4ZKTB

Crystal structure of the progenitor m complex of clostridium botulinum type e neurotoxin
Total Genus 271
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
271
sequence length
1159
structure length
1114
Chain Sequence
KINGNLNIDSPVDNKNVAIVRSRDVFFKAFQVAPNIWIVPERYYGESLKINEDQKFDGGIYDSNFLSTNNEKDDFLQATIKLLQRINNNVVGAKLLSLISTAIPFPYENNTEDYRQTNYLSSKNNLVIFGPGSNIIKNNVIYYKKEYAESGMGTMLEIWFQPFLTHKYDEFYVDPALELIKCLIKSLYYLYGIKPNDNLNIPYRLRNEFNSLEYSELDMIDFLISGGIDYKLLNTNPYWFIDKYFIDTSKNFEKYKNDYEIKIKNNNYIANSIKLYLEQKFKINVKDIWELNLSYFSKEFQIMMPERYNNALNHYYRKEYYVIDYFKNYNINGFKNGQIKTKLPLSKYNKEIINKPELIVNLINNTVLMKSNIYGDGLKGTNFYSNYIIPYNHSINYSYLDNVNIEEIEKIPPINDEDIYPYRKNADTFIPVYNITKEINTTTPLPVNYLQAQMIDSNDINLSSDFLKVISSLVYSFLNNTMDYLEFIKYDKPIDTDKKYYKWLKAIFRNYSLDITETQEISNDTKIIPWIGRALNILNTNNSFVEEFKNLGPISLINKKENITIPKIKIPSSMLNFKDLSENLFNIYCKNNFYLKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMASKSVLAQEKLIKKLIQKQLRYLMENSNISSTNLILINLTTTNTLRDISNQSQIAINNIDKFFNNAAMCVFENNIYPKFTSFMEQCIKNINKSTKEFILKCTNINETEKSHLIMQNSFSNLDFDFLDIQNMKNLFNSYTELLIKEQTSPYELSLYAFQEQDNNVIGDTSGKNTLVEYPKDIGLVYGINNNAIHLTGANQNIKFTNDYFENGLTNNFSIYFWLRNLKQNTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFENDGLVFNIIDSNGNEKNIYLSNISNNSWHYIVISINRLKDQLLIFIDNILVANEDIKEILNIYSSDIISLLSDNNNVYIEGLSVLNKTINSNEILTDYFSDLNNSYIRNFDEEILQYNRTYELFNYVFPEIAINKIEQNIYLSILNFKPLKFKLLNQYVQKWDEVIFSVLEKYLDISTTNNRIQLVDNKNNAQIFIINNDIFISNCLTLTYNNVNVYLSIKNQDYNWVICDLNHDIPKKSYLWIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Molecular Assembly of Clostridium botulinum progenitor M complex of type E.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bontoxilysin A
molecule tags Hydrolase/toxin
total genus 271
structure length 1114
sequence length 1159
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 4zktB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4zktB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4zktB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 4zktB01
3C8AA 2PHFA 4FOWA 3HN1A 5H9QA 2NZ9A 4KC3A 5DZGA 2ZABA 2K43A 4Q9GA 5DUUA 1WLWA 4PC4A 5CNAA 2HYKA 1FGAA 1HCDA 4FGFA 1JLXA 4GKXA 5JLVA 1S0IA 2E7TA 3MW4A 2I2SA 1GANA 2L5XA 1GZCA 4XTPA 1PWAA 3WDTA 3CNAA 1O4ZA 1LJ7A 1IRPA 3D3XA 4ZXKA 2VXTI 1ITBA 5BVPI 1RITA 3WVJA 4JPZA 3O0XA 5F8WA 4QALA 1VLNA 3W59A 2RSTA 3POSA 4DPNA 1Z7HA 1PC8B 4GP3A 3ZUQA 3ZXDA 4LO2C 5T52A 3DGTA 4SLIA 1HQLA 1RG8A 2MIBA 5H9PA 4YLZA 4YM0A 3C9ZA 3SNMA 3C8BA 2JE7A 3WMUA 4JCKA 2NM1A 4XBQA 1Q8SA 2ERMA 3A21A 6I1BA 3RSJA 3PUBA 4JAWA 4G1RA 5GM0A 4WZFA 1HWMB 3N7MA 1CVNA 1H9WA 1CESA 2ZHKA 4YM3A 1AJKA 2ZHMA 1BYHA 2ZHNA 2KI4A 4Q9PA 4XJUA 4LO0C 1CJPA 1E1HA 4Z8SB 3N35A 4BMEA 3ILAA 3FUOA 4XMAA 1XG6A 1FQ9A 3MEPA 4ZLBB 5BQMA 1V00A 4P0JA 1ENQA 2ZHLA 3JRRA 2X2TA 21BIA 2G7QA 5EYYA 1DBNA 4XBLA 5LK5A 1W3FA 3I2XA 4D8HA 1DQ0A 2Z49A 3HMYA 1WW4A 2Q5TA 4HA2A 2JJ6A 2R1DA 2B7YA 4I6IA 1V6UA 1ISYA 2WLQA 3WDYA 1S0EA 4L8QA 4BQ1A 4AN7B 4FPLA 5IK7A 3VKMA 5GZGA 1LODA 3AYCA 2OUHA 1B09A 4I4OA 1RINA 4QC4A 1V6JA 2UWAA 3I29B 3O4AA 3CRIA 1ZL6A 4M3CA 2ZMNA 2WRYA 1DYKA 4QD2C 1LOFC 2A97A 2E4MC 3O49A 2YROA 3B69A 5EXOA 3FLPA 3AP4A 3EF2A 2DU0A 3FJBA 5DUWA 1G9DA 4C1WA 3BAGA 3Q9OA 4K20A 3WDXA 4TZDA 3P6JA 3HOMA 2XHLB 1AJOA 1WBLA 4LO3A 1LGCA 1GYKA 2I1BA 1QOTA 2IHOA 1S0FA 4QO3A 1RY7A 4JKXB 1VAVA 1JT7A 2ZGUA 3NV3A 2AYHA 3NBCA 1G8WA 4D0ZA 1ULFA 3QIYA 2OVUA 3WA1A 1S0JA 2BEAA 1W6QA 4K21A 3UD8A 5BOWA 2DRZA 3ZYRA 3W9TA 4YM2A 1SR4A 3INAA 1M16A 3WO4A 2HWMA 2EAKA 3SH5A 5T5JA 3A0NA 1V6NA 3JUTA 4IYBA 4BLJA 3QW7A 4R9AA 1AFCA 4ZA3B 4LBOA 4L4HA 4ZFUB 3OPZA 1ISVA 1RIRA 1BA7A 3POKA 2KI6B 1IKPA 3ZUSA 4IZEA 4EB2B 4I4XA 1AXYA 1Q04A 4UW5A 1LU1A 5IUQA 4AGGA 1ZKWA 5EYXA 1S0BA 1Y7BA 1LENA 3AX4A 1T4QA 3LCPA 3IM5A 2Q9XA 3VT1A 1JHNA 1IJTA 5DUVA 2Z42A 5IK5A 1ZL5A 4YW4A 1O4YA 31BIA 1GLHA 3DS9A 1ULDA 4I4RA 3AJ5A 1Q56A 2RHPA 2UURA 5E8AA 5GALA 1VIWB 2ISGA 4YZ5A 4Y24A 3BAUA 1GNHA 2ISEA 3VEQA 1W6NB 3D5OA 1SCSA 2AH2A 2ZGOA 2K4AB 3M3EA 2GNDA 3BAQA 3GNEA 4GAFA 5KXBA 1TTUA 1CVSA 1OQLB 2ZA9A 3NV2A 1WLCA 4Y20B 4WV8A 5GLZA 1URXA 1Z78A 1AVUA 3O4OA 5BYNA 1JW6A 2YUGA 3H6RB 3WMVA 4LO1C 2RQ9A 1CQ9A 4ENDA 3CAHA 1LHNA 2CWSA 4DRVA 2ZBJA 4I8MA 4G9MA 3FLTA 1FV3A 2Y9GA 4GKYA 4Z9WB 4Q26A 5F9TA 1MS5A 2AAIB 3CA6A 3ZXLA 1YTOA 4ATFA 2W52A 3ZXGA 3AKIA 1KITA 3POYA 5BXSA 1FNZA 3BAOA 3KQRA 1BARA 3B9CA 4R9BA 5BP5A 4M3CF 4PF5A 2GMPA 1N3OA 2A3XA 4XDQA 3WDWA 1K5VA 3SH4A 3WOGA 3MALA 1W0OA 2DU1A 3WUCA 3UJ4A 4I1BA 5HCBA 4HANA 2ZGSA 1W6PA 2MLLB 3FFZA 3ZXJA 3VT0A 3ZC8A 1ULCA 1KJLA 4FOVA 5F5QA 2GMEA 2XOAA 1UMZA 4R9CA 4EFQA 5GLVA 1ISZA 3R05A 1ZB7A 1LGNA 1YBIA 3N7LA 1JYIA 2YMZA 1UZYA 2A6ZA 1W6MA 4U36A 4KBBA 3RTIB 2CNAA 4YGEA 2WT0A 3OY8A 2DUOA 3DDBA 4FP3A 4EKXB 1T9FA 4ASMB 5FREA 4QKRA 3IPVB 1ZN3A 2QYIB 1J0SA 3WCRA 4P0KA 1GZWB 4YZ3A 3H6SE 2JD4A 1PZ7A 4FPYA 2YY1A 2AXMA 3UD7A 2PHWA 2D6LX 1Q1UA 4MYEA 3RMYA 1LHUA 3AK0A 1Q8PA 2D20A 3O4DA 3W58A 3MW2A 2OW4A 5DZFA 2HW9A 2ZGQA 2ZGRA 4I1EA 4X38A 2E51A 3PVNA 2IMCA 1LHOA 5D63A 2JKBA 1YRZA 3M2MA 2ET2A 1LOGA 3B00A 1V6XA 1MR5A 5BQUA 1MS0A 2D3RA 1IOBA 5DVHA 3V64A 3S8JA 2IMBA 3O3QA 3Q7XA 3O5SA 2BQPA 4GWNA 1CR7A 3T2TA 2BFHA 3CRHA 4DRRA 3I2AA 2CTVA 1K5UA 3AZWA 1LCLA 1JT5A 3LTQA 1LEDA 2F2FC 1G7YA 1VALA 3MW3A 4I0YA 4KEIA 2DTWA 3WG2A 3OJ2A 1T3AA 2GNTA 1JN2P 4Q1RA 5JOZA 4EFPA 5DZUA 3CA5A 4USOA 5KXDA 5T54A 3D6EA 4IY9A 5HPZA 1V6MA 3V0BB 2P3IA 3IN9A 3AZYA 4I4VA 3RMXA 2NMOA 2R49A 4QD2B 4X39A 1LECA 3O12A 3OJMA 3WHTA 3BONA 4Y1XA 4GOYA 4YM1A 4Q1PA 2PELA 1HCEA 2DUPA 3AP5A 3IM6A 1BJQA 2ZMKA 5IK8A 3QIXA 2SLIA 4YW1A 4I96A 3AXEA 1KDKA 4I30A 4IONA 1FN0A 4U2AA 3P53A 1MS9A 1LTEA 2KKIA 5CA6A 4YW5A 2GMMA 2WBCA 4BM8A 2Y9WC 1ULGA 3FLRA 1J1TA 3R4UA 5GLUA 1G86A 4LBMA 5CAZA 3ZX7A 4GALA 1KJRA 1N1VA 1ABRB 4QBCA 3RRDA 1U0AA 1DZQA 4FPKA 1W3GA 1T3CA 3WINC 3LLPA 4P6AA 2EXHA 4L4IA 5JOWA 3QIZA 2D3SA 4W65A 5T5OA 5B2HA 4D69A 1H9PA 1N1SA 3SH3A 2VW2A 1Q8VA 2HZ9A 1I1EA 3T1MA 1LU2A 1LHWA 3CQAA 3OBTA 2DVGA 1N4KA 1S0LA 1N3PA 1GKBA 2A3YA 4WVVA 3PHZA 2P37A 1NXD1 4FPCA 1YF8B 1QNYA 4OEFA 2R0FA 2JECA 3D7WB 1G9CA 4WBCA 4JP0A 1IOAA 3O5WB 4I7IA 2Q3NB 3ASIA 1DGLA 4AN6A 4K1YA 2NTDA 1FMMS 1F5FA 1BFCA 4ZBVB 1KQRA 2DVAA 4IY8A 1ISXA 4P0LA 2VSEA 3AJZA 4J1LA 3VKNA 5DUXA 2DV9A 4PQ9A 3SISA 1JQZA 4GA9A 4ZKTB 2JE9A 3ZSMA 2DVFA 2WSVA 1UN1A 1AVWB 3PJQA 3F62B 4ISQA 3BOKA 3BAHA 3TB0A 3QR5A 3FIEA 3BB2A 3C89A 3VKLA 4AVTA 2UUSA 2FFVA 1JLYA 4XJ8A 1YYNA 3N7JA 2D6OX 4PBOA 4D0TA 3V79C 3UD9A 1V6KA 4EL4A 2Y9XE 1SLTA 3QCWA 2FFUA 4HL0A 3BTAA 2MC2A 3BRGC 2A75A 3WG3A 4A7KA 3T8SA 2A8AA 3R4SA 4IHZA 1LOBA 3RG0A 3WCSA 5BXTA 2FGFA 1S1AA 2DVDA 1WBFA 1EVTA 3QYDA 1QGLA 1FNYA 1DYPA 2VH9A 1V6OA 4YW2A 3PVEA 1Q03A 2ERFA 1SCRA 2KM2A 2D6PA 4Y22A 3RTJB 4NO4A 2ISHA 3ZXFA 1N1YA 1QDOA 1ONKB 4XXAA 2WSUA 2WKKA 3ZC9A 1YXWA 5BXPA 4P14A 5L73A 4II0A 5IT6A 3V0AA 1TWEA 1DQGA 1S0GA 3OBRA 1AXKA 2AFGA 1KDMA 1HQWA 3USUB 1SLBA 2KLLA 2P23A 1CONA 2IMAA 2D7IA 2XB6C 4M3CB 1DQ4A 3N3HA 5T55A 2WT1A 2LIQA 4FP2A 3H6QA 1AX1A 1IS3A 3BRFA 2J3PA 2AUYA 5CBLA 2EIGA 5BXRA 1QXMA 2NN8A 5FZUA 2ZGTA 1FATA 3C88A 5H9SA 2D6NA 4M3CE 2D7RA 1YO8A 1A3KA 4AYUA 1MC9A 3A22A 3IAGC 4M00A 1FYUA 5GZEA 2W39A 3FGMA 1WD4A 8I1BA 1QMJA 3UJOA 1NZKA 1NLSA 4FQ4A 1DQ5A 2YZ4A 2FDBM 3FJEA 2R9KB 4GOVA 1TEIA 2DYCA 3AP6A 1AX2A 3VSFA 1BLAA 3SLIA 3A4UA 2UU8A 2A6XA 5H9RA 1G82A 1AVAC 4XTMA 5GLTA 3HSMA 3BRDA 3ZPYA 3FUQA 2F8XC 1R1ZA 1LOEA 2PHTA 4OWKA 1W3AA 1ENRA 4EEEB 1WLDA 4XXPA 3AXDA 2WJSA 4ZFWB 4PCRA 4GXLA 2NVHA 2R16A 2TEPA 2X2SA 3SNVA 4BLIA 3FJHA 2EF6A 4H04A 2WNEA 1JY0A 3SITA 3ZSLA 2ZQNA 3AZVA 4F83A 3O0VA 3QW5A 4LO2A 1WW6A 1CIWA 2A6YA 4WVWA 2EALA 3E8LC 2M49A 1GZWA 1DFCA 4LBJA 1V6IA 1A8DA 2CY6A 1YIFA 1KRIA 4XIOA 2NMNA 2ZQOA 4ITCA 3AFKA 4I2SA 4Q91A 3B01A 3QW8A 4LBNA 1N47A 4X37A 1LULA 2NYYA 1L2HA 2E53A 2FPQA 5FZZA 41BIA 1F82A 5CB7A 1Q8OA 3WV6A 3ILRA 4ATEA 4OZXA 2Z48A 3S8KA 1EV2A 1DQ1A 1GSLA 4LO0A 2W08A 4XE9A 4GAIA 3CA4A 1TP0A 1XYFA 3FJ9A 4I37A 1GGPB 4XJAA 4LO3C 4LBQB 2PHUA 4J2SA 1IRAX 2CYFA 4UW3A 4ZGRB 4CJMA 1A78A 3IM0A 1JBCA 1HWOB 1X50A 1V6VA 3OYWB 2ETFA 1I3HA 5JDBA 1OFSA 3IMNA 1ZM1A 1DZDA 1AXMA 1SZ6B 4ZJXA 1AXZA 1QOSA 2VW1A 3FJ8A 5SV8A 4YZ2A 3A23A 1BQPA 1RMLA 1ISWA 5BQNA 1SR4C 3V0BA 1ONAA 4DFSA 2ZGMA 5KXCA 1V6WA 1SBDA 2XG3A 3FIIA 3CA1A 2SBAA 5DSSB 1LOFA 3M1HA 3WNXA 2E4MA 4BPZA 4TYSA 3VSZA 2QN0A 2ZGKA 3A0KA 1AVXB 4XBNA 3APBA 1W6PB 2DRYA 1FMZA 2QN4A 2GNMA 1W6OB 2DS0A 2V5YA 2A7AA 3IKWA 1LEMA 3BX1C 5AVAA 5D62A 2K8RA 4OW4A 2G7KA 4EJ5A 4J2KA 2UWCA 4XYXA 4P9WA 4XFTA 3NJ5A 3WG4A 3WG1A 3P6IA 2GDFA 1JYCA 4UW6A 4YZ1A 2PHXA 4R6UB 1QDCA 3WLUA 4FPGA 2VSAA 4QKSA 4BMBA 1W0PA 4PBPA 1WBCA 2W2DB 2ZMLA 1BFBA 1UZZA 4UW4A 3ENRA 1G9AA 1XTGA 2ES3A 4FPOB 1ZA4A 1AX0A 2JDZA 2ZACA 4LO7C 7I1BA 3TC2A 1MVEA 1IS5A 1PZ8A 3VWCA 1N1TA 1MVQA 3POWA 3WO2A 1V6LA 4AWDA 1MS8A 3FJCA 4CRQA 4CTEA 4JC1A 3IIRA 2VW0A 1FV2A 3DSEA 1DQ6A 5GAQA 1D0HA 4XJWA 4KUFA 4Y1YA 4RA0A 3I8TA 4G6JA 3WDUA 3BA7A 2NP0A 1PZZA 4OUJA 1JTCA 4I4UA 3K1XA 2GNBA 2EXKA 4Q8KA 2ILPA 5HCAA 1SLAA 2D43A 1BFFA 2LIEA 4J2YA 4F34A 1HKNA 1IKQA 1P63A 1MS3A 1LOCA 3ZXKA 1IS6A 1TFMB 1Z0HA 4CZSA 3B3QE 2D6MA 1EPWA 3ZSJA 2P39A 4DCKC 1ENSA 2G4IA 5KXEA 2ARXA 2ZGNA 3FBYA 2R0HA 1GBGA 4AVSA 4YGDA 1MZ5A 3PVOA 5BP5C 4IZXA 1AF9A 4Q2FA 3QW6A 1R8OA 3UJQA 3KMVA 1FWUA 3NBNA 1HKDA 1IS4A 3M3QA 3JUUA 1TOOA 4Y1VA 5T5PA 1OKQA 4YGCA 3V65A 1PZ9A 4XZPA 1WW7A 4HR6C 3BOPA 1JXNA 3KM5A 1DJSB 4LBLA 3BAVA 2FMDA 4J2XA 2XHLA 4LO1A 1PUUB 2AENA 4HJJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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