3V0A | Genus

Total Genus 408

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	408
sequence length	1295
structure length	1280
Chain Sequence	MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex. pubmed doi rcsb
molecule tags	Toxin
source organism	Clostridium botulinum
molecule keywords	BoNT/A
total genus	408
structure length	1280
sequence length	1295
ec nomenclature	ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date	2011-12-07

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1120.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain	Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain	3v0aA02
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	3v0aA03
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	3v0aA04
3.90.1240.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Zincin-like	Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like	3v0aA01

3NF3A 3C9ZA 9ILBA 1W3GA 3O3QA 3N7KA 2ILPA 1IS5A 4KEIA 1S0DA 5CBLA 2CNAA 1DQ5A 5JOXA 1N1YA 1W6QA 1CPNA 3MW4A 1YO8A 5JDBA 1LHUA 4QKSA 1GSLA 1E0OA 3U4XA 4ZFYB 4I4SA 3OY8B 4J2YA 1DQ0A 1AX0A 4KBBA 1F5FA 5KXDA 1MVEA 4XILA 2CWSA 2GN7A 3SLIA 2ZR1B 2ERFA 4XDQA 1DZCA 1T9FA 4ZFUB 1WLDA 1JT3A 2E4MA 3B3QE 4XFUA 2IHOA 1AVWB 4GP3A 2UWAA 4I4OA 1JUIA 4ZGRB 4XTPA 3OGFA 3A21A 4M3CB 1AXMA 3IPVB 4JQ0A 1A78A 3VEQA 3RSJA 1APNA 4LBQD 3AYAA 3CA0A 4YW5A 1IOBA 1R8NA 1QOTA 3ZXGA 2BFHA 4TZDA 2RSTA 2J3PA 3H0OA 2ESUA 1GICA 1JLXA 3P6IA 3INAA 5IK5A 1IILA 4R9CA 3BAHA 1QNYA 2E7QA 2HWAA 3FGMA 2NMNA 1QF3A 1LU1A 2D1ZA 3N36A 1CPMA 2EXHA 5DZGA 1ENQA 3S8KA 1IT0A 1JTCA 1WD4A 4ISQA 1Y7BA 4OZXA 3BAQA 3WINA 1J0SA 2WT1A 3FJKA 2G7PA 2RHPA 3B9CA 2KH2A 3A0KA 4MYEA 1U0AA 1LOFC 4DRVA 3FJHA 4IQPA 1IKPA 5CA6A 1G9FA 5GLTA 1XG6A 1Z4SA 4XBNA 3AP9A 4XXPA 2AXMA 2I1BA 1AVBA 5GALA 1Q04A 3V79C 3N7LA 1UPSA 3ZSKA 4ZA3B 4JKXB 1V6NA 4XMIA 2R49A 3ZYRA 3S8JA 3WHTA 1Z0HA 4DCKC 1V6UA 1GZWA 2V5YA 3BB2A 1DLLA 1HWMB 3NV3A 3TB0A 4ZLBB 3ZSJA 2ZGUA 4R6UB 3VKLA 3DDBA 1CVNA 5IUQA 2DU1A 1JT4A 3ILAA 3FFZA 2PHRA 5GZGA 4EJ5A 1TTUA 4OEFA 2W39A 2WT0A 4FOVA 3W9TA 4XBLA 2RQ9A 1GZ9A 4D69A 1OKQA 1DQ2A 3VKNA 3PHZA 3BRGC 4YM3A 2CY6A 4P9YA 2JKBA 4XXAA 4I3NA 4P6AA 1S0JA 1LEDA 4YFZA 4XJAA 3POYA 1GBGA 1QU0A 5IK7A 2DVBA 3KM5A 1V00A 2EAKA 4I2SA 3H6RB 5GJ6A 1MS1A 1XTGA 3B01A 1II4A 1YXWA 3VWCA 2VXTI 5H9RA 1C1LA 4I4VA 2DTYA 1F9KA 3NBEA 3UJ4A 2ZGPA 2NM1A 4ENDA 4W65A 3PVEA 3WG2A 5T50A 2E7TA 1QNWA 4BPZA 3IIRA 2KM2A 3O0VA 4GA9A 1MD6A 1ULCA 3C8AA 3BTAA 4KEJA 4I4QA 3I8TA 2WKKA 2VSAA 4XE9A 4AGVA 1N3QA 2CYFA 3SH5A 4M00A 5GLVA 1G86A 1AFCA 1HQLA 3D5OA 2ZA9A 3HBWA 3I2XA 2ZABA 1CN1A 1MC9A 1Q1UA 2G7KA 4FP2A 2TEPA 4I4XA 3JRRA 2ZGQA 2KLLA 1HCEA 1WW4A 1LOAA 2ZMLA 5EYXA 1EYLA 2YUGA 2XHLA 2XG3A 1WLCA 1W6OA 1ENSA 2KI6B 4WBCA 3HOMA 3VT1A 2ERMA 3UJQA 1YRZA 1JN2P 5BQMB 1PZZA 5KXBA 1RIRA 1MS0A 3USUB 3FJBA 2W52A 1LGNA 2PHFA 3HALA 2R16A 4QBVA 1LULA 4XKIA 3V64A 1WBAA 1DQGA 1MZ6A 5GZDA 1J1TA 2JD4A 2SBAA 1S0IA 2P3IA 3TAYA 2PELA 4XJUA 1W0OA 1FYUA 4XIOA 4BLIA 1ABRB 3APBA 1LOGA 1MS3A 2ZHNA 3ILNA 1KQRA 1AX1A 3NBNA 3OJMA 2NMOA 1WUVA 3QYDA 3F1RA 3WINC 1SLCA 3ZXKA 2ZMKA 4I0YA 3T8SA 1M2TB 4Q9GA 1AZDA 4GKXA 1HWOB 2UU8A 3O4DA 3RQ0A 1ENRA 1V6KA 3NWKA 3WG3A 4ATEA 5DSSB 1KRIA 4H9WA 4YG6A 3V0BB 2ZGLA 5IT6A 5EG6C 2F2FC 4C1XA 4X38A 4D0ZA 3VKMA 2R0HA 1BA7A 1ZM1A 1DFCA 1ISWA 4GALA 2DVFA 1MS5A 1LHOA 2CL2A 4YZ5A 4LBLA 2DUQA 5DVHA 4PQ9A 3N0KA 3W59A 4ELCA 4FVVA 4FPLA 1A8DA 4K1YA 1R1ZA 3JUTA 1CJPA 4BMBA 1YBIA 1BASA 2WBCA 4R9BA 1DQOA 4R9DA 3NJ5A 1DQ6A 1JHNA 3CA1A 3AKHA 1ULDA 1W0PA 1ISXA 5F90A 4FPGA 2D6KA 3E8LC 4EL4A 3KMVA 3AYCA 4I37A 2DURA 1KJRA 3WO2A 2HW9A 4EB2B 1WBFA 4H55A 4UW3A 3A0NA 3SITA 3VKOA 2ZGKA 4P0KA 2FFVA 3C88A 5D63A 4Y1VA 4ZKTB 5GLWA 3UDAA 4JAWA 1AXKA 1LCLA 3AJ5A 3CNAA 4XJWA 1QGLA 4M01A 1LHVA 4I4RA 3K1XA 2ZZJA 1N3PA 3WV6A 1Q8VA 3UD9A 1BQPA 2GNMA 5H9SA 3WVJA 3ENRA 2DU0A 2IMCA 1MACA 1LOBA 2DYCA 2LIQA 4FOYA 4JRAA 3LLPA 2G7QA 4AN7B 5BXSA 2A7AA 2NP0A 1Q56A 4AVVA 4Z9WB 4HR6C 3ZVXA 5FZUA 4YG3A 4AN6A 4LBMA 3LTQA 4XHXA 4PF5A 2YV8A 2FDBM 1ILR1 3WDUA 4OUJA 3OPZA 4BM8A 3C8BA 4FPEA 3QLQA 3WUCA 1WBLA 1MR5A 3O44A 2EALA 1V6MA 4OEEA 1HIBA 1IHKA 1W3FA 2C5DA 2WT2A 2FFUA 4G9MA 2VY0A 1WW6A 4XTMA 4YLZA 3M2MA 1H30A 2Z49A 3FBYA 1KDMA 3IMNA 3L2YA 4F34A 1SBDA 3R4UA 1I3HA 1S0LA 1VCLA 4LBOA 2ARXA 1K5VA 3D6EA 1Z2VA 1LHWA 1BLDA 1TEIA 1UX6A 3GNEA 3ILFA 4M3CA 3ZXLA 3UD7A 2GMPA 1RY7A 3BA5A 4A7ZA 5CAZA 3ATGA 3BODA 3AZWA 3OBTA 1H9WA 1LENA 2QYIB 2JE7A 1MVQA 4CJMA 1SLLA 1JW6A 2Y9XE 4AWDA 1XHBA 2R1BA 3NBDA 1ISVA 3WO3A 4JP0A 1IKQA 3ZXJA 4YGDA 3QW5A 4USOA 3QCWA 4KS6A 2AH2A 1YVGA 5DUWA 4LO1A 3NV2A 4GOVA 2DVDA 2K8RA 1V6WA 1BFGA 3BAVA 3FJDA 3N7JA 2FGFA 3AXEA 3OYWA 4KTXA 4YM0A 2P3KA 4Y22B 1DYKA 3FJCA 2W08A 4LBQB 4U36A 5E89A 4TYSA 3CA4A 5JOWA 2JDZA 3QR5A 2PHWA 4L4HA 5BP5A 1BFFA 3RS6A 4FPOB 5GM0A 1ZB7A 3CA3A 4AYUA 3BA4A 2ZACA 1BARA 4XHBA 4HJJA 1T3CA 3RTIB 4CTEA 5F8SA 3NV1A 3PUBA 1CIWA 1DBNA 3O4AA 5B2HA 3FLTA 3AP7A 1TWMA 4GAFA 2UWCA 5BXRA 1JT5A 3M3CA 1QQKA 1T3AA 5BQUA 3ZUQA 4Y26A 4ITCA 1BLAA 1MS8A 4Z8SB 5DUXA 2W2DB 3RG0A 3CRHA 1JY0A 3UJ0A 4I7IA 4K20A 4FPCA 1KJLA 5T5LA 2KKIA 4LO7C 3CRIA 1ZL6A 3T2TA 2WSVA 1N1SA 4FOQA 3FJ8A 3RTJB 4LO2C 2JECA 1PC8B 2A6WA 4HEVA 4J2SA 3KQRA 4LO0C 3AZYA 4Y1YA 4FQZA 3FJEA 4LO3A 2WSUA 5GZFA 3AKIA 3H6RA 2A6YA 4USPA 5BVPI 5FZYA 1JXNA 1ITBA 5D61A 5AVAA 5GZCA 2ZGRA 4J2KA 3MALA 4XJ8A 1FV2A 1FMMS 1DZQA 4EFPA 41BIA 1G9DA 5T5JA 2A75A 3M3QA 5DZEA 2A97A 4UW6A 1Z78A 4X39A 4YW4A 2VUAA 3AYEA 2Y9FA 3BX1C 2D7IA 2GALA 1V6VA 3T1LA 1LOEA 5EHAA 3ZSLA 2ISGA 2W68A 1D0HA 3CA6A 4Q27A 1GZWB 3MPPG 5DG2A 1S0EA 2Q9XA 1QKQA 3O0WA 1SLBA 3CU1B 1FATA 5EYYA 1JYCA 1SR4A 1HWPB 1MZ5A 4GXLA 2JJ6A 4YW3A 4DRRA 1VIWB 3T1MA 3DEBA 3MEPA 3OJ2A 1FAYA 1ULFA 2A6XA 2DTWA 3IAGC 4YZ2A 1UMZA 4KUFA 3NV4A 4Q91A 1QQLA 1WCSA 2EF6A 1PWAA 3Q9OA 5HCFA 1QDCA 4YGEA 3USUA 2E4MC 3CRGA 4M3CF 4FP3A 2NN8A 1WBCA 4WVWA 4M3CE 4OW4A 3F62B 3FUQA 3BAGA 4WVVA 3VT0A 4OWJA 4LBNA 4AVTA 1RINA 3WNXA 2P37A 1W6NB 3RMXA 2G7NA 4I1EA 4P9WA 4G9NA 1UZZA 4YZ1A 4TLPA 1FQ9A 3AKFA 1DHKB 5DZUA 2R9KB 2ZGNA 1DYPA 4F83A 4PBOA 31BIA 3LCPA 2C9AA 1QMJA 3AH1A 1CR7A 1XZZA 1XYFA 4SLIA 1TIEA 3D4KA 3O5WB 4A7YA 3ZXEA 2XOAA 1W6PB 3AZVA 1W6MB 2GNDA 1ISZA 2OVUA 1AX2A 1M16A 4P14A 4XFSA 1XTFA 2D3SA 1LHNA 3QIZA 1CQ9A 5DUYA 4PBPA 1KITA 4ZJXA 2YXSA 4I4PA 4QBCA 3ASIA 4XIKA 4QKRA 4FGFA 2GNTA 1URXA 5SV8A 3IM6A 5BQUC 1G7YA 3ZC8A 3AK0A 3ILRA 4HL0A 4FPYA 2VH9A 4KC3A 4Q9PA 4XMAA 1VALA 3ZXFA 3PG0A 1G9CA 3M1HA 4IZXA 4RA0A 3VSZA 1JLYA 1LU2A 1FWUA 1TFMB 3WDWA 1CVSA 1DQ4A 4I96A 3O12A 1UL9A 3DUIA 2VSEA 4OWLA 1BZWA 3AP5A 4A7KA 4GWNA 1NXD1 3WHUA 1S0CA 1LODA 5BOWA 2LIEA 1ULEA 1PZ9A 2GMEA 1LECA 3WMUA 3O4CA 3FJFA 4DFSA 3I2AA 1G82A 2K4AB 3WG4A 2SLIA 4ZXKA 2GZBA 4XJZA 2IWTB 3Q7XA 3LSEA 3Q7WA 1ZKWA 5T5PA 1Q03A 1JT7A 4Z8BA 1DQ1A 2YROA 2K43A 3BADA 4YFWA 3BA7A 2GDFA 4CZSA 3BOKA 2DRZA 4FOWA 1G8WA 1B09A 1GLHA 1BKZA 1TOOA 3SH3A 5BQNA 1T4QA 2ET2A 1ZL5A 1Q8QA 3POKA 3A23A 2P23A 5BXPA 4IONA 2ZGTA 3AZZA 1HDKA 3VV1A 4IZEA 2A5ZA 1SBEA 3A22A 1LOFA 1PZ8A 3QW8A 1QOSA 3BOOA 1SR4C 1IOAA 3HMYA 2ENRA 1JYIA 1PZ7A 2ISHA 4ATFA 4OEGA 1ZN3A 2ZQOA 3A4UA 3ZUSA 2WNEA 5FRAA 2H0BA 4GAIA 1IJTA 1AVUA 1P63A 1V6XA 1S0FA 3WCSA 1XQNA 1RG8A 4Q8KA 1UN1A 2A6ZA 2RG9B 3UK9A 5F8YA 2DRYA 3SH4A 2HWMA 5FNXA 1C4RA 3W58A 4H04A 4UW5A 3POSA 2AENA 4Y20B 5L73A 4ZBVB 1SFYA 2D3RA 1V6LA 4RL7A 2PHXA 3AFKA 4HA2A 2CTVA 1CESA 1HKDA 2ZHLA 3ZSMA 1PUMB 1CONA 4LO7B 4LBKA 4DEPA 3FJ9A 3AJYA 4Y1XA 3OY8A 2EXJA 5BXTA 1VAVA 2CWMA 5FNWA 1EPWA 3SNVA 2LALA 1QDOA 1DFQA 2A71A 4YG0A 3DDAA 1YI7A 2OUHA 4ISRA 3ZURA 1LESA 5GZEA 3RMYA 4NO4A 4JC1A 1S0BA 3QW7A 3N3HA 1ONAA 5KXCA 1X50A 5E24E 2YZ4A 2ZQNA 3D7WB 3IM0A 3V0AB 2MC2A 3WDTA 3SISA 5GLZA 3IPVA 2B7YA 2P3JA 4Q26A 2Z48A 2VLCA 4I4UA 2ISEA 1ZKXA 4U2AA 3AYDA 3AJZA 3IM7A 4L8QA 4GKYA 3UL2A 1ONKB 4BOWA 1QXMA 1F31A 1WD3A 5GAQA 2D44A 2ZKNA 4Y22A 2L5XA 4BQ1A 21BIA 4LBQA 3SNMA 4AGRA 2Q5TA 4YM1A 5FREA 4Y1ZA 2ETFA 1SACA 1A3KA 2VW2A 5JOZA 5JMCA 1LEMA 5JVVA 3AH2A 4QD2C 4FPKA 5DG1A 1W6QB 4R9AA 5EXOA 4PC4A 1AJOA 4JPZA 1FMZA 4EFQA 3WMVA 3VKFC 3A07A 1VAMA 2E53A 2Y9WC 2A3XA 2WQZC 3PJQA 3WUDA 2VU9A 4FQ4A 4ZFWB 2A3YA 1EV2A 2W2DA 1AJKA 1BJQA 1YYNA 4FPJA 2QN4A 3FJAA 2E51A 4DS0A 3OBRA 4I1BA 5FZZA 1UZYA 1Q8OA 1I1EA 1ZA4A 1SCSA 2YMZA 1JQZA 3FJIA 1O4YA 3WDXA 2ZAAA 1SLIA 1YIFA 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1QOOA 4G1RA 4Q1PA 2PHUA 4IY9A 4Y24A 2MLLB 1LJ7A 1FV3A 2NTDA 2OUJA 4L4IA 1FX5A 3B00A 3HSMA 2FMDA 4YGBA 1W6PA 4EKXB 2A6VA 1W6MA 4LO1C 4EEEB 2KI4A 3QW6A 3O4BA 3UD8A 2DUOA 3BAUA 3HR9A 3M3EA 4Y1UA 3WDVA 1MS9A 3V65A 4JKQA 3AJ6A 4G6MA 1C1FA 4GP0A 4YZ4A 2FO1A 4LO8B 1N1VA 2ES3A 5BP5C 4XJ9A 2GMMA 2D7FA 4Q1RA 1H9PA 1IS4A 1HCDA 3AH4A 4I6IA 1NLSA 3ZXDA 2AREA 8I1BA 3FLPA 2DWRA 2D6PA 5EWSA 3V0BA 3ZX7A 1HWNB 3FJJA 2D20A 3FUOA 2D22A 1RITA 3LSDA 5H9QA 2XHLB 2ZGMA 1W6OB 4GOYA 3MW3A 2AQZA 3PVOA 2AR6A 1N47A 5DUUA 5T5OA 3VT2A 2FHRA 3BIWE 2ZHKA 3K3QB 1MS4A 2NVHA 2X2TA 2D6NA 5CB7A 2AUYA 5IK8A 1IS6A 1GV9A 2HZ9A 2D6LX 5DZFA 2DS0A 2DREA 1LOCA 4EFRA 3OJBA 2A70A 4DENA 1NZKA 2A8AA 3PVNA 5HCBA 3ZYPA 1V6IA 3CQAA 1VLNA 5T54A 2QN0A 3CA5A 5CNAA 5HCAA 1OQ1A 4LO3C 3FLRA 5F5QA 4K21A 2Y9GA 3WLUA 3WA1A 1DGLA 2GO2A 3VSFA 2X2SA 3BRFA 2D24A 2LTNA 3JUUA 3O5SA 2WRYA 5DXDA 1K5UA 2Z42A 4D0TA 4HANA 3C2UA 4BLJA 3IN9A 3WO4A 4AVSA 4J23B 4QD2B 1V6OA 1DJSB 4BMEA 1LGCA 3R05A 3RRDA 2GN3A 3FIIA 5KXEA 1KNMA 4J2XA 4DPNA 1GKBA 2UURA 1OFSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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