3VUOA

Crystal structure of nontoxic nonhemagglutinin subcomponent (ntnha) from clostridium botulinum serotype d strain 4947
Total Genus 330
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
330
sequence length
1196
structure length
1151
Chain Sequence
MDINDDLNINSPVDNKNVVIVRARKTNTFFKAFKVAPNIWVAPERYYGEPLDIAEEYKLDGGIYDSNFLSQDSERENFLQAIITLLKRINNTISGKQLLSLISTAIPFPYGYVGYRETNYIESQNNKNFYASNIVIFGPGSNIVENNVICYKKNDAENGMGTMAEILFQPLLTYKYNKFYIDPAMELTKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVVPYRLRTELDNKQFSQLNIIDLLISGGVDLEFINTNPYWFTNSYFSNSIKMFEKYKNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFQNSVQDIWNLNLNYFSKEFNSIIPDRFSNALKHFYRKQYYTMDYGDNYNINGFVNGQINTKLPLSDKNTNIISKPEKVVNLVNANNISLMKSNIYGDGLKGTTEDFYSTYKIPYNEESDNFPLNNISIEEVDSIPEIIDINPYKDNSDDLLFTQITSTTEEVITHTALPVNYLQAQIITNENFTLSSDFSKVVSSKDKSLVYSFLDNLMSYLETIKNDGPIDTDKKYYLWLKEVFKNYSFDINLTQEIDSSCGINEVVIWFGKALNILNTSNSFVEEYQNSGPISLISKKDNLSEPNIEIDDIPDSLLGLSFKDLNNKLYEIYSKNRVYFRKIYFNFLDQWWTEYYSQYFELICMAKQSILAQESVVKQIIQNKFTDLSKASIPPDTLKLIKETTEKTFIDLSNESQISMNRVDNFLNKASICVFVEDIYPKFISYMEKYINNINIKTREFIQRCTNINDNEKSILINSYTFKTIDFKFLNIQAIKNFFNSQVEQVMKEMLSPYQLLLFATRGPNSNIIEDISGKNTLIQYTESVELVYGVNGESLYLKSPNETVEFSNNFFTNGLTNNFTICFWLRFTGKDDDKTRLIGNKVNNCGWEIYFEDNGLVFEIIDSNGNQESVYLSNVINNNWYYISISVDRLKDQLLIFINDKNVANVSIEQILNIYSTNVISLVNKNNSIYVEELSVLDKPVASEEVIRNYFSYLDNSYIRDSSKSLLEYNKNYQLYNYVFPETSLYEVNDNNKSYLSLKNTDGINIPSVKFKLINIDESKGYVQKWDECIICVSDGTEKYLDISENNRIQLVSSKDNAKKITVNTDLFRPDCITFSYNDKYFSLSLRDGDYNWMICNNKVPKGAHLWILKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
publication title Small-angle X-ray scattering reveals structural dynamics of the botulinum neurotoxin associating protein, nontoxic nonhemagglutinin
pubmed doi rcsb
molecule keywords NTNHA
total genus 330
structure length 1151
sequence length 1196
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
A PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3vuoA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3vuoA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3vuoA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3vuoA01
1SZ6B 1IS6A 1WW6A 1FV2A 3AKHA 3UJOA 3VSZA 1MS0A 2X2SA 3ZVXA 4AGGA 3HBWA 1N3QA 3AJ6A 4K20A 3AJZA 1WBAA 1CVNA 2TEPA 3K1XA 2QN4A 2J3PA 1HKNA 4A7KA 3JU9A 1FV3A 4ZFYB 3USUB 3AYEA 3WDXA 1C4RA 2MLLB 4G1RA 3AZZA 2OUHA 1VAMA 2AUYA 1IRAX 2UWBA 4XXPA 4I4XA 3ZYRA 4Q91A 1G7YA 3IM0A 3V0AB 4KEKA 3ASIA 3I2XA 4XBQA 2ETFA 1ULDA 1Z78A 3T1LA 1FGAA 4Q1RA 4P9YA 2V5YA 2JKBA 4L4IA 4YOLA 4YZ1A 4YM1A 5T5LA 3B9CA 1DHKB 3PVEA 1K5UA 3QW6A 5HCAA 5JOZA 1LEDA 1NZKA 1LJ7A 3ZPYA 2DVAA 2ARXA 1W6OB 4GP3A 2WSUA 1DZDA 3AKGA 2C5DA 5CBLA 3C8AA 3OBTA 1DIWA 4R9BA 1ULGA 2D20A 1F31A 4L4HA 3WNXA 2DUQA 1EV2A 1BLAA 2A3WA 4DRRA 3FJIA 2ZHLA 1SLTA 1ZKXA 1JXNA 1IILA 3ZXFA 3BAHA 2NVHA 2FFVA 1IOBA 2V73A 5BVPI 4LBOA 1FN0A 1GV9A 4XTPA 4AN7B 4DCKC 4OEEA 5GLVA 2GN7A 1DFCA 3NBEA 1IS5A 5DZGA 1LOFC 1Q1UA 3I2AA 4FPHA 1DZCA 3VKNA 4YW5A 1JYCA 1YI7A 2PELA 3WV6A 2E53A 3AKFA 4USPA 1G9DA 2DRZA 4Z8BA 1G9FA 2BEBA 4BOWA 4Y1ZA 4YLZA 5LK5A 1BXHA 1W6MB 3BOOA 5GM0A 2FPQA 2WLQA 4LO3A 4YZ2A 1UN1A 3BB2A 8I1BA 2ZGSA 3VKLA 1YF8B 3FIEA 2AFGA 4ATEA 4IHZA 2KM2A 3IM7A 2NYYA 3LSEA 1MS3A 2Q9XA 3H6RA 5IK5A 2A75A 2GN3A 2PHUA 3MW3A 4FPEA 4XJWA 3ILNA 1GZCA 1G8WA 3NV4A 3RG0A 1ENRA 4DFSA 2OVUA 2GALA 3FJCA 3IM5A 3N0KA 2ERMA 1II4A 3QW7A 2GNDA 2VW1A 2Q5TA 2ZKNA 4TYSA 3E8LC 4A7ZA 4YGEA 2A6XA 5F8YA 3ZXGA 4D8HA 4FPYA 5JOWA 3ZUQA 4KTXA 1MZ5A 2D7IA 3FJKA 2WJSA 5GLTA 2ZHMA 2DTYA 3BA5A 2QN0A 3POKA 3O44A 4XHBA 1W6PA 4J23B 2JD4A 1YBIA 5FZZA 4USOA 3BONA 1Z0HA 3FLPA 1MR5A 1MS5A 4FP3A 4I4YA 3WG1A 1FMZA 1H30A 2D7RA 4M3CE 1MZ6A 3FUQA 4ZFUB 4JKXB 5FZYA 2GNBA 3O0WA 1M16A 4J2SA 3QJ0A 2PHFA 2E4MC 1V6IA 1Y7BA 2EXKA 5KXDA 4XXAA 1O4ZA 4BMEA 1ULCA 4YW2A 3WUDA 3A23A 1KRIA 3A22A 3VKFC 1DQ2A 5JLVA 4Y22A 4GP0A 1JT3A 2DVFA 1OKQA 5FZUA 1DFQA 3AZXA 4EFQA 1C1FA 1DJSB 3NBCA 3SH5A 3ZSKA 2ZGUA 3AH1A 3OGGA 1LU2A 5GLZA 4JKQA 3ZURA 1I1EA 3C2UA 3CRGA 4G9NA 5BP5C 1YO8A 1VALA 4RL7A 1SR4C 5EYYA 2P23A 4OWLA 1G9BA 1DQGA 1LGCA 1SACA 1BFBA 1QU0A 1UL9A 3D5OA 1PC8B 4J2KA 4G6MA 2LTNA 1N1YA 3OJ2A 4OZXA 1LCLA 4YG0A 2AGSA 3KMVA 1PZ7A 41BIA 2EAKA 3WDUA 4BPZA 1CJPA 3Q7XA 1QOTA 4PCRA 4XILA 1N1SA 3WCRA 2WQZC 5E88A 5H9RA 1AX2A 1ISWA 4JCKA 1Z2VA 3BRFA 1IRPA 4GKYA 4JRAA 4FOYA 5T50A 5DVHA 1ZKWA 4X39A 3RMYA 1AVAC 4ITCA 4I4SA 1MS8A 2DV9A 4Q26A 1H9WA 3A0KA 2WRYA 1GZWB 3O0VA 1MACA 1UPSA 3S8JA 1LOAA 4QC4A 2NMNA 2YV8A 3CU1B 1Q03A 2AENA 3OBRA 1JOJA 4XJ8A 2YY1A 1CONA 2D6KA 3H6RB 2P34A 3Q7YA 2ILPA 1MS9A 4I8MA 3AXEA 1AJKA 1JQZA 4LBKA 4WVVA 3WHTA 1MC9A 1Q8SA 4AVSA 2E7TA 4PC4A 4LO7B 1Q8PA 3M3QA 1TEIA 5BXPA 2AR6A 1LOFA 3BODA 4I0YA 1LODA 4PBPA 3PUBA 2G4IA 1J0SA 2D44A 1WD3A 1HWPB 1CE7B 3FJ9A 1PUMB 4UW5A 2EALA 4HANA 5GALA 1QNWA 1J1TA 3IPVA 4FPCA 3RMXA 4ISQA 2ZACA 2FFUA 1W0PA 4I4PA 1JW6A 3VEQA 3TB0A 2VU9A 1W6PB 4TZDA 3N7JA 1N1VA 2NZ9A 5GLUA 1I3HA 2A5ZA 2GMPA 2A71A 3POSA 2AXMA 3IMNA 1CN1A 2RSTA 1BA7A 4YM3A 1TWEA 2ISEA 2Z48A 3OPZA 4XYXA 3I8TA 4YFZA 2GO2A 4PF5A 2IWTB 1LULA 3BAVA 2EXJA 4R6UB 4DS0A 3CRHA 3WG4A 4QO3A 4ZXKA 2AQZA 1SFYA 1B09A 1WLWA 2FO1A 1KJLA 2OW4A 4AWDA 1L2HA 4KBBA 3FJDA 4ZGRB 2EXHA 4GOYA 1T3CA 31BIA 4Y22B 2KKIA 3APBA 1LHUA 3AYAA 1BLDA 1D2SA 1YIFA 3ZXEA 4YM2A 4YG3A 1XG6A 2D24A 4FPOB 5EG6C 4QBCA 4XKIA 3A0NA 3VT0A 3I29B 5E89A 1IJTA 1I1BA 3HSMA 4Z8SB 3WO4A 2K43A 2ZGTA 4GAIA 3OY8A 2P2KA 5FNXA 1Q8OA 1QF3A 3FJHA 1LENA 3P6JA 3D6EA 2P3JA 4U2AA 1BYHA 3O0XA 2LALA 2JE9A 4I7IA 2PHWA 3AX4A 3BOPA 3OJBA 1LHNA 3RTIB 2NMOA 5FREA 4OWJA 2P3IA 1IS3A 2E4MA 1QGLA 1W6NA 2DUOA 3IM6A 2C9AA 4QKRA 4ZFWB 5F5QA 2A97A 1V6OA 4QALA 2G7KA 1NUNA 2ERFA 1IS4A 3AK0A 4I30A 3D3XA 4L8QA 3W9TA 5BQUA 4YW3A 1HCEA 5T5JA 4FOVA 2D1ZA 3A4UA 2GMEA 4XFUA 3OGFA 5BP5A 2JDZA 1APNA 1SR4A 4IONA 2XOAA 5CA6A 5CAZA 2D7FA 1V6NA 1BARA 3LSDA 4JP0A 1KDMA 3BAOA 3FJEA 3H6SE 3NBNA 7I1BA 4FP2A 1XHBA 3DSEA 1HKDA 1S1AA 1GYKA 4LO0C 2HYKA 2YZ4A 4Z9WB 3ZSLA 2AAIB 1JLXA 1ENQA 4YFWA 3UD7A 2E51A 4BM8A 4FPLA 4Q9GA 4GALA 4XFTA 21BIA 1NXD1 1A3KA 4X3AA 1BQPA 2KH2A 5T52A 1IKQA 4IYBA 2ZHNA 5GLWA 2DUPA 4CZSA 2K8RA 1DYKA 5D62A 1HQWA 1W6QA 1S0DA 3INAA 3NV1A 4YGCA 3BRDA 2CWMA 4GWNA 5BQNA 4H9WA 1K5VA 2ZMLA 4II0A 4P0KA 4EJ5A 1TP0A 4AGVA 1M2TB 4LO1C 4HR6C 4M00A 5KXEA 3OYWA 2A3YA 5IK8A 5GZEA 2MC2A 3DDBA 4XJZA 5BOWA 4KEJA 2ZBJA 3KQRA 3BRGC 2PHRA 2VLCA 1SLBA 3O4AA 1QDOA 1UX6A 3MW2A 4I1EA 1ULEA 2WT1A 3UK9A 5I1BA 3WCSA 3B3QE 3NV2A 4X38A 3ILAA 4TLPA 4MYEA 1XZZA 2VXTI 4Y26A 5HCBA 1LHVA 2KI6B 1F5FA 3CA3A 2VY0A 4Q1PA 3FUOA 3RQ0A 2W08A 3UJ4A 2D3RA 3T1MA 3DS9A 2ES3A 2D22A 3BAUA 1ISZA 3ZYPA 3JUTA 4EFPA 4A7YA 3N7MA 3H6QA 3TAYA 4YGBA 3O5WB 4YG6A 4I4VA 1AFCA 3BAGA 3S8KA 2XHLA 3WLUA 4LBQB 1ITBA 3DUIA 1A78A 3OY8B 4XDQA 5F9TA 3V64A 2CNAA 1V6VA 4GA9A 4Q8LA 3QR5A 5H9SA 1UAIA 2JECA 3CAHA 4R9DA 1Z4SA 1YYNA 5H9PA 3RTJB 1XQNA 4KEIA 5DG1A 4WBCA 2ZQOA 3C8BA 5B2HA 4LBLA 5D63A 1VIWB 2A6VA 1W6NB 2UWAA 2R16A 3UD9A 1IKPA 1HCDA 3O4BA 3N7KA 4W65A 2ZGMA 2LIQA 3P6IA 3B69A 2D6PA 1E1HA 1U0AA 3AP5A 3RSJA 1QXMA 3CNAA 2VW0A 2AH2A 1WBLA 2ARBA 4HL0A 4FOWA 1PWAA 5GZFA 1RY7A 3V79C 2ZZJA 1PUUB 2IMAA 4ZJXA 2VH9A 2YUGA 2LIEA 2WT2A 1CPMA 4NO4A 3EF2A 5DUXA 2Y9XE 2YXSA 2G7NA 1N1TA 5E24E 5IT6A 4QD2B 1WW7A 1ABRB 1DQ1A 1MS1A 3MALA 2D6LX 1GKBA 4OEGA 2GNMA 1V6WA 3ZSJA 3BTAA 1WUVA 4YZ5A 3AP7A 3WINC 1V6UA 4ZLBB 3M2MA 1GICA 1ZL5A 2Q3NB 3MW4A 2A6YA 1YXWA 3SH4A 1OFSA 4D69A 3MEPA 1LOCA 1T3AA 1ULFA 3WVJA 3U4XA 1WCSA 1AJOA 2WSVA 2VW2A 4FPFA 3AJ5A 1QMJA 1GSLA 2WBCA 1FATA 1SLLA 1W6QB 5IK7A 5FRAA 1BFFA 3ZUSA 1N3PA 1HDKA 2SBAA 4XZPA 4FPKA 5F8WA 4IZEA 3R4SA 3BWIA 3OYWB 1UZZA 1CIWA 3SLIA 1XYFA 2K4AB 4UW6A 4ASMB 3WDYA 2FDBM 1DZQA 3UJQA 3AP6A 5DUYA 4YGDA 4LO0A 4XJUA 2HWMA 4AVVA 3ILFA 4K1ZA 1ZA4A 3VSFA 2ZGPA 3CA0A 2UUSA 3IIRA 1DQ6A 5L73A 4I4UA 4P6AA 2NM1A 1D0HA 1AXMA 2ZQNA 3B9UA 3AJYA 2G7PA 5GJ6A 2RHPA 3ATGA 1TFMB 4C1XA 4K21A 4XMIA 4FQ4A 5DZFA 1S0FA 1R8NA 5GZGA 1LGBA 5D61A 5DXDA 4AGRA 2XB6C 2D23A 2XHLB 1T9FA 1XTFA 4J2XA 4LO1A 1PZ8A 4R9AA 1KITA 4LO2C 1FNYA 3WDVA 4Y1VA 3A21A 3N3HA 3ZC8A 2E6VA 2DVBA 1CR7A 2Y9WC 1PZ9A 3FLRA 2A6WA 3LLPA 1LOGA 5T5PA 1Q04A 3AYCA 4BMBA 1YVGA 3V0BA 4DRVA 2I1BA 3O5SA 1JY0A 4JQ0A 2RG9B 4I2SA 3C88A 2VSEA 2DU1A 1DQ4A 1G82A 4H04A 5EC5A 1FQ9A 4I3NA 5IK4A 1W0OA 1WD4A 1UMZA 2DVDA 1R8OA 3VT2A 1VAVA 1HQLA 1W3AA 1QOOA 4EKXB 1CESA 1AVXB 5EWSA 5JVVA 5JOYA 1QDCA 3GNEA 4GWMA 4HEVA 3AYDA 3TC2A 2DREA 2CL2A 2ZA9A 3O49A 4EB2B 4JAWA 5F90A 3AH4A 1Q56A 2IMBA 1SLAA 4LBQD 3UD8A 1QKQA 2FHRA 1DYPA 3HR9A 1SLIA 3PVNA 2W68A 2ET2A 3CQAA 4M3CA 5GAQA 3O4OA 4XHXA 3H0OA 1FWUA 3UL2A 4D0TA 2P3KA 2ZGRA 2ZGKA 3O4DA 1LEMA 3AXDA 5GZCA 3T8SA 5SV8A 1TOOA 3QCWA 1RITA 4QBVA 4EEEB 1CQ9A 3LCPA 4DQAA 3UJ0A 3QYDA 1MD6A 3F62B 3ILRA 5BXSA 2A3XA 2ZGQA 1Z7HA 2A8AA 4EL4A 5T5OA 3FBYA 1A8DA 4XMAA 1H9PA 5AVAA 1G9CA 4FPJA 1W6MA 1ZB7A 2A6ZA 1S0CA 4XTMA 4ISRA 5DSSB 2NN8A 3B01A 1RMLA 5IUQA 2R0FA 2D3SA 1HWMB 4I1BA 2UU8A 1CVSA 4G6JA 4SLIA 3BOKA 1WBCA 1BZWA 4HJJA 1BJQA 1V6XA 1BASA 1WBFA 3WINA 3IKWA 1G9AA 1GBGA 2MIBA 3W58A 4F34A 5EYXA 2ZMKA 2D6NA 1T4QA 1GZ9A 3AP4A 4C1WA 1AX0A 1X50A 3BIWE 4I96A 2H0BA 1O4YA 2DU0A 4M3CF 3HALA 1LHOA 3KM5A 2D3PA 1JLYA 3ZXDA 1JHNA 1JT4A 1TTUA 2EXIA 4BLIA 4XBLA 4ELCA 3D4KA 3FJJA 4GKXA 4I6IA 1QQLA 3ZSMA 4CJMA 2YMZA 4P9XA 4RA0A 2DWRA 3I4IA 2YROA 3NF3A 4YM0A 2PHTA 2D6MA 2VSAA 3OJVA 3O3QA 2UURA 4P0JA 2VXRA 4F83A 2D6OX 3QLQA 1AF9A 1DLLA 1V00A 4I4RA 3QIZA 3AH2A 4PQ9A 2RQ9A 2F2FC 1XTGA 1RINA 1S0LA 3OJMA 3V0BB 1C1LA 1OQLB 1W3GA 5BXTA 5DUUA 1ZL6A 4YW1A 3B00A 4X37A 1SLCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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