4ZKTB

Crystal structure of the progenitor m complex of clostridium botulinum type e neurotoxin
Total Genus 271
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
271
sequence length
1159
structure length
1114
Chain Sequence
KINGNLNIDSPVDNKNVAIVRSRDVFFKAFQVAPNIWIVPERYYGESLKINEDQKFDGGIYDSNFLSTNNEKDDFLQATIKLLQRINNNVVGAKLLSLISTAIPFPYENNTEDYRQTNYLSSKNNLVIFGPGSNIIKNNVIYYKKEYAESGMGTMLEIWFQPFLTHKYDEFYVDPALELIKCLIKSLYYLYGIKPNDNLNIPYRLRNEFNSLEYSELDMIDFLISGGIDYKLLNTNPYWFIDKYFIDTSKNFEKYKNDYEIKIKNNNYIANSIKLYLEQKFKINVKDIWELNLSYFSKEFQIMMPERYNNALNHYYRKEYYVIDYFKNYNINGFKNGQIKTKLPLSKYNKEIINKPELIVNLINNTVLMKSNIYGDGLKGTNFYSNYIIPYNHSINYSYLDNVNIEEIEKIPPINDEDIYPYRKNADTFIPVYNITKEINTTTPLPVNYLQAQMIDSNDINLSSDFLKVISSLVYSFLNNTMDYLEFIKYDKPIDTDKKYYKWLKAIFRNYSLDITETQEISNDTKIIPWIGRALNILNTNNSFVEEFKNLGPISLINKKENITIPKIKIPSSMLNFKDLSENLFNIYCKNNFYLKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMASKSVLAQEKLIKKLIQKQLRYLMENSNISSTNLILINLTTTNTLRDISNQSQIAINNIDKFFNNAAMCVFENNIYPKFTSFMEQCIKNINKSTKEFILKCTNINETEKSHLIMQNSFSNLDFDFLDIQNMKNLFNSYTELLIKEQTSPYELSLYAFQEQDNNVIGDTSGKNTLVEYPKDIGLVYGINNNAIHLTGANQNIKFTNDYFENGLTNNFSIYFWLRNLKQNTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFENDGLVFNIIDSNGNEKNIYLSNISNNSWHYIVISINRLKDQLLIFIDNILVANEDIKEILNIYSSDIISLLSDNNNVYIEGLSVLNKTINSNEILTDYFSDLNNSYIRNFDEEILQYNRTYELFNYVFPEIAINKIEQNIYLSILNFKPLKFKLLNQYVQKWDEVIFSVLEKYLDISTTNNRIQLVDNKNNAQIFIINNDIFISNCLTLTYNNVNVYLSIKNQDYNWVICDLNHDIPKKSYLWIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Molecular Assembly of Clostridium botulinum progenitor M complex of type E.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bontoxilysin A
molecule tags Hydrolase/toxin
total genus 271
structure length 1114
sequence length 1159
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 4zktB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4zktB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4zktB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 4zktB01
2XHLA 3AJZA 2IMBA 2WJSA 2A3YA 4U36A 4Q1PA 1JW6A 4GKYA 3NWKA 3IM0A 2VW0A 1RINA 5E89A 5BOWA 1SR4A 4YW2A 1C1LA 3RRDA 3WO3A 1AVBA 1DYPA 3APBA 4UW6A 4KS6A 4LBLA 3VSZA 4Y1ZA 4OEFA 1ENSA 4Q1RA 2NN8A 2E4MA 8I1BA 3BTAA 2GNDA 4I30A 5GLZA 4R9BA 2A97A 4J2XA 4GAFA 3VSFA 3WO2A 1S0DA 1Q8PA 2JDZA 1LOCA 3CQAA 3ZSKA 3LLPA 2ZHLA 2UWAA 3H6SE 4I2SA 4ZXKA 2GMPA 1LOAA 4EFPA 4H9WA 2W39A 3T8SA 1LTEA 2DREA 3QW8A 2ZHKA 3ZXJA 1DQ1A 4Q2FA 1T9FA 3BOPA 1T3CA 1MS1A 3WCSA 1SBEA 1LOBA 2NMOA 1I1BA 1II4A 1DQGA 2ENRA 5KXEA 3C8BA 4F83A 5T5JA 2Y9XE 1N1SA 3CRGA 5GZCA 1FYUA 2UURA 2Z48A 4WVWA 3BADA 4GXLA 3FIEA 2DVFA 4QO3A 4FQ4A 4BMEA 2P2KA 2G7QA 2ZMKA 2ZMLA 4KEJA 5GLUA 2EF6A 3BRGC 1KDMA 2QN0A 1G9BA 1V6NA 1WBLA 4HR6C 1ULCA 3AZZA 1V6UA 4YM0A 4LO1A 3GNEA 2F8XC 1QOOA 2TEPA 1OQLB 2FMDA 3INAA 2D22A 3N7JA 2Q9XA 1DQ4A 1ISXA 3AP9A 3R4SA 1LULA 1Q8QA 1N47A 3M3QA 1IKQA 4OZXA 1FWVA 2DWRA 2P37A 1BQPA 4BM8A 1E1HA 2E51A 1LOFC 1O4YA 3CRHA 1D0HA 4FVVA 4IQPA 1ZKWA 1WLCA 5BYNA 1LENA 1W6OA 4PQ9A 3OYWB 2JJ6A 2Y9FA 3WA1A 1F82A 1XHBA 1QQLA 3TC2A 1URXA 2W52A 1APNA 1GBGA 3T1MA 1QOSA 3V0AB 4ZFWB 3WUDA 4Y1YA 4FQZA 2FFUA 3LSEA 1N3OA 3ZXKA 1DQ6A 4EFQA 3P53A 2FHRA 1GANA 1C57A 3TB0A 5FZZA 31BIA 1CPNA 3USUB 4BOWA 5CNAA 2GALA 2LIEA 2D7RA 2J3PA 2VUAA 1AXYA 4XJZA 1KQRA 3WVJA 2FPQA 2BQPA 5GLTA 1GICA 5CB7A 1G8WA 3WO4A 3ZC8A 5GZGA 1JT4A 2E7TA 3MEPA 1EV2A 4L4HA 2KI6B 1W6QA 4JQ0A 2E4MC 1QDCA 1QU0A 4YW5A 2FGFA 1LHNA 1L2HA 2JECA 1BZWA 1R8OA 3WOGA 4P0JA 2G7KA 1S0CA 1N3PA 1QNWA 3WG4A 4BQ1A 3POKA 2Q5TA 2OUJA 3ATGA 1HWMB 4FOWA 1A8DA 4ZLBB 3AYAA 1LODA 4GP3A 4C1WA 2OUHA 4ISRA 2KM2A 3ILFA 4OWLA 2A6VA 2E53A 4I37A 1W6MB 2QN4A 4LBJA 3WNXA 1GZWA 4EKXB 3O4OA 3QW5A 1ISWA 3C89A 3K3QB 1JHNA 4LO8B 2A7AA 5I1BA 1LESA 4Q27A 3UD8A 3P6JA 1CPMA 1BKZA 1SLIA 5T5OA 5T50A 2D6NA 2GNBA 4ATFA 1TFMB 5BQNA 2LTNA 4Y1VA 2A3WA 1RITA 2EALA 2ERMA 2W08A 4LO7C 1G7YA 4RL7A 3SLIA 4OEGA 1YVGA 3SITA 3JRRA 1UAIA 2PHXA 1W6NA 2ARXA 3CNAA 1N4KA 1IJTA 1F31A 2XB6C 3ZSMA 1SZ6B 1ULGA 4XOGA 1ZL5A 4LO1C 2ESUA 1FMMS 1Q1UA 1SCRA 3A0NA 1NXD1 4OWKA 2VH9A 4J2SA 4M3CE 1ULFA 4Q26A 3DSEA 4XXPA 4JC1A 1WW5A 1RIRA 4FPLA 2DUPA 1MS0A 2UWBA 2R9KB 4I7IA 2D7IA 3N7LA 4AWDA 4IONA 5JVVA 4FPKA 1AVWB 2RHPA 4XILA 1JY0A 3HOMA 3O44A 21BIA 3O5SA 4G9NA 4Q9PA 1UN1A 4P9XA 2NVHA 2DVDA 1FQ9A 5DUVA 4AGRA 1AJOA 3BOOA 2P3IA 1F5FA 3PHZA 1WBFA 2UU8A 2KKIA 1Z78A 5BXRA 4I4YA 3AYEA 1T4QA 1V6KA 3AH1A 2CTVA 4X3AA 4FPGA 3BAGA 3QR5A 2R1DA 3FJHA 1XTFA 3ZX7A 1S1AA 4CJMA 1ENRA 1DZCA 2HZ9A 5T54A 3N7MA 4M3CA 2JE7A 2WKKA 5JMCA 4P14A 3WLUA 3CRIA 5DUYA 3B9CA 3PMEA 3VKFC 1SLTA 2SLIA 4Y20B 1V6XA 2VSAA 3WUCA 5DUWA 5G00A 5DUXA 5H9PA 2W2DA 3AZYA 3PVOA 3C2UA 1UZYA 4OEEA 2A6WA 1XQNA 5T55A 4H55A 3VKMA 4FP2A 4DEPA 1IKPA 3GALA 1DBNA 5LK5A 4I4SA 4LBQA 3WZ1A 1TWEA 1W6PA 2DU0A 3I4IA 3UD9A 3WDWA 3M2MA 4CRQA 3A22A 3UJ4A 4XTPA 1IS5A 3VT2A 4HJJA 2ZHNA 4YW1A 3RQ0A 3WINA 4Y20A 2VSEA 2ZGTA 3ZUSA 1Y7BA 2DVAA 2D23A 4XDQA 1FN0A 2D20A 2OVUA 4JP0A 4A7YA 2C5DA 1YO8A 2Y9GA 4F34A 1ENQA 1TEIA 3BOKA 3T1LA 4UW4A 4YFWA 4ZKTB 3QCWA 4DRVA 3UJ0A 4L4IA 2ZAAA 2HWMA 5HCBA 2XHLB 1PZ8A 2D24A 4BLIA 5BXTA 4YZ4A 3FJDA 1M2TB 2HW9A 2XOAA 2WT0A 3ZXEA 1S0JA 3FLPA 5HPZA 1UL9A 3FGMA 3VKLA 1ZN3A 4XMIA 3ASIA 2I1BA 3CA6A 5BP5A 3D5OA 3AKFA 4XZPA 2E7QA 3H0OA 1TP0A 2X2SA 1Q8OA 1W3FA 4D0TA 1YYNA 2DTYA 2E6VA 1CVSA 3R05A 2V5YA 3HR9A 3I2AA 1GKBA 5F8SA 3CA4A 4XHXA 5BVPI 1MD6A 3M1HA 1CONA 4YZ5A 1J1TA 2H0BA 1LU1A 1VAMA 4RA0A 3HBWA 4ASMB 2PHUA 4YG0A 1AX1A 5JDBA 3BAOA 5GAQA 2YROA 1EVTA 4I3NA 5EG6C 2UWCA 3P6IA 5FZYA 2AH2A 1JT3A 3DS9A 3POWA 1LHVA 2KH2A 1HQWA 1DLLA 1CR7A 1UX6A 4J23B 2ET2A 2Y9WC 2FDBM 3TAYA 3ZSJA 3ZPYA 1TIEA 2A71A 3NV2A 2HYKA 3LTQA 3BAHA 1N1TA 1AVAC 4X37A 1WCSA 4EL4A 4D69A 4DCKC 1DJSB 1FNYA 2EAKA 5H9QA 1G9DA 4TLPA 2ZR1B 5L73A 3M3EA 3FJFA 1H30A 2ZMNA 1JTCA 4LO7B 1ONAA 5DZFA 2DUQA 1SLAA 5JOWA 4PBOA 1SBDA 4Y26A 3FJBA 4LBKA 2VY0A 2OW4A 3Q9OA 1FV2A 1DYKA 4YFZA 4IY9A 2GMEA 2ZGRA 2GDFA 3ZXFA 2K4AB 1D2SA 3N0KA 2AXMA 1MACA 3S8JA 3CA0A 5F8WA 1FATA 3WINC 3CU1B 3ZVXA 2D6KA 4DENA 4YM1A 5IT6A 2AYHA 5IK8A 3D4KA 4FPHA 1ZKXA 1AVXB 4YZ1A 3PVNA 1W6OB 4JRAA 1S0EA 3FJEA 2IMCA 1LGBA 2G7NA 3I29B 1WBCA 2A3XA 5F5QA 4SLIA 4A7KA 1LECA 1AX2A 1EPWA 4I6IA 1BLAA 4G6JA 4X38A 3IPVB 4LBMA 3A23A 3O49A 1GLHA 2A5ZA 2WSUA 2DRYA 1MR5A 4ZFYB 3BB2A 4AYUA 2G4IA 4U2AA 1BJQA 2AAIB 3BA5A 3IKWA 1ISYA 4K1ZA 1QKQA 5CBLA 3QIXA 5BP5C 1VAVA 3ILRA 1XZZA 3HSMA 4QKSA 5SV8A 2CL2A 1FWUA 5CA6A 4ATEA 3HALA 4LBQD 1W6QB 4DS0A 1PWAA 4EB2B 3IPVA 2L5XA 3AX4A 5DVHA 5JLVA 1CESA 2MIBA 1H9WA 2R49A 2GZBA 1E0OA 2KLLA 1IRPA 1BFGA 2RSTA 1ULEA 3FUOA 2AUYA 3OY8A 3B01A 3O0VA 3AKIA 4GALA 4FPOB 4YG3A 1SR4C 3QIZA 4LO0A 3ILNA 5F9TA 5F8YA 5T5PA 3I2XA 3WDYA 1GZWB 3FJ8A 2CNAA 3SNMA 2WT2A 1HCEA 3B3QE 3QW6A 1JN2P 4I1BA 4MYEA 3AP7A 4Q9GA 5KXDA 1N1YA 4FOQA 1MC9A 3AP4A 3B00A 3LSDA 2ETFA 4BLJA 1CN1A 4FP3A 3FBYA 4KBBA 1SFYA 3C9ZA 3ZYRA 1V00A 1GNHA 4I1EA 4NO4A 5EC5A 4YGEA 4D8HA 5E24E 4FPEA 1DIWA 2ZQOA 1G9CA 3VV1A 1W6NB 2DYCA 2IHOA 1QGLA 1IT0A 5BQUA 2WNEA 2SBAA 4XE9A 1P63A 3VUOA 2AFGA 4P0KA 4FOVA 1AXZA 2CYFA 1V6OA 3IM6A 2I2SA 1IOAA 4P9YA 2HWAA 5GJ6A 1FMZA 1NUNA 2ZGSA 1S0IA 2KI4A 1YI7A 2CWMA 4Y22B 1UPSA 4I8MA 3O4CA 4XJ9A 3VEQA 3A4UA 3WHUA 3SH5A 3NBEA 2P34A 4X39A 4Z9WB 4CTEA 4Y1XA 3AP5A 1AF9A 1R8NA 4EEEB 1I3HA 4I4UA 2EIGA 4K1YA 5DXDA 1JYCA 1OKQA 1IHKA 3EF2A 4IHZA 1SCSA 1GV9A 4AGVA 3RTIB 3OJ2A 3ZSLA 1HKDA 3SH4A 2YZ4A 4WVVA 1JT5A 4Y22A 4ZJXA 2YV8A 3T2TA 1NLSA 4USOA 1CIWA 3OGFA 3UL2A 2ZQNA 4M3CB 2R16A 4QBVA 3FJCA 1LEMA 1YTOA 2P23A 5DZGA 4USPA 3Q7WA 1Q8SA 2A6XA 1PC8B 4Q91A 2MLLB 1DHKB 2RQ9A 3DDAA 3WDUA 2JKBA 4I4QA 1R1ZA 1JQZA 2W2DB 4XYXA 4XHBA 3R4UA 1WBAA 1ZB7A 1TWMA 4JKQA 4DFSA 1WLWA 1IILA 2XG3A 1S0LA 1BFCA 5EYYA 4YZ2A 2ZGMA 1PUUB 1W3GA 4XIKA 2MC2A 4LO0C 4LBQB 1W6PB 5T5LA 4BPZA 2GN7A 4W65A 1H9PA 5KXBA 2D6LX 5JOXA 4HL0A 3FJ9A 3ZXLA 3FIIA 4ZBVB 1FNZA 4WBCA 1ITBA 2A6YA 3UJOA 3OJMA 4GA9A 2F2FA 1XTGA 2R0FA 5EHAA 1ABRB 3QW7A 3A07A 1LOEA 3RG0A 3RS6A 5GM0A 1XG6A 2CY6A 1AXKA 4J2KA 5AVAA 5D61A 2V73A 4XBNA 1WW7A 2LALA 2ZGKA 4A7ZA 2ZBJA 3F1RA 2D6PA 5DZUA 4G9MA 1AZDA 2DS0A 4Z8BA 1JOJA 1M16A 5D62A 1WW6A 1LU2A 2A75A 1HDKA 4I0YA 2P3KA 4G6MA 4GWNA 3AZXA 3BAUA 5BQUC 1G9FA 3VT1A 4PBPA 4OWJA 1G86A 2YUGA 4H04A 1Z4SA 3FLTA 3VWCA 4YGBA 1DQ2A 1S0FA 41BIA 3Q7YA 1MS9A 1YF8B 3FJAA 3AXEA 1Q8VA 1JLYA 3UD7A 2WBCA 2B7YA 3N36A 1HWNB 1CE7B 1ISVA 2QYIB 5EWSA 1N1VA 3E8LC 3C8AA 3DGTA 1KRIA 1K5UA 3DDBA 1VCLA 3ZURA 5DUUA 4YW4A 5DG2A 2BEAA 1MS8A 3OJVA 4YZ3A 1GSLA 3WMUA 1KJRA 3O0XA 5H9SA 1JT7A 1O4ZA 3IN9A 1A3KA 1W0OA 2AGSA 4R9DA 1IS3A 3ZXDA 4WV8A 1T3AA 1YBIA 3NBNA 4OW4A 3D7WB 4YW3A 1QOTA 3V79C 1IOBA 2D7FA 2VLCA 1FAYA 2ISGA 4P9WA 2DTWA 3WG1A 3HN1A 3BA7A 1TTUA 4JPZA 1YIFA 4XBQA 5GALA 2Z42A 1HCDA 4LBNA 5FNXA 2NZ9A 3OJBA 3O12A 4KTXA 2FFVA 4CZSA 5E8AA 3NV4A 2YY1A 2GNMA 4IYBA 2PHFA 1J0SA 1C1FA 4WZFA 3AZWA 3V0BB 2EXHA 4K21A 3SISA 3WDTA 2F2FC 2D1ZA 5HCFA 4HEVA 2NMNA 2RG9B 3BRDA 4L8QA 4I4OA 3BONA 2NM1A 3VT0A 1Z0HA 3D6EA 3CA3A 4XMAA 3V65A 5JOZA 3N7KA 1AXMA 3WHTA 4YOLA 4ZOTA 5IK7A 1ONKB 4XJAA 3AYDA 1CJPA 4KEIA 3DEBA 1LHUA 3ZXGA 4I4RA 4Q8KA 1LHOA 3V0BA 1QNYA 3WG2A 3KQRA 5GLWA 4XJWA 4Z8SB 3QYDA 1QMJA 2AREA 1Q03A 5GZDA 7I1BA 2NP0A 3SH3A 5EXOA 1IS6A 4FGFA 2PHRA 2GO2A 1OFSA 3WMVA 1QF3A 1LCLA 3ZUQA 3O3QA 2A70A 3BA4A 4ZFUB 3RMXA 4QKRA 2ISHA 5DG1A 3WCRA 3AJYA 4DRRA 3O5WB 3IIRA 2D6OX 1YRZA 2NYYA 4R9CA 4LO2A 2Q3NB 1S0BA 4XIOA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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