3V0BA

3.9 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 409
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
409
sequence length
1295
structure length
1280
Chain Sequence
MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords BoNT/A
total genus 409
structure length 1280
sequence length 1295
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-12-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0bA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0bA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0bA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0bA01
4JQ0A 4A7KA 1ULFA 3AZWA 5L73A 5LK5A 4OEEA 3A22A 3W9TA 4FPFA 4LBJA 4Y1YA 3AJZA 5GZCA 5BOWA 1WD4A 1LHOA 1D2SA 1YBIA 4YZ1A 4KEJA 1XYFA 5DZUA 3FFZA 3INAA 4FOWA 1E1HA 3T8SA 1G7YA 2YZ4A 1W6OA 1S0JA 4QC4A 3BRFA 1KJLA 1W6OB 3R05A 4XFSA 1N1VA 2JECA 2E7TA 4U36A 1PC8B 2L5XA 2Y9GA 4YG6A 1VLNA 3JU9A 4IQPA 1JHNA 1JXNA 1C4RA 1Q8SA 3VV1A 4GWNA 6I1BA 1TP0A 3UD8A 4LO0C 2VY0A 2V5YA 4ZKTB 1MVQA 1NXD1 3ZYRA 2K4AB 1MZ6A 4I4RA 3LTQA 2FPQA 5HCFA 5T5JA 2UU8A 1ISXA 4OUJA 1HQWA 2GN3A 3JRRA 4A7ZA 3HSMA 4D8HA 3WMVA 1JLYA 1YVGA 4LO8B 2GMEA 3WG4A 1WBAA 3RMYA 2VU9A 1G9CA 2DUPA 3T2TA 1FN0A 2DUOA 8I1BA 3DGTA 3VWCA 3F62B 3JUUA 3ZXDA 3ZXEA 4LBMA 4PF5A 4QKSA 3ZXKA 1UX6A 2VW1A 1IS6A 1MS4A 1RG8A 1YIFA 3WG2A 1IHKA 4RL7A 1SR4C 5HCAA 1M2TB 4M3CA 3WV6A 1GKBA 1EVTA 5GZGA 2FGFA 1N3PA 4HANA 4M3CB 1BFCA 3CRGA 1ZB7A 3IN9A 5BVPI 2G7KA 4HA2A 1DQ4A 2XB6C 1V6XA 1LGBA 2PHRA 1S0LA 2YY1A 1GLHA 3I2XA 5F8YA 4XBLA 1GBGA 4WVWA 4FQZA 2MIBA 7I1BA 4Z9WB 3O0WA 1UAIA 3WHUA 3VT1A 3N7KA 1O4ZA 2CWSA 4IY9A 3AH1A 4G9NA 5F90A 2ZAAA 2JE7A 3AKHA 1LGNA 2E6VA 4I96A 1AXYA 4GAIA 1QNWA 2RQ9A 2A6ZA 1SLTA 1HCDA 5DZEA 3H6RA 5DXDA 3QIZA 1DFCA 1QMJA 3WNXA 3H6RB 1PZZA 4LO2C 4WVVA 4P9YA 5T50A 3GNEA 4XZPA 3WDTA 1MS5A 1G9FA 4HR6C 3P6IA 4EKXB 1DBNA 2P2KA 1DQ0A 3A4UA 3VEQA 1CQ9A 1IS5A 1KITA 4XTPA 4Q2FA 2A97A 4YZ2A 2EIGA 3N36A 3AYDA 1PZ9A 2JD4A 3OBRA 2ZMLA 4KC3A 1WLDA 1ULCA 3QW7A 4LBNA 4I8MA 1ISZA 1DQOA 3DSEA 1JN2P 3AP9A 1AJOA 3FJCA 2MLLB 2ENRA 2W39A 3HR9A 1Q8QA 1RZOB 1S0CA 3WUDA 2OVUA 5GLUA 3I8TA 1Z78A 1TOOA 2IHOA 2D22A 4ZGRB 2XG3A 4ASMB 1QQKA 1HWMB 3NBNA 1ENQA 2JJ6A 2JDZA 3ZSKA 1B09A 3N3HA 5G00A 3DUIA 2ZQNA 5H9RA 1NLSA 3D4KA 3O3QA 3IM5A 2DVFA 2D7FA 4R6UB 2UWCA 4W65A 1A78A 4JPZA 2W2DA 1A3KA 3H6SE 2KH2A 3AFKA 4ELCA 1G8WA 2A6VA 2HW9A 2W2DB 2DUQA 3FBYA 1QU0A 3AZYA 4J23B 5BP5C 4R9AA 3DS9A 4J2XA 1BA7A 4KS6A 3CA0A 2WT0A 4I37A 4J2YA 1GV9A 3LSEA 1HLCA 4YW5A 2XOAA 1I1EA 4WZFA 3MW4A 1PWAA 4SLIA 4LBOA 4XYXA 2QYIB 1SZ6B 4YM3A 2CL2A 1JT5A 1W6NA 1DYPA 2ZGPA 2YV8A 2A3YA 3WCRA 1Z4SA 4XIKA 2A8AA 2G7NA 4QBVA 1W6NB 1I1BA 1AXKA 1LOGA 5D63A 4Y1VA 1BFGA 4ZXKA 2DU1A 1Y7BA 3IM0A 4AWDA 1PUMB 4JP0A 3K1XA 3RQ0A 2KI4A 1V6MA 2BEAA 5IK8A 5IK7A 1QQLA 1DLLA 4HEVA 3N7JA 4M00A 3BAHA 4PC4A 3VT0A 4P0KA 1LHNA 4C1XA 1AVBA 3OYWA 3PHZA 5BQNA 3AXEA 2DWRA 4DPNA 1SLAA 1II4A 2ZGMA 2C9AA 2D6NA 3AYCA 3OYWB 4GXLA 3EF2A 1ONAA 3OJ2A 1KRIA 2TEPA 1TWEA 4LBQA 2C5DA 1SBFA 4I3NA 2UUSA 3WDXA 1ITBA 2ISGA 3PVOA 4A7YA 4LO7C 3O4OA 4LBQB 3H0OA 5KXBA 1ZM1A 1TFMB 1MD6A 3OJVA 3U4XA 3CU1B 1ENRA 1W6QA 2P3KA 1V6UA 4XFTA 3LCPA 4GOVA 4YM1A 3FJBA 2D6KA 2GNTA 3SITA 5FREA 5T54A 1W6QB 4I4QA 4UW3A 1AJKA 1CE7B 3FJFA 1W3AA 1DQ5A 2ZHKA 2NTDA 1UMZA 4FPLA 2EAKA 1PZ7A 4YFWA 3TB0A 1V6NA 3B9CA 3O44A 4Q8LA 3PUBA 2DVAA 3SNMA 3ZUQA 3O4BA 1DJSB 1RINA 3ZXJA 3ENRA 3DEBA 4ENDA 2ERFA 2AH2A 5GM0A 3B00A 2DS0A 2EXKA 1UN1A 3PMEA 1QOTA 5DUVA 1W0OA 2NMNA 5GALA 2F2FC 1CONA 5DUYA 1YF8B 2BEBA 2Q5TA 3NBCA 2R1DA 2W08A 1X50A 5CA6A 1VCLA 1FV3A 3AP6A 1HKNA 3W58A 4YW2A 1W6MB 1Q03A 3WCSA 3FJKA 2VUAA 1N1SA 2D1ZA 1BQPA 4GALA 1L2HA 1YXWA 4YFZA 3FJJA 4DCKC 2FMDA 3WZ1A 3AZXA 3C2UA 3LLPA 4G1RA 1LENA 4LO1C 4JAWA 4P9WA 3P53A 1UL9A 4XILA 3ZSJA 1DQ6A 4GP0A 1CN1A 1GSLA 1MS8A 1TTUA 5GLVA 4HJJA 1F31A 2WNEA 3ATGA 2UWBA 2FO1A 2A6YA 5GZDA 3POKA 1G86A 3FUOA 2A75A 1LOCA 4TYSA 1IILA 2YROA 1JTCA 3ZX7A 4LBQD 2FFUA 3KM5A 2G7PA 4FPEA 2AYHA 2AAIB 1FQ9A 4Y20B 2ZQOA 4ZBVB 1ZKXA 1W0PA 1JYCA 4YLZA 3O0XA 4X3AA 4I4VA 1VAVA 1HWOB 3O0VA 1U0AA 4M3CF 1LEMA 3R4UA 3LSDA 3O12A 4Y1XA 5GLZA 4GA9A 1UZZA 2ZGKA 2Z49A 2ZGTA 1JYIA 3AX4A 1FMMS 1BXHA 2AR6A 2CYFA 3AJ6A 4ZOTA 4USOA 3ZXGA 1FMZA 1AXMA 2LTNA 1FNYA 1SACA 4IYBA 3CNAA 3SH5A 4EFQA 3DDAA 1APNA 3POSA 3A0KA 1IKQA 4OWKA 3BODA 1CPMA 1QNYA 1DIWA 2ARXA 3NV1A 4X37A 3E8LC 1TWMA 5DUWA 4TLPA 4J1LA 3BA7A 2E4MC 5IK4A 1KDMA 4J2KA 3ZYPA 1J0SA 3MALA 2HWAA 3PVNA 1NZKA 3AJYA 4AVTA 1FATA 2Z48A 2D3PA 2LALA 3QYDA 3NF3A 1WLWA 4YGCA 1ZKWA 1CIWA 2R0HA 2IMAA 3ZURA 3A07A 5H9PA 3C88A 2DVBA 3MPPG 1GZWA 2SBAA 3IPVA 1JT3A 3CRIA 3HN1A 2Y9WC 3FJDA 3RSJA 2WT1A 1FWVA 2ISEA 1GZWB 3IPVB 4XJZA 3CAHA 1NUNA 3AK0A 2D44A 5JLVA 3NWKA 3CQAA 2EXHA 3V65A 3BOPA 1FX5A 4ZFUB 2DV9A 1LOBA 3A21A 1SLCA 4Q26A 4Q9PA 4M3CE 4ZFWB 2ZR1B 5JMCA 1VALA 2QN4A 4QD2C 3AZVA 1QGLA 1MC9A 1JY0A 5GAQA 3L2YA 5H9QA 1DQGA 4XJ9A 4OZXA 3V79C 1DHKB 2XHLA 4WBCA 3JUTA 4YZ5A 4P9XA 1LOAA 2XHLB 4YM0A 2R0FA 3RRDA 3NV4A 5IT6A 3IM7A 3C89A 2JE9A 3UJ4A 5GZEA 1S0DA 4Q91A 2A6WA 5BXSA 4YW3A 1SBEA 1CESA 4XTMA 1JUIA 2P39A 1IKPA 1JQZA 3ZSMA 5BYNA 1RY7A 5FZYA 4F83A 4FPCA 1DYKA 2EALA 2GN7A 1YI7A 1CJPA 2SLIA 2AREA 1XZZA 1BASA 2DU0A 1S0FA 1GZCA 3BRDA 4FPOB 1AVWB 1SCSA 2W68A 4DRVA 4LBKA 1URXA 2D23A 1LHWA 2NZ9A 4K21A 1FWUA 1LU1A 5E8AA 3WDUA 3N0KA 3O4DA 1QOSA 2WBCA 2D7RA 3KQRA 1BLDA 3WA1A 4NOTA 4H04A 4LO7B 3WINC 3OGGA 3B01A 2D3SA 2M49A 1M16A 3O4CA 1SLBA 4DQAA 2NYYA 5DZGA 1N3OA 3C8BA 3T1MA 2ET2A 3ZSLA 4BLJA 4I4XA 4I7IA 1UZYA 4JKQA 4FPKA 3IMNA 4EL4A 1IRAX 3UJOA 3POWA 3M3CA 3WO3A 2ILPA 1FYUA 2Y9FA 1V6VA 2PHFA 1W6PA 5E88A 1LTEA 2A3WA 3FGMA 1ZL6A 2CTVA 4ATEA 1LECA 3P6JA 1SCRA 1DQ1A 4OWLA 4I1EA 1W6PB 5IK5A 2DVGA 4I4SA 3QW5A 4XBQA 4KTXA 5BQMA 2ZGQA 2Y9XE 1DFQA 1D0HA 2ZMNA 1GGPB 4P0JA 3DDBA 4ZLBB 5BQMB 1H30A 1DZCA 4EFRA 1BLAA 4NO4A 2NN8A 2VXTI 1UPSA 4Q1PA 1JLXA 2DVDA 2P23A 3ILAA 4AGVA 4LO1A 3QW8A 3OY8A 4YM2A 2K8RA 3MEPA 4DRRA 4XXAA 1OQLB 3OGFA 3WMUA 1S1AA 4KEIA 3F1RA 3OY8B 4I4UA 3RMXA 1N3QA 4XMAA 3SH4A 3WG1A 4FQ4A 2LIEA 2ZHMA 4EFPA 2ERMA 1KDKA 3AJ5A 3AKGA 1HIBA 1ZA4A 1N1YA 5DUUA 3BA4A 4EEEB 2D3RA 3Q7YA 2NP0A 4Z8SB 1C57A 4IHZA 1GZ9A 1WW6A 1ABRB 1DZQA 1FV2A 2D6PA 2NVHA 1LOFA 1GANA 1H9WA 1BARA 2HWMA 2ZGRA 1G82A 3RTJB 3WUCA 4R9DA 1RMLA 4XHBA 4RA0A 3VKMA 1HCEA 2OUHA 3O5WB 4QALA 4QO3A 3UD9A 1QDCA 3AZZA 3S8KA 1HKDA 3M2MA 1SBDA 3BAQA 3RG0A 1Q8VA 3BOKA 2Q3NB 1G9BA 3IKWA 2PHUA 1JT7A 5JOWA 3M3EA 3PG0A 4QKRA 3QW6A 2I2SA 3B9UA 3V64A 3UDAA 1ISVA 3Q7WA 2E51A 5EC5A 1FNZA 1QXMA 1Q8PA 5GJ6A 4AVVA 5E89A 4UW6A 2FHRA 3V0AB 4AGRA 2P3JA 1R8OA 3CRHA 3Q9OA 1UKGA 2OW4A 4YW1A 1AVUA 3BWIA 4LO0A 1SLLA 4XXPA 4EJ5A 3QIXA 1KNMA 2VW0A 1AZDA 1C1FA 2ZGSA 3TC2A 1IS3A 3I4IA 1IS4A 1F5FA 4UW5A 5DG1A 1JBCA 2IMCA 3FLTA 3HMYA 4XIOA 2I1BA 4U2AA 2HYKA 4I4OA 2FDBM 3UJ0A 2GDFA 4ITCA 3NBEA 2GNMA 4XE9A 4H9WA 1W6MA 3UJQA 2CNAA 1T9FA 2ZHLA 4FPJA 2X2TA 2ZGNA 1WBLA 1JOJA 1LJ7A 5KXEA 4BMEA 5I1BA 1PUUB 4IONA 3WDYA 2H0BA 2W52A 2R49A 5GLTA 4KEKA 5F8SA 4PBOA 4I0YA 4XFUA 3CA3A 2GMPA 2A70A 4XDQA 2ISHA 1ISYA 1CPNA 2P37A 5BXTA 3POYA 3WG3A 4P0LA 2KLLA 3N7LA 5FNWA 2ARBA 4I6IA 1SR4A 1SLIA 2P3IA 4FPGA 2A7AA 1YRZA 3BONA 1BFBA 4ZFYB 1MVEA 2QN0A 1CVNA 2WQZC 4Y1UA 3BAOA 1GNHA 3ZXLA 4Y20A 4G6JA 3N7MA 4L4HA 1Q8OA 4XMIA 2HZ9A 3NV3A 5CAZA 4QD2B 3IM6A 5F9TA 1TIEA 4YZ3A 4GOYA 1BZWA 2YXSA 1V6IA 4Q1RA 1CR7A 2F8XC 2ESUA 3USUA 1OKQA 1W3FA 1GICA 3TAYA 2DURA 1VAMA 5JOYA 2KI6B 4ISRA 2PHXA 3USUB 1HWNB 3Q7XA 2K43A 3VT2A 2VLCA 1S0IA 4YGEA 3WLUA 1J1TA 2WLQA 4Y1ZA 1FGAA 1V00A 2NMOA 3CA1A 3I2AA 4M01A 4DS0A 1LOEA 2DREA 3AP5A 1RITA 1E0OA 9ILBA 2DYCA 3NV2A 5H9SA 4LO2A 2PELA 3QLQA 2ZBJA 3WVJA 1KJRA 1Q1UA 3M3OA 1AX2A 4YG3A 1ULDA 3APBA 1C1LA 3BOOA 2ETFA 3D5OA 4FOYA 2J3PA 3AKFA 2EXJA 3UK9A 4CTEA 3D7WB 2CY6A 4I4YA 1HWPB 4AYUA 5KXCA 3BIWE 3I29B 1LCLA 1R8NA 2Z42A 3WINA 3IAGC 4PBPA 1ULGA 4OWJA 4IY8A 1EYLA 5CBLA 1S0BA 1G9AA 4LO3C 4IZXA 1Q04A 2D43A 5CNAA 3T1LA 3VKFC 3A23A 2WRYA 3ILFA 3A0NA 3O49A 1H9PA 4ZA3B 4AN7B 3BADA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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