3V0BB

3.9 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords BoNT/A
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0bB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0bB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0bB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0bB01
2EXKA 3AYEA 3VKLA 4K21A 2GNMA 1LENA 4Y1XA 1MS4A 5F8YA 4YG6A 1AJOA 4WBCA 3ZURA 2LTNA 1SLLA 4XILA 3RMYA 4LO3C 5CAZA 1WW5A 4IZEA 3ZVXA 4I4PA 5GZEA 1NLSA 1HKNA 1F82A 3POSA 2DVDA 1DHKB 5D63A 2UUSA 1LOEA 3VSFA 3HSMA 5DZFA 2G7NA 5GLTA 3LTQA 4XKIA 2RSTA 1PUMB 2ZR1B 2IWTB 2LIEA 1LU1A 4I4UA 1WW7A 5T52A 1CVSA 1QOSA 3WO4A 5B2HA 4UW3A 1BFGA 2E4MC 1W6NB 3WUCA 2QN4A 4FPYA 4J2YA 4AYUA 2P2KA 3NBEA 5H9RA 4OEGA 1FNZA 2NYYA 1W6OA 1RIRA 4Q1PA 2GN3A 2DREA 1VIWB 3ZXFA 4LO0A 1UKGA 5LK5A 5BXSA 3CRIA 1M2TB 2FHRA 3ZXJA 3R4SA 2ZZJA 1BQPA 4Q9GA 3AXDA 3ZX7A 2A6XA 5HPZA 2ZABA 2W08A 3M3CA 4NOTA 4LO2A 1W6QB 1I3HA 3CRHA 1LULA 2VUAA 1RZOB 4OW4A 2AFGA 3B3QE 1K5VA 1LTEA 3OBRA 1RITA 3W59A 2WT1A 1T3AA 3USUB 3WNXA 3M2MA 3BAGA 2R9KB 5FNXA 1AXYA 3D5OA 3QIXA 4FPGA 1N1YA 4FPEA 4OUJA 4XBLA 4YFZA 1FV3A 3MW3A 4K1YA 3P6IA 4YM1A 1V6KA 1HIBA 2CWMA 2XHLA 1FYUA 5BQUA 4R9BA 4MYEA 1GGPB 1N4KA 2G7KA 4Y20A 5F9TA 2ZGRA 5D62A 4ELCA 3OYWA 3GALA 4EFQA 2OVUA 2UWBA 5FZUA 4WV8A 3L2YA 2HW9A 4Z9WB 1MZ6A 5FRAA 1OQ1A 1W3AA 1G9AA 4TLPA 1CESA 1SCSA 4GWNA 4XMAA 3K1XA 1NXD1 2CL2A 2ZHMA 4YM0A 1AXZA 3UD9A 2ERMA 4GKYA 3V0BB 3O5SA 1V6OA 2VXTI 2Y9FA 1LGCA 3WCSA 5CNAA 3O12A 1N1TA 3MEPA 1N3QA 3CA6A 1IKQA 2HYKA 1JOJA 5BQMB 2UU8A 1QMJA 1ULCA 1J0SA 4EKXB 3AH1A 2DVFA 1DYPA 2ZACA 1H9PA 3QW6A 3R4UA 1Q8QA 5AVAA 4I4SA 1BARA 2OUJA 3PVOA 1MS9A 1AX2A 3NV3A 1ENQA 2D20A 3V0AA 4DQAA 2UWCA 2LALA 2ZHKA 1MC9A 4JCKA 4QKSA 4I30A 3A22A 3POYA 4EFPA 5IUQA 2P39A 3FJ8A 3WG4A 2YZ4A 4YM2A 1CE7B 2D43A 4C1WA 2W68A 4ZLBB 3BAUA 3WMUA 3INAA 1UMZA 1JLXA 2AH2A 5HCFA 3Q7XA 1S0DA 3C9ZA 1SLAA 1TWMA 3WCRA 3MW4A 1JN2P 4YZ1A 4Y1ZA 1T4QA 5DUUA 1KRIA 3WG3A 4D69A 2F2FA 4ZKTB 4HANA 2JE7A 1A78A 1A3KA 3BODA 1S0CA 1FGAA 3VKOA 2VW0A 1V6JA 1D0HA 1UL9A 3FJKA 4EFRA 1SFYA 5BOWA 2QN0A 4KTXA 1T9FA 1RY7A 1YTOA 5BXTA 1QNWA 3IM5A 3ZXLA 5BXRA 3FLRA 4R9CA 2OW4A 1FV2A 2ZGUA 2AAIB 3QIYA 1ZB7A 2R49A 4Q1RA 1O4YA 3P53A 4I2SA 2AENA 3HN1A 3CA1A 5T50A 3CU1B 2DVGA 2PHFA 1FATA 2JD4A 3FJFA 1Q56A 1QOOA 1LOCA 4I4RA 2FMDA 1Z2VA 1LHOA 3SLIA 1SR4C 3H0OA 5IT6A 2K8RA 1WBFA 3AP7A 1ZA4A 3SNMA 4R6UB 2VY0A 3O0XA 4ATEA 4AVTA 1QQKA 5BXPA 1AX0A 5JOWA 4LO3A 4JKXB 2WNEA 2EALA 4P6AA 3D4KA 4XBQA 1CVNA 4FPJA 3VKFC 3LSDA 4P14A 3WOGA 2ETFA 2ARBA 3RQ0A 4KUFA 4LBQD 1ISXA 3CNAA 1C4RA 1JUIA 2DVBA 4XTPA 4USPA 4PF5A 2H0BA 5H9QA 1F5FA 4YGBA 3RMXA 4AGRA 4XJZA 2KKIA 1JBCA 2E4MA 4A7ZA 3N7LA 5DZGA 1JY0A 2R0FA 1R8OA 3UD7A 3O4OA 4ZFWB 1QQLA 3IM7A 3NBDA 4XBNA 4ZFYB 1JT7A 2ENRA 4M3CE 1W3GA 4I4XA 3HALA 4J23B 4UW5A 4BLJA 3FFZA 3NV4A 1UZYA 4X38A 1EV2A 2YV8A 3CA5A 2WT0A 1JT3A 1G9BA 3OJ2A 1X50A 3B9CA 5CA6A 1DQOA 1JHNA 3O4DA 1EYLA 1MVEA 1LEDA 5IK8A 5HCBA 1IRAX 1HWNB 2EXIA 1VCLA 1LEMA 3QW7A 1BFCA 3ENRA 4OZXA 5GZDA 3WO2A 1BFBA 4X39A 4Q91A 4LBQB 2DRZA 4BPZA 1G9FA 2D24A 1KJLA 3QYDA 4FPOB 2AQZA 1CONA 3OY8A 4I1BA 3QIZA 3KQRA 2BFHA 4I0YA 2Q5TA 4XMIA 2RG9B 3OPZA 1SZ6B 4M01A 4DENA 1IS3A 1YI7A 3S8JA 4G6JA 1AZDA 1IILA 1ISYA 3ZC9A 1Z78A 3MPPG 3NWKA 4P9XA 1PZZA 5FZYA 3VUOA 4AGVA 3WUDA 4ZFUB 4AVVA 2AR6A 5G00A 5T54A 1P63A 4I4YA 3I2XA 1C57A 2XOAA 2P3IA 3VT2A 4I6IA 1IOAA 3AJ5A 1IRPA 1MS8A 2JE9A 1FAYA 5DUWA 4YFWA 1DQ6A 4CRQA 3ILAA 2KI4A 1RINA 4LBQA 3S8KA 3H6SE 1JQZA 4KC3A 4AN6A 4USOA 2WKKA 1HQWA 1D2SA 4I4QA 1F9KA 4SLIA 4H9WA 2ES3A 4ITCA 4QALA 3AXEA 1ZM1A 2NN8A 4F83A 4DFSA 1N47A 5F5QA 3BAQA 3UDAA 3AP5A 5BP5C 2E6VA 1TOOA 4GWMA 2X2TA 3DSEA 3NJ5A 5JOYA 3ILNA 1GZCA 3AKIA 3FGMA 5DSSB 4KEJA 3ATGA 3AJYA 3VSZA 1JW6A 4XOGA 4G6MA 4FPKA 2C9AA 4YGDA 4Q26A 1WD3A 5KXBA 4ASMB 1AXMA 2ZMKA 5IK7A 4YLZA 2D6PA 2E51A 2FFUA 2ZGLA 3BAHA 3UL2A 1WW6A 3PUBA 4QO3A 2PELA 3H6RB 5CB7A 41BIA 3OJVA 2GZBA 3O0VA 1N1VA 4FPLA 5JLVA 2ZGMA 2MLLB 5KXDA 1PWAA 4EJ5A 3BAOA 3QLQA 4ISRA 1ULDA 4KEIA 2G4IA 5CBLA 1ITBA 4XXPA 4YW3A 2HWMA 3N36A 2I2SA 4M3CB 3AJ6A 4XE9A 1JYCA 2J3PA 4KS6A 3SH3A 1DIWA 2WJSA 2GALA 3AFKA 3EF2A 1TIEA 1W3FA 1JT4A 4DCKC 1HQLA 2FO1A 1Z4SA 1URXA 2JKBA 1YF8B 2A7AA 2VSAA 1GZWB 2NVHA 1Z0HA 1OFSA 2E7QA 4BM8A 1MVQA 3KMVA 4P0JA 3FUQA 1II4A 4XJUA 4OEFA 4JKQA 2SLIA 1GICA 1W6NA 3WV6A 3Q7YA 3UJQA 3PHZA 3WZ1A 2DUOA 1SLBA 1ULEA 3FJHA 3N7JA 4WZFA 1ISZA 3N7MA 3ZSMA 5F8WA 2WBCA 3FIIA 1DGLA 4M3CA 1TFMB 4LO1C 1W6PB 4Q27A 4XTMA 4I1EA 1DQGA 2GO2A 4HEVA 1S0JA 3O0WA 1DFQA 1SR4A 2UURA 2ZGOA 4Y22B 1AFCA 3PVEA 5GM0A 3UJ0A 2DYCA 1AVAC 4C1XA 2DUQA 1W6QA 1GZWA 2FPQA 4JPZA 1BFFA 3HMYA 3WHUA 2UWAA 2ZMLA 5BVPI 3NBCA 1BASA 2WSVA 1XTFA 4L4IA 1G86A 3WDUA 4YG3A 4D0ZA 1C1FA 5GZCA 4J2XA 3NF3A 4YW1A 1OKQA 5H9PA 3USUA 4Q8KA 1AF9A 3U4XA 5KXCA 1QDCA 5JMCA 3OJBA 3QJ0A 4XJWA 1QXMA 3K3QB 1MZ5A 5DZUA 2EXJA 3M3OA 4XDQA 3BIWE 1W6PA 3CAHA 2TEPA 3R05A 3FJEA 2HWAA 4DEPA 3VKNA 1IJTA 5GLWA 2ZKNA 4Y22A 3VEQA 1FWVA 2NZ9A 4FQZA 4FOYA 3FJDA 1N3PA 1LHVA 2ZAAA 3WINC 1OQLB 2BEAA 5DUYA 2DTYA 1ZN3A 3H6QA 1HKDA 1GANA 2A3WA 5DG2A 3AYDA 1I1BA 3VKMA 4J2SA 4CTEA 2D6OX 5H9SA 4HJJA 3N7KA 3JUTA 4XHXA 4Y1UA 1GBGA 2OUHA 3B01A 1WLDA 2XB6C 5DUXA 1V6LA 4BMEA 1E1HA 4R9AA 2AXMA 3BADA 1GZ9A 4LBOA 4KBBA 3PG0A 3V0BA 3IAGC 2ISGA 4P0KA 1G9CA 1IHKA 5IK4A 1TTUA 1DZCA 3C8BA 5BQMA 4I37A 2G7QA 2L5XA 1E0OA 4J2KA 2W52A 4IHZA 4RA0A 4NO4A 1J1TA 1JLYA 3RG0A 1Q04A 1HWMB 2JECA 4Q9PA 1F31A 3FJBA 6I1BA 2CWSA 2P3JA 4XXAA 2A6WA 2LIQA 4GP3A 3I2AA 4I3NA 1BLDA 1CIWA 1IS4A 2D7IA 3PVNA 4U2AA 2DS0A 1FNYA 4FP3A 5E89A 5GALA 4UW6A 3AP6A 1B09A 4GALA 1NUNA 1IS6A 1S0IA 2D3PA 1MS5A 4LBNA 1N1SA 3MW2A 4FPCA 1FQ9A 3FJ9A 1ULGA 3B69A 3NV2A 5BYNA 1S0GA 1Q8PA 2ZQNA 1YIFA 5DUVA 1Y7BA 5F90A 4BOWA 3HR9A 2A6ZA 1ONAA 2KLLA 1MR5A 3T2TA 3C88A 2P3KA 5EXOA 4TZDA 3BRDA 1TP0A 3ZSKA 4M3CF 2A3YA 5GZGA 1XYFA 3A0KA 1SCRA 1AXKA 5E88A 1KDMA 4QD2B 1FN0A 5BP5A 3A4UA 1UZZA 5F8SA 3Q7WA 4X3AA 1JXNA 3FLTA 1PUUB 2ISHA 1VAVA 3ZXEA 4LBMA 1HWOB 3ZSJA 2MIBA 1AVXB 2ZQOA 1YBIA 3RTJB 4K20A 4PBPA 2P34A 4WVWA 3LLPA 1LODA 3BA4A 2YMZA 5SV8A 3V64A 1DZQA 2Y9GA 4IZXA 2D6MA 2WLQA 4YW4A 1SBEA 2VW1A 3BONA 1FWUA 4II0A 4PC4A 1ISWA 1GLHA 1YO8A 3FJCA 1WD4A 3IMNA 4I8MA 1YVGA 1AX1A 2A97A 4Y1YA 2DU1A 4HR6C 4IYBA 3UD8A 3AJZA 1LOAA 3O3QA 5T5JA 4YW5A 3JUUA 4HA2A 1HCEA 1QDOA 4WVVA 1FMZA 1LGNA 2RHPA 2D23A 1Q03A 2A75A 1S0EA 2X2SA 3ZUSA 3VV1A 2K43A 1VALA 2NTDA 4FGFA 4ZBVB 4YGEA 1LECA 4YZ4A 2M49A 1S0BA 2Y9XE 3O5WB 4ZXKA 2Y9WC 3P6JA 4AN7B 1FX5A 3IPVB 2W2DB 2WT2A 2CY6A 2IHOA 4OWJA 1C1LA 5DXDA 4LO1A 4YGCA 2KM2A 2GNTA 1UN1A 4YZ5A 3SISA 1M16A 4X37A 3DDBA 1HDKA 2R1BA 3IN9A 3SITA 2D7RA 2Q3NB 1UAIA 3BAVA 1LOBA 2IMCA 4FPHA 4ATFA 3V65A 3HBWA 4FPFA 5T55A 4QBCA 3WHTA 7I1BA 1ENRA 3DUIA 2ESUA 4XFSA 3CA3A 1DQ0A 4IY9A 3RRDA 2NP0A 5DG1A 2D22A 4LBJA 2HZ9A 4PQ9A 3AKGA 2ARXA 3ASIA 2Z42A 2E53A 1GNHA 3DGTA 4FQ4A 3OGGA 4YOLA 3BOOA 1WUVA 4AGGA 4BLIA 2W2DA 2YUGA 2A5ZA 4UW4A 2V5YA 1CR7A 3ZXGA 3A07A 4YZ3A 2DVAA 1DYKA 3T8SA 3WINA 2FDBM 5L73A 3JU9A 1LOFC 4XJ8A 2DRYA 5EC5A 1W0PA 5HCAA 4LBKA 2CNAA 3UK9A 2YXSA 3BB2A 3QCWA 1V00A 1SLIA 3ILFA 3V79C 3CQAA 3RTIB 2EIGA 4ZOTA 4I7IA 1KJRA 4PCRA 4OWLA 3NBNA 2I1BA 2JJ6A 4U36A 1CPNA 4YZ2A 1ISVA 3O44A 4QKRA 1MS1A 2D3SA 4GKXA 1XHBA 3AZYA 5JVVA 4GOVA 4JQ0A 4AWDA 1QKQA 3WDWA 3N0KA 4DS0A 2GNDA 1LHUA 4XIKA 2D7FA 2FGFA 3WVJA 1S0FA 4F34A 2D44A 4D0TA 1WCSA 3BX1C 3O4CA 2IMAA 4QD2C 2GDFA 1V6XA 2DWRA 2VLCA 9ILBA 1BZWA 4FVVA 1DBNA 2D3RA 3WLUA 1N3OA 2P37A 2AREA 3I4IA 3WG2A 4L8QA 1BA7A 1YXWA 4Z8BA 3FLPA 5GLUA 3AK0A 4BQ1A 1DQ5A 3C89A 1LHWA 1V6NA 2ZGSA 5FNWA 1ZKXA 2ERFA 5JDBA 5DZEA 5IK5A 2W39A 2GNBA 5I1BA 3NV1A 2NMNA 1HWPB 4IQPA 4W65A 3WO3A 2XHLB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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