3V0BB

3.9 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/A
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0bB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0bB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0bB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0bB01
3ENRA 3NV3A 2UU8A 4IZEA 4EEEB 2NYYA 4PC4A 2XG3A 1JT7A 1S0JA 1Q04A 3UD7A 1ZM1A 1ZB7A 1RINA 1DQ0A 3FFZA 1FN0A 3ZXKA 4QKRA 4Q26A 3CA4A 4FP2A 4YW2A 1ULGA 1ISXA 4WBCA 3ZURA 1S0EA 3WNXA 4J2YA 3Q9OA 1MVQA 1S0IA 2D7FA 3IAGC 1Z4SA 2E4MC 3M1HA 1I1BA 3A21A 1KJLA 4I1BA 4XJ8A 4X39A 3AZVA 1XQNA 1LHOA 3W59A 2JKBA 3VT2A 1LHVA 3UJOA 4QBVA 4YM0A 1G82A 4KBBA 2UUSA 2GN3A 1WUVA 3BAUA 1LJ7A 2FDBM 3E8LC 1D2SA 4LBQD 2AYHA 5E24E 4Y1VA 3APBA 3UDAA 4AVSA 3ILRA 5JVVA 1QNWA 3N3HA 3FGMA 5BP5A 1N1YA 2G7NA 1UZZA 2RQ9A 2ZGTA 5EYYA 2ZKNA 3CAHA 3VKFC 3HMYA 3INAA 2F8XC 2HYKA 3O3QA 2ZACA 1W6QB 1A78A 1VCLA 4DQAA 3LLPA 2GMPA 1K5VA 2QN0A 1ILR1 4AVTA 4GOYA 1W0OA 2X2SA 3A0KA 5AVAA 1LU2A 3O44A 4LO3C 2ESUA 5L73A 2ET2A 5FZZA 1C1FA 3BADA 4D0ZA 4Y20A 4LBKA 4L4HA 2P2KA 2AXMA 2I1BA 2VLCA 4XJWA 4X38A 5F8YA 4HJJA 2DTYA 3T8SA 4W65A 5DUVA 5GZDA 4IY8A 5F8WA 5IK4A 1TOOA 3IM7A 3MALA 3FUQA 2ES3A 3ZUQA 1G9BA 4WVWA 4KUFA 5H9QA 2HW9A 1LOAA 1AXZA 1JQZA 1I1EA 3POSA 4JRAA 1LULA 3IM6A 1N1SA 3ZYPA 3QW8A 1BFCA 3AJZA 2WT1A 3CQAA 2ZHLA 3I2XA 1HQWA 1LU1A 1WW4A 1ONAA 2FHRA 1WD3A 2FFUA 5JOZA 2W68A 1AVAC 4EFRA 2LIEA 1TIEA 3FLRA 4ATEA 4PQ9A 5CBLA 4TZDA 3QIXA 3BOPA 1C4RA 1H30A 1T9FA 4DFSA 2DUPA 1DZQA 4UW5A 4M01A 4I0YA 4FPGA 3JRRA 2DRYA 2DREA 1R1ZA 1OQLB 4LO7C 3SH5A 3O0WA 4AWDA 1UN1A 3AP7A 2HWMA 4I8MA 1G8WA 1CE7B 2K4AB 2OVUA 2E4MA 5B2HA 4XFTA 1GBGA 1LOEA 5FNWA 1AXKA 5JMCA 1HCEA 4M3CE 3F1RA 4Y22A 1H9WA 2E53A 2F2FA 1Q03A 5GZGA 2D44A 3CA1A 5H9SA 5FZUA 3SITA 1EYLA 2YXSA 1DQ4A 2UWCA 1QQKA 3BAVA 2P23A 2XHLB 2ZGRA 4FQ4A 1M2TB 3S8JA 3NF3A 2V5YA 3I2AA 2DURA 2IMBA 3WDTA 1LOFC 1BKZA 2P37A 4UW3A 5I1BA 1PC8B 1WW5A 2Q9XA 2ZQOA 2VSAA 1IHKA 2ZGQA 4XJAA 3POKA 2ZMNA 3AH2A 1S0CA 4YW4A 1AXYA 2AQZA 4XE9A 5H9RA 1V6UA 4MYEA 5KXDA 2PHXA 4LO3A 1BLAA 1MC9A 3WUCA 2GALA 4Q8KA 6I1BA 4Y24A 2XB6C 1ONKB 4I4PA 1V6JA 2WT2A 3FJ9A 4H04A 2D3SA 2A6YA 2NMNA 2A71A 1BQPA 1KDKA 1N47A 5T52A 4BLJA 3BAHA 1QOSA 4I4RA 4YFZA 2VW2A 1S0FA 3QLQA 1JT3A 3NBDA 4Y26A 3N35A 2BQPA 5EWSA 4XXPA 1HWOB 1G86A 1QF3A 2Z49A 2WJSA 3AP6A 5EHAA 1I3HA 41BIA 31BIA 2YUGA 3WA1A 3RTJB 3RSJA 3VSFA 3C8BA 1W6OA 3HOMA 3ZC8A 4KEJA 1V6MA 1MS0A 3N0KA 5GM0A 2DUOA 4QD2C 3MW3A 1FGAA 4IONA 3DDBA 4GA9A 3MEPA 4G9NA 3WUDA 3O5WB 4AGRA 2VXRA 1CN1A 1SR4A 1Q8OA 3CA6A 1DYPA 4DRVA 1AJKA 2GMEA 3RMYA 2WBCA 2ZQNA 4M3CA 4DS0A 2FGFA 3WMVA 1WD4A 3PG0A 3D3XA 3RQ0A 1DZCA 1HQLA 1S1AA 4P0LA 5T5LA 3OBRA 5DUYA 2RG9B 1YXWA 2V73A 1LCLA 2EXHA 4I4YA 1ISYA 3IKWA 4ATFA 1FV2A 2ZA9A 3CRIA 5LK5A 2D6PA 1D0HA 2MLLB 3BAQA 4P6AA 2NM1A 2A6WA 2AR6A 2R1BA 2WLQA 2JDZA 3V64A 1GV9A 1LOFA 1P63A 3K1XA 5BQMA 5JOYA 1ZL6A 1YVGA 1Q8SA 1RY7A 2R1DA 3O0XA 1T3AA 4H55A 4UW6A 1SFYA 5KXEA 2SBAA 3HSMA 3BRGC 4H9WA 4KS6A 3DUIA 1R8NA 5BP5C 3WDXA 3MPPG 1N1TA 1Q8VA 4GOVA 3NBCA 2CWSA 2Y9WC 2FMDA 2HZ9A 4I4SA 4LO1C 2PHUA 1TWEA 4JC1A 3OYWA 3WZ1A 3I29B 3ZC9A 1L2HA 4FPJA 2R16A 4BPZA 3NBEA 4TLPA 2DVFA 3USUA 4LBMA 1CPMA 4OWJA 3RRDA 2ISGA 4Z9WB 2ZGOA 1KRIA 4I4OA 1LTEA 3FJBA 1WBFA 3V0BA 1OQ1A 3CA3A 2P3KA 1Z7HA 2CNAA 4OWKA 1CPNA 4AVVA 4I3NA 5FZYA 3DSEA 4I37A 3ZXJA 3FUOA 1NZKA 2A3XA 2ZBJA 1JT4A 1IT0A 1ULCA 3AJ5A 4Q9GA 4FPHA 3QW6A 5CAZA 3T1MA 1LENA 1AF9A 4OEFA 2EAKA 4Y1XA 3B3QE 4DPNA 2XOAA 1SBEA 3CNAA 2A97A 3KQRA 4Q27A 1GZWB 1ITBA 1LGCA 2CWMA 1JLXA 2G7PA 3A07A 3P6JA 3AYEA 1FWUA 2D3RA 1HWPB 1SZ6B 4UW4A 1HLCA 2GNDA 2G7KA 4BQ1A 1QKQA 3W9TA 4USOA 1S0GA 2CY6A 3IM0A 2MC2A 1SBFA 1V6XA 1LOBA 1V00A 1AVWB 4R9BA 2EXKA 1QXMA 4LBQA 1ISWA 1GANA 4EJ5A 1DBNA 3QIYA 3O49A 1DQGA 2FPQA 4DEPA 1W6NB 1DQ1A 2YMZA 1UKGA 2OUJA 1E0OA 4D69A 4PCRA 5H9PA 2D6NA 2GNTA 4SLIA 1ABRB 1O4ZA 5E88A 3WDUA 1R8OA 3WDYA 2F2FC 3AH1A 1DQ2A 4Z8SB 1JYCA 5KXBA 4GKYA 21BIA 3VKNA 1PZZA 4XMIA 4BM8A 4Q8LA 2ZZJA 3AP5A 1JW6A 5IT6A 5IK7A 3D6EA 3F62B 4II0A 4QALA 3H0OA 2A3YA 5GZEA 2KM2A 3OY8B 3AJ6A 3UJ4A 3PVOA 4ZKTB 3ZYRA 2P34A 2GZBA 4J2SA 4LO1A 2RSTA 4F83A 2KI4A 1VALA 1IILA 4C1WA 1SLBA 1LGBA 4FQZA 1QDCA 3VT0A 3PVEA 4XJ9A 1N4KA 1CVNA 4ITCA 4XJZA 1JXNA 1FV3A 4KC3A 2DUQA 2AUYA 3NV1A 5BYNA 5DZUA 1AX2A 3B9CA 3K3QB 3T2TA 5JOWA 1A3KA 3UK9A 3C2UA 3DDAA 3LSEA 2Y9GA 4DENA 2ZGMA 1UMZA 1GGPB 4GWMA 2ZMKA 3H6RB 3FJ8A 5CB7A 4XKIA 1WW6A 1JLYA 1LESA 2C5DA 5GLUA 4A7YA 1JUIA 1AX1A 5IK5A 1ULDA 1IS4A 1MZ6A 3BB2A 1LGNA 3UJQA 3DGTA 1ZL5A 1MD6A 2NTDA 2P39A 3WINA 4YZ4A 1BASA 2ERFA 4Q1PA 2AGSA 4YG0A 5BXPA 4YZ5A 2NMOA 4ZGRB 4AN7B 1O4YA 2DVDA 3BTAA 1CR7A 2JE9A 4ASMB 4XBNA 3M3CA 2VSEA 4IQPA 1IS6A 3SH3A 1A8DA 4QBCA 3R05A 3Q7YA 2DVAA 5BQNA 1V6IA 2FFVA 3ASIA 4NO4A 3LTQA 4YOLA 5EC5A 2XHLA 5EG6C 1SR4C 4Y20B 2VY0A 4QO3A 1APNA 2X2TA 3CU1B 2WQZC 3HR9A 5HCFA 1UZYA 3M3QA 3A22A 2NN8A 1FYUA 3RMXA 3BRFA 4JKXB 1V6KA 2DVGA 5D63A 1LOGA 1G9FA 2VH9A 2J3PA 3QW7A 3HBWA 2ZHKA 1F31A 3VKOA 2E7QA 5GLWA 5BQUA 4XHBA 3U4XA 2A7AA 1QOOA 3IPVA 3N7MA 2G4IA 2B7YA 2GMMA 3VSZA 5F9TA 5F90A 4R9AA 4ZOTA 1AVBA 4XTPA 2A8AA 3BONA 3AYDA 2GN7A 1UPSA 1DJSB 1PUMB 2RHPA 1S0BA 3WDVA 1TTUA 2GNMA 4YW5A 2JJ6A 1OFSA 1DQ5A 2ILPA 4EL4A 2E51A 4WV8A 5GZCA 1NLSA 1BARA 1ISVA 5D62A 1URXA 2NVHA 2W2DB 1AZDA 1Z78A 1HKNA 3FJDA 3GALA 4OWLA 4YG6A 5DVHA 2NP0A 4YW3A 1AVUA 1CONA 4RL7A 3BRDA 3BX1C 4Y22B 1ISZA 4LBOA 4Q1RA 4FPYA 2AENA 3VKLA 4EKXB 5FNXA 1F5FA 1HDKA 2R0FA 1BJQA 4JCKA 1XTFA 4USPA 4YGDA 1GICA 1N1VA 2DYCA 4I96A 4R9DA 5DUUA 3WG2A 2D3PA 3I8TA 1YIFA 5GALA 1E1HA 4GKXA 2YZ4A 1DFCA 2EXJA 2GNBA 2PHTA 1M16A 2PHRA 2W08A 5BXSA 4FPOB 2JE7A 4FOWA 1YI7A 2ERMA 3S8KA 1WCSA 2IWTB 5DG1A 3NBNA 4DRRA 1XZZA 4ENDA 5IK8A 1MVEA 2C9AA 1J0SA 3LCPA 3QR5A 2PELA 3AKFA 3SLIA 4GAIA 3WHUA 4AGGA 5D61A 4P9YA 4M3CF 1H9PA 4YZ3A 1GLHA 3AKIA 2EIGA 2WNEA 3ILFA 2VW1A 5HCBA 1JBCA 3PHZA 1SCRA 5E8AA 1FQ9A 4LO0C 1ULFA 3SISA 3D4KA 4J1LA 3CRGA 1JYIA 3FJHA 1V6OA 2OUHA 4RA0A 2R9KB 3ZXEA 9ILBA 3ZX7A 1LECA 2VUAA 1EVTA 4ISQA 3TB0A 3IM5A 4K20A 1Z0HA 3WLUA 4LBNA 4YGBA 1CVSA 1BZWA 1W6OB 5EXOA 1JOJA 3C89A 2ARXA 3AZWA 1BXHA 5BOWA 3AYAA 1QGLA 3AK0A 3WHTA 3B69A 4I4QA 4G1RA 3FLPA 4A7KA 1V6NA 4XIKA 2FO1A 3JUUA 4D0TA 5HCAA 4ZFUB 1NXD1 3C88A 2P3IA 2Z48A 1FNYA 1Q8PA 2DU0A 3ZSKA 1QOTA 3VV1A 1N3QA 4FGFA 5HPZA 4DCKC 1YRZA 2LIQA 3CA0A 5DZFA 1T4QA 2D23A 4OEEA 2Q5TA 3FBYA 4LO7B 1WBAA 1TWMA 4M3CB 5T5JA 3OGFA 2UWBA 1DHKB 2KI6B 3OJVA 1TP0A 3N7KA 4F34A 1W6MA 4I6IA 5SV8A 1ENSA 1F82A 3ZUSA 2SLIA 4I7IA 2IMCA 1VAVA 1G9CA 4XBQA 1N3OA 1KDMA 2R0HA 3H6QA 4R6UB 5E89A 1NUNA 4CRQA 3P53A 2VXTI 2DRZA 4C1XA 4HR6C 2HWAA 4A7ZA 1JY0A 3V0AA 3N7JA 1GZWA 1HCDA 1X50A 2LTNA 2EXIA 1WBLA 3BA5A 4KEKA 5KXCA 3A23A 2TEPA 5BQMB 4BLIA 4P9XA 1JN2P 2ZHMA 2P3JA 1AJOA 1WBCA 1G9DA 3RG0A 2ZGPA 3EF2A 1JT5A 4G9MA 1F9KA 1UX6A 1IS5A 2ZMLA 3L2YA 3BOKA 3BWIA 3ZSLA 3ZPYA 1W3FA 3UL2A 1G7YA 2D24A 4LO2A 5DZGA 3B9UA 3JUTA 3WINC 1IKPA 4FOVA 4LO0A 2Q3NB 1ENRA 5DZEA 4YW1A 4HA2A 3POYA 4XXAA 1SCSA 3ZXFA 2WSVA 3WMUA 4AGVA 1XHBA 4WZFA 2IMAA 3O4BA 3ILAA 4GP3A 1RZOB 3BAGA 3USUB 5BXRA 3OPZA 4BOWA 4FPFA 3OJMA 3WV6A 1JHNA 1XYFA 3C8AA 3O4OA 1MS4A 1AXMA 2CL2A 1W3AA 3AX4A 1MS9A 2QYIB 3V0BB 1LODA 3OY8A 4FPEA 1FWVA 3QW5A 1W6PB 2R49A 1CJPA 3O5SA 2KLLA 4YGCA 2DU1A 4JPZA 4LBJA 3C9ZA 4QD2B 1W6QA 3MW2A 4Y1ZA 4PBOA 3Q7XA 3FJCA 1BFFA 1C57A 1CQ9A 3WO4A 5FREA 3BAOA 3SH4A 1LOCA 1WLCA 1YYNA 1RIRA 1PWAA 4EFQA 3T1LA 1FMMS 1SLTA 1YF8B 5BQUC 2IHOA 4XTMA 3R4UA 2H0BA 3AJYA 2WKKA 3WVJA 5G00A 4R9CA 3QJ0A 2YV8A 4M00A 5IUQA 3PMEA 4XZPA 4FPCA 5CA6A 1K5UA 1PZ8A 1TEIA 3NWKA 3FJFA 3DEBA 7I1BA 3WG1A 5JOXA 1GNHA 2ZGLA 4ZA3B 4GP0A 3H6RA 1SLAA 4YFWA 3VUOA 3BA4A 2W52A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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