3V0AB

2.7 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/A
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0aB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0aB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0aB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0aB01
1JW6A 2V73A 1DZQA 2ZHLA 4NOTA 31BIA 4BPZA 1QDOA 1E0OA 4QKSA 1S0BA 4OEFA 2RQ9A 1GZ9A 5IUQA 4XILA 5DG2A 3AJZA 3AKIA 3FJ8A 2VW0A 4HL0A 2MLLB 4JPZA 1GZCA 4IZEA 1I1EA 1P63A 1ENSA 2JECA 1YO8A 2D44A 4GA9A 1DQGA 2ZGLA 3BWIA 3WDYA 3RMXA 3H6QA 1W0PA 2OUJA 3H0OA 5JDBA 1BA7A 4XHXA 4Q8LA 3BIWE 1XYFA 3QIYA 1GKBA 4GOYA 3BA4A 5DUUA 1MS3A 1DBNA 5CBLA 2Z42A 4H55A 2KKIA 2ENRA 3FUQA 3NV1A 2K4AB 1TWMA 2YUGA 5JMCA 3A0KA 1JT4A 4QD2B 1LODA 3C89A 2ARBA 1ULGA 1SFYA 3B69A 3VKOA 2GNMA 2BFHA 2AQZA 2VUAA 2JJ6A 2ZMKA 1Q8VA 1F5FA 1UL9A 3CA6A 1LOBA 2VU9A 1LTEA 3O12A 4XFUA 41BIA 1LEDA 1C4RA 5EYYA 1APNA 1QDCA 1V6KA 1ULDA 1N47A 1BFFA 3V0AA 4M00A 1BLDA 3V79C 4EFPA 3WINA 2YXSA 3FLPA 1CQ9A 1AJKA 4Q27A 4XTPA 2ZGMA 4I3NA 4IY9A 5B2HA 1ZKWA 3O4BA 4I1EA 3I4IA 2EF6A 2Y9FA 1MZ6A 3V64A 3ZVXA 4BMEA 3WDUA 3UJOA 4EEEB 2I1BA 4XIKA 3Q9OA 3WA1A 4Y20A 2DURA 1EV2A 1CONA 4LO2A 4ENDA 2W2DB 1ISYA 4BQ1A 3ZC9A 1ZB7A 5SV8A 3OBRA 1FMMS 3P6JA 5GLVA 4J1LA 4X39A 2IHOA 4L4HA 3AXDA 4XBQA 3M3EA 4CTEA 1YTOA 5F5QA 3MPPG 4LBQD 3WUDA 2A3XA 4Q9GA 5FZYA 5DUYA 3O5SA 2ZAAA 4AGGA 3JU9A 1WLDA 4D8HA 2DVGA 4OZXA 1N1TA 5HPZA 3TAYA 3BA7A 3RSJA 1QGLA 3O4DA 3BONA 2DUPA 3WG3A 5T5LA 5KXEA 5BQMA 1Q8OA 3IPVA 4DEPA 3RMYA 1XHBA 3WDTA 2CYFA 5E8AA 2EXJA 3AH1A 5BQNA 3APBA 1HWOB 3I8TA 4D0ZA 2ISEA 1GZWA 3OPZA 1PWAA 1N3OA 4GALA 1N3QA 3NV4A 4LO0A 1QOSA 3K3QB 4ZFUB 1ONAA 2E4MC 4I37A 5F90A 5IK5A 3FJDA 3AP7A 4ISRA 5FZUA 2D7IA 2ZGOA 4P9XA 1QQLA 1DZDA 2DV9A 4YG3A 2DRZA 2ESUA 4UW5A 1WLWA 5BXSA 3UDAA 1MACA 3N7LA 3BRGC 1AF9A 4XJ9A 5T52A 3DS9A 2UWCA 1V6VA 1CR7A 3DUIA 3JUUA 4W65A 2GNBA 4K1YA 1IS5A 4HJJA 1LOEA 1MS4A 4L4IA 6I1BA 2Q3NB 1IHKA 2FFUA 2WNEA 5CA6A 3GALA 1JUIA 1JLYA 4Y22B 2NZ9A 1SBFA 3O4OA 3WV6A 1CPNA 3T1LA 4AGRA 1LECA 3BODA 4NO4A 2NMNA 1JTCA 4WZFA 3HSMA 3CA5A 4LO3A 4LBQA 2DVBA 2FMDA 3CA4A 3AYEA 4FQZA 2R49A 1DYPA 2PHTA 3ILRA 4YZ3A 3UD9A 3R4UA 5KXBA 4LBOA 2CNAA 4P0LA 4I7IA 4H9WA 2F2FA 4JAWA 1HQLA 2VW2A 4IQPA 4Y1VA 1CESA 3WDXA 3VSFA 2A6YA 4FPOB 2JDZA 3D7WB 2SBAA 1OKQA 1NUNA 1CVNA 1LHUA 4WV8A 3UJ4A 1T4QA 3VSZA 2YV8A 5GZGA 3RQ0A 1PUUB 2A75A 1MS1A 2WQZC 1MD6A 4AN6A 3AJ6A 3OYWA 1Q8PA 1WLCA 5GLWA 2EAKA 2F8XC 3FIEA 1DQ0A 2ZGRA 4YFZA 3UK9A 3C9ZA 1ISWA 3WMUA 1TEIA 2VXTI 4YM3A 5BXTA 1X50A 1A8DA 2DVDA 2ZGSA 1W6NB 1B09A 2E7TA 3WLUA 4PC4A 4LBMA 3M3QA 4FPHA 1R8OA 1JT7A 2A6WA 4GWMA 1LU1A 1N1SA 1S0IA 2D22A 3NWKA 4LBJA 1T3AA 2QYIB 1LOCA 2EXIA 4D69A 1BQPA 4DQAA 5GAQA 2WSUA 1AVUA 1YYNA 2D6MA 4I8MA 2DUOA 1W6QA 2WT0A 2D6NA 3FJHA 2ZQOA 3QW6A 4XDQA 2C9AA 2NYYA 1HWNB 5F8YA 5IK7A 3VKNA 5T5JA 3AZVA 4OEGA 1LOFC 3DDAA 5H9QA 3BAVA 4ELCA 2JE9A 4Z9WB 4XHBA 2X2SA 4X38A 3KM5A 2AAIB 1JOJA 3N7MA 3RRDA 4TZDA 2A70A 2ISHA 2EALA 3ZXKA 3BAGA 4F83A 1JT3A 2R9KB 1SLAA 2CY6A 1U0AA 2LTNA 1LOGA 3QR5A 2LALA 2Y9GA 5FNWA 1TFMB 4I0YA 1SR4C 1F9KA 2YROA 2GNTA 3BB2A 5T50A 2A71A 4RL7A 1W6PA 3P53A 3E8LC 3DEBA 1LENA 3TC2A 1YBIA 4ATEA 3DDBA 1UN1A 1RIRA 3AZXA 3IM0A 3ILFA 2UURA 3WO4A 1HKDA 4KEIA 2VH9A 3USUB 1G9BA 4X3AA 4X37A 1GYKA 1FNYA 4FP2A 4YGCA 1BFGA 2IMCA 3VKFC 2YMZA 1J0SA 4YLZA 2AFGA 1FV3A 3ZSJA 4AVSA 4PCRA 1FMZA 1RINA 4Y1ZA 3O5WB 5EXOA 1ILR1 2A5ZA 2ZZJA 3N7JA 3BX1C 3B9CA 1ZL5A 4K1ZA 3TB0A 1TOOA 4XJUA 2ZQNA 5JOYA 3ZXEA 1SACA 4GOVA 1WBLA 1ZM1A 4PF5A 1UX6A 1VAVA 2ZACA 3VT0A 3WO2A 1GNZA 1AVWB 4GAFA 3PVOA 3ZC8A 4ITCA 3AKGA 1PC8B 3ZURA 3M3CA 4I4SA 1S1AA 1W3AA 3O0WA 1C1FA 2PHXA 2XHLA 4M3CB 1GLHA 2NTDA 2D7RA 3OJ2A 1C57A 1V6JA 1GSLA 4K21A 1TWEA 3WG1A 4FOYA 2W68A 4UW4A 1TTUA 1MS5A 1V6XA 3VUOA 2AREA 1SLCA 1DFCA 4YW3A 3VKMA 2HWAA 2MC2A 1HQWA 3WMVA 2TEPA 1LEMA 3AYAA 4AVVA 1K5VA 2I2SA 3ZXJA 5DZFA 4YW5A 1N3PA 1SZ6B 1BLAA 1IRPA 1I3HA 4K20A 4AWDA 2WKKA 2GNDA 1XZZA 2VW1A 1G8WA 2ZGPA 2WRYA 3RG0A 2NN8A 1M2TB 4P9YA 4QD2C 3T1MA 4QBCA 5KXDA 2ZGNA 2WSVA 3ZXGA 1W6OB 3FJAA 1V00A 3WZ1A 1ZKXA 4ZOTA 2A3YA 3FJCA 5EHAA 3CA1A 1BARA 2D6LX 4KEKA 1RY7A 1RMLA 3N0KA 3I29B 1DQ6A 2L5XA 2CTVA 1S0DA 1KJLA 2ZGQA 1YI7A 2VSAA 1IOAA 2ZHMA 4C1WA 2KLLA 2X2TA 1Z7HA 1IT0A 1DJSB 1Q03A 3B3QE 2LIEA 1DHKB 1ISZA 3WDVA 3VEQA 4BM8A 1DYKA 1ZA4A 5BXRA 5BYNA 5EYXA 1ZL6A 1V6LA 1HCEA 3UD7A 4G6MA 1FQ9A 1UAIA 3A07A 4OWLA 1A3KA 2BEAA 1IKQA 3AJ5A 4Q26A 3INAA 4OEEA 3LCPA 5KXCA 3A0NA 4UW3A 3DSEA 2E4MA 1HLCA 1FAYA 2VY0A 4JCKA 1LGNA 1K5UA 1JBCA 4ZKTB 2SLIA 2RHPA 1G9CA 2EXHA 4QBVA 2VSEA 1SLLA 1MVQA 1IOBA 1TP0A 1V6WA 1WBFA 1UMZA 2ZBJA 1VCLA 3BTAA 4L8QA 1WW7A 1JLXA 3CQAA 3POYA 2Q9XA 1ISVA 4WBCA 3IKWA 1KRIA 3FJ9A 1D2SA 4EB2B 3O0XA 1G86A 1ZN3A 5DUXA 3VT1A 4M3CE 5AVAA 2AXMA 2GN3A 2PELA 4Q1RA 5H9SA 2V5YA 1WUVA 1IS6A 5HCAA 3QYDA 1JXNA 9ILBA 1N1VA 2D1ZA 3OGFA 2WT1A 4OUJA 4J2KA 3QW8A 2K8RA 3WNXA 4YGBA 4AVTA 3JUTA 2R0FA 3AX4A 2GO2A 3OJMA 5H9RA 3FLTA 1YXWA 2AYHA 3PMEA 4BLJA 3BAHA 4FPYA 2VLCA 3ATGA 1YRZA 3U4XA 1DQ4A 2DU0A 1Z0HA 2D6OX 2P3IA 3OY8B 4GXLA 4OWJA 1E1HA 5DSSB 4FPGA 4YG0A 4Y20B 1YVGA 1V6MA 4KBBA 1Z4SA 3IAGC 3FFZA 4C1XA 4Y26A 4ATFA 2JD4A 4ZA3B 4I4XA 2W39A 1LHVA 4I4RA 1IS4A 3ILNA 2ERMA 1DQ2A 2NVHA 1ONKB 1LOAA 2ERFA 2E6VA 3WHUA 5DVHA 3WCSA 5GALA 1HCDA 3I2XA 3D6EA 2WT2A 3FJFA 2FFVA 1W3FA 1DQ5A 3ILAA 1D0HA 4J2SA 5DZGA 2RG9B 2A6VA 1DIWA 4Q9PA 4I4QA 3D5OA 3WG4A 3AYDA 4CZSA 4JQ0A 4XJWA 4KUFA 5GLTA 1XTFA 4G9MA 4EFRA 4YGEA 4OW4A 4QKRA 1C1LA 4FOVA 1W6MB 4YGDA 1W6NA 3BRDA 2GDFA 4KTXA 1AJOA 3JRRA 4A7ZA 3AH2A 2D3RA 1QMJA 4U2AA 1AVAC 1JHNA 2CWSA 4YW1A 5T55A 4G1RA 1ABRB 3CA0A 4LO7B 4G9NA 4XXPA 1UZZA 3KMVA 3IM7A 4II0A 5FZZA 3B9UA 2P3JA 4FQ4A 2G7KA 4IY8A 1ENQA 2DYCA 3GNEA 1BYHA 2ZHKA 3SH4A 1LGCA 4LO7C 2PHWA 3ASIA 1JT5A 4FPJA 2LIQA 1LOFA 4PBPA 1QU0A 3D3XA 5JVVA 3HOMA 1IRAX 1QXMA 1G7YA 2CL2A 1FV2A 4USOA 4I30A 2BQPA 3ZYPA 2RSTA 4FVVA 1ISXA 1AFCA 1XTGA 1YF8B 1VALA 1FWUA 3V0BA 3NBEA 2ISGA 2R1BA 1CJPA 1IS3A 3FLRA 5BXPA 3NJ5A 4J2XA 3R05A 2KI4A 3ZYRA 3H6RA 1SR4A 1QQKA 1Q8SA 4IHZA 3A4UA 1WW4A 5DZEA 2A3WA 5DUWA 4LO1C 4GP3A 1FATA 1Z2VA 5FREA 5BOWA 2DU1A 2E51A 2KI6B 2PHUA 2FGFA 3NBNA 4AGVA 3BADA 2JE7A 1F82A 1S0GA 2XG3A 3Q7WA 3USUA 4M01A 3ZXFA 1KDMA 5BQUC 1MS9A 2E7QA 2D23A 2P3KA 3ZX7A 2D43A 1BFBA 5H9PA 2MIBA 4KC3A 5D61A 3PUBA 4R9BA 1RG8A 2D3PA 5EC5A 3UJ0A 2R16A 1V6OA 4GAIA 2G7QA 1BFCA 3SH5A 1XG6A 1DQOA 4H04A 1PUMB 3AH4A 1MS8A 3IN9A 2AR6A 2XB6C 3N3HA 3AK0A 4UW6A 3ZXDA 3AZZA 1WCSA 3O0VA 3POWA 1SBDA 2VXRA 2FDBM 4LBKA 1KITA 2P34A 5FRAA 4XFTA 4M3CF 4LBLA 4TLPA 2GALA 3BRFA 3N35A 1M16A 4CJMA 1S0FA 2R0HA 4P0KA 4XMAA 4ZGRB 3WUCA 3MEPA 4LO8B 5IK4A 1PZ8A 4DCKC 3PVEA 1N4KA 4DFSA 1JN2P 2PHFA 4I6IA 3PVNA 2GMPA 2ZA9A 1HWMB 4DPNA 1YIFA 4Z8BA 2CWMA 4YZ5A 2ZMNA 4R9CA 2ARXA 3I2AA 2Y9XE 3HBWA 5GLUA 1R1ZA 5I1BA 1QF3A 4P14A 4Y1YA 4P0JA 4EL4A 5T5OA 1WW5A 3HALA 4IZXA 3IMNA 5EG6C 2GMMA 1OQLB 1CPMA 1HWPB 3QIXA 21BIA 3BAUA 2HZ9A 4FGFA 4JRAA 3WG2A 3ZSLA 4AN7B 1AVXB 1WD3A 4BMBA 1KDKA 5BP5C 4YW2A 2HWMA 3S8JA 5IK8A 4GWNA 4ISQA 3FJJA 1FGAA 1AX1A 1W6PB 5F8WA 4YM1A 4YW4A 3NV3A 2ZKNA 2D6KA 4FP3A 1W6OA 4DRVA 1GGPB 1R8NA 1T3CA 3ZUSA 2W52A 1FX5A 3FUOA 1BJQA 1HDKA 1EVTA 1GICA 3O4CA 3QCWA 1URXA 4XIOA 3D4KA 3A23A 5DZUA 4YZ1A 4XOGA 1LULA 2J3PA 4U36A 3ZSKA 1S0LA 3AFKA 2ZMLA 1JY0A 2AENA 8I1BA 1S0CA 2EIGA 3UL2A 2A6XA 2ZGUA 4HR6C 3BA5A 5FNXA 5T54A 5LK5A 5JOWA 1GBGA 4XMIA 1H9PA 2ZR1B 4FPCA 1AXZA 3AKFA 4QALA 1ULEA 2D3SA 1Z78A 4I4PA 2YY1A 2KH2A 3OJBA 1O4YA 4G6JA 4MYEA 2WBCA 3UD8A 2DTYA 4GP0A 1DFQA 5L73A 2ES3A 4FPLA 3F1RA 3ZSMA 4A7KA 3CRHA 1BXHA 3POSA 2D24A 1TIEA 2W2DA 2WJSA 3O3QA 3FJEA 1DQ1A 5E88A 1Q1UA 1RZOB 1FNZA 2XHLB 3K1XA 4HEVA 4R9AA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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