4ZKTB

Crystal structure of the progenitor m complex of clostridium botulinum type e neurotoxin
Total Genus 271
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
271
sequence length
1159
structure length
1114
Chain Sequence
KINGNLNIDSPVDNKNVAIVRSRDVFFKAFQVAPNIWIVPERYYGESLKINEDQKFDGGIYDSNFLSTNNEKDDFLQATIKLLQRINNNVVGAKLLSLISTAIPFPYENNTEDYRQTNYLSSKNNLVIFGPGSNIIKNNVIYYKKEYAESGMGTMLEIWFQPFLTHKYDEFYVDPALELIKCLIKSLYYLYGIKPNDNLNIPYRLRNEFNSLEYSELDMIDFLISGGIDYKLLNTNPYWFIDKYFIDTSKNFEKYKNDYEIKIKNNNYIANSIKLYLEQKFKINVKDIWELNLSYFSKEFQIMMPERYNNALNHYYRKEYYVIDYFKNYNINGFKNGQIKTKLPLSKYNKEIINKPELIVNLINNTVLMKSNIYGDGLKGTNFYSNYIIPYNHSINYSYLDNVNIEEIEKIPPINDEDIYPYRKNADTFIPVYNITKEINTTTPLPVNYLQAQMIDSNDINLSSDFLKVISSLVYSFLNNTMDYLEFIKYDKPIDTDKKYYKWLKAIFRNYSLDITETQEISNDTKIIPWIGRALNILNTNNSFVEEFKNLGPISLINKKENITIPKIKIPSSMLNFKDLSENLFNIYCKNNFYLKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMASKSVLAQEKLIKKLIQKQLRYLMENSNISSTNLILINLTTTNTLRDISNQSQIAINNIDKFFNNAAMCVFENNIYPKFTSFMEQCIKNINKSTKEFILKCTNINETEKSHLIMQNSFSNLDFDFLDIQNMKNLFNSYTELLIKEQTSPYELSLYAFQEQDNNVIGDTSGKNTLVEYPKDIGLVYGINNNAIHLTGANQNIKFTNDYFENGLTNNFSIYFWLRNLKQNTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFENDGLVFNIIDSNGNEKNIYLSNISNNSWHYIVISINRLKDQLLIFIDNILVANEDIKEILNIYSSDIISLLSDNNNVYIEGLSVLNKTINSNEILTDYFSDLNNSYIRNFDEEILQYNRTYELFNYVFPEIAINKIEQNIYLSILNFKPLKFKLLNQYVQKWDEVIFSVLEKYLDISTTNNRIQLVDNKNNAQIFIINNDIFISNCLTLTYNNVNVYLSIKNQDYNWVICDLNHDIPKKSYLWIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Molecular Assembly of Clostridium botulinum progenitor M complex of type E.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase/toxin
molecule keywords Bontoxilysin A
total genus 271
structure length 1114
sequence length 1159
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 4zktB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4zktB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4zktB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 4zktB01
4YW3A 3AK0A 3NV4A 1C4RA 4Q9GA 3WZ1A 4PC4A 1S0GA 1JBCA 3A21A 2VXTI 1W3GA 5GJ6A 2DUPA 3WMVA 4LO1A 3UJOA 1W6QB 4I96A 1SLTA 1QF3A 1LU2A 5H9SA 4U2AA 3WLUA 1HWNB 3DGTA 3AH2A 2JECA 4W65A 2Q3NB 1AVWB 3FJCA 2Y9WC 2R1BA 4ZFUB 2D6OX 1BASA 3KM5A 5KXCA 2AR6A 2WLQA 3FGMA 3AP5A 4ISRA 1N3PA 2GNTA 1WCSA 5DUWA 2Y9XE 3FJBA 3WCSA 3NV2A 1SR4A 4ZKTB 4AVTA 4EL4A 1ISWA 4HL0A 1LHUA 5BQMB 4LO2C 1Z7HA 3HBWA 1ZN3A 4ZJXA 1LHVA 1FNYA 5EYYA 4OUJA 1ENRA 1GLHA 1WLWA 1G82A 1JT5A 3WCRA 4Y22A 3ZSJA 3C89A 2AYHA 2J3PA 1ENQA 5EYXA 2EXIA 3O5WB 3CNAA 2R0HA 2FO1A 2EXJA 1WW7A 1FMZA 1Z0HA 1LHOA 4UW4A 4J2XA 1DQ4A 4ZBVB 4H9WA 2ZHLA 4BMBA 3FBYA 3POSA 2AH2A 3IPVB 1FN0A 1FMMS 3ENRA 4FPYA 3POYA 1TOOA 1APNA 3H6RA 4I4SA 1BFFA 4BQ1A 3BAGA 4YW1A 2W52A 1H9WA 3N3HA 4I2SA 5BQNA 2CNAA 1CQ9A 1XG6A 5KXDA 1BYHA 4TZDA 2M49A 4GWNA 4GOVA 3P53A 4LO3C 1K5VA 1N1VA 2DUOA 3ZC9A 3CA4A 3SNVA 2KM2A 1WLDA 3MALA 3BA4A 2X2SA 1JN2P 1Q8VA 2ZMNA 4K1YA 2MIBA 3TB0A 3PVOA 2JKBA 3V0BA 2ZMLA 3N7LA 2DVBA 1AF9A 1GKBA 1UX6A 3AP7A 1LEMA 3IM7A 1H30A 1MS4A 2AGSA 5DG2A 1Q8OA 2XG3A 1II4A 4LBMA 3IAGC 3QYDA 2CY6A 3PJQA 3RMYA 2DYCA 2PHUA 3AXDA 2KKIA 1IS4A 2OUHA 1MS9A 1OQ1A 3IN9A 3FJ8A 5KXBA 5GLUA 3VT2A 2W2DA 2GNBA 1S0IA 3PMEA 3OJ2A 4I4XA 1W3AA 4AWDA 2ZABA 1NXD1 3VKOA 5GZDA 1CESA 2CWMA 1IT0A 2K4AB 3O5SA 4M3CE 3O0VA 3USUA 1FV2A 1ZA4A 1PZZA 3N7KA 1I3HA 3WOGA 2DVFA 4AGGA 1BA7A 1XTGA 2DU1A 4H04A 2WT2A 3ILFA 2D7RA 1X50A 4I3NA 1F82A 5GM0A 4ZFWB 1MR5A 3MW4A 3F1RA 4L8QA 2VW1A 2NTDA 5GLZA 1ZL6A 5F8YA 1LODA 2VSEA 3T1MA 2QYIB 1FQ9A 1JT4A 4LO0C 1KNMA 1C57A 3MW2A 4DENA 5JOYA 1G86A 2PELA 2ARBA 2L5XA 5I1BA 1JXNA 4FPLA 2E51A 2P3JA 3NBCA 4CTEA 1G9AA 3CQAA 1YF8B 3V0BB 2AFGA 3WA1A 1QDCA 1BFBA 2OUJA 3DDBA 2IMCA 2A3WA 2ZQOA 5E24E 2D43A 1ZKXA 2ZGUA 1DGLA 5T5LA 3AP4A 4CRQA 1ISVA 5E8AA 3WDWA 4YGBA 1YIFA 1PUMB 5IK7A 4XJUA 3GALA 1JOJA 4OEEA 1ULCA 1LESA 3O4BA 4BLJA 4FQZA 3AJ6A 4Q8LA 5IK5A 1FV3A 3NJ5A 1F9KA 3OYWA 4WBCA 4FOWA 4XMAA 4G6MA 4HEVA 3QW6A 1EPWA 1QDOA 4F34A 1PZ8A 1CJPA 1N1YA 4ISQA 3B00A 1V6XA 3NBDA 2FFVA 2ZMKA 3OPZA 3WDTA 2R9KB 3FJIA 2E7QA 2P2KA 2V5YA 2A3XA 4K21A 3BTAA 4RA0A 2BEAA 1S0CA 3AJ5A 4Q27A 4J2SA 1LOCA 2D7IA 3FLPA 3O44A 3T1LA 3FJJA 3JRRA 3M2MA 3WDXA 1XTFA 4XIOA 1JHNA 3AH1A 1S1AA 5T54A 1IOAA 2IWTB 3FLRA 3H6SE 1AJOA 4U36A 4GAFA 2I2SA 2ZGNA 1G9CA 1LEDA 5H9PA 2OW4A 1AXYA 4YW2A 3AKGA 3CAHA 1BQPA 1LOFA 3UDAA 4FQ4A 2NMOA 4UW5A 4XXAA 8I1BA 2ZGSA 3FUOA 1RIRA 2A5ZA 5JOWA 4F83A 3AYEA 1AVBA 3HSMA 1Q8PA 1J0SA 4BMEA 2CTVA 1AX0A 4LO2A 1AVAC 1ABRB 3ZURA 1DQGA 3SISA 3FLTA 2ZACA 4AGRA 2P3IA 3SITA 1BFCA 4C1XA 4YW5A 4YGDA 2LALA 5FZYA 2ZQNA 1URXA 5FREA 4QALA 1KQRA 3AZZA 4XBNA 4YZ2A 1V6LA 2BQPA 1Z78A 2VH9A 3ZYRA 2JE7A 3BWIA 3C9ZA 1AX2A 2EXHA 1SBEA 1GZWB 6I1BA 3Q9OA 2AUYA 1KJLA 2ZGQA 3I8TA 4R9DA 1W6QA 4GA9A 4DRVA 1ENSA 4YZ4A 2LTNA 1QOOA 5F9TA 2DTYA 1Q8QA 3WDYA 3VUOA 4JQ0A 1Q56A 4R9CA 3C8BA 2WT1A 1O4ZA 1J1TA 3WO2A 1Q03A 1I1BA 4LO3A 2JD4A 1JT7A 2E53A 1KDKA 1LHWA 3OBRA 1N1SA 1S0JA 1ULFA 1LGBA 3D7WB 4JPZA 2ETFA 1ISZA 5BOWA 1DQ2A 3D6EA 4A7ZA 3P6JA 1T3AA 1O4YA 4Q1RA 2D23A 4C1WA 5GLTA 3FUQA 2EALA 1GANA 5HPZA 1V00A 2KI4A 5DUUA 4II0A 2HWAA 5DZUA 5BQMA 2VW2A 1ZB7A 1U0AA 1R8OA 1W6NB 2FHRA 3WO3A 4GOYA 3FJ9A 2GN7A 3POWA 2AENA 3ZSMA 1GV9A 3RTJB 3DUIA 3C2UA 3B01A 1MS3A 3FJEA 3B9UA 3AKFA 3SH3A 5CAZA 3WG1A 2Y9FA 4G6JA 1HQWA 4YOLA 3UJ4A 2YROA 1W6OB 3IPVA 1N3QA 1V6OA 3WHUA 3UD8A 4DCKC 2F2FC 1NZKA 3V0AA 3FFZA 3AYCA 3JUUA 5DUVA 3MPPG 1OQLB 3ZXJA 2DVGA 4GKYA 4XJZA 3OBTA 2R16A 4TLPA 3WUDA 2HZ9A 4LBNA 4IQPA 1RZOB 5BP5C 1FX5A 1LOFC 1Z4SA 3WG4A 1AFCA 4LO0A 5D63A 5HCFA 5F8WA 1IKPA 4YG0A 1V6UA 5SV8A 5IK8A 1D2SA 4KBBA 4A7KA 5D61A 2A3YA 4A7YA 1IRAX 4OZXA 4KEIA 3VV1A 4XYXA 3AKIA 3DSEA 3OY8B 1T3CA 2WBCA 2A97A 4M00A 1WD4A 4I4UA 3BOPA 5JOXA 2GMEA 1IOBA 1AX1A 3CA6A 4XIKA 1CN1A 1R8NA 1JTCA 1HDKA 1QNYA 1W6MB 2K8RA 4LO7B 1YRZA 2AXMA 1KITA 3HMYA 2IMBA 5FNWA 1GZ9A 4IHZA 2Y9GA 3AJYA 2ENRA 2SLIA 4XDQA 2XOAA 4P0JA 3V0AB 2D44A 3HR9A 5T5JA 2F8XC 3R05A 3CRGA 1DZQA 1B09A 1RINA 1QNWA 4YFZA 1CVSA 3O49A 3V64A 4FPGA 3IM6A 1MVQA 3UL2A 1QQKA 4Z9WB 4FOVA 3BRDA 3RG0A 1HCEA 1IS5A 4I7IA 3IMNA 4P0KA 4K1ZA 1RY7A 2D6LX 1DLLA 1WBAA 3WVJA 4FOYA 4D8HA 3VKLA 2ISEA 3KMVA 4YZ3A 4DPNA 5HCBA 2ERFA 3FIIA 1QOSA 5GZFA 1T9FA 2X2TA 4Y20B 4BLIA 3AJZA 1LOGA 3DS9A 1LECA 4BPZA 1UPSA 3ZVXA 4AN6A 2JDZA 2UWBA 2BFHA 1TP0A 1HKDA 3APBA 4P9YA 2A8AA 4X37A 2YMZA 1S0LA 5JOZA 2GN3A 4YM3A 4Q26A 2P37A 2A6VA 2DTWA 2ESUA 2FPQA 3W59A 1UZZA 3ZXEA 2VW0A 3FJFA 3RMXA 4EFRA 3CA1A 4RL7A 1TWEA 3VSFA 1MZ5A 4LO7C 2RSTA 4GAIA 2RQ9A 3AX4A 5EG6C 3ZX7A 3P6IA 4AYUA 2P39A 3CU1B 2A7AA 1ZL5A 4M3CA 4TYSA 1ISXA 5FZUA 3E8LC 1YO8A 4ZGRB 4YZ5A 4HR6C 1BZWA 1FNZA 1KRIA 2D1ZA 3KQRA 3QR5A 4IZEA 2H0BA 2QN4A 4ATEA 3ZXLA 4IYBA 1CE7B 4ZA3B 5F8SA 2FDBM 3N7MA 1S0BA 3PVNA 3QW5A 4IY8A 3FJDA 3QCWA 4GXLA 3BODA 2NP0A 2YY1A 1JLXA 2E4MC 4XFSA 4J2KA 2D3RA 3IM5A 4EJ5A 1M2TB 3ZSLA 2R0FA 4G1RA 1DHKB 1SCSA 2C9AA 1F5FA 3SH4A 4Y1YA 2BEBA 1MS0A 2A6ZA 1QXMA 1DQ6A 2JE9A 1DZCA 4PBOA 2D22A 1YXWA 1XHBA 1N3OA 1ULEA 1LHNA 3N36A 4OWLA 5GLVA 4YZ1A 4P0LA 1A3KA 1GBGA 1RMLA 4YW4A 4G9MA 3A22A 4XHXA 3NWKA 1WD3A 1W3FA 3L2YA 1V6WA 4XJ9A 3FJAA 2WNEA 1HIBA 4XFUA 3BOKA 1TTUA 4ZXKA 3NBNA 1SLAA 2MC2A 3B9CA 3AXEA 2VUAA 4R9BA 1EV2A 3BX1C 1SCRA 4XJWA 2A75A 3PVEA 4QKSA 3MEPA 4M3CB 1QU0A 1A8DA 4P9XA 1WBFA 4GKXA 4FGFA 4H55A 1GZWA 2NM1A 2F2FA 4GP0A 5BXSA 1CONA 1CPNA 2W39A 5IUQA 4J23B 1BXHA 2NVHA 5T5OA 1Y7BA 2ZGPA 3C88A 3PUBA 4Q1PA 4LBLA 4QBVA 3M3OA 5GAQA 3AH4A 5FNXA 4YM0A 1WBLA 3UJ0A 4LBJA 3QIYA 3D3XA 1HQLA 2EAKA 1C1FA 4BOWA 5BP5A 4ASMB 3VWCA 2GO2A 2RG9B 2D6KA 1HWOB 4FPFA 1ZM1A 1G7YA 4FPHA 1DQ0A 4K20A 1UN1A 2DVAA 4FP2A 4XJ8A 2V73A 3OJVA 3TAYA 3N7JA 2VSAA 2KI6B 2WSUA 2GMMA 3ILRA 2GNMA 1IILA 3ZPYA 3O0WA 3INAA 1W6NA 2DRZA 1UAIA 2R1DA 21BIA 4I37A 3M1HA 3JU9A 1AVXB 4MYEA 5GALA 5JLVA 5T52A 5DVHA 3W9TA 3RTIB 1T4QA 4I0YA 3WO4A 1SBFA 1UKGA 1MZ6A 2UWAA 4Y1UA 2Z49A 2YV8A 4LBOA 4UW6A 1V6MA 1FGAA 1SZ6B 4DRRA 3SLIA 4JP0A 2G7NA 1GZCA 3SNMA 1GNHA 2ZGTA 1E0OA 2NMNA 2HYKA 1W6OA 1SACA 2IHOA 1RITA 4DFSA 1SFYA 4AVVA 1LOEA 1WBCA 2D6PA 4FPOB 2D7FA 5B2HA 2A6YA 3WV6A 4L4HA 4I1BA 3LCPA 4P9WA 3O4OA 1W6PB 1S0FA 1GYKA 1WW5A 4G9NA 3V79C 5GZEA 4XILA 1BARA 3FJHA 3BAVA 2XHLB 4ATFA 3DDAA 3QLQA 3T8SA 2PHFA 3M3CA 2D20A 2GDFA 4NO4A 1UMZA 4PCRA 3OGFA 3CA0A 3WMUA 3VSZA 1DIWA 4EB2B 1MACA 4ITCA 4QD2C 1MC9A 5GZGA 3BAQA 2G7QA 3O4CA 3ZSKA 1LGNA 5HCAA 3WDVA 2ET2A 3D4KA 3VT1A 4QC4A 1ONAA 4OEFA 2C5DA 3WHTA 5E88A 3BA5A 2ZGOA 1PZ7A 2K43A 1YYNA 4QO3A 3OY8A 3WUCA 2VXRA 1JW6A 5IT6A 2WQZC 1ULGA 1W0PA 3CA5A 2OVUA 3NF3A 5CBLA 1VCLA 4LO8B 2EXKA 3PG0A 3M3QA 4IONA 4XHBA 3OJMA 4D69A 2ZHMA 1DBNA 2AREA 2EF6A 5DUXA 3ILAA 3Q7WA 1FWUA 3BADA 5FZZA 1FWVA 1W6MA 4X38A 1LU1A 2LIQA 4OW4A 4X39A 4PF5A 5DZGA 1G9BA 1D0HA 4I4QA 1SLCA 2Z42A 5BQUA 1L2HA 2DUQA 4FVVA 3A23A 4L4IA 1FATA 1E1HA 1V6NA 3O4AA 2P3KA 3BIWE 3A07A 2G7PA 4XMIA 3S8JA 1MS5A 1XYFA 3O0XA 3ZYPA 1F31A 1QQLA 4FPEA 3SH5A 1N1TA 5CA6A 2D6NA 1A78A 2W08A 2KLLA 4YFWA 2YUGA 2ILPA 1ILR1 5JVVA 3AYDA 2PHWA 3VEQA 1YI7A 1ULDA 1TFMB 3AZWA 1C1LA 2ZBJA 3A0NA 2D3SA 2ISGA 2P34A 2E4MA 3WG3A 1Z2VA 4KUFA 3VKFC 2QN0A 2ZZJA 1JYIA 3GNEA 2ZGLA 3V65A 2VLCA 2NZ9A 3I4IA 4DS0A 4Q8KA 4Y24A 3ZC8A 2ISHA 2G4IA 5F90A 4EFPA 4LBKA 5DSSB 4LBQD 4LBQB 4KC3A 3BOOA 1WW4A 4R6UB 4P6AA 2D24A 1MVEA 4Y20A 4XKIA 4X3AA 5E89A 3K3QB 1QOTA 2ARXA 2WJSA 4YM2A 2ZA9A 1I1EA 4WZFA 4ZFYB 2DV9A 4Y26A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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