1BUPA

T13s mutant of bovine 70 kilodalton heat shock protein
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGSTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The hydroxyl of threonine 13 of the bovine 70-kDa heat shock cognate protein is essential for transducing the ATP-induced conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (70 KILODALTON HEAT SHOCK PROTEIN)
molecule tags Hydrolase
source organism Bos taurus
total genus 122
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1bupA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bupA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bupA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1bupA04
4CZFA 1BWFO 1RDWX 2A6AA 1R59O 1IJJA 4J8FA 4WQ4A 3H6EA 4CZEA 3D2EB 1TYQA 2YHXA 2E8AA 3KHYA 2P9KA 4CBXA 3VERA 1C0FA 2IVPA 3P4IA 3ATUA 2ZGYA 5E26A 1XQSC 4CZKA 4H0OA 2CH6A 1QQOA 3R9PA 3ATVA 2P9SA 3D2EA 1ZXOA 3B8AX 2DPNA 1NGAA 4FPBA 3UKUB 2PBDA 1SAZA 1D4XA 3LDOA 5KQ8A 1OKJA 4NO7A 2WUSA 3ID8A 1ZBSA 4BR4A 3WXKA 4MO4A 3MN5A 4FL9A 2E2OA 4EIAA 3CERA 3BF1A 3I8BA 2E2PA 3UKUA 1TUYA 2UYTA 4BC2A 3LM2A 1H1VA 1NWKA 1BO5O 2W41A 4BC4A 2Q36A 3VGMA 4BRHA 1KAYA 5AQJA 1U6ZA 3GG4A 4IJAA 5TKYA 4CZIA 4IZ9A 3LL3A 4ISGA 2IVOA 4PL8A 2D0OA 2P9LB 4F9OA 5JLHA 1KAZA 1ATNA 3VEXA 4Z94A 3H3OB 3GE1A 5F2RA 2EWSA 1TUUA 2ASMA 4BVOA 3VF6A 2P9UA 4K25A 4BRDA 5JMVA 4B1YB 5AQVA 3VOVA 3M1FA 2QWPA 4FWLA 3GDQA 1NGIA 2VWBA 4FWKA 2P9LA 4BRNA 5JLFA 3EZWA 2QM1A 2V51B 4FWPA 4JN4A 4H5RA 3VEYA 3U9ZA 3ZEUB 3LM9A 4CZLA 1X9JA 3EKUA 5BRHA 2E2QA 5AQHA 3CJ9A 4CZMA 3H45C 5AQZA 2HMPA 2QWQA 3FZKA 4B9QA 2CH5A 3S41A 4BG9A 1U2VB 4XH1A 1V4TA 3ULEA 3MN6A 4B1XB 1DEJA 5EY4A 1CZAN 2D4WA 5AFUA 4BRCA 4FPAA 2FSJA 5AZJB 3VEWA 4PKIA 1ATSA 1SQKA 1IG8A 3VF4A 3WXJA 2BUPA 4IWVA 3VEOA 4FO0A 3TU5A 3UE5A 1EQYA 4O5FA 3A5NC 1C0GA 3F9MA 4DQ8A 3LDLA 2FSKA 3A0IX 1NGGA 2Q31A 1NMDA 5EX5A 4FSVA 1NGFA 5BN8A 2YCHA 3C7NA 5FPMA 3U9DA 1E4FT 3FR0A 5AQFA 1BUPA 3CQYA 4BG8A 4GNIA 3JS6A 2NRHA 1MWMA 2F9WA 5AQYA 3QBWA 1GLEG 4C23A 1NGCA 3ZX0A 2A40A 3QFUA 3DJCA 4CD3A 1WUAA 4Y0WA 4FWQA 3H1QA 4H5NA 3MN9A 4BRKA 4YDUC 4RWTA 4H0YB 3UKRB 5EXWA 2Q1NA 1BA1A 1Y64A 4ISFA 4HTLA 4JD2B 1BOTO 1Z05A 3GL1A 2QXLA 3SLCA 4CZGA 3DXMB 4HWIA 3FZFA 1WOQA 1T6CA 3AY9A 4B1UB 4PKGA 3UKRA 4BR2A 4JHDB 3CETA 1G99A 2V7YA 5LY3A 3FZLA 1HJOA 3FGUA 4I6MB 1KXPA 3MN7A 4FWNA 3VESA 3ZX2A 1GLJO 4EFHA 4EAHD 2P9IB 2P9PB 4BRQA 3HSCA 1T6DA 2AP1A 4JHDA 3CJBA 4K42A 4XH4A 3M6GA 3HTVA 5BN9A 4BRAA 3SMPA 3BEXA 1P8ZA 2FXUA 5ADXA 3ZX3A 1S3XA 4CI6A 2P9PA 3EO3A 3HI0A 1NGBA 2CGJA 1ZC6A 1QQNA 3ENHA 1XC3A 3GOIA 4H0PA 4WQ5C 3VGLA 4AM7A 5AQQA 1RGIA 5AQMA 1E4GT 4WYBA 4BQLA 1QZ5A 4NB4A 3WEEB 3L0QA 5FPEA 3UB5A 4BR5A 2IVNA 5AQNA 4XH5A 2QWMA 5AR0A 5AQSA 1QQMA 2NZTA 3CIPA 2QWOA 3GBTA 2YHYA 5I9EB 1T44A 2YJFA 4DHYA 3R8EA 1X3NA 4KBOA 4FOIA 2IIRA 2A3ZA 2CGLA 3QFPA 4CD1A 4WQ5A 1YUWA 5BPLA 5FPDA 3BP8A 5AQRA 3CQXA 3WXIA 3RSEB 2QWLA 1QHAA 3ZETB 5JICA 3ZEUA 4H0VB 3L6QA 1ATRA 5KPTA 4BRMA 3G25A 4FWSA 5BR9A 2YJEA 4EHTA 5FPNA 3ZETA 3WT0A 3KVGA 4FOEA 2HOEA 4AM6A 5KPRA 1GLCG 1U2VA 2HF4A 3CI5A 4BREA 2QW9A 5BPMA 2E20A 2ZWHA 4CJ7A 1NGJA 2VCPA 3VETA 3L4IA 2FLOA 2ZGZA 5AQGA 3MMVA 3O5BA 3VEZA 5AZJA 5KPZA 5BRFA 3VENA 3O1BA 4L3QA 4A2AA 1K8KB 3HZ6A 3VPZA 1BG3A 1BU6O 2OANA 1Z6RA 1NGHA 3CJAA 1MA9B 2HF3A 1KAXA 4A2BA 1HX1A 5ELZA 3EL2A 3J8AA 3O08A 3CJ7A 3TPQA 3FE1A 4DB3A 1Q18A 2AA4A 4IXCA 1NGEA 5AQWA 2ASOA 2E1ZA 3VF2A 3FZHA 1JCEA 4BVPA 3CJ1A 4FWOA 3O6WA 3FLCO 3R6MA 3W0LA 2ASPA 5CE3A 3WUHA 3CJCA 5AQOA 2A42A 3LDQA 5F0XA 1JCFA 3CHWA 4BRPA 1DKGD 5F1XA 4O8KA 1HUXA 4MLEA 3HM8A 2ZF5O 1HKCA 4BRFA 2P9KB 4E1JA 4EHUA 5AQKA 3MDQA 1YAGA 3DAWA 1NM1A 4JD2A 2V7ZA 2PAVA 1HKGA 5AZIB 3DXMA 4YDUA 2GWKA 2P9SB 4BRGA 4H0TB 3WXLA 3U4LA 5BRDA 2P9NB 2A41A 3A5OC 2I7PA 1HPMA 4M63C 1GLBG 4K43A 5AFUH 3SK3A 3QICA 1GLLO 4I6MA 2D0PA 5AZIA 4CBUA 5AQPA 4BRIA 2E1YA 2I7NA 4PKHA 2P9IA 3U8XA 2QWNA 4DCHA 2BTFA 2P9NA 3WQTA 2D1KA 3H3NO 3QMLA 2NLXA 4BR0A 2GWJA 2E2NA 4ISEA 1ESVA 3MCPA 3BUZB 3O8MA 3A8YA 5AQIA 4IJNA 3VGKA 3ENOA 3SMSA 3HBTA 3A5MC 3WQUA 1JCGA 5BREA 2H3GX 3JXUA 3FZMA 1GLAG 4B1VA 2W40A 3IUCA 3D7EO 1DGKN 2P9UB 3WEEA 4BC3A 5B8HA 4H5VA 3BF3A 3IDHA 4IO8A 3C0BA 5AQXA 5EVZA 4MLHA 2A5XA 4MO5A 5AQTA 1YXQA 1NBWA 3EN9A 2GUPA 3KZBA 2E88A 1LOTB 3LDPA 5E84A 2GTDA 2FF6A 3W3DA 1HLUA 3H46O 4CZJA 2Q0RA 1MDUB 2Q0UA 3RSEA 2V52B 2F9TA 3O1WA 3ULEB 3IFRA 3D2FB 5KQDA 1MWKA 4BRLA 3LDNA 4BGAA 3SJHA 1XUPO 4RCHA 3EKSA 1J6ZA 5EOYA 3MK6A 1GLFO 3QBXA 4FWRA 3O80A 4BGBA 3D2FA 2FSNA 4JAXA 2ITMA 4K41A 1S22A 1NGDA 3M3ZA 1SZ2A 3QB0A 5AQUA 4A62A 3DXKB 3AAPA 4BQZA 4M7XA 2YI1A 5ADXH 4QS8A 4B1WB 4FWMA 4RTFD 4H5WA 1YVNA 5LJVA 4GY2B 3C7NB 5BPNA 1RFQA 4H5TA 1K8KA 2YHWA 4PL7A 1LCUA 3AARA 2VYPA 3H1VX 3OHRA 1QZ6A 3IMXA 4CBWA 4QS9A 3DXKA 4BC5A 4JNEA 3VEVA 2J4RA 4B1ZA 2GELA 3DWLA 1HKBA 1NLVA 2GEMA 4M7YA 4WQ4C 1V4SA 2FF3B 4BR9A 2KHOA 1BA0A 4BR7A 2Q97A 1GLDG 1BDGA 5AQLA 4LC9B 3FFKB 3O4WA 3A5LC 4BROA 4A61A 3AAQA 2QWRA 1TYQB 3I33A 3QDKA 4XEIA 2Q2RA 4CZHA 4QS7A 4H0XB 1X3MA 5LJWA 2CGKA 4H03B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RDWX 3ALYA 1R59O 3U3GA 3PY8A 2UXDK 4J8FA 1LQQA 4Q5VA 2ZJQL 3D2EB 1I39A 5FLXO 3NH2A 1T0ZA 3NVKA 3BZKA 3P4IA 4CZKA 3ITHA 2CH6A 1BQMA 3V9WA 4CEEA 4KI6A 3PX6A 3RMDA 1NGAA 2PBDA 2KW4A 3DMJA 4JI1K 2G8UA 5KQ8A 1TGOA 1QS4A 3WXKA 4MO4A 1EWQA 3CM6A 3CERA 4GV3A 2E2PA 1SKRA 1NK6A 5SWMA 3PLAA 3OYHA 4DTPA 1A5WA 1OZZA 1NWKA 2KFNA 1S6PA 4PWDA 1VQ4N 3KLGA 4JEPA 5TKYA 3HOSA 3LL3A 4ISGA 2HNDA 4B9SA 5JLHA 2HW3A 1TKXA 1YTAA 1YI2N 3AV9A 2YNFA 1TUUA 1ZBFA 1BCGA 4BRDA 4E3SA 3CXCM 1QSLA 3VQQA 4NXMK 3HXMA 4FWKA 4DV1K 3OW2M 2X6SA 5JLFA 3EZWA 4BACA 3I0RA 1FKOA 2O8DA 3OYEA 3HVTA 2BANA 3U9ZA 4CK3A 3OYFA 2KZZA 4CECA 3EKUA 2XRIA 4B3TK 1VQPN 4M3TA 1O13A 2E2QA 1C1BA 4CJLA 4OLBA 1T8EA 4GVMA 4NCGA 1EX4A 4DV2K 3AO3A 4RG8A 5CZ2A 4XH1A 1V4TA 2F4VK 3FFIA 5EY4A 1CZAN 2B3CA 4BRCA 2BGGA 4DQRA 2YX6A 3LP0A 1VRUA 4RW4A 4AHTA 1P90A 3VEOA 3IS9A 4FO0A 3O4QA 3TU5A 1KV0A 1W0HA 3CM5A 4B9NA 4FLUA 1B92A 1EQYA 3QI7A 2X74A 3LDLA 1I6FA 3JYTA 4OLAA 1NGGA 4JK7A 1NMDA 3NMUA 2DFHA 1E3MA 4DR6K 3MCAB 5M1NA 5BN8A 5K14A 4GW6A 4OPKA 1QSSA 1E4FT 3OJUA 2F8TA 3KIOA 5AQFA 4W5QA 3KC6A 4OPHA 2XY7A 2BRZA 1ICAA 1NJWA 4GNIA 3JS6A 2IS3A 3B6PA 2PYLA 4IOAL 1NGCA 4E7IA 2A40A 2PZSA 3K59A 3KD1E 4I9QA 3H1QA 4H5NA 3ZSVA 4R5PA 4EZ6A 4BWMA 1GOBA 1IG9A 1Y64A 4HTLA 4JD2B 1BOTO 4FK0A 3GL1A 5KGXA 1IO2A 2N2QA 4JI0K 1VQ8N 4HWIA 3VQ4A 1WOQA 3CCRN 4GVEA 4B1UB 3UKRA 1BIUA 3PX4A 4JHDB 5HRRA 1N36K 1HJOA 4CIGA 4OGEA 4DR3K 1GLJO 2ATQA 2YEOA 4RW9A 4PA1A 3VTHA 4OVLA 4K8ZA 1ZYVA 4BRQA 1BQNA 3CJBA 1O1WA 3B6OA 1IKWA 3SMPA 4CIFA 3SCXA 2OYQA 1EP4A 1LV5A 1RNHA 4CJQA 1VSEA 2CGJA 1QQNA 2G2KA 1XC3A 3KK2A 3VGLA 4AM7A 3VQ8A 3AVHA 1NJZA 4FJNA 1FH3A 4LH5A 1E4GT 4JKFA 1NRAA 4IBNA 4F3OA 4CJ4A 3NF6A 4BR5A 3QEXA 4Y1DA 4M3YA 5AQSA 5AR0A 4CHYA 4B9TA 2O8EB 3NVMA 3GBTA 3H08A 3G4SN 4IFEA 1YTUA 2HVHA 3UIQA 4WFNL 1SUQA 2A3ZA 1HNWK 1ZBLA 1C1AA 2CGLA 5GAEP 4CD1A 1U45A 3KTQA 3MXJA 4TSXA 3BP8A 1WB9A 1ASVA 5AQRA 1HJRA 3TSUA 3LWLA 1TL3A 3WXIA 4IO9L 4MDBA 4JKBA 1TK0A 5CYQA 3ZETB 2LR3A 5CHIA 4FJ5A 4LY7A 1VNBA 1ITGA 3L6QA 1VSKA 2FC0A 2VG7A 3AA3A 3AGKA 4YY3K 2KYQA 1SL0A 3SF4D 2IDOA 1A5VA 4Z0UA 3S3MA 4CFBA 5FPNA 5D3GA 4FOEA 2HOEA 4AM6A 4IFVA 5M1PA 3CI5A 1L3VA 3O9RA 2YNGA 5SZTA 3CCMN 1JL1A 2DFFA 2HBLA 4KO0A 3VQDA 2NY9X 3L4IA 4CGJA 4U67L 3MMVA 3O5BA 1TK8A 4A2AA 4B9LA 1K8KB 2G8IA 4C8OA 2O4IA 4WF9L 4BY9C 4C8KA 2B5JA 3AGRA 2E6LA 1NGHA 1MA9B 3THWA 4A2BA 1HX1A 4CGIA 2ZD1A 3O08A 2YNIA 1G15A 2NRVA 3VQ7A 4OKEA 1Q18A 1NGEA 1KVAA 2ASOA 4LF5K 2P5GA 1Q9XA 2Z1HA 1CXQA 3BY5A 2Y1JA 4O5BA 1W2BM 2ASPA 1YJWN 2A42A 3OBWA 3LDQA 4BRPA 1DKGD 2O8BA 4UQGA 1HUXA 1X9SA 2ZF5O 4DTUA 1HKCA 4KHYA 2W6LA 4CHNA 4DUZK 3OVNA 3MDQA 1I2VA 4U7BA 1YAGA 3DAWA 4JD2A 3SZ2A 1W7AA 3CCQN 5AZIB 4YDUA 4JV5K 2P9SB 4H0TB 1C0TA 1Z25A 5BRDA 2A41A 2B4JA 3I8DA 1DLOA 3DRPA 1KLNA 3CW4A 1U04A 3LZJA 4BDPA 1GLLO 3VA0A 3HPGA 5AQPA 4PKHA 2HBJA 3PIPL 1IBKK 1KFDA 3OS0A 1GOAA 3WQTA 3QMLA 2GWJA 2E2NA 1YT3A 4KB1A 4B3OA 4AHCA 3QERA 4ICLA 4DS4A 3J81O 1RCHA 3WQUA 3HK2A 1T7BA 5GAHP 3JXUA 1GLAG 3T3FA 1GPTA 4NLBA 3ZT2A 1DGKN 2OPQA 2P9UB 3U3YA 5C0YA 4H5VA 1C0MA 4LH4A 3BF3A 4YHHK 4IO8A 1RT5A 3P1GA 5GIPA 4MLHA 2A5XA 3T19A 3NFAA 4AAZA 1NBWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1RDW X;  3ALY A;  1R59 O;  3U3G A;  3PY8 A;  2UXD K;  4J8F A;  1LQQ A;  4Q5V A;  2ZJQ L;  3D2E B;  1I39 A;  5FLX O;  3NH2 A;  1T0Z A;  3NVK A;  3BZK A;  3P4I A;  4CZK A;  3ITH A;  2CH6 A;  1BQM A;  3V9W A;  4CEE A;  4KI6 A;  3PX6 A;  3RMD A;  1NGA A;  2PBD A;  2KW4 A;  3DMJ A;  4JI1 K;  2G8U A;  5KQ8 A;  1TGO A;  1QS4 A;  3WXK A;  4MO4 A;  1EWQ A;  3CM6 A;  3CER A;  4GV3 A;  2E2P A;  1SKR A;  1NK6 A;  5SWM A;  3PLA A;  3OYH A;  4DTP A;  1A5W A;  1OZZ A;  1NWK A;  2KFN A;  1S6P A;  4PWD A;  1VQ4 N;  3KLG A;  4JEP A;  5TKY A;  3HOS A;  3LL3 A;  4ISG A;  2HND A;  4B9S A;  5JLH A;  2HW3 A;  1TKX A;  1YTA A;  1YI2 N;  3AV9 A;  2YNF A;  1TUU A;  1ZBF A;  1BCG A;  4BRD A;  4E3S A;  3CXC M;  1QSL A;  3VQQ A;  4NXM K;  3HXM A;  4FWK A;  4DV1 K;  3OW2 M;  2X6S A;  5JLF A;  3EZW A;  4BAC A;  3I0R A;  1FKO A;  2O8D A;  3OYE A;  3HVT A;  2BAN A;  3U9Z A;  4CK3 A;  3OYF A;  2KZZ A;  4CEC A;  3EKU A;  2XRI A;  4B3T K;  1VQP N;  4M3T A;  1O13 A;  2E2Q A;  1C1B A;  4CJL A;  4OLB A;  1T8E A;  4GVM A;  4NCG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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