4ZKTB

Crystal structure of the progenitor m complex of clostridium botulinum type e neurotoxin
Total Genus 271
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
271
sequence length
1159
structure length
1114
Chain Sequence
KINGNLNIDSPVDNKNVAIVRSRDVFFKAFQVAPNIWIVPERYYGESLKINEDQKFDGGIYDSNFLSTNNEKDDFLQATIKLLQRINNNVVGAKLLSLISTAIPFPYENNTEDYRQTNYLSSKNNLVIFGPGSNIIKNNVIYYKKEYAESGMGTMLEIWFQPFLTHKYDEFYVDPALELIKCLIKSLYYLYGIKPNDNLNIPYRLRNEFNSLEYSELDMIDFLISGGIDYKLLNTNPYWFIDKYFIDTSKNFEKYKNDYEIKIKNNNYIANSIKLYLEQKFKINVKDIWELNLSYFSKEFQIMMPERYNNALNHYYRKEYYVIDYFKNYNINGFKNGQIKTKLPLSKYNKEIINKPELIVNLINNTVLMKSNIYGDGLKGTNFYSNYIIPYNHSINYSYLDNVNIEEIEKIPPINDEDIYPYRKNADTFIPVYNITKEINTTTPLPVNYLQAQMIDSNDINLSSDFLKVISSLVYSFLNNTMDYLEFIKYDKPIDTDKKYYKWLKAIFRNYSLDITETQEISNDTKIIPWIGRALNILNTNNSFVEEFKNLGPISLINKKENITIPKIKIPSSMLNFKDLSENLFNIYCKNNFYLKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMASKSVLAQEKLIKKLIQKQLRYLMENSNISSTNLILINLTTTNTLRDISNQSQIAINNIDKFFNNAAMCVFENNIYPKFTSFMEQCIKNINKSTKEFILKCTNINETEKSHLIMQNSFSNLDFDFLDIQNMKNLFNSYTELLIKEQTSPYELSLYAFQEQDNNVIGDTSGKNTLVEYPKDIGLVYGINNNAIHLTGANQNIKFTNDYFENGLTNNFSIYFWLRNLKQNTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFENDGLVFNIIDSNGNEKNIYLSNISNNSWHYIVISINRLKDQLLIFIDNILVANEDIKEILNIYSSDIISLLSDNNNVYIEGLSVLNKTINSNEILTDYFSDLNNSYIRNFDEEILQYNRTYELFNYVFPEIAINKIEQNIYLSILNFKPLKFKLLNQYVQKWDEVIFSVLEKYLDISTTNNRIQLVDNKNNAQIFIINNDIFISNCLTLTYNNVNVYLSIKNQDYNWVICDLNHDIPKKSYLWIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase/toxin
publication title Molecular Assembly of Clostridium botulinum progenitor M complex of type E.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bontoxilysin A
total genus 271
structure length 1114
sequence length 1159
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 4zktB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4zktB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4zktB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 4zktB01
1JQZA 3OGFA 1EYLA 9ILBA 3AP4A 1IS3A 3AJZA 2A3YA 4CJMA 1WLDA 4FPEA 3BOOA 1PZZA 4PQ9A 3VKOA 3C88A 5HCBA 2W08A 4EB2B 1A3KA 4Y1UA 3GALA 1IHKA 5FREA 2QN0A 3O0VA 3WO3A 2M49A 1F5FA 1JHNA 1W6MB 4GWNA 4ZFWB 2GO2A 2ZHLA 3ZPYA 4BMBA 1WW4A 4MYEA 1DZCA 2A7AA 4Y22A 5F8YA 4LBQB 3A23A 1G9CA 2D1ZA 2DRZA 1SR4C 3BX1C 1C4RA 2FMDA 1ISZA 2GZBA 2ZGOA 1JYIA 1CPMA 3MW2A 3WINC 2EXIA 1GSLA 4FPOB 2BFHA 1OQLB 3VV1A 2YZ4A 4D0TA 1LTEA 5DG2A 4AYUA 1GYKA 1BXHA 1G7YA 2P2KA 1ITBA 1Q8SA 4D69A 2EIGA 4LO1A 3F62B 4XBQA 2Y9XE 3CRHA 4AGGA 4LBMA 3K1XA 5IK8A 1UMZA 2ZA9A 2ZZJA 5FZUA 2NN8A 3O5WB 4I4PA 1W6MA 2XG3A 2R1BA 4II0A 4XTMA 3D5OA 1JY0A 4FPKA 1GZ9A 4HL0A 4AVVA 1S0DA 2JKBA 1I1BA 5CNAA 1GV9A 4LBQA 1AX0A 3S8KA 4PBPA 1YBIA 3DDBA 3W58A 3MPPG 2ARBA 1DHKB 1NUNA 4P0KA 1KNMA 2OW4A 1MC9A 1SBEA 1BQPA 3GNEA 5H9RA 4W65A 2AFGA 3H6QA 5DZUA 3RTJB 1FX5A 1HKDA 1YO8A 3WO4A 1Y7BA 4KEJA 1BFFA 4YG0A 1OQ1A 2VW1A 3DEBA 1W6QB 1ZA4A 2NMNA 5E8AA 2D6LX 21BIA 2PELA 5T5PA 3O5SA 4AGRA 3FJEA 2AGSA 1II4A 3PHZA 4JKQA 3WA1A 4EFQA 3FGMA 4Q9GA 3BAUA 5EHAA 4XTPA 3M3QA 3SH3A 1KJLA 1HWOB 4I37A 2FFVA 4FPFA 4EFPA 5GALA 4G9MA 1CVSA 1DFCA 2ZHKA 5HPZA 3ZVXA 4YZ1A 3EF2A 2ERFA 4LO0A 1N47A 2DVAA 3O4AA 3N3HA 4UW4A 4XFTA 4OEEA 3CA6A 2MIBA 1GKBA 2CWSA 1W6PB 2PHUA 4RA0A 3BA7A 2GMMA 3LSDA 1W6QA 2NMOA 4J2YA 4YZ5A 2OUHA 4DQAA 4Q2FA 3AKIA 5E89A 3A4UA 1MS4A 3I2XA 3P53A 5IT6A 1FMMS 1LHVA 3O12A 2Q3NB 1AXYA 3SNVA 2DURA 4GXLA 3WDXA 2X2SA 1V6WA 3BTAA 4D0ZA 2A70A 4ZFUB 5E88A 4ELCA 1ZN3A 4K1ZA 4XJAA 3A07A 4YGEA 4BPZA 4XBNA 4XZPA 2DUOA 1UX6A 1GLHA 2A71A 2A5ZA 5KXCA 1A78A 5HCAA 4LO7C 4DRRA 2AXMA 5G00A 5KXEA 1LOBA 1ENRA 3Q7WA 3S8JA 3RTIB 1KJRA 4Q91A 3SITA 2ARXA 5F8WA 3PVNA 1S0LA 4FOWA 3WDVA 4YZ4A 2R0FA 3FJCA 2ZHMA 1XQNA 1AX1A 3NF3A 1J1TA 5F8SA 3M3EA 3MEPA 3ZYRA 4M3CF 3B69A 1AXZA 1W6PA 1WLCA 4LBJA 4XXAA 4OWJA 5JVVA 4FPCA 2P23A 2IHOA 4FPGA 1N1SA 2CWMA 4DENA 3CNAA 1LU1A 1JLXA 1RG8A 5CB7A 2ILPA 3QW6A 3C2UA 5DUWA 1V6LA 1AXMA 4GP0A 3T2TA 5FZZA 2WKKA 5GLZA 2KH2A 1AFCA 4Q27A 3IMNA 5H9PA 3DDAA 4BM8A 2W52A 2EXHA 2A6VA 4IHZA 5GJ6A 4AN6A 31BIA 3NV2A 1UPSA 4IONA 1UN1A 1RZOB 4I4XA 4ITCA 3POWA 4UW6A 1N1TA 5DUXA 4C1XA 5GLUA 1SR4A 3AX4A 2KI6B 3BA4A 2WJSA 1JLYA 4G6JA 1W6NA 3AZYA 1H9PA 3IIRA 2FGFA 3WINA 2Z48A 1T9FA 4Y26A 1H30A 3VKNA 3FUOA 5BYNA 3WVJA 3APBA 1VCLA 2DWRA 1LOAA 1HKNA 1N3PA 1IJTA 4XDQA 1CVNA 2JDZA 3KQRA 2R49A 1IOAA 3BAQA 3BA5A 3AYCA 3HN1A 1G9AA 3LSEA 4A7KA 3FJJA 3UJOA 1WBAA 3O3QA 5FZYA 1YIFA 4KTXA 2DVDA 3OBTA 41BIA 4BMEA 4M3CB 5IUQA 3UD9A 1QDCA 4R9AA 1PC8B 1W6OB 3WLUA 4F83A 2A6YA 4LO8B 1GANA 4Y1ZA 1YTOA 4ZGRB 2PHFA 1QU0A 2TEPA 5BP5C 3WOGA 4FOVA 1WW6A 3E8LC 1XG6A 3N7JA 3H0OA 2WT0A 4FVVA 3QW7A 2BQPA 1DQ6A 4XBLA 1Q8OA 3PUBA 1WUVA 4OWKA 4OZXA 1FWVA 1Q8PA 1K5VA 1LOCA 4TZDA 3O4BA 3R4UA 4YZ2A 3AKHA 1UZYA 4JC1A 3AFKA 1PUMB 4WZFA 2UUSA 4HJJA 1KITA 3WCRA 1BASA 4YG6A 3F1RA 1QMJA 3O0XA 4I6IA 2ZABA 4QO3A 2ZACA 1TIEA 3OY8B 4GA9A 1HCEA 4G6MA 1VLNA 4LO3A 1W6OA 2ZKNA 1N1YA 4HA2A 2NM1A 1TFMB 5JLVA 1AJOA 3FJKA 1PUUB 3QR5A 3FJHA 3M3OA 4PCRA 1NZKA 5D62A 1FYUA 8I1BA 3I4IA 3WHTA 3NJ5A 2V73A 3ZYPA 1GZCA 1SLLA 2D3SA 5H9SA 2EF6A 4I2SA 2C9AA 1BFBA 2PHRA 3MW3A 1LEMA 4K20A 1YVGA 3AJ5A 3IPVB 3A0KA 4QC4A 1YI7A 5DUYA 4HEVA 1A8DA 5DZGA 3Q7XA 4XIOA 1MS9A 1DQ0A 2GMPA 3AP9A 5KXDA 2BEAA 1J0SA 4LBKA 3RG0A 2GDFA 3D3XA 4QKRA 4DPNA 1TEIA 3PVEA 2VLCA 2C5DA 4Y1XA 4GKXA 3OJ2A 1GBGA 4CRQA 4QKSA 3HALA 3RRDA 3V64A 3DGTA 1FV3A 5GLTA 2HWAA 2E51A 3D7WB 4ZJXA 3AH4A 5BXRA 2ZAAA 4OWLA 1YYNA 1DBNA 1DIWA 4KBBA 3UJ4A 4Q26A 4M3CE 1G9BA 5DZFA 5EWSA 2MLLB 1GICA 2KI4A 2D44A 5BXPA 4USPA 3L2YA 3ZC9A 2ISGA 1DQ4A 2ZGLA 3LCPA 5JOXA 4AN7B 1E0OA 3NBCA 3AZVA 3CA0A 4A7ZA 4PC4A 1ENSA 5GZDA 1G86A 1QXMA 2G7PA 5IK5A 3IN9A 3U4XA 2DV9A 3NBNA 2DU1A 3ZXGA 1W3GA 3RMYA 1JT5A 1JOJA 1UKGA 2ZBJA 4GP3A 3WG1A 1FGAA 1DQGA 4FPYA 4USOA 3H6RB 3ILAA 4NO4A 5GZCA 2P3KA 5F90A 1DQ2A 5DUUA 1PZ9A 2HW9A 3PG0A 4HANA 1BJQA 2ZQNA 4C1WA 4FP2A 2F8XC 2P37A 3I8TA 1MS8A 4H04A 1DGLA 2ESUA 4J2SA 1N1VA 4UW3A 1LECA 3QIZA 1JXNA 4J2KA 1Z4SA 3O4OA 3A21A 1CQ9A 2CNAA 1Q8VA 2SLIA 2AH2A 3N7LA 1NXD1 4GAIA 3FJIA 4WVVA 4KS6A 2A6ZA 4Y24A 2AYHA 2IMAA 1VAVA 3OJMA 3AZZA 4RL7A 2FDBM 4EL4A 4YW4A 4I4OA 1LGCA 1CPNA 5JMCA 3QW8A 3VT1A 4TYSA 3H6RA 4YLZA 4I96A 3BONA 4YM0A 1MS3A 4XOGA 1JTCA 1F31A 3AYDA 2Q5TA 3WDYA 4XKIA 3ZURA 2GN3A 1BARA 2PHWA 5BP5A 2DU0A 2GALA 2A75A 1DZDA 1KDMA 3KM5A 1QF3A 3C89A 2AREA 1SBDA 2HWMA 1TOOA 1RIRA 4L8QA 3RS6A 4K1YA 2J3PA 4ZOTA 1LOFC 4GKYA 3AK0A 4YW3A 2D3RA 4FPHA 2RHPA 2K4AB 2FPQA 4U2AA 3AJ6A 1ULEA 3R05A 1LCLA 3BOKA 3WZ1A 3UD7A 3CA5A 1VIWB 1G82A 3CRGA 4LO3C 4TLPA 1BLAA 3W59A 4I7IA 1CIWA 3CQAA 4DFSA 3BAGA 2FHRA 2G4IA 4YM2A 4DRVA 1GNHA 1YF8B 4JQ0A 3D4KA 4FGFA 1SLIA 1BKZA 3AZWA 2ZR1B 4FQ4A 4FOYA 3V0BB 5F9TA 1HIBA 4YM1A 1LOGA 3M2MA 2ZMLA 2UWAA 2VU9A 3QJ0A 1EV2A 1LJ7A 2ZGKA 3FIIA 3B9CA 4EEEB 1V6JA 1M2TB 1Z7HA 2ZGSA 3AYAA 1IS4A 3R4SA 2WT2A 2E7TA 5D61A 1D2SA 4M01A 3OBRA 3CA1A 3JUTA 3ZXJA 1XYFA 2YV8A 2QN4A 1S0JA 4WV8A 3FLRA 4EKXB 1WBLA 2IMBA 5SV8A 4YG3A 2GMEA 3BADA 3I2AA 1SFYA 1RY7A 3SH4A 3ZUQA 2MC2A 1SLCA 4OEFA 3LTQA 2E7QA 3ILFA 2JE9A 2A6WA 4Q9PA 1LGBA 3V0BA 3HSMA 1APNA 3N7KA 4FPLA 3A22A 5GZGA 4J23B 1AZDA 2E53A 2G7NA 1YRZA 2WSUA 1AVBA 2AENA 3TAYA 2E4MA 3BRFA 3M1HA 1S0FA 2DUPA 3NBEA 4YW5A 5JDBA 1HQLA 2ERMA 2WRYA 2A3XA 3B3QE 3BAHA 1ZKWA 3OJVA 4DS0A 4DCKC 2DRYA 4P9YA 3B01A 1M16A 4IY8A 3C8AA 4R9CA 3RSJA 5EYXA 4OW4A 5T52A 2AR6A 2ZHNA 2ZMNA 2V5YA 2D6NA 3HR9A 3ZUSA 3ZXFA 1DQOA 3CAHA 4QBVA 4I8MA 3FJFA 1MVQA 3VT2A 1MZ5A 1Q56A 3FBYA 2FO1A 5GZFA 5IK7A 3ZSLA 2Z42A 4KEKA 3RMXA 4FP3A 4YM3A 3Q7YA 1CR7A 4KEIA 4WVWA 4YGDA 1V6MA 4KUFA 2I1BA 3CRIA 3DSEA 4ZLBB 2P3JA 3HOMA 3UDAA 4YZ3A 4GALA 3K3QB 1SACA 2ZMKA 3IM0A 2DTYA 1CONA 2ZGPA 3ZXEA 1LENA 1N3OA 1MZ6A 3VT0A 1VAMA 2FFUA 3NBDA 1FN0A 5BXTA 4K21A 4I4VA 2VW0A 4LO2C 1GZWB 2DREA 3VSFA 1DFQA 5DG1A 3BRDA 2D7FA 1S1AA 3JU9A 4D8HA 4JCKA 3FUQA 1ZL5A 3ZXKA 4XMIA 3AP7A 2RG9B 1V6OA 2CTVA 2YMZA 2CY6A 3ZC8A 1W0OA 4QD2B 1L2HA 1MD6A 4YFWA 2LTNA 4FPJA 3IM5A 3BAOA 2XHLB 2HYKA 2GNDA 1DQ1A 3B00A 4JP0A 1AF9A 2DVFA 4YW2A 2NZ9A 2D6KA 1DLLA 3UK9A 2D6MA 3KMVA 1MR5A 2JECA 3IKWA 1TP0A 3NWKA 4J2XA 2DS0A 3MALA 2DYCA 2D24A 1LOFA 1JYCA 2WBCA 2R1DA 5BQUA 2P3IA 1BLDA 2ISHA 4IZEA 2NP0A 5H9QA 2GNTA 4I30A 4LBNA 4M3CA 1ILR1 1BFGA 3FJ8A 4FQZA 1ISXA 1SLAA 3RQ0A 4U36A 4XJWA 3ILRA 1PZ7A 3DUIA 1S0CA 1UAIA 1WLWA 1DQ5A 3UL2A 1FATA 1ULDA 2CYFA 1IT0A 3FJDA 2DVGA 2R0HA 1N3QA 1V6KA 2XHLA 2K43A 1AX2A 3QW5A 3WMVA 1IKQA 4XJUA 2JD4A 1WD3A 1CE7B 2F2FC 2GN7A 5GLWA 3O4CA 5T55A 3ZXDA 1C57A 2JE7A 3OGGA 2NTDA 5EYYA 2RSTA 1O4YA 2XB6C 3CU1B 2VY0A 3OY8A 1YXWA 2SBAA 1FWUA 3N35A 4Y1VA 2D20A 5BOWA 2VXTI 4UW5A 2ZGUA 3POKA 2RQ9A 3A0NA 3WMUA 4X39A 4I4UA 1ZKXA 3VWCA 1QQKA 1AVAC 1ZB7A 4CTEA 4Z8BA 3FJ9A 1LHUA 2W2DB 4P9XA 1SCRA 5GM0A 1GNZA 1MACA 4Q8KA 1ULGA 3TB0A 1CN1A 1N4KA 4P14A 4XHXA 4I4RA 1W0PA 1LGNA 2E4MC 1LODA 3IPVA 2ES3A 1F82A 4AGVA 6I1BA 3DS9A 4YW1A 1VALA 5EG6C 3BODA 2W68A 1AXKA 3C9ZA 1KRIA 1IS5A 4PF5A 5LK5A 4P0JA 2Y9GA 3CA3A 1LOEA 4ZBVB 4JAWA 3OPZA 1OFSA 5T5OA 1HDKA 4YOLA 4BLJA 1FMZA 1ISWA 4X38A 5BQMB 4ATFA 3CA4A 4YFZA 2IWTB 1Z78A 3WUDA 1FQ9A 1T4QA 2W2DA 3PJQA 3ILNA 3JRRA 1PZ8A 4L4HA 1JBCA 2W39A 1B09A 4IQPA 3WDWA 1IOBA 3QCWA 4I0YA 2B7YA 3B9UA 4ZKTB 3BIWE 1V6XA 1ENQA 2WT1A 4NOTA 1SLTA 1WW5A 1IILA 3SH5A 2VUAA 4JRAA 2KLLA 1S0EA 3BWIA 4R6UB 2H0BA 1Z2VA 1ULFA 1R8OA 5I1BA 3WNXA 5GZEA 2WSVA 1EVTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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