3BTA | Genus

Total Genus 336

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	336
sequence length	1295
structure length	1277
Chain Sequence	PFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNVGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHELIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNRKTYLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Toxin
molecule keywords	PROTEIN (BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE A)
publication title	Crystal structure of botulinum neurotoxin type A and implications for toxicity. pubmed doi rcsb
total genus	336
structure length	1277
sequence length	1295
ec nomenclature	ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date	1998-08-12

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1120.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain	Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain	3btaA02
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	3btaA03
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	3btaA04
3.90.1240.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Zincin-like	Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like	3btaA01

2A6ZA 4QD2C 2WSUA 1BKZA 1ENSA 1HDKA 5HCFA 5DG1A 4I30A 1UX6A 3HN1A 4XMIA 4QKSA 3N3HA 1ONKB 2A70A 1HCEA 2VH9A 1MACA 4Z8BA 2DTYA 1G86A 1VAVA 2P34A 3FLRA 4X37A 3IM6A 4JRAA 1DQ4A 2W2DB 1KDMA 3RRDA 4I2SA 1YO8A 3A0KA 3WINC 4ZXKA 4J2KA 1ZA4A 3ZX7A 4IY8A 1GLHA 1C1LA 2OUJA 5HCBA 3QJ0A 3AJ6A 3IMNA 2P23A 2DUOA 2PHWA 1RINA 2WT2A 2FO1A 4M3CE 3IAGC 3BONA 4I1EA 4ENDA 4DQAA 3Q7XA 3BOKA 4G6MA 1JLXA 4GAIA 4XJUA 3KM5A 1SZ6B 5GZCA 3PJQA 2Q3NB 4FVVA 4K20A 5BQMB 4K21A 1MD6A 1G9CA 3L2YA 2NVHA 4I3NA 3O4AA 5BQUA 3VV1A 2ZHKA 1IOAA 3WDUA 5FREA 3AH4A 3KQRA 2NN8A 1W3FA 1LCLA 3F62B 5BOWA 1YF8B 3C8BA 2MLLB 1WW7A 2E53A 2OW4A 1LEDA 1VALA 3PG0A 5D62A 2ESUA 1DYPA 2R0FA 2PHUA 5FNWA 1HIBA 3TB0A 3QCWA 4Q8KA 4X3AA 2VW1A 3FGMA 9ILBA 1Q03A 3IM0A 4EFPA 5HPZA 2A6VA 3N35A 2A97A 2W2DA 2K4AB 1NZKA 4KBBA 1V00A 4IZEA 2MC2A 3ZXKA 3BAHA 3FJCA 4IQPA 4XIOA 1VLNA 2NMNA 1HWOB 3NBDA 4XKIA 3QW8A 1MVQA 2D20A 5GZDA 3UJQA 5BP5A 3QLQA 1O4YA 5E89A 1MVEA 3GNEA 6I1BA 4DFSA 2ZR1B 3CNAA 4BQ1A 2A8AA 5T5LA 5L73A 2ZGKA 5SV8A 4J23B 4OWJA 3AH2A 5CA6A 1BLAA 1DFCA 1QQKA 3ASIA 1JT7A 5BQMA 3A21A 1X50A 3HALA 2DV9A 2KI6B 4GOYA 4HANA 2D6PA 4LO0A 4EFRA 2R49A 2XOAA 3AKFA 2ZQNA 4XE9A 1ULCA 1CQ9A 1Z4SA 5GM0A 1LJ7A 4YG6A 3AFKA 4G1RA 2CYFA 3AYEA 1PZZA 3WCSA 3ZYRA 5DUYA 5F8SA 2Y9FA 1QGLA 1MS4A 1RITA 5T55A 3S8KA 2IMBA 3MW2A 1Z2VA 2ILPA 3WLUA 4WVWA 4GP0A 3BRFA 1F5FA 3POSA 5T50A 1N1VA 1N3PA 4EJ5A 4GAFA 4A7KA 4BPZA 1O4ZA 5I1BA 2XB6C 4LBMA 3WG4A 5E24E 1QDCA 1IS4A 2OUHA 5IT6A 2VW2A 1IKQA 1E1HA 1M16A 1MS3A 3WNXA 1S0FA 3UK9A 1IHKA 1CONA 3QYDA 5D63A 2AR6A 2ZGSA 1PZ7A 1ZM1A 1GANA 1HLCA 1FAYA 2ERMA 2PHXA 4JAWA 2GNBA 3NV4A 5DZEA 1V6OA 3MALA 2X2TA 3O5SA 3B00A 3BAGA 1AVWB 3Q7WA 1LECA 1S0CA 4II0A 4JP0A 2R1DA 4K1ZA 2C5DA 4YZ5A 1BASA 5GZFA 1SBDA 4LBKA 1AXMA 3A22A 1H9WA 2ZGRA 3PHZA 2ISGA 4YZ2A 2AREA 4P9YA 4F34A 1ZKXA 1LHNA 3A0NA 4UW3A 3RQ0A 3ATGA 3N7LA 1SLCA 2Z49A 5JOZA 2ARBA 3AP5A 2B7YA 2Q5TA 2UUSA 2Q9XA 5B2HA 4I4OA 2ZGTA 1WBAA 4FPEA 2Z42A 4P9XA 3WHUA 4CRQA 2DREA 3ZSLA 1I1BA 2D24A 1DZCA 1NLSA 4YFZA 3CAHA 4I4QA 1ISVA 4FOQA 1GGPB 2ES3A 3LCPA 4YG0A 4TYSA 1ENQA 1C57A 4MYEA 4LO3C 1Q8PA 21BIA 2YXSA 4OEEA 5KXDA 3WDWA 2VSEA 4PBPA 4I37A 4Q27A 1DJSB 1CR7A 1LEMA 4LO7B 3OPZA 2ZA9A 1FMMS 2ZHNA 4R9BA 2EXJA 3I4IA 4X39A 1AXZA 1AX2A 2PHRA 4P6AA 5FZYA 1S1AA 5E88A 5DUVA 3NV2A 3PUBA 3UDAA 2IMCA 3VKMA 4Y1XA 1N4KA 3DGTA 3O4OA 3M3CA 4FPJA 1W6OB 4Y24A 5FZZA 5T5PA 2G7NA 2ZKNA 4OUJA 1H9PA 2WQZC 1IS5A 3BOOA 4KUFA 3CA0A 4X38A 2L5XA 2VY0A 2ZHLA 1CESA 4XJ8A 3VKNA 1XZZA 1K5UA 1GZWB 1S0LA 3FFZA 4GP3A 4WBCA 3CA6A 2V73A 1DQ2A 1WBLA 1KJLA 3QIXA 4QD2B 2ZMLA 4LO2A 1N1TA 1EVTA 4ZBVB 4R9AA 4P0LA 4XIKA 4G9MA 4EL4A 2ZGQA 3D6EA 2HYKA 4L8QA 3R4UA 2F8XC 2JKBA 4KC3A 3BAUA 1GICA 2E6VA 3OGGA 3C8AA 1YTOA 3AKGA 1WUVA 3I29B 3WMVA 3RMYA 1ILR1 2Z48A 5DUUA 1UZYA 4EB2B 5EG6C 3CA3A 3AZZA 4DEPA 3FBYA 3VKLA 1GSLA 1FX5A 1XYFA 1BLDA 1TFMB 8I1BA 2I2SA 4LBNA 3B01A 1W6OA 4RA0A 1WLDA 1LOFA 1V6IA 3IIRA 4C1XA 3OBTA 4H9WA 5GJ6A 2ZZJA 4M3CF 3SH3A 1TWMA 3O44A 1BA7A 3FJDA 2DVAA 1XG6A 4I1BA 2W52A 2HWMA 3AP7A 4Y1VA 1LGNA 2E4MA 3CQAA 2A5ZA 1AJKA 3FJJA 3H6RB 3NBEA 4OWLA 4UW5A 1GZWA 1G9DA 2FFUA 5GLVA 3ILFA 4USPA 4ZA3B 3QW7A 1DGLA 3NBNA 5JLVA 1BARA 1IRAX 1CPMA 1JT3A 5T5JA 3HOMA 2WT0A 3FIEA 3ZYPA 3VUOA 1HQWA 4Y26A 5JOXA 1HWPB 4RL7A 3B9CA 4XXPA 1DQOA 3MW3A 1JW6A 3FUQA 1L2HA 1AFCA 4L4HA 1ZB7A 1JHNA 3BWIA 1QOOA 1ABRB 2NM1A 2VSAA 2UWBA 2GMEA 2KKIA 1LOGA 1QNWA 3C88A 2LALA 1MC9A 5F5QA 1W6PB 2QN0A 1FQ9A 4YGEA 4ATEA 1JBCA 1YRZA 1JUIA 2QYIB 1DZDA 4BOWA 5BXPA 3WINA 5GZGA 2GMMA 4ZFYB 2E7TA 4J2SA 3QR5A 3RMXA 5BXRA 4I96A 2AUYA 1CE7B 2IMAA 1AJOA 3UD9A 4F83A 3OBRA 1E0OA 5DZFA 4XMAA 3WDVA 4Z9WB 3RSJA 1AVBA 3H0OA 5T5OA 3HR9A 2A3WA 4DS0A 1LENA 2LTNA 3TAYA 4QC4A 1FN0A 5BYNA 3IN9A 3H6RA 1QOSA 2WT1A 3C9ZA 1HWNB 3BAVA 1IT0A 2E7QA 4DCKC 2GNDA 1MR5A 4ASMB 2D6KA 1FV2A 4BMBA 1QXMA 4FPOB 4EKXB 4XJAA 2YY1A 4YW1A 2ERFA 1WLWA 1V6NA 3OJMA 4GKYA 1ONAA 1RZOB 1OFSA 2P3JA 1DQGA 1DLLA 3LTQA 3RG0A 1FMZA 2R16A 3ZSJA 4R9DA 1IKPA 1FGAA 1T3AA 4ITCA 1W6QB 3AP9A 4QKRA 3V0AB 1XTGA 5KXBA 3JU9A 1SLBA 4TZDA 1SFYA 3WV6A 1T4QA 2AYHA 3ZC8A 5T54A 3P6JA 4QO3A 4I0YA 1EYLA 4FPLA 2A6YA 4WZFA 1BXHA 2ZBJA 1W6PA 1ITBA 2DU1A 3VSFA 1ENRA 4UW6A 5GAQA 2DYCA 2D7IA 4XHBA 1UL9A 1JT5A 3AZXA 2WKKA 3AYDA 2P2KA 4H55A 2PHTA 2D7RA 3M3QA 5IK8A 3Q9OA 4XFTA 2DWRA 2ENRA 4LBOA 2BEAA 3FLPA 1QF3A 3SNVA 2D3SA 4I4SA 2D6OX 5HCAA 3VT1A 2P3KA 5JOYA 3BB2A 3T1MA 3AK0A 3POKA 3AP4A 5G00A 1ULGA 1JLYA 4Z8SB 2D6MA 3VWCA 1HQLA 1A78A 1F9KA 1RMLA 4DENA 1G9BA 4HR6C 3A07A 5DZUA 4UW4A 1V6KA 3AZYA 1EV2A 4XJ9A 3QIZA 3ZVXA 4C1WA 4YGBA 2FMDA 3OGFA 1W6QA 3V0AA 1QOTA 4YW2A 1LHVA 4Q1PA 1LHWA 2JE7A 7I1BA 3FLTA 2R1BA 4XFSA 1LOCA 4Y22B 2D23A 3P6IA 4J2YA 1UKGA 3IM5A 2XG3A 1R1ZA 2R9KB 4FP2A 4YZ3A 3RTIB 1G8WA 3BAQA 4FP3A 4FGFA 1C1FA 3T1LA 3CA5A 4TLPA 1W3GA 3CRGA 2EAKA 3B69A 2PHFA 5BXTA 4LBQB 5H9QA 4AYUA 2KM2A 3SH5A 2A71A 3AZVA 2CWMA 3WOGA 5F9TA 4XTPA 2GN7A 2C9AA 4DRVA 2ISHA 3VKOA 2YUGA 3U4XA 1MZ5A 1AX0A 2P37A 4J1LA 4Y1YA 1DYKA 1AVUA 3O0VA 2A3XA 2GMPA 5EYYA 3AH1A 2WNEA 1FATA 2AQZA 3D7WB 3W58A 3ZSKA 3DEBA 3SITA 2DURA 3V0BB 3I2AA 3VT2A 1SR4C 3OJBA 4G6JA 1NXD1 2F2FC 3D5OA 1CJPA 1TP0A 2UURA 2A6WA 4IZXA 1FNZA 1SLIA 1U0AA 5E8AA 1DHKB 1Q8OA 1PWAA 5H9SA 41BIA 1I1EA 3UJOA 1DQ5A 1GNZA 4Y22A 2ZMKA 3POYA 5GLTA 1WD4A 1ZN3A 3K3QB 1QU0A 1V6WA 3FJAA 3ZUSA 2WSVA 5EWSA 3FJEA 4ZFWB 1TOOA 1AXYA 2AENA 3VSZA 4LO3A 1D0HA 1LU1A 5CBLA 1MS0A 4YW3A 3PVEA 4A7ZA 1BZWA 2AXMA 4YM3A 1V6VA 4LBQA 4XJZA 2D7FA 3NWKA 4LBJA 1B09A 2HW9A 3M3OA 2D6NA 1BFGA 3UJ0A 3OJ2A 1DQ1A 3CRIA 3DSEA 3R05A 2D1ZA 1V6MA 1S0IA 2YMZA 2ZGUA 5GLZA 4XTMA 4Y1ZA 2NZ9A 5DXDA 1JOJA 3VT0A 1BQPA 5IK4A 1S0EA 1A8DA 4J2XA 4YG3A 4YM0A 3HBWA 1S0GA 4AN7B 4ISQA 3D3XA 1HKDA 3V0BA 1JY0A 3W9TA 3FJ8A 1T3CA 3ZURA 2BQPA 2GDFA 2DUQA 2CNAA 2D43A 4ZKTB 5KXEA 4FOWA 3BOPA 5CAZA 2JDZA 3PVNA 4AGRA 4AVVA 3AKIA 3WDXA 1GV9A 4YM1A 1LGCA 1ISWA 4YLZA 3PVOA 3BA4A 1QKQA 2DU0A 3AKHA 3H6QA 4M01A 2PELA 3WDTA 5DUXA 4QBVA 2BEBA 3ILAA 3M1HA 1W6NB 4P9WA 3DS9A 1Q8SA 3FUOA 4YZ1A 1ZL5A 2WBCA 4YM2A 1HWMB 1R8OA 1AVAC 2DVDA 2ZHMA 1TWEA 5CB7A 1RIRA 1IILA 2XHLB 3CRHA 2VU9A 4I4UA 3LLPA 1KJRA 2FGFA 5BVPI 4KTXA 5DZGA 2ETFA 1KDKA 2DTWA 1XHBA 4R9CA 3ZSMA 3H6SE 2HZ9A 4FPYA 2DVBA 1Q04A 3BX1C 2EF6A 4PCRA 3APBA 1WCSA 2WLQA 1IRPA 4FQ4A 2ZGNA 2D6LX 1ISXA 3JUTA 3BA5A 2ZMNA 4LO1C 2J3PA 3BIWE 3M2MA 3HSMA 4XFUA 1YBIA 2TEPA 3O5WB 3AJYA 5DSSB 3UD8A 2DUPA 3WHTA 4BMEA 1YIFA 3BRDA 5FZUA 2AAIB 4Q9GA 3WO3A 1LGBA 5JVVA 4I4VA 2SLIA 4ZGRB 1KNMA 3B9UA 2EXIA 3VEQA 3FJFA 1Z0HA 3BRGC 4EEEB 1W6NA 3ENRA 4FPHA 3OY8A 2GNMA 3MW4A 1RY7A 1BJQA 5GALA 5BXSA 2ISEA 3RTJB 4PF5A 2XHLA 4FOYA 1GBGA 4CZSA 4ZLBB 1TTUA 5EC5A 1PC8B 3SH4A 2CY6A 2E51A 1LESA 2YROA 3P53A 1II4A 2LIQA 2P39A 5IK5A 1IS3A 2SBAA 3AYCA 1DIWA 2AH2A 3V79C 3SLIA 1G82A 4D0TA 1UPSA 4I7IA 1GZ9A 4BLIA 4LBQD 3JRRA 2ARXA 1F31A 2G7KA 2VUAA 2G7PA 4Q26A 3IM7A 4P0JA 1N3OA 3NBCA 1KRIA 3AX4A 2JD4A 2RG9B 5LK5A 4FPCA 4BLJA 1JTCA 2DRZA 1G9AA 2GO2A 2R0HA 1WLCA 4XHXA 3NJ5A 2NP0A 3WO4A 5DVHA 4OWKA 4XOGA 4XDQA 4Q9PA 2EXKA 2A6XA 2Y9XE 3ZPYA 3WA1A 1GKBA 4SLIA 2YV8A 3O49A 3CA1A 3N36A 3EF2A 1SBFA 4Q8LA 4U36A 4NO4A 2EXHA 2FPQA 4I6IA 1WW6A 3WUDA 2ZGPA 1IS6A 1SCRA 3O0XA 2NMOA 3BTAA 4FPFA 3C2UA 2JJ6A 2K43A 5BQUC 1WBFA 3VKFC 3NF3A 1C4RA 1YVGA 4XBLA 2UWAA 4I4YA 5FRAA 4Y20B 3E8LC 4ELCA 1A3KA 1JQZA 5T52A 1WW5A 3FJIA 1MZ6A 4DRRA 3NV1A 1Q56A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3BTAA

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