1NGA | Genus

Total Genus 120

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	120
sequence length	378
structure length	378
Chain Sequence	GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINSPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
source organism	Bos taurus
publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
total genus	120
structure length	378
sequence length	378
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1ngaA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngaA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngaA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1ngaA04

1HPMA 5B8HA 1G99A 4BRMA 3D2EB 3DAWA 1ATSA 1MWKA 1KAXA 2BUPA 2QWPA 1D4XA 1CZAN 1YVNA 2FF3B 1RDWX 3FLCO 4BREA 4ISEA 2P9PB 5AQPA 3HTVA 3OHRA 3H3NO 5AR0A 3WUHA 3P4IA 3ID8A 4H0XB 4XH5A 4A2AA 2KHOA 4CZHA 4H5WA 3O08A 3M3ZA 3BUZB 3VEYA 3FFKB 3CERA 4J8FA 5LY3A 2GTDA 4JD2A 1EQYA 4DHYA 2P9SA 3MMVA 3IUCA 3L4IA 3CJCA 3A0IX 4FWSA 2F9TA 1WUAA 3LDNA 5AQFA 3A5LC 3BF3A 4CZGA 3VGKA 4BRLA 1QHAA 5AQYA 1ZXOA 4FPBA 1JCEA 5AQSA 1GLJO 4BC4A 2NZTA 2E2QA 5ELZA 5BPMA 2E2PA 4CZKA 1C0FA 2GWJA 2DPNA 1QZ5A 2CH5A 4IZ9A 3J8AA 1X9JA 3I8BA 4BR5A 3KZBA 4PL7A 4PL8A 1ATRA 4BVOA 5BREA 4IXCA 4JNEA 5ADXH 4BROA 2E1YA 4ISFA 1DGKN 1GLFO 1NLVA 2ASOA 3O1BA 4B1WB 4H0PA 2E1ZA 4CZEA 1P8ZA 5KQDA 1JCGA 4K25A 5BRDA 1GLLO 2F9WA 4EAHD 1KXPA 3FZLA 4XH4A 4BR0A 3A5MC 3A5NC 1DKGD 3UKUA 5AQIA 1Z05A 3H45C 4WQ5C 2W41A 4CD1A 4H5TA 5F2RA 2FXUA 5BN9A 3FGUA 3VOVA 1LOTB 2Q1NA 3O4WA 1NGGA 1HUXA 3HBTA 2YHXA 2GUPA 2A42A 2A3ZA 4BR4A 3CQXA 2YJFA 1WOQA 3H46O 4A61A 4H5RA 2P9NB 5F0XA 2HMPA 3SLCA 4JHDB 5AFUH 2V52B 1NGFA 3KVGA 4FL9A 3QB0A 2P9UA 5AQGA 3GG4A 4O5FA 4BRFA 3FR0A 3ZX2A 1IG8A 4MO5A 4B1XB 3TPQA 1NGDA 1RGIA 2EWSA 4B1YB 4KBOA 2FLOA 3R6MA 3ZETA 2QXLA 2FSJA 4Z94A 4BRDA 2E2OA 3L6QA 3DXMA 3O80A 1BOTO 2Q0RA 4JN4A 3LDPA 3LL3A 4FPAA 5AZIA 3ZEUB 3R9PA 3ULEA 4M7YA 4O8KA 1V4TA 5AQUA 3BF1A 3D2FB 4Y0WA 3VGMA 5ADXA 3VEOA 5AQXA 3R8EA 3GBTA 1BU6O 1MWMA 2D0PA 3QDKA 1QQNA 4C23A 5AQHA 2I7PA 2QWLA 3DXKB 3FZHA 4H0VB 1NBWA 3WQTA 3EKUA 3QBXA 3UKRB 3HSCA 1S22A 3JXUA 5AQQA 5AQMA 2P9IA 4HWIA 1MA9B 4FOIA 4B1UB 3QICA 1H1VA 3MN7A 2YHYA 3MN9A 3I33A 5AQNA 5E84A 1DEJA 2Q0UA 1NGAA 2HF3A 4GY2B 3LDQA 4WQ4A 1Q18A 1SQKA 1NGHA 4BC3A 4CZIA 5JMVA 5JLHA 4H0OA 2VYPA 3QFUA 2P9KA 3BEXA 3IMXA 4H0YB 5AQZA 4BRGA 1C0GA 5FPEA 2V7ZA 3QFPA 3F9MA 4I6MA 1ZC6A 3SJHA 3WXJA 5AQWA 5AFUA 4EHUA 4IO8A 2Q31A 3A5OC 1TYQA 5AQOA 2J4RA 4BRIA 2ZGZA 1RFQA 2IVOA 5FPNA 3MN6A 4JD2B 1NWKA 1BA0A 2P9SB 3WXIA 2Q36A 1NGCA 4WQ5A 3HI0A 3C0BA 3GDQA 1K8KA 1YAGA 3VETA 4BRAA 1S3XA 1OKJA 2H3GX 5BN8A 3C7NA 4ISGA 3B8AX 3L0QA 1KAYA 4FWQA 5KPRA 5AQRA 3AY9A 2HF4A 4A62A 3VESA 4BRQA 2HOEA 5I9EB 3RSEA 4XEIA 1QZ6A 5AQVA 5AQLA 4RTFD 1ESVA 4B1VA 3UE5A 5FPDA 3DWLA 1E4FT 1XQSC 5EXWA 2QM1A 5AQKA 3MN5A 3TU5A 2VWBA 2CH6A 2V51B 3FZMA 3EZWA 4BRPA 5F1XA 4PKGA 4CBWA 4CZLA 5KPZA 2WUSA 3O8MA 4RWTA 2QWRA 4K43A 4BQLA 2BTFA 3D7EO 2FSKA 1JCFA 3EO3A 3VF6A 3VERA 5AZJA 4DB3A 1T44A 4AM6A 2ZGYA 1NGJA 3UKUB 5BRFA 1QQMA 3LDOA 3EN9A 1BDGA 3BP8A 4FWOA 3HM8A 3W3DA 1Y64A 3AAPA 2I7NA 5LJWA 4H5NA 4BRKA 2QW9A 2P9LA 3AAQA 5FPMA 3UB5A 3WT0A 1YXQA 3JS6A 5BR9A 2W40A 3H1VX 4E1JA 3VPZA 4H0TB 2Q2RA 5AZJB 2ZF5O 3WEEA 1X3MA 3FZFA 4CI6A 1HKCA 3HZ6A 2P9UB 5TKYA 2D1KA 3D2EA 4BC5A 5EVZA 3H3OB 4EIAA 2E88A 3ATUA 2P9PA 3FE1A 4RCHA 1NM1A 1E4GT 3CJ1A 3LM2A 3DJCA 4LC9B 5LJVA 3M6GA 3ZETB 2E20A 3VF4A 1MDUB 4IJNA 2E2NA 3U9ZA 3KHYA 4DCHA 3DXMB 4JAXA 2D4WA 3H6EA 2CGJA 4FO0A 4F9OA 5AQTA 2QWNA 3CJAA 5AZIB 3GE1A 4BRCA 4BRHA 3ULEB 4YDUC 2V7YA 4B9QA 3O5BA 1HX1A 1X3NA 2GEMA 4AM7A 1V4SA 1NGEA 1GLBG 3ZX0A 2QWOA 1SAZA 2D0OA 3MDQA 1BA1A 4QS8A 1HJOA 4BGBA 2P9IB 4H5VA 3MK6A 4DQ8A 3CIPA 5BPNA 1YUWA 4BG8A 3LM9A 3W0LA 2VCPA 3ENOA 3VEVA 4IJAA 1ATNA 3IDHA 3M1FA 3SMSA 2A41A 4FWLA 4K41A 2CGKA 4K42A 4PKHA 3S41A 4BR2A 1GLEG 4NB4A 3IFRA 5KPTA 2A40A 1HKGA 1NGBA 2IIRA 4FWNA 1BWFO 5BRHA 2E8AA 2P9KB 2ASPA 2YHWA 4IWVA 3VGLA 5BPLA 4FWKA 1BG3A 1XUPO 2FF6A 5EY4A 1HLUA 4I6MB 2PBDA 4CJ7A 2ASMA 3CHWA 3MCPA 4PKIA 1TYQB 3U9DA 1BO5O 3WXKA 3GL1A 5EX5A 5KQ8A 3WQUA 2YI1A 4NO7A 5EOYA 1J6ZA 3AARA 4H03B 3ATVA 1TUYA 3LDLA 4FSVA 4BG9A 3CJ9A 4EHTA 3ENHA 1R59O 4WQ4C 4BRNA 4BR9A 3H1QA 4BC2A 3EKSA 1K8KB 4FWRA 4CD3A 1KAZA 1NMDA 1IJJA 4A2BA 2A6AA 3C7NB 1T6CA 2AA4A 2QWMA 3VF2A 4CBXA 4QS7A 3RSEB 3GOIA 1Z6RA 1GLAG 2AP1A 2ZWHA 2GELA 2P9NA 2YJEA 3G25A 4JHDA 3QBWA 1ZBSA 3CETA 1GLDG 4QS9A 3VENA 2PAVA 1QQOA 2NLXA 1HKBA 1T6DA 4MLEA 3FZKA 4M7XA 2OANA 3A8YA 2IVPA 3O1WA 4GNIA 4BVPA 3VEZA 1U2VA 2FSNA 2GWKA 2CGLA 4HTLA 2IVNA 3VEXA 3WXLA 4B1ZA 4FWMA 4CZFA 3CJBA 1BUPA 5CE3A 3CQYA 3QMLA 4BQZA 3U4LA 1LCUA 2YCHA 4M63C 3O6WA 4YDUA 3CJ7A 4CZJA 2ITMA 3ZEUA 1GLCG 1NGIA 3EL2A 4BR7A 3D2FA 3SMPA 3VEWA 4CZMA 4L3QA 3SK3A 4FWPA 2P9LB 4CBUA 1U2VB 1TUUA 1U6ZA 3U8XA 3CI5A 4FOEA 4XH1A 3DXKA 2UYTA 5JLFA 2NRHA 3WEEB 1XC3A 3UKRA 1SZ2A 5AQJA 2Q97A 4BGAA 3ZX3A 5E26A 4WYBA 4EFHA 4MO4A 2A5XA 2QWQA 5JICA 4MLHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

4OPKA 4DQRA 1W2BM 2XHBA 3T1YK 4C8KA 3BDPA 5GAHP 3P83D 1QSLA 4KKOA 1KAXA 4BREA 1YVNA 2FF3B 4BE1A 4ISEA 2P9PB 1BMRA 4KHPK 3H3NO 4H0XB 4XH5A 1C0TA 3WXMB 1QHTA 4IFVA 4DSLA 3VEYA 2E3FA 3CG7A 3FFKB 4NCBA 2YEOA 4JI7K 4CJTA 3CERA 1YI2N 1OVQA 2G8UA 1VSDA 1VQKN 1BQNA 4CESA 5J2MA 4GVEA 2Q3SA 1JLCA 2P9SA 4MFBA 3IUCA 1JZAA 4ILJA 1ASUA 4FLVA 1WUAA 1J9AA 3A5LC 4FM1A 4FCYA 2ATBA 1QHAA 1VQ8N 4FW2A 4R79A 3CCLN 3TTCA 2HW3A 3CXCM 3K0SA 4HTUA 4ZTJA 5ELZA 2E2PA 3EE9A 3I0RA 1C0FA 2DPNA 3AVBA 1QZ5A 3ZT1A 3LP0A 3ENBA 4AHUA 3RMAA 1B9DA 3AVMA 4N5SA 1VSIA 4PL7A 4PL8A 4BVOA 1RDBA 4BROA 3THYB 1T05A 4LY7A 4W5NA 1NLVA 4CHZA 2XY5A 3E9LA 2O8BB 1K9MO 2E1ZA 1YTAA 4K25A 5BRDA 1GLLO 2F9WA 1KXPA 2MN5A 4DSKA 4FXDA 1Q81O 1DKGD 3UKUA 2F96A 3SPZA 3R3LA 4CD1A 2FXUA 3PSIA 4IDHA 2O8CA 1Q8IA 5C2FA 4UJ0A 2E6MA 1JL1A 3O4WA 3LPTA 4JK7A 1S6QA 1S9GA 2A42A 1HNZK 1JZBA 1D5AA 4F2RA 4B9NA 1CXQA 4LFBK 1MR4A 3CQXA 4CK1A 1WAFA 2YJFA 3L2RA 2VWJA 4M3XA 1VSMA 4FZYA 5HBMA 5AFUH 2V52B 3TWHA 4FL9A 1G15A 3QB0A 2P9UA 1WSEA 5C2DA 3IAYA 4KHWA 3OYNA 2X6SA 3MX2A 3V9SA 4TSXA 4HE7A 2KSKA 4DKWA 1IG8A 5C0YA 3TPQA 4IG3A 4FYDA 2FLOA 3C6TA 3U3GA 4FLWA 2O8DA 3OYCA 2RF2A 4HUGA 5M1NA 4Z94A 4CK3A 2A1SA 4FJ9A 2D56A 3IRXA 4JKCA 1BOTO 2Q0RA 4JN4A 3LP3A 1RDUA 1LAWA 1KFDA 3ULEA 3MECA 3VGMA 3GBTA 1BU6O 4CEFA 4PA1A 2D0PA 4J2BA 1JLQA 5AQHA 2O8FA 3J7ZO 4YOUA 2WTUA 2YNHA 1UA1A 3WQTA 2VG5A 3EKUA 3UKRB 5AQQA 4FOIA 5M1PA 3QICA 4WFAL 4JS5A 1LQHA 2ZJRL 2G8VA 3ZSQA 5JENA 3DLRA 1Q18A 3VQ5A 2VG7A 1NGHA 3PIPL 1L3VA 4OPAA 5E41A 3K2PA 1RBVA 2VYPA 1T7BA 1FH3A 2X78A 4NLBA 4ZHRA 5HLFA 4BRGA 5AJ3K 5FPEA 2V7ZA 3QFPA 5C10A 3V9XA 4DFPA 4IO8A 3A5OC 3B6OA 2VWKA 5AQOA 4BRIA 2RKIA 3O4QA 2DFFA 1RDDA 2YKMA 4JD2B 1NWKA 4BDYA 4CF8A 3SNNA 1N8RO 1NGCA 4X65K 5BR8K 3VETA 1YAGA 1RT4A 1EWRA 4BRAA 1OKJA 1KQSM 1L3UA 4FJHA 4IEIA 3VQ8A 4Z4HA 1YITN 2HF4A 2QKBA 4Y1CA 3VESA 3K58A 2QA4N 1QZ6A 1WLJA 1QVGM 3M5RA 1ESVA 5FPDA 3DWLA 1NNEA 1XQSC 1ZYWA 2NRWA 4IOXA 2HSTA 4ICLA 3TAEA 3TTDA 2GL1A 3FZMA 3VQPA 3L3UA 4R5PA 3I55N 4E19A 3VQ9A 4JI1K 4K43A 1T7EA 2BTFA 1U47A 3D7EO 3E1YA 1SN1A 2FSKA 2YNIA 4O5BA 4I7FA 4CIEA 3QEIA 3VQQA 5HROA 3SAGA 4KYPA 1TV6A 4IDKA 3K5LA 1LQIA 5BRFA 4KREA 3EN9A 4FWOA 1OH6A 2I7NA 5LJWA 4Z4CA 4BRKA 3WT0A 4MDAA 3JS6A 4B3SK 4OJRA 1ZVEA 5BR9A 4B08A 5J2NA 3VPZA 3AVAA 5CZ1A 4EZ6A 4FJXA 1BCGA 1EXQA 3T1AA 3AA2A 3FZFA 4I9QA 2NRZA 5TKYA 3T7ZA 5EVZA 1NK7A 2XY7A 4HHFA 4CGIA 3V1RA 3LALA 2W00A 4JI6K 1PX9A 1WMTA 4RCHA 4Z4EA 3EZ5A 1E4GT 1LQQA 4OKKA 3M6GA 5CHIA 4DR1K 4NXMK 4Y1DA 3CPEA 4JI4K 3HPHA 3VF4A 1Q82O 1IBLK 3KHYA 1ZBFA 3DOLA 5AQTA 2QWNA 4O0IA 4C8LA 5AZIB 1BIUA 4BRCA 4BRHA 4LFAK 1VQMN 1W0HA 1KCFA 4B9TA 1ZBHA 4ID5A 4CGFA 3ZX0A 1TGOA 4FJIA 3QEPA 3MDQA 1BA1A 1WT7A 1HJOA 4DR3K 1GOCA 1VSEA 1SL2A 3IS9A 3LM9A 1OH8A 3VEVA 3OYKA 3TAQA 1NH5A 1U49A 5FLXO 3SI6A 1N4NA 3ID6A 4KO0A 1Z26A 4K42A 4BR2A 4CEEA 3M8QA 2A40A 1HKGA 3OYEA 1I94K 4B3RK 1I2UA 3CPWM 4DSJA 2E8AA 2P9KB 4LH5A 1XUPO 1NU0A 4RW6A 4DTMA 1EO1A 2FF6A 3S3NA 3C94A 1QS4A 5EY4A 1S72N 2KZZA 3LP1A 4CJ7A 4FVMA 3CHWA 3MCPA 4RWTA 3CFRA 3GL1A 5EX5A 3WQUA 4BDPA 2Z1HA 2NY9X 4H03B 1VQPN 1CZ9A 3ZT3A 2RPIA 1ICAA 3C6UA 4J2EA 3LDLA 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3K59A 4CZGA 2KLAA 1ZXOA 4HHTA 1SKSA 4PUOA 2KJAA 5DMRA 1WN7A 3SQ2A 5FRMA 1ZBUA 3F5TA 3OYDA 2D5RA 3J8AA 1VQ9N 4OX9K 3O9SA 2YIPA 3I8BA 5FRNA 4BR5A 1UGLA 3KZBA 5MLCQ 1ATRA 4IXCA 4JNEA 5ADXH 2E4LA 4AAZA 4ISFA 4FJ8A 5T7BA 1DGKN 1GLFO 2ASOA 2VQEK 4B1WB 3MXJA 4CHPA 1N33K 1JCGA 3ALYA 2PY5A 2HHUA 3CC2N 4WFBL 4X62K 3CCMN 3A5NC 4OLAA 1KVAA 1FKOA 2RN2A 1I2VA 1Z05A 3H45C 5HRSA 4WQ5C 1NG9A 4H5TA 3AVJA 1C6VA 4JKGA 1LOTB 2Q1NA 4PQUA 4DFKA 1NGGA 1HUXA 2HVIA 3F9KA 3IG1A 1NJZA 1XNRK 4GW6A 5HRPA 2HNDA 1WOQA 1EWQA 4A61A 3MEGA 5F0XA 2HMPA 1EETA 3AVHA 3K5OA 3KK1A 5AQGA 3GG4A 4BRFA 1S1TA 3HXMA 3FR0A 4JK8A 3WNEA 1JLFA 3P31A 1O13A 4B3OA 1RGIA 1RCHA 2OPPA 4XJXA 4EP5A 3ZETA 2QXLA 1TK5A 2LT8A 4O4GA 2E2OA 3L6QA 3DXMA 4F4KA 3G0ZA 3LDPA 2LJMA 4CJSA 4M7YA 4O8KA 1V4TA 5AQUA 3AA4A 4FLUA 3DLHA 3D2FB 3SQ1A 1EKEA 4E1NA 1RBSA 3VEOA 4KTZA 5AQXA 3CC4N 5DK5A 1K8AO 4PWDA 1MWMA 1C55A 2BANA 3QDKA 1OVYA 3FZHA 4OPJA 1XRSB 4OLBA 3KP0A 3U6FA 3QBXA 4B3TK 2QK9A 3E9PA 4CGHA 3BZKA 2P9IA 2ATQA 1MA9B 3DLBA 1OMYA 3CYMA 5GIOA 1H1VA 3MN9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4OPK A;  4DQR A;  1W2B M;  2XHB A;  3T1Y K;  4C8K A;  3BDP A;  5GAH P;  3P83 D;  1QSL A;  4KKO A;  1KAX A;  4BRE A;  1YVN A;  2FF3 B;  4BE1 A;  4ISE A;  2P9P B;  1BMR A;  4KHP K;  3H3N O;  4H0X B;  4XH5 A;  1C0T A;  3WXM B;  1QHT A;  4IFV A;  4DSL A;  3VEY A;  2E3F A;  3CG7 A;  3FFK B;  4NCB A;  2YEO A;  4JI7 K;  4CJT A;  3CER A;  1YI2 N;  1OVQ A;  2G8U A;  1VSD A;  1VQK N;  1BQN A;  4CES A;  5J2M A;  4GVE A;  2Q3S A;  1JLC A;  2P9S A;  4MFB A;  3IUC A;  1JZA A;  4ILJ A;  1ASU A;  4FLV A;  1WUA A;  1J9A A;  3A5L C;  4FM1 A;  4FCY A;  2ATB A;  1QHA A;  1VQ8 N;  4FW2 A;  4R79 A;  3CCL N;  3TTC A;  2HW3 A;  3CXC M;  3K0S A;  4HTU A;  4ZTJ A;  5ELZ A;  2E2P A;  3EE9 A;  3I0R A;  1C0F A;  2DPN A;  3AVB A;  1QZ5 A;  3ZT1 A;  3LP0 A;  3ENB A;  4AHU A;  3RMA A;  1B9D A;  3AVM A;  4N5S A;  1VSI A;  4PL7 A;  4PL8 A;  4BVO A;  1RDB A;  4BRO A;  3THY B;  1T05 A;  4LY7 A;  4W5N A;  1NLV A;  4CHZ A;  2XY5 A;  3E9L A;  2O8B B;  1K9M O;  2E1Z A;  1YTA A;  4K25 A;  5BRD A;  1GLL O;  2F9W A;  1KXP A;  2MN5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1NGAA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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