1BUPA

T13s mutant of bovine 70 kilodalton heat shock protein
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGSTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The hydroxyl of threonine 13 of the bovine 70-kDa heat shock cognate protein is essential for transducing the ATP-induced conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (70 KILODALTON HEAT SHOCK PROTEIN)
molecule tags Hydrolase
source organism Bos taurus
total genus 122
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1bupA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bupA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bupA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1bupA04
5KQ8A 3CJAA 1T6DA 4LC9B 3U4LA 5BR9A 2P9SA 1GLJO 3HBTA 4I6MB 3VF6A 5LJVA 1HLUA 3IUCA 3ULEB 3ZEUB 3W3DA 2E88A 1CZAN 1GLEG 4B1UB 1BOTO 3QB0A 2Q36A 3MN9A 1X3MA 2EWSA 5AR0A 2P9UA 5AZIA 4BQLA 3A5NC 4DHYA 4IO8A 1NGAA 3LDPA 5BPLA 2PBDA 4FWKA 3SJHA 3CJBA 5JLHA 1K8KA 2IVPA 2F9TA 3HTVA 5BRHA 2P9IB 4O8KA 5BN9A 3VERA 4ISFA 5AZJB 2HOEA 4BRHA 1QQNA 1X3NA 4CZHA 3I33A 3LDNA 3LDQA 2FLOA 2E2QA 2W41A 4DB3A 2GELA 5B8HA 1Y64A 2A3ZA 3O8MA 2VWBA 1U2VB 3MK6A 3R8EA 4JHDB 3VOVA 3AAPA 3DJCA 4GNIA 4MO4A 3DXMA 3ZETB 1LCUA 2A5XA 4DQ8A 4CBUA 4BR5A 4H0XB 5ELZA 4JD2B 5AFUA 4FWOA 5AQUA 2VYPA 5E26A 4WQ4A 2E8AA 1HUXA 2PAVA 3GL1A 5AQZA 3DXKA 3VEWA 4PKIA 1HKBA 3WQUA 1WOQA 4M7XA 3HZ6A 3IDHA 4BG9A 2YJFA 3A5OC 4B9QA 2DPNA 3CJ1A 3KZBA 4BRFA 1NGEA 3D2FB 4FWSA 2GWKA 2FXUA 3HI0A 5EXWA 3BEXA 2KHOA 4BGAA 1Z05A 3C0BA 1E4FT 1KAYA 3H45C 3AARA 4M63C 4BVPA 4BRMA 1SZ2A 3FFKB 1BG3A 4AM7A 1YUWA 4QS8A 4FOIA 5KQDA 1BU6O 2BUPA 3L4IA 3EO3A 3UKUB 3VGLA 1NGIA 2D4WA 4BRCA 5CE3A 5EY4A 5AQQA 2FSNA 1KAXA 1QQMA 1E4GT 3J8AA 3WEEA 2J4RA 1JCGA 4FOEA 3BUZB 2FF3B 3P4IA 3ZX0A 1SAZA 4XEIA 3VGKA 4JAXA 4BC4A 2ZWHA 3QICA 5LY3A 1NGCA 3O1WA 2Q0UA 3QMLA 1GLCG 3SMSA 2W40A 3IFRA 2GWJA 4RWTA 2P9KB 3WXLA 3MN5A 3A5LC 3JS6A 3B8AX 4BC2A 4FL9A 2P9PB 3L0QA 1MWKA 2AA4A 2E2OA 5AQGA 4BG8A 2I7PA 5I9EB 1ZC6A 3O6WA 1U6ZA 3VF2A 2CH6A 2GTDA 3ZX3A 1HX1A 4BGBA 4H0VB 4FWNA 1TUUA 4EHTA 1NGDA 1J6ZA 5KPTA 3U9DA 1QQOA 2D0PA 3DAWA 1P8ZA 3MN7A 4RCHA 3O08A 3C7NA 4F9OA 3U8XA 4BQZA 3VEYA 5BREA 4B1YB 3EL2A 3H3NO 4H5NA 3BF3A 3TU5A 5F1XA 1H1VA 4XH5A 4A62A 1YVNA 3RSEA 3UB5A 4AM6A 5AFUH 4K43A 3UE5A 1NGGA 1BA0A 3EKSA 2ASPA 4O5FA 2A40A 3UKRA 5KPRA 4IJNA 5FPEA 5EVZA 2QWLA 2QWOA 1ZBSA 3QBXA 4PKHA 1NGFA 4NB4A 4CZIA 3EN9A 3ATVA 1NLVA 4A2BA 4BRGA 4XH1A 4FWPA 1GLFO 1MWMA 2ASMA 1G99A 2ASOA 2P9SB 1ATNA 4H0YB 3LM2A 3M3ZA 4IWVA 3D2EB 1T44A 4CZMA 5BRDA 4K25A 2P9UB 1NMDA 5BN8A 4WYBA 3VEXA 4NO7A 5AQJA 4BRPA 4H5VA 3G25A 2D1KA 3EKUA 2QWMA 3GE1A 1JCEA 1K8KB 4BVOA 4DCHA 2HF4A 3CQXA 5BPNA 1QZ5A 2NLXA 3VEOA 3CJ9A 3MMVA 5JMVA 3WUHA 1MDUB 2FSKA 4WQ5C 3EZWA 5AQYA 1BO5O 1YXQA 2CH5A 3CJ7A 1C0GA 3S41A 4BRKA 3VETA 3ENOA 3M1FA 1OKJA 1NGHA 4WQ5A 4CD1A 4HWIA 3DXMB 4CZEA 4L3QA 5AQLA 1GLAG 3GOIA 2NZTA 1RDWX 1BWFO 4IJAA 1DEJA 3CETA 3LDOA 3ZX2A 4K42A 3FLCO 2P9LA 3FZFA 3DXKB 2YI1A 4YDUC 2QWRA 1ZXOA 3O1BA 1V4SA 3AY9A 2WUSA 2Q31A 2E1ZA 1Q18A 4CZKA 1T6CA 1TYQB 3R6MA 4BR0A 1C0FA 4BR4A 4BROA 3LDLA 1IJJA 1S22A 3BF1A 3U9ZA 4BRQA 3CI5A 5E84A 4EAHD 1V4TA 1GLBG 1RGIA 3VPZA 3F9MA 2IIRA 4H03B 4JN4A 1GLLO 1QHAA 5LJWA 5BRFA 2AP1A 2A42A 2CGKA 4MLHA 2GUPA 4B1ZA 3FZLA 2V7YA 5AQHA 3CERA 1NGJA 3FE1A 3H3OB 4MO5A 3WT0A 1MA9B 4I6MA 2P9NB 3WEEB 4H0OA 4BC3A 4IZ9A 3JXUA 3ULEA 3ZEUA 4Y0WA 4BR9A 5AQPA 3TPQA 5BPMA 1DKGD 1XQSC 3QFUA 3CIPA 4BRDA 4CZFA 3MDQA 1D4XA 4PL8A 3A8YA 2NRHA 1NWKA 2CGLA 3FZMA 2ZGYA 3AAQA 1HPMA 3KHYA 4BR2A 1TUYA 4B1WB 3H1VX 2BTFA 2A6AA 2P9IA 4ISGA 2F9WA 4EFHA 5AZJA 3W0LA 1XC3A 2Q0RA 3GBTA 4CZGA 4CI6A 3VF4A 3O4WA 3OHRA 2CGJA 1XUPO 2ZF5O 3D2EA 4BRNA 1U2VA 3FR0A 3C7NB 3VENA 5KPZA 4JHDA 4CBWA 5AQXA 1YAGA 2FF6A 4QS9A 3R9PA 1IG8A 4BRLA 3O80A 4BRIA 4FWMA 5FPDA 5AQVA 3I8BA 3ZETA 4M7YA 1SQKA 5AQIA 3GDQA 3LL3A 5ADXA 4JD2A 3RSEB 3LM9A 4E1JA 1EQYA 4EIAA 1RFQA 4Z94A 2Q2RA 3CQYA 5AQOA 2YCHA 5AZIB 3KVGA 1NM1A 3VEVA 5EOYA 3D7EO 1JCFA 2IVNA 2VCPA 3UKRB 2Q1NA 4MLEA 2YHYA 4BR7A 3A5MC 1NGBA 2QW9A 4ISEA 2ZGZA 2Q97A 5AQMA 3VEZA 3WXJA 3D2FA 3H6EA 4A2AA 3QFPA 4H5RA 4B1VA 3H46O 3MCPA 3CHWA 2GEMA 1ATSA 5TKYA 4FO0A 1WUAA 1X9JA 4WQ4C 5AQWA 2IVOA 5AQTA 2E2NA 1BDGA 4EHUA 3FZKA 1LOTB 2OANA 4XH4A 3L6QA 5EX5A 1BA1A 1S3XA 2V7ZA 2E2PA 3M6GA 3UKUA 4FSVA 3WXIA 4CJ7A 1HKGA 2QWNA 3ENHA 3A0IX 4H0TB 3VGMA 4KBOA 3FGUA 1ESVA 3QBWA 1HKCA 3DWLA 1Z6RA 3CJCA 3HM8A 1TYQA 3MN6A 4K41A 4BRAA 2QM1A 4FWLA 4C23A 5AQSA 2HMPA 4CD3A 3BP8A 4H0PA 2P9KA 4PL7A 2P9PA 4RTFD 4H5TA 1ATRA 4YDUA 2ITMA 4PKGA 2H3GX 3IMXA 2QWPA 4H5WA 5AQRA 2YHWA 3O5BA 2UYTA 4B1XB 2P9NA 4CBXA 2E20A 4BREA 5AQNA 2FSJA 3QDKA 4CZJA 3WXKA 3GG4A 1HJOA 5AQFA 1KXPA 3FZHA 5JLFA 2V51B 3ATUA 5AQKA 2V52B 3SMPA 1QZ6A 2YHXA 2QXLA 4FPBA 2YJEA 2P9LB 1NBWA 3SLCA 4FWRA 1BUPA 4IXCA 5FPNA 5ADXH 4FPAA 3VESA 4CZLA 2I7NA 3H1QA 2D0OA 1KAZA 5JICA 4HTLA 3HSCA 4JNEA 4BC5A 4FWQA 1GLDG 5FPMA 2QWQA 2A41A 5F0XA 3WQTA 4J8FA 4A61A 1DGKN 4GY2B 5F2RA 1R59O 3SK3A 2E1YA 4QS7A 2HF3A 3ID8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K5NA 3CJAA 4LC9B 4Z4FA 3EE8A 1JLEA 3C6AA 1HLUA 4JKAA 4IEIA 2E88A 3O9QA 4B1UB 3PUFA 1ASWA 5DK5A 4B9TA 3MN9A 1WWNA 4BQLA 4CHQA 4JS4A 3TI0A 1B9FA 4DHYA 3CM5A 3RR8A 2VG5A 4PQUA 1NGAA 5BPLA 3NGYA 3QETA 3S3NA 4FJMA 3KOYA 1BK8A 1JLGA 1YJWN 3L2WA 2P9IB 4W5OA 4O8KA 2YHAA 5JS2A 5AZJB 2HOEA 1SL2A 3LDNA 1JZBA 2W41A 2E2QA 4DB3A 2GELA 5B8HA 1NH5A 2QXFA 3E7RL 4CEZA 3O8MA 4JHDB 2HBLA 3AAPA 4DFPA 4GNIA 4MO4A 4JKFA 3O4NA 2ZE2A 3EEQA 1OVYA 3ZCMA 4AHSA 1LCUA 2A7TA 5DM6L 5TKWA 3CCJN 4H0XB 1BMRA 4CF1A 4FJ7A 2VQEK 4FWOA 1NJWA 2G8VA 1K8AO 4ICLA 3DLLL 3V9SA 4DV6K 5AQZA 3E9OA 4YOVA 4PKIA 4ID1A 1ASVA 5GADP 2PY5A 4MFBA 1X9SA 3RRHA 4V1DC 3CJ1A 3HOTA 1B92A 3F5TA 3RR7A 3ZSOA 2YNHA 4LF8K 2GV9A 1WLJA 3BEXA 1YF5L 1I6FA 1IKWA 1GPTA 3H45C 3OS2A 2W42A 4YORA 4AHRA 4BVPA 1BG3A 1EXQA 1J5EK 1WNSA 1MU2A 5KQDA 2BUPA 3EO3A 3UKUB 3VGLA 1NGIA 1HJRA 3KTQA 5C25A 5CE3A 5EY4A 4FW1A 4MQ3A 1HRHA 4B8AB 2J4RA 3NH1A 2P5OA 4I2PA 1SAZA 4JRPA 4HUEA 1WBBA 4CEOA 4M3TA 2EX3A 5LY3A 1SKWA 5SWMA 3EY1A 2NRXA 5IWAK 3EE9A 2NY9X 2GWJA 4UQGA 3CCQN 4DR4K 3MN5A 4F2RA 3B8AX 1NU0A 2HHWA 2E2OA 5AQGA 2GL1A 2I7PA 5FRMA 1XHXA 3ASMA 1U6ZA 2YNGA 2G8FA 4JK7A 3ZX3A 5E41A 4H0VB 3KLEA 1TUUA 2D0PA 3OVNA 3DAWA 1P8ZA 4RCHA 1QVGM 2JWLA 4WFNL 3AA4A 1VSFA 4LSNA 2VWJA 4F9OA 1RCHA 1Y97A 3U8XA 4B1YB 2FBYA 1OH7A 4FJNA 2RKIA 3TABA 3NMUA 2O8FA 3K5OA 1SL0A 4Z4CA 4AM6A 3WNFA 1RDAA 4CJ4A 1NGGA 1BA0A 4DTMA 3CFOA 4HUGA 4WF9L 2OYQA 4QCLA 4FJKA 1KFSA 1ZBSA 1YIJN 4NYNA 4CZIA 3PIPL 2NRRA 1RT1A 3EN9A 2OTLN 1KTQA 2VGNA 4BRGA 4FM0A 2ASOA 3OYJA 2VQFK 2W6LA 2JDQD 1DTQA 2ASCA 3IKMA 3RRGA 3LM2A 3KOZA 4U67L 4CZMA 5BRDA 2QK9A 2KFNA 1BI4B 3IG1A 2OCEA 1HNIA 1N32K 4WYBA 2Q3SA 3VQAA 4H5VA 3G25A 1EP4A 3SAGA 1AYJA 3SI6A 1QSLA 2QWMA 4BVOA 1LQHA 3HYFA 5BPNA 5D3GA 4LFBK 4X66K 1QZ5A 2G8WA 3C94A 3CJ9A 5JMVA 2K35A 2ZM6K 2MN5A 1BIUA 4FJ9A 4BRKA 3VETA 3ENOA 2G8KA 2ZJRL 1REVA 4WQ5A 1NGHA 1P00A 2GMOA 3SQ0A 4L3QA 3AVNA 3GOIA 1HQUA 1VSMA 4IJAA 3CETA 3THXA 4N47A 3S3OA 2RE2A 4I9QA 5CY0A 3DMJA 1K9MO 2OPQA 1GOCA 1VNBA 2O8DB 2WUSA 2DFFA 2E1ZA 2O8BA 2I61A 3OYBA 1TYQB 3R6MA 1C0FA 4BR4A 4BROA 2N2QA 3OYAA 2BDPA 2NUBA 3BF1A 3KIOA 3CI5A 4FZYA 2ZJPL 2E0HA 2LY5A 3T3FA 3F9MA 1JKZA 1SN4A 1GLLO 1QHAA 2LJMA 5BRFA 2Z1IA 1WMTA 3OYDA 1D9DA 4O44A 4CHOA 2C1IA 5AQHA 1JXBA 4CIFA 3I0RA 4AF1A 1MA9B 4I6MA 2P9NB 3QIPA 2YIOA 4LSLA 4OPHA 3WEEB 4H0OA 3LWLA 4IG3A 1WT7A 5CHIA 3ULEA 3NBPA 5AQPA 3TPQA 2PYLA 1NRAA 3DLGA 4AB0A 3THWA 4CJQA 2X78A 3VQ6A 5CR4A 3OY9A 2WFBA 3AVLA 3AVAA 1C55A 1W0HA 5CYMA 5FDLA 5CYQA 3FZMA 2ZGYA 4FXDA 4CJUA 4B8CA 4DQPA 2BTFA 1KSPA 4ISGA 2F9WA 3GBTA 1T7EA 1CXUA 4CJRA 4CZGA 4YOTA 3NGZA 1HMVA 2CGJA 3M5RA 4ELVA 2WONA 3CYMA 1RDDA 1U2VA 2B5JA 1GPSA 1YAGA 4QS9A 4JKGB 1VSDA 4K8XA 1S1TA 1ZYQA 4CJTA 5KTQA 4KI4A 4EIAA 4X64K 1T3VA 2N2RA 3UIQA 3CQYA 5AZIB 3KVGA 1Q86O 3VEVA 1L5UA 2E6MA 3DRRA 1JCFA 4A5BA 2Q1NA 4MLEA 2YHYA 5K14A 4DSKA 2XY8A 3A5MC 3HRGA 4NYFA 2Q97A 2X6SA 1KCFA 3PSFA 3SF4D 4Z0UA 5KRTA 4B1VA 4KAZA 2O8EB 3MCPA 5TKYA 1WN7A 3O3HA 4Z4GA 3P83D 4HVJA 1RT2A 4E7JA 4WQ4C 2ETJA 3KK2A 5AQTA 4LD0A 3BZKA 3NF6A 4XH4A 1RBUA 3M6GA 4JKDA 3G4SN 2OZSA 4CJKA 3A0IX 5GIOA 4KBOA 3FGUA 1LQQA 3QBWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3K5N A;  3CJA A;  4LC9 B;  4Z4F A;  3EE8 A;  1JLE A;  3C6A A;  1HLU A;  4JKA A;  4IEI A;  2E88 A;  3O9Q A;  4B1U B;  3PUF A;  1ASW A;  5DK5 A;  4B9T A;  3MN9 A;  1WWN A;  4BQL A;  4CHQ A;  4JS4 A;  3TI0 A;  1B9F A;  4DHY A;  3CM5 A;  3RR8 A;  2VG5 A;  4PQU A;  1NGA A;  5BPL A;  3NGY A;  3QET A;  3S3N A;  4FJM A;  3KOY A;  1BK8 A;  1JLG A;  1YJW N;  3L2W A;  2P9I B;  4W5O A;  4O8K A;  2YHA A;  5JS2 A;  5AZJ B;  2HOE A;  1SL2 A;  3LDN A;  1JZB A;  2W41 A;  2E2Q A;  4DB3 A;  2GEL A;  5B8H A;  1NH5 A;  2QXF A;  3E7R L;  4CEZ A;  3O8M A;  4JHD B;  2HBL A;  3AAP A;  4DFP A;  4GNI A;  4MO4 A;  4JKF A;  3O4N A;  2ZE2 A;  3EEQ A;  1OVY A;  3ZCM A;  4AHS A;  1LCU A;  2A7T A;  5DM6 L;  5TKW A;  3CCJ N;  4H0X B;  1BMR A;  4CF1 A;  4FJ7 A;  2VQE K;  4FWO A;  1NJW A;  2G8V A;  1K8A O;  4ICL A;  3DLL L;  3V9S A;  4DV6 K;  5AQZ A;  3E9O A;  4YOV A;  4PKI A;  4ID1 A;  1ASV A;  5GAD P;  2PY5 A;  4MFB A;  1X9S A;  3RRH A;  4V1D C;  3CJ1 A;  3HOT A;  1B92 A;  3F5T A;  3RR7 A;  3ZSO A;  2YNH A;  4LF8 K;  2GV9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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