3VUOA

Crystal structure of nontoxic nonhemagglutinin subcomponent (ntnha) from clostridium botulinum serotype d strain 4947
Total Genus 330
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
330
sequence length
1196
structure length
1151
Chain Sequence
MDINDDLNINSPVDNKNVVIVRARKTNTFFKAFKVAPNIWVAPERYYGEPLDIAEEYKLDGGIYDSNFLSQDSERENFLQAIITLLKRINNTISGKQLLSLISTAIPFPYGYVGYRETNYIESQNNKNFYASNIVIFGPGSNIVENNVICYKKNDAENGMGTMAEILFQPLLTYKYNKFYIDPAMELTKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVVPYRLRTELDNKQFSQLNIIDLLISGGVDLEFINTNPYWFTNSYFSNSIKMFEKYKNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFQNSVQDIWNLNLNYFSKEFNSIIPDRFSNALKHFYRKQYYTMDYGDNYNINGFVNGQINTKLPLSDKNTNIISKPEKVVNLVNANNISLMKSNIYGDGLKGTTEDFYSTYKIPYNEESDNFPLNNISIEEVDSIPEIIDINPYKDNSDDLLFTQITSTTEEVITHTALPVNYLQAQIITNENFTLSSDFSKVVSSKDKSLVYSFLDNLMSYLETIKNDGPIDTDKKYYLWLKEVFKNYSFDINLTQEIDSSCGINEVVIWFGKALNILNTSNSFVEEYQNSGPISLISKKDNLSEPNIEIDDIPDSLLGLSFKDLNNKLYEIYSKNRVYFRKIYFNFLDQWWTEYYSQYFELICMAKQSILAQESVVKQIIQNKFTDLSKASIPPDTLKLIKETTEKTFIDLSNESQISMNRVDNFLNKASICVFVEDIYPKFISYMEKYINNINIKTREFIQRCTNINDNEKSILINSYTFKTIDFKFLNIQAIKNFFNSQVEQVMKEMLSPYQLLLFATRGPNSNIIEDISGKNTLIQYTESVELVYGVNGESLYLKSPNETVEFSNNFFTNGLTNNFTICFWLRFTGKDDDKTRLIGNKVNNCGWEIYFEDNGLVFEIIDSNGNQESVYLSNVINNNWYYISISVDRLKDQLLIFINDKNVANVSIEQILNIYSTNVISLVNKNNSIYVEELSVLDKPVASEEVIRNYFSYLDNSYIRDSSKSLLEYNKNYQLYNYVFPETSLYEVNDNNKSYLSLKNTDGINIPSVKFKLINIDESKGYVQKWDECIICVSDGTEKYLDISENNRIQLVSSKDNAKKITVNTDLFRPDCITFSYNDKYFSLSLRDGDYNWMICNNKVPKGAHLWILKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Small-angle X-ray scattering reveals structural dynamics of the botulinum neurotoxin associating protein, nontoxic nonhemagglutinin
pubmed doi rcsb
molecule keywords NTNHA
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 330
structure length 1151
sequence length 1196
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
A PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3vuoA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3vuoA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3vuoA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3vuoA01
1Q8OA 3N35A 4GALA 3VUOA 1C57A 3T1LA 4PQ9A 2JE9A 1V6XA 1K5UA 3R4SA 3ILFA 4JAWA 3M3EA 2P34A 2WLQA 4YZ3A 1GLHA 2LIEA 2A6YA 3N0KA 1SR4C 3Q7XA 3ZXLA 2D44A 3UJQA 3FIEA 4OEFA 1IKQA 1RG8A 3QW8A 3MW4A 3AJ5A 4J2SA 1G9DA 4FPEA 41BIA 1Z0HA 1SZ6B 2NP0A 1CJPA 4KTXA 5GZFA 3ZSJA 1QOTA 2M49A 3WNXA 1EYLA 3I2XA 4FPKA 3BA4A 1WD4A 2A6WA 3H6RB 3BAQA 5LK5A 4BM8A 3ZUSA 5GLZA 2XOAA 1ONAA 4XIKA 1JN2P 1G86A 3BX1C 4DS0A 4I8MA 1JYCA 2DWRA 4XILA 4FPCA 2ZHMA 1ILR1 2ZA9A 2ZHKA 1BFFA 4LO7C 1LEMA 3D4KA 1YO8A 5F8WA 2D6LX 4QC4A 3WVJA 2CWMA 1GZCA 1SACA 1AJKA 3EF2A 2Q3NB 4FP3A 2VUAA 3SNVA 2ZQNA 3ZXJA 1UPSA 1W6NA 2P39A 3A23A 1G82A 8I1BA 4YM1A 1DQ0A 3LTQA 1II4A 4YW3A 1NUNA 5JDBA 3B69A 3WG4A 2ILPA 4JC1A 1ZL6A 1BKZA 1JBCA 2X2TA 3BTAA 1DFQA 3PMEA 1FNZA 5EG6C 4WV8A 4YW2A 1JOJA 4TLPA 4YZ1A 4J2YA 1SBEA 1K5VA 1IJTA 1E1HA 1W6OA 2ERMA 1LU1A 1P63A 1QOSA 1LHUA 1Z78A 3KMVA 1W6PB 3AFKA 4LO7B 4XFSA 4XIOA 3E8LC 3H0OA 1V6KA 2PHFA 2A3YA 1JYIA 1FYUA 1SLIA 1S0IA 1B09A 1S0JA 3PVNA 3MALA 2Y9WC 4HL0A 1DQOA 1V6JA 4P0KA 1QKQA 1Q1UA 2D24A 1PZZA 1Z2VA 1W6QB 4Y20A 4YM3A 2IMAA 1QQKA 2FO1A 1MS5A 3OPZA 2ZGNA 3WO3A 1T3AA 2ZHLA 3W59A 1J1TA 3R4UA 2FHRA 4XOGA 3SH4A 3O49A 1TEIA 1D0HA 3IM5A 1SR4A 1XG6A 4YGDA 2ZAAA 3FUOA 5D62A 4IQPA 2J3PA 2MLLB 3PHZA 1S0EA 3OJMA 1W0PA 1IS4A 9ILBA 5KXEA 4XKIA 1FWVA 4LBJA 4LO1C 4XE9A 1LHVA 1MD6A 4YOLA 3JUTA 5BVPI 5D61A 3BB2A 3B00A 3WOGA 1OFSA 4DFSA 4OWKA 3ASIA 5CAZA 2P3JA 4KUFA 4W65A 4GOVA 3WG1A 1ZM1A 1GV9A 5GZCA 1WCSA 2DURA 4I37A 2EXIA 3QYDA 1G9AA 4SLIA 1AXZA 2A75A 3CQAA 4XBLA 5GLUA 2G4IA 1W3AA 2BEBA 1TOOA 1PZ9A 2GN7A 1IRPA 2GO2A 2KLLA 4U2AA 4PBOA 2NYYA 1N1TA 3P6IA 2GMEA 5BQMB 4HJJA 2DRYA 5H9RA 3BAHA 4YG3A 2AENA 1S0BA 2AXMA 1ISYA 4QKRA 2V5YA 3D6EA 1FNYA 3AP4A 5GLTA 1FWUA 4XZPA 4I3NA 1VAMA 1TFMB 2JECA 1M2TB 1MS8A 4EFPA 2DVFA 1VIWB 3OBRA 3FGMA 4BMBA 1F82A 1LODA 3BODA 2UUSA 2W39A 1WW6A 2VSEA 2RHPA 2I2SA 4U36A 2NTDA 1FMMS 3IAGC 1VAVA 2AFGA 3BOOA 3AYDA 4P9XA 3QLQA 2BFHA 1DZCA 3OJVA 2Z48A 2SBAA 5BXRA 1UX6A 4Q27A 3ILRA 1TWEA 3VSFA 2BQPA 2DVAA 3BAGA 3M1HA 1BFBA 3RTJB 2XHLA 1HCEA 4ZFUB 6I1BA 1WW5A 1MZ6A 4ZJXA 4Y1YA 3ZXGA 2ARBA 1LEDA 4I4VA 1SBFA 1JHNA 1SCSA 3OJ2A 2ZACA 3NBCA 5H9SA 3QIYA 4KEJA 1LOAA 3AKHA 4F34A 2X2SA 3CA0A 2W2DB 4Q2FA 1ITBA 5DUWA 1XQNA 2ETFA 2Z49A 2W52A 1YTOA 3ZUQA 1QOOA 2GNDA 3UL2A 4I4PA 3SLIA 4LBNA 1AXMA 1IS5A 2OUJA 3O5SA 1LGCA 3K1XA 3ZXEA 5BYNA 1JUIA 4ZLBB 4LO1A 3USUA 1BLAA 4ZXKA 3UDAA 1QU0A 2R0HA 3V64A 4FPYA 1DQ2A 1AX1A 4FP2A 1HWOB 3N7LA 3ILAA 3WUCA 2ZGQA 3PUBA 3BOKA 4QBCA 1YI7A 3O4CA 1H9WA 3UJ0A 3ZC8A 2ZGKA 3O4AA 2ZGTA 3N7JA 5GLVA 3QR5A 2HWMA 1DYKA 2H0BA 1GYKA 2D43A 2GNBA 3O3QA 1KJRA 4FPJA 3A21A 2LIQA 3AKGA 5GZDA 3BAOA 2QN4A 1LOBA 2WT0A 4LBQD 2JE7A 3AH2A 1ENRA 4I4OA 2E4MA 1A78A 5FZUA 1IILA 4CJMA 1YYNA 2AAIB 3VKNA 1FX5A 4F83A 1V6OA 1XTFA 5DZEA 1T3CA 2VXRA 4JCKA 1V6LA 1SLBA 2MIBA 3S8JA 2F2FA 4NO4A 1LHOA 1MC9A 1XZZA 3AYAA 1UN1A 1GGPB 1LGBA 4YW5A 4Q8LA 2EIGA 3BA7A 1MS1A 3V0AA 2WSUA 4X38A 1WLWA 1TWMA 3NJ5A 3BRDA 1N1SA 1SBDA 4I4RA 3TB0A 1RMLA 3OGGA 4AGGA 2ERFA 5DUYA 1JLYA 2LALA 3ZVXA 3NF3A 1KJLA 4YLZA 4IHZA 2GMMA 4X39A 1WUVA 3V79C 5EHAA 1Q56A 1LESA 2C9AA 2ZGUA 3OY8A 1WBCA 2A71A 4XFTA 1V6MA 3AH4A 3ILNA 5BQNA 1HWMB 2DREA 4LO3C 2F8XC 3HN1A 3AP6A 1RIRA 1DYPA 1BZWA 1G8WA 4YZ5A 2JJ6A 3HALA 3B01A 2D20A 1EPWA 5IK5A 4Y1VA 2ESUA 1LULA 1WW4A 4XDQA 3FIIA 1XTGA 4G9NA 4XMIA 3V65A 1LCLA 1V6NA 2XB6C 4BLIA 1W0OA 4OWLA 3N7KA 3FLPA 1HQLA 4ZOTA 2E7TA 3AJZA 1W6NB 2L5XA 5I1BA 3C89A 4EEEB 1N1VA 1DIWA 4LO0A 1W3FA 3WO4A 3WDWA 4UW6A 2UU8A 2JD4A 4IYBA 2ENRA 3GNEA 3M2MA 1Y7BA 4I6IA 1WLCA 1S0GA 4D0ZA 1BYHA 4XJ8A 1GANA 2PELA 5BXTA 3AP7A 1FATA 3BAUA 1IHKA 1AVUA 4P6AA 4EL4A 2AH2A 1BJQA 4IONA 1W6OB 1Z4SA 3CA3A 4ATEA 3QJ0A 1GICA 3NV2A 4L4HA 1OQLB 3BONA 3Q9OA 1LHWA 1VCLA 4FPLA 5E88A 2R1DA 5T5OA 3GALA 2DUPA 1NLSA 2EALA 2IMCA 4EFQA 1Q8SA 1A8DA 2VH9A 3U4XA 2W08A 1YXWA 2NMNA 3QIXA 2WQZC 5T54A 2KH2A 2WT2A 1QQLA 2AYHA 4Y20B 3ZXDA 2DS0A 3WMVA 1BQPA 5DZFA 1O4ZA 4Y26A 3C9ZA 2CL2A 2FMDA 4KC3A 3POYA 5BQUA 3BA5A 3T2TA 4G6MA 1N3OA 3WDTA 2DTWA 1AX0A 4R9DA 4GP0A 2ISEA 1KNMA 5DG2A 3VT0A 1UL9A 1OKQA 1W3GA 3C8AA 2Z42A 3OYWA 3AXDA 4CTEA 1MS3A 2ISHA 4I4SA 4J2XA 3A07A 5T50A 1ENSA 3DS9A 4ELCA 3WCRA 2P23A 4XFUA 2VXTI 1UAIA 3ZXKA 1E0OA 3D5OA 1XYFA 4EKXB 1IS6A 3RG0A 4LO3A 2K8RA 4DQAA 1JLXA 5GM0A 2DU0A 5E24E 3IM6A 2CY6A 3WDXA 2MC2A 2IHOA 4G9MA 1KDKA 4FOYA 3FJDA 2OW4A 1LOCA 2A7AA 4ZFWB 1LTEA 1VLNA 4GKYA 4Y1XA 4XJWA 5JVVA 4XMAA 1FQ9A 1Q8VA 1V6VA 3IMNA 4YFWA 4I4UA 1LOEA 4M01A 5EXOA 1JY0A 1C1LA 2D3RA 4HR6C 3HBWA 4C1XA 4AGRA 2CNAA 1TP0A 2AUYA 2D7FA 1UKGA 4IZEA 4Y1ZA 1LECA 4DPNA 3SITA 2ZABA 5EWSA 3I4IA 1R1ZA 4LBQA 2D1ZA 3ZSLA 3NV1A 4I4YA 1MS0A 3AJ6A 1ISVA 5L73A 2ZQOA 1Z7HA 3I2AA 4LBLA 2VU9A 4ZA3B 4FOVA 5GZEA 4AGVA 3WINC 1JT5A 1FV3A 2D7RA 2WNEA 3UJOA 3UD8A 1DQ6A 2ZGPA 2XHLB 3AP5A 1AVBA 4K21A 4IY9A 4K1ZA 4Q91A 1JTCA 2Y9XE 4GA9A 5E8AA 3WUDA 5F90A 1S0DA 4D0TA 2HZ9A 4YFZA 3WG2A 5JOYA 3DDAA 2RG9B 3POWA 2CWSA 4GAFA 3O4BA 4UW5A 1HIBA 4ZBVB 2E4MC 1WBLA 1H9PA 2WJSA 3FLTA 1ISXA 2ES3A 4D8HA 5DUUA 2DTYA 2Q9XA 4YGBA 4Z8BA 1GZWA 4BOWA 5T5JA 3VT1A 1QNWA 1Q03A 4FOWA 2F2FC 5IK7A 1AXYA 3JRRA 4GAIA 1SLCA 1QGLA 3USUB 4I96A 3AZWA 3AH1A 3UD7A 1AFCA 2GMPA 3B9UA 1AZDA 2AR6A 3MPPG 1DHKB 1ZKXA 4K20A 5DVHA 4WBCA 3P53A 4Q9GA 3DEBA 2A6VA 1I3HA 1DQGA 2ARXA 5DXDA 4PC4A 5G00A 2OVUA 1JT7A 3ZURA 2WT1A 4P9WA 4ITCA 1NXD1 2LTNA 2D22A 2FPQA 4XJAA 4FVVA 4FPHA 5KXDA 1HKNA 4GP3A 2R1BA 1PZ7A 3DGTA 1Q8PA 1LENA 4Q26A 2NM1A 4M3CA 2UURA 2FDBM 4QD2C 4JKXB 2XG3A 3NWKA 4C1WA 4JKQA 1DFCA 2WSVA 1FMZA 1C1FA 4HANA 1RY7A 3NBEA 4EB2B 4OZXA 3QW6A 5EYXA 4QBVA 3N36A 3IM7A 1IT0A 1N47A 2R16A 3BADA 1TTUA 5F8YA 2PHRA 4L4IA 4KS6A 4LO0C 4BQ1A 4DCKC 1UMZA 2WBCA 3V0AB 2R0FA 1H30A 3CA6A 4BMEA 1YF8B 3VV1A 4ZFYB 1M16A 2OUHA 3C88A 4RL7A 2P2KA 1ZKWA 4J1LA 2G7NA 2KI4A 4Q9PA 4FPGA 2GDFA 3WINA 1RINA 2A3XA 5DG1A 2YXSA 3OY8B 4LBKA 1PWAA 1ONKB 1XHBA 2ZGRA 2G7PA 1AX2A 2A97A 4FQ4A 3AZZA 2QYIB 5HCFA 3WA1A 3PVOA 1AVXB 3WHTA 2HW9A 3NV3A 1JT4A 1C4RA 1HDKA 2NVHA 3C2UA 4Q1PA 3FFZA 1LOFA 4QD2B 2G7QA 4XBNA 3MW2A 4YW4A 4II0A 1T9FA 4LO2A 4OEGA 5F8SA 4WVVA 1HWNB 2JDZA 2DVDA 2Y9FA 2D6KA 4BLJA 2UWBA 3HR9A 3A22A 2TEPA 3ZSKA 2D3SA 3IM0A 4FQZA 3RSJA 1QNYA 1QDOA 3PJQA 21BIA 1CE7B 4H9WA 5BXSA 4I30A 4XYXA 1Q8QA 5BQUC 1N3QA 2EAKA 4I4XA 1F5FA 3AZXA 5AVAA 2K43A 1CN1A 5CNAA 2ZZJA 4ISQA 4R6UB 1DZDA 1HKDA 3F62B 4GOYA 4USOA 4I0YA 2PHUA 1LOGA 3FJIA 1CR7A 5GJ6A 5CBLA 4ENDA 1I1BA 3RMXA 1OQ1A 3L2YA 4H04A 1BARA 1PZ8A 2FFUA 3SISA 3K3QB 4AN6A 5BP5A 2VW1A 3LSEA 4I2SA 3SH3A 1S0CA 4XJUA 1KDMA 3CU1B 1G9CA 5DSSB 4TYSA 5JMCA 4ATFA 3RQ0A 1JXNA 3O0WA 2DVGA 3I8TA 3D7WB 1MS9A 4FOQA 4J23B 4L8QA 1JT3A 1LJ7A 4OEEA 3PVEA 4ISRA 2YUGA 2P37A 1YBIA 1HLCA 1DQ5A 1W6MA 2YV8A 3IPVA 2P3KA 3WDYA 1SFYA 3N3HA 3UK9A 3TAYA 3WMUA 1HQWA 1F31A 3OGFA 3BOPA 2WKKA 4R9CA 3OJBA 3NV4A 5H9PA 3CA1A 3RTIB 2DVBA 3OYWB 3CAHA 2A3WA 2D23A 1IOAA 1FV2A 3WHUA 4QKSA 3CA5A 5FNXA 1AJOA 4OWJA 2A70A 3QW5A 5JLVA 1BFGA 4GWNA 4YW1A 2EXJA 3M3QA 4QALA 2RSTA 4XHBA 5F9TA 4P0JA 4M3CE 3ZX7A 3M3OA 5JOWA 2PHXA 2QN0A 3AJYA 1T4QA 4I7IA 3FJKA 1WD3A 3FJEA 4XTPA 1DJSB 2A5ZA 1CQ9A 4WZFA 1NZKA 1PUUB 3BIWE 4UW4A 4JRAA 3WZ1A 1U0AA 3LCPA 2ZGOA 3OBTA 3INAA 3O0XA 1N1YA 2GNMA 1V6WA 2EF6A 3NBNA 1LU2A 3A4UA 2SLIA 2W68A 2AGSA 4YM2A 2ZKNA 3FJJA 4Q8KA 4DEPA 4YG6A 1KITA 5IT6A 4Y22A 2ZMKA 2A6XA 2V73A 1G7YA 1ENQA 1SLTA 5IK8A 4XJZA 4ZKTB 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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