4ZKT | Genus

Total Genus 271

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	271
sequence length	1159
structure length	1114
Chain Sequence	KINGNLNIDSPVDNKNVAIVRSRDVFFKAFQVAPNIWIVPERYYGESLKINEDQKFDGGIYDSNFLSTNNEKDDFLQATIKLLQRINNNVVGAKLLSLISTAIPFPYENNTEDYRQTNYLSSKNNLVIFGPGSNIIKNNVIYYKKEYAESGMGTMLEIWFQPFLTHKYDEFYVDPALELIKCLIKSLYYLYGIKPNDNLNIPYRLRNEFNSLEYSELDMIDFLISGGIDYKLLNTNPYWFIDKYFIDTSKNFEKYKNDYEIKIKNNNYIANSIKLYLEQKFKINVKDIWELNLSYFSKEFQIMMPERYNNALNHYYRKEYYVIDYFKNYNINGFKNGQIKTKLPLSKYNKEIINKPELIVNLINNTVLMKSNIYGDGLKGTNFYSNYIIPYNHSINYSYLDNVNIEEIEKIPPINDEDIYPYRKNADTFIPVYNITKEINTTTPLPVNYLQAQMIDSNDINLSSDFLKVISSLVYSFLNNTMDYLEFIKYDKPIDTDKKYYKWLKAIFRNYSLDITETQEISNDTKIIPWIGRALNILNTNNSFVEEFKNLGPISLINKKENITIPKIKIPSSMLNFKDLSENLFNIYCKNNFYLKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMASKSVLAQEKLIKKLIQKQLRYLMENSNISSTNLILINLTTTNTLRDISNQSQIAINNIDKFFNNAAMCVFENNIYPKFTSFMEQCIKNINKSTKEFILKCTNINETEKSHLIMQNSFSNLDFDFLDIQNMKNLFNSYTELLIKEQTSPYELSLYAFQEQDNNVIGDTSGKNTLVEYPKDIGLVYGINNNAIHLTGANQNIKFTNDYFENGLTNNFSIYFWLRNLKQNTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFENDGLVFNIIDSNGNEKNIYLSNISNNSWHYIVISINRLKDQLLIFIDNILVANEDIKEILNIYSSDIISLLSDNNNVYIEGLSVLNKTINSNEILTDYFSDLNNSYIRNFDEEILQYNRTYELFNYVFPEIAINKIEQNIYLSILNFKPLKFKLLNQYVQKWDEVIFSVLEKYLDISTTNNRIQLVDNKNNAQIFIINNDIFISNCLTLTYNNVNVYLSIKNQDYNWVICDLNHDIPKKSYLWIL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase/toxin
molecule keywords	Bontoxilysin A
publication title	Molecular Assembly of Clostridium botulinum progenitor M complex of type E. pubmed doi rcsb
total genus	271
structure length	1114
sequence length	1159
chains with identical sequence	D, F
ec nomenclature
pdb deposition date	2015-04-30

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
B	PF01742	Peptidase_M27	Clostridial neurotoxin zinc protease
B	PF07953	Toxin_R_bind_N	Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B	PF08470	NTNH_C	Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1120.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain	Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain	4zktB02
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	4zktB03
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	4zktB04
3.90.1240.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Zincin-like	Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like	4zktB01

1V6NA 2WRYA 4XJWA 3OY8A 1SLBA 2VW2A 4RL7A 2LIEA 4OW4A 3AP6A 1DLLA 4LBKA 2FO1A 4JAWA 4J23B 1E1HA 2GNDA 5BP5A 1W6QB 5AVAA 2DUQA 2B7YA 3AP4A 3BX1C 3QW6A 4KS6A 4D8HA 3DSEA 3ASIA 4BMBA 3KMVA 2W08A 4LO1C 5JLVA 5L73A 4ITCA 2D6PA 5KXCA 1A8DA 1QOSA 3RRDA 2AYHA 4XHBA 2DYCA 2ZGLA 1QGLA 3A4UA 3ZXGA 1WBCA 4OEFA 1T4QA 1BFFA 3FUQA 1WW6A 2X2TA 4YGCA 2WSUA 4CJMA 2Q9XA 3WO3A 6I1BA 4M3CA 3CA6A 3AK0A 3AZVA 2D3PA 1N47A 2X2SA 2TEPA 4AVSA 1JUIA 3I4IA 4GXLA 2QN4A 5HCBA 2C9AA 5JVVA 1GBGA 3DGTA 2D7RA 4P0KA 1ISZA 2EF6A 4P0JA 2GZBA 1DQ0A 1S0BA 1WLWA 3AZWA 1WW7A 2A71A 4DS0A 3ZVXA 3VT0A 5IUQA 2DTYA 1LULA 3A07A 2ZA9A 1HQWA 4WVVA 3ZUQA 3TAYA 5EHAA 3UDAA 3WUDA 2WBCA 2WQZC 1CJPA 3QIXA 2XHLA 2ZHLA 3QLQA 3BOKA 4YG0A 3QW8A 1KQRA 1CONA 1YBIA 2AQZA 4ZBVB 3BAHA 3MPPG 1FGAA 4EB2B 3VEQA 2ERFA 3BWIA 1FMZA 3FIIA 4CTEA 2E51A 2GMMA 4IONA 4A7KA 1GNZA 1JN2P 3ZX7A 1ZB7A 5GJ6A 1LU2A 3FJEA 2A75A 3T1LA 3V79C 2ZGNA 4PF5A 2DV9A 4GAIA 3FJBA 1UZYA 5IK8A 4P9WA 1IKPA 3WG1A 1S0EA 4USPA 4A7ZA 1JQZA 1HQLA 4Y1XA 3PUBA 2Z42A 2YV8A 2A6VA 2P37A 2HZ9A 3ZXKA 2BFHA 4UW4A 4AN6A 4ZJXA 2FGFA 1LHVA 3CA5A 2FMDA 1HIBA 2OVUA 2Q5TA 2Z48A 1RINA 1WCSA 1N1SA 1ENRA 3PVOA 4KBBA 4BMEA 1FATA 3VWCA 5DUWA 4I4QA 3V65A 1DQ5A 4ENDA 2D6MA 5DUXA 2WT2A 3O0XA 3CU1B 1MACA 2DURA 1EV2A 3BA7A 1DQ1A 4F34A 2P34A 3D4KA 1XZZA 2G7QA 1DFCA 2KM2A 3SNVA 2A3XA 2ZABA 3LCPA 4IY8A 1LOCA 4G1RA 4JRAA 1FN0A 4IY9A 2J3PA 1I1BA 4BM8A 1F9KA 2RQ9A 4H04A 3SH4A 3SLIA 3D6EA 4JCKA 1G8WA 1V6IA 1GV9A 3RS6A 1UPSA 2I2SA 2D7FA 2EALA 3H6QA 2AREA 4XOGA 4I4UA 1BJQA 3AH1A 1TP0A 5BXRA 1FNZA 4Q91A 1SCSA 1Q8VA 3IPVB 2R0FA 1JT4A 4ZGRB 3WUCA 2R16A 2GNTA 2QN0A 1JLYA 1W6OA 2Y9FA 4KTXA 4I4SA 1CVSA 1W6MB 1JOJA 1G86A 1FWUA 1E0OA 1RZOB 4EJ5A 2ZGTA 1JXNA 4I8MA 3CA0A 5T5LA 1JLXA 2VSEA 5BXTA 3C8AA 3CA3A 2JE9A 4FPKA 5H9QA 5KXBA 4J2XA 5EXOA 1GSLA 2EXHA 4IHZA 2DUPA 4AWDA 4FPCA 4U36A 1DZDA 3B9UA 3FJJA 3O3QA 4PBOA 3ZXEA 4X39A 1G9CA 3BAGA 1QF3A 3WZ1A 1S0CA 1P63A 1IILA 4KEIA 1G9FA 4YZ4A 4YZ3A 5JOZA 1WBLA 2P2KA 4XHXA 1WBAA 4ASMB 3OBTA 4DENA 3ILAA 1S0DA 2D7IA 3Q9OA 1TEIA 3T2TA 4LBJA 3FJ8A 4H9WA 1DJSB 4EFQA 5BXPA 1RITA 1IHKA 3INAA 1DFQA 2FHRA 3O5WB 3WDYA 3DEBA 3VUOA 5DZGA 1GZ9A 4G6JA 2Z49A 4GALA 1VCLA 4YM3A 1EVTA 2NYYA 5EWSA 8I1BA 3M3EA 2ARBA 4YLZA 2GO2A 4DQAA 3RMXA 1MZ5A 1QU0A 3MW4A 2SBAA 3BRFA 3NBEA 1IJTA 1IS3A 1VAVA 1Z78A 1W6NA 4FPFA 3O4BA 4XKIA 1FV3A 3WG4A 2IWTB 3OY8B 5E8AA 3BA4A 1BYHA 1LU1A 4I4PA 1L2HA 2DTWA 1ENQA 4YW2A 4USOA 3TB0A 4G9MA 3ZSLA 4D0TA 4QALA 2C5DA 3WDWA 4M00A 1WD3A 1AX2A 1C4RA 3BAVA 2D20A 5H9RA 1R8OA 3OBRA 3ZURA 2A3YA 4OEGA 3V0AA 3FJAA 1QNYA 4R9BA 2E4MA 4IZEA 4LBMA 4WBCA 4I37A 4XYXA 4LO3C 4ZLBB 2CWMA 5CB7A 1XYFA 2E7TA 2W39A 3RTJB 4PQ9A 3WINA 1SLTA 3FUOA 2FPQA 3NV4A 1FNYA 4YZ2A 2DVFA 4ISRA 5GZDA 1WLDA 3IM6A 2CTVA 1D2SA 1G7YA 1LHUA 3OGGA 5DVHA 4K1ZA 1VIWB 1LGCA 3UL2A 3WMVA 2KI6B 3PMEA 2I1BA 4KEKA 5B2HA 1T3CA 2A6WA 3JU9A 2EIGA 4FQZA 4EEEB 4GWNA 4Y1VA 2ZMNA 1F31A 4LO2C 3IIRA 4XZPA 3QYDA 2NP0A 3AFKA 4WZFA 5GZGA 3PVNA 3UJOA 3RG0A 5GLZA 5GALA 1KDKA 5BXSA 2NMNA 1QXMA 1LHOA 1ULEA 1NUNA 3AKIA 1NZKA 2DU1A 4FPEA 1KNMA 4FGFA 2XHLB 1ONKB 5DZEA 1LGBA 2DS0A 3ZUSA 1PZ8A 4R9AA 3A22A 3VT1A 2AXMA 1YVGA 3O0WA 5BQUA 2EXIA 2RHPA 1Y7BA 2AAIB 3KM5A 3L2YA 4Y22A 2ISGA 3NF3A 3UJQA 2IHOA 4M3CF 2CL2A 5SV8A 1C57A 2K8RA 2ESUA 1HLCA 1CPNA 2CNAA 1C1LA 1ZKWA 5BVPI 4F83A 1ULDA 3UD9A 4ZA3B 1QQKA 3N0KA 2D6NA 5BYNA 3O44A 1AVAC 5T5PA 3BRDA 3C8BA 4I30A 4ZFYB 1YRZA 4UW6A 1SZ6B 2WLQA 4KUFA 2SLIA 3ZYRA 4XE9A 3M2MA 4FP2A 4ZOTA 5JOXA 3WHUA 1II4A 4ISQA 4YFZA 3AYEA 4I4VA 1LOFC 1N1VA 3V0BA 2VU9A 4Y24A 1V6VA 2Q3NB 2NM1A 1U0AA 3USUB 2KI4A 4YGBA 3O5SA 1UN1A 4Q8KA 3ZPYA 4OUJA 5T50A 1G82A 2VLCA 1TFMB 2EAKA 3CAHA 3RSJA 2A8AA 3VKFC 4YZ1A 2ZGRA 4XXAA 4U2AA 3SH3A 3QIYA 3Q7XA 3FJFA 5EYXA 5IK5A 4I1EA 3CRGA 4M3CE 2EXJA 5HCFA 4Y20A 2E6VA 4HL0A 5I1BA 4EL4A 1YYNA 4AGVA 2ZR1B 1GANA 4XTMA 2WSVA 3AZXA 3BOPA 2CY6A 5T52A 5G00A 3VKOA 5BP5C 1JYCA 3NBNA 4UW3A 4YW5A 3OJBA 3JRRA 1AVUA 3I8TA 1WLCA 2BEBA 5DUYA 5JOYA 5FNXA 1IT0A 3APBA 2DRYA 4QBVA 2R1BA 1DQ2A 5F9TA 4AVTA 1ILR1 4DRRA 4X3AA 4FVVA 1AVXB 4QD2C 3PG0A 2M49A 2HYKA 2NN8A 5GLVA 2F2FC 3BA5A 4M01A 3NJ5A 1GICA 21BIA 4JPZA 2R49A 1PWAA 1MD6A 1ZM1A 2OUJA 4GP0A 3M3QA 5CAZA 1EPWA 1GZWB 5DG1A 2D6KA 1MS8A 2UU8A 1V6WA 1N4KA 1S0JA 4Q27A 5JOWA 2LALA 4ATEA 5FRAA 1RIRA 3O4DA 2K4AB 1JT5A 3SITA 3RMYA 5D63A 4FP3A 1PC8B 3UJ4A 3UD7A 1WD4A 5F8SA 2W68A 5H9SA 1EYLA 3O4AA 1D0HA 1G9DA 3BADA 4WV8A 4JP0A 3EF2A 2GN3A 1GGPB 5LK5A 2R9KB 1BA7A 2VUAA 3WCRA 1FAYA 5BQMB 5F90A 2ZGOA 4YG6A 1H30A 2YUGA 3IM0A 2ZHKA 2YROA 1Q8QA 3ENRA 4R9DA 3BTAA 3IN9A 1S0LA 3AJ5A 1TOOA 1W6NB 3POKA 1HWNB 1CQ9A 1QQLA 2JECA 1R1ZA 1W6QA 3MW3A 1VAMA 1Q03A 2DUOA 1ULGA 2AUYA 3H0OA 4Q9PA 4DFSA 3WMUA 4HJJA 3N7JA 3AYCA 3CNAA 4DCKC 3DDAA 2VSAA 5DUVA 3AXEA 3AP7A 3N7LA 3V0AB 4H55A 3W58A 4TZDA 3FJ9A 1JT7A 2L5XA 1WBFA 1M16A 1S0GA 4YG3A 3I29B 1VALA 1MS5A 3T1MA 1SACA 1Q8OA 2ETFA 2GALA 1AJKA 3SISA 3WO4A 3HBWA 4XTPA 3M3CA 1AXYA 1JY0A 1UX6A 1Z2VA 1R8NA 1LOAA 3PJQA 2PELA 1LOGA 2ZKNA 1N3PA 1PZ9A 1IRPA 5HPZA 3U4XA 3R05A 4JC1A 3KQRA 1XTGA 3BODA 1JT3A 1ZA4A 2G7PA 1PUMB 2W2DA 2ISHA 1SR4A 4EKXB 5E88A 3AYDA 1FYUA 2ET2A 1IOAA 4YW4A 3BAOA 1IS4A 2ILPA 4HANA 1LECA 3WDUA 4LBOA 2VXTI 4KEJA 1CR7A 4LBQB 3B00A 1HWPB 2NMOA 1PUUB 3OJVA 3ZSMA 1AFCA 3WDVA 1OQ1A 1ISXA 1F82A 4J2YA 1QNWA 3QCWA 1IS6A 1SLLA 2UUSA 2MIBA 1V6KA 1LOEA 4I7IA 4LO0A 1ULCA 1Z7HA 4JKXB 4Y22B 4NO4A 3DUIA 3FJDA 1AZDA 3ZXFA 4QKSA 3ZC8A 3AKFA 2DWRA 5JDBA 1SBDA 1BLDA 1DYPA 3JUTA 4J2SA 4LBQD 3WO2A 2ERMA 1SCRA 1AXKA 3CRHA 5EG6C 3M1HA 5D61A 3WDXA 3AP9A 4K1YA 3O12A 1WW4A 4GKXA 4W65A 2ZMLA 4RA0A 1T9FA 1UAIA 1V6XA 3WG3A 1LHWA 2E7QA 1A78A 4L4IA 3R4SA 5GAQA 3QIZA 2Y9XE 1QMJA 2PHUA 1JYIA 2AR6A 2KLLA 2GMPA 2YZ4A 3AX4A 1TWEA 31BIA 1ZL5A 4X37A 3OYWA 1W3GA 3K3QB 1DIWA 4GP3A 1XG6A 4G9NA 4OWKA 7I1BA 5IT6A 4QD2B 4I1BA 1XTFA 3A0KA 3ATGA 3F62B 1SLIA 5FNWA 4D69A 3N36A 3V64A 4I2SA 1LOBA 3A23A 3S8KA 1Z4SA 5F8YA 3FGMA 4GAFA 1CPMA 1SLAA 1VLNA 2ZZJA 1BFBA 4M3CB 4HEVA 4OEEA 1UKGA 4P6AA 2D43A 5CNAA 1K5UA 3VT2A 2ISEA 2KH2A 4IZXA 1W0PA 2HWAA 1ONAA 1AVBA 2DVGA 4DRVA 4Q8LA 4EFRA 3A21A 2A6ZA 4AN7B 3ZXDA 4FPOB 1SFYA 1MS0A 1Q56A 4Y20B 4OWJA 4PC4A 4YOLA 2ZGUA 2IMBA 2ES3A 3O4CA 3HN1A 3NBDA 1DQGA 1MS3A 3UK9A 1A3KA 5BQNA 3W9TA 1BZWA 3LSDA 2MLLB 4XJAA 1BFGA 2ZACA 2DVDA 2KKIA 3QR5A 3O0VA 3R4UA 1KJLA 3K1XA 1PZ7A 1RG8A 3N7KA 3WLUA 2FFUA 4J2KA 2E4MC 1Z0HA 4R6UB 1OKQA 1N1YA 4I96A 4I4RA 2NTDA 4BLJA 2GMEA 3WINC 1BQPA 3N7MA 3IM5A 2WT1A 1V00A 4FOVA 3WDTA 4P14A 4LO1A 3PHZA 2ZBJA 3H6RA 5DSSB 4MYEA 4XJZA 2ZMKA 4XDQA 2ZGSA 1XHBA 2PHWA 4J1LA 5GZFA 3WA1A 1GZCA 2E53A 1K5VA 4YM1A 3WNXA 1AJOA 3SNMA 1LTEA 1TTUA 3H6SE 4XFTA 1V6UA 3BAUA 1MR5A 4P9XA 4YZ5A 1AXMA 3POYA 1V6JA 4YGDA 2CWSA 4YM2A 3PVEA 3VKNA 1QDCA 2ZHMA 4QKRA 4XBLA 1HCEA 4I4YA 1HWOB 2A7AA 4FPHA 2UURA 3UJ0A 2G7KA 2P3KA 4HR6C 4GKYA 2AH2A 3JUUA 3FJKA 1HDKA 4I4OA 1MZ6A 4P0LA 2A3WA 4K21A 2PHRA 5KXEA 2ENRA 3I2AA 3BRGC 4K20A 1ZKXA 3AKGA 5BQUC 4XMIA 2MC2A 2CYFA 5IK4A 1RMLA 4Q2FA 1W3FA 5EYYA 1F5FA 4LO7B 1QOTA 1FX5A 1LEMA 5E89A 1BFCA 4GOVA 1GNHA 2PHFA 2ZGQA 1FMMS 1LEDA 1BXHA 4YFWA 3ILFA 1ENSA 3B3QE 2F2FA 3B9CA 2ZAAA 1SBEA 2ZQOA 5T5JA 1S0FA 2OUHA 3FFZA 1KITA 2A70A 3GNEA 2P3IA 1JTCA 1LGNA 2VW1A 2WNEA 1MC9A 2UWAA 2AGSA 1W6OB 3VKMA 1HKDA 4EFPA 1IRAX 1HKNA 1J1TA 3POSA 3IMNA 4GOYA 1LJ7A 1WUVA 1LODA 5F5QA 4GA9A 1RY7A 3OJMA 3IAGC 1N1TA 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chains in the Genus database with same CATH topology

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4ZKTB

Total Genus

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Chain Sequence

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