4ZKTB

Crystal structure of the progenitor m complex of clostridium botulinum type e neurotoxin
Total Genus 271
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
271
sequence length
1159
structure length
1114
Chain Sequence
KINGNLNIDSPVDNKNVAIVRSRDVFFKAFQVAPNIWIVPERYYGESLKINEDQKFDGGIYDSNFLSTNNEKDDFLQATIKLLQRINNNVVGAKLLSLISTAIPFPYENNTEDYRQTNYLSSKNNLVIFGPGSNIIKNNVIYYKKEYAESGMGTMLEIWFQPFLTHKYDEFYVDPALELIKCLIKSLYYLYGIKPNDNLNIPYRLRNEFNSLEYSELDMIDFLISGGIDYKLLNTNPYWFIDKYFIDTSKNFEKYKNDYEIKIKNNNYIANSIKLYLEQKFKINVKDIWELNLSYFSKEFQIMMPERYNNALNHYYRKEYYVIDYFKNYNINGFKNGQIKTKLPLSKYNKEIINKPELIVNLINNTVLMKSNIYGDGLKGTNFYSNYIIPYNHSINYSYLDNVNIEEIEKIPPINDEDIYPYRKNADTFIPVYNITKEINTTTPLPVNYLQAQMIDSNDINLSSDFLKVISSLVYSFLNNTMDYLEFIKYDKPIDTDKKYYKWLKAIFRNYSLDITETQEISNDTKIIPWIGRALNILNTNNSFVEEFKNLGPISLINKKENITIPKIKIPSSMLNFKDLSENLFNIYCKNNFYLKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMASKSVLAQEKLIKKLIQKQLRYLMENSNISSTNLILINLTTTNTLRDISNQSQIAINNIDKFFNNAAMCVFENNIYPKFTSFMEQCIKNINKSTKEFILKCTNINETEKSHLIMQNSFSNLDFDFLDIQNMKNLFNSYTELLIKEQTSPYELSLYAFQEQDNNVIGDTSGKNTLVEYPKDIGLVYGINNNAIHLTGANQNIKFTNDYFENGLTNNFSIYFWLRNLKQNTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFENDGLVFNIIDSNGNEKNIYLSNISNNSWHYIVISINRLKDQLLIFIDNILVANEDIKEILNIYSSDIISLLSDNNNVYIEGLSVLNKTINSNEILTDYFSDLNNSYIRNFDEEILQYNRTYELFNYVFPEIAINKIEQNIYLSILNFKPLKFKLLNQYVQKWDEVIFSVLEKYLDISTTNNRIQLVDNKNNAQIFIINNDIFISNCLTLTYNNVNVYLSIKNQDYNWVICDLNHDIPKKSYLWIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Molecular Assembly of Clostridium botulinum progenitor M complex of type E.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bontoxilysin A
molecule tags Hydrolase/toxin
total genus 271
structure length 1114
sequence length 1159
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 4zktB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4zktB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4zktB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 4zktB01
2A6XA 1SBDA 2XB6C 3POWA 4LO7C 2BEAA 3WVJA 4UW4A 4ZBVB 3BOKA 4LO2A 2TEPA 3RMYA 1IJTA 2VY0A 1VCLA 3FJIA 2DURA 5KXCA 2AR6A 4FQZA 2D6PA 3ZSLA 1FWVA 4KBBA 3QW8A 3AYCA 1QNWA 1SCSA 1QGLA 2P3KA 1C1FA 1LOFC 4LBQA 1LOEA 2XG3A 1BJQA 1S0IA 3IMNA 1G9BA 4LO1A 2ZABA 5E8AA 5D61A 3A23A 4D8HA 4IZXA 1V6XA 3AX4A 2X2TA 5DZEA 1LTEA 2ZGMA 4YZ5A 1QOTA 3ZUSA 4LO3C 2P34A 3WDTA 3VKMA 4D69A 2RSTA 3O3QA 4AGGA 4P6AA 1N47A 2ZAAA 3IKWA 1J1TA 3ILAA 3WINA 5DG1A 5E88A 1RIRA 1DQOA 4QBCA 2F2FA 5T5LA 2ERMA 3SLIA 1C57A 2ZGUA 2CWSA 2NM1A 3ATGA 1URXA 4QBVA 4ZFWB 3FJHA 2NVHA 3W58A 3CRGA 3BAOA 31BIA 4Q91A 1GKBA 2GMPA 3ZC8A 4BMBA 3M3OA 2AQZA 3WDYA 1QKQA 2ZHKA 3SH4A 1GGPB 3HN1A 4GWNA 4DEPA 2GNBA 3NV1A 1H30A 1JW6A 4A7YA 2HW9A 4KC3A 1ZKWA 4ITCA 2YROA 3BAHA 4ISQA 5KXBA 4EJ5A 4QKRA 4Y22A 1Z2VA 2AH2A 3WMVA 1F5FA 3I2AA 2E7TA 2DVBA 3OBTA 3FIEA 1QDCA 1XZZA 3AJ5A 2D1ZA 1RZOB 3KMVA 3TB0A 5IK7A 4X39A 4P9XA 1CONA 2DTYA 1BLDA 1YRZA 1G9CA 4OEEA 2A70A 4XE9A 1T9FA 4CRQA 5EC5A 1W6NB 4RA0A 2W39A 4HA2A 1DQ4A 1HKDA 4GP3A 1F31A 4DPNA 1VAMA 1G9AA 4XYXA 4GALA 1ZL5A 4XFUA 3O4AA 2ZGRA 5BP5C 4FPCA 2A6WA 4PBPA 1H9WA 3AJZA 3APBA 4HR6C 4BPZA 3BODA 4BLIA 5IK5A 5IT6A 1KQRA 3FUQA 3V0AA 3PJQA 1AVXB 4XMAA 1R1ZA 4FPOB 2P2KA 3GALA 1SFYA 1I3HA 1V6KA 4LO7B 4HEVA 2AREA 4XHXA 1Z7HA 1DQ2A 4XJZA 5CNAA 4I4RA 3WO4A 1MZ5A 3OJ2A 1HWNB 3BB2A 5EHAA 2NZ9A 1J0SA 4SLIA 4Y20B 1V6UA 1EPWA 3AKFA 4IHZA 1LGNA 3E8LC 2EXJA 5HCAA 3RRDA 2ZHLA 2R16A 2WKKA 1HQWA 2R0FA 3OBRA 5EWSA 3WDWA 4LO0C 3NV4A 1KITA 4Q9PA 2LTNA 2ZGNA 3EF2A 2ZHNA 4KUFA 3ZSJA 5GAQA 4P9YA 2E51A 2F8XC 1VALA 3HOMA 4Y1VA 4K21A 3BOPA 4HJJA 5DG2A 1F82A 3BADA 3V0BA 1IT0A 2C9AA 1FATA 1LU1A 2ZGOA 4M3CA 2BEBA 4I7IA 2PHXA 5T5OA 4R9CA 4AYUA 2A75A 3BAUA 4ZXKA 4JQ0A 5BQUA 2NMOA 2ZMNA 4YW2A 5F8YA 2YUGA 2A6ZA 3N7JA 2EF6A 4Q9GA 1UKGA 3B69A 4H55A 2L5XA 2A7AA 4P0JA 4XOGA 3UJ4A 4ZKTB 1N3PA 1TP0A 4YFZA 5BOWA 4JP0A 4IZEA 5B2HA 1WW4A 4YLZA 2OW4A 1LOGA 2YV8A 4C1WA 2R9KB 2PHFA 3O5SA 2SBAA 2DUQA 1M16A 3O0WA 4IY8A 4LBKA 1W6PA 3RMXA 2RHPA 2HZ9A 1SLTA 2G7KA 2K8RA 2DRYA 4U2AA 3WG1A 1LHNA 4I2SA 4AWDA 3WHUA 4AGVA 5BXSA 4YM3A 1JT7A 2NN8A 5T50A 1F9KA 1LOBA 2I2SA 2RG9B 2IMAA 3FJ9A 3H0OA 1IRAX 4DRVA 3RSJA 1LU2A 2ZGPA 2PHTA 1LGCA 3O49A 3SISA 3IPVA 4P0LA 1JT3A 3FIIA 3ZXFA 3BRFA 5FRAA 1A8DA 1G9FA 2LIQA 3C88A 5BQNA 2DRZA 4FOWA 3VEQA 4XJ8A 4YG0A 1CQ9A 1DYPA 4LBLA 3N36A 1OKQA 4YW3A 3AKIA 3S8JA 4XZPA 2JE9A 1OFSA 1W3FA 3DSEA 2GALA 4BMEA 3NBDA 1MS3A 2VW1A 4XTMA 3BAVA 1CPMA 1Q8SA 5CBLA 5JOWA 2XOAA 1ULGA 3O0VA 5IK4A 2P23A 4I0YA 2ZGKA 5BQMB 2CTVA 5T55A 3LCPA 3PVOA 2Q3NB 1B09A 1TOOA 4M3CE 1WBFA 4I8MA 5DUVA 5GJ6A 1V6JA 5GZFA 4QALA 1S0GA 4XHBA 2FFVA 4XJ9A 1BKZA 4FOQA 1S0BA 1Y7BA 4AGRA 3BIWE 2CWMA 2E4MC 4XJUA 1W6QA 2X2SA 1T3AA 4KTXA 1HDKA 1SLLA 4MYEA 5E89A 2D6MA 1FGAA 9ILBA 1AJOA 5BYNA 3GNEA 3WDUA 3ZSMA 1HIBA 1LOCA 2R0HA 1BFFA 3PG0A 3W59A 3H6RB 3FBYA 3DUIA 2ISHA 1N3OA 4C1XA 2A5ZA 3FJFA 3PVNA 1UN1A 4QC4A 3O12A 4M3CB 3N0KA 4YM1A 2G7PA 1GZWA 1JY0A 2CYFA 1LODA 2A8AA 4J1LA 5HPZA 3DDAA 4X38A 3RS6A 1SLBA 3WMUA 2V73A 1AX2A 1Q8VA 3RG0A 2VSEA 1SZ6B 4YG6A 1AXZA 3VKFC 1Z78A 4FPFA 1TEIA 1ITBA 3I29B 4Q8LA 1O4YA 2ZZJA 5H9SA 2AAIB 3IAGC 5FZYA 1YO8A 1LESA 4L8QA 4GOVA 1T4QA 1JXNA 3UDAA 4NOTA 2VUAA 3T1LA 3O4CA 3AJYA 2EAKA 1V6VA 1JYIA 1YBIA 1W0PA 3AKHA 2A6VA 1A3KA 1YI7A 3D3XA 2AUYA 5DXDA 1TIEA 4LBOA 5H9RA 3USUA 2Y9XE 1II4A 2BQPA 2ZMLA 3FGMA 1IKPA 1AVUA 1W6PB 1BFBA 1N1TA 2I1BA 3WCRA 2G4IA 4I30A 1SBEA 4XJAA 1FQ9A 5EXOA 1SBFA 3QR5A 5GZGA 3OYWA 2E6VA 3POSA 3F1RA 1N1VA 4LO2C 4UW5A 1ENSA 2G7NA 2EXHA 1WCSA 1DLLA 5EG6C 3HALA 5JOYA 1WUVA 4M01A 4R6UB 2CL2A 2VW2A 4JPZA 2UWAA 4BQ1A 1S0EA 4I4QA 5GALA 3WG4A 4G1RA 1FAYA 3JRRA 3D7WB 3N35A 4WZFA 4USPA 1ENQA 4FOVA 3CA6A 3FJEA 5F8WA 4LO1C 5FNXA 4YGDA 1DYKA 4BM8A 4I4YA 1EV2A 2GN3A 1DFQA 2D7FA 5JDBA 3BA5A 4PCRA 1QOOA 4FPGA 3C8AA 3WG2A 1CESA 5GLVA 3AXEA 3VKNA 3HBWA 1YF8B 2UUSA 3BRGC 4KEKA 3ZXKA 4GA9A 1MS9A 4LBQD 4YM2A 5G00A 3WINC 4I4UA 1SR4A 3OPZA 4I1EA 1JTCA 1CJPA 2F2FC 4FP2A 5KXEA 1WLCA 3T2TA 1Q8OA 4M00A 1ULCA 4IY9A 1E0OA 2MIBA 5JVVA 1GBGA 2PHRA 3CRHA 4EKXB 4GXLA 3OY8B 1AFCA 1WD3A 3IN9A 2A3XA 3QYDA 1W6QB 4CZSA 1KRIA 1WBAA 4Y24A 1QQLA 5DUUA 2ZMKA 3AYDA 1PWAA 5I1BA 1X50A 3UJ0A 4OEFA 3OGFA 3ZXLA 2FGFA 3VSFA 2UWBA 2DVDA 4A7KA 1S0FA 1LJ7A 3Q7XA 3N7KA 3N3HA 1ISYA 3RTJB 4I4PA 1V6LA 1PZ7A 3AXDA 2C5DA 5T52A 4AVVA 1BFCA 1BLAA 4YZ2A 1S0DA 1V6WA 4JCKA 2FPQA 1DFCA 4DFSA 3AP6A 1ISWA 3B3QE 2DYCA 3LSEA 3DS9A 5CA6A 3H6QA 3IM5A 5DZGA 4F34A 4FOYA 1ZKXA 5D63A 1XHBA 1FX5A 2V5YA 4KEIA 2D20A 2RQ9A 1ULEA 1OQLB 1Z0HA 4XIKA 3Q7YA 3W9TA 1SLAA 2XHLA 5L73A 4XILA 3I8TA 2ARBA 4ASMB 1IRPA 4WBCA 3CU1B 2YMZA 1Q1UA 1GNHA 5CAZA 3QW7A 4J2SA 1W6MB 1KJLA 3USUB 5FREA 6I1BA 2IWTB 1T3CA 4TLPA 7I1BA 1SLIA 5HCFA 3WLUA 4PBOA 2IMCA 2ET2A 3K1XA 1AX1A 4ZFUB 2IHOA 1DZDA 2ZHMA 1XTFA 3A07A 3B9UA 2UWCA 1TWEA 3CRIA 1QNYA 1DQ6A 2DU0A 4Z8BA 3ZX7A 1TTUA 1RINA 2Q5TA 1NXD1 2VW0A 4LBQB 4XTPA 2AENA 3V65A 3R05A 1JUIA 1UZYA 2D3RA 4BOWA 2GNDA 3FJBA 3BRDA 2NYYA 1GICA 4EFPA 3HR9A 5T5JA 2KI6B 4I3NA 4LO8B 4ZOTA 4U36A 3AH2A 1N1SA 1ONAA 2ES3A 8I1BA 1UPSA 1FNYA 2M49A 5F5QA 3D5OA 4DRRA 2A3WA 1Q8QA 2AFGA 2D3SA 5FZZA 2ZA9A 1HCEA 2ISEA 1MVQA 1WW6A 5BQUC 2LIEA 4EFQA 5SV8A 1IS4A 4OEGA 3POYA 4CJMA 3ILRA 4W65A 3O4DA 1GZCA 4YGCA 4XJWA 2ZGQA 4ATFA 2B7YA 1IOAA 1AXMA 1YYNA 4Q26A 1DQ0A 4JRAA 2LALA 1VIWB 4UW3A 4Y1ZA 1S1AA 5KXDA 2ENRA 2W68A 2QN4A 4KS6A 2D43A 1EYLA 1AVBA 4Q2FA 4AVSA 1LGBA 1KDKA 4BLJA 4I37A 4Y22B 3AP4A 2OUHA 1LCLA 1H9PA 4YGBA 3ENRA 2GMMA 3L2YA 4I4SA 1L2HA 1YTOA 4OZXA 3A4UA 1W6OA 3POKA 4K1YA 1UAIA 2ZKNA 1AZDA 4UW6A 4YOLA 4P0KA 1C1LA 3UK9A 3BAQA 2WNEA 1AF9A 4IYBA 1UMZA 2JJ6A 3WO2A 2DV9A 1IKQA 1WW5A 2FFUA 1IOBA 3QIXA 2WSUA 1S0CA 2A71A 3T8SA 3AH1A 1MS0A 3O0XA 5D62A 4NO4A 3VKOA 2DREA 1DQ5A 1FV3A 2XHLB 3A0KA 1R8OA 2ZQNA 1ISZA 2IMBA 2R1DA 4ISRA 5T54A 3ZXEA 4Q27A 3WHTA 3CA5A 2DWRA 1TFMB 4I6IA 4JKQA 3FJKA 3V0AB 3O5WB 4I4XA 5E24E 4YG3A 3ZXDA 2FMDA 4WVWA 2KKIA 1NUNA 1BYHA 2WLQA 4AN7B 4IONA 1YXWA 3AFKA 1BASA 4L4IA 4EB2B 3SNMA 4JAWA 3AP7A 1AX0A 2HYKA 2A6YA 1I1EA 1LHWA 4FQ4A 4ZFYB 4Q8KA 3AP9A 5BXTA 4QKSA 3QJ0A 3WDVA 1IS6A 3RQ0A 3PVEA 1NLSA 4XDQA 2Z42A 4YW4A 4JC1A 4GAFA 2QYIB 4GKXA 2GDFA 2ISGA 4H04A 3UD7A 2J3PA 2VLCA 3V0BB 3V64A 4XIOA 1UZZA 1XQNA 3AYAA 4F83A 1CE7B 4OUJA 4AN6A 1D0HA 2VSAA 1LHOA 2JECA 3MPPG 3D4KA 4YZ4A 2ZGSA 1ISVA 4TZDA 2ZR1B 1FYUA 1YVGA 1Z4SA 1G7YA 2DU1A 1W6NA 2P39A 2D23A 1CR7A 3ZPYA 2Y9FA 3SNVA 3O4BA 5JLVA 3WG3A 1LOAA 3AZXA 1BA7A 1RMLA 4RL7A 1I1BA 5GLUA 3O4OA 1UL9A 4II0A 4OWKA 1MVEA 1JT4A 3PUBA 4X37A 3TAYA 4GAIA 1AXYA 3UJQA 1HQLA 3OJVA 2WJSA 1GSLA 4ELCA 3LSDA 2ILPA 1BQPA 1PC8B 21BIA 4FP3A 3VV1A 4XBLA 1CVNA 2ZGLA 3OJBA 1PZ8A 3BA4A 2JE7A 3MW2A 1RG8A 4ZA3B 1V00A 1OQ1A 3SH5A 4H9WA 3T1MA 4R9AA 4FPLA 1KDMA 5F90A 3I4IA 2D6OX 1N4KA 4Y26A 4Y20A 5DSSB 3WV6A 3A22A 1MD6A 1WLWA 1FV2A 4R9BA 1DZCA 1V6IA 1W6OB 1FN0A 41BIA 2D3PA 3BTAA 1PUUB 3IPVB 1GNZA 2DTWA 1LOFA 1Q03A 2PHUA 1DJSB 4FPJA 2OVUA 2GNTA 4GKYA 1LECA 3U4XA 1G86A 5BVPI 2VU9A 3WOGA 4EL4A 4P9WA 3CA4A 1O4ZA 3R4UA 3BONA 2BFHA 1FMZA 4LO3A 1LHVA 3AYEA 2SLIA 1WBLA 5DVHA 1PZZA 1W3GA 5GLZA 2G7QA 3C89A 3DGTA 1LEDA 1DQ1A 1G9DA 1JQZA 3AJ6A 1S0LA 1M2TB 1CPNA 3NF3A 3QCWA 4G9MA 4QD2C 1SR4C 4M3CF 3OJMA 2YZ4A 4DS0A 1KJRA 2D24A 3TC2A 3UJOA 3JUTA 3FLTA 3WDXA 2YXSA 4XKIA 2OUJA 2ARXA 4LBMA 4Y1YA 5DUWA 1RY7A 3FJ8A 4ATEA 1IHKA 3AKGA 5DZUA 1V6MA 2DVFA 2GMEA 3D6EA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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