3V0BA

3.9 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 409
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
409
sequence length
1295
structure length
1280
Chain Sequence
MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/A
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 409
structure length 1280
sequence length 1295
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-12-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0bA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0bA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0bA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0bA01
3O4CA 1WW5A 3HMYA 1MS1A 2VU9A 4AGVA 4P0LA 2EIGA 2H0BA 2WKKA 1SBFA 3D4KA 2YUGA 1WCSA 1LU1A 1TWMA 1WW4A 2GNDA 4IYBA 1KRIA 2GMMA 4XIOA 2CNAA 3BRGC 4I8MA 1SR4C 4QBVA 1F82A 41BIA 5EWSA 3BA5A 5EG6C 1Z4SA 3CQAA 2XOAA 3AZVA 4X3AA 5DUYA 4PCRA 3WG3A 3ZXKA 2GNTA 4JAWA 1GICA 5E88A 3CRIA 3WHTA 4KBBA 1XHBA 1AVAC 4M3CA 1T9FA 4GA9A 3MW2A 1XZZA 1KDKA 1S0IA 4Z8SB 5FNXA 4RA0A 2A3XA 2ARBA 3A4UA 2D6OX 5JOWA 3CA5A 2IMAA 2A7AA 2EXJA 4C1WA 4ZLBB 1VALA 2HWMA 1YO8A 2EALA 1G9CA 3MW3A 1LHUA 4R9BA 1VLNA 5T5LA 3JRRA 4I4PA 4YW5A 4KEJA 2ERMA 4D69A 2XHLA 1Q8OA 1DLLA 5T5JA 1AVWB 1FWVA 4YW1A 2GALA 3Q7WA 3IMNA 3BA7A 1KJLA 1LOGA 4P14A 3RRDA 3QW7A 4YZ3A 2PHWA 2UWBA 1IKQA 3NBNA 1S1AA 5BQMB 3DSEA 1W6OB 4JQ0A 4FOVA 3HOMA 4J2SA 2GNMA 2ZZJA 3BONA 4GXLA 2IMCA 1GANA 3FLPA 4LBQB 2A3WA 2ZMNA 1IOAA 4DEPA 3NV4A 3UJOA 2QN4A 1GYKA 3A0NA 3WOGA 1MS5A 3BOOA 1GZWA 4I0YA 2F2FA 1QOOA 4FPOB 1DZCA 2FHRA 2NZ9A 1IKPA 1LOBA 4QO3A 3MPPG 3AKFA 3IAGC 1MS8A 2WNEA 4U36A 1AVXB 1DQ0A 2DUQA 4YZ1A 1DFQA 1DQ2A 3VKFC 1SBEA 1V6LA 2AH2A 2DURA 4I4YA 1MS4A 2D6NA 4YFZA 4XYXA 1JT5A 4QD2C 3P6JA 3NBDA 1NZKA 1QXMA 3WG4A 3WINC 4LO0A 1BASA 4ZFUB 4PF5A 2V5YA 4J2KA 1VCLA 1BJQA 2GN7A 1BFBA 2YROA 5BXTA 3OGFA 3QW8A 1BFCA 1W3AA 3WNXA 4HJJA 3AH2A 2ZQOA 1QQKA 3OGGA 1PWAA 4A7ZA 5KXDA 4ENDA 1RINA 2LTNA 3KQRA 1N1SA 1CIWA 3N3HA 5AVAA 3AKIA 4LBLA 3N7KA 1CVSA 2R1DA 5FREA 5BQNA 3CRGA 2E4MC 5KXEA 4I4RA 1Q8VA 3CA3A 1TTUA 1PZ7A 2ZHMA 3WCSA 1DIWA 3USUA 3M3CA 2W39A 1FV3A 3QYDA 2WQZC 2VSEA 3SH4A 4I1BA 5T5OA 3AJ5A 4Y1XA 3ZUSA 5GZDA 3AFKA 4KEIA 3TC2A 1YTOA 3OBRA 3QCWA 2ZKNA 2YXSA 2D6MA 2RSTA 2ZGTA 2DREA 4YM3A 3O4OA 1JUIA 4AYUA 3PJQA 4ZFWB 2OVUA 4OEFA 1W6QA 2ZGLA 4EFQA 2BEBA 2X2TA 2D7RA 3AP9A 4TZDA 5F9TA 1Q04A 1T4QA 4KTXA 2HWAA 5GLWA 3KM5A 5D63A 2DVGA 2NTDA 2M49A 3ZURA 2P39A 4LO1A 3M1HA 1JOJA 3V0AA 3AP5A 3VT2A 2PELA 2VH9A 3AJZA 3UD7A 1G9BA 4YGDA 2A6ZA 4JC1A 1BA7A 1KNMA 2UUSA 1HWNB 4J2XA 2EXHA 5FZUA 2A8AA 2W08A 3VKOA 1QDCA 3OJMA 2WBCA 1SLLA 4FVVA 3WCRA 3C8BA 3VUOA 5G00A 2AUYA 3FFZA 3D7WB 4Y1UA 4M3CB 2D24A 4UW5A 3Q7XA 1FAYA 2D3SA 3BIWE 1YRZA 1FYUA 1YIFA 4FPHA 1JW6A 1WBLA 1BFGA 4YOLA 3C8AA 4XFTA 2CWSA 2ERFA 1IHKA 4Z8BA 3N7MA 3NBEA 4XJZA 2ISEA 2DS0A 2Z42A 2LIEA 4M3CF 1I3HA 1S0EA 3AZXA 2P34A 5GLTA 2XHLB 3K1XA 4QALA 1UZZA 2JD4A 3M3QA 5EXOA 1UMZA 1ENSA 3D6EA 4OEEA 2G7KA 2JJ6A 4IY8A 5B2HA 1BXHA 6I1BA 3QIYA 1C57A 1JY0A 3DUIA 2NMNA 2ZA9A 1DQ6A 4XMAA 1ULDA 1PZ8A 1LEDA 1G7YA 2NP0A 3LLPA 2MIBA 2EAKA 4XE9A 3SITA 1HQLA 5SV8A 3NJ5A 4LBOA 1ZL5A 2ZGPA 3S8JA 1H9WA 3N7JA 4YM2A 1WLCA 2HZ9A 1ZL6A 3BWIA 2BFHA 1JYIA 1UZYA 4Q8KA 4FOYA 3D5OA 4R9DA 1SZ6B 5E8AA 5CBLA 2CL2A 1W0OA 1GZWB 4JKXB 1K5UA 3LTQA 4FOQA 5BP5C 5F8SA 3WG2A 4OZXA 4J23B 4X37A 5BQUA 2D3PA 5H9PA 1A3KA 2ZHKA 3ZSMA 1EVTA 3ZSJA 4I37A 4XOGA 1ZKWA 3FIEA 3ASIA 3B69A 1JLXA 3ZXGA 1V6UA 3AYEA 3CRHA 1UX6A 4IY9A 1QQLA 3BAHA 3UJ4A 21BIA 4ATFA 3WMUA 4LBKA 4XBNA 2C5DA 1TWEA 4PQ9A 2Y9GA 1R8OA 3SLIA 1CJPA 4LO7B 1BFFA 7I1BA 2YZ4A 3GNEA 1ENQA 3O44A 3AZWA 5BOWA 2ZGQA 4I4VA 4M3CE 2D6PA 1JLYA 2YV8A 2D7FA 5E89A 3UJQA 4XHBA 4YW3A 2TEPA 2E7QA 1ENRA 2PHTA 3L2YA 3LSEA 2A6XA 4Z9WB 3ZC9A 2WSVA 1Q8PA 3BAUA 3C89A 3USUB 3WO2A 1K5VA 1LENA 1ISWA 1Q03A 3NBCA 2VW1A 1UAIA 2WJSA 3POKA 3FJAA 4Y1ZA 5IK8A 4BLIA 3A07A 1TIEA 1FWUA 1Z0HA 31BIA 3AYCA 4OEGA 2J3PA 2DUPA 2NVHA 3UK9A 1HIBA 1BLAA 4L4HA 1SCSA 5GLUA 3AH4A 1LCLA 2UWAA 1BZWA 4F34A 1V6WA 1W6QB 5GZFA 3A21A 3NV2A 2CYFA 4F83A 2PHFA 5BVPI 3O3QA 2EF6A 1EPWA 3ZSKA 2GMPA 4ZOTA 1F5FA 3V0AB 1T3AA 5E24E 2P2KA 2D7IA 2SBAA 4XILA 4J1LA 1CE7B 4DRVA 3O4AA 4PC4A 3UD8A 3Q9OA 4CTEA 3V64A 2VW0A 4XJAA 3WZ1A 4GP3A 3AKGA 1G9AA 1QU0A 3CA4A 3IIRA 1BKZA 2DTWA 1ISXA 1AFCA 3AXDA 2JE7A 3AXEA 3B00A 2D22A 1IS3A 3JU9A 3AJ6A 4K1ZA 2A6VA 1FMZA 1FV2A 4HEVA 1EV2A 2IHOA 5DXDA 1I1EA 1YVGA 3I2AA 5IK4A 3HBWA 3OJ2A 3W9TA 1Z7HA 3WO4A 4D0TA 3IPVA 2XB6C 3FIIA 4XTPA 4YGEA 2ZMKA 4I30A 3AYAA 3V79C 4DQAA 2AENA 5EYYA 3CU1B 2DYCA 3ILAA 3O5SA 4P9YA 2Y9FA 2JDZA 4IHZA 2DRZA 4UW3A 1YBIA 1NUNA 3T1MA 5IK5A 1DYPA 3C2UA 1C1FA 3ILFA 2R49A 3W58A 4JRAA 1CESA 5DUXA 1S0DA 5DG1A 5FRAA 3H6RA 5JVVA 2VSAA 3ZXLA 1WW7A 5DUVA 3MW4A 2GO2A 5D61A 1QDOA 1R1ZA 4QKSA 4GKXA 2HW9A 2ISGA 1RMLA 1CVNA 5FNWA 4HANA 1QOSA 4RL7A 5JOXA 3BOPA 3MEPA 1XQNA 3OJVA 2Z48A 3FBYA 1G8WA 1QKQA 1V00A 3QLQA 1II4A 2WT0A 1ULFA 1V6MA 5HCFA 1LHWA 2P3KA 4ISQA 1Z78A 3AP7A 3INAA 4GOVA 1H9PA 1WLWA 5DZFA 4EEEB 1N3QA 5F5QA 2ES3A 5IUQA 4Q27A 1GZ9A 1N3PA 1TFMB 3I29B 4XFSA 1IJTA 4JKQA 2I1BA 3IM5A 3VT0A 1GNHA 2ZHLA 5JLVA 3WV6A 4XKIA 1SLIA 2A70A 1DQ4A 1LOFC 1V6OA 2VLCA 1G86A 3AYDA 3H6QA 3M2MA 3POYA 5T50A 2AYHA 5T54A 3ZVXA 1ZM1A 4LO2C 5L73A 3PMEA 5JMCA 4XJ9A 4DFSA 3T8SA 1T3CA 4QD2B 4DRRA 1ONKB 2FPQA 2D6LX 4PBPA 3ZUQA 1JT7A 4AVSA 2FFVA 3CAHA 1DZDA 1LGCA 5BYNA 1WD4A 2AFGA 3O12A 3RG0A 3BAGA 3ZYRA 5DG2A 4AGRA 5T55A 4P9XA 1QNWA 4I1EA 5GJ6A 2ISHA 2A6YA 1TEIA 3ZYPA 2ENRA 4GAIA 1F31A 2UU8A 2R1BA 4IZEA 1G82A 4EL4A 2D43A 2FMDA 4IZXA 4G1RA 1GKBA 1OFSA 4DPNA 5CNAA 1IRPA 3F1RA 2A6WA 4GAFA 1D0HA 4H9WA 2DVAA 5JDBA 3BAQA 3RQ0A 4SLIA 4TLPA 5GZGA 4W65A 3SH3A 1E0OA 2Q5TA 1J1TA 3AZYA 5HCAA 2BQPA 1RZOB 2Q3NB 1FN0A 4I4OA 1RY7A 3VKMA 4LO3A 4I2SA 3QW6A 3FUOA 1AVBA 3WA1A 2B7YA 4ISRA 2I2SA 3WDVA 3AX4A 4G6JA 4K20A 1SBDA 4GP0A 2MLLB 2G4IA 3IM0A 2L5XA 4YM0A 1LTEA 1WLDA 5F8WA 4HA2A 3M3EA 4Q1RA 4UW6A 2FO1A 1SR4A 1ULGA 4BM8A 2D1ZA 4ZGRB 1VAMA 4AVTA 3UD9A 1Q1UA 4I4QA 4NOTA 4Y20A 3T2TA 3O49A 2FFUA 3T1LA 2JECA 1PZ9A 3R05A 2D3RA 1CPNA 3UJ0A 3IPVB 3AKHA 3OYWA 4AN6A 4Y24A 3F62B 4ZFYB 4PBOA 1AVUA 4YM1A 2VXRA 1LECA 3WDUA 4WVWA 1HCEA 1N3OA 1FQ9A 1QNYA 4OWJA 2CTVA 4EJ5A 5GLZA 2G7NA 1IS4A 4BMBA 2R16A 4Q91A 4BPZA 5DSSB 2DVDA 1Q8QA 4Y22A 4I4SA 2JE9A 4ASMB 1WBAA 2A71A 3POWA 2RQ9A 1A8DA 1JYCA 1TOOA 4Q1PA 2E53A 1JQZA 4DCKC 1MD6A 4FQ4A 3OPZA 3FJEA 3H6RB 3P6IA 3O0XA 3W59A 4I6IA 4G9NA 4ZBVB 2NM1A 4Q26A 2ZGNA 4GOYA 2F2FC 2K43A 3GALA 1FNYA 3H6SE 3ENRA 3B9CA 4LBMA 4JCKA 3ZX7A 1N1TA 1MZ5A 2HYKA 3RTJB 3A0KA 3WMVA 1ISZA 1G9DA 4XTMA 3WVJA 3PVOA 4KC3A 1P63A 1MR5A 2X2SA 5GZCA 1M2TB 3E8LC 1ISVA 2EXKA 4XHXA 1C1LA 1JN2P 1OKQA 2OW4A 1W3GA 3BA4A 4DS0A 1SLCA 3D3XA 4BMEA 4D8HA 2ESUA 4CZSA 2P3IA 4YZ2A 3QIZA 5KXBA 5EYXA 1BLDA 1CQ9A 4LO7C 3QR5A 2WSUA 2SLIA 4OWLA 1AZDA 4OWKA 4P0JA 3HR9A 2QYIB 3AP4A 1DJSB 3QW5A 1YXWA 3AH1A 5BXRA 4YG6A 3C9ZA 1B09A 1W6NA 2A5ZA 2GZBA 3PG0A 2ETFA 1Q8SA 1CN1A 3BTAA 3ZXFA 4AVVA 4U2AA 1MVQA 3WLUA 3WINA 4XJ8A 1Q56A 4YGBA 1NLSA 3VSZA 1WW6A 3WO3A 3PVNA 2AQZA 4XJUA 1DQOA 4Y1VA 1MACA 1UL9A 3BADA 2ZGKA 4FP3A 9ILBA 3KMVA 1DBNA 2VW2A 2AGSA 4UW4A 1WBCA 5D62A 4FOWA 2OUHA 1AJOA 1LU2A 1LOFA 3QJ0A 1XYFA 1A78A 1DQGA 4QBCA 1F9KA 1DHKB 5I1BA 4AN7B 1HCDA 3WG1A 1MS9A 1OQLB 4WBCA 1DZQA 2GDFA 2E4MA 4FPGA 1FGAA 1GZCA 3FJBA 2W2DA 5DVHA 3FUQA 3LCPA 1JTCA 2VXTI 1IRAX 2NYYA 1S0FA 5IT6A 4LO1C 5H9SA 4EKXB 3TAYA 1S0LA 2ZR1B 1LESA 4EFRA 2WRYA 1UKGA 3H0OA 4XIKA 2NMOA 1N4KA 4XDQA 4X39A 1EYLA 4XJWA 3IKWA 4L8QA 3IM6A 3O0VA 3ZXDA 2ZGSA 3QIXA 4BLJA 1V6XA 3FJ9A 2DVBA 3A22A 2QN0A 2E51A 3HN1A 1RG8A 3N36A 3V65A 3FLRA 3FJHA 2KI6B 2R0FA 1WBFA 3O4BA 4USPA 1S0JA 1KJRA 5GAQA 3UL2A 1AXKA 3ZXEA 4A7YA 1ZN3A 3V0BA 1N47A 3AZZA 1LJ7A 4H55A 1AXYA 2GN3A 1W6MA 4WV8A 2CY6A 3I4IA 4KUFA 1LEMA 1H30A 4XXAA 4YGCA 4AWDA 4FP2A 1HDKA 4Y20B 3FJKA 3OBTA 1O4ZA 4GWMA 1W3FA 4XFUA 1DYKA 4K21A 2AXMA 5EC5A 3AK0A 3FJJA 3OYWB 1LOAA 4ELCA 1YYNA 2DTYA 4YLZA 2K4AB 1S0CA 3B3QE 4MYEA 4Y26A 4USOA 4Y22B 3APBA 2YY1A 1PZZA 1DQ5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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