA1A 3BB2A 1V6MA 1MACA 5T5PA 3AYDA 1LU1A 4P9XA 2GZBA 1SCRA 3K1XA 4ZFYB 4FPLA 3BAGA 1WLWA 2EALA 4FOWA 4ZGRB 2DRZA 3DEBA 3ZSJA 1A3KA 4DS0A 1FYUA 1A78A 2FFUA 3TAYA 4NO4A 4Q26A 1SLTA 4XMIA 3PG0A 3IN9A 1V6WA 4XHBA 4ISQA 3LTQA 4GAIA 1DQ2A 3AJZA 2MLLB 4I4VA 3H6RA 1ILR1 5HCAA 4QALA 1BKZA 3WVJA 4ZXKA 3QW8A 4XBLA 3CA4A 4I7IA 1LEDA 2ERMA 1Z78A 3T2TA 2ZGSA 2GNBA 4IZXA 3JU9A 2G7PA 4L8QA 4SLIA 2P34A 2FFVA 1G9BA 1RMLA 3WV6A 1SFYA 2DTYA 4Y22B 3D4KA 3R4UA 3VWCA 1G86A 3SITA 3USUA 1QDOA 1RINA 1LOGA 2UWBA 1IOAA 1ONAA 2AXMA 1T3AA 3OBRA 3AZVA 1FATA 4BLJA 1ULGA 4BPZA 2EXJA 2SBAA 1BZWA 3VKOA 1LENA 4P6AA 2DUOA 3LSEA 4I30A 1FMZA 4USPA 2QYIB 3OJMA 1ITBA 3W9TA 1W6MB 2FDBM 4DENA 4J2YA 1AFCA 4XJUA 3MW2A 2NN8A 1GICA 4Z8BA 1MVEA 3D7WB 3A0NA 3GALA 4PF5A 1PZ8A 3CRIA 1LOFC 4UW5A 1ZL6A 5T5LA 2YXSA 2ZBJA 3VT1A 4IYBA 1ZM1A 1V6JA 2NMNA 4M3CF 2HW9A 1PUUB 5GLWA 1AXZA 5DUYA 4P14A 1N1VA 4QKRA 1S0FA 2PHRA 4BQ1A 4FGFA 1W6QA 4EB2B 1KRIA 3ZC9A 1TFMB 1YYNA 2ZACA 2A71A 1W0OA 3FLPA 1ULEA 1WBCA 1ISVA 3POKA 2D1ZA 5BOWA 4YM2A 2IMAA 3AKGA 4JRAA 3RRDA 3H6RB 3I4IA 4R9CA 4FPKA 1ISZA 2MC2A 5T5OA 2RHPA 4ISRA 1FNYA 1V6KA 4FPFA 2ZZJA 4OEGA 5GZCA 1DHKB 1O4ZA 1EPWA 1WBAA 1BFCA 1F9KA 4AYUA 1W3GA 2FMDA 1V6VA 1SLCA 3OYWA 3WNXA 1JQZA 1XTFA 3JUUA 2BEBA 1B09A 3BONA 4R9AA 2A3XA 2F2FC 5GZFA 4XBNA 3USUB 2P3KA 3P53A 2JJ6A 4XKIA 1N1TA 1W6OA 4GAFA 1Q1UA 2EXKA 3AFKA 1QOTA 3BAQA 4KUFA 1SLLA 4OWJA 3BRFA 1VLNA 1KQRA 1LOFA 4U36A 2XHLA 2NMOA 1QNYA 1GGPB 4RA0A 1AX1A 2FHRA 4I4XA 1N47A 5DG1A 3B9CA 31BIA 5HPZA 1Z4SA 4DFSA 4FOVA 3PMEA 5IK5A 2K8RA 1VAVA 2GN3A 1N1SA 4PBOA 2W08A 5I1BA 1WBLA 1YO8A 4FPGA 1T9FA 3VT0A 1C4RA 3O0VA 3BAOA 4Y1VA 4WV8A 1OQ1A 3FJ8A 1SBEA 1W3AA 1WCSA 3ZC8A 4IHZA 5GLZA 3BA5A 3FUQA 5IK4A 4YW3A 2L5XA 1BLDA 1JT5A 3PJQA 1G8WA 5GZEA 3QJ0A 7I1BA 3BAUA 2ESUA 1MVQA 2VSAA 5DUXA 3AP9A 5EG6C 2AH2A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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