3V0AA

2.7 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 408
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
408
sequence length
1295
structure length
1280
Chain Sequence
MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/A
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 408
structure length 1280
sequence length 1295
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-12-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0aA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0aA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0aA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0aA01
2YZ4A 4FPGA 5F9TA 1HKDA 2DVFA 1MS5A 1PUMB 3BAGA 1HCEA 4PF5A 1FMZA 1DZQA 1JT5A 3WDVA 2E7TA 2DU1A 1B09A 4NO4A 3O0WA 2D6MA 2NVHA 1BFCA 2WBCA 1A8DA 2E7QA 1YO8A 3ILAA 2A6XA 5EWSA 1SLIA 3DDAA 3LTQA 4M00A 4XFUA 3ZSJA 2R1DA 1DQOA 2XHLA 2A75A 1YYNA 4OEFA 3T2TA 4LO7C 4OUJA 1URXA 3KM5A 2ZGLA 3IPVA 5T5LA 4Q8LA 3H6RB 3RTIB 1JUIA 3O4OA 1Q8VA 1DQ2A 1UZZA 1GANA 3AYAA 2A3XA 1N4KA 4XTPA 1S1AA 41BIA 2DV9A 3QCWA 3JRRA 3NJ5A 3FJHA 2WT1A 4LO1A 4EFQA 4I4XA 3ZUQA 5BQUC 5CBLA 3POWA 8I1BA 3R4UA 3FJ9A 2FPQA 3L2YA 4YGEA 3F62B 4LO3A 1BLAA 3T1MA 3HR9A 1G9AA 1N1VA 1C1FA 3D4KA 3ZC8A 2AGSA 4ASMB 1SLCA 2ZKNA 3ZXGA 4XILA 1V6VA 5BQMA 2WLQA 4MYEA 4DEPA 4K1ZA 1WBAA 3FUOA 1PWAA 4HJJA 1QOOA 4AWDA 2D23A 5HCAA 1E0OA 3BODA 4M3CF 3DUIA 4UW3A 4AGVA 1SLTA 1GZWA 2A3YA 2D6NA 4I96A 2WSVA 3N36A 3UK9A 3ZXDA 1HQWA 4IHZA 3B9CA 1ISZA 1VLNA 4DFSA 1FNZA 3DS9A 3O44A 3N3HA 5T5OA 3RSJA 3D3XA 3AKIA 4BLIA 1CN1A 1TOOA 5DG1A 4Y24A 4LO3C 3NBNA 1SACA 2ZHKA 1UPSA 4A7YA 1Q8QA 3LSDA 1DQ1A 3NF3A 3OJVA 1TP0A 5EYYA 5T5JA 1ZA4A 4YFWA 4G9NA 1OQ1A 4QBCA 4D69A 4OW4A 3QW5A 2Z48A 1ENSA 1LCLA 1TEIA 2BEBA 1W6OB 2JE7A 1LOGA 1V6WA 1DGLA 1ISYA 3JUTA 3WCRA 2UWBA 5EC5A 2R1BA 2NM1A 1CESA 1V6KA 1DQGA 1W6NA 1QQLA 3O4BA 1SLLA 1DZCA 1XG6A 1S0DA 3O12A 1L2HA 4YGBA 4NOTA 5BP5C 1IKPA 4FVVA 3IN9A 5H9SA 1Z2VA 5DUYA 4KBBA 2DTYA 3QIYA 3BTAA 4WVVA 2F2FA 1DQ0A 1F31A 4XKIA 1LJ7A 2G7KA 3V65A 2A6ZA 2VLCA 2A8AA 5IK4A 1W6PB 2YXSA 31BIA 5KXDA 4FPOB 5JLVA 1LEDA 1W6MA 1QMJA 3INAA 2HW9A 1KQRA 4EJ5A 1GICA 3T1LA 4GALA 2HWAA 4GAIA 1LOFC 4CZSA 3TB0A 2ISHA 1Z4SA 2V73A 2Y9XE 4IY9A 4Y1VA 3FJKA 1GBGA 2DVBA 4TYSA 3F1RA 4XBNA 1T3CA 3ZX7A 3ZSLA 1DFCA 2D44A 4JCKA 2FDBM 2UWAA 1DQ5A 1LOCA 4KEJA 2RHPA 4XOGA 4ATEA 4J2XA 1QNYA 3OJ2A 1JN2P 5T55A 2UU8A 3AH1A 4HA2A 1MVQA 1IOAA 2P3IA 1ITBA 4FPCA 4XXAA 4DS0A 3ZYRA 2IMBA 3JU9A 3RQ0A 1GYKA 1A78A 3BAQA 2D6LX 4ZGRB 3IM0A 1DQ4A 4FPKA 1LECA 3LSEA 1VIWB 2ZR1B 4YW5A 1H9PA 1WW7A 1LULA 1FNYA 4ZBVB 4ZFWB 1AF9A 2EXKA 3ZPYA 1PUUB 4XBLA 4BLJA 1AXYA 3M3QA 2DVDA 1S0JA 1APNA 2QN4A 2K8RA 1G9DA 4GKXA 4G9MA 3I4IA 3MPPG 2ET2A 4LBQB 2CTVA 4P0KA 3A4UA 3HSMA 3B01A 3IMNA 1UAIA 1ZKWA 4U2AA 4Y1ZA 2ZGSA 2KI6B 1AX0A 4IQPA 1JT3A 1GKBA 1W0OA 1LHWA 4G6JA 4YOLA 4Y1UA 2K4AB 3SH4A 5EXOA 5IK8A 3WDYA 2YY1A 2Y9GA 1RITA 4SLIA 3B69A 2CWMA 1QDOA 3O5WB 4Q1PA 4A7ZA 3AZYA 3WDWA 1BA7A 4PBPA 3DGTA 4XMIA 1ONAA 3AYCA 3NBEA 2AR6A 3NBDA 1BARA 4FGFA 4M3CA 3K1XA 3I2XA 3AKHA 4XFTA 1ULCA 4I4PA 3MW4A 4AN6A 3NV1A 2Y9FA 3AYDA 3VKMA 4UW5A 1N1SA 1LGNA 2E53A 1QDCA 5E24E 2K43A 5G00A 4YG0A 2R16A 2ZQNA 1BLDA 1Q03A 1MS8A 3N7JA 2CY6A 2SLIA 4Z9WB 4J2SA 1D0HA 1SR4A 2GZBA 2G7NA 4Q9GA 1AJKA 5DUUA 3UJQA 1GZ9A 1UL9A 2D7IA 1MS1A 1LOEA 3OYWA 4JKQA 3QLQA 1P63A 1AX1A 1BFFA 3V64A 1XTGA 1WLCA 5HCFA 4J2KA 3AXEA 5GZCA 3N0KA 2WT0A 1HIBA 4XE9A 4I4YA 3N7LA 4Y1YA 4I3NA 3M2MA 1Q1UA 4ENDA 6I1BA 4Y26A 3GNEA 5CAZA 4QKRA 4A7KA 1BYHA 4QD2B 1O4YA 2LIQA 1DHKB 2LALA 1N3QA 3GALA 2MLLB 4G1RA 5BXTA 3WG3A 4DQAA 2A6WA 2B7YA 1BFGA 2ENRA 4BMEA 3AJ5A 2VXTI 2ZGMA 2C5DA 4Q27A 2W08A 4WZFA 4ATFA 1W6QB 1KRIA 1VALA 1ZL5A 2Z49A 2A6YA 4I4UA 2YROA 3OGFA 4K21A 1HKNA 1Z0HA 4I30A 1RMLA 1K5UA 1FV3A 3B9UA 3AH4A 2Q5TA 4EKXB 1G9CA 2JDZA 4ZLBB 1QF3A 1UZYA 2JKBA 5H9RA 4XJ9A 5GZDA 4ISRA 5F90A 3WZ1A 1YXWA 3IM7A 2FGFA 3O5SA 2IHOA 3SNMA 2VY0A 2W2DA 4K20A 4YM2A 1TIEA 1ISWA 2XG3A 3HOMA 3C9ZA 1R8NA 2GNTA 5JOZA 2ZMKA 4J2YA 4PBOA 4P9YA 1KDMA 1BKZA 1QKQA 2ZHMA 3O4AA 1LOAA 1MC9A 2JE9A 3D7WB 4WVWA 5HPZA 3UD7A 1JYIA 5BQUA 3BRFA 4QO3A 3PG0A 2ZGUA 3AFKA 4BQ1A 3AH2A 3M3OA 4XBQA 3O4DA 4CRQA 5D61A 4GXLA 1OKQA 4FPEA 1Q8PA 2FFUA 5GLVA 3FLTA 1GZCA 3T8SA 4YM3A 1DZDA 1V6OA 1N47A 2VSEA 4XJZA 1S0EA 1LOBA 3ENRA 1JTCA 3A07A 1J1TA 3BONA 1IS4A 4J1LA 2R0FA 5DZUA 1S0CA 1Q8SA 4HR6C 3PHZA 5DZEA 3UJOA 2L5XA 3FJJA 1FAYA 5E88A 4P9WA 3QYDA 4I4RA 1JW6A 1WW5A 4XHBA 4LBLA 2KLLA 4Y20B 3C8AA 2WKKA 1LHNA 1YTOA 2PHTA 1ZM1A 1I1EA 2GN7A 4GP0A 1G86A 1G9FA 3WUDA 1V6XA 4L8QA 1AVUA 2UUSA 3WOGA 2OUJA 4YG3A 2AREA 5GAQA 2D1ZA 5GLUA 1ZN3A 2WT2A 4OEEA 1C4RA 4YGDA 4II0A 3V0AA 3FLRA 2ZGTA 4FQZA 4H55A 5F5QA 3BRGC 4KEKA 4OZXA 1JT7A 2ZGNA 4XIKA 3WMVA 4YFZA 1ISVA 1LHVA 4AGGA 5BP5A 1WCSA 2R0HA 3PJQA 4XHXA 3SITA 3AP6A 3MALA 1MS3A 2ZGRA 5DZFA 2Q9XA 3PVEA 1NXD1 4P9XA 1AXZA 4I4SA 1AX2A 2GMPA 3C8BA 1Z7HA 3IKWA 3VWCA 2FHRA 1EV2A 3W58A 4TZDA 3BIWE 4Y22B 1S0LA 3O4CA 1W3FA 3QJ0A 4LBJA 4XIOA 3TAYA 5T54A 1O4ZA 3I29B 1ZKXA 3D6EA 4XJ8A 1NLSA 1SCSA 2EF6A 2XB6C 2YUGA 1LOFA 1FWUA 4I7IA 4FP2A 3O0XA 1QU0A 3ZUSA 4GOVA 4EFRA 1XHBA 2MC2A 3WA1A 2P3KA 3A0NA 4AGRA 1EPWA 3CA1A 3ATGA 1X50A 3NV4A 2EXIA 5F8YA 1QQKA 3BADA 1H9WA 2EALA 2P2KA 1RINA 3CRIA 4GWMA 4ZXKA 2GN3A 1HLCA 2GMEA 1DBNA 4FOVA 2AH2A 3BRDA 1R8OA 3AJYA 1C1LA 2ZMLA 1LHUA 4LO0A 5IUQA 3QIXA 1BQPA 3BX1C 3C2UA 1DJSB 1LU2A 3N35A 1MR5A 3DDBA 2WJSA 5FNXA 5BXSA 1G9BA 3I2AA 3MW2A 1RG8A 1D2SA 1T4QA 1VCLA 3FFZA 2DU0A 1XYFA 3WINA 2Y9WC 3ILFA 1YIFA 2UURA 5KXBA 2D7RA 2V5YA 3CA0A 3A23A 3VKLA 2MIBA 2GALA 5GM0A 3USUA 2ESUA 1FMMS 1ISXA 2NTDA 1ZL6A 2ZQOA 3FJ8A 1JLYA 3AXDA 3FJAA 1WUVA 3V0BA 4LO0C 4YM0A 4QD2C 2FFVA 1T3AA 4LBNA 5T5PA 2KI4A 4YZ4A 3PVOA 3FJBA 4P0JA 1TWEA 4KS6A 3H6SE 3BOOA 2PHUA 4K1YA 3V79C 3OPZA 2IWTB 3WINC 5FZZA 3R4SA 2XHLB 3BAVA 2BQPA 3ZC9A 2PHFA 2GNDA 1SCRA 4LO2C 3KQRA 3IPVB 4UW6A 3OY8A 3CU1B 3HALA 1ABRB 2LIEA 4H9WA 1ILR1 1SBDA 4GAFA 2I2SA 5GALA 2P39A 1FX5A 2G7QA 3WVJA 2WRYA 1AVWB 3E8LC 3IAGC 3CNAA 1WBLA 4XXPA 1SLBA 4PCRA 1CPNA 4I4OA 3BOKA 4IYBA 2D6OX 2PELA 1S0BA 5GZGA 1HDKA 4ITCA 2F8XC 4R9CA 4KUFA 2CYFA 5EYXA 5IT6A 3ZURA 3RS6A 3C88A 4RL7A 4JPZA 5BQMB 2ZZJA 1CPMA 3NV2A 5EG6C 2A5ZA 1GNZA 5GLTA 5JOXA 3AZVA 3H6RA 1G8WA 5CA6A 2CWSA 1GZWB 3POSA 5IK5A 1JT4A 1GV9A 3IM6A 4R6UB 4X3AA 1XQNA 1V6NA 1Z78A 4JC1A 1JOJA 4I8MA 5CNAA 4YW1A 3SNVA 3P6JA 1ULDA 1HWNB 1RIRA 2PHWA 1TTUA 4BM8A 2QYIB 1SBEA 4HL0A 1EVTA 4ISQA 3U4XA 1LENA 3N7MA 4ZJXA 4XJWA 5JOWA 5GZEA 1M2TB 4I37A 1HWOB 3S8JA 3O3QA 2DRZA 4F83A 3FGMA 1AVXB 4H04A 3AYEA 1BZWA 4KC3A 3DEBA 4LBQD 1CONA 4Q26A 2ERMA 2G7PA 3IIRA 1QOTA 2VXRA 1YVGA 1GLHA 1F5FA 1W6NB 3VSFA 5LK5A 3ZXFA 4YG6A 4FPFA 2E51A 3WHUA 3RRDA 2ETFA 3WDUA 3LLPA 4AVVA 1CJPA 1F82A 1FQ9A 4YW3A 3RMXA 1G7YA 1DYPA 1ZB7A 3AZXA 1QNWA 5GLWA 1I3HA 1IS5A 4YM1A 4D0ZA 1VAVA 2TEPA 4I1BA 5FZYA 4IZXA 3EF2A 3CA3A 3ZVXA 4YZ3A 3WO2A 5DSSB 3OGGA 1N3PA 1W6MB 1UX6A 3Q7XA 4ZFUB 1W0PA 3H0OA 2J3PA 2Q3NB 1W6OA 3RMYA 1IKQA 1JHNA 1LEMA 1TWMA 3ZXKA 1Q56A 4IZEA 2AYHA 1KITA 3FJEA 2UWCA 4P14A 4JAWA 1YRZA 1CR7A 2ZHLA 3AP5A 1MZ5A 4PC4A 4ZA3B 1JYCA 3RTJB 5DG2A 1OFSA 2W68A 1FV2A 4IONA 3APBA 2SBAA 3BWIA 1YF8B 3VT2A 4X38A 4J23B 1LGBA 2DS0A 3WG1A 1WLDA 1W6PA 3FLPA 1AFCA 3W59A 4LO8B 4LBOA 21BIA 2ISGA 1LU1A 1LESA 5I1BA 4KEIA 4FP3A 2R9KB 1HQLA 3BAOA 1IT0A 1AJOA 4EB2B 3Q9OA 1YI7A 4GWNA 3FIIA 3Q7WA 1LHOA 3VKOA 3OJBA 3VSZA 3W9TA 1N1TA 4D8HA 2QN0A 1V6IA 4XYXA 1IHKA 1VAMA 1W3GA 2H0BA 1SFYA 3Q7YA 4USOA 1HWMB 4L4HA 1J0SA 1GNHA 5JMCA 4HEVA 2VU9A 4X39A 2P34A 1IOBA 3ZXEA 3ZXLA 1S0GA 2I1BA 5BXRA 1WD4A 2AENA 2D3RA 3FUQA 3AKGA 4FPHA 3VKFC 1DQ6A 4LBMA 3VT0A 2KH2A 3WO3A 3BOPA 5GZFA 3UD9A 4YGCA 3WMUA 2Z42A 3AZWA 1BFBA 3ZXJA 2ARXA 3C89A 5HCBA 4YW2A 4G6MA 4FPLA 4QBVA 1HCDA 2A6VA 4FPJA 1KDKA 1ULGA 2LTNA 2IMAA 1SBFA 5FRAA 3ZSMA 4LBKA 4L4IA 2VW1A 4GA9A 1CVNA 4M3CB 4I6IA 1R1ZA 2JD4A 2D22A 5H9PA 4LBQA 1WW6A 2DTWA 2EXHA 3HMYA 3AJ6A 9ILBA 2GNMA 4F34A 2D24A 3JUUA 2W52A 1UMZA 3BA7A 1EYLA 3WO4A 1WW4A 3ASIA 3BAHA 4CTEA 2ZGOA 4BMBA 5T50A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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