3VUOA

Crystal structure of nontoxic nonhemagglutinin subcomponent (ntnha) from clostridium botulinum serotype d strain 4947
Total Genus 330
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
330
sequence length
1196
structure length
1151
Chain Sequence
MDINDDLNINSPVDNKNVVIVRARKTNTFFKAFKVAPNIWVAPERYYGEPLDIAEEYKLDGGIYDSNFLSQDSERENFLQAIITLLKRINNTISGKQLLSLISTAIPFPYGYVGYRETNYIESQNNKNFYASNIVIFGPGSNIVENNVICYKKNDAENGMGTMAEILFQPLLTYKYNKFYIDPAMELTKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVVPYRLRTELDNKQFSQLNIIDLLISGGVDLEFINTNPYWFTNSYFSNSIKMFEKYKNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFQNSVQDIWNLNLNYFSKEFNSIIPDRFSNALKHFYRKQYYTMDYGDNYNINGFVNGQINTKLPLSDKNTNIISKPEKVVNLVNANNISLMKSNIYGDGLKGTTEDFYSTYKIPYNEESDNFPLNNISIEEVDSIPEIIDINPYKDNSDDLLFTQITSTTEEVITHTALPVNYLQAQIITNENFTLSSDFSKVVSSKDKSLVYSFLDNLMSYLETIKNDGPIDTDKKYYLWLKEVFKNYSFDINLTQEIDSSCGINEVVIWFGKALNILNTSNSFVEEYQNSGPISLISKKDNLSEPNIEIDDIPDSLLGLSFKDLNNKLYEIYSKNRVYFRKIYFNFLDQWWTEYYSQYFELICMAKQSILAQESVVKQIIQNKFTDLSKASIPPDTLKLIKETTEKTFIDLSNESQISMNRVDNFLNKASICVFVEDIYPKFISYMEKYINNINIKTREFIQRCTNINDNEKSILINSYTFKTIDFKFLNIQAIKNFFNSQVEQVMKEMLSPYQLLLFATRGPNSNIIEDISGKNTLIQYTESVELVYGVNGESLYLKSPNETVEFSNNFFTNGLTNNFTICFWLRFTGKDDDKTRLIGNKVNNCGWEIYFEDNGLVFEIIDSNGNQESVYLSNVINNNWYYISISVDRLKDQLLIFINDKNVANVSIEQILNIYSTNVISLVNKNNSIYVEELSVLDKPVASEEVIRNYFSYLDNSYIRDSSKSLLEYNKNYQLYNYVFPETSLYEVNDNNKSYLSLKNTDGINIPSVKFKLINIDESKGYVQKWDECIICVSDGTEKYLDISENNRIQLVSSKDNAKKITVNTDLFRPDCITFSYNDKYFSLSLRDGDYNWMICNNKVPKGAHLWILKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords NTNHA
publication title Small-angle X-ray scattering reveals structural dynamics of the botulinum neurotoxin associating protein, nontoxic nonhemagglutinin
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 330
structure length 1151
sequence length 1196
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
A PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3vuoA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3vuoA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3vuoA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3vuoA01
4HA2A 3C8AA 4OWLA 3IIRA 1TP0A 5HCBA 3MW4A 3DSEA 1MD6A 1UAIA 3AP9A 3R4SA 3E8LC 3MALA 2A70A 4OEFA 3UJOA 4R9BA 1IOBA 5DSSB 3JUUA 3BB2A 1GNZA 4FPOB 3ZUSA 2DUOA 1W0PA 2NM1A 1FAYA 2ISHA 4LO8B 2MLLB 1YVGA 2D7RA 3NF3A 2A75A 2WJSA 8I1BA 3FJ8A 2EXKA 4A7KA 3B9CA 5D62A 3ENRA 1IS6A 4BPZA 2EXIA 3SLIA 4ZFUB 3ZSLA 4WV8A 4P9WA 2ZQOA 3IPVA 5GZFA 2ZGPA 3TB0A 3ZXKA 1GGPB 4YZ5A 4H04A 3IM5A 1QOOA 3NV2A 3AZVA 4X3AA 1ISXA 5F5QA 4LBKA 5DG2A 1ZKXA 4USPA 3CA5A 4Z8SB 3I29B 4HEVA 4DRVA 2QYIB 1J0SA 3I4IA 1G9CA 1HQWA 2DVBA 2JDZA 3IM6A 4L4IA 1ULGA 1UL9A 3N7KA 2VU9A 3ZYRA 3O0WA 4OEGA 2D3PA 2A5ZA 4YLZA 5LK5A 5FNWA 3Q9OA 5EYXA 2VW1A 3W59A 5DG1A 4MYEA 5IK8A 3CRIA 1GV9A 2EIGA 3R4UA 3T1LA 3LTQA 3POSA 4AWDA 2WNEA 4JAWA 4QKSA 2C9AA 3BWIA 1G9BA 2AH2A 5H9RA 2ZABA 3NBDA 1AJKA 2AGSA 3WDWA 4ZBVB 1ONAA 4WBCA 3ZXJA 3AYEA 3O4OA 3AH1A 1N3OA 4LO3C 1XQNA 5DUXA 3OYWB 3WDTA 1ZN3A 4TLPA 2WSUA 2DTWA 3AP6A 3AXDA 5BXSA 4ZJXA 5DZGA 4Y22B 4HANA 2NMOA 1QNWA 4GOYA 2K4AB 4FVVA 1FNYA 4PF5A 3PG0A 3MPPG 4Q9PA 4I2SA 1XZZA 2NN8A 4W65A 1HIBA 4P9YA 5DZEA 4CZSA 4OEEA 3ZPYA 1MS1A 1SBFA 4LBMA 2F2FC 1V6IA 3HSMA 4Q8LA 1CONA 4Q27A 4EEEB 2W52A 2ZACA 1O4ZA 3F1RA 2EALA 3VT2A 1C57A 3A22A 3CNAA 3UJQA 3ZSKA 1BQPA 2GNMA 3ZC8A 2MIBA 5E24E 2SBAA 1FMMS 5GLZA 4CRQA 2FPQA 2NVHA 3KQRA 3WMVA 2V5YA 4HL0A 5F8YA 3WUDA 4XIKA 1JT4A 4ENDA 3N7LA 1UZZA 4YFWA 4I4QA 1FNZA 5DZFA 5DVHA 1W3FA 1QF3A 3JUTA 3SH4A 1G8WA 4KEJA 5F9TA 1W6MA 1H9WA 4XHXA 3H6RB 1YF8B 3FJ9A 1UMZA 5DUUA 2E53A 1WLDA 2LALA 4Y22A 2D6MA 4OW4A 1DQ0A 4NOTA 4QD2B 1DGLA 1FMZA 5FZZA 3AH2A 2VY0A 3VKLA 4DQAA 1DJSB 1GZWB 2ARBA 1IS3A 5JDBA 1VAVA 1BLAA 4IYBA 3UDAA 1WBAA 1PZ7A 2YV8A 4IQPA 2E7QA 2FDBM 3PMEA 1XG6A 3W58A 4YM2A 2ERFA 5GLTA 1PWAA 5FZUA 2SLIA 4AVTA 1BJQA 3ZXDA 3A07A 4YW2A 1JYIA 3A0KA 1SLTA 3OGGA 3B9UA 4ZLBB 3HOMA 2YXSA 1X50A 3V0BB 1MS5A 1MS9A 5BXRA 4XYXA 4DPNA 3FIEA 4XXPA 3I8TA 1IILA 1JLXA 2I1BA 3SNMA 2ZGMA 1JOJA 1FWVA 1SLAA 1HCEA 4GALA 3KMVA 1W6OB 2DWRA 5KXEA 4ZKTB 3OY8A 3UJ4A 4KEKA 1AVXB 4M3CE 5IK5A 2FHRA 2FGFA 4P0KA 4FPFA 4FGFA 1V6WA 4I4YA 1G9AA 3H6RA 4BM8A 1L2HA 5F8SA 1ISVA 5JOXA 2GMMA 2GMEA 4YW4A 1PC8B 1AX2A 1DFQA 1WD4A 1AX1A 1AJOA 4J2KA 3N3HA 4GP0A 3B00A 1DQ5A 1ULCA 1W6NA 3QYDA 1TWMA 1ZB7A 2ARXA 2D6KA 2AFGA 5BQNA 4FQ4A 4QBCA 4FPGA 1GZWA 1CPNA 1MACA 3AJ5A 3U4XA 1AVWB 1GYKA 3AJZA 3S8JA 1RY7A 2UU8A 3WINA 4J23B 4I6IA 2ZBJA 2PHRA 5JMCA 4Q1RA 3O4BA 3INAA 3WA1A 3V0BA 2E6VA 3ZSJA 4YW1A 5CBLA 2DS0A 3WHUA 3WZ1A 4M01A 1LGBA 1MS0A 3K3QB 1JN2P 1W6OA 3CA3A 3ZXFA 21BIA 3AYAA 4R9CA 4XTPA 3BTAA 3N7JA 4I3NA 1QKQA 3O5WB 1DQ6A 1EV2A 2CYFA 4P9XA 3QIZA 2P2KA 1LOEA 4R9DA 1WBCA 3AK0A 4J2XA 1AZDA 4FOQA 1F5FA 1Z2VA 5GZEA 1CVSA 2ZHKA 1OQLB 4GXLA 4Q26A 2KLLA 3CRHA 1JBCA 3VEQA 1S0IA 4XILA 2EAKA 1WCSA 3RTIB 4ZGRB 1V6MA 4D0TA 3HN1A 1SFYA 2R0FA 4GAIA 1JYCA 1M16A 1URXA 1ISZA 4Y1ZA 2ISGA 3ILRA 4GKXA 1D0HA 2GN7A 1K5UA 2KH2A 2Y9FA 2A6ZA 4PC4A 4BLIA 4I7IA 2DU0A 2ZHNA 5DUYA 2E4MA 1TFMB 3BODA 3VKOA 1IKPA 4IY9A 1N3PA 1BKZA 2RHPA 4M3CB 3CA1A 3N36A 2NZ9A 4PQ9A 3M1HA 3F62B 3PVOA 2NYYA 2DRZA 1PZ9A 4LBQB 5BOWA 1QU0A 1H9PA 3OJ2A 4X37A 1XYFA 4IZEA 1LU2A 2W68A 1RINA 3ZUQA 1VALA 1LHNA 1LHWA 1DQ4A 2P3JA 4I96A 4IZXA 2A7AA 3AJ6A 5L73A 4Q8KA 3CA0A 3FJIA 1G9DA 4I0YA 5GJ6A 3P6JA 4R6UB 4D69A 2OW4A 3BIWE 3NV4A 4TYSA 3V0AB 4M3CF 1GKBA 4XFUA 1V6JA 2DUQA 1A8DA 4FPEA 2D7IA 1DLLA 3AYCA 3IAGC 1XTGA 1BASA 4KS6A 1SLLA 2CY6A 3AZWA 4G1RA 4DCKC 1JT5A 3BA5A 1LECA 5CA6A 1C1FA 5T54A 1MVEA 1WUVA 5FZYA 2JJ6A 4YM1A 4EFQA 1W6QB 1JHNA 4Y20B 3UD7A 3WG4A 1SZ6B 1FQ9A 3M2MA 4WZFA 5KXCA 1KJLA 31BIA 3AKHA 1N1SA 3JU9A 5IUQA 2YY1A 3WO2A 4XMIA 3BRDA 5E8AA 3N35A 2CWSA 5DUWA 4G9MA 2HWMA 4M3CA 1W6PA 3B3QE 4EFRA 2BEAA 1IT0A 1YRZA 3ATGA 1UKGA 4Q1PA 1LOAA 1AVBA 2HYKA 1V6VA 4A7YA 4XJUA 3WMUA 4Y1UA 4H9WA 2ZKNA 1IRAX 1CVNA 3SISA 2W2DB 2NP0A 2WSVA 4D8HA 4Y1YA 4UW6A 1DYKA 1UPSA 4PBOA 2XB6C 1AXYA 5BP5A 1WW6A 4ASMB 1BFGA 4Q2FA 1C4RA 1V6KA 4F83A 4JP0A 4ZFWB 1TEIA 1HLCA 2ZMLA 4LBQD 1IJTA 1SBEA 3OJBA 3PHZA 1NUNA 1N3QA 3V0AA 3HBWA 4P0JA 1QQLA 2IMBA 3BADA 4LO2A 4XDQA 4AGVA 1V6XA 2ZHLA 5DZUA 3IM0A 4LBNA 2VSEA 1AXKA 3W9TA 1KDKA 1Q03A 5EHAA 1V00A 5H9SA 3QIYA 1MS3A 1CIWA 1GNHA 2G7NA 1XHBA 3WINC 2ZGOA 3DDAA 1ULEA 3LSEA 4BQ1A 3ASIA 4LO7B 1HKNA 4FPJA 1GBGA 1F9KA 4Q9GA 2ZQNA 2Q3NB 4G9NA 2Z42A 3P6IA 3WVJA 3AJYA 2GNBA 2G7QA 1G86A 2D44A 2UWAA 4XJWA 1Z7HA 1LHVA 2DVGA 2VXTI 1JXNA 1Z78A 5GLWA 3AFKA 4G6MA 1LCLA 1MR5A 3FJKA 1Y7BA 1JLYA 3M3EA 4PBPA 4QKRA 4I4SA 2ZAAA 3AKIA 3AKFA 2D24A 1S0DA 1WW4A 5EWSA 4YZ4A 1IS5A 5BQMB 1ZM1A 1JT3A 1G7YA 1Q56A 2ZGRA 3I2XA 2DURA 2W2DA 2D1ZA 1S0EA 1V6LA 5FNXA 1W3GA 2B7YA 4F34A 2KI4A 1Z4SA 1SCRA 3VKMA 1ENRA 5DUVA 1NZKA 2HZ9A 4ISRA 4AYUA 2WRYA 4XKIA 3BRGC 3IM7A 4Q91A 1Q8SA 3O49A 3FIIA 5BXPA 1R8NA 1PZ8A 4ZA3B 3UJ0A 1VCLA 1WBFA 1YXWA 2VW0A 4QC4A 2DREA 4I4PA 4I37A 3FJBA 4KTXA 4YGBA 1T9FA 4I4XA 3APBA 3DUIA 3QW5A 3OYWA 1LOFA 1LHOA 2E51A 2DRYA 3AH4A 4EKXB 3OBTA 2P39A 4CTEA 5BQUA 3RRDA 2K43A 2UURA 3ZSMA 3ZC9A 4II0A 4XFTA 1WW5A 1OFSA 1YI7A 5T5OA 1CJPA 2R16A 2M49A 1YTOA 3EF2A 3A4UA 3FJHA 1FV3A 2DVDA 5BQMA 4ISQA 3FLTA 3UD8A 3WDYA 2ZGTA 1E0OA 3C88A 3M3OA 4WVWA 2GNTA 4YW3A 3AZZA 2G7PA 3AZXA 2KKIA 4YM3A 5KXDA 1UN1A 1J1TA 3CA6A 4DRRA 2L5XA 5DXDA 4Y24A 2YROA 1RG8A 1LGCA 2RG9B 2ZMKA 2ZMNA 5GZGA 4AVVA 3MW3A 3VSFA 4EL4A 4XXAA 1IHKA 4AGRA 3CQAA 1NLSA 4YW5A 2A6WA 1MC9A 2GNDA 5EC5A 2D20A 4GOVA 1DQ2A 1S1AA 3DS9A 3RTJB 4EFPA 3OJMA 4FPCA 2DVFA 2DVAA 3C8BA 4X38A 2KM2A 4GWMA 4UW3A 2P37A 4LO1A 1LOGA 1AF9A 2A6XA 1CN1A 1Q1UA 4ZXKA 4JQ0A 1DIWA 5EG6C 3TAYA 1W3AA 1LEDA 4EB2B 4K20A 1N47A 1RIRA 1FGAA 1A3KA 4GP3A 4DENA 2IMAA 3P53A 2WQZC 3N7MA 3FJCA 3LLPA 2VUAA 3IN9A 1RITA 1I1BA 2LIQA 3VWCA 3V65A 1YIFA 2WKKA 4LBJA 1HDKA 4YGCA 3AX4A 1ZL6A 1UX6A 3WHTA 5BP5C 4YGEA 1DQOA 5AVAA 3FJEA 3FLPA 1SR4A 3BA7A 1KQRA 2UWBA 4HR6C 1DQGA 4ATEA 5T55A 1PZZA 1LESA 4I4OA 4JRAA 2ZZJA 2MC2A 1ZL5A 2KI6B 3TC2A 2ZA9A 3AXEA 1N1YA 3C9ZA 1LTEA 4ITCA 1QQKA 2FFUA 3O5SA 4LO3A 2X2SA 1GZCA 2Y9XE 3BAQA 3BRFA 4C1XA 4OZXA 4JPZA 1TTUA 3WO3A 1M2TB 1FN0A 3RSJA 1LULA 3UL2A 1D2SA 4FPYA 1JQZA 4XFSA 1AXMA 3DGTA 1RMLA 2IHOA 1KDMA 1CE7B 2Q5TA 2CL2A 3VT0A 1OKQA 4IHZA 3FUOA 1HKDA 4YZ2A 3VT1A 3QW8A 2D7FA 3D6EA 1U0AA 2P23A 5KXBA 3OPZA 1N1TA 3ZYPA 3MEPA 5BXTA 4XHBA 2R1BA 1GZ9A 1S0LA 3WDUA 4FOYA 4D0ZA 2A3WA 1QNYA 2F2FA 2AENA 2DUPA 4FPHA 3B69A 2GMPA 4ZFYB 1N4KA 2ES3A 3NJ5A 1ABRB 2XOAA 1YO8A 1JUIA 1WD3A 4QBVA 2A97A 1HCDA 3LSDA 4YG3A 4BLJA 2QN4A 2D6OX 1DYPA 3WCRA 1AVUA 4XJ8A 1PUMB 5JOZA 3H6SE 1GANA 5D63A 4ELCA 1Q8VA 2ZGKA 2UWCA 3O3QA 2PHUA 4AGGA 1LHUA 2GN3A 3AKGA 3H0OA 4DFSA 1JTCA 2JD4A 1CESA 3IKWA 4A7ZA 1LU1A 5IK4A 2ZR1B 2PHTA 3O12A 5FRAA 1Q8OA 1SLBA 3POYA 2ISEA 3HMYA 2ENRA 1LOFC 3CAHA 3ZXEA 1YBIA 3Q7YA 1S0FA 1WBLA 1V6UA 1QOTA 5BQUC 3DDBA 5E89A 2JECA 3JRRA 3RS6A 2HWAA 2GALA 4XBQA 1DZDA 4Y26A 3WUCA 2DTYA 4I30A 1C1LA 4XTMA 1FV2A 5JOYA 2D22A 1BARA 2G4IA 3HR9A 3USUB 3ZX7A 3FJFA 4GAFA 4K21A 5T5PA 1HWPB 4JKXB 2EXJA 3WDXA 3RMYA 3VUOA 5CNAA 4KBBA 3C89A 1HQLA 1CPMA 2ILPA 4QO3A 4H55A 1AFCA 3R05A 2P34A 2WLQA 4I8MA 4Y1XA 1WLCA 5D61A 3O44A 2ETFA 2F8XC 2VW2A 1MS4A 1F31A 4Z8BA 5GM0A 5BYNA 3OJVA 1JW6A 1T3CA 9ILBA 2JE9A 2AYHA 3Q7WA 4RA0A 4LBQA 4FOWA 3FGMA 1DZCA 4GKYA 4BOWA 2ZHMA 4RL7A 3M3CA 4LO1C 4DEPA 4XMAA 4XIOA 4I1BA 2W08A 1EYLA 2Q9XA 3BA4A 1AXZA 3LCPA 3L2YA 1JT7A 4J2YA 4NO4A 3FBYA 2ET2A 2AAIB 2J3PA 1CR7A 3BAVA 4LO0A 2GDFA 1BXHA 5G00A 3O4CA 4QD2C 3T2TA 3BAOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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