3V0AA

2.7 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 408
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
408
sequence length
1295
structure length
1280
Chain Sequence
MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/A
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 408
structure length 1280
sequence length 1295
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-12-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0aA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0aA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0aA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0aA01
1QXMA 3VKOA 3A23A 1F5FA 3UD7A 1YXWA 4YLZA 1GYKA 3ZSKA 1IOAA 3I29B 4KUFA 3M3EA 3TAYA 2I2SA 2IMCA 3NBNA 4Q2FA 1DQ0A 3QIYA 2WNEA 2ZGKA 5CNAA 1ZL5A 2ZGOA 1F31A 2ZGTA 1I3HA 4ENDA 3V0BB 2A3WA 1BASA 1BFGA 2IHOA 3BAOA 1BJQA 4Y24A 4YW1A 2UURA 5G00A 1XTFA 2K8RA 1GZWB 3AP4A 1KJLA 2ZABA 4I7IA 3FJJA 5T5LA 1HWPB 2PHTA 3T2TA 2M49A 3BA7A 3FJFA 2PHFA 2WT1A 5IK5A 4GA9A 1K5VA 1Z2VA 5IK8A 5GJ6A 3PUBA 1HLCA 1SFYA 1W6NB 1GLHA 4AN6A 1DYPA 5DUWA 1Z4SA 3EF2A 2A6WA 3N7MA 4XJUA 4I4UA 2ZMKA 1Q8VA 3INAA 3GALA 1FYUA 1UKGA 5GZCA 4FVVA 2DRZA 1TP0A 3KQRA 4P6AA 1KDKA 4FPGA 4YGDA 2BEBA 3BTAA 3W59A 1RINA 1WW6A 2ZQOA 3ILFA 3WHUA 3T1MA 1AX1A 1S0IA 1TWEA 5F5QA 1Q04A 2ZQNA 1ZM1A 3OJBA 1IOBA 4FOVA 4I4XA 1BXHA 3ZX7A 1ZA4A 3F62B 4FOYA 4NO4A 1QNYA 3BB2A 1URXA 1SLIA 1CIWA 4PF5A 4R6UB 1LOAA 3OY8A 1EVTA 3O4OA 5CA6A 2AR6A 2ZAAA 3AX4A 1IT0A 1N1SA 5HCAA 1JUIA 1ZKXA 2E4MA 1LHWA 4PCRA 1GSLA 4TLPA 4HANA 3AXDA 2ZZJA 4I4SA 1JHNA 1FMZA 1ULEA 4UW6A 2AREA 1KITA 4OW4A 2KKIA 1SR4C 3H6QA 1T9FA 2D43A 3BRDA 1DZDA 7I1BA 4F34A 4ZKTB 5BQUC 2ZR1B 4JPZA 3ZYPA 1I1EA 3QYDA 1KDMA 2NM1A 4BM8A 1S0EA 4MYEA 1FWVA 1VIWB 3M3CA 4FQZA 5FNXA 4DQAA 4FP3A 1BLAA 1YVGA 3Q7YA 3C8AA 5IK7A 2D3SA 2JE7A 4J2KA 4FOWA 5DUUA 1YYNA 4Q9GA 2ZHLA 2D44A 1LOGA 4FPLA 4LO2C 1GKBA 1GNHA 2UWBA 4HR6C 4I4QA 4FPKA 1M16A 4HL0A 1ISYA 1JTCA 2CY6A 4U36A 4Y26A 4P9XA 4QC4A 5DSSB 3HR9A 4Q1RA 4J2XA 3FJHA 4H55A 5E24E 1S0GA 3HBWA 3VKLA 1J1TA 1AVWB 4RL7A 4ZFUB 5CAZA 1AXKA 8I1BA 2DUQA 4I8MA 2BQPA 3MEPA 1QQLA 1WBCA 1WBFA 4SLIA 3QIZA 3IM5A 1YIFA 1S0DA 2D6LX 4Y1ZA 1PZ8A 4L4HA 1N1TA 1ZB7A 1W3GA 5T50A 1CR7A 2IWTB 1IS5A 3POWA 1WLCA 4YFZA 3VKMA 3HSMA 1AX0A 1G9CA 2ZHMA 1JN2P 5H9RA 4XFUA 2Q3NB 3A0KA 4AN7B 1W6PA 2AYHA 3C89A 1ABRB 3C8BA 1UPSA 3FJDA 1V6UA 5T5PA 2D20A 4EJ5A 1LULA 1QGLA 2D3PA 4OZXA 3CAHA 3FJCA 1GGPB 1MR5A 2G7KA 1Z78A 4YM2A 3POSA 2WQZC 4I30A 2A3XA 1W3FA 1DJSB 2WT2A 2GN3A 5E88A 1LODA 3WDUA 2GNTA 3QW8A 3RG0A 3O0XA 2F2FC 1AZDA 4Y1XA 1V6KA 1VCLA 4IZEA 1FV3A 3FJAA 3NWKA 1C57A 3FJKA 3S8JA 4XMAA 3SNMA 3FGMA 5DUVA 2YXSA 4RA0A 4C1WA 4I1BA 5GM0A 4KC3A 4GXLA 4GAIA 1WW7A 3TC2A 1WUVA 3FUQA 1MS1A 2XG3A 3C9ZA 2D6KA 2LTNA 3IIRA 3R05A 5FRAA 2ZMNA 4BLJA 3PVNA 1WD4A 3SH4A 3WLUA 3IAGC 4QKSA 1G9BA 3WG1A 4FPEA 3NJ5A 2P39A 4ZFWB 4JC1A 2DUOA 3C88A 2DURA 1A3KA 1DHKB 1YI7A 1LEDA 1AVAC 3O0WA 1IRAX 5KXCA 1MVEA 4Y22B 3RQ0A 4Q26A 4XILA 1JLYA 3MW4A 3D7WB 2ZGQA 2D1ZA 1OQLB 4I4YA 1PUUB 1MC9A 2L5XA 2SLIA 1AJKA 4K1ZA 1IKQA 1JT5A 1G7YA 4LO8B 2KLLA 2DVAA 4LBQD 1TFMB 2KI6B 4XJ9A 4OUJA 4ATEA 4GKYA 1K5UA 3AH1A 1Q8OA 4KEIA 1G9FA 1SLBA 2GO2A 4LBQB 1W3AA 3HN1A 3O4BA 4YZ3A 1DQ5A 2ENRA 4Y1UA 3MW2A 9ILBA 3V79C 1MS0A 3HMYA 3SISA 3SH5A 1HQWA 4IZXA 1OQ1A 1HIBA 1FX5A 2V73A 2ZGNA 4DRVA 3RTIB 4AVVA 4PQ9A 3WNXA 3H6RA 1FV2A 1VLNA 1SCSA 1DFQA 5BVPI 2D7RA 3AP7A 2Z49A 1S0LA 1QKQA 1ISZA 1VAMA 3ILAA 4ITCA 1GNZA 3W9TA 1LHNA 3CA3A 3OYWA 3RTJB 2DU0A 2FFVA 1CQ9A 4QO3A 3D3XA 4R9CA 4DCKC 5FREA 5BQNA 1RY7A 1B09A 3H6RB 5GAQA 1W0PA 1RZOB 4I1EA 4XIOA 4XMIA 3O0VA 2C5DA 3QW7A 3ZPYA 3M3OA 3ZXDA 2DRYA 2PHWA 5JOXA 2E7TA 2DS0A 4Q8KA 1FGAA 2QYIB 4OWKA 2FPQA 2WT0A 3N7JA 4ZGRB 5GZGA 2FHRA 5GLZA 4FOQA 1IS6A 3V0AA 1JBCA 2JJ6A 3AKFA 3I2AA 4TYSA 5T54A 1QMJA 2A3YA 3UD8A 3M1HA 1AVUA 4EFPA 1YRZA 4J2SA 1UAIA 3QCWA 4AGVA 5DZEA 5GZEA 2D6PA 2BFHA 4K21A 2NMOA 2D24A 1ONKB 2ARBA 1DLLA 4HA2A 4P0JA 4D0ZA 1G9AA 3NBCA 1QNWA 1N4KA 3CRHA 2HWAA 2Y9FA 3DS9A 4LBOA 3B9UA 4KEJA 5DZUA 3VEQA 4AVTA 5DXDA 1GANA 3OGGA 4L4IA 4OEGA 1SLCA 3WDTA 2R0HA 4GAFA 5EG6C 4XHXA 1T4QA 3O49A 4ISQA 3RS6A 1CN1A 4TZDA 5DZGA 3SLIA 2WJSA 1O4ZA 3WO3A 3AP6A 3AZYA 4GWMA 2D6NA 2YZ4A 2A6YA 3SH3A 4ZLBB 3FLPA 1EV2A 1EPWA 1AXYA 1BZWA 2E51A 2ETFA 2XOAA 4W65A 4P0LA 4YZ5A 1Q8SA 3CU1B 1NXD1 4GOVA 1NZKA 4PC4A 1KRIA 1AF9A 1G8WA 4QBCA 4XJAA 4JRAA 4EFRA 2A7AA 4U2AA 1SLAA 4LO0C 1LOCA 3M3QA 5D61A 1LHOA 3C2UA 4KBBA 5BYNA 5B2HA 4JQ0A 4J1LA 2VXRA 4M00A 4USPA 4XIKA 5KXDA 5BXPA 1PC8B 1JYCA 3UL2A 1DZQA 3NV4A 4ELCA 3PVOA 4IQPA 4JKQA 4A7YA 5HPZA 1ULFA 2R1BA 4JAWA 1JW6A 1AJOA 5LK5A 3WDYA 1TEIA 2MLLB 3AXEA 4WBCA 4EL4A 3BAVA 1VAVA 3BADA 3PMEA 1A78A 1FNZA 2ILPA 3ZUSA 2EIGA 1AVXB 3O3QA 3FJEA 2HW9A 5JVVA 1W6MA 5EYYA 3AH2A 4H04A 2ERFA 1RIRA 2W68A 1R8NA 2CL2A 1MVQA 3OY8B 3ILNA 2Y9WC 1ITBA 3OPZA 2RSTA 1UMZA 3O12A 1IRPA 3HOMA 3ZVXA 4I3NA 4J23B 2NYYA 1XQNA 4Y20A 1AXMA 4EEEB 1N3OA 3WMVA 3B9CA 3NBDA 4P9YA 2A6VA 5T52A 1W6MB 3B3QE 3ZXKA 4GALA 4GOYA 5DVHA 3A22A 3DUIA 5EXOA 1D2SA 3VKNA 3RMYA 2ZHKA 3VT2A 3POKA 3ENRA 2HYKA 2R49A 4XJZA 1W6QA 4IONA 2X2TA 3UJQA 3N36A 4I4RA 1WBAA 4BQ1A 5BP5A 1G86A 5GLVA 4LO7B 2RHPA 5F9TA 2IMAA 2D22A 1V6LA 2ISEA 4YZ1A 4LO3A 4YZ2A 2LIQA 2GALA 4G1RA 3ASIA 2AXMA 3B69A 3AFKA 1QDCA 2AH2A 1DZCA 3JUUA 1JT3A 4Y1YA 4X38A 4XJ8A 4M3CF 3PVEA 3ZYRA 2W2DA 3WDXA 2I1BA 2GNMA 2SBAA 4Q8LA 1XTGA 4M3CA 3AK0A 3WVJA 4ZBVB 2FO1A 4XXPA 2EXHA 1LHUA 2EALA 4M01A 2ESUA 1N3QA 4YGCA 1PWAA 2P2KA 3S8KA 2R16A 2IMBA 3BAQA 3IM6A 3O4DA 1V6NA 2EXJA 5H9PA 2B7YA 2PELA 2ZGUA 4IY9A 4UW4A 4ZXKA 5EWSA 5BXSA 3AP9A 2DREA 2P3KA 3BOOA 5F90A 2G7NA 1V6VA 1DYKA 3CA4A 1CVNA 3RRDA 4GWNA 4QD2B 5IT6A 4R9AA 4XFTA 3UDAA 2D6OX 3AJ6A 3MW3A 2H0BA 3SITA 3FJ8A 3OJMA 4LO1C 1TTUA 2AFGA 2ZHNA 1FATA 3VUOA 1D0HA 1LU1A 1DIWA 3CRGA 1QOTA 1ISVA 1ZKWA 2OUHA 1UL9A 4K20A 2K43A 2ZGSA 3AH4A 1UZZA 4Z8BA 1HWNB 4FPFA 1ILR1 2D6MA 1CPMA 3I8TA 2DTYA 3FIEA 1CESA 4XOGA 5BQUA 2UWCA 1GZCA 1ONAA 1W6PB 2GNDA 4CZSA 4GKXA 4LBMA 1BKZA 2AGSA 2YUGA 3E8LC 4YW2A 1IKPA 2DYCA 4XHBA 3D4KA 2ISGA 4Z8SB 4A7ZA 4XJWA 1WD3A 3O5SA 3OBTA 3AZWA 3QW5A 2EF6A 4LO2A 4GP0A 2VUAA 4OWJA 2VLCA 6I1BA 1LGCA 2GZBA 1C4RA 4IY8A 3WCSA 3K1XA 1OFSA 1V6WA 1XYFA 3MALA 1RG8A 5JDBA 3WG3A 4I0YA 2OVUA 2BEAA 5FNWA 3QIXA 1SBFA 3BA5A 1ISXA 4Q1PA 3BAGA 3IN9A 1HWOB 1JY0A 1PZ7A 1MS5A 4XBQA 1ISWA 3FBYA 4I4PA 2W08A 5T5OA 2LALA 3VSFA 2VSAA 2CYFA 2W52A 2YMZA 1R8OA 2P37A 2E7QA 3O44A 5BQMA 2GMMA 1DFCA 3BAUA 3USUA 1BFFA 5H9SA 4Q27A 1H9PA 4BMBA 1CPNA 1LEMA 2QN4A 3ZC9A 2ZGPA 5DG1A 1BA7A 5CB7A 3CQAA 3WINC 2Z48A 1T3CA 3AZXA 3GNEA 3VWCA 4DEPA 3W58A 4L8QA 2ZMLA 4YOLA 4YG6A 4I2SA 5CBLA 4BOWA 3DGTA 2J3PA 3N0KA 1AX2A 5FZZA 1U0AA 3K3QB 4AYUA 3R4UA 2VW2A 3F1RA 1S0JA 1ULCA 4UW3A 5KXBA 2DTWA 1DQOA 5GALA 3OJ2A 1ENSA 2RG9B 2NMNA 1M2TB 4FPJA 1GV9A 3BODA 1DQ4A 2F2FA 2NP0A 2DWRA 5DZFA 3NF3A 2W39A 2ZA9A 21BIA 4WVVA 4G6MA 3ZURA 4D8HA 3CA1A 1BYHA 1XG6A 3CA5A 1W6OA 5F8SA 1FAYA 1LOFA 2VSEA 2E53A 3QR5A 1A8DA 2NN8A 1I1BA 3ZXLA 1Z0HA 3B00A 3ZSLA 3OYWB 2QN0A 4BLIA 2Q5TA 3L2YA 1AVBA 2ZGMA 5GLTA 1W6OB 2XB6C 3IM0A 2Y9GA 1JT4A 3B01A 4EB2B 4X3AA 1HKDA 3KMVA 4G9MA 1SACA 1V6JA 1N1VA 3N7LA 3AZVA 4CJMA 4YG0A 1IJTA 2FMDA 1N47A 3PHZA 3H0OA 1S1AA 1X50A 2ZGRA 2DUPA 1MACA 5BXRA 4K1YA 3ZUQA 2DVGA 4OEEA 3JRRA 2EAKA 1WW4A 3V0AB 3RSJA 3I4IA 1AFCA 3V0BA 3UJOA 4ZA3B 2P34A 2ZBJA 4X37A 3VKFC 3M2MA 3ZXFA 2E4MC 3JUTA 1LENA 1HCEA 4QBVA 1OKQA 3FUOA 1UX6A 1H30A 1GZWA 4D0TA 3N35A 4YFWA 1MS9A 4JP0A 1KNMA 1PZ9A 2FFUA 2HZ9A 2ET2A 2OW4A 2JECA 2DVDA 2UUSA 1XZZA 1N1YA 2AUYA 4EKXB 3BX1C 3V65A 4YZ4A 3IMNA 2YROA 2ZGLA 1JT7A 3BOKA 3QJ0A 3NV1A 4LO7C 4XZPA 4JCKA 1W6NA 4LBLA 4ATFA 4XTMA 3VT0A 3UK9A 1RITA 3R4SA 5EYXA 2C9AA 5BOWA 5E8AA 3WOGA 2A6XA 5E89A 2GNBA 2HWMA 3ZSJA 2KM2A 3V64A 5BP5C 2ZACA 2FGFA 3FJIA 4CTEA 2P23A 1MZ6A 2UU8A 1RMLA 4DFSA 5GLWA 1LTEA 5GZDA 4FPCA 2VXTI 3AJYA 2JD4A 3MPPG 1T3AA 3BWIA 4LO3C 5I1BA 3LSDA 1S0FA 3N7KA 1LOBA 2UWAA 2WLQA 3DDBA 1LECA 3BA4A 4Z9WB 4YGEA 5EHAA 3AYAA 1VALA 1QOOA 2AENA 1BARA 4XBNA 4JKXB 2OUJA 1G82A 1V6MA 3NV2A 1TOOA 2DU1A 1QDOA 4BPZA 3AYDA 1Q56A 3AJ5A 5AVAA 2CWMA 4QD2C 1YTOA 1Y7BA 2NZ9A 2CNAA 3QW6A 4HJJA 5KXEA 2CWSA 4XTPA 1TIEA 2FDBM 2VW0A 4USOA 1DQ1A 2VH9A 2XHLA 3CNAA 2D23A 2WBCA 3ILRA 1YO8A 2VW1A 2EXKA 2RQ9A 3FJ9A 1SLTA 2DV9A 4ISRA 5JOZA 3WDWA 5JLVA 2ERMA 3DEBA 1J0SA 1GBGA 1JQZA 4YGBA 1DGLA 4UW5A 1TWMA 2NTDA 3Q7WA 2R1DA 1JLXA 2NVHA 3O5WB 4I4VA 5D62A 5SV8A 2V5YA 1YF8B 3H6SE 4P0KA 2A6ZA 3JU9A 1L2HA 2XHLB 2PHXA 1R1ZA 5L73A 3U4XA 5IK4A 5IUQA 4R9DA 4FGFA 1N3PA 4LBJA 3A21A 3T1LA 1ULDA 2JDZA 3VV1A 1G9DA 4IHZA 3BAHA 3UJ4A 3VT1A 1MS4A 2KH2A 4LBNA 2ISHA 1C1LA 4Y20B 4AGRA 3OGFA 3APBA 2G7QA 2ZKNA 4M3CE 3BIWE 3HALA 31BIA 3ZC8A 1HWMB 4PBPA 3IM7A 1H9WA 1W6QB 4LBKA 1BLDA 1MS8A 3AZZA 4LO0A 2G4IA 4DS0A 2PHUA 1SBEA 3POYA 4YG3A 1ENRA 4DRRA 3P6IA 4BMEA 1II4A 3TB0A 1DQGA 4XKIA 1BQPA 3WHTA 1SZ6B 1V6XA 3AJZA 2GMEA 1F9KA 4OEFA 4EFQA 1ENQA 1YBIA 3CA0A 4II0A 3ZXGA 4D69A 2VY0A 2P3IA 3WUDA 1QU0A 4KEKA 5F8YA 5JMCA 1FNYA 4FPYA 2W2DB 1NUNA 4M3CB 1ULGA 3PJQA 41BIA 1KQRA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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