3V0BB

3.9 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/A
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0bB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0bB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0bB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0bB01
1UMZA 1RITA 5BQNA 2L5XA 3CQAA 2WBCA 4EL4A 4JC1A 2ZGSA 3F62B 5F9TA 2ZHKA 4KEKA 3POYA 3VKOA 1T4QA 2IMBA 4R6UB 5DVHA 2GMMA 1T9FA 3N3HA 1W6NA 2AQZA 2AREA 4KBBA 2CNAA 4AVVA 4I1EA 4FPLA 4W65A 5GAQA 1JN2P 3E8LC 2LTNA 4QKRA 2KI4A 1Q1UA 3V0BA 1G9FA 4YM1A 4I4OA 1W6MB 2A3XA 2A97A 2P37A 2E53A 1MD6A 3QLQA 3B01A 3VUOA 4P6AA 1AVXB 1HWOB 3FJFA 2SLIA 3HR9A 3WHUA 3HSMA 5FREA 5HCFA 1KRIA 3EF2A 2ZGTA 2D6KA 4JAWA 3ATGA 4WVWA 1A3KA 2OW4A 3C89A 3BX1C 3BOOA 2WQZC 2ESUA 4OWLA 1VIWB 2E7TA 1UZYA 3CA3A 4CRQA 3QJ0A 4FQZA 4I96A 3AP9A 1SLAA 1BXHA 2A3YA 3WV6A 1WLCA 5IK5A 1CIWA 1IS6A 1DQ5A 2R1DA 5IT6A 1SLCA 3O44A 2C5DA 4G9NA 2DU0A 1XYFA 2ZGNA 4H04A 4LO0C 4FOYA 3A22A 5KXDA 2ZKNA 3AYEA 3H6RB 2A7AA 1MS5A 3AKFA 1N47A 1N1YA 4ZFYB 3WINA 2ETFA 2DV9A 1QU0A 1Z78A 3NV3A 2RQ9A 1DQ2A 4ZA3B 1EVTA 4HJJA 5T54A 2YV8A 4ZBVB 5D62A 1JXNA 3SH3A 1WD3A 5E24E 5FRAA 3BAQA 1V6WA 3IPVB 5H9RA 5F5QA 3FJ9A 2YMZA 2PHUA 1ISXA 4XZPA 1QMJA 1RY7A 3PMEA 4LBMA 1GLHA 3APBA 1LECA 3PHZA 3BWIA 2QN4A 3WDYA 3QW5A 1FNZA 4D0TA 1ISVA 3AH4A 1PZ9A 3O3QA 3IM6A 1UKGA 3OJVA 4XXAA 4Y22B 1S0EA 2K43A 4YZ1A 4D69A 3HMYA 4JP0A 3V64A 1GKBA 2D7FA 1V6XA 1HQWA 4ZGRB 1GZ9A 3WINC 4I8MA 1D2SA 3AJYA 4IY8A 2ENRA 2P3IA 2WNEA 3JUUA 4GAIA 2J3PA 3ZC8A 4A7KA 4LBLA 1BA7A 4AGRA 1DYPA 3POKA 2JKBA 1LJ7A 3UJOA 2D1ZA 2RHPA 4X39A 1LHWA 1QOTA 1W6QA 2D7IA 2IHOA 4GAFA 2NM1A 2YXSA 3BADA 3WDWA 1DGLA 1A78A 2D20A 2D3PA 4GKXA 1HWNB 1S0LA 2A75A 4OZXA 3L2YA 4JQ0A 1W0PA 4C1XA 3BRDA 1KDMA 1WCSA 3AKHA 1WLWA 4QALA 1N3QA 2DYCA 3CRIA 1HCDA 4K20A 5F8YA 4YGCA 3N0KA 4Q8KA 2A6XA 2A6WA 3WA1A 3DS9A 1QQKA 4I0YA 4A7ZA 1ULDA 1HWMB 2MIBA 2C9AA 3TB0A 4R9CA 4I4QA 4Y1XA 4Q91A 3AX4A 4I1BA 3WOGA 4OEFA 3FLPA 3T2TA 4M3CF 3VKNA 4EFQA 1ZKXA 1S0GA 1GV9A 2GO2A 2ZBJA 2DRZA 1DQ6A 4DQAA 1JT5A 3CRGA 2FFVA 1FNYA 1JYCA 4R9BA 4K1ZA 3RMXA 4OWJA 3OGGA 1QOSA 5BP5C 1G9CA 4WZFA 2FGFA 1VLNA 2VY0A 3D6EA 4LO2C 1R1ZA 1N1TA 3OJ2A 4RA0A 2D23A 4YZ5A 1N4KA 5JVVA 4LO7C 3UDAA 1SBEA 1IS5A 5BXTA 5DZGA 2DTWA 4OW4A 4P9YA 1GBGA 2DS0A 2D6OX 3WLUA 1UPSA 4C1WA 4XJWA 3C8AA 2FHRA 1YF8B 2ET2A 1DFQA 2Z42A 1WLDA 4FGFA 3D5OA 4ATEA 3UD7A 1LOCA 2G7QA 3MW4A 3SLIA 4LBQB 1Q8QA 4L8QA 4DCKC 4X38A 1BYHA 4BM8A 2Z48A 3SH5A 1LU1A 3QR5A 1YBIA 4LO3C 4AVSA 4PC4A 1G9DA 4I4SA 5CA6A 3DDAA 3UJ4A 3AK0A 3KM5A 1UX6A 1SR4C 1FATA 3FJEA 2KKIA 3NBCA 2IWTB 2AGSA 4I4UA 4I37A 4DENA 4EB2B 2EF6A 3OBRA 3POSA 2D43A 2DWRA 3BAGA 2JE7A 1I1BA 1JW6A 2KM2A 4AVTA 3AZVA 4U36A 1BFGA 3QIZA 3OYWB 5CBLA 3NJ5A 2GN3A 4PBOA 4ELCA 5T52A 2WT0A 4DFSA 3I4IA 4JRAA 4WV8A 4UW4A 5T55A 1ONKB 2WT1A 5GLWA 3V0AA 4P0LA 3N7JA 1LODA 4XBNA 4YGBA 1Z4SA 2Q3NB 2D7RA 1K5UA 2Q9XA 5BQMA 4J2KA 3ILRA 2CWSA 1TP0A 2EXKA 1KITA 2WLQA 1MS9A 3AJZA 4QKSA 3WG1A 2D24A 1AF9A 4XE9A 4Q9GA 3IAGC 1QNWA 5JOZA 4I6IA 1H9WA 2ERFA 3NBEA 1QDCA 1J0SA 3I2XA 5DZFA 3WHTA 5BVPI 1FYUA 2DURA 4DEPA 1SACA 1ENSA 1JLXA 1LGBA 3NBDA 5CNAA 2VUAA 2NZ9A 3M3OA 3IMNA 4U2AA 5DZUA 1M16A 2UWCA 1LENA 2G4IA 3ILNA 4K1YA 5DG2A 4AN7B 3CNAA 5EXOA 1DQOA 3AP5A 3NV2A 3VKMA 1M2TB 2GZBA 4XMIA 3S8JA 5IK7A 1ITBA 3H6SE 2FDBM 41BIA 1CE7B 4ISRA 4YOLA 1DYKA 2VW0A 4XJUA 1W6MA 3OY8B 1S0FA 3VEQA 1ULCA 5SV8A 5FZYA 4UW5A 5JMCA 1F9KA 4M01A 3HALA 3WCRA 3AH1A 3B3QE 2MLLB 1AXZA 1SLIA 1TWMA 1ZL5A 2AR6A 2Z49A 3B69A 2G7KA 3CA1A 3BRFA 1A8DA 1ZN3A 1V6LA 2NVHA 2ZHNA 3K3QB 2E7QA 3N7MA 2LIEA 5BQUA 3R4UA 1FMMS 1YXWA 5F90A 4FQ4A 1LOGA 1FGAA 2ISHA 2BEAA 4USOA 4H9WA 1FX5A 3BOKA 1GNZA 2GDFA 5JOXA 1DLLA 4AGGA 3W9TA 1H30A 2WRYA 4GP3A 2UURA 1N1SA 3AYAA 3A4UA 4Y20B 4GWMA 1FAYA 1LOEA 1F31A 2ZHMA 3VT1A 1CR7A 5T50A 1PZZA 4BMBA 2PHFA 3H6RA 3WO3A 1NLSA 1N3OA 1LOFA 3W59A 4II0A 1ONAA 1GZCA 3T1LA 1FWUA 3AZWA 5T5OA 4KS6A 3MW2A 3I8TA 4YW3A 1ILR1 1DZDA 1BQPA 2AH2A 4AN6A 3TC2A 4OEEA 4L4IA 4IZEA 2ZR1B 3IPVA 1LTEA 5BQUC 2Y9GA 3ZX7A 1WBFA 2KLLA 2HWAA 2DVDA 2F2FA 1BLDA 3NV1A 1S0DA 3AXEA 1DBNA 2P3KA 4EFRA 1T3AA 3AXDA 2DTYA 3M3EA 1PZ7A 2UWAA 3WDVA 5IK8A 2Y9WC 1ZB7A 2EXIA 3FIEA 3WG2A 1VAVA 1H9PA 3CA5A 3VV1A 4GKYA 1S0BA 4Y22A 3RTIB 1JY0A 3FBYA 1LU2A 1CONA 4Q8LA 3MW3A 3BODA 4H55A 1LOFC 3A0NA 1V00A 3QCWA 2GNMA 4BLIA 2A70A 2DUPA 2A71A 2PHWA 1DQ4A 4KEJA 2ZGKA 5D63A 2F2FC 2D6MA 4KTXA 1BFFA 3DDBA 4FPCA 3FJJA 3ILFA 4YM3A 2D6NA 1JQZA 4CTEA 1SCRA 1YIFA 4P0JA 4KUFA 2D44A 2UUSA 5GLUA 3RS6A 3CAHA 3USUB 3BRGC 3IIRA 1V6IA 3LCPA 1LHOA 6I1BA 3C8BA 5DXDA 1TOOA 21BIA 4XTMA 3P53A 1WBAA 1IOBA 5JOYA 2NN8A 1SFYA 4G6MA 4FP3A 5HCBA 1FWVA 1FMZA 3FJIA 3FGMA 4XHBA 4P0KA 3A23A 4IQPA 1V6KA 5F8WA 1S0JA 2RSTA 4OWKA 3AYCA 3BAVA 4ITCA 5T5JA 31BIA 3FJAA 1B09A 4PF5A 1N1VA 1WBCA 5FZZA 1W3FA 2B7YA 5GZCA 2BEBA 5BXPA 3PJQA 4FOVA 2JECA 1XTGA 1CJPA 5E8AA 3BB2A 1KDKA 3O0XA 2GNDA 3AJ6A 1BJQA 2JJ6A 4G9MA 2JDZA 4K21A 4JKXB 3F1RA 1OKQA 1L2HA 2D3RA 1U0AA 1IILA 2ZMLA 3AYDA 3ASIA 4LBQA 5GALA 4ZJXA 4TYSA 3Q9OA 1S0IA 3FUOA 3T1MA 3SNVA 2GMEA 3AP4A 2KH2A 2MC2A 3M1HA 4J1LA 3PVEA 3JUTA 3WNXA 4Q1RA 4Q1PA 3H6QA 1RINA 1HIBA 4EJ5A 2XHLB 3JU9A 4XJZA 1RZOB 1IRAX 3O49A 2VXTI 5BXRA 1X50A 1DZQA 4UW3A 1WBLA 1IS4A 3VKFC 4I4VA 3UJ0A 2QN0A 4QD2C 1AJKA 2ZAAA 4PBPA 4GOYA 2H0BA 5DUYA 1DHKB 4G1RA 3P6IA 1DQ1A 3N7KA 1QOOA 2LIQA 3PUBA 1Z7HA 2Q5TA 4BQ1A 3GALA 4FPHA 1SLLA 3OYWA 2ERMA 4AYUA 2W52A 4XJ8A 4P9WA 2K8RA 4R9AA 2Y9XE 3ZC9A 2ISGA 2A3WA 4QBVA 1G9BA 3FJKA 2R16A 3A07A 4A7YA 1F5FA 4G6JA 1E1HA 1MS3A 2G7PA 2A5ZA 3NBNA 3SITA 1IHKA 1C1LA 1IT0A 1BASA 5D61A 4M00A 4IZXA 1TIEA 1AXYA 3RMYA 3RG0A 4EFPA 2HYKA 3VKLA 3M3QA 3V65A 1G9AA 2VSAA 1UAIA 1XHBA 4YW4A 3ZURA 1QKQA 4YGDA 1ZM1A 4FPKA 5DG1A 3ZSJA 4KC3A 3DEBA 3O4DA 2WJSA 2QYIB 1S1AA 2AYHA 4I4XA 1QF3A 3SISA 1O4ZA 3BA7A 3BA5A 1LOAA 4WVVA 3PVNA 2E51A 4ZFUB 4YW5A 5DUWA 7I1BA 4NOTA 2ZGOA 3MPPG 3DGTA 1EPWA 4XIOA 5FNWA 3IM0A 2WSUA 3N35A 3OY8A 1MS4A 4ZFWB 1GZWB 1JHNA 5H9PA 2D22A 2P34A 3UD9A 5GZEA 3CA4A 4YFZA 2ZGLA 1MZ5A 5EWSA 5JLVA 1N3PA 1EV2A 2OVUA 3WO2A 1V6JA 2HZ9A 4ENDA 1KNMA 1AX0A 4HEVA 1OQ1A 1LCLA 5G00A 1LULA 2D6LX 3KMVA 3QW7A 1SBFA 2ZGUA 1Q8VA 3C9ZA 3CA6A 4MYEA 3PVOA 1JLYA 2CL2A 4XKIA 3ZYPA 1FN0A 2WSVA 1MACA 1BZWA 3QIYA 4Y20A 3WG3A 5GLTA 3VSZA 4Q2FA 4YM2A 4Y1YA 3ZSKA 4GALA 2R9KB 1QXMA 1VCLA 2GNTA 1IRPA 3UD8A 3WUCA 1W6OB 1DIWA 3WDUA 3B9CA 2I1BA 1HKDA 1PUMB 4YM0A 2HW9A 3BOPA 2NMOA 1F82A 2EAKA 1SZ6B 4LO1A 4QO3A 5EC5A 5EYYA 3UK9A 4QBCA 1ZL6A 3ZXKA 2VW1A 3U4XA 1TTUA 3FJBA 4DRVA 3IM7A 1C4RA 1LESA 4BMEA 3K1XA 2W39A 4P14A 4DPNA 1NXD1 3A21A 4PCRA 2AXMA 3C88A 2G7NA 5HCAA 3D7WB 3TAYA 5KXBA 1RIRA 2OUHA 4XJ9A 1IKQA 1GICA 3FJ8A 3ZXDA 1G8WA 1V6UA 2M49A 3WVJA 2W2DB 4OUJA 3DUIA 4FOQA 4I4RA 1LHUA 2CY6A 4LBNA 1ABRB 1D0HA 3OBTA 4J2YA 3ZUSA 5HPZA 5BOWA 1WW6A 2P3JA 3FJHA 4YG3A 4TZDA 1G82A 4M3CB 1G7YA 3M2MA 1AFCA 5IUQA 4CJMA 4XHXA 1RG8A 4ASMB 4LBOA 2AFGA 2AENA 4ATFA 1TWEA 4X37A 1HKNA 2WT2A 1SCSA 1W3GA 3FLTA 1AVUA 3BONA 3OJMA 2XOAA 3Q7XA 1W3AA 4Z9WB 2ZABA 2IMCA 1URXA 4HA2A 2DRYA 1C1FA 4FPOB 3VT2A 3WG4A 3V79C 3FFZA 1C57A 2JD4A 1JT3A 2FMDA 2AUYA 5IK4A 2DVAA 1QGLA 1NZKA 1Q8OA 3AZZA 1II4A 3NF3A 4NO4A 3ZVXA 4IY9A 1DQGA 2XB6C 1JT7A 3VSFA 1AZDA 2NYYA 1OFSA 2DVBA 2VH9A 1BARA 1PUUB 3AJ5A 4M3CE 3KQRA 3R4SA 3USUA 2ZACA 4DS0A 2OUJA 1DZCA 3O4BA 3LTQA 5JDBA 3ENRA 2P39A 4GWNA 5CAZA 3N36A 2BQPA 1APNA 2NTDA 2FPQA 2ILPA 1MS0A 4QC4A 1IJTA 1O4YA 2GNBA 3O4CA 3IN9A 4XJAA 4YZ2A 5B2HA 1GSLA 3UJQA 4GP0A 4GOVA 3BIWE 1AXMA 1Z2VA 4Q26A 2PHTA 2ZA9A 1CESA 4LO0A 4YLZA 3ZSLA 5H9QA 4FPYA 2A6YA 3OGFA 1YO8A 4KEIA 1CPNA 4ZLBB 2ZMNA 4Y1VA 3HOMA 1W6PB 2UWBA 2Y9FA 1CQ9A 3FJCA 3CRHA 1AVBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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