3V0BB

3.9 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/A
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0bB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0bB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0bB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0bB01
4ZBVB 1I1BA 3W59A 1LHWA 3O4BA 1DQOA 4I3NA 2P3IA 3ENRA 1LGCA 1MS4A 5KXCA 1LTEA 3AZVA 2C9AA 1VCLA 2D23A 4I8MA 2ZGLA 2RG9B 3ZSJA 3ZXEA 1AXMA 1GZ9A 1U0AA 3NV2A 3O4DA 4I4VA 1S0DA 2G4IA 2E7QA 1AJOA 8I1BA 4HEVA 3NBNA 4ZLBB 4CZSA 1PWAA 2EXKA 4XBNA 1LOEA 4FP3A 3FJJA 1ISYA 3AZWA 1TIEA 2WT0A 2ARXA 4LBMA 4IZEA 2UUSA 2PHRA 4H9WA 2ARBA 1V6JA 3ZC8A 4YZ4A 1Q1UA 4XYXA 5F8WA 4XMAA 3I29B 1RG8A 2D6NA 4Q1PA 3Q7YA 3AYCA 3WDXA 3AJ5A 2DREA 4ZFUB 4DPNA 4KEJA 3A07A 2I2SA 1SBDA 4I4YA 5GZEA 4I4OA 3AZXA 3RMXA 2W68A 3MEPA 3FJAA 4BOWA 2V73A 4TZDA 2JKBA 2CTVA 2JDZA 1QU0A 2ZMNA 2AGSA 4IONA 2ZGSA 4D8HA 4LO2A 1QMJA 1QQLA 5H9SA 5HCFA 4Y1YA 4P0JA 1RMLA 4DCKC 4GALA 2GO2A 1BKZA 3RG0A 4YW1A 4YZ5A 1T9FA 4AVSA 2ZHMA 1MVEA 3AYAA 1LOFA 1L2HA 2GNDA 2A3XA 2ZBJA 3IM7A 1V6IA 3AYDA 2A71A 1LU2A 1A8DA 2OW4A 5H9RA 3R05A 3WO3A 1JOJA 5FNXA 2EXJA 3OBTA 5HCBA 4IY8A 4ELCA 1FX5A 3IIRA 1Q8SA 2XHLA 4EFQA 2KKIA 1PC8B 1Q56A 3Q7WA 5L73A 3SH5A 3T2TA 3A21A 2WLQA 4GA9A 1BYHA 1E1HA 2CNAA 4UW6A 1S0LA 1Z78A 1N1SA 4YG3A 3NF3A 4YGCA 2GALA 1IS3A 3BAQA 3FJDA 3BTAA 3ZSLA 2JJ6A 1PZ8A 3BB2A 5GM0A 3V65A 3NWKA 1DGLA 4BLJA 5T50A 4OWLA 4KS6A 2P3KA 3IM5A 3WV6A 5GLZA 4Y1UA 3HR9A 4I0YA 4UW4A 1AXKA 2ZHLA 4ISQA 4DS0A 4KBBA 1AVAC 4J1LA 3O4CA 2XG3A 1LHVA 4AVVA 5F8SA 3E8LC 4AN7B 2AQZA 2VW0A 3WG4A 3LSEA 1LOAA 4XTMA 3KM5A 5GALA 4FPCA 2DRYA 3QIYA 2DVBA 5BP5A 1YYNA 4P9YA 5FZYA 3FJ8A 2DV9A 3FBYA 2NMOA 1SLLA 3VKLA 1NUNA 3PUBA 1FNYA 2NP0A 5DSSB 1ONKB 1ULEA 4WVVA 2Q9XA 2A6ZA 2A7AA 1KDMA 1HKDA 4LBJA 4XMIA 4YZ1A 3O3QA 1DZDA 3MW3A 3PMEA 1DQGA 3CA6A 1HWPB 4DQAA 4J2SA 3BOPA 1MS0A 2A8AA 1Y7BA 2C5DA 2D44A 3D4KA 3FJHA 2D43A 4LBNA 1EPWA 1CR7A 1GZCA 3ZURA 3I8TA 1FGAA 4L8QA 1SCSA 1HWMB 5EG6C 4OEFA 4PBPA 2E4MA 2BEBA 1O4ZA 3WZ1A 4JKQA 2R1BA 1WBFA 2WT1A 5DG2A 5E89A 3O0XA 2Z48A 21BIA 4GXLA 3SITA 4XIKA 3VT2A 3FFZA 4DENA 1ISZA 1QDOA 2WBCA 2GN3A 1ZKWA 2D7IA 1LOCA 2CWMA 2MLLB 2ZAAA 4A7KA 1V00A 4AN6A 2R16A 4P9WA 4DFSA 2ZMKA 1DZCA 5B2HA 1G8WA 3NV4A 3VUOA 1MS5A 1FYUA 3DUIA 4HJJA 2AYHA 4YM3A 4LO8B 5DUVA 3VT0A 4XHXA 2A5ZA 4LBQA 1Q04A 5BQUC 3FJIA 3BONA 5DUWA 4WZFA 1GZWA 3MPPG 3WHUA 3ZXLA 1DQ2A 3B9UA 1S0BA 4ASMB 1JW6A 3BODA 1CN1A 4LO7B 3NV3A 1Q8QA 5I1BA 3WDYA 1JLXA 3CU1B 4XTPA 1DQ1A 2IMAA 4GAFA 1WLWA 3T8SA 4BMEA 4I96A 4XJZA 2ISHA 3S8JA 1TTUA 1ENSA 4TYSA 3KQRA 3AP6A 4YGEA 4Y22A 5SV8A 5F5QA 2L5XA 2DS0A 4GKXA 3O5WB 1JN2P 1KQRA 1LJ7A 3MW4A 4Q2FA 2DUOA 3V0BB 2ZGNA 3CA4A 1KITA 4XBQA 2DTYA 3CAHA 4AYUA 3I4IA 4JKXB 1BFGA 1JQZA 2ZKNA 1CVNA 5F8YA 1FWUA 1H30A 4D69A 1OKQA 3OGFA 3UJOA 3BAGA 5JLVA 4EKXB 4JC1A 4KTXA 4EFPA 2FGFA 3UL2A 5E8AA 3VKNA 1XG6A 4FPGA 3HMYA 1KNMA 3SISA 3SNMA 2ZQOA 3PVOA 4Y20B 4Q8KA 3H6RB 5DZGA 3B9CA 5HPZA 2FDBM 2GNMA 2HYKA 1K5UA 1S0GA 4AGRA 4WBCA 2R9KB 2DWRA 5DG1A 4GWNA 1IKQA 2OUHA 4I30A 1WBCA 1X50A 5GZDA 1FV3A 1OQLB 2TEPA 3UD8A 3UD9A 3AK0A 1V6LA 3FUQA 2ISGA 1Q8OA 4LBQD 4OEGA 2EIGA 4KUFA 5BXSA 2D20A 3K1XA 4J2YA 4BM8A 4ZXKA 4QBVA 4FPOB 5GZFA 3DDAA 2YV8A 1BXHA 2A3YA 3AYEA 1V6NA 2YZ4A 5T52A 1RZOB 2ZGMA 1IS5A 3WNXA 4Z9WB 4FPFA 5IUQA 1W0OA 4I4SA 2E6VA 1M16A 3WG1A 3P6JA 1YXWA 3WDVA 3UK9A 1T4QA 3TAYA 3ZXGA 5EWSA 1I1EA 4EJ5A 1VAVA 1XTFA 4Z8BA 5D62A 1C4RA 4M3CB 2KI4A 2G7NA 4CRQA 3QR5A 5D63A 1UZYA 2EXIA 2ERMA 5BOWA 2DURA 1A78A 1HQLA 2ZZJA 3FLRA 4EB2B 1FAYA 4FPJA 1AJKA 4P14A 3WDWA 4LBLA 4JRAA 2EALA 1V6OA 1BLAA 1JHNA 1D0HA 3WINC 3H0OA 1MS1A 2AREA 1SLAA 4YM0A 1SR4C 1F82A 1N3OA 4USPA 3HBWA 3VSFA 4JQ0A 2D22A 2AFGA 3BRFA 3BAHA 1UX6A 4OEEA 2ZGPA 5GAQA 1R8NA 1BQPA 4U36A 2AH2A 4Q8LA 2W2DA 4X37A 4IQPA 1JY0A 1FNZA 3ZC9A 1T3CA 5IK7A 1LOGA 3W9TA 4LBKA 3C2UA 5EXOA 1LU1A 1QOSA 4G9MA 1G7YA 4X3AA 1LGBA 1LHUA 5LK5A 3HALA 3EF2A 2DTWA 3N7KA 4WV8A 2ETFA 5FZUA 4FPYA 4XJ9A 3QIZA 3Q9OA 2HW9A 1BJQA 4I1EA 1MZ6A 1W6OB 3N7JA 2CYFA 2EF6A 3M1HA 1SLCA 3MALA 2YUGA 1HKNA 2Q3NB 1AX1A 2FPQA 4YGDA 3A23A 2EAKA 2ZGUA 2K4AB 5EC5A 3POKA 2ISEA 1W3FA 1H9WA 1LODA 1F31A 1BFBA 2ZGOA 1MVQA 5BQUA 1YO8A 4KEIA 3R4SA 1YTOA 1LESA 1C1FA 3VKFC 1KJLA 2XOAA 1N4KA 1G9BA 1S0IA 1SBEA 1W6QB 5CBLA 3OPZA 1GYKA 2F2FC 4Y1ZA 1HCEA 5KXEA 1MD6A 4TLPA 2ES3A 3CA0A 2I1BA 2D6PA 3AH4A 2ZQNA 3ZXJA 3C8AA 3TC2A 1IOBA 4A7ZA 2BFHA 2IMCA 4I37A 3ZVXA 3AXDA 1Q8VA 2IHOA 3N35A 5FNWA 2QN4A 1AX2A 1IS6A 1Q8PA 1N3PA 1AF9A 1YVGA 1JBCA 1QOTA 3CRHA 1Z7HA 3M3CA 3QLQA 4W65A 2IWTB 3P6IA 4QD2B 3OY8B 1YIFA 4Y1XA 2IMBA 1LCLA 5T55A 5BXPA 4UW3A 1ULGA 2A75A 3FJCA 1LGNA 1S1AA 2GDFA 3ASIA 5T5PA 4LO7C 1V6UA 2WNEA 3I2AA 2D7FA 41BIA 3USUB 4ZGRB 3CRIA 1WUVA 2OUJA 4FOQA 1AZDA 3O4OA 4XIOA 4FPLA 2DVDA 5GLTA 5F90A 4FPEA 3BAUA 1BASA 3SLIA 2Y9GA 2D3SA 1S0FA 4XJAA 3V0AB 1PZ7A 2DVAA 2VXTI 1LECA 5IK5A 1LHOA 1ULFA 3LCPA 1G9AA 4M01A 2FFUA 4GP0A 2YMZA 1ZB7A 2JE7A 3BAVA 2Q5TA 3BAOA 5T54A 3LSDA 1Z2VA 3AKIA 2CL2A 3UD7A 4QO3A 2VY0A 4XXAA 1R8OA 1YF8B 4J2KA 3CA5A 4JP0A 3A0KA 1IHKA 4QKSA 2D6KA 2FHRA 4OWJA 4L4HA 3O0WA 2FO1A 3IMNA 2WSVA 4OUJA 2KH2A 1EYLA 3AZYA 1IT0A 2R49A 3AP7A 1JT4A 4IY9A 1HDKA 3F62B 2OVUA 1WLCA 5JOZA 2ZMLA 4YW4A 2P23A 1SACA 3B69A 1UZZA 2D24A 1M2TB 1CPNA 3AJ6A 3V64A 3VV1A 4X39A 3A22A 5AVAA 3WINA 1PUMB 3WDTA 1SR4A 3D7WB 4PCRA 3BRDA 2VH9A 3VWCA 3A4UA 3AJYA 1F5FA 1QXMA 1WW5A 3O12A 5DUXA 2ZGTA 3ZYRA 4Q9GA 2HWAA 4I4UA 4YZ2A 4EL4A 4GP3A 4ATEA 3KMVA 1W6MB 4JPZA 4XFSA 1XZZA 1QNWA 1ENRA 1G9DA 2AXMA 3WCRA 9ILBA 4Y1VA 5BXRA 1DIWA 1QKQA 1UKGA 5BQMB 2SLIA 2D1ZA 1ENQA 4H04A 4BQ1A 1HLCA 2K43A 3RTJB 3H6SE 3ATGA 5IK8A 2MC2A 3FJKA 2YROA 1QQKA 2AUYA 4M3CF 2PHTA 3OYWB 4QKRA 4YLZA 4BMBA 3FLTA 2UU8A 2VXRA 1VLNA 3CA1A 4J23B 3DEBA 3JUTA 1JT3A 2P37A 2VSEA 3ILAA 2ENRA 5DXDA 5H9QA 4JAWA 3LTQA 3FJ9A 1S0JA 4BLIA 1WW4A 3M3OA 2VW1A 5FRAA 1II4A 2GN7A 3POSA 1DLLA 1DQ6A 3AH2A 2DU0A 5DZFA 5BQNA 3M2MA 3A0NA 4M00A 4HA2A 4YM1A 4Q26A 4I4XA 2WQZC 5BYNA 3NJ5A 3VT1A 5GLVA 3RRDA 2P3JA 1DHKB 1WCSA 1TOOA 5H9PA 2F2FA 1O4YA 1V6WA 1W6PB 3FLPA 3QW6A 4XKIA 5DZEA 1IJTA 5EYXA 3IPVB 4AGVA 3GALA 2DU1A 1EVTA 2A6WA 3MW2A 4XJUA 2HWMA 1WW7A 1BFCA 2A3WA 4DRVA 2VUAA 4U2AA 2VW2A 3BX1C 1AXZA 2KI6B 4FPKA 3WOGA 4II0A 1LOBA 2ESUA 3C88A 2P39A 3FJFA 3T1MA 5DVHA 2E51A 1DJSB 2VSAA 1D2SA 2YY1A 2GMEA 1FQ9A 1IOAA 5JMCA 2W52A 1N3QA 2CY6A 1LHNA 2R0FA 3N0KA 3HOMA 3TB0A 1YRZA 1UN1A 3JU9A 1MC9A 4YFZA 3WVJA 3NBDA 3C89A 5E24E 1IS4A 3N36A 4Q1RA 3RQ0A 1SLTA 1GSLA 4K21A 4CTEA 3RSJA 5CB7A 1DFCA 1APNA 2D7RA 1JLYA 2ZGRA 1JT7A 1DZQA 1JUIA 1HCDA 1YI7A 3WDUA 2FFVA 3JRRA 4AWDA 4HANA 3IN9A 2DUQA 1TP0A 4I4RA 1MS9A 4Q91A 1HQWA 2PHWA 1AVBA 1UMZA 1N1TA 4QBCA 2UWBA 3OBRA 1DQ4A 1ITBA 3AP4A 1FN0A 2DVFA 3VKOA 4LO3C 1MS3A 3V0BA 1G9FA 2J3PA 3ZXFA 2G7PA 4QD2C 1XHBA 1W6NB 3GNEA 1GBGA 5CNAA 2ILPA 3ZSMA 1GLHA 4XFTA 2NVHA 4XILA 1JT5A 4DRRA 2FMDA 1S0EA 4P6AA 3ZSKA 3F1RA 2A70A 2V5YA 3IPVA 1ISWA 3UDAA 4QC4A 1ZL6A 3ILRA 4RA0A 4UW5A 1RITA 1AVUA 1J0SA 3B00A 1V6VA 1WBLA 4GAIA 4Y20A 3H6RA 1SBFA 1FWVA 4I7IA 1P63A 4XFUA 4XE9A 5BVPI 1W0PA 2XHLB 1MACA 4R9AA 1CPMA 4XDQA 4FOVA 1RIRA 3FUOA 1DYPA 5GZGA 3VKMA 5HCAA 5IK4A 1BLDA 4IHZA 2WSUA 4FP2A 1KRIA 2WKKA 3RS6A 1AFCA 1UPSA 2E53A 3QW7A 1CE7B 1QGLA 3HSMA 1AVXB 1VALA 5JOWA 2GNBA 1XTGA 3DSEA 4LO0C 4XJWA 3PJQA 4I1BA 1SLIA 3ZXDA 3O49A 1DBNA 4C1WA 5IT6A 1UL9A 5JDBA 4G6JA 4GOYA 2EXHA 3SH4A 1ISVA 4Q9PA 1OQ1A 3AZZA 3PVEA 1Q03A 2E7TA 1G9CA 1AXYA 1N1VA 3FGMA 4A7YA 1PZ9A 3O0VA 1SCRA 2CWSA 2Y9XE 1LENA 2Y9WC 4M3CA 1HWOB 4WVWA 4CJMA 2AR6A 3AFKA 1CJPA 4XJ8A 1I3HA 3QIXA 4R9CA 1IILA 3ZUQA 3DS9A 4ENDA 1MR5A 4XZPA 3AJZA 3WG2A 1XYFA 4P0LA 1W6NA 3N3HA 4FGFA 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